3L67A

Xenobiotic reductase a - c25s variant
Total Genus 130
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
130
sequence length
358
structure length
358
Chain Sequence
ALFEPYTLKDVTLRNRIAIPPMSQYMAEDGMINDWHHVHLAGLARGGAGLLVVEATAVAPEGRITPGCAGIWSDAHAQAFVPVVQAIKAAGSVPGIQIAHAGRKASANRPWEGDDHIAADDTRGWETIAPSAIAFGAHLPKVPREMTLDDIARVKQDFVDAARRARDAGFEWIELHFAHGYLGQSFFSEHSNKRTDAYGGSFDNRSRFLLETLAAVREVWPENLPLTARFGVLEYDGRDEQTLEESIELARRFKAGGLDLLSVSVGFTIPDTNIPWGPAFMGPIAERVRREAKLPVTSAWGFGTPQLAEAALQANQLDLVSVGRAHLADPHWAYFAAKELGVEKASWTLPAPYAHWLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Cysteine as a modulator residue in the active site of xenobiotic reductase A: a structural, thermodynamic and kinetic study
pubmed doi rcsb
molecule keywords Xenobiotic reductase A
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas putida
total genus 130
structure length 358
sequence length 358
ec nomenclature ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date 2009-12-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3l67A00
2ZFAA 4FEZA 1EX5A 2YDAA 4I7WA 3DH7A 4YCOA 4OU1A 2A0NA 3LLFA 4XBKA 1OHLA 1SW0A 1HL2A 4GC4A 1Z42A 3N2MA 1LLZA 4CQ8A 2WKJA 2ZZ1A 1TSIA 4DO5A 1KFCA 2H6RA 1TTJA 3CEPA 4OHQA 1TTQA 3G18A 3KVKA 3FIGA 1TQXA 5F4XA 3QMRA 3BG3A 4XZ9A 3TR2A 1SO6A 5D03A 3UWUA 3ZR4A 3IIVA 3SFKA 2Y7EA 3P7YA 2XN2A 5T26A 1ZHAA 4CCDA 3SIZA 4DF0A 1GTHA 5F4WA 1T96A 4E2BA 1FWTA 1KBIA 1YTDA 2QF7A 4JICA 1P5BA 4YWIA 1YDOA 1KV5A 4FNTA 2P10A 4IX0A 4EWND 3LTPA 3KVJA 4MUZA 4EF8A 4FO4A 4QQ3A 2A7NA 4LVBA 3EXRA 3P84A 3QYQA 1RV8A 3A22A 4UTMA 4QITA 3TU9A 2W0UA 4NNBA 5AC7A 4WY0F 5G2HA 3NQFA 3INPA 3D0CA 4LS1A 4GFSA 2BSLA 2PRLA 4MKNA 3TROA 4AH7A 1TRDA 2CZDA 5LSMA 1R2TA 5D32A 3UXAA 1QR7A 3MI2A 3QPYA 3K30A 1J2WA 1I4NA 4ADUA 4NNAA 2DZUA 3RFAA 4EVZA 3O16A 5AHLA 4JYEA 3UY7A 1SFLA 4K8HA 2TYSA 1VYRA 3ABSA 4OE7A 4CQAA 2VFFA 1NF7A 1WDWA 1VHCA 4M5PA 1V5XA 1M7OA 1EB3A 2E5BA 1TJPA 4IMCA 1YTEA 3GDTA 3DENA 4BR1A 4LUJA 5KINA 1LYXA 3BW3A 1G67A 3C2OA 2ABAA 4RZ5A 3W1UA 2GQ8A 2DZTA 2DZPA 3E96A 3QM3A 2V5BA 1FWNA 4MY1A 5C5YA 4HKPA 3MUXA 3W1NA 1JCJA 1H51A 4UR8A 1JQVA 4O1DA 3RK8A 1MEHA 3F1QA 3HPXA 2X1UA 4P61A 5HWNA 1SO4A 3DKJA 3EX6A 3L68A 2QEZA 4CQ9A 3H53A 3WK2A 3HIJA 1SPQA 3O07A 4LS2A 3CU2A 3KFTA 4J9JA 2QKFA 1BTMA 3W07A 4UXDA 2W6RA 5IM51 1W54A 4HN4A 1ZALA 4IPJA 2TMDA 1OFDA 4PEKA 1YDVA 1N8FA 3DFQA 6ALDA 4N9EA 1TPC1 1SO5A 1GVQA 2CLOA 3OBKA 4DBEA 1NEYA 3W74A 2FFCA 4M6PA 4UIOA 2YW4A 1KTCA 3LXCA 1DQWA 2YYUA 3NNTA 5E0KA 3P60A 5C6MA 2QCHA 5K9CA 1IXNA 4O16A 1UASA 5EY5A 3NQEA 3W7EA 2I9EA 3MHUA 4LTSA 3C2RA 3W7DA 1X1ZA 4N9DA 3P62A 4JY9A 5H2ZA 4OQVA 5FF2A 1W0MA 3FJ6A 2FTPA 2NXHA 3B4UA 3EWXA 3GR7A 4M19A 4FNPA 1B9BA 1L6YA 5DY2A 4S2CA 3TSMA 3DZ1A 2NLIA 1C29A 3UQNA 2H3DA 5AN7A 1OYAA 1QPNA 3P67A 5CZSA 3MW7A 4BI5A 1O5KA 1JUKA 1AK5A 1UUMA 1F74A 4JX4A 3W1TA 1GVFA 3HOJA 4IGHA 4DO6A 1LRNA 4O14A 1OYBA 1VH7A 1QPOA 1AL7A 3CT7A 4LOCA 5AHIA 5MHBA 1XUUA 2ZQ0A 3W2MA 1LORA 2ALDA 3W2KA 4BF9A 5CZTA 2Q8ZA 1OFOA 3NQ2A 1R2SA 1IF2A 4W9TA 1XL9A 2F7FA 4RX0A 4YMZA 3OEXA 3W7GA 3C8FA 5I3KA 2Y7DA 1J4EA 3SSJA 5LNUA 1IXPA 3PBUA 1XCFA 3SI9A 1KLZA 3S5NA 4Q4KA 1NAL1 2HS6A 3CLMA 2X1TA 1WA3A 3LHZA 3TA6A 7TIMA 3I65A 3R8RA 4AXKA 2G96A 5G2IA 1LBLA 2QCCA 1RZMA 1O94A 2X1RA 1W8SA 2NXGA 2QCGA 3O6DA 2IQTA 5IBXA 1ZENA 2ZZ4A 1M6JA 1G4EA 1H7XA 4UFKA 1ICPA 3DFPA 2Y7GA 2QJGA 2TRSA 3B0PA 1H63A 3L5AA 4NU7A 1JRCA 4GUFA 3TIMA 5FEPA 2A85A 3DU0A 1FY6A 3GK0A 5LZLA 5D2TA 4PODA 3A9IA 4A2SA 2V2CA 4NX5A 1BWLA 2VFGA 1XBXA 3OIXA 2RDTA 4UTKA 3CWNA 1VS1A 1YYAA 4IXHA 3W7IA 3W85A 3LCFA 4JTTA 3TJLA 2VFEA 1TJRA 1UUOA 4DF1A 2V8ZA 5BW6A 3QJAA 2RDWA 3W1QA 4O17A 2H8ZA 3THAA 3PB0A 2YYTA 4FNUA 4CCEA 1JUBA 2QCDB 2Q3OA 1Z41A 1I8JA 4XBSA 5FF7A 1SSGA 1KFJA 2AQWA 2XN1A 3CWOX 4JTKA 2WJZA 4JX6A 4QISA 4MY8A 3LCXA 4KFPA 3LDVA 3B0UX 4K37A 4FX7A 1W3IA 3N9RA 1TV7A 3PAJA 2OT0A 5KMYA 4ONVA 1UB3A 3LV5A 2JBMA 1YXDA 3NQ8A 4RK8A 5FEZA 4O18A 1JCLA 6TIMA 3TV8A 3C2EA 3GLCA 4O8RA 3OVRA 3W7PA 5E1QA 2PURA 2ZRXA 4WUIA 2I1OA 2ZRVA 4NJGA 3B8DA 3C6CA 2DJLA 1DQXA 3W7NA 1G6CA 3G24A 4TMBA 2JK2A 5J5DA 1KA9F 4A2RA 1QO2A 4JTGA 1M5WA 1TPDA 3TNOA 2ZTJA 3M5VA 3LX9A 1I2OA 3W6YA 3A5FA 4QAIA 2Y6ZA 2Y89A 5EBUA 3LCGA 4RZ4A 3LERA 1HO4A 5LHFA 1ZNNA 1H60A 4KFOA 4BWLA 2Y63A 3QQ1A 3SGZA 3WJYA 5LNVA 3QC3A 3GNDA 1KFLA 4GUIA 3DAQA 4HPXA 1TQJA 2QJIA 2Z1BA 1L2UA 4C1KA 4JTLA 1E51A 3LTSA 2C15A 4OWGA 2PC4A 4MLJA 4O28A 4HSNA 3WJZA 1KM6A 3WFAA 4GBUA 4Q33A 3I7SA 4O0KA 4ADTA 4AEOA 4UFJA 1I2PA 3IIXA 3LI1A 4TX9A 3DGRA 5HWMA 3BK0A 4O1CA 3CHVA 5DY3A 4FIQA 1VGAA 3U8GA 3W2LA 1J5TA 1F6PA 1OX4A 3G1HA 4ZQOA 4GWEA 4GE8A 3NPUA 2Y88A 1YDNA 4AWSA 2QCNA 4GXMA 4RLIA 3W88A 3JR2A 4JTFA 4Z1CA 3KOFA 5KZDA 1B4EA 4JTEA 4K36A 4LRSA 5D04C 1L6WA 4Y90A 2QDHA 2EF9A 3NA8A 3PVFA 1DV7A 1LOSA 3EX3A 4IMGA 2E5CA 4IMDA 1IXQA 3L0NA 3HGSA 1CX9A 1W1ZA 2ZZ3A 1OABA 4RXGA 3ELFA 4O19A 2H8XA 3G3MA 2JGYA 2QAPA 3PB2A 3CEUA 3S0CA 4ZQCA 4N6FA 2DZWA 4XKYA 2EAWA 2ISSA 4RKAA 3Q58A 3BVJA 2PRMA 2ZZ5A 4NQ1A 1GJPA 3G22A 3LCWA 3EWUA 5HJLA 2CZFA 4FB7A 3EEGA 3HJZA 3W7QA 3W7KA 5A5WA 4UTWC 3LCIA 3LOTA 2XN0A 4WY0A 4JTHA 1GG1A 1XUZA 3ABQA 1GYLA 1MEWA 3FOKA 3I7RA 1P4CA 4KWVA 5K3VA 3BW4A 5BMXA 5D02A 2CLEA 2YX0A 4LT9A 4UR7A 4OBTA 3EX2A 1TPFA 4X2RA 2CLKA 4GUJA 4P2VA 1LBMA 4A3UA 3NQVA 2WPBA 5HUOA 5HULA 4QIUA 4ORMA 3LV6A 3KRZA 3W2NA 2A6NA 5H91A 3STCA 2J6XA 1DVJA 2ZYFA 2GJLA 1D3HA 3M1ZA 1TCDA 5LGXA 3P74A 3TSDA 2A6LA 2FJKA 2CU0A 1TV8A 3UY8A 5CPLA 3O8AA 1TTPA 1QDSA 3HO8A 3TC7A 4NZJA 1GOXA 3H54A 4DELA 3RMJA 2CLHA 3PUOA 2ZRZA 4S2BA 2CLIA 1NVMA 2RH9A 4MYXA 4OV9A 5D09A 5SWUA 3UYCA 3GXNA 3O63A 3W72A 3PBWA 2FDSA 3S6DA 3NM1A 4O4VA 2VXNA 1F76A 1TRIA 3LCLA 4JDYA 3S1VA 1JUEA 3N19B 1KFEA 4QM1A 1H7OA 4TR9A 3LB0A 5C54A 1SU5A 1X1OA 1JULA 2VFDA 3LCHA 2J88A 3G1YA 2PCQA 4UTHA 2DJXA 2Y7FA 3O6YX 2ZDRA 1FDZA 5G5IA 1P0KA 4IX2A 1EA0A 1I2RA 4N02A 1DJQA 2RHGA 1PHQA 3FYPA 2P0OA 1HG3A 1LCOA 4Z08A 4LVGA 4AMAA 4UFLA 5G1YA 1AL8A 2YR1A 4LRTA 3DBPA 1OFEA 4O12A 4H6KA 3HGRA 1B4KA 3W1MA 2ISWA 1QO5A 3TCEA 4O53A 3OVPA 2GUUA 3C2FA 1RPXA 3DHFA 3S1WA 3W7HA 5HMSA 3PWAA 3MMTA 5FF4A 3USBA 1UJPA 3FEMA 4NX0A 1OYCA 3MYOA 3S5YA 2E6AA 3YPIA 3P82A 1SO3A 4L4LA 4MLRA 2WV8A 3C56A 1SR9A 1TMHA 1TREA 4FXSA 4LU0A 5A8GA 4UTJA 4AVFA 2A1YA 3GXPA 4KFNA 5AHFA 3CIWA 3MBFA 4XWUA 1FCVA 2ZZ6A 4ICNA 4DPQA 1ML1A 2Z0IA 4FX8A 4LC8A 4HNUA 3KHJA 4O10A 2WSRA 3OHIA 2BWGA 2QJHA 2ISVA 3P5ZA 4K6AA 1GTEA 2VELA 3EXTA 3C3NA 2Z6JA 3NM3A 3O6CA 4FX6M 3NZ1A 4RCXA 1DBTA 1OFRA 2QCMA 3GDMA 3GNNA 3PG9A 4H4IA 3IGSA 2C6QA 2ZBTA 4MZYA 1VHNA 3G8RA 2KZHA 2OZ0A 3TJXA 3M44A 5HWJA 1Z48A 1KFKA 1XM3A 3W76A 3ZS4A 1VC4A 3UWZA 4B5NA 1YLVA 3TK7A 1FQ0A 5L6UA 1Z44A 2DU2A 3NPWA 4A22A 2A7PA 5AHNA 4WXZA 3MWAA 4WOQA 5GVJA 5KTLA 3FFSA 1ZCOA 4JNMA 4Z1DA 5K2ZA 2V0TA 2AAMA 3S42A 4MY9A 3NPVA 4RZ6A 3NPXA 5K9XA 5KZMA 1G69A 3O06A 1QMLA 4LVDA 2GJNA 4E0CA 4ZMGA 5E93A 3AO0A 2NWRA 1RQHA 4XQ6A 5K4XA 2QUUA 1G4TA 4UFMA 3DKLA 1SW3A 4N6EA 1LTDA 1XBYA 3HG4A 1AW1A 1FX6A 2EGZA 3MP4A 5C2XA 1FDJA 2QUVA 3E49A 4JYFA 2ATSA 4ZZ9A 4M7TA 1W37A 4KKXA 1XKYA 1P0NA 1KTNA 1B3OA 1DORA 1S3HA 2ZCGA 1TPH1 2V2DA 3W2JA 3SY5A 4WJEA 2ZA3A 1S5TA 1FWRA 3KX6A 4QJ1A 2FLIA 1H61A 3LHWA 2OJPA 2X30A 4Z0JA 5DBTA 1PL9A 4UFIA 1I2NA 2J9ZA 4K38A 1S5WA 5CPOA 5FEXA 1OK6A 5LGZA 3I7QA 3N73A 4C1LA 3T78A 3O05A 5C55A 1LDCA 4QSHA 3F03K 1KLYA 2RKXA 1TPUA 3C61A 4NJIA 1WOBA 4H3DA 4UTTC 3VCRA 4YXGA 3P80A 3S9YA 1L6SA 2BX7A 2ZZ7A 4Y6GA 4CNOA 5KITA 1VZWA 2YCEA 4K7VA 4MJMA 1OX4B 1SZGA 2GVGA 3WK0A 3TFCA 1F05A 4MVAA 4N4PA 1VJIA 1W5QA 3TW7A 3DFOA 4WX2A 3NOEA 1Q6OA 3NL3A 3M6YA 5FF3A 3O15A 1WQ5A 4MFEA 1WBJA 3NDOA 2HS8A 1QOQA 2C13A 4RXFA 1YPFA 1FXPA 1TPVA 3LLDA 1PVNA 2Y70A 3PULA 5FI8A 3NYZA 2WO5A 3W1RA 1JCXA 3FS2A 4O11A 2O7QA 5D37A 1DHPA 2QAFA 5AHMA 1D3GA 3HG2A 4POCA 1MXSA 3THQA 3O1NA 3CTLA 3R5EA 4MYAA 1K8XA 2BLEA 2P1FA 4EF9A 2LLEA 2YSWA 2OCZA 4XKYB 3B04A 1KM1A 3NQAA 3NL5A 5F2MA 5CSRA 3PBYA 2NX1A 2UV8G 2VOMA 3Q94A 1W5OA 3MI3A 3UD6A 2J9XA 3R12A 2QR6A 1KM4A 4LV9A 3M43A 3M5ZA 4WY0B 3IGUA 3C0JA 4AWTA 1IXOA 3TUUA 2B7NA 1FXQA 3MP3A 4NNCA 3UWQA 1Q6LA 5AFDA 1PCKA 1L9WA 1QOPA 3BG9A 1XI3A 5EPDA 1K8YA 3EWBX 3IEBA 4HSOA 2NUYA 1XC4A 5D2YA 1PIIA 2H3BA 1KW1A 1IGSA 2WOQA 1ZY9A 5J5RA 2CZEA 3RF9A 3UWVA 1W5NA 4BFAA 3R2GA 3LBCA 1SW7A 5G1TA 3LXAA 3NQ7A 4D2JA 4HIBA 3PG8A 3V75A 2ZA1A 5DN1A 4Z1AA 4BI7A 3EXSA 3HB9A 3W87A 5LNWA 3QMSA 3DI0A 5HUPA 2PRHA 2HMCA 5F2GA 4IXXA 1O4UA 3NGJA 2HTMA 3NG3A 1Y0EA 1EUAA 2BXVA 3NL6A 1ZFJA 3LRKA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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