3KX6 | Genus

Total Genus 134

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	134
sequence length	358
structure length	344
Chain Sequence	MQVKLSQERAKELAENASFIASPGKGILAADESTGTIQKRFDNVGVENTEKNRAEYRSILFTTKGLGKYISGCILFEETLFQQAPNGQNMVDLLRAEGILPGIKVDKGLVTIPNTDEEVSTTGLDGLAERCQKYYNAGARFAKWRAVLSIDVKKNKPSNLSILETAHTLARYAAICQENGLVPIVEPEILADGDHSIEVCAEVTERVLAAVFKALNDHKVLLEGALLKPNMVTQGVDCKDKPAPQTVGFLTSRALRRTVPPALPGVMFLSGGQSESMATRHLNEINKCNKHPWSLSFSYGRALQSSVLKTWNGSMSNAAAAQDVLMKLAQQNSEASLGSLKYIY

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structure of fructose-1,6-bisphosphate aldolase from Babesia bovis at 2.1A resolution rcsb
molecule keywords	Fructose-bisphosphate aldolase
molecule tags	Lyase
source organism	Babesia bovis
total genus	134
structure length	344
sequence length	358
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date	2009-12-02

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00274	Glycolytic	Fructose-bisphosphate aldolase class-I

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3kx6A00

5DCEA 3QQ0A 2NX9A 4JR5A 4OT7A 3TSBA 3C2VA 5BOOA 1H7PA 3FA5A 5FF3A 4GBUA 3W70A 4YWIA 1XBXA 3UPBA 4LW7A 5D30A 2FFCA 2QCDB 1FXPA 2WPBA 3EX2A 3OBKA 4FIRA 3BO9A 3W74A 5FF2A 4N4PA 1GTEA 4E2BA 2Y61A 3W75A 1LBMA 1X8FA 4AB4A 1WOBA 5LNVA 2ZFAA 1P4CA 2EPHA 3NOEA 3S8HA 3LTYA 3UYCA 3GX9A 4BF9A 1PIIA 2NZLA 2EGZA 1WAUA 4JTLA 4H3DA 2V2DA 5IBXC 3W2LA 2I9EA 3OA3A 2DU2A 2X16A 3PSVA 5HJLA 1LOSA 1PL9A 2YW3A 4NT0A 4UTTA 1TV7A 5AHMA 2RH9A 2QCDA 1I2RA 4MZYA 3FYOA 3RU6A 2V5BA 4JICA 4E2DA 4EWND 2FTPA 5DXXA 3B04A 5D33A 4UTIA 3UZJA 1I2OA 1ML1A 3P8JA 5FI8A 1KLZA 5EA9A 3W7EA 4CNPA 1KM6A 3EWYA 4LTSA 2WNQA 3K30A 1H62A 1EX5A 3NDOA 3Q94A 3U6WA 3RK8A 3ABSA 4ZL1A 1SFJA 2R8WA 2DZTA 4M6VA 5G2IA 3W7HA 3E96A 1O60A 1SW0A 4UMBA 3W1RA 4UTJA 4N02A 1O4UA 2J9YA 4JTUA 4ONVA 5DY2A 4IX2A 1NEYA 3NEVA 5I3JA 5D05A 3LI1A 2A7NA 4TMBA 2X2GA 1W5MA 1FWTA 3THAA 3EX6A 1EEPA 2V9DA 3W72A 2H8ZA 4PA8A 4R53A 1I4NA 2P0OA 2VELA 1OFAA 3P84A 1JJKA 2CLLA 5F4SA 3S5OA 3TW7A 5KSWA 1RQBA 3MHGA 3W1XA 1UUMA 3DHFA 1OFEA 3G1VA 3EWBX 5J5DA 2NUYA 4QNWA 3MI6A 3W2UA 3L0GA 2NXGA 2JKEA 2ZRYA 3FYPA 1TTJA 3GXPA 3VCRA 3W23A 2ZZ3A 3UXDA 4Z1DA 5HUOA 2CU0A 2P1FA 2NLIA 4UCGA 2CLFA 2ISVA 2V2CA 1N7KA 3B4UA 2DZVA 5EBUA 4NVTA 4WJEA 1IXNA 5GVJA 4UFHA 1QOQA 3GXNA 1PHQA 4K7VA 3TJXA 3B03A 3NPUA 1W56A 4LY8A 3CC1A 5KMYA 1T99A 3P5ZA 3CQ0A 4G1KA 3GXTA 3IVSA 4O4WA 1LTDA 2PC4A 3QEZA 4B5NA 2CZEA 3W7MA 1W54A 1FDZA 4ZQPA 1DQWA 3DKJA 1QOPA 2PRLA 1SZEA 1QDSA 3UZ5A 3M6YA 3PB0A 4MLRA 2VFGA 4JTKA 5CPNA 4FF7A 3BK0A 1UUOA 1SO4A 1VGAA 3KAOA 1NAL1 3PC0A 2GVJA 3JS3A 4ML9A 3E0IA 4FNRA 1H63A 4HIBA 5F4WA 5H91A 5BMXA 3C6CA 5AC6A 1LP6A 3W2JA 4S1FA 2J24A 1KTBA 4M6PA 4Q33A 5HWJA 3W85A 3DGRA 2EF9A 2Y89A 3HO8A 4QM1A 3MW7A 5K9CA 1GVSA 3LLFA 5FESA 3STFA 3H55A 4O4VA 3WK1A 5CPOA 2ZDRA 3C2RA 3R2GA 3IVTA 4O53A 4X2RA 3W7IA 1U5JA 1X7FA 1ZAIA 3QJAA 2ZBTA 1AG1O 1P5BA 5DXYA 1K02A 5EMUA 4OV4A 2ZTKA 1KW1A 1Z41A 4N9EA 1OX6A 4OWGA 2OT0A 1YTEA 1TTIA 3QMSA 4O0ZA 2E09A 3NZ1A 3W7KA 5AFDA 5TQLA 3KVMA 1YTDA 1MZHA 3EX1A 4I7VA 3UWYA 3PR2A 3SR7A 2LLEA 4LS1A 3GDLA 4WXYA 4HPXA 5LKYA 4X22A 3JRKA 1OK6A 1G6CA 2ZA2A 3OIXA 4GUHA 2PCQA 3R8RA 4LC6A 5HR7A 3S5ZA 3W86A 4BR1A 4Z1BA 4C1KA 3V75A 3HGSA 3LERA 3N2MA 1W3TA 2YGYA 1S5WA 3GVGA 4N2YA 1OFBA 1DOSA 4H4IA 3DI0A 2C6QA 3W73A 1EWEA 1L6WA 1TJPA 3HJZA 4A2SA 2HMCA 3MJYA 4HNTA 2WNNA 2ATSA 2FLIA 1WX0A 4PL1A 2YCEA 1PS9A 1OFPA 3FJLA 2QUVA 3WK2A 2X1SA 4P2VA 4IX0A 3UY8A 1J4EA 1FCUA 4JIQA 5F4XA 5D02A 1GVQA 5K7JA 4JTTA 2CZ5A 4MYXA 5KZDA 3NL2A 4R33A 1GQNA 4K38A 1UB3A 4JS3A 1W37A 3C3NA 3TIMA 2E6DA 4UMAA 2G95A 3M43A 3PUDA 4M6QA 5H2ZA 4BI7A 4N6EA 1XDMA 3SJ3A 3W1MA 4UTWA 1Q6RA 1W5QA 1G67A 3N14A 1SFLA 4CQAA 1FCQA 1W3NA 1DHPA 1ONRA 4WZHA 3IRDA 2QCNA 5U4NA 1BWKA 3D0CA 3GDMA 1AW5A 1FXQA 3HF3A 3LBMA 1YTKA 1WV2A 5K2ZA 4GE8A 2NUWA 3G0SA 3LHWA 1FUYA 4ZQOA 2QAPA 4NX0A 1TIMA 3M47A 4FO4A 2A1YA 3EWXA 3ATZA 3FKKA 5L6UA 2QCEA 2GVGA 1M5WA 1VPXA 4EIVA 5LHFA 4HSNA 1LBLA 3W7PA 4NXSA 1ZAHA 5LGZA 3LDVA 4JN6A 2ZZ1A 2D73A 2QUTA 1Q6LA 4MKNA 2J9XA 4RZ4A 3W7CA 1H1ZA 4UFIA 2QCMA 3I6RA 2Q8ZA 5G1YA 4O0KA 3A9IA 3FS2A 4EVZA 4AHPA 5AHIA 1NFBA 4NJKA 5CSSA 1SO6A 3N9RA 1ICSA 4IWWA 3P61A 2DJXA 2YFNA 2A6NA 4HN4A 4TIMA 1TPUA 3NQDA 3EXRA 4WUIA 1MSSA 1JRBA 1V5XA 4Z0SA 4FB7A 1QR7A 2VFIA 3W7QA 4ZMGA 4NU7A 4TX9A 1SO5A 1BEUA 1MXSA 2KZHA 5HWNA 2J88A 3RMJA 4EF9A 2O7SA 5F1UA 1RR2A 5G1TA 4RKAA 1JCYA 3S5YA 2ISSA 4JY8A 1P0KA 3C61A 1IXQA 4FX6M 3HMJG 1K7XA 1VCVA 3WFAA 1Z42A 2C1HA 3EWZA 5I3FA 1G4PA 1PE1A 2V30A 1PVNA 3KHJA 3CT7A 3NL5A 1G4TA 1LRNA 3QZEA 2WJZA 2QJGA 1ZY9A 2Z6IA 3DFNA 5D2YA 4WY0F 4WX2A 1ZFJA 3W7JA 4IUOA 5E93A 2GVLA 3NG3A 3W1PA 4O19A 4UTKA 1SUXA 3TSDA 3ZR4A 1SPQA 2E1DA 4NXKA 1QNVA 4UFJA 3NVTA 5A5WA 4O50A 5F2GA 5G2WA 1CI1A 2BSLA 4Z1AA 3ZWTA 2VFDA 4DPQA 2BWGA 3W6YA 4LUJA 2A0NA 4IMDA 3KOFA 4O18A 3GR8A 4ZVJA 3LHTA 2H3DA 1AW2A 2CLKA 1L9WA 2R91A 2FIQA 4TO8A 4IOTA 1YDNA 5FEZA 2VFEA 1G69A 3VE9A 1R2SA 3T55A 1RVGA 3DKLA 5HMSA 1UCWA 1YPFA 4WD0A 4IXXA 3TDFA 1F76A 2QCGA 5KTLA 3L5AA 4JX5A 4AMAA 5C55A 3QPYA 4GFSA 1K03A 5DLCA 1G7UA 1FWWA 1R47A 4O17A 4O1AA 5E1QA 1SO3A 2H3BA 3NM3A 3I68A 4AH7A 1DJQA 3N19B 1ALDA 4FXSA 3SZ8A 2W0UA 4GUFA 3GNNA 1GTHA 5AHFA 4W9TA 3W7DA 3BVJA 1L6SA 5K9DA 1D3GA 2YYTA 1IIGA 3QW3A 3QPZA 3TH6A 4GNJA 2Y7EA 3P7YA 1LZOA 2CLMA 1EP2A 2GJLA 3TNOA 2C0AA 2G5WA 4JIPA 3CWOX 5G4WA 1EB3A 2FB3A 2W79A 3G8RA 2ZRWA 4CQ9A 1H7XA 5L9FA 1F6KA 2ZA3A 3AO0A 3NL6A 2B0MA 4MOZA 4K8EA 3QM3A 2BX7A 3CB8A 4PODA 5C6MA 1TREA 4O16A 4D2JA 3TMQA 3G8EA 4HHPA 1RQEA 3EKLA 4DF1A 3IEBA 3CWNA 5T26A 4AHQA 1VYSX 3EXSA 5HQEA 4UR8A 3NPVA 3M7WA 3S1XA 1KFBA 4BI5A 4UTWC 5FF0A 3ATYA 3U8GA 3BLIA 4O1DA 1OFQA 5DCBA 3MHFA 1XFBA 4O52A 3UWUA 1R2TA 2NXIA 2NX3A 5DELA 4ZQMA 2OCZA 4ORMA 4CNOA 3FLUA 1KFJA 4O54A 4AWUA 4AWSA 4A22A 3P60A 5CG7A 2YPIA 5HNRA 4YLWA 1YYAA 1NVMA 3LCHA 5D32A 4N9CA 5A8GA 3HG3A 4O14A 5AYZA 1GOXA 3U2OA 4OBTA 1H60A 1L2UA 5EY5A 5J5RA 4MUZA 3C2EA 3RLUA 1HFBA 1WDWA 2BZNA 1XUUA 1F5ZA 1LCOA 1GT8A 4RV8A 3UXAA 2FPTA 2G97A 2R14A 2VKZG 3UQNA 5DY3A 1TPWA 5DN1A 2DZPA 4NNAA 3PVFA 3W3OA 1LRQA 2E5BA 4K7YA 2HSAA 3LV6A 2ZRUA 3O8AA 4CLMA 3G0UA 2XFWA 2P10A 4O1BA 3NYZA 3TXZA 5BRBA 1HG3A 4Y8FA 1LORA 2QR6A 1LDCA 2C3ZA 3OEXA 3GAKA 3W7GA 2QCHA 4LT9A 1PCWA 3IIOA 5G4EA 1A5CA 1OYBA 2J6XA 4Q4KA 4LNYA 4N6FA 2E6YA 1T96A 4CQ8A 1IXOA 3NQEA 2V5LA 3TFCA 2ALDA 3FFSA 4IMCA 2BTMA 2A7PA 1KBJA 1FWRA 1Q6OA 4XTIA 1G4SA 2FPVA 3W1AA 5LSMA 1TRIA 4PL2A 4AWTA 5E0KA 2VEKA 5AYXA 1ZJIA 3H54A 3DFPA 2JKAA 2ZTJA 3UWWA 4MIMA 3DFSA 4ZQCA 2OJPA 1OF6A 4E0CA 4O1CA 2PRHA 1XBZA 4K36A 3SSJA 3FEMA 2OZ0A 3MWAA 3TC7A 5D04C 2V8ZA 1PV8A 1JCJA 4XBSA 3SIZA 1FCVA 1H7RA 3L65A 1TPH1 3I7RA 5F2IA 3W7LA 3QMTA 1JCNA 4H6KA 3SY5A 5U7SA 4AVFA 3VNDA 3TV8A 4A21A 2AGKA 2OMAA 4NX5A 2NV1A 3G1YA 5BMWA 4MJZA 1RQHA 5LNUA 3P8IA 3M5YA 5AOUA 3LM7A 4ZQRA 4OHQA 2ZCGA 1OX5A 2DZXA 1R46A 3RNDA 4EF8A 4XWUA 3L21A 4MY9A 2ABAA 3LRKA 4FEZA 3NQAA 4DBEA 4TU1A 1VJIA 2F7FA 4K8HA 1ZENA 5BW6A 3GZ3A 1NSJA 5C5YA 1EP1A 2C13A 4HNUA 3CTLA 5IM51 5KITA 2X1UA 5D38A 3NQ7A 1KFCA 5K9XA 1H50A 1TQXA 4O10A 1TTQA 3EEGA 4AHOA 4LRSA 4IMGA 1OX4B 5AC8A 3N9SA 1W8SA 1WXJA 1HTIA 3CU2A 3GDRA 1B4EA 4M19A 3NL3A 3C2FA 2C15A 1QMLA 1Q3NA 3NA8A 3BLFA 4A3UA 4OGZA 3HPXA 1EPXA 1TV5A 3DHDA 1OYAA 3F03K 3EB2A 4N9BA 1XCFA 1YXCA 3R12A 2FB2A 2FQIA 2TMDA 1W1ZA 3O07A 1EUAA 1TPEA 3ZFHA 1VLWA 2DZWA 3S42A 1X1OA 3SGUA 1KM0A 2Z0IA 4MYAA 2ZRZA 1AL7A 3PWAA 2RDWA 5EYWA 1VH7A 1GYLA 4JYFA 3FKRA 1GG0A 2PE4A 1OX4A 1Q6QA 1H7WA 3W87A 2VC6A 2ZZ7A 4R7JA 1LOQA 1TPVA 4YMZA 3W7RA 4QJ1A 4HNVA 3KX6A 1EP3A 1W0MA 1VR6A 3G1XA 4JYEA 4BI6A 1M6JA 3O6DA 3INPA 3PF3A 2C18A 1A5AA 3G22A 2QJIA 3S1UA 1H1YA 1ZALA 3M9YA 4LWWA 2NXHA 1ME9A 3HOJA 4N4QA 1D3HA 2A21A 3NR0A 3SGZA 3O15A 4XQ6A 2GUUA 3P5YA 3DI1A 3T7VA 3IGUA 2RFGA 1N55A 4ADSA 1J2WA 3NGJA 4LV4A 4UFKA 3OVRA 2H90A 2Y70A 2OT1A 3M5XA 3LCXA 1K3UA 3HBLA 2GQ9A 1S3HA 2QEZA 2JBMA 5AHNA 3NQVA 1TO3A 3QSRA 3KRUA 3BW2A 4UTTC 4MFDA 1EWDA 3LHYA 5F2LA 2Y6ZA 4PH6A 2EHHA 1P1XA 5KINA 3TXVA 3S5NA 3BGJA 3TCEA 5LNWA 4NNCA 1YDVA 3QMRA 1OVDA 3P82A 1TSIA 4LOCA 4GJ1A 3W2NA 1QO5A 1LM1A 3CIXA 5CPLA 1N8FA 1BKSA 5CZJA 5D2WA 3QF0A 3W1NA 4WY0B 4JNMA 3DAQA 3EX4A 3GKAA 1H7OA 5DBUA 1KA9F 2X30A 4M7TA 2NX1A 1ZHAA 2O7QA 3PSWA 1JUKA 4MVAA 3LRLA 1HO1A 3LI0A 3ZWSA 6TIMA 3E02A 4FIQA 3LRMA 1MO0A 3NM1A 2YSWA 3NQ8A 3PUOA 4NJJA 3W1TA 3CEPA 5BNKA 1VHCA 2Q8LA 4CCEA 1QO2A 1THFD 2CWNA 2ZRVA 4ADTA 1PHWA 2Z2UA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3KX6A

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Chord Diagram

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