3L5MA

Xenobiotic reductase a - coumarin bound
Total Genus 121
50100150200250300350020406080100120
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
359
structure length
359
Chain Sequence
SALFEPYTLKDVTLRNRIAIPPMCQYMAEDGMINDWHHVHLAGLARGGAGLLVVEATAVAPEGRITPGCAGIWSDAHAQAFVPVVQAIKAAGSVPGIQIAHAGRKASANRPWEGDDHIAADDTRGWETIAPSAIAFGAHLPKVPREMTLDDIARVKQDFVDAARRARDAGFEWIELHFAHGYLGQSFFSEHSNKRTDAYGGSFDNRSRFLLETLAAVREVWPENLPLTARFGVLEYDGRDEQTLEESIELARRFKAGGLDLLSVSVGFTIPDTNIPWGPAFMGPIAERVRREAKLPVTSAWGFGTPQLAEAALQANQLDLVSVGRAHLADPHWAYFAAKELGVEKASWTLPAPYAHWLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
AH8 (307-316)EMPTY3H1 (3-5)S1 (8-10)TII'1 (10-13)TI8 (223-226)AH2 (76-92)S2 (13-15)S12 (321-323)S3 (19-21)TVIII1 (50-53)S4 (52-59)TIV1 (29-32)TI1 (67-70)3H2 (62-64)S5 (95-101)TI4 (123-126)AH3 (150-170)TI'2 (180-183)3H3 (104-106)TVIII2 (131-134)TVIII3 (269-272)TIV3 (106-109)TIV5 (113-116)TI2 (111-114)TIV4 (112-115)TI3 (120-123)TIV6 (139-142)S6 (130-131)S7 (146-147)S9 (228-235)S8 (175-179)AH4 (184-189)AH5 (204-220)TI5 (190-193)TI6 (191-194)TI7 (198-201)AH6 (241-258)O1 (272-274)S10 (262-267)O2 (276-278)TII1 (279-282)TIV8 (301-304)AH7 (283-294)TVIII5 (317-320)S11 (298-300)AH10 (333-342)AH9 (325-330)TIV9 (344-347)3H4 (347-350)AH11 (353-357)AH1 (36-48)TIV2 (59-62)TII'2 (138-141)TIV7 (238-241)TI9 (303-306)Updating...
connected with : NaN
publication title Cysteine as a modulator residue in the active site of xenobiotic reductase A: a structural, thermodynamic and kinetic study
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas putida
molecule keywords Xenobiotic reductase A
total genus 121
structure length 359
sequence length 359
ec nomenclature ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date 2009-12-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3l5mA00
3NQ8A 1U83A 2ZCGA 3R2GA 4IPJA 3KX6A 5HWMA 4IUOA 2CLFA 3L2IA 3CTLA 2ZZ7A 4MLRA 2AGKA 5FF3A 4AWUA 3W2LA 1ONRA 4IMGA 3TK7A 3SSJA 1S5TA 1VYRA 3GXTA 3QPYA 1M7OA 3EXSA 5IBXC 4QIUA 3LB0A 1KLYA 3WJZA 4IXXA 4NU7A 4RX0A 3GX9A 3MUXA 1TPVA 4A22A 2G96A 5D09A 2R94A 1LROA 4IOTA 3G3DA 5LSMA 2YFNA 2BTMA 2VFIA 3W1NA 3QF0A 3MBFA 2PRLA 3Q58A 4ICNA 3NVTA 3KRUA 4U28A 4Y90A 4J9JA 4RZ6A 2H3BA 1PCWA 2FFCA 5K9XA 2ABBA 2Q8LA 3IGUA 3PB0A 1K8YA 4LRTA 3NPWA 4MFEA 5EY5A 5HINA 3RF9A 5LGXA 4E2BA 4GUFA 1OX4B 1T8XA 2B4GA 3VE9A 1I4NA 2V5BA 4S2CA 2Y70A 1ICQA 1SZFA 3W73A 1GYNA 3PWAA 4O10A 1VYPX 4WQ6A 3CLMA 2WKJA 3E9AA 2X30A 5D32A 1R30A 2H6RA 6TIMA 3GB6A 4FX7A 3W7OA 4NVTA 5DBUA 6ALDA 4O17A 2P10A 4JX6A 4H6KA 1MXSA 2EKCA 2DZTA 3MO7A 4N9DA 3G1AA 5SWUA 2NUWA 2EF9A 4PA8A 4RR4A 3RK8A 3TSMA 3IEBA 2X16A 3BVJA 1YTDA 3GDMA 5AB3A 2OCZA 3TC7A 3FLUA 3HGJA 3DGRA 3HIJA 5AYZA 1TB3A 3W07A 3QPZA 5GVJA 1CX9A 4W9TA 3V1PA 2J88A 4Z0SA 3IVUA 1VPXA 3NG3A 3NQAA 1TJPA 3GZ3A 3P5ZA 4UTUA 4EF8A 2WQPA 1LOLA 3P61A 2Y61A 1H61A 3AO0A 3NGJA 3IIVA 3QFEA 3OEXA 1DKWA 2HSAA 1HUVA 3HG4A 1WX0A 5KITA 5AFDA 3BW4A 5HWNA 1YDNA 2FDSA 3LHVA 4S2BA 1L6WA 3FFSA 1ZAJA 2QCHA 4WZHA 4M19A 4JYFA 5F4SA 5G2IA 3STCA 1SU5A 3QYQA 2B0MA 4O57A 4UCGA 3N34A 3OA3A 1HFBA 1XDLA 3FEMA 3MYPA 3NZ1A 3PUEA 4Y96A 2DZSA 2NV1A 1KFCA 3B0UX 1TV5A 3I68A 4O1DA 1XUZA 5K4ZA 1XBVA 4OGZA 3LM7A 4K8EA 5F4XA 1Q6LA 1EX5A 1SQ7A 1LRQA 4KWVA 1QNVA 3A23A 2QJHA 3LBMA 3IGSA 1IXQA 5I3KA 1O94A 3DZ1A 4BR1A 3MI3A 5CPMA 3P60A 3GLCA 3UNDA 1HO1A 1I8JA 3G24A 3THAA 3W87A 1EUNA 3L0GA 4UNKA 1ME7A 3B0PA 4IMDA 3LCLA 4X3ZA 4ZQNA 1XDMA 4RKAA 4ADSA 2YW3A 3NEVA 1QAPA 2VEIA 1SO3A 1TMHA 1I2RA 4UMBA 1M7PA 3W7LA 1O5KA 5HUPA 4BI5A 3G1FA 3SECA 4XBSA 3W23A 1RD5A 3T40A 2QR6A 1XI3A 2PRMA 2NUXA 4RCXA 3EXRA 3TAOA 3SGUA 5HUOA 1KFJA 1ZALA 3GDTA 4UTTC 2CLOA 3U2OA 1XBXA 4OHQA 3LRLA 2DZVA 4WXZA 5D05A 4WY0B 1RPXA 1XUUA 3L5MA 5D03A 4UFJA 5AHNA 5KZEA 3HBLA 5HULA 3RLUA 1PE1A 4MIMA 1GVRA 1OYCA 4UFHA 3S5OA 5FEPA 3NPVA 2A6LA 1TPC1 3UZ5A 1KW1A 4UTIA 1G7VA 3VNDA 4A29A 1JCLA 1VHNA 3LERA 1QWGA 4PEKA 2C1HA 3IIOA 3QEZA 3IIXA 3PB2A 3LLFA 4LOCA 4S1FA 4TU1A 4AHQA 3HPXA 1GG0A 4AHPA 5FF7A 1Q3NA 3W7NA 5AC6A 1FDYA 1LZOA 5DXYA 5TIMA 4M6QA 3PBUA 1UUMA 3LI1A 3QQ1A 2TYSA 3W7DA 1TPB1 3WK0A 3L0NA 1FXQA 3S1WA 5G2WA 1K7EA 1VQTA 3W1UA 3GXPA 5LGZA 3PF3A 2ZYFA 3A21A 3CB8A 5DELA 2V2HA 3P5YA 1WBHA 2Z0IA 1A5BA 3N3MA 2Y7FA 2JKAA 4R53A 2QDGA 1WYIA 1YXYA 3IRDA 5LNWA 3VI2A 2NWSA 4BI6A 2WPBA 3E12A 1H63A 2WNQA 1FDZA 3S5ZA 1WDWA 4LVGA 2WSRA 1R47A 3SR7A 1LORA 2GPTA 4KFPA 5TQLA 1OYAA 3B04A 3S1XA 3PM6A 1K02A 3TNOA 5DY3A 3M5XA 2RH9A 5C5YA 4TR9A 4JGDA 3NZRA 1H7XA 4LVDA 4NNCA 3AJXA 2JBMA 1F7BA 1JRCA 2X1TA 2VEPA 2E6AA 4JDYA 3UWUA 2QAPA 3TQVA 3PULA 2Y89A 3NAVA 4LS1A 3CU2A 3GAYA 4QITA 2DJLA 5U7SA 1QR7A 1LBFA 5H91A 2HTMA 3W70A 3GK0A 4UUIA 2J6XA 5LHEA 2ZBTA 3P7YA 4P2VA 1OK4A 1OX6A 3ABOA 4ZVJA 4UNLA 4I9AA 4ADTA 3W7KA 2ZRYA 4JR5A 3ZR4A 1TV8A 4JTGA 3WK3A 5AC8A 4K37A 5DBTA 4JX4A 3LHWA 1MSSA 5KMYA 1IGSA 3O05A 1QPRA 4B5NA 5K9DA 3STEA 3SGZA 3TQ0A 4D2JA 3H55A 1EA0A 3P82A 5KZMA 3GR8A 3NQ2A 3GDRA 4UR7A 4WOZA 1OFOA 3DENA 4LUIA 1KTNA 4JIPA 4AEOA 3TA6A 2QEZA 4LS2A 4HKPA 5K2ZA 5J5RA 1K8ZA 1RQBA 1UUOA 2QCEA 1H60A 1DQXA 2YX0A 4RZ5A 5HR6A 4IJBA 3WFAA 1SZEA 1H7PA 3C61A 1PV8A 2O7QA 3RLVA 4K39A 3TE9A 5A8GA 1FWSA 3LBCA 3RNDA 2QUVA 3MBDA 5L6UA 3EWBX 4LU0A 4O0KA 1L9WA 1LOSA 3QM3A 3G8EA 1OF6A 1SW3A 1ZFJA 4LUJA 1K7XA 1ME8A 4QNWA 2V5LA 2V8ZA 3BW2A 3PBWA 3H54A 5AN7A 1EWEA 2XFWA 3TROA 1TPDA 3BPWA 1GZGA 3W3OA 1GTEA 4FNPA 1H7RA 4JN6A 5DN1A 3KRZA 4MUZA 2FIQA 1QDSA 2V2CA 2GOUA 4NJJA 1AL8A 1X6UA 1JJKA 4Q32A 3M5VA 4PH6A 4N4PA 3HO8A 3S1UA 4PC8A 1JCNA 1F2JA 3DFNA 3NQCA 3FJLA 4FEZA 3CC1A 5AHLA 1SFJA 3P84A 5FF4A 4MZ1A 3NQDA 1VLIA 4RK8A 3W76A 1G4TA 4CNPA 3G3MA 3CT7A 4MZ8A 3QZEA 5C2XA 3A22A 2W0UA 5BOOA 1F5ZA 1ZY9A 3CPRA 3FOKA 1TO3A 2NX9A 2OZ0A 3LTYA 2BWGA 2ZTKA 3DI1A 1I2QA 2X1RA 4AH7A 3C2FA 3M47A 3HMJG 5IM51 1XKYA 3FKRA 3NDOA 4N9EA 4N4QA 3EWZA 1GEQA 4IGHA 4RXFA 1O4UA 1XBYA 4M7TA 2A7RA 1A50A 2DZWA 4GUGA 3G0XA 3VCRA 3S5NA 2V81A 2R8WA 1MEWA 1VLWA 3PY2A 1H51A 1TTJA 1FBAA 4TMCA 1B9BA 1GG1A 1EP2A 4LS0A 4Y8FA 2J27A 2ZFAA 3LHYA 3MI6A 3NYZA 1E51A 4LC6A 2ZRUA 3MP5A 1J4EA 3B4UA 3SFKA 4NUWA 4CLMA 1FCQA 1ML1A 2RFGA 3EWXA 2BZNA 4DO5A 5LNRA 3KVLA 2EAWA 1FUYA 3S9YA 3ABQA 3C0JA 1IF2A 3O1NA 4GUHA 4O1AA 1GVSA 3G1SA 2C18A 2ZZ1A 4PCFA 5K9CA 5I3GA 4DXVA 5LKYA 1QPQA 4UXDA 1TJRA 4O53A 3TSDA 3DI0A 1TRIA 4XWUA 4YL2A 3M16A 3TDFA 3BLIA 3MHFA 4XBKA 1Q6OA 1BEUA 5F2LA 3A5FA 3W7JA 4JYDA 4HNVA 1XM3A 1L6YA 1TYGA 4FO4A 4UTHA 3W1TA 4GJ1A 1H7OA 1ICSA 1OJXA 1BTMA 3DHDA 3M44A 3MMTA 5HMSA 3L21A 4DELA 1MZHA 3C3NA 4NJHA 4AHOA 1DJNA 3MW7A 4Z1CA 3LCXA 4O16A 3LCGA 4O13A 2RHGA 4Q4KA 5BMXA 4LV9A 3LXCA 3CEUA 2OJPA 4N9CA 3B8DA 1H1ZA 5AOUA 5FI8A 2G5WA 2Q3OA 3TXVA 1CW2A 3DHFA 3D0CA 1U5JA 2VFEA 1B3OA 4NJGA 5CSRA 3KVKA 3UY7A 5G1YA 4HPXA 1ZNNA 1OF8A 2JGQA 2PCQA 5LHFA 2X2GA 4GRSA 5AHEA 4M6VA 4AWTA 5CZ0A 3WJWA 3TX9A 1J2WA 1KLZA 1FWTA 4PODA 4BK9A 2W6RA 3OVPA 3UWYA 1YDOA 1JUEA 1YLVA 2E68A 4ZQMA 5C6MA 1OK6A 4FNRA 2A6NA 3BLFA 3KAOA 1THFD 2CZFA 2NUYA 2WSYA 2E6YA 1OVDA 4RXGA 2DZPA 4BF9A 3HQ1A 2Z1BA 3L0KA 5AYXA 3EB2A 4PTNA 1H7NA 1X1ZA 3BV4A 3MYOA 4JICA 2GUUA 1LYXA 4IXHA 1FCBA 3RFAA 3NL6A 3NM1A 3UD6A 4O1BA 3W71A 4FF7A 2JGYA 4UTKA 2CZ5A 1KM3A 3TQKA 2E5CA 5I3JA 3FS2A 4X22A 3W7RA 1SPQA 2I1OA 3YPIA 3W7HA 3M41A 4JTSA 1RVGA 5DCDA 3E96A 2R91A 3TR2A 2Y7EA 1YTEA 4RV8A 2FJKA 1JCYA 4UTWA 3B0VC 1YADA 2C13A 3UYCA 5E1QA 4FIRA 4HNNA 3Q37A 5AC7A 1EP3A 1NFBA 1TPUA 4O8RA 2TPSA 1KFLA 2J9YA 3PS7A 5G4WA 4IQLA 1ZAHA 3UXAA 4R34A 3EX3A 1NF7A 3IVTA 3W6YA 2YSWA 5HNRA 4XKYA 1EEPA 1I2OA 2QCLA 3W22A 3ZFHA 4HNTA 5LZLA 4ZMGA 3DAQA 1XCFA 3HB9A 4MY9A 1P0KA 3QH2A 4NXKA 1I2PA 4GE8A 1WBJA 2OX1A 3IV3A 4TIMA 4JY8A 3MI2A 2Y63A 3TCEA 3WJYA 1OFBA 3TAKA 2CW6A 4JTLA 5F2MA 2LLEA 1PL9A 3TJLA 4K7YA 1FQ0A 1O95A 1VCVA 3N19B 1OYBA 3EWYA 1SO5A 3NO5A 2VKZG 3M5YA 2Q8ZA 4UFIA 3PR2A 3G8RA 2DU2A 3LXBA 3CWNA 4DPPA 2HMCA 2GQAA 4UC5A 1OABA 1SO4A 4C1LA 1GYLA 3THQA 3F4NA 4FXRA 3M9YA 3TFXA 3O63A 3O06A 1EIXA 4G1KA 3P81A 1SSDA 5F2IA 2NZLA 5HJLA 5DCEA 1W31A 3ABSA 2Q3RA 4O28A 3BGJA 2YR1A 3QC3A 4YXGA 4NNAA 4H4IA 3PC0A 2QCCA 1WA3A 3ZWTA 4DO4A 4ML9A 3RU6A 1LBMA 3BG5A 2ZTJA 5F1VA 2A4AA 4FNUA 3W7IA 5KZDA 2RDWA 4N6FA 4X9SA 1VCGA 4MJMA 5D02A 4LVAA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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