3KVMA

Crystal structure of human dihydroorotate dehydrogenase (dhodh) with amino-benzoic acid inhibitor 951 at 2.00a resolution
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
366
structure length
366
Chain Sequence
ATGDERFYAEHLMPTLQGLLDPESAHRLAVRFTSLGLLPRARFQDSDMLEVRVLGHKFRNPVGIAAGFDKHGEAVDGLYKMGFGFVEIGSVTPKPQEGNPRPRVFRLPEDQAVINRYGFNSHGLSVVEHRLRARQQKQAKLTEDGLPLGVNLGKNKTSVDAAEDYAEGVRVLGPLADYLVVNVSSPNTAGLRSLQGKAELRRLLTKVLQERDGLRRVHRPAVLVKIAPDLTSQDKEDIASVVKELGIDGLIVTNTTVSRPAGLQGALRSETGGLSGKPLRDLSTQTIREMYALTQGRVPIIGVGGVSSGQDALEKIRAGASLVQLYTALTFWGPPVVGKVKRELEALLKEQGFGGVTDAIGADHRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Discovery of novel inhibitors for DHODH via virtual screening and X-ray crystallographic structures.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase, mitochondrial
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
total genus 138
structure length 366
sequence length 366
ec nomenclature ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date 2009-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3kvmA00
2I1OA 2QDHA 3B04A 5H2ZA 3BG3A 5EMUA 3R12A 4PL1A 2QCHA 4UUIA 3THQA 2DZUA 2V0TA 4EOUA 4HIBA 4FNRA 1WYIA 4AHOA 1VHCA 1YPIA 2E5DA 2QCDB 4LT9A 1EP3A 1PCKA 2B4GA 4QITA 4RXFA 3STCA 3TAKA 5TBOA 5K9XA 3LV6A 1DOSA 2YDAA 3UWVA 4NU7A 5LKYA 1ML1A 3G0UA 3QYQA 4O0ZA 3P62A 4H6KA 4IJBA 4WXZA 2PE4A 3W83A 4UTKA 3DFQA 4FX8A 3N3MA 1VRDA 3U6WA 2H3DA 2PRMA 4AMAA 4O19A 4PCFA 1VCVA 4WZHA 1QOPA 4NQ1A 3G1DA 1SW7A 4Y8FA 3QC3A 3B4UA 3DFOA 3LLDA 1MSSA 3SJ3A 1WA3A 3G24A 1E51A 2VEMA 2JGQA 1XUUA 1MEWA 1F7BA 3NAVA 3OA3A 2C14A 4UNLA 3UD6A 4BI6A 4FHAA 1LZOA 3B03A 2ZQ0A 3C2RA 5F4XA 4FXSA 2EHHA 5E93A 3QMRA 1P0KA 2OCZA 3PUDA 3OVPA 3WK2A 3W7PA 4MJMA 3RMJA 3OVRA 1UBSA 1H7OA 2CLIA 5FF0A 2Z6JA 1AL7A 2A7NA 2YX0A 3NXFA 4UFJA 5CPOA 1XXXA 4AF0A 1HO4A 3STFA 5EY5A 5EYWA 2NXIA 3M7WA 3USBA 3NZ1A 4GRSA 2GQAA 3OHIA 5I3FA 1JCXA 2CZFA 1LLWA 4IPJA 3UWWA 5KINA 5KTLA 3B0UX 3G1AA 4C1KA 1F2JA 2NX3A 1PHQA 3M43A 4JTEA 1IF2A 2Y63A 5HINA 5FF2A 3T7VA 3HGSA 1YDNA 4KFPA 1SZNA 3C6CA 3E9AA 4YWIA 3TXZA 1ZALA 3PF3A 2G95A 5A5WA 1TPVA 3DHDA 3LBCA 2I9EA 4GUJA 4LRTA 4LUIA 3W7QA 3L0NA 1WAUA 4LS0A 4K38A 3CHVA 2H3BA 3FS2A 2TMDA 1QDSA 2EAWA 4R53A 2CLEA 1FX6A 4R33A 3NPUA 4IGHA 4E2DA 1GWJA 3THAA 2D73A 4XBSA 1TQJA 1I2QA 3LM7A 3LXAA 2IQTA 2E6FA 3CQ0A 5LZLA 1THFD 3TCEA 2C1HA 1XUZA 3FA5A 5DBTA 3O15A 1P4CA 2GJLA 3UYCA 1QPRA 3GXPA 4LC8A 3A24A 4NZFA 2CFFA 3GKAA 2NWRA 4HNUA 2NZLA 4JN6A 1I2RA 4K7YA 3PC0A 1KM1A 1OJXA 3BVJA 4YLWA 5D2XA 1MZHA 1P1XA 4AXKA 1H63A 5G2IA 4PL2A 1W54A 3HG2A 4XTIA 3LHZA 2B7QA 3FLUA 3GYEA 2ISSA 5HJLA 1C9DA 2VEKA 4CNOA 4LV9A 1FY6A 2QCCA 1R2SA 3NG3A 3ABRA 1Z44A 3BO9A 2HSAA 4HHPA 2VFHA 5FEXA 4FF7A 1TV5A 1SO6A 4L4LA 5DBUA 3R5EA 3M1ZA 2WPBA 2H90A 2ZZ7A 3Q2DA 1XDLA 4MY1A 4IX0A 3PG8A 1NAL1 3HGRA 1KM6A 2Z6IA 2VC6A 3L2IA 4M6PA 3A5VA 4Y9AA 3G22A 4FIQA 4WXYA 5DLCA 4TO8A 3S1WA 2ALDA 1S5VA 4JGDA 5D2VA 4O17A 4JEQA 4MPQA 2G97A 4YCOA 2NUWA 2WNZA 2DZXA 1Z41A 1VGAA 3I7RA 1JQVA 1SUXA 4N9DA 3UY7A 4O1CA 3W1LA 5LSMA 1HUVA 1TTQA 3GAKA 1DL3A 4UIOA 2CLMA 5HUOA 2A21A 2QCGA 3GXTA 4QSHA 3WK3A 4NXKA 3NYZA 5A8GA 3QW3A 1KTBA 1ME9A 4Y96A 1TRIA 4HKPA 3N2XA 1UUMA 1R47A 3W7HA 5DELA 1JCYA 3W2MA 3NR0A 1LBFA 2XN2A 1VJIA 3PY2A 3CWNA 1A53A 1KFCA 3P80A 3GNDA 1JULA 3LI1A 3KAOA 5G2WA 3KX6A 4NNBA 2CLFA 4UFMA 5LNVA 2DZSA 3MP4A 2DU2A 4KFNA 2Y89A 2QUTA 3W87A 3L67A 3RNDA 2C19A 5U4NA 1JCNA 1KTNA 3W71A 2ABAA 1DQWA 1PL9A 3G1SA 2A7RA 2X16A 4IMEA 2VXNA 3NNTA 2JKAA 5KITA 1SSGA 4O10A 5KMYA 3LCHA 5GVJA 3CIXA 1OG0A 2OX1A 3MI3A 2WSRA 1O4UA 2ZRWA 4O15A 4YMZA 3MW7A 3W7EA 3G18A 1OYBA 4TR9A 3G8RA 1CI1A 3GR8A 3DKJA 3L66A 4JY8A 4LTSA 3KXQA 3IIXA 4RJEA 3TW6A 1I45A 3O6YX 4U28A 3QM3A 5F1UA 4S2BA 4MFDA 4K8HA 4UXDA 3W76A 2VFEA 4RK8A 1OVDA 1OABA 4LRSA 4K36A 3AJXA 4GFSA 3A5FA 1O94A 3P60A 3QF0A 4MJZA 3BW2A 2A1YA 1O5XA 4UR8A 1TMHA 3HPXA 2CLHA 1GYNA 1V7YA 2QR6A 3P67A 3MUXA 2OT1A 4AF0B 1OFDA 4XKYA 4O11A 3U8GA 4TMCA 3PBYA 3TFCA 4CNPA 1SO4A 3CU2A 3NQ2A 3R8RA 3JRKA 3W88A 2GQ9A 1ALDA 2PC4A 3QMSA 3PBUA 2F7FA 3MP3A 7TIMA 4O14A 3O06A 4PFMA 1GVOA 3L5MA 3HF3A 3KFTA 3EWYA 3S0CA 3QQ1A 1FUYA 4M6QA 4OWGA 2NWSA 5C55A 3P84A 5BRBA 3E12A 1WQ5A 2P10A 4XBKA 4AWUA 3W1XA 4DO5A 3GDMA 3L65A 3ZS4A 1M7PA 3OBKA 1H51A 1EWEA 4JXCA 2ZCGA 4LNYA 5DY3A 1KFJA 1EB3A 3DH7A 2VOMA 1FWSA 1IXQA 3GKFA 4NX5A 2ABBA 4LWWA 1GTEA 3KHJA 5BMXA 3VE9A 1TQXA 2R14A 2BZNA 3ATZA 1XBXA 4X22A 1OFOA 1ICQA 3DBPA 1ZCOA 3H55A 3TX9A 1BTMA 5EA9A 2J6XA 2ZZ6A 4CCCA 2RDTA 4FNPA 4OT7A 3V1PA 4YCPA 3DFPA 4OGZA 4GUFA 4JYFA 1QPQA 1WOBA 3MP5A 3CEUA 1TREA 1OFPA 3HBLA 2VKZG 3QH2A 5TQLA 4D2JA 1G4SA 2YZRA 3UZJA 3HMJG 1LRNA 2X1SA 5F1VA 1D3HA 3LCIA 4YXGA 1G67A 5FF3A 2WNNA 3DI1A 1JRCA 2WKJA 1LOLA 3E0IA 4GUGA 4I7UA 4JX4A 3DFTA 3C4UA 3TROA 1OX5A 2C3ZA 5HWJA 1VH7A 3IIVA 3LLFA 4AEOA 1HG3A 5DCDA 4JTTA 3P61A 2BWGA 3W7OA 3NM3A 2QEZA 3WK0A 3GAYA 3NQCA 3BGGA 1WV2A 5AHLA 1GG0A 2GVJA 1YADA 3DI0A 3GDTA 4IMCA 1R2RA 4RXGA 3HGJA 3M5VA 5DCBA 1EP1A 3FFSA 3BW4A 1KFKA 1QO2A 3ABQA 4UTIA 3M41A 3EX4A 5AN7A 1OF8A 1X1ZA 1S5WA 3PBVA 3M5ZA 3BLEA 4KKXA 2Z1BA 3BK0A 5C5YA 3TR2A 1SSDA 1K7EA 2DJLA 4JDYA 5E1QA 1IXNA 1OYCA 2VFFA 2B7PA 2ATSA 4JTIA 2BTMA 1O95A 5AYXA 2VFGA 2RH9A 3QFEA 2OT0A 3I6RA 2A6LA 1SPQA 2Y7FA 5HNRA 1LYXA 3M5YA 1Q6LA 2TYSA 3W1MA 1EUAA 3QZEA 1KM5A 3SW6A 5G5IA 2QJIA 5CZ0A 1SR9A 4OE7A 3ZFHA 1H5YA 3S5YA 1W3IA 3W2NA 3FJLA 4BI7A 1A5AA 2H8ZA 5AHEA 1UCWA 1EP2A 4H3DA 1Q6QA 4UMAA 4EF8A 2XFWA 5AFDA 3HG4A 4MLJA 3W1TA 2Y70A 5AYYA 3BLIA 3GX9A 1KV5A 4FO4A 3P82A 1F6KA 4JTFA 1Q45A 4NXSA 3DZ1A 3C61A 4JTHA 4M19A 4WOQA 3DFSA 1IXOA 1SW3A 3JR2A 4N6FA 1KFLA 3BG9A 1VLWA 5CPLA 3S42A 1R2TA 3KVKA 1K02A 1PV8A 3KRSA 5G4EA 1FWNA 5DCEA 4O1DA 3W1RA 3TAOA 2V2DA 2DZPA 3GDRA 1TPH1 2FIQA 4IMGA 1WBHA 3EXTA 1JR1A 3GK0A 4WY0F 4ADUA 3TC6A 1WBJA 3VFLA 2H6RA 4I7VA 2J88A 4CQAA 4QNEA 5CPMA 4BK9A 1G4PA 3LCWA 2GVGA 2UV8G 1FDZA 4LVDA 1C29A 1A5SA 2EGZA 2DP3A 1QR7A 3C2VA 3B0VC 4XKYB 1RZMA 2O7QA 3W2KA 2Q3OA 4Q32A 4S2CA 4UFHA 1H62A 4Z1DA 1YPFA 1EUNA 3O63A 3RLVA 5D33A 2E6AA 1K8ZA 1VPXA 3W23A 3D0CA 5I3JA 2CWNA 1F74A 5I3HA 4O1BA 4AWSA 1A5CA 5D03A 3V75A 4HNVA 3CLMA 1KBIA 4JX5A 5C6MA 2Y61A 3MYOA 3KVJA 1YTKA 3IIZA 4Q33A 2PCQA 3NQGA 3W7CA 1CW2A 1B3OA 5AOUA 4X3ZA 5LHFA 3E49A 3SY5A 4IPIA 4ALDA 3BARA 1DJNA 3SR7A 1ZFJA 2RDWA 5HWNA 2ZZ2A 3S5NA 1WDWA 1W0MA 1VC4A 2V2CA 4LY8A 3I7SA 1YDOA 3PAJA 4M6VA 4GBUA 2ZBTA 2CZ5A 3GNNA 4DBEA 4O54A 1SFJA 2YYUA 2X1TA 1OFBA 1OK4A 1W8SA 2Y85A 3B05A 1RPXA 4ZQRA 5CG7A 1K7XA 2V81A 3LHYA 3RF9A 1LTDA 3DAQA 4UTWA 1M5WA 1VHNA 4GWEA 3L5LA 3N2MA 3LTPA 4GE8A 4NNAA 1VCFA 3T78A 3I68A 2QUVA 1EWDA 2VEIA 2FPVA 3G1XA 5DN1A 4R34A 1Q3NA 3BV4A 5CKSA 4DF2A 1QMLA 3W70A 4C1LA 2DZVA 1FWWA 4TU1A 3LV5A 3M47A 1GVRA 1YXCA 3S6DA 5F4SA 4LV4A 2VEPA 1X8FA 3W7LA 1XL9A 2YFOA 4N02A 1FWTA 4J9JA 5AB3A 4FNTA 5IM51 3W1UA 4GNJA 3W85A 3EB2A 2NXGA 3MBFA 2XN1A 1FCVA 2PRHA 5D05A 5F2MA 3M16A 2J9ZA 1Z48A 3NA8A 4XZ9A 2ZTKA 4JTLA 3R13A 3SSJA 2NX9A 4IWWA 1VLIA 2V30A 4PA8A 3TJLA 2F84A 3W7IA 4GUHA 2EF9A 4JTGA 2FB3A 3LCLA 3O6DA 1W5PA 4JS3A 1P5BA 2VENA 4BR1A 1GVFA 3FKRA 1L9WA 1H7WA 2TSYA 3EKLA 3LXCA 3HPSA 1IGSA 3M9YA 3KRUA 3N19B 1LRQA 2WSYA 1Z42A 2BLEA 3W9ZA 4FB7A 2X1UA 3H54A 5BNKA 2Q8ZA 3NOEA 4UFLA 2KZHA 4CLMA 3PS7A 3PSVA 2A4AA 1VCGA 3C0JA 1N8FA 4QJ1A 2Y62A 1JRBA 6TIMA 1OYAA 4IOTA 4ONVA 1Q6OA 1KBJA 2OJPA 3K30A 1TV8A 4FNQA 8TIMA 1ONRA 3TUUA 3PG9A 3F4NA 3M6YA 4EWND 4UR7A 1F05A 1XDMA 5HWMA 3HG3A 4DF0A 1T99A 4O52A 3QPYA 3B8DA 2ZRZA 4QIUA 3RFAA 3TMLA 3YPIA 1I4NA 1TYGA 1NFBA 3PB2A 1QO5A 2CLLA 2C13A 4GUIA 1AW5A 1SO3A 4WJEA 5I3GA 1LBLA 2TPSA 4P61A 1OFAA 3EWXA 3G1FA 3W2UA 1G4TA 5ABTA 2ZZ1A 3IVUA 4MYXA 3N9RA 1LRTA 1SZFA 1LM1A 5J5DA 4MUZA 2J9YA 5AC8A 4MZYA 4NJGA 1TRDA 3Q58A 1GYLA 5FI8A 1QCWA 1LBMA 3CWOX 3TW7A 1SU5A 4ZZ9A 3TKFA 4G1KA 1UUOA 1F73A 1H60A 4EIVA 4O13A 4CQ9A 1YLVA 1K8XA 2QF7A 1RV8A 4Z08A 2WO5A 3UPWA 1W1ZA 3KVMA 5LNUA 2C18A 1JUKA 2JK2A 5CGQA 5HR7A 3MYPA 4MKNA 2BSLA 3N9SA 2QCFA 4IUOA 3W1PA 2DORA 3TQ0A 3FYPA 3TQVA 4O4VA 2PRLA 3PB0A 1N55A 1TJPA 1NSJA 1TPEA 2HS8A 3HPZA 3KRZA 3S8HA 4LS2A 3OEXA 4UCGA 2JGYA 2FLIA 3PUEA 2E68A 4DF1A 4N4PA 4PEKA 4BF9A 1DHPA 3IRDA 5CSRA 3RU6A 3B0PA 4Y6GA 3W6YA 3OVQA 4HPXA 5K4ZA 1F76A 3GB6A 2QJGA 3WJWA 4IX2A 3QJAA 5AYZA 3ZWSA 3I65A 5J5RA 4R7JA 3L21A 3F03K 5EPDA 3CT7A 3A21A 1P0NA 4CQ8A 2NLIA 1W31A 3I7QA 5D09A 1WXJA 1X6UA 3TV8A 4LU0A 1XKYA 4OQVA 1IXPA 1FXPA 1L2UA 5D37A 1PE1A 2X2GA 3LCGA 3FEMA 2QAPA 3IGSA 3GDLA 1X7FA 1HO1A 3DFNA 1FBAA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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