3L0KA

Human orotidyl-5'-monophosphate decarboxylase in complex with 6-acetyl-ump
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
MELSFGARAELPRIHPVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSLARELLQLADALGPSICMLKTHVDILNDFTLDVMKELITLAKCHEFLIFEDRKFADIGNTVKKQYEGGIFKIASWADLVNAHVVPGSGVVKGLQEVGLPLHRGCLLIAEMSSTGSLATGDYTRAAVRMAEEHSEFVVGFISGSRVSMKPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKRGSDIIIVGRGIISAADRLEAAEMYRKAAWEAYLSRLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
publication title Lys314 is a nucleophile in non-classical reactions of orotidine-5'-monophosphate decarboxylase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Uridine 5'-monophosphate synthase
total genus 101
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.10: Orotate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2009-12-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3l0kA00
4QQ3A 1F7BA 3W1NA 3EWBX 4A2RA 3G1SA 3GAKA 4NJGA 4K8EA 2HSAA 4OWGA 5HUOA 1Z48A 3LCFA 3HGOA 3NXFA 1RPXA 2GUUA 4IGHA 4MOZA 3M5VA 3NDOA 3O6DA 4OHQA 4LRTA 5G4WA 2X1TA 3L0NA 5DXXA 1BTMA 3DZ1A 2C16A 3SECA 1EX5A 3EX1A 1YDVA 3PBVA 5D02A 3S9YA 5BW6A 3EKZA 4QNEA 5LZLA 2YR1A 3LRKA 3MMTA 4X3ZA 4L4MA 1TV5A 3NZ1A 2Z6JA 5CZTA 1H1ZA 1HL2A 4ORIA 2I14A 1OABA 2QCDA 3W1QA 4O15A 2KZHA 1VRDA 1LDCA 4UTLA 1QAPA 2QCNA 2E1DA 1JCJA 5IBXA 4ZQPA 4G1KA 3BLFA 4XWUA 1C9DA 3N3MA 1Y0EA 2PC4A 1FQ0A 3IGUA 5ABTA 2ZFAA 3RLVA 4HPXA 4POCA 2R91A 3C2EA 3PF3A 3G1FA 3MBFA 4LOCA 4WY0B 1B9BA 2QCDB 3E0IA 1TTIA 3STCA 3EX2A 4MJZA 3O15A 5H2ZA 4NJJA 2CW6A 2VC6A 1A53A 5FESA 5D2YA 3LXCA 2X1SA 3PM6A 4YWIA 1O94A 3EWUA 3OVRA 5D2VA 3N9RA 1Q6RA 2Y7GA 3T40A 3W7MA 1YLVA 1JCMP 2WOQA 3RFAA 5AC7A 2CZ5A 2FB3A 1ZAIA 3NL3A 4GUFA 1S5TA 1Z42A 3QRHA 4RLIA 3GR7A 4X2RA 4NZFA 1QOQA 3LCGA 3DH7A 3ATYA 1KM1A 3W71A 5LSMA 1AL8A 5HMSA 3W1RA 4N2YA 2FQIA 3PUOA 1YXYA 1GTEA 3C2FA 1GT8A 1VC4A 1T99A 4LS0A 1XBXA 3CM4A 2GQAA 2VKZG 3TROA 3GDLA 1KFCA 1W5MA 1IXNA 1LOQA 1G7UA 4BK9A 1D9EA 3DHFA 2P1FA 1WDWA 1N55A 2FIQA 4UTMA 1FWNA 1OFEA 5FF4A 1JUBA 1QMLA 2Z2UA 3ATZA 3E96A 1P0KA 5K4XA 3VI2A 5AFDA 4JTFA 2A5HA 4RXFA 5FEPA 1Q6QA 1OX4A 2YX0A 3O05A 3E02A 3CWNA 1FDZA 4O14A 4GUHA 3DFSA 2YSWA 2F84A 2ZTJA 2YYUA 3E49A 2UV8G 4HHPA 3WJXA 5BOOA 4LW7A 4O50A 3S42A 5L6UA 3UWQA 3QSRA 2QCHA 3C3NA 3LV6A 3BV4A 3ZFHA 3S6DA 5AHNA 5CZSA 1TYGA 3S5ZA 5EY5A 4LV4A 4JS3A 1GWJA 4DF0A 3YPIA 3NNTA 3HO8A 3PS7A 1ZY9A 3LV5A 4U28A 1GOXA 4U4MA 4LU0A 3W75A 3IGSA 4J9JA 3EEGA 1TPH1 4N4QA 3SJ3A 3GLCA 3EKLA 1ZAHA 3B4UA 3L0KA 3Q94A 3W2JA 1TIMA 1EPXA 3M9YA 3O6CA 3CIXA 4IXXA 4WXYA 3P7YA 3CEPA 1NF7A 1TTJA 3Q58A 5CPMA 1PHQA 2YPIA 1ZNNA 3RF9A 4CCEA 4P2VA 1DOSA 3OBKA 4AXKA 5EMUA 4HPJA 4AWUA 2A21A 1Q6OA 3ZWSA 1I2RA 1LBFA 2OT1A 2V9DA 4R53A 4LUJA 3LHVA 3DKLA 2NUWA 5G1TA 4O16A 2O7SA 3HPSA 1WX0A 3M0ZA 5D2TA 3H53A 3SY5A 1I8JA 3C2OA 5HUPA 5F2GA 5FF3A 2VFHA 4ZQMA 1KTNA 5AHIA 4CNOA 1UJPA 4JTSA 3FEMA 2FDSA 3NO5A 3C8FA 2Q3OA 1ICSA 4ZVJA 4GJ1A 3GXNA 3GNNA 2E6AA 3FKKA 3I65A 1FUYA 1KA9F 4MYXA 4H3DA 1HFBA 5I3IA 4CCCA 3L5MA 2ZRWA 1OK6A 3R8RA 3BLIA 3GAYA 4MY9A 2I1OA 1HO1A 2FJKA 2QUTA 3I7RA 3U6WA 3EX6A 5EYWA 2CZEA 1TTPA 2A7NA 2Y62A 2W6RA 1F76A 1W31A 3A21A 1L2UA 3HGRA 3SIZA 2EKCA 1B4KA 2AAMA 2ZZ4A 4OQVA 1QPRA 1ZHAA 4GUIA 2GVGA 3M5XA 4JIQA 3SFKA 2XFWA 2DP3A 1KBJA 1G7VA 3S5NA 4UNKA 4O18A 1WOAA 5DN1A 3TU9A 1XBZA 5A5WA 2V81A 2PE4A 3PSVA 4YL2A 5CPNA 3TFXA 1F2JA 3A5VA 4UFIA 3P74A 2R8WA 2RFGA 2IQTA 5HJLA 3DXIA 1C8VA 1P5BA 2JKAA 1SO4A 3UZJA 1Q3NA 5E0KA 2VFFA 1CX9A 5G4EA 1PCWA 2Y7DA 2YFNA 3P62A 1IXQA 1TPVA 4TMCA 5F2LA 4RR4A 5HULA 3F03K 1KM3A 2A7PA 1H7RA 3HQ1A 3PSWA 5AHEA 3TAKA 5AYYA 3QQ1A 1MO0A 1ZAJA 3C56A 3BO9A 1TQJA 5I3KA 3U2OA 1LRNA 5DBTA 2JKEA 1LRTA 1PV8A 3F4NA 2VEKA 5D32A 4QNWA 5CGQA 3QZEA 1KFBA 5C55A 4IQLA 1YTDA 3UZ5A 1LCOA 4XBKA 4ZQOA 1FCQA 2C0AA 3HJZA 3BG9A 1CW2A 1JJKA 1QO2A 5J5RA 4BI5A 2X1UA 4GFSA 4JTTA 1S5WA 4WJEA 2H3BA 1IIHA 4HSOA 2RKXA 2V2HA 1N8FA 3MUXA 4JTKA 4IMEA 4JTEA 1RD5A 2GQ9A 4UFLA 2C19A 2ZRYA 1B57A 1JCNA 1SZEA 1Q45A 3LXAA 1YXDA 2BLEA 2BZNA 3A22A 1OFQA 4IPJA 3SR7A 3WK3A 3TC6A 5U7SA 1FBAA 3G1AA 1XC4A 3PB0A 1NAL1 2OT0A 5K9CA 1H7PA 2BX7A 3W88A 1BWKA 3W2NA 3W7PA 4H4IA 3W2LA 3DI0A 2VEMA 4TU1A 3T55A 3WJZA 2QDGA 3N34A 3QC3A 1LP6A 3OEXA 3W7DA 3HG2A 1LOLA 3UQNA 4RX0A 1HO4A 3N19B 1R2SA 3NQGA 3TE9A 3HMJG 2ZZ6A 3P82A 3W72A 3KOFA 2NZLA 4X9SA 4UTKA 1LYXA 1D3HA 3NL2A 4RK8A 4S1FA 3TAOA 1SU5A 3MP5A 3OA3A 5EA9A 4CNPA 3L68A 3W07A 1L6SA 5C54A 2R14A 3GDRA 5AYXA 1H7OA 3N14A 3KVKA 2Y61A 2RDWA 3NQCA 1KTCA 3B04A 4M6QA 3VFLA 4O17A 5I3HA 1RVGA 2LLEA 1YDNA 1VH7A 3H55A 3OVQA 3WJSA 1R2TA 3QPZA 1VJIA 1RQHA 3TV8A 4ALDA 4XKYA 2CFFA 4WOZA 5F1VA 1A5BA 1NVMA 2FTPA 4OV4A 3R2GA 1SSDA 1OX6A 3B03A 1LM1A 3PUEA 5LNSA 3VKJA 3PWAA 4ORMA 4RJEA 3GYEA 3TNOA 2V8ZA 4WD0A 1OFAA 3NQVA 1VHNA 3LCHA 3UXDA 3NQFA 4XKYB 2E77A 3G18A 1W0MA 3F1QA 5CKSA 5DLCA 4N4PA 3RNDA 2DZXA 1VYSX 3RK8A 1FDJA 5LNRA 4K7VA 3S1VA 3UWVA 3C0JA 4NJIA 5G5IA 1ME7A 1OF8A 1DL3A 3M7WA 4NNAA 5K9XA 2G96A 3W85A 5DCEA 1TJRA 2E09A 3O16A 1KM4A 2F7FA 4HSNA 1VCFA 5BRBA 1SR9A 3P60A 1YPIA 2A1YA 3W1MA 5IBXC 1T8XA 1DHPA 1DVJA 1M7PA 4EVZA 2VEPA 4JX5A 3RLUA 4YXGA 1H51A 1EA0A 4EF8A 2J88A 2VENA 4UNLA 3PBUA 4ADUA 4ZZ9A 4Y96A 4IOTA 3TQ0A 5CSSA 3NQDA 3HGJA 3LCXA 4M6VA 4Q4KA 3MI6A 5LHEA 3MBDA 1V7YA 1EP2A 4JY9A 3T44A 1XL9A 4LVAA 3W76A 1QDSA 3BPWA 3BG5A 4JY8A 1FWWA 2V5LA 3N2MA 4Z0SA 1VQTA 4WQ6A 3BLEA 3M5ZA 1KM6A 3NPUA 2O7QA 2FPYA 5KZDA 2C1HA 3IIVA 1R2RA 3HGSA 2C13A 1ZENA 3EXTA 2ZRZA 3GK0A 1O5KA 2NXIA 1W5QA 3I6RA 3T7VA 4WY0A 4RXGA 3BK0A 2GOUA 2GJLA 3FLUA 4TR9A 1NSJA 4K7YA 3UXAA 3LBMA 2CLMA 1DQXA 1QWGA 3MWAA 4E2BA 3W7RA 5HWJA 4UTWC 1VHCA 3CU2A 1WV2A 4OT7A 3TCEA 4Y9AA 2GQ8A 1GVOA 1P1XA 3DFOA 3IV3A 2V30A 4ICNA 3N73A 3W2KA 3T78A 5D38A 2ATMA 1SUXA 1WQ5A 4UFJA 3TIMA 2NXGA 3QW3A 3TKFA 2YFOA 3GIYA 3TX9A 4YLWA 4Z1BA 4O1DA 2RDTA 4NXSA 2RDUA 4PODA 2B7NA 3EX4A 4I7WA 5TBOA 3IIZA 1S3HA 3L65A 3LRMA 3UPWA 2H8XA 5D09A 3R89A 4DF2A 5KITA 1SPQA 3CQ0A 3C4UA 4K8HA 1OYBA 1OFPA 4LS1A 3CT7A 5E1QA 2X2GA 4O28A 1TPWA 4UCGA 4O1CA 5AC6A 2A2IA 4B5NA 1XFBA 5KSWA 1PE1A 2PURA 4BI6A 1GG1A 4Q32A 1G4SA 4Q33A 3H54A 2FB2A 5MHBA 4KKXA 1Z44A 3ELFA 4FXSA 3UWZA 1MZHA 3GZ3A 1SZNA 3TA6A 5I3JA 3IVSA 3R5EA 4JYEA 2DJXA 2DZUA 4AMAA 1WXJA 4TIMA 3LHTA 2VELA 3KXQA 4NX5A 1O60A 1SFLA 1DQWA 4BFAA 3IIPA 4FNQA 1GPWA 1TREA 4HNVA 1W54A 3STEA 4KWVA 1G69A 2B7QA 1XDLA 3HB9A 1X8FA 3PBYA 4DQWA 2ISWA 2QUUA 3UPBA 1OF6A 1XI3A 3L9CA 1YPFA 3M47A 1VGAA 3C2VA 3B0VC 3UD6A 3B06A 4JEQA 1LBLA 1K3UA 1ZALA 3FIGA 5D2XA 1NF0A 3F4WA 3G1HA 5LGZA 1FWRA 4LT9A 3DFPA 4UTJA 4HT3A 1K8XA 5D04C 5I3FA 3CTLA 3MO7A 4OBTA 1ME8A 4MVAA 3CPRA 4O0KA 4XZ9A 3L5LA 5C2XA 2HTMA 2X16A 1GQNA 5TIMA 1TPFA 4W9TA 4FF7A 3ZR4A 4JYFA 4UUIA 4DELA 4R33A 4FX6M 1KLYA 4K36A 5BNKA 3L66A 1EP1A 3BGGA 4QM1A 4BWLC 1X7FA 4N9EA 5FF0A 4FNTA 3UWWA 3C61A 3UWYA 2YYTA 4TO8A 3S5YA 2CU0A 1GTHA 4NVTA 1D3GA 3W9ZA 2VFIA 2WNNA 3NGJA 4I7UA 3K30A 3W1AA 3B8DA 1JRBA 3FYOA 4MPQA 1AK5A 1KLZA 4AVFA 3USBA 1YXCA 5KZMA 2Y89A 4LC8A 4RZ5A 1A5SA 1WA3A 2ZTKA 3DENA 4IMFA 1RR2A 2DZPA 2NX1A 3NG3A 4UFKA 4IUOA 4NJKA 3EWZA 5HINA 5HWNA 3QMSA 3TXZA 3EB2A 3TSDA 3HG4A 1TPB1 1KV8A 1G4TA 2ISVA 1GYLA 3BG3A 3TUUA 2H6RA 4AF0B 1QPNA 4D2JA 4JTLA 1U5JA 1HG3A 3R13A 4DEFA 4IWWA 3LLFA 2H3DA 4LUIA 1GYNA 2C14A 2VFEA 4ZQCA 3CEUA 3NPWA 3NQAA 5AN7A 3MI2A 3SGUA 4NNBA 1FX6A 1GVFA 1OFRA 3HG5A 1OJXA 1NEYA 1KTBA 1K03A 3QMRA 4FNRA 3LI0A 5F1UA 3W70A 3IGXA 1TO3A 3UNDA 3E12A 3NAVA 2Q8ZA 3DFNA 4Z0JA 4O4WA 2QR6A 2E5DA 2QUVA 1KV5A 3W7QA 2ZRUA 3G1VA 2PRLA 4O12A 3IIOA 3PC0A 3MP3A 2WQPA 2W79A 3KRZA 4O57A 4O1AA 4JTGA 2FPVA 5C6MA 2QEZA 3FFSA 4N9DA 3EWXA 1LRQA 4NUWA 3VE7A 3W87A 1LOSA 1TMHA 1PCKA 5SWUA 3M16A 5AHLA 2CLEA 1SW0A 2B7OA 2FLIA 4JIPA 4HNUA 5AHMA 4NQ1A 3P8IA 4YCOA 1DV7A 1T96A 2DJLA 4O52A 2NLIA 1OVDA 1LORA 1RZMA 1ICQA 2CLKA 2DORA 3LERA 8TIMA 2ZA2A 3LTYA 3W7LA 1PS9A 2VXNA 2VOMA 4ZMGA 3NQ2A 5BMXA 4JXCA 4UTHA 4IMDA 4GUJA 3W3OA 4LTSA 3TQVA 4XTIA 3W1LA 5KINA 5DY2A 3KRUA 4JDYA 5HR6A 4A2SA 2PRMA 4HNTA 3W7JA 4WXZA 1WBHA 5CZJA 1I4NA 3PAJA 5DELA 3TJLA 2Y7EA 1XXXA 2JGQA 2J9ZA 2YCEA 4CQ8A 4JD4A 3S1WA 4GNJA 1SO6A 1G4EA 4JDBA 3GR8A 1JQXA 1M7OA 5A8GA 3QEZA 1VCGA 1UUOA 3QMTA 4OV9A 1KM5A 5DCDA 3DGRA 3KVLA 4IMCA 1XDMA 2JK2A 1VPXA 4M6PA 3OIXA 7TIMA 2DZVA 4DPQA 1VS1A 3IEBA 2QCEA 3MI3A 1VLWA 2E6YA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3GC4 A;  3VIF A;  3MZ2 A;  3EWB X;  4A2R A;  3G1S A;  4NJG A;  4K8E A;  1KQY A;  2HSA A;  1DXE A;  4IIH A;  4B2D A;  3AXH A;  3PFR A;  1ZZM A;  2GUU A;  1HJS A;  2V68 A;  2R1K A;  3K4A A;  4G56 A;  2X1T A;  1BTM A;  2C16 A;  1EX5 A;  1YDV A;  3CHC A;  5D02 A;  1B5T A;  2YR1 A;  3LRK A;  4L4M A;  3NZ1 A;  1HGY A;  9XIA A;  1H1Z A;  1HL2 A;  4ORI A;  1A5N C;  2PDF A;  2I14 A;  2QCD A;  4QR6 A;  4UTL A;  1QAP A;  1E1E A;  3QY8 A;  2QCN A;  1UYQ A;  1JCJ A;  1Z6K A;  4F0M A;  3QV8 A;  1Q63 A;  1EJ7 L;  1E1F A;  3A3W A;  4GVH A;  5LIY X;  1A3H A;  1JNE A;  3IGU A;  5ABT A;  3RLV A;  4HPX A;  4B5X A;  3C2E A;  3CPU A;  1QUM A;  3G1F A;  3PZT A;  4YVX A;  1B9B A;  2QCD B;  4JIH A;  2HV5 A;  3STC A;  1URO A;  3EX2 A;  4PRR A;  1NQ6 A;  5AKQ A;  3O15 A;  1J0Z A;  1A53 A;  5E6Z A;  3VK5 A;  2XHY A;  3VM7 A;  1O6I A;  1QNQ A;  3PM6 A;  1DTU A;  3IUD A;  1O94 A;  3EWU A;  3OVR A;  4Q3M A;  3PTD A;  2HBX A;  1XR2 A;  3KP0 A;  4RLI A;  4X2R A;  3LCG A;  3ZJ8 A;  3PAN A;  3DEC A;  4HME A;  2V6A A;  5F7U A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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