3KX6 | Genus

Total Genus 134

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	134
sequence length	358
structure length	344
Chain Sequence	MQVKLSQERAKELAENASFIASPGKGILAADESTGTIQKRFDNVGVENTEKNRAEYRSILFTTKGLGKYISGCILFEETLFQQAPNGQNMVDLLRAEGILPGIKVDKGLVTIPNTDEEVSTTGLDGLAERCQKYYNAGARFAKWRAVLSIDVKKNKPSNLSILETAHTLARYAAICQENGLVPIVEPEILADGDHSIEVCAEVTERVLAAVFKALNDHKVLLEGALLKPNMVTQGVDCKDKPAPQTVGFLTSRALRRTVPPALPGVMFLSGGQSESMATRHLNEINKCNKHPWSLSFSYGRALQSSVLKTWNGSMSNAAAAQDVLMKLAQQNSEASLGSLKYIY

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structure of fructose-1,6-bisphosphate aldolase from Babesia bovis at 2.1A resolution rcsb
molecule keywords	Fructose-bisphosphate aldolase
molecule tags	Lyase
source organism	Babesia bovis
total genus	134
structure length	344
sequence length	358
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date	2009-12-02

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00274	Glycolytic	Fructose-bisphosphate aldolase class-I

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3kx6A00

2C19A 1RQBA 1YXYA 3P84A 5BNKA 2J9ZA 1EP1A 3KOFA 2Q3OA 5EBUA 2I1OA 4Y90A 3R13A 3QPZA 1FY6A 2FJKA 3Q58A 1PCWA 3NAVA 3NPUA 3FJ6A 4EF9A 3GDLA 4WOQA 1AL8A 2AGKA 4QM1A 5FF2A 4UTTA 4MJZA 3RFAA 2NV1A 3N73A 4AVFA 3UD6A 3S5OA 1EUAA 3LRLA 2R8WA 1B4KA 1MZHA 4CQAA 1XL9A 4UFJA 4LVDA 3N34A 3R2GA 4Y9AA 1ALDA 1IIHA 2WSYA 1OHLA 3SW6A 3I65A 3PBUA 4LT9A 3E12A 1A5SA 2P0OA 4UR8A 3WJWA 4TU1A 4N9EA 4LVAA 3BV4A 3W71A 4MVAA 1F76A 3EWXA 1MSSA 4MOZA 3G1XA 1F73A 3W7QA 4FNSA 3OBKA 4KFOA 3NXFA 5DN1A 3HPSA 3DFNA 2NWRA 1KM1A 1S3HA 4X9SA 3NQAA 3N14A 4BR1A 1I2RA 3UYCA 1VYSX 1TTPA 5DCEA 4WD0A 1HG3A 4DBEA 1K7EA 3W1QA 1YPIA 4AAJA 4BFAA 3L2IA 2CZ5A 3GK0A 1OABA 3GDRA 3P61A 1XDMA 2B7PA 1WAUA 1JUKA 1MXSA 1TPB1 3Q37A 3N3MA 4UTWA 3TAKA 2B7NA 3QMSA 4Z1CA 2ZDRA 4N6FA 3ZWSA 3QC3A 3TH6A 2QCDB 1LROA 4PC8A 5KSWA 3W7RA 4UTIA 1U5JA 4DBDA 2ZA3A 3W73A 1H51A 3ATZA 5HR7A 2EF9A 2C14A 2OX1A 1T8XA 4LS0A 1H1YA 2ZFAA 2X1TA 1LP6A 3SI9A 1EWDA 1QNVA 4HSOA 1GTHA 3QMTA 3CC1A 2TRSA 3MI2A 2V9DA 2DZTA 4DEFA 1ML1A 1X1OA 2RDWA 1LLWA 3LLFA 3MW7A 3IV3A 2FIQA 4M19A 1NF7A 4FX6M 3DAQA 3W7HA 1AW5A 4TMBA 1F2JA 3CIXA 4CQ9A 3C56A 3C6CA 3ABOA 1KM3A 4O14A 2WSQA 3CT7A 4UTHA 3S8HA 1T0OA 5FEXA 2BTMA 1IXOA 4JTEA 1VRDA 1H7OA 1LTDA 1XFBA 1OX5A 1JUBA 5AHNA 4NJKA 1TV8A 2NWSA 4WZHA 1I45A 4O1DA 3G18A 3UWWA 3TKFA 3TU9A 1FCUA 3BK0A 4M7TA 4HPJA 3CPRA 4CCDA 4LRTA 5DBUA 2V82A 1KTNA 1A5AA 5LNUA 1R46A 2OZ0A 3TJLA 1JR1A 5BMWA 3BVJA 4HNUA 1ZHAA 3C0JA 2DU2A 3HGJA 2A7PA 2W0UA 1KFEA 3IRDA 4NQ1A 3TA6A 2WQPA 3WJZA 5I3FA 1TIMA 5U7SA 1FWWA 4YWIA 3NM3A 4FF7A 3DI0A 4O0ZA 5EMUA 1TPH1 3L65A 4AF0A 1WYIA 3BW3A 1H7RA 2E5BA 5AYXA 1WBHA 5T26A 1YTEA 4Q4KA 1DKWA 4RZ5A 1DJQA 2A21A 1ZY9A 2NXHA 2ZRXA 3DKJA 2ABBA 4W9TA 1Q6OA 5LNWA 4QITA 1KFBA 1FX6A 5G4WA 1EWEA 4PTNA 1GTEA 1RQEA 3O15A 4IX2A 3W2KA 3W85A 1KM4A 2DZWA 2EHHA 3NVTA 2ZRWA 1EUNA 3BLIA 3PUDA 1W5PA 2V2HA 2EPHA 2G5WA 4MYAA 5AFDA 1I8JA 3SGZA 1G67A 4GUFA 4LC6A 1JRCA 3IVTA 3TROA 5F4SA 1VPXA 2DZSA 3BGGA 3M7WA 3MUXA 2C0AA 3LCIA 1LRQA 3O6CA 2EAWA 4BK9A 2V30A 2GVLA 4IQLA 4JTUA 4N9CA 2Y7FA 3B05A 5GVJA 3EXTA 5TQLA 3I7QA 1FWTA 4YXGA 1XUZA 2DZUA 2QKFA 3GAYA 4HHPA 1W3NA 4HN4A 4TO8A 2V2DA 1OFAA 3DU0A 3PUOA 4UMCA 4K39A 2ZZ5A 4DXVA 3VKJA 2YDAA 4YCPA 3C2RA 3UXAA 5DY3A 3NM1A 1Z42A 3B4UA 2TYSA 4ONVA 3M1ZA 4EVZA 5BMXA 1XCFA 1AK5A 2ZZ1A 2GPTA 4O13A 4IMGA 3TNOA 3S5ZA 4Q33A 1JCMP 3GDMA 2JKEA 2A6LA 2A4AA 4FNTA 4RX0A 3TR2A 3L21A 3LDVA 3GB6A 1IXQA 3DFOA 1SO3A 5CZJA 4RZ6A 2FPYA 3T55A 3W22A 2QJGA 4K6AA 1O95A 5A5WA 3CHVA 5LGXA 4NNCA 3TXZA 5HWMA 3KVLA 3VE9A 4RZ4A 2F84A 2AQWA 1YTDA 1R2RA 3IEBA 1P0KA 3Q94A 1OYBA 3N2XA 3MYOA 1WXJA 2WO5A 1H5YA 1ME8A 2HS8A 4O19A 3UXDA 1L6WA 4FX7A 1XBVA 1JRBA 3M47A 3DFSA 1V5XA 1UASA 1F6PA 3CB8A 1W3IA 3NPWA 5BOOA 3NQ2A 1S5WA 4K37A 1Y0EA 5HQEA 4FNQA 3W83A 1TQXA 3PUEA 2LLEA 4LC8A 4UC5A 2FQIA 3P81A 3HG2A 1J5TA 3KX6A 2Z6IA 3BLEA 3UWVA 2YXGA 3TCEA 3MBDA 3KRUA 4DQWA 4XZ9A 1QR7A 4K7YA 2FFCA 3M5YA 2GVJA 3PM6A 1T99A 4RR4A 4XKYA 4CLMA 4LV4A 4RJEA 3E02A 4H3DA 3IGSA 2E09A 3W1PA 4IJBA 1W37A 2VEIA 4BWLC 3LCXA 3P62A 4GFSA 3UY8A 5CPLA 1W5NA 1GVQA 2VXNA 1EPXA 1B3OA 2XN0A 4HPXA 2JKAA 3A24A 1W8SA 2E5DA 3LHTA 4LWWA 2YX0A 1HUVA 1FCQA 2ABAA 5EY5A 1RR2A 1K02A 1KFLA 4IMDA 2QAPA 3N2MA 1TV5A 4ZQNA 2NX9A 2OCZA 1N7KA 3W86A 1QPNA 2NXIA 4P61A 4XTDA 5LHFA 2BLEA 1D3GA 1I4NA 5DELA 3W2LA 4OBTA 2V8ZA 1G7UA 4HNTA 1MO0A 5DCDA 3W2UA 2ISSA 1UCWA 1JJKA 3CEPA 3IIPA 3NZRA 1TPEA 3HG3A 2YW3A 3PSWA 4HNVA 3FLUA 1TJRA 3HGSA 3RMJA 4S2CA 3M5VA 3W7NA 2HSAA 4NZJA 2V5LA 4E2DA 5G1YA 1K7FA 3UWZA 1QCWA 2DZPA 4M6QA 3TUUA 3NGJA 1F05A 4MY8A 1TJPA 1OFRA 2QCMA 4WJEA 3NL3A 4IX0A 2X1UA 3A5VA 3W2NA 3W88A 2Y62A 4IUOA 3K30A 1QMLA 5LNRA 3MI6A 1YXCA 2E6DA 3D0CA 5G2HA 1GG1A 4FXSA 2XN2A 4A2RA 2CLHA 5FF0A 1UUOA 2NX3A 2YCEA 5G1TA 4MIMA 1T96A 5HUPA 3AO0A 1G69A 2D73A 4JTKA 2J6XA 1GVSA 1K7XA 5KMYA 3G0XA 2DP3A 2C16A 1LRTA 3M16A 3CQ0A 1JCXA 3W7PA 1JQXA 1Z41A 5FF4A 1XM3A 1TPUA 3JRKA 3TSBA 4ZL1A 4O4VA 2C18A 2WV8A 3MMTA 5AHIA 1JQVA 3W1TA 1OG0A 1ADOA 4X2RA 3L5LA 4M5PA 4DF1A 3OG3A 1A53A 3HB9A 3HMJG 3WJSA 1R30A 3PY2A 3N9SA 2PCQA 1KLZA 3LXAA 3O1NA 2H6RA 5AHEA 1N8FA 2WNNA 1HL2A 4WUIA 5CPOA 3O05A 3E9AA 4DPPA 4FB7A 4MY9A 4JIPA 1SSGA 4O0KA 5I3JA 1FWRA 1HTIA 3LHZA 2QDHA 4FIRA 4O52A 3W2MA 2ZRZA 2Z6JA 1F5ZA 1U83A 1ZAJA 3C2FA 3TQKA 1KV5A 1DORA 1QO2A 4IGHA 3EWZA 4O54A 2VEKA 1S5VA 3G8RA 1GVFA 1VGAA 3QJAA 1P4CA 1DL3A 3NQMA 2H3BA 1VR6A 4UFKA 3LCGA 3NEVA 2X30A 4UTJA 4FO4A 3WK0A 1K8XA 2QCFA 3HQ1A 2CW6A 4NJIA 3UWYA 1RVGA 3P67A 1KFJA 3OA3A 4Y8FA 3CWNA 3MI3A 3A22A 1X6UA 2YYUA 3KVJA 2QCNA 2PE4A 4H6KA 4NNBA 2PURA 5DXXA 5I3HA 3G1HA 1G4SA 3F03K 3L0GA 1GEQA 4ALDA 4LS1A 2ZTJA 3LB0A 1PHWA 1M5WA 3BPWA 3FJLA 3G1SA 4JTHA 2E6YA 1NFBA 5AHFA 4RXFA 3S42A 5FEWA 3TJXA 2TPSA 3GYEA 5U4NA 3W7IA 3UWUA 1YDNA 3LHVA 4M6VA 2J9XA 3WJYA 5FESA 1SFJA 2ISWA 3JR2A 1LOQA 3O8AA 4YMZA 5EL1A 2G97A 3PG9A 4KKXA 4O1CA 2QR6A 4MZ1A 4AWSA 5CGQA 3HIJA 3STGA 3TV8A 4HT3A 5DY2A 2H90A 3W7EA 4E38A 4I7UA 4PH6A 5DCBA 1SO6A 3QH2A 4JR5A 1EB3A 4OV9A 3TAOA 4ZMGA 5D2XA 3QZEA 2F7FA 4A3UA 2JGQA 5D2YA 4FXRA 3ZS4A 3R8RA 1JCJA 5CSSA 1QDSA 3GKFA 1VHNA 3T7VA 3LCFA 3MHUA 4OWGA 3CTLA 1G6CA 3FS2A 1TRIA 3GDTA 4GUJA 1GG0A 2V2CA 2OJPA 3IIVA 4ZQOA 4HSNA 3CLMA 4JY9A 2HMCA 1SO4A 3W1MA 4TR9A 1TREA 2G95A 4DO4A 5EA9A 2HS6A 4JTJA 2NXGA 1YDOA 4M7SA 4XWUA 1K8YA 1OK4A 2A85A 1VZWA 5I3GA 2QCDA 3SECA 3NQGA 3W76A 4TX9A 4ORMA 3F1QA 3QM3A 2FPVA 3W7OA 5CZ0A 4IXHA 4EWND 2FB3A 1QOPA 5J5RA 2VEPA 4ICNA 1XC4A 2X1SA 3LBCA 1W5QA 3LI1A 4A2SA 3LTYA 4QISA 3NDOA 4KWVA 3U8GA 4IMFA 1KM2A 2A1YA 2J27A 5F4XA 2A2IA 2DJXA 2ATSA 5F2GA 4N2YA 4JTLA 3A9IA 3B03A 1QPOA 3M5ZA 4PODA 5CZTA 1W3TA 1W54A 2Y88A 1FQ0A 1KLYA 1HO1A 3W7MA 2Y85A 3C61A 4N9BA 3OVRA 4O16A 3NPVA 1OVDA 2FB2A 4UFHA 3QEZA 1YYAA 3TXVA 2Z0IA 1MEWA 4UTUA 4MZYA 3S1XA 5D03A 4JTSA 5D37A 3NQFA 5HMSA 4C1LA 3SR7A 4N4QA 3BG3A 1OX4B 3EXRA 1BEUA 4B5NA 1AMKA 3SSJA 4UNKA 5G4EA 3P80A 4EOUA 1I2NA 3IVUA 3TFCA 3CIWA 2GJNA 1X1ZA 1SU5A 3GX9A 1OFOA 2TMDA 3HO8A 4PEKA 1BWLA 1RQHA 4PCFA 4RXGA 1WQ5A 4JX5A 3QW4B 1NSJA 3TMLA 3S0CA 5EPDA 2VFDA 1SPQA 3GAKA 2NUXA 1KBJA 1ZNNA 3QMRA 4UNLA 4ZQPA 1AW2A 2B0MA 1DJNA 4GBUA 4FNPA 5K9CA 2QUTA 1YADA 3UZ5A 4AB4A 4RKAA 1JUEA 4A21A 3PBVA 3E0IA 4AHOA 2VFIA 4NJHA 3HJZA 3M5XA 4YCOA 3PR2A 4MUZA 3QW3A 4JTFA 1PE1A 1O4UA 3NL2A 4QAIA 3MYPA 3MO7A 3BG5A 1LRNA 1VYPX 3PBWA 3UY7A 4BI5A 2VEMA 3UNDA 1HFBA 4N6EA 3O16A 2ZYFA 1OFEA 2QCEA 3EB2A 4UMBA 2WPBA 3IGXA 3GXPA 3NQDA 4FNUA 4O4WA 3VCRA 2FDSA 2VFEA 3M6YA 1FDZA 2O7SA 3P74A 4OQVA 3C3NA 3GLCA 3LHWA 1TRDA 5LSMA 3DHFA 2VFFA 3L0KA 3BARA 4UXDA 4BF9A 6TIMA 2ZRYA 3DI1A 1GJPA 1NAL1 1YLVA 3GR7A 3LRMA 3W6YA 5I3KA 1W31A 1NVMA 4NUWA 3MWAA 5E0KA 3WJXA 5I3IA 3TW7A 4XUGA 4PA8A 2X2GA 1G4TA 1Q45A 3NNTA 5D30A 1J2WA 3QYQA 4BWLA 5FI8A 2Z2UA 1WOAA 4JTIA 4R34A 4ZQMA 1OFQA 1H1ZA 1KTBA 2H8ZA 4LV9A 3NQ6A 5AB3A 1TTIA 3RNDA 1TO3A 3A23A 1QFEA 3W07A 1K3UA 3NG3A 4JYDA 2ATMA 3GVGA 3NZ1A 3PAJA 4UTKA 5FF3A 1OF6A 1C9DA 2DJLA 1YTKA 1DBTA 2UV8G 3C2VA 1PL9A 4JGDA 2A6NA 2GOUA 5K4XA 5G2IA 4WXZA 1JCYA 1OFPA 5K9XA 1B4EA 2O7QA 4I9AA 3W1AA 1EIXA 1SSDA 1W0MA 4UUIA 3THQA 2ALDA 5F1VA 1TTQA 4NJJA 3YPIA 1FXPA 2DZVA 5L9FA 3LHYA 1Q6QA 5TBOA 4FNRA 3W7CA 1ZCOA 5HJLA 5FEZA 2YSWA 1C29A 2V5BA 1TMHA 2J24A 4AHPA 1M7PA 2YFOA 2GVGA 4NXKA 1LOLA 3O6DA 4O12A 1ICPA 5FF7A 4CNNA 1XBXA 3QRHA 2RFGA 3STCA 3TDFA 3UPWA 1ZENA 5LNSA 4EF8A 3QFEA 4KFPA 5LKYA 3W74A 1B9BA 1ZAHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3KX6A

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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