3L5MA

Xenobiotic reductase a - coumarin bound
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
359
structure length
359
Chain Sequence
SALFEPYTLKDVTLRNRIAIPPMCQYMAEDGMINDWHHVHLAGLARGGAGLLVVEATAVAPEGRITPGCAGIWSDAHAQAFVPVVQAIKAAGSVPGIQIAHAGRKASANRPWEGDDHIAADDTRGWETIAPSAIAFGAHLPKVPREMTLDDIARVKQDFVDAARRARDAGFEWIELHFAHGYLGQSFFSEHSNKRTDAYGGSFDNRSRFLLETLAAVREVWPENLPLTARFGVLEYDGRDEQTLEESIELARRFKAGGLDLLSVSVGFTIPDTNIPWGPAFMGPIAERVRREAKLPVTSAWGFGTPQLAEAALQANQLDLVSVGRAHLADPHWAYFAAKELGVEKASWTLPAPYAHWLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas putida
publication title Cysteine as a modulator residue in the active site of xenobiotic reductase A: a structural, thermodynamic and kinetic study
pubmed doi rcsb
molecule keywords Xenobiotic reductase A
total genus 121
structure length 359
sequence length 359
ec nomenclature ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date 2009-12-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3l5mA00
4XTDA 5LNVA 1WOBA 1XBXA 3W1AA 5I3IA 2Q8LA 2RDUA 2QCMA 3R12A 3G0UA 4RZ5A 4YXGA 3LBMA 5E1QA 4JYEA 1VH7A 1XM3A 4UTTC 3ATYA 3O15A 2ISWA 5A8GA 2NUYA 5AHFA 3N2MA 2Z0IA 2BXVA 4FX8A 2GUUA 1VGAA 4ORMA 1ZFJA 1GEQA 4X3ZA 1FBAA 5HULA 2B0MA 2VEMA 3VNDA 4O50A 4N9CA 3DU0A 3O07A 2Y89A 3THQA 4QSHA 3MI2A 5LGXA 1J4EA 4XTIA 2C15A 3RU6A 2W0UA 4M7SA 4R53A 2VFIA 3TQVA 2WNQA 2OCZA 4IPJA 3W86A 2QJIA 3F4WA 3BVJA 3BW3A 2B7QA 4O4WA 2P1FA 4ZQPA 1TV5A 1VC4A 3DZ1A 3G22A 1XC4A 3HJZA 3C2FA 3LHWA 3LCIA 3PAJA 1AMKA 2W6RA 3A24A 1JULA 4JNMA 3QEZA 4TMBA 1SFLA 5FF2A 2C13A 1TPC1 2Y62A 3NPVA 5CZ0A 1KFBA 1JQVA 1L2UA 1YXYA 2ZA1A 2A6LA 1G4PA 2QCHA 1AW2A 3MI6A 2C14A 1SSGA 1LM1A 4JTTA 3UXDA 4JGDA 1TYGA 1OK6A 1Q6RA 4AHPA 1NVMA 4FNQA 2QCLA 4L4MA 2CZDA 1W8SA 4FHAA 3PWAA 3W71A 2C18A 5HMSA 1TIMA 2WSQA 1YDNA 2OJPA 2YPIA 4B5NA 5J5RA 1GPWA 3P74A 1XL9A 1EWDA 4XKYB 1LZOA 1MO0A 2E6YA 3TSBA 3KX6A 1ME7A 4NXSA 3G8RA 5HWNA 2ZRZA 4K6AA 1KM1A 1P0NA 4GFSA 1QOQA 2RFGA 1X8FA 1H63A 5BRBA 1PV8A 3KVJA 4LY8A 5CZJA 4GE8A 1CX9A 1R46A 5DN1A 5CGQA 1TJPA 5I3JA 1I45A 3EWBX 3ZR4A 4JYDA 4JN6A 3W2KA 3IGSA 3Q2DA 1KBJA 3PBYA 3L66A 4IGHA 4NVTA 1W5PA 1H7OA 2V81A 4BK9A 5KZDA 1IXNA 1LBLA 4Z1CA 4P61A 4LC6A 4TR9A 3TW7A 3OVPA 2HS6A 4O17A 1SFJA 1OF6A 4X22A 5CZTA 2TMDA 3F4NA 2QCDA 3LOTA 3LHYA 4IMFA 2PURA 3NPXA 3LV6A 1SW3A 3Q37A 4UCGA 4G1KA 1D3GA 3E9AA 4AHOA 1KTCA 3KVMA 2BWGA 2YW3A 1J5TA 2JKPA 4N2YA 4O13A 3A22A 5AHMA 1PIIA 2VXNA 1QCWA 5DY2A 4JYFA 4AVFA 2NV2A 1TPB1 2Y7EA 5EA9A 3G0XA 1LBMA 4JTSA 4Y90A 1GG0A 4I7VA 4K37A 2E5BA 5FEWA 1YPFA 4S2BA 4OT7A 2ZCGA 3RFAA 4PL1A 3U6WA 3KOFA 3DI0A 2H3DA 3MUXA 2DJLA 4MLJA 5EL1A 3TSDA 1XBVA 4EWND 1HUVA 4WOQA 5D2WA 4DPQA 4N02A 2EF9A 3CC1A 2C19A 4K39A 4MIMA 2NV1A 2DORA 5D05A 1F73A 3CB8A 5EKYA 3S0CA 5GVJA 1JCXA 3EXSA 2ZZ1A 2H8XA 4FO4A 3S5YA 1JVNA 3N3MA 1T8XA 2QUTA 1DQXA 2E6DA 2CZFA 5H91A 1NF7A 1W54A 4N4QA 3W7OA 4MOZA 4ZQCA 2CLEA 5G1YA 1QPOA 4O57A 1P1XA 3TQ0A 4X9SA 3ABQA 2WV8A 1ML1A 1IXQA 2PRMA 1UJPA 3PY2A 3W6YA 5AHNA 3ATZA 4DO4A 2HS8A 3M5XA 3N19B 2CWNA 5CPLA 3BO9A 3ZFHA 3PSWA 1XDMA 2X1TA 4RZ4A 2VFHA 2X1SA 4UTTA 1TO3A 3IRDA 4GWEA 1OX5A 4LVDA 3IGXA 1GJPA 3NQVA 1T99A 2E6AA 3R5EA 2YDAA 1VR6A 4QJ1A 2VFEA 3PR2A 1V5XA 4M7TA 3ZS4A 3EWWA 3N14A 1TRIA 3KHJA 3STCA 3TC7A 3UPWA 1H62A 1P0KA 1YDVA 6TIMA 3W2UA 1YTKA 1QDSA 1I2OA 4FNUA 4BF9A 3BW4A 1ICQA 4S2CA 3GKAA 3QMSA 3P61A 3DKLA 4GUGA 1TREA 3MP3A 2KZHA 3GZ3A 3C4UA 1ME8A 1A5BA 3TKFA 3P67A 3TH6A 1JUKA 1EA0A 5EBUA 3GDTA 4O14A 3HO8A 2GQ9A 3UQNA 4AXKA 2YSWA 1YTEA 5DELA 3W7PA 4ZMGA 1LRTA 1NEYA 3NXFA 4MZ8A 2IQTA 5U7SA 3W1QA 2QF7A 4LW7A 4NJIA 4Y6GA 5AHIA 2C16A 2A1YA 1EP2A 3HMJG 1BWLA 1KFLA 3CM4A 1H61A 3QZEA 1SSDA 2ZRUA 1KBIA 2PRLA 3CWNA 4JIPA 3CWOX 3YPIA 4GUIA 1OJXA 5BMWA 3GX9A 2DZWA 3N2XA 2AQWA 1FWNA 4L4LA 1A5SA 1ZENA 1KM4A 3W72A 4O1BA 4TX9A 4RJEA 1WX0A 4AF0B 3NPUA 4EF9A 4ICNA 2A6NA 5F2IA 3I6RA 4I7WA 3SJ3A 5AOUA 4OGZA 4MYXA 2E68A 4YLWA 5BW6A 4N4PA 3LCWA 1U5JA 1K8ZA 3PBUA 1XCFA 2EPHA 1AL7A 2QCFA 3GDKA 4HPXA 2VC6A 1YPIA 4BWLC 4DF0A 2HMCA 3H53A 2HSAA 4XZ9A 1R30A 1OX4A 3E49A 1RD5A 5D33A 4XWUA 1X1ZA 3EKLA 4WXZA 1JCMP 3FIGA 4UTWC 3QMTA 3MW7A 2QUVA 4R7JA 2Z6JA 5H2ZA 2GVLA 2EHHA 5CPMA 3M44A 2C1HA 1KFKA 1DORA 1GOXA 5EYWA 4DEFA 1OFPA 4JD4A 4QNEA 4FEZA 4PTNA 3IEBA 3DKJA 4FIQA 1AW5A 4AAJA 1OFRA 3TE9A 1WV2A 3M16A 3FOKA 3DI1A 3G1HA 4K38A 3G3DA 3AJXA 3LCLA 3MI3A 3LLDA 3THAA 3A23A 5MHBA 4O0KA 3QF0A 1A53A 3G24A 3N73A 1Z48A 1YTDA 3W23A 2WJZA 1UUMA 2G95A 4TO8A 4KWWA 2TRSA 3FLUA 1C9DA 1SO5A 1ICPA 1VPXA 3NQ8A 1I2NA 4LVAA 3S8HA 3ZWSA 3B03A 5FF3A 3KVLA 1G67A 1R2TA 3P5ZA 1OFDA 2Z2UA 2CU0A 1WA3A 1SR9A 1J2WA 2QEZA 2CFFA 3N9RA 5EMUA 5DBUA 2WNZA 2VFDA 4Z0SA 1JCYA 1AK5A 2VFGA 5CG7A 1QO5A 1FCVA 4WQ6A 3WK3A 5D04C 1SZEA 4O54A 3NNTA 4CNOA 5KZMA 3W22A 1FDJA 2WQPA 4LRSA 3STGA 2ZZ2A 2A85A 3L0KA 2GVGA 1FWWA 3O6CA 3EB2A 3GAKA 4CQ8A 3BLFA 2YW4A 5I3FA 3PUOA 3LI0A 4MFEA 3QPZA 1G7VA 5KINA 3M41A 1KFJA 2Y61A 1D3HA 2QCEA 1TPWA 4O1DA 4UTIA 2ZZ6A 1CW2A 1TV8A 3HGRA 5FI8A 1QMLA 4O1CA 5FEZA 5D09A 3LM7A 3PC0A 3R2GA 3S1UA 5LZLA 3LCHA 1TTJA 3GXNA 1F5ZA 4O8RA 2DZTA 4E38A 3PF3A 3C2EA 3EKZA 3M7WA 3MHUA 3IGUA 5F4WA 2FPVA 2J6XA 3W7CA 3GR7A 2NUXA 4QAIA 3GDRA 4RZ6A 4IMGA 4XBKA 1VYSX 3A5VA 2G96A 3MO7A 1O4UA 1TPDA 4E0CA 2VELA 3MP5A 5D2TA 1GYLA 2DU2A 1PHWA 1H50A 1K7EA 1EPXA 5DCEA 5LNSA 3NGJA 2QCCA 2NX1A 1LYXA 1SO4A 3M0ZA 1JJKA 3IIPA 1TSIA 4Z08A 1YLVA 1PHQA 3UNDA 4CQ9A 2QDHA 1C29A 2FLIA 1I4NA 4Z0JA 1XUUA 4HNNA 4O4VA 4CCDA 2ZDRA 1EP3A 4IPIA 2WO5A 3TAKA 4JTIA 1SO3A 3EX3A 3L2IA 3CIXA 4I7UA 1BWKA 4KFPA 5LSMA 1Z44A 3W2MA 2OT1A 1JQXA 1OFOA 1SZFA 5LHEA 1TV7A 2QAFA 3QH2A 4LUJA 3T4CA 1GVFA 4MY1A 1GYNA 4WY0A 3EX2A 5D38A 4UFHA 3SIZA 3W7LA 3RF9A 5F1UA 4YCOA 3C0JA 1Q3NA 2CLLA 5HQEA 2X30A 3HPXA 1IGSA 3W1XA 4FXSA 2J24A 1WQ5A 3NM3A 2Y88A 1K3UA 1GVQA 1NF0A 1Z42A 3HGOA 4FX6M 4DF1A 2E5DA 3NPWA 2E09A 3NQEA 1W3IA 3NQ2A 4LV4A 2YFNA 4UR7A 3HG2A 3W70A 1O5XA 2QR6A 5D2XA 3C3NA 3DFPA 3GK0A 3W7QA 3LRMA 3NEVA 4K8HA 4NNCA 3TJXA 1QOPA 4OE7A 1I2QA 3MYOA 3W75A 1FWTA 3U8GA 5AFDA 1RPXA 4JTEA 2PRHA 1WOAA 3CTLA 4DO5A 3SGUA 3G1AA 4YL2A 1GQNA 1TTQA 1H1ZA 2HTMA 3W7KA 5G4EA 3EWYA 2YGYA 5D37A 4UFLA 3WJXA 5K7JA 4OHQA 2Y6ZA 1XI3A 4JTUA 4W9TA 3L5MA 3S5OA 4HSOA 2VKZG 2CZ5A 3S6DA 2DP3A 1AG1O 2BLEA 4HNUA 4BWLA 4M6VA 1G6CA 1ALDA 1WDWA 3DXIA 3FA5A 1OFQA 2OMAA 2X16A 3QC3A 5HWJA 4LTSA 1LOLA 2FIQA 4UUIA 1E51A 1OK4A 1XDLA 4UTWA 4P2VA 2A5HA 2QKFA 2YFOA 3H54A 1HFBA 5DCDA 4KFNA 2WSRA 1RZMA 1SW0A 2I14A 2E1DA 3LI1A 3QM3A 1GTHA 3NQGA 5AHLA 3T7VA 2A21A 5T26A 3WJWA 4ORIA 4H4IA 3B0UX 1OYCA 1MEWA 4A2RA 3AO0A 5AYZA 1WBHA 3EXTA 2CZEA 3NQFA 4O28A 1F2JA 5AB3A 5EPDA 1ADOA 2XN0A 3M6YA 2TSYA 1X7FA 4IOTA 5A5WA 4PL2A 2WSYA 4MLRA 2NWRA 3WK0A 3L68A 1EIXA 5J5DA 2X1UA 1MSSA 3LERA 1ZAJA 1XFBA 1MZHA 3LTSA 5KITA 3VCRA 1TB3A 3HOJA 2ZTJA 3R13A 5L9FA 3TROA 1PL9A 3MJYA 4ZQOA 3QYQA 1LCOA 4AWUA 1XBZA 3B0PA 3Q94A 4MJZA 5CSSA 4CCCA 3NL2A 1GTEA 3HF3A 4ML9A 3W7MA 1FWRA 3HG3A 4UTUA 4JICA 4JY8A 3HG5A 4NU7A 4NZFA 3SECA 1FCQA 3IVSA 3W3OA 1TPVA 4RKAA 1IXOA 1RVGA 1F7BA 1W56A 1MXSA 1JCNA 2H90A 5BNKA 3M5VA 3O06A 4JX6A 2P0OA 2TYSA 2GPTA 4OV4A 1KFCA 4WOZA 1KM6A 3JR2A 5BOOA 3W7IA 2OX1A 1P5BA 2NLIA 3HGJA 3IIZA 4LU0A 3ANYA 2C6QA 3GVGA 4UIOA 4X2RA 2NX9A 4QIUA 3TSMA 3R8RA 4AB4A 1DQWA 2ZFAA 4ZQRA 5I3KA 4MUZA 3UWZA 1TCDA 1NSJA 1D9EA 3BV4A 4JDYA 4R33A 1HG3A 3N9SA 2J88A 3G1DA 1VLIA 2OT0A 2QCNA 3WJSA 3MHGA 4O15A 3KAOA 3B8DA 4XKYA 1I2RA 3C2OA 3TMQA 1O60A 4MZ1A 3RNDA 3PSVA 3C2VA 3QW3A 1LORA 3PBVA 5HR6A 5SWUA 2YCEA 3NQ6A 3W7EA 1VRDA 4FF7A 4IMEA 4YMZA 3G1XA 1L6SA 3MYPA 5C55A 3W07A 1LBFA 1VHCA 3FKKA 1ICSA 3UY7A 1OYBA 3TAOA 1GVOA 5TQLA 4N9EA 1S5TA 5K9XA 5G5IA 1I8JA 3W76A 3S9YA 1F6KA 5AHEA 1B3OA 4POCA 1VCGA 2V30A 3LTPA 2VEIA 3W88A 2CLKA 3HPZA 4UC5A 4A29A 3OBKA 1QPRA 3Q58A 3C2RA 4MPQA 3S1WA 1W5NA 3DFOA 5F2GA 1U83A 3BG9A 2Y85A 3TIMA 3LRKA 3IV3A 3KRZA 2W79A 1F76A 3GIYA 5CPNA 4U28A 2ISVA 4JIQA 3B04A 1W0MA 1OVDA 3MP4A 1BTMA 1BKSA 4MYAA 5KSWA 2AAMA 5FF4A 3OIXA 5HUOA 5G2WA 3FJLA 3M47A 2E77A 1FXPA 2CLOA 4KKXA 1OHLA 1ONRA 4UXDA 1VHNA 1OYAA 4A21A 2GQAA 4WX2A 4O52A 1S5VA 4RXGA 1K03A 4AH7A 4R34A 4HKPA 2DZPA 1SZNA 3E96A 5CZSA 3DH7A 4FB7A 3E02A 3M9YA 3N34A 4UTHA 3LHVA 3QMRA 1C8VA 1S3HA 4ALDA 3M1ZA 2FB2A 4YWIA 4H3DA 5F2LA 1UB3A 4PFMA 4NT0A 3M43A 1G7UA 2DZXA 5G1TA 4DPPA 3LCFA 3LCGA 4JTJA 2Z1BA 1W1ZA 5K3VA 5HWMA 4QQ3A 4UFKA 2UV8G 4WY0F 4MVAA 3G3MA 3A5FA 1T96A 4NJGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3V75 A;  4IMC A;  4UMA A;  1GVS A;  3BLE A;  1KM3 A;  2ZRX A;  4RV8 A;  4E2D A;  4WUI A;  1W31 A;  2QJH A;  3QRH A;  4AMA A;  1F6P A;  4PC8 A;  4O10 A;  3LXC A;  3MBD A;  5F4X A;  1M7O A;  3BPW A;  3OA3 A;  1XBY A;  1XKY A;  4CNP A;  4MFD A;  3W1L A;  1ZY9 A;  1LRN A;  1TPF A;  3G1S A;  2ISS A;  4IUO A;  5FES A;  4ZZ9 A;  1A50 A;  5D2Y A;  4Q33 A;  1K02 A;  4HSN A;  3PBW A;  1M7P A;  2NWS A;  2RH9 A;  4QIS A;  4Y9A A;  5DBT A;  3LHZ A;  3QFE A;  3TJL A;  4CNN A;  2A4A A;  4S1F A;  3W2J A;  2WPB A;  4LV9 A;  5AC7 A;  3W7G A;  3LDV A;  3UZJ A;  3INP A;  3TC6 A;  1FCB A;  1JCL A;  3W1P A;  4EVZ A;  2C3Z A;  3CT7 A;  1W3T A;  4ADS A;  1G4T A;  4JTF A;  1F05 A;  3W2L A;  1FY6 A;  1SW7 A;  2RHG A;  2VOM A;  2E5C A;  2ZQ0 A;  1RV8 A;  1HTI A;  4JTL A;  1Q6L A;  3FJ6 A;  1UUO A;  2JGY A;  1LDC A;  1TTI A;  4C1L A;  5AC8 A;  4LVG A;  5G2I A;  1TTP A;  4N9B A;  5F1V A;  2ABA A;  5EY5 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1A4L A;  1XBX A;  3N6H A;  3W1A A;  2YBT A;  3VO0 A;  4L65 A;  4KEZ A;  3D3A A;  3MAN A;  3LBM A;  4JCM A;  1KWG A;  3PPH A;  2BY2 A;  5GJN A;  4BCE A;  3M64 A;  2BVT A;  3AHZ A;  4B5V A;  4O50 A;  1MQR A;  3IS4 A;  3A4W A;  4Q8W A;  4WLC A;  1TE6 A;  1JZ6 A;  4XTI A;  2C15 A;  3RU6 A;  4M7S A;  2OCZ A;  3A9B A;  5LA2 A;  3B0X A;  3CUG A;  1B30 A;  3QKE A;  4E2O A;  2QJI A;  3SN4 A;  4DWS C;  3F4W A;  3H6O A;  3S9Z A;  2EKG A;  3M6D A;  1TV5 A;  1BPL B;  2WZE A;  4CU6 A;  3C2F A;  3LHW A;  4MUP A;  1XQL A;  3PAJ A;  4GZE A;  4LCQ A;  4GOA A;  2AL2 A;  1JUL A;  1TPC 1;  3I4K A;  3A3H A;  1K1D A;  1UOK A;  3N2B A;  4JTT A;  4GJI A;  4C6J A;  1TYG A;  3H26 A;  4J3W A;  4FNQ A;  2QCL A;  3O0K A;  4XUY A;  4FXF A;  2C18 A;  5HMS A;  3WBA A;  4ROQ A;  5BRQ A;  2WSQ A;  1X97 A;  2YPI A;  4Z2G A;  2PPG A;  5J5R A;  4JQ2 A;  4Y8E A;  3UCD A;  1LZO A;  3TSB A;  1PIG A;  4GAC A;  4NXS A;  3G8R A;  2ZRZ A;  2F38 A;  4ZO8 A;  1KM1 A;  4GFS A;  2RFG A;  5DRC A;  3KVJ A;  2ISD A;  1CX9 A;  3W6L A;  1DID A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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