3L5AA

Crystal structure of a probable nadh-dependent flavin oxidoreductase from staphylococcus aureus
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MYRYKPLLQSIHLPNGIKISNRFVLSPMTVNASTKEGYITKADLAYAARRSNSAGMQVTGAAYIEPYGKLFEYGFNIDHDACIPGLTNMASTMKQHGSLAIIQLAHAGRFSNQAILNFGKVYGPSPMTLHSPIEHVVIAMSHEKINSIIQQYRDATLRAIKAGFDGVEISIAQRLLIQTFFSTFSNRRTDHYGADSLKNRARLCLEVMRAVQEVIDKEAPDNFILGFRATPEETRGSDLGYTIDEFNQLIDWVMDVSNIQYLAIASWGRHIYQNTSRTPGDHFGRPVNQIVYEHLAGRIPLIASGGINSPESALDALQHADMVGMSSPFVTEPDFVHKLAEQRPHDINLEFSMADLEDLAIPHAAFKDIVKMMDYGEGLKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Staphylococcus aureus
publication title Crystal structure of a probable NADH-dependent flavin oxidoreductase from Staphylococcus aureus
rcsb
molecule keywords NADH/flavin oxidoreductase/NADH oxidase
total genus 125
structure length 381
sequence length 381
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-12-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3l5aA00
3STGA 3NAVA 5HWMA 2WSRA 5EL1A 2GQAA 4Z1BA 4NJIA 2GJNA 3W6YA 1UUMA 3QQ1A 3LHWA 4HPXA 4R53A 1F73A 3C2EA 4RK8A 2VELA 2Y89A 5BW6A 4GUIA 3PG9A 2FLIA 3G3DA 4AWUA 1PCKA 1KW1A 4JR5A 1QAPA 1TQXA 1VS1A 1R46A 3I65A 1XFBA 4N9CA 3FA5A 3M44A 5A5WA 3BK0A 3C0JA 4JTTA 1FUYA 3O15A 3IGUA 4S2CA 4ZQPA 1H7PA 2J9YA 2OT1A 3W22A 2J88A 4O57A 1TV7A 4ADUA 3NR0A 3EWUA 5FEZA 1XUUA 3LRLA 3VNDA 3QFEA 4UMCA 5KINA 3O07A 4S1FA 1KA9F 5HNRA 1O5KA 1TJRA 3ZWSA 3MP5A 1JCJA 1A5AA 5BNKA 5E1QA 2H90A 1DQXA 4JTFA 4OE7A 4M6PA 1WX0A 2J24A 3P74A 3GDMA 1YXCA 1NF7A 4MYXA 3UQNA 4JTSA 2ZRZA 1TSIA 4CCDA 2DU2A 2YX0A 3QMTA 1GOXA 2RHGA 4H6KA 4CLMA 1DV7A 2FB3A 2X1TA 1L9WA 3JS3A 3RLVA 3UWQA 3EX3A 2LLEA 3G0UA 3IVUA 3R5EA 4LUJA 1WAUA 2BXVA 4FNTA 1JCMP 3H55A 2EHHA 3QPZA 1YYAA 1QOQA 3ELFA 3G24A 1JQXA 1JULA 1ZHAA 3MBFA 3ABQA 4O19A 5LGXA 3G1VA 4OHQA 2VXNA 1DBTA 4O54A 1XCFA 2RFGA 3S5OA 1YXYA 4M6VA 4EOUA 3QRHA 3STFA 4IGHA 3G3MA 5HUOA 1GG1A 2YSWA 3C52A 5DY3A 4XTDA 2QJGA 1JCLA 4BFAA 1GTEA 3O05A 3FOKA 1YTKA 2VEPA 3TKFA 4LS2A 4N9EA 4K6AA 2C1HA 5LSMA 1JUEA 3DHFA 1M7OA 4FIQA 1FWSA 3Q58A 3BO9A 3EWXA 1K8XA 3O63A 1I2PA 1ICPA 3FLUA 1R2SA 4IMFA 3C2RA 4R33A 5HINA 3SW6A 3NQEA 3M6YA 2I9EA 4UCGA 3LI0A 5HQEA 1HO1A 2CWNA 1JUKA 1LDCA 3LI1A 2GQ8A 4ZVJA 3W1AA 4O17A 2Y70A 1XC4A 4PFMA 1XKYA 4JX5A 1JVNA 4PCFA 1Z44A 4O0ZA 1A5CA 1UBSA 2A5HA 1FWWA 3W73A 1KBJA 1U5JA 1NSJA 4QAIA 3B0VC 4FNSA 5CPLA 3NPXA 1FCQA 4JDYA 1T96A 3W07A 3WK0A 5D2YA 2E1DA 3QH2A 5H2ZA 1I8JA 3S0CA 3S1WA 3G18A 1BWLA 1X8FA 4IQLA 1GWJA 3PF3A 3A23A 3UXDA 1FDYA 1DJNA 3GZ3A 1RQBA 1GVSA 4TX9A 3IEBA 4GWEA 1DJQA 4ZZ9A 3HB9A 3CHVA 1CW2A 2WSQA 2OMAA 1M7PA 4O15A 1TIMA 2HS8A 4DF2A 3P8JA 2YW4A 1G4SA 3PWAA 2B0MA 4P2VA 1H62A 3HG5A 1HO4A 2YYUA 3O6YX 1XM3A 4R7JA 2CLEA 2ZRUA 1O94A 1R30A 1HL2A 3JRKA 2RKXA 5LHFA 3GVGA 1GEQA 4LRTA 3EWZA 1C9DA 1FDJA 3NL3A 1KTNA 3OVPA 4LVAA 3GNDA 2Y62A 3LV6A 4JGDA 3MHUA 3LB0A 4IXHA 4OU1A 1QPRA 3BLEA 1IIHA 4J9JA 1TPEA 2ZRWA 2V2DA 2ISWA 1NVMA 4MPQA 2W79A 4FB7A 3TFXA 3SIZA 4UMAA 4JNMA 4RXGA 1S5WA 1TV5A 1H1YA 3G8EA 2ZZ5A 4Z1AA 2P0OA 3NZRA 4DF0A 5K9XA 4TO8A 2QR6A 3U2OA 3T78A 3L9CA 1V5XA 2NXIA 3QSRA 3TW7A 2C0AA 1W3TA 3NA8A 4KKXA 1AW5A 4RZ6A 3F4WA 4C1KA 5D03A 1VYSX 4QM1A 4MJMA 3CPRA 2WOQA 3TA6A 4GXMA 1D9EA 3D0CA 3NXFA 4XQ6A 4HNNA 2CLHA 4RXFA 4K7VA 2H3DA 3DZ1A 3W3OA 3HQ1A 4DBEA 5IM51 3P81A 1XUZA 4UTJA 4GC4A 1FWNA 1G7UA 2NLIA 1O5XA 3QPYA 4IMEA 3C2VA 3HIJA 3KX6A 1ME8A 1OK6A 3KVMA 2FQIA 4LTSA 3W2UA 2O7SA 1DOSA 4I9AA 4N9DA 1PE1A 4N02A 1H60A 3THQA 4PA8A 2YFOA 3W1XA 2C6QA 3HPSA 3PR2A 2FFCA 2YW3A 4EIVA 1Y0EA 1FDZA 1P0NA 4O4VA 3NQFA 3NZ1A 2GQ9A 5D33A 5AC7A 2QEZA 4AEOA 4MOZA 2VKZG 4Z0SA 3G1SA 3B05A 3KVJA 4BWLC 3PUOA 3L2IA 1NEYA 3QQ0A 2V8ZA 3I7SA 4M5PA 3L21A 3LCIA 2ZQ0A 1JCYA 3NQ6A 4HPJA 4JTEA 3W7RA 5AHNA 4MFEA 5EYWA 1IIGA 4WY0F 3KRUA 3LLFA 4UTTA 3W87A 1OFPA 2QCGA 1GVQA 3W7JA 1E51A 1LROA 3UWYA 3TSMA 5G5IA 5LHEA 2E6DA 4QITA 1OYBA 4O16A 3EXRA 1EWEA 2H3BA 1F7BA 3HGJA 4YL2A 2WNZA 3MHGA 3Q94A 4FO4A 2DZXA 1VHCA 4NZJA 3W83A 1SO3A 4X3ZA 3WJXA 5CG7A 1KM2A 3BARA 4UTWC 1TPH1 1LP6A 5HJLA 4ZQOA 1KM5A 2WNQA 5J5DA 5D02A 3DFOA 4X2RA 2QAFA 5AYXA 1W5QA 3GK0A 4LU0A 3BGGA 2I14A 1KM4A 2ZCGA 2WO5A 3G1YA 4AWSA 1EA0A 4BWLA 3CWOX 4BI7A 1EP3A 3L0GA 1AW2A 3KVKA 1XBVA 1KFJA 5GVJA 4U28A 4TMCA 4A29A 3NQMA 5DLCA 4O13A 5CPOA 4ADSA 1FBAA 2VENA 3MW7A 1IXNA 1SU5A 1PV8A 3M5ZA 2P1FA 3KHJA 3P82A 3TFCA 2ATSA 3TU9A 3TAKA 1O60A 3TNOA 3WFAA 4UR7A 1OVDA 3MUXA 2ZBTA 5CSSA 1ZALA 3M5XA 1GG0A 4O14A 1LRTA 3MWAA 4UFHA 2VFGA 2A6LA 1KV8A 3LTSA 2YPIA 3P61A 3QMSA 3USBA 4YLWA 4UTWA 5F1UA 3DKJA 1JCXA 2VFIA 1H50A 1TPUA 3R8RA 2HSAA 3T44A 5AHLA 3MO7A 3JR2A 1OFEA 2B4GA 4A2RA 1ADOA 4E2DA 1R2RA 1RZMA 4JDBA 1YPIA 2EGZA 1H7NA 4TMBA 1MO0A 1RR2A 4MLRA 2CZ5A 2CLMA 5IBXA 4JN6A 4HNVA 4ML9A 3TXVA 2TRSA 3C56A 2JKEA 1TCDA 2C13A 1XI3A 4YCPA 1SSGA 4JTGA 1P0KA 3E96A 4MKNA 2FPVA 4CQAA 4NJKA 3UPBA 1SO5A 5AYYA 4LRSA 4AHQA 5DXXA 1VCFA 2G96A 4FX8A 1YXDA 4XBKA 3FFSA 3M47A 5CGQA 3P7YA 3LCXA 1ZCOA 3N3MA 2IQTA 5I3IA 5EKYA 5AN7A 2VFEA 3A24A 5LKYA 2CLOA 3PSWA 4EWND 4ZL1A 1OFBA 1H1ZA 1YDNA 4UFJA 1QFEA 2P10A 3A9IA 3MMTA 5FEPA 3TW6A 1JQVA 1O95A 1T0OA 4AXKA 3NPWA 2BLEA 2QCMA 4Q4KA 4MY1A 3PUEA 2X1RA 2NV2A 2NX3A 3GKAA 3M41A 4X22A 3TROA 2Q8ZA 4KFNA 3NL6A 3NQ2A 1RQHA 1VLIA 2Z2UA 4FX6M 5D2WA 3IIPA 3I7RA 4MFDA 2RDWA 2I1OA 4KFPA 2GJLA 3TIMA 4JY9A 1NF0A 3LBCA 4IMCA 1OJXA 3IGXA 3W1RA 2BSLA 5AYZA 1TPWA 2QAPA 3HG2A 3SI9A 2Y88A 1N55A 1LBMA 1LOQA 2Y7EA 2E6AA 1M5WA 1OX6A 1OFDA 4JYEA 5LNUA 3MJYA 2H8XA 3DFNA 3OEXA 3CTLA 3TQKA 1T8XA 1OFQA 4KWWA 2JKPA 1Q45A 4X9SA 3BGJA 3ZR4A 4YXGA 4E0CA 3BW3A 1QR7A 4LWWA 2QCDB 1ZJIA 5F2MA 1K3UA 4AVFA 4UTMA 1OYCA 5BRBA 3W7IA 1PIIA 4Z08A 3GAKA 4CCCA 3SECA 3B03A 1QPOA 1RD5A 3QZEA 4LV4A 5I3JA 3I6RA 2QJHA 2OZ0A 1FX6A 2ZRVA 3G1HA 1LOSA 3W7GA 3INPA 1DKWA 4XKYB 1IF2A 4Y6GA 4B5NA 1G7VA 3W2KA 4FXSA 4BI5A 4CNNA 4TIMA 4Z1CA 4DO4A 1TTQA 2EAWA 4XWUA 4PL1A 3BLFA 2ZA1A 1Q6RA 2J9ZA 1H61A 2A6NA 3P67A 3P8IA 1U83A 5J5RA 2W0UA 1KTCA 5G1TA 3G22A 4N2YA 4Z1DA 3UXAA 2A7PA 3W86A 4QSHA 2E09A 3QYQA 3M0ZA 1HFBA 1KBIA 3TQ0A 1PL9A 4GUJA 1BTMA 5LZLA 1O4UA 4LY8A 3TX9A 3P5ZA 3W7DA 2B7NA 3ZWTA 1OF6A 2CZFA 1W5NA 1GPWA 2OX1A 4NXSA 1FWRA 1WYIA 2F84A 5BMXA 4ZQRA 1XBZA 2HMCA 2DP3A 5ABTA 4O1BA 2V30A 2QCLA 3WJZA 3GR7A 2QUTA 1LM1A 2GVJA 3RF9A 4LVFA 1KFBA 2AQWA 2B7PA 3T55A 3DXIA 3W9ZA 2PRMA 4FNQA 1LCOA 5CKSA 5FI8A 3FKKA 5LNRA 4NJHA 1JRBA 4FXRA 3DI0A 5CSRA 1I2RA 1N8FA 3TJLA 3L65A 1WOAA 6ALDA 2WJZA 4K8EA 3O6DA 5TBOA 1H5YA 4DF1A 3BG9A 1LLZA 3W74A 3WJWA 4I7UA 2XFWA 4UNLA 2R14A 1KFLA 1SSDA 3EB2A 3SSJA 2OT0A 3TE9A 1F74A 2G95A 1VCVA 5DCEA 3HPXA 1QO5A 2NUWA 2ZA2A 4DELA 1W1ZA 3QW4B 1QO2A 1FXPA 3W2LA 1A5SA 3FJLA 1UUOA 2Z0IA 3DFPA 2C18A 4HKPA 4XZ9A 1K7FA 3PVFA 4GUGA 4OV9A 3LXAA 3MI2A 2V0TA 2VEMA 4PTNA 1D3GA 5FF0A 3NQ8A 4O1CA 3CEPA 3PY2A 3B0PA 1WA3A 4UFKA 1H51A 3TR2A 3NGJA 3N19B 4S2BA 5AOUA 4N6EA 2PE4A 2C3ZA 2C15A 4ZQMA 3TSDA 1L2UA 3W75A 3LERA 3TUUA 1L6WA 4RCXA 3W85A 2H6RA 2YDAA 3S1VA 3BV4A 5AHEA 3BPWA 5AHFA 3NM3A 4WOZA 3NYZA 3W2JA 3MI3A 3G1XA 5H91A 4IMDA 3UZ5A 1TTJA 4XUGA 4LS1A 1MSSA 1EUAA 3WK3A 3EXSA 3E02A 1SW7A 1KFEA 1ME7A 3R89A 2ZZ6A 3N14A 3DENA 3WJSA 4CCEA 4AF0A 1H7WA 4UFIA 3TH6A 4QNWA 3N2MA 3STEA 1QCWA 4K7YA 4IUOA 5D30A 1R47A 5DBTA 5LNWA 1I45A 3UY7A 1S5VA 4LW7A 1TPDA 5FF4A 2CLKA 1D3HA 4ICNA 4RX0A 2NZLA 2GVGA 3LHVA 4LNYA 5F2IA 1B57A 5I3KA 1K8YA 3DHDA 5K7JA 3M1ZA 4DO5A 3KFTA 4DXVA 3RNDA 3W1TA 1GZGA 1TTPA 4LVGA 4JTKA 3NL2A 4MY8A 4PL2A 3A21A 3W7HA 2ALDA 2V9DA 1AL8A 4WY0A 5DBUA 1KLYA 4IJBA 4DBDA 3NQGA 1EUNA 2X1SA 2Y6ZA 2TPSA 5TIMA 1OFOA 5K9DA 5KMYA 3PAJA 4JYDA 3RLUA 4HNUA 4GUHA 3IRDA 1G67A 5E0KA 3EWBX 3DBPA 4UTKA 1XBYA 4O4WA 1W31A 1YTEA 1GTHA 4UUIA 3CIXA 5I3FA 2VFFA 1YPFA 2VC6A 1W3IA 5KTLA 2YR1A 2E5BA 2GPTA 3L0KA 1ICQA 3N9RA 3QJAA 5LNVA 1AL7A 1JRCA 2A4AA 1THFD 2A0NA 5AFDA 1OYAA 2TYSA 2FB2A 2CZDA 3UYCA 1V7YA 1PHQA 2FTPA 5HUPA 4GJ1A 5K4XA 2CFFA 3MBDA 3S1XA 2E6YA 2QUUA 2ATMA 2ZZ4A 5CZSA 2V82A 4I7VA 3HBLA 1OFAA 2EPHA 4FNUA 1AW1A 3DFSA 1DQWA 4O1DA 8TIMA 2C19A 1SW3A 3ABRA 1P4CA 3BLIA 4Y90A 3SY5A 1LORA 3NOEA 3NPVA 5K3VA 2NXGA 5G2IA 3KAOA 3O8AA 3R2GA 2QCCA 3NO5A 5U7SA 1ME9A 2NUYA 4Y8FA 5D09A 2V81A 2A85A 2RH9A 3TAOA 3DH7A 3A5VA 3E12A 4CNPA 3NDOA 3NQAA 5DELA 1W8SA 4O0KA 1L6SA 3FEMA 3YPIA 1ONRA 1VLWA 1TV8A 1VHNA 1B4KA 3OG3A 3IIOA 2VOMA 3S8HA 2E68A 3QC3A 3SJ3A 1BKSA 3LHZA 3PSVA 2RDUA 3OIXA 4AWTA 3IIVA 1I2NA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1CGT A;  2GQA A;  4Z1B A;  2GJN A;  3W6Y A;  1UUM A;  1FWI C;  1HW6 A;  1O5Q A;  3LHW A;  4J2M A;  3DYM A;  1F73 A;  4FOK A;  2W66 A;  4DWD A;  4RK8 A;  2VEL A;  5BW6 A;  1W1P A;  2ZUN A;  3PG9 A;  4H6E A;  4AWU A;  1I0B A;  1PCK A;  1KW1 A;  2DFA A;  2I7G A;  1TQX A;  2CBJ A;  2J7C A;  4KW2 A;  3I65 A;  4KRU A;  2NT1 A;  1XFB A;  3M44 A;  1R6W A;  3R0D A;  4JTT A;  3NEH A;  3O15 A;  3IGU A;  1US0 A;  3UZW A;  4ZQP A;  1ECE A;  2A3B A;  3U48 A;  1IYX A;  3W22 A;  5HME A;  3CV6 A;  3G5E A;  4ADU A;  2XSX A;  2ZX7 A;  3KP0 A;  2O92 A;  3LPF A;  1ELS A;  3MCM A;  1K4G A;  3TLQ A;  1NTH A;  4H04 A;  1CXH A;  3MP5 A;  5E1Q A;  1DQX A;  4JTF A;  1WX0 A;  3GDM A;  1YXC A;  1F6Y A;  3UQN A;  4JTS A;  1TSI A;  4LBS A;  2YX0 A;  1GOX A;  3GG7 A;  2RHG A;  1JZ4 A;  3OGV A;  3JS3 A;  5GJM A;  3G0U A;  3IVU A;  3A3X A;  5FJU A;  1BLI A;  5GJP A;  2Z28 A;  4HB7 A;  2YKK A;  3RIT A;  3B97 A;  4CNU A;  1E0W A;  1JPI A;  3G24 A;  1JUL A;  1ZHA A;  2OQH A;  5LGX A;  2IXU A;  1DBT A;  3N9K A;  1JYV A;  2RFG A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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