3L67A

Xenobiotic reductase a - c25s variant
Total Genus 130
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
130
sequence length
358
structure length
358
Chain Sequence
ALFEPYTLKDVTLRNRIAIPPMSQYMAEDGMINDWHHVHLAGLARGGAGLLVVEATAVAPEGRITPGCAGIWSDAHAQAFVPVVQAIKAAGSVPGIQIAHAGRKASANRPWEGDDHIAADDTRGWETIAPSAIAFGAHLPKVPREMTLDDIARVKQDFVDAARRARDAGFEWIELHFAHGYLGQSFFSEHSNKRTDAYGGSFDNRSRFLLETLAAVREVWPENLPLTARFGVLEYDGRDEQTLEESIELARRFKAGGLDLLSVSVGFTIPDTNIPWGPAFMGPIAERVRREAKLPVTSAWGFGTPQLAEAALQANQLDLVSVGRAHLADPHWAYFAAKELGVEKASWTLPAPYAHWLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Cysteine as a modulator residue in the active site of xenobiotic reductase A: a structural, thermodynamic and kinetic study
pubmed doi rcsb
molecule keywords Xenobiotic reductase A
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas putida
total genus 130
structure length 358
sequence length 358
ec nomenclature ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date 2009-12-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3l67A00
1ZALA 2KZHA 4FNTA 1SFJA 1OX4B 1HO1A 4AF0A 2VFHA 3DXIA 3W1RA 4NX5A 2JKAA 4AXKA 3WK0A 3L5LA 5CPLA 2NX9A 5EMUA 5D09A 4O17A 2DU2A 2WKJA 2Y62A 3DAQA 4EWND 1BWKA 3N73A 1IXPA 3O6CA 5F2GA 2FB2A 2X16A 2A1YA 4R53A 2Y85A 4H6KA 1J5TA 4A29A 1HO4A 5D2TA 2QEZA 3O16A 3FJLA 4LUJA 3RFAA 1DV7A 6ALDA 4Y6GA 4N6EA 3MP5A 3C3NA 2Z6JA 5C54A 2Y7FA 2HMCA 2B7OA 1W3NA 1G67A 3R89A 2HSAA 3UWUA 2Y7GA 3HB9A 1EP2A 4ORIA 3W7LA 1H51A 3F4NA 3F03K 3PB2A 5KSWA 4GFSA 3LRKA 3DBPA 3NM3A 4AVFA 3FKKA 3CEUA 1IXQA 2RDTA 4QAIA 1GJPA 4MYAA 1ZAHA 1F6PA 3ZR4A 4QSHA 3T7VA 3A23A 1GVRA 3MJYA 3W7EA 2ZRUA 4LWWA 2CLKA 2DP3A 1PE1A 2JBMA 4XUGA 5BMWA 1RR2A 3LXCA 3O63A 2Y89A 4UTJA 4AWUA 4HPJA 4PA8A 5DBTA 2QCCA 3W7KA 1D3HA 2Y63A 3L9CA 3P80A 1JCYA 1FX6A 4O53A 5CGQA 3W87A 3LXAA 4MOZA 4QNWA 3TU9A 3EWWA 2RDUA 2E68A 5G5IA 4MZYA 3ABQA 3B04A 4HSOA 3GDTA 3NQ8A 1WX0A 1TPUA 1EPXA 2GQAA 3W6YA 3P7YA 5LNSA 5DELA 2PE4A 2JGYA 3CEPA 1I8JA 2C18A 3KVJA 3M6YA 1W0MA 2DJXA 3HBLA 1TTIA 4O1DA 4IWWA 1KTNA 2QF7A 4WY0A 4XZ9A 3BPWA 2EAWA 4C1KA 4WXZA 4ADSA 3G24A 3CIXA 3STEA 3S1UA 1LROA 4R7JA 2YXGA 4NXKA 3W7GA 1LYXA 3W3OA 3DI0A 1MO0A 2GVJA 1AG1O 3G1XA 1SR9A 1FWSA 5DCBA 5LKYA 1QPNA 4AF0B 1TJRA 3WFAA 4FF7A 4K7VA 1OFQA 5FF2A 3MO7A 2A5HA 3AJXA 1OK4A 3G8EA 3TSBA 3NQMA 1KV5A 5DCEA 3NQCA 1I45A 1SW3A 2NZLA 1NFBA 4O1BA 3E12A 2A7PA 1HG3A 1BTMA 5MHBA 3L0KA 3PSWA 1A5CA 1QAPA 3W73A 2YPIA 4AMAA 5IBXA 1Q45A 4FX8A 5CPNA 5E0KA 5E93A 4AWTA 4O15A 3NL3A 2Q8ZA 1L6WA 2QUTA 2TYSA 2GVLA 1FDJA 3GKFA 3SIZA 1GG1A 4DF1A 1SO6A 2C3ZA 3KOFA 1YXYA 2QDHA 5HR6A 3KAOA 3G3MA 4UXDA 5CZ0A 1ONRA 3Q58A 1LM1A 3R8RA 3N2MA 2H3DA 5D05A 4DF2A 4JD4A 3M0ZA 2FPTA 3W84A 3PUEA 4OHQA 4E0CA 1ME7A 3W7RA 3LHTA 3C56A 3KVMA 4GE8A 4JTUA 4LS2A 2HS6A 5HJLA 1FXQA 3V75A 3HG5A 4UMAA 4TU1A 4JTSA 2B7QA 3EWXA 1QOPA 4PODA 5D2WA 3S1XA 2H3BA 5I3GA 1H7PA 3EWBX 3LTSA 2QCDA 3C2VA 4NT0A 3H53A 4RZ6A 4RCXA 3TQVA 3W1MA 2GPTA 4IMGA 2PRHA 1G4PA 1W3TA 3QEZA 2QUUA 1LOLA 3THQA 3W7IA 4JDBA 4DF0A 4NU7A 3B0PA 4EF9A 1KFEA 4N6FA 5CSSA 4CNPA 4L4MA 5CPMA 3TMQA 3FYOA 3N9SA 3TROA 3QQ1A 3DFSA 1XFBA 4UTMA 1X1ZA 1B3OA 2OT0A 3SGUA 3E49A 1B4KA 3BARA 3W72A 5HWJA 2PRMA 4JTEA 3W7QA 2ZDRA 2WNNA 1O5XA 2J27A 4HKPA 4JR5A 5K4XA 5L9FA 1DVJA 1U5JA 2A85A 3I6RA 3EX3A 3PBYA 4NNCA 4JYDA 3ZFHA 1OJXA 4XWUA 4RXFA 5U7SA 1MEHA 4S2BA 2VOMA 2FTPA 3HJZA 2CWNA 3CIWA 1I2NA 3LCHA 2YFNA 3PBUA 4DO4A 1M7PA 2ZZ7A 3M9YA 5AHMA 5FESA 1DJNA 4NQ1A 1ZAIA 4U28A 4UR8A 2I9EA 5K4ZA 3BLFA 1ICSA 3ABOA 4K36A 4XQ6A 2QAFA 1F2JA 1FQ0A 2E6AA 4JTKA 4A2RA 4NJIA 4TX9A 3LTYA 1GG0A 4PCFA 1F5ZA 4DELA 2V5LA 3GXNA 5EY5A 4FNUA 3S1VA 4JNMA 5LNVA 3PR2A 2ZA1A 2NWSA 3L5MA 4K39A 2B0MA 3CC1A 3IGXA 1XBVA 4ICNA 2OT1A 4OV4A 3SW6A 4LY8A 3WJSA 1XBYA 2CLOA 3EWYA 4UFLA 4I7VA 3GB6A 3KXQA 3I65A 1GT8A 1IGSA 1YTEA 4ORMA 5FF4A 3TFXA 4RZ4A 2VEKA 3RK8A 3UYCA 3W1UA 1TPWA 3DFOA 3LDVA 3TSMA 4JX6A 5DY3A 5LNUA 1GPWA 3W1QA 4PEKA 2H8XA 4NJKA 3IIPA 3R13A 4HT3A 2R8WA 3W1TA 2QCEA 3QRHA 4NNBA 1VYPX 1OF8A 4FXRA 1PHQA 1YDNA 1XC4A 1WBHA 1L6SA 3DFQA 1YLVA 4MY8A 1JUBA 4IXXA 3TQ0A 5K9DA 3GZ3A 3ATZA 3HPZA 4UNKA 4Z1BA 1OHLA 2CZDA 3LCGA 3EXTA 5CZTA 5SWUA 3N19B 2A7NA 1X8FA 4QNEA 4WUIA 3LCXA 3CWOX 3HG4A 2B7NA 4Y9AA 1JUEA 3C2EA 2GQ9A 4O16A 3PG9A 2QDGA 4FIRA 2E5BA 5L6UA 3SSJA 3N14A 3THAA 1Z41A 5I3JA 1RQHA 2JK2A 3HGJA 3PSVA 3O1NA 4LVBA 1PS9A 3A5FA 3BGJA 3KX6A 3O6DA 1H7RA 3NYZA 3SECA 3TC7A 1TTPA 2ZRWA 4Z1CA 5KTLA 2BSLA 3LXBA 4CNNA 2NV2A 2J9XA 5DY2A 3IGUA 1W5PA 3P8IA 1OFPA 5AB3A 4LTSA 4A3UA 4O10A 2Q3OA 1SQ7A 5BRBA 1TJPA 4PC8A 5IBXC 3L67A 3NL2A 1BKSA 5CG7A 1H61A 2WOQA 1ME8A 4JX5A 3W07A 5DLCA 4M7TA 3QQ0A 4N02A 5TBOA 4DEFA 4TMCA 3F1QA 1T8XA 4RX0A 1WOBA 4IPJA 1ZENA 3MYOA 4LNYA 4AH7A 4IQLA 3SJ3A 1R2RA 2ATSA 5HULA 4UUIA 2Z0IA 3IVTA 2CZFA 1W31A 1B57A 3FIGA 1QR7A 3MWAA 4YXGA 4G1KA 3P67A 1FCUA 3S6DA 4JY9A 2XN0A 3TK7A 1H1ZA 1L2UA 4MJMA 1RV8A 3MBFA 4FNSA 1K3UA 3DI1A 1VS1A 4OQVA 1ADOA 4HSNA 3HMJG 1YDOA 3TE9A 4O57A 1TB3A 3W23A 5A5WA 4IPIA 1H7XA 1NF0A 1VRDA 3BLEA 4PFMA 3PVFA 5H2ZA 3CWNA 3O8AA 2YFOA 5CSRA 4MFDA 4WY0F 3UQNA 2IQTA 4ADUA 2QUVA 5EBUA 2FLIA 1Z48A 1GYNA 3MP3A 4N9EA 2ZRYA 1H50A 3HO8A 1ZCOA 3SGZA 5D03A 3QC3A 3GKAA 1AW5A 3QW3A 5LGZA 3M5VA 4JYEA 1KTCA 4HNVA 4O19A 4DBEA 3MP4A 1QO2A 1EIXA 4ZQMA 4M19A 3NQFA 2QCHA 3WJYA 4M6PA 4NX0A 1EWEA 3QF0A 5FF3A 5AC6A 1H7OA 3B03A 4WOQA 2AGKA 2ZZ4A 3MYPA 3O07A 1F73A 3NEVA 1P5BA 1GVFA 3SR7A 4ZQPA 3NQVA 2FIQA 4GUJA 3NPXA 4JDYA 2VFDA 4MZ8A 1I4NA 1FDYA 5AYZA 2C6QA 1KA9F 3MI2A 2A21A 5HINA 1P0NA 1PCWA 2A4AA 5AOUA 1W5OA 1LBMA 4LC8A 4WD0A 2B7PA 3NL6A 2V9DA 4O28A 4LRTA 2QJIA 3EX2A 1LRQA 3STCA 1H62A 4R34A 1JR1A 5K3VA 1ML1A 1MSSA 3B0VC 1WYIA 4HNNA 3R5EA 4I7UA 1Q3NA 3GDRA 2O7QA 4BWLA 3O05A 3KRZA 1PHWA 1O60A 3QW4B 4Z0JA 4XTIA 1XXXA 2NX1A 4HN4A 3GNDA 4RKAA 4BI7A 2YR1A 3GXTA 1SSGA 3E9AA 4GBUA 3BVJA 4XTDA 1QPQA 3W1XA 1KM1A 4IUOA 3G8RA 3LV6A 1LRTA 5DXYA 3L21A 3FEMA 1XKYA 4JIPA 5AN7A 5C55A 3Q2DA 2D73A 2NXGA 1QWGA 3MHFA 3CQ0A 2ABAA 1XL9A 1G4TA 2DZUA 1EUAA 1ZY9A 3TMLA 4BI5A 2WSRA 3W2MA 4GUFA 1VZWA 1SO4A 1YXDA 5KMYA 2ZRVA 2BZNA 4KFOA 3TAOA 4O0ZA 4NJHA 1Q6LA 3PBWA 4NJJA 3P61A 3NR0A 3GLCA 3LB0A 3TH6A 3C52A 1O4UA 1OK6A 2GJLA 4UMCA 4DBDA 5C5YA 4KWVA 3G22A 1W1ZA 3W74A 1JQVA 1BEUA 4WOZA 2TSYA 3GNNA 5FF7A 4YL2A 5F1VA 3I7RA 3U6WA 3QSTA 3C2OA 4TR9A 3NPUA 1TCDA 4UTTA 1H7WA 4H4IA 2Y61A 1MEWA 4FNRA 4JTFA 3MI6A 1JVNA 3I68A 1F6KA 4GUIA 2VKZG 3S0CA 1EP1A 2NV1A 3BW4A 4R33A 4Y96A 5D32A 3HGRA 1K8YA 1S5WA 3R2GA 1D3GA 3PB0A 1W5QA 2HTMA 5FEWA 5F2MA 2QCMA 2TMDA 4ONVA 4ALDA 4MLJA 4AHQA 3LCFA 2RFGA 3LRLA 1H63A 2ZZ6A 5K2ZA 5C6MA 3RU6A 4AHOA 3UZ5A 2EPHA 3INPA 1JCMP 2LLEA 4MJZA 4M7SA 4N9BA 3WK3A 1TTQA 3M7WA 4K38A 4N2YA 2C16A 4EVZA 1YYAA 3P5ZA 2QKFA 3MMTA 4LOCA 4CCDA 3UWYA 4ZQCA 2JKPA 4E2DA 3OEXA 2WSYA 5KZEA 1LORA 2ZBTA 1S3HA 2YDAA 3C2RA 3W2NA 3W75A 1LTDA 1S5TA 4HIBA 4N4PA 1I2RA 1JCJA 1XDLA 1PCKA 1OFDA 4YWIA 1RD5A 3IIZA 3LLDA 4LUIA 3T78A 4CNOA 4DO5A 2YW4A 3G1SA 1FBAA 4JS3A 5FF0A 4CQ9A 1OYBA 3HGSA 2QCGA 2V2HA 2V5BA 1SZEA 4I9AA 1SO3A 4WZHA 5HQEA 3HPSA 1Q6OA 3FLUA 4JTHA 4RJEA 3WJWA 1VH7A 4AHPA 3W2JA 1C8VA 3LGEA 3MI3A 1ICQA 4Z1DA 2FB3A 3QH2A 5HNRA 1V5XA 3TCEA 1YADA 2QJGA 3FFSA 4KFPA 2GOUA 2UV8G 4N9CA 4UFHA 4LC6A 4LS0A 4M5PA 3W1AA 4GWEA 4YCOA 5D04C 4HNTA 4Y8FA 1L9WA 1VGAA 1N55A 3M47A 3UPWA 1T99A 1X6UA 3L66A 1MZHA 4DXVA 1PV8A 4OT7A 4JTJA 1PIIA 1W5MA 4CQAA 3LCIA 3N34A 3LCLA 1KM4A 1R2SA 2VEIA 5AHIA 1K03A 3BLIA 1GWJA 4FB7A 4DQWA 1QCWA 1QMLA 2ZYFA 3WJZA 4O11A 1OF6A 1I2QA 4JTLA 3VFLA 5CZJA 3C6CA 2W79A 3CTLA 4FIQA 5D30A 2C1HA 1M6JA 3PULA 4AEOA 1ZJIA 3GXPA 3TQKA 1NF7A 2PURA 3TW7A 1LOSA 1OFRA 3E0IA 1KFJA 3EKZA 1OG0A 2WQPA 3T4CA 3NQ6A 1W56A 4CCEA 1DJQA 1Q6QA 4X3ZA 4O52A 5TQLA 3WK2A 1LCOA 4Q33A 2FQIA 3W7MA 3LBCA 4EIVA 2FFCA 1TV7A 2NXIA 1SUXA 3W1LA 5HMSA 1Z44A 4BWLC 5I3HA 5EPDA 1S5VA 3GX9A 3W83A 1J4EA 3EEGA 1MEIA 1AW1A 3LX9A 2BTMA 3V1PA 1FWTA 1W8SA 1EUNA 3MW7A 3S42A 1T96A 2AQWA 2J9ZA 3NG3A 1ICPA 4XBSA 3NZ1A 4IXHA 4QIUA 4QM1A 1TQJA 1HUVA 1A5BA 3DZ1A 3PAJA 2QCFA 3A5VA 1LBFA 1QPRA 3R12A 1J2WA 3GR8A 5AHLA 2WJZA 3ABSA 3BV4A 1SZFA 3A9IA 1LDCA 1VC4A 1XUZA 4UFMA 1SW0A 1B9BA 3O6YX 3RLUA 4YLWA 1KM2A 3WK1A 4X22A 3IGSA 2V8ZA 4O54A 2DZWA 5D2VA 3DU0A 1KFKA 1TO3A 3W76A 4UTLA 4TO8A 4FNPA 3MUXA 4M6QA 4NUWA 1VCVA 3PUDA 4O12A 2X1UA 3S5YA 2C15A 3FJ6A 1H5YA 2FPVA 1SZGA 3L5AA 3LHYA 2X2GA 4S1FA 1LP6A 2YZRA 4JEQA 1HFBA 3QMTA 4PTNA 3H55A 2Z2UA 5BMXA 2NUWA 2AAMA 1O94A 3M43A 3LHVA 1SO5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2G5W A;  1F7B A;  2R14 A;  4EF8 A;  1B4E A;  3W1P A;  2RDW A;  2DZS A;  3G1F A;  7TIM A;  3NZR A;  4JIC A;  1LLZ A;  3PG8 A;  2P0O A;  3SFK A;  1G69 A;  1EP3 A;  3W71 A;  5G4E A;  1E51 A;  1FCV A;  5DXX A;  1LOQ A;  4GXM A;  3BW3 A;  4O4W A;  3H54 A;  1TTJ A;  3BG3 A;  2ZZ3 A;  1DQX A;  1SU5 A;  4S2C A;  1KFL A;  3W70 A;  1EWD A;  3FKR A;  1KBJ A;  1WOA A;  1OFO A;  2E5C A;  1GEQ A;  4LVG A;  2A7R A;  4IX0 A;  5LSM A;  1EX5 A;  1JRB A;  2O7S A;  1PVN A;  1H60 A;  2CZE A;  4AWS A;  2DZX A;  1JUL A;  2QCN A;  1RPX A;  4IME A;  3DHF A;  1VR6 A;  2DZT A;  3SZ8 A;  3TV8 A;  1Y0E A;  3JS3 A;  4LW7 A;  3TDF A;  3NVT A;  1AK5 A;  3NNT A;  4POC A;  3M5X A;  3G1Y A;  1H1Y A;  2BLE A;  4ADT A;  2VEN A;  4NXS A;  1H7N A;  1TV8 A;  3HG3 A;  4EOU A;  3OVQ A;  2QJH A;  4O14 A;  1LBL A;  3W7H A;  4JIQ A;  3VI2 A;  2ZZ1 A;  4FO4 A;  4ML9 A;  3PM6 A;  4MKN A;  3P62 A;  3W1N A;  5F2I A;  1G7V A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1T8Q A;  1ZAL A;  4C6K A;  1BHG A;  4AF0 A;  3HFY A;  4AIS A;  4I6K A;  4NX5 A;  2NX9 A;  5EMU A;  3ICJ A;  4O17 A;  3EBV A;  3RLG A;  2XGI A;  1ENU A;  3GVW A;  3N73 A;  1FWG C;  4D71 A;  1VF8 A;  2Z25 A;  1UZ1 A;  3GG0 A;  2ZWZ A;  4R53 A;  1O6I A;  1J5T A;  1HO4 A;  3UZW A;  5D2T A;  3O16 A;  3IUI A;  4F3H A;  1K9D A;  3RFA A;  3A4J A;  3WO8 A;  3GHT A;  3B40 A;  1V6U A;  4N6E A;  2GJR A;  3C3N A;  2Z6J A;  4C6O A;  1TE6 A;  5C54 A;  1F3T A;  2HMC A;  1W3N A;  3HB9 A;  2XDF A;  4ORI A;  1H51 A;  1XC6 A;  3F03 K;  2OYL A;  1EJW C;  4GFS A;  4JQ1 A;  4RE4 A;  3ZZ1 A;  3MUI A;  1XR2 A;  3DBP A;  4AVF A;  3STP A;  1MNZ A;  3CEU A;  1OEP A;  1GJP A;  1V02 A;  1VFF A;  4MYA A;  3ZR4 A;  1F6P A;  2I16 A;  3UA4 A;  3KEH A;  1ZPT A;  1OIF A;  1FWC C;  3BAJ A;  3QV9 A;  3URA A;  3W7E A;  3C86 A;  2ZRU A;  4LWW A;  2VTF A;  1TR9 A;  2RJH A;  1YNQ A;  4S3E A;  4XUG A;  3PAO A;  2IUZ A;  1PYF A;  3O63 A;  4HPJ A;  3W7K A;  3P80 A;  3GG8 A;  4O53 A;  4O0Q A;  1F4A A;  4MOZ A;  4B15 A;  2WZT A;  2RDU A; 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