3L65 | Genus

Total Genus 121

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	121
sequence length	361
structure length	361
Chain Sequence	SALFEPYTLKDVTLRNRIAIPPMAQYMAEDGMINDWHHVHLAGLARGGAGLLVVEATAVAPEGRITPGCAGIWSDAHAQAFVPVVQAIKAAGSVPGIQIAHAGRKASANRPWEGDDHIAADDTRGWETIAPSAIAFGAHLPKVPREMTLDDIARVKQDFVDAARRARDAGFEWIELHFAHGYLGQSFFSEHSNKRTDAYGGSFDNRSRFLLETLAAVREVWPENLPLTARFGVLEYDGRDEQTLEESIELARRFKAGGLDLLSVSVGFTIPDTNIPWGPAFMGPIAERVRREAKLPVTSAWGFGTPQLAEAALQANQLDLVSVGRAHLADPHWAYFAAKELGVEKASWTLPAPYAHWLERY

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Cysteine as a modulator residue in the active site of xenobiotic reductase A: a structural, thermodynamic and kinetic study pubmed doi rcsb
molecule keywords	Xenobiotic reductase A
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Pseudomonas putida
total genus	121
structure length	361
sequence length	361
ec nomenclature	ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date	2009-12-23

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00724	Oxidored_FMN	NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3l65A00

4HT3A 2FDSA 1VJIA 1NEYA 3HGJA 1OFEA 3NQ7A 1YADA 4NJIA 1LCOA 2OMAA 5D38A 2J6XA 3FKRA 3ZR4A 5FF4A 2BWGA 3G1FA 4BF9A 4Z0JA 5EPDA 2C15A 3Q58A 3LBCA 4GUFA 4NQ1A 3YPIA 1IXNA 4POCA 3BG5A 5CPLA 2NX9A 1F2JA 1OF6A 4MJZA 3R5EA 3DU0A 3S9YA 2Q3RA 2OT1A 3T55A 2J9XA 1P1XA 2Y88A 4JEQA 3NYZA 1H1ZA 3OVRA 3TC6A 1QR7A 3DBPA 3A22A 3PSVA 5HQEA 1QNVA 2X1RA 2YFNA 4E0CA 2J88A 2E6FA 4CQ9A 4UUIA 4R33A 3W88A 4BWLA 3BK0A 5HUOA 5EBUA 1GJPA 4JYFA 3RF9A 4PA8A 4Z0SA 1LP6A 2X1TA 2YPIA 4RZ4A 1XXXA 1IIGA 4L4MA 4MIMA 1EEPA 5K9CA 2B0MA 1N55A 4PH6A 4S1FA 3NVTA 1JR1A 3QJAA 4IX0A 2BSLA 1AL7A 5G2HA 1AG1O 2B7PA 3W74A 5D2YA 5FEWA 3M9YA 4IUOA 1GVSA 3LTSA 3I7SA 3P7YA 4O8RA 3WK1A 3R13A 4NXKA 4NNAA 4BK9A 3C0JA 4JTTA 1F05A 5AFDA 4UCGA 2YYUA 3PBVA 3LM7A 3NQEA 1LBFA 4OGZA 2QKFA 2DZPA 4EOUA 1DOSA 3KRUA 3W7PA 1WBJA 3FOKA 4KWVA 1FX6A 1GG0A 3TJLA 4ZQNA 1NVMA 1KTNA 3B03A 3I7RA 3QRHA 1W56A 2FJKA 2ZZ6A 3BLEA 1T99A 1OF8A 1XUZA 4ZZ9A 4LUJA 3LXCA 4ZL1A 1MEWA 3PC0A 5G5IA 1SW0A 5CZ0A 3STEA 4K39A 4IMEA 1HFBA 1VCGA 1PIIA 3RLVA 2QAFA 2X1UA 4JTFA 4HSNA 1L6WA 3W85A 2XN1A 3C6CA 3QZEA 2RH9A 3TNOA 1LROA 3PVFA 1ZCOA 4I7WA 4JX6A 1TV7A 1S5WA 1TO3A 5EKYA 4UIOA 4IMCA 3F4WA 3QH2A 4LVBA 1G4EA 5I3FA 1OFBA 1MSSA 3NPUA 1QPOA 3EX3A 5F1UA 3VFLA 4JTIA 4AMAA 4FX6M 1DV7A 3HPXA 2E77A 3TMLA 2QCEA 3CB8A 4R7JA 1WXJA 5D33A 2W0UA 1HO4A 4FX8A 5FF0A 2ZZ3A 5F4WA 3GDMA 5CSSA 2R14A 3LXBA 1XBVA 3TK7A 4R53A 2NXGA 3NL3A 1YYAA 3TAKA 1UB3A 1DORA 3NQCA 2V30A 2Z2UA 5FF7A 3GNDA 4LVFA 2G96A 4UTIA 1JUBA 4JY9A 3AO0A 1KFJA 2B7OA 2V2DA 1Z42A 3TKFA 1K02A 3IV3A 3M43A 4PCFA 3G1YA 1WYIA 4UTKA 2LLEA 1H63A 1ZAJA 3TX9A 4DO5A 4IWWA 3W7GA 1RR2A 3LCFA 4CCCA 1IXQA 3A5VA 4BFAA 1DKWA 3SR7A 1DJQA 2V81A 3SW6A 4Q32A 3W7MA 4X3ZA 3ABOA 1TRDA 3NPVA 3EXTA 3ANYA 2ZDRA 5J5DA 3IIPA 1X8FA 1RPXA 3P61A 5HJLA 4NNBA 2BZNA 1OX5A 2QF7A 5DLCA 4XKYA 3G24A 4NUWA 4O12A 3K30A 3MP5A 4XWUA 1JCLA 4O52A 5U7SA 3Q37A 1IXOA 3W3OA 5K9XA 1W3TA 5D05A 3SGUA 4LV9A 1TPB1 1LOLA 2UV8G 3QQ1A 3P8IA 4LNYA 3HG3A 1H51A 4W9TA 1KM0A 4O0ZA 4ORIA 1NF7A 4UTUA 2VXNA 2YW4A 3EX2A 2A4AA 3SI9A 1KFKA 3C2OA 3W2KA 4WY0B 2QJGA 2JKPA 1LORA 1LYXA 4Y6GA 4O17A 3G8RA 3SZ8A 5FEXA 3GKFA 2QR6A 4KFPA 1X1ZA 3VKJA 1H7OA 4MFDA 1KV5A 1I2OA 4LRSA 1W3IA 2A1YA 5AYZA 1OX6A 4TO8A 4DQWA 3DFNA 2WJZA 2HMCA 2YFOA 4GUJA 3NL6A 1GVQA 3VE7A 1H7PA 3LTPA 1MZHA 2I9EA 1JULA 2YXGA 3DFTA 1XI3A 5F2IA 5K9DA 3W70A 3RLUA 4QNWA 3IVUA 4FNRA 1ZAIA 1RQHA 3M6YA 1ICQA 5HWJA 1WQ5A 4MPQA 4JS3A 1VH7A 3L68A 2YR1A 4IXHA 4NJKA 3S5OA 4LC6A 3DAQA 3UZJA 1HTIA 3EXSA 1OFPA 1FXQA 4JY8A 3EWZA 2QDGA 4BI7A 2CZ5A 1M6JA 4PFMA 4UR7A 1P5BA 2Z0IA 2CFFA 3KHJA 1J4EA 5HUPA 4NX5A 1VYRA 2FLIA 3HOJA 3CIXA 3L67A 4LVDA 5E93A 4UTHA 2QDHA 4AH7A 4JXCA 1TJPA 2VFGA 4RX0A 3IGXA 3WJXA 3PUEA 2GQ8A 1VR6A 3TSDA 2IQTA 3JRKA 5HMSA 3T7VA 5AC7A 3KVLA 1W5PA 3NXFA 2FB3A 3TW7A 3EKZA 5H91A 3BG3A 4H4IA 4GUHA 4J9JA 1GVFA 1OK6A 4TR9A 2EHHA 3W7KA 1BEUA 4DELA 4JNMA 1XKYA 3CEUA 1DVJA 3UWWA 4JX5A 1YDOA 3P67A 2WSYA 1A5BA 3BG9A 3C52A 5F4SA 3I7QA 3C3NA 3OVPA 4NNCA 5D03A 4IPJA 4UNKA 4JGDA 4YLWA 3STFA 3GXNA 4AF0B 3EB2A 3N2XA 3OIXA 3P74A 4U28A 2C13A 2ZTJA 3IGSA 2V9DA 3L2IA 5CPOA 1YDNA 1EWDA 3SIZA 1OK4A 2J24A 5TBOA 3N19B 2ABBA 8TIMA 3B05A 3LRMA 3CLMA 4M6PA 2OX1A 4YL2A 1GOXA 3G1DA 1ML1A 3QEZA 2VEMA 5EL1A 4N6EA 4QJ1A 2BTMA 3E12A 4HN4A 3L5LA 1LRNA 3W1XA 3B0UX 1R46A 1FQ0A 4ALDA 5LNSA 4UFIA 3BARA 3SY5A 2E6DA 1G4PA 5F2MA 3S1WA 2NXHA 3KOFA 2ZRYA 3MI3A 4FNTA 1LM1A 3MJYA 4O53A 4LS0A 5AHNA 2ZRWA 1O5XA 3DI0A 5MHBA 2PCQA 3JR2A 4QIUA 3AJXA 4M6QA 2V82A 4NVTA 1N7KA 3LHUA 5CZSA 4NXSA 3PUOA 4GWEA 4JDYA 3TUUA 3DFSA 3I68A 1VYPX 1KFLA 1C29A 3CC1A 2V5BA 4KFOA 5SWUA 4MJMA 2BLEA 5G2WA 2A2IA 2H3BA 1VZWA 3BGGA 4Z1DA 1SO5A 2OZ0A 2YDAA 3KXQA 1TREA 3DHDA 1P0KA 1RD5A 1R30A 5K4ZA 2QCDA 1PCKA 4I9AA 1D3HA 3BO9A 1ZHAA 5DCBA 1X1OA 1A50A 1OX4A 4JYDA 5K2ZA 2J9YA 3WJWA 4ZQPA 5KITA 5A5WA 1KM3A 4Z1CA 1CW2A 1NF0A 4LC8A 5AOUA 3TIMA 1W5MA 1YPFA 2QCLA 1O60A 3LHYA 2YX0A 4FHAA 4M7SA 1OABA 4WUIA 4I7VA 1GPWA 3G8EA 1WV2A 4O54A 3CWNA 1TQJA 4UTTA 5KMYA 1XBYA 4TMBA 1PV8A 1QPQA 1LOQA 4MYXA 3NQ6A 2CLFA 2TPSA 4O1AA 1OYCA 2P0OA 4DO6A 1BTMA 3LHTA 4UMCA 1VLWA 1IGSA 1KBIA 3L66A 4TMCA 5LNUA 2NXIA 3W7RA 3GAKA 5LHEA 3ZWSA 1L6YA 3LHZA 3PULA 1TJRA 5FEZA 1M7PA 3DFOA 3TFXA 3GVGA 1FDJA 3NQ8A 4JTHA 4RXFA 4N9EA 1KLYA 4D2JA 2TMDA 4WOZA 4AVFA 2GJLA 4NJHA 2Z1BA 3EX4A 4ZQCA 1LOSA 4RKAA 3QW3A 4FF7A 1EUAA 1YTEA 4UTWC 3F4NA 2VFFA 3MHGA 4CNPA 3EWWA 1S3HA 1GEQA 3O06A 3W7HA 3B04A 5AHLA 3BLFA 4N9DA 3S6DA 3NQVA 5BW6A 4RR4A 2YYTA 3TROA 3W6YA 3OA3A 3NM1A 4WZHA 3CEPA 4MUZA 1BWLA 3PBYA 1KFBA 3FIGA 3S5YA 1O94A 5C6MA 3DXIA 4PL2A 5CGQA 5D32A 1FCUA 2ZZ2A 2H8XA 3GB6A 1EWEA 2R94A 4Y9AA 2X1SA 2FQIA 3NQAA 2ATSA 1EA0A 2QJIA 1TV5A 5G1TA 3DFQA 1G4TA 4JTLA 2P10A 4BI5A 5D2XA 2B7QA 3FYOA 4KFNA 2CZDA 3CT7A 3LCHA 1YPIA 4I7UA 2WKJA 3MBFA 1I2PA 3KVKA 2Y63A 2H6RA 4ZMGA 1EP1A 1I2NA 1T96A 1SU5A 3LV6A 3B0VC 3GDTA 3LCWA 1G6CA 5L9FA 1LTDA 4K36A 3M5YA 1TPUA 3LBMA 3FS2A 4HPXA 4QAIA 1VLIA 3N73A 2C14A 4RZ5A 1GZGA 1VHNA 1D9EA 4XBKA 5KZEA 1VCVA 5LHFA 1BWKA 3QPYA 1RZMA 1WOAA 4GNJA 3LCXA 4UTMA 1GYLA 3UWVA 3HJZA 4O0KA 3V1PA 4RLIA 3CM4A 4Y96A 4XZ9A 4QQ3A 3MMTA 1QFEA 3N9RA 2Q8LA 3S5ZA 2AAMA 2NUXA 1OG0A 1BKSA 2I14A 3RMJA 1QAPA 1KM5A 1JCYA 4QM1A 5EA9A 2A6NA 1SZGA 3I65A 1TMHA 1M7OA 1Z48A 2ZQ0A 4O16A 1K7FA 3P81A 4M19A 5D09A 1Y0EA 3W7OA 1JCJA 3L5AA 4UFMA 1DQWA 2V2HA 3GDRA 1VCFA 3UY8A 1SW7A 1HL2A 1XCFA 1TTPA 2ZRUA 5K3VA 3GXPA 3EWBX 3QYQA 4OQVA 4WX2A 4JIQA 3P5ZA 5BMWA 3CWOX 4CNNA 3HPZA 4O50A 5HWMA 4IOTA 1Q6LA 3ABRA 1KFCA 1SQ7A 2QCCA 3W1QA 3QFEA 3T4CA 1TTQA 2AQWA 4N2YA 4JTKA 1C9DA 1O95A 1RVGA 2GVLA 3FYPA 1EP2A 5KINA 1W37A 1FCVA 4QNEA 4OE7A 4UFLA 3LERA 2DZTA 2PRHA 3PBUA 1HUVA 2A0NA 3LHVA 2O7QA 3W1AA 4NX0A 4N02A 5HULA 3O1NA 3BLIA 3G3DA 1OFQA 1DJNA 1MXSA 1PHWA 2V5LA 1TPVA 4XQ6A 1B3OA 1KV8A 4EIVA 3DHFA 7TIMA 3HGSA 3A9IA 3SECA 3HIJA 4MLRA 3ABQA 3W1UA 2EAWA 5KZMA 4UFJA 3LOTA 1OJXA 4YCOA 3G1VA 4LVAA 1ZALA 3PB2A 2V8ZA 1EIXA 5DY2A 4CLMA 1ZFJA 2NX1A 3NAVA 1I8JA 3R12A 1OFRA 1RQEA 5K4XA 3S8HA 4TIMA 4BR1A 3LDVA 4AHQA 1OVDA 2PURA 5DN1A 3C8FA 3WK0A 3A23A 1KFEA 4DPQA 2NWRA 2WV8A 3TFCA 3C4UA 5DELA 2VEKA 3OG3A 4WY0F 2YCEA 1F76A 4YWIA 4ZQMA 3HGRA 1UUOA 1S5TA 1SFJA 2R91A 4M6VA 5CSRA 1HG3A 3INPA 4O28A 4DBDA 3LI1A 1H60A 5HR7A 1YTKA 3N2MA 4MZ1A 1LRQA 4RXGA 2OJPA 3O6CA 3O8AA 1U83A 3G1AA 3M1ZA 4UMBA 1T8XA 4FB7A 1YXCA 2JGQA 4UTJA 3O16A 3S1VA 4NZJA 1OYAA 4WD0A 2C16A 2KZHA 5BRBA 3TA6A 3MHUA 4BWLC 4ML9A 3TSBA 1FWWA 2E5CA 4Y8FA 2O7SA 1ME8A 1K8ZA 3TXVA 6TIMA 3FEMA 4GJ1A 1I45A 5EMUA 3KVMA 4XKYB 3W73A 5I3GA 1FBAA 4P61A 2PC4A 4MOZA 2CLIA 3CTLA 1KW1A 2NLIA 4KWWA 1XBXA 2TSYA 3N14A 2WNQA 3P84A 1K03A 3TCEA 1F73A 1Q6QA 5FI8A 3C2VA 3FJLA 3W75A 4YCPA 2A7PA 4WXYA 3W22A 2C19A 1GTEA 3ZFHA 1QO5A 4JIPA 4MKNA 1F7BA 2ALDA 3EKLA 5HNRA 4OV9A 1K3UA 2CU0A 4ZQOA 4X22A 1CI1A 3MHFA 4MY1A 4NJJA 3W71A 3LRLA 4DF1A 4K8HA 1AMKA 5AC6A 4YXGA 3ELFA 1K7XA 1XDLA 2NZLA 2YZRA 4QISA 5HR6A 1QDSA 4DO4A 1B57A 3EEGA 4Q4KA 4ONVA 2ATMA 1TYGA 3SFKA 1PL9A 1XBZA 1K8XA 1XL9A 2HSAA 3PR2A 3OBKA 3STGA 1JQXA 2CZEA 3NL2A 3EX6A 1TSIA 3DENA 4JICA 1KM4A 5G1YA 4LS1A 2VFDA 3W2LA 2VOMA 3CHVA 2Y6ZA 3CIWA 4N4QA 3MP4A 1ZAHA 3W7JA 2C6QA 1GT8A 3QC3A 1QWGA 1EP3A 5HINA 4Q33A 4ADUA 4GXMA 3FFSA 1LZOA 3QQ0A 2WQPA 2CWNA 3MI2A 4UNLA 4AHOA 2NUYA 5LZLA 4OT7A 1FWSA 3ABSA 2NWSA 3UWYA 3QW4B 3UPBA 2DZSA 5LKYA 1LDCA 4HPJA 2QCMA 2D73A 5AHFA 2CLEA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3L65A

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