3LGEA

Crystal structure of rabbit muscle aldolase-snx9 lc4 complex
Total Genus 140
50100150200250300020406080100120140
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
363
structure length
349
Chain Sequence
PHSHPALTPEQKKELSDIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHIYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKYSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGVTFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSNHAY
5010015020025030030025020015010050
020406080100120140Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
TII1 (24-27)S10 (296-301)S1 (28-32)TI1 (69-72)AH11 (306-313)EMPTYO1 (49-51)AH3 (52-64)AH4 (80-84)AH12 (320-338)3H1 (67-69)S2 (73-78)AH5 (93-100)TI3 (87-90)S3 (103-107)S4 (111-114)S5 (122-125)TII2 (115-118)S6 (144-152)TIV1 (118-121)TIV2 (156-159)AH7 (160-179)TI4 (154-157)AH8 (198-219)S7 (183-191)3H2 (223-225)AH9 (245-258)TI5 (236-239)AH10 (276-288)TIV3 (261-264)TII'1 (271-274)3H3 (303-305)3H4 (317-319)TI'1 (313-316)AH6 (130-140)TII3 (127-130)S8 (227-228)S9 (266-269)AH1 (9-23)AH2 (36-46)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Lyase/protein binding
source organism Oryctolagus cuniculus
publication title Mechanism of aldolase control of sorting nexin 9 function in endocytosis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase A
total genus 140
structure length 349
sequence length 363
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2010-01-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3lgeA00
4KFPA 3GNDA 2HS8A 4UNLA 1LBMA 1H7PA 3TX9A 3CEPA 1W5NA 3SI9A 4IX2A 4LY8A 1RQBA 2VELA 3RLVA 1TV5A 3W87A 1DJQA 1Y0EA 1TQJA 3NR0A 1TYGA 3BLEA 3B03A 1KM3A 2H8XA 3QC3A 1TMHA 3LHVA 4YCOA 4XWUA 5DY3A 2JK2A 3W2UA 5BOOA 1H5YA 1YTKA 4N6FA 2VEIA 1PIIA 2NX3A 3VKJA 3QPZA 5FF7A 4H6KA 3MHUA 4FNUA 2ABBA 1VRDA 3CLMA 2D73A 1AW5A 3MHFA 4EVZA 3DXIA 3O16A 4O14A 3IIZA 4TMBA 2BSLA 1NVMA 3TQ0A 2VOMA 2ALDA 1KV5A 5DBTA 4AHQA 1C29A 1QCWA 3SSJA 4Z0JA 4QIUA 2CLOA 3OVQA 2Y89A 4Z1AA 4MLJA 4NX5A 4O19A 3TQKA 3P67A 1K03A 1QMLA 3EKLA 4NNAA 3GXTA 4PL2A 2R14A 5EPDA 3MWAA 1SSGA 2Q8LA 4A21A 3B0VC 1UBSA 3OEXA 3PVFA 1ZJIA 3BW3A 3I7SA 3ZWTA 4JIPA 3IRDA 1TB3A 3S5ZA 3O63A 4O17A 2X1SA 1HO1A 2B7QA 4OE7A 2H3DA 3MI2A 2ISSA 5CZJA 4P61A 4AF0A 4ZQPA 5D2VA 4LRTA 1PHWA 3LOTA 4DBEA 3U2OA 4DXVA 4HPXA 2QCCA 3FS2A 3WK1A 3TR2A 1QFEA 1QO2A 2VEPA 4IOTA 3NPUA 3NQEA 3EX2A 2ZZ4A 4L4LA 4XBKA 3W1XA 4NJHA 3S1XA 2QAPA 1GVQA 1WV2A 4AEOA 3CIWA 2CLKA 4MVAA 3GAKA 2Y7EA 3L0NA 5K2ZA 3NDOA 2VFFA 4FB7A 1T99A 3PB2A 5FF2A 3AO0A 4A3UA 1Z42A 4ZQOA 4JS3A 2JKEA 1OK4A 4ONVA 3GDKA 3TUUA 3W72A 2ATSA 3RF9A 3L5MA 4TX9A 3DI0A 5AHEA 5KSWA 1FWTA 1LOSA 1JQXA 3C2VA 3C56A 4JYFA 1FCQA 3GR8A 5E0KA 4ALDA 4CCCA 3SY5A 3HOJA 3P82A 1K3UA 4EOUA 3NL6A 1DVJA 2C6QA 3EWUA 3SZ8A 3KVLA 1OJXA 1KM6A 1KFCA 4FX7A 3QMRA 1L9WA 2E6FA 3GDMA 4UIOA 3KOFA 2Q8ZA 4MFEA 5CZTA 3R5EA 5BW6A 5CKSA 4XQ6A 2H6RA 4ZZ9A 2E5DA 1TV7A 3UYCA 2GPTA 3PSVA 1EP3A 3NL3A 2ZRZA 2V5LA 4YMZA 3PUDA 1BTMA 4YCPA 3GXNA 5CZ0A 3NO5A 3MBDA 3GZ3A 2F84A 3EWYA 1A53A 3KFTA 1PS9A 4J9JA 2ATMA 5KINA 1C8VA 1KBJA 2Y6ZA 3HJZA 3SGZA 3WJZA 3L5LA 3RU6A 1Z44A 8TIMA 1TO3A 2YCEA 3FLUA 4BR1A 3KRSA 4Z1CA 3B4UA 4EF9A 1QR7A 3OVRA 1GYNA 1EP1A 3QSTA 1IXQA 3I65A 3IVSA 5CPNA 3QZEA 1GEQA 3MJYA 3T7VA 4R34A 4NJIA 3UWUA 5CZSA 5BMXA 1Q3NA 3HIJA 3IGXA 3FFSA 4OU1A 4RXFA 4UFMA 4Y90A 2TMDA 2YYUA 4JY8A 3ABQA 3W1AA 2TSYA 1TQXA 1TPB1 3W7JA 1G69A 1W3IA 3NAVA 4YLWA 2CW6A 4E2BA 2A21A 3UQNA 1LP6A 1CI1A 3KVJA 5D30A 2A6LA 1I2NA 3C2EA 3CQ0A 4XKYA 5HWMA 1W31A 1KLYA 3BARA 2J9XA 3TA6A 1OABA 2B7PA 1A5AA 1LM1A 2V82A 3GKAA 2YXGA 2ZRUA 4JDYA 1SFLA 5AYYA 2DP3A 1TTIA 3WK0A 3S8HA 2O7SA 2OJPA 5D2WA 3LRKA 3P7YA 3USBA 1TREA 3L66A 3EWZA 4WY0B 1DV7A 3NQ8A 5D09A 2R8WA 1IXNA 4C1KA 3O1NA 4NJJA 1FQ0A 1P1XA 4DPPA 5CGQA 1LOLA 2B0MA 5AN7A 3OHIA 4DBDA 1S5TA 3FYOA 3IGUA 2DZTA 1TRIA 1MSSA 3G1VA 3C61A 2Y63A 2LLEA 3H54A 1OFPA 1YTEA 3A23A 3ATZA 5G2WA 4KFOA 2DJXA 5C2XA 3W85A 4JICA 5D33A 2H3BA 3CC1A 4GUJA 1KM1A 4FNRA 2CLLA 2P1FA 2EKCA 1LDCA 2JBMA 1XXXA 4IUOA 4TR9A 1TPUA 3PS7A 2J9YA 3L68A 5LNRA 5KMYA 3M6YA 4X3ZA 2FPYA 3KHJA 3QW4B 2R94A 4MIMA 3DFOA 5I3FA 1DQXA 4O12A 4RZ5A 5A5WA 4WXYA 4M6VA 5AYZA 1LRQA 3TDFA 3H55A 4JTIA 1BKSA 4LT9A 6TIMA 4PTNA 3PULA 3LXBA 4WJEA 2NV2A 2NWSA 2GQ9A 5G1TA 1ZAJA 4TIMA 3S5YA 4RJEA 2NX1A 1IXPA 4E38A 4LUIA 3TNOA 3EXRA 1K8YA 3PG9A 4UFKA 2RDUA 1LYXA 2HS6A 4K39A 4FEZA 2YW3A 1IXOA 2X16A 5CSRA 4D2JA 3M44A 5TIMA 1H63A 3HG4A 4YWIA 5D37A 3SIZA 2F7FA 3STEA 3W23A 5J5DA 4GUGA 5LZLA 4FX6M 3R8RA 5LHFA 2DZVA 3W71A 3W73A 3NGJA 2DJLA 4FHAA 3TV8A 3W88A 1F05A 1U5JA 3W76A 3NEVA 1F74A 7TIMA 1Z48A 1NF0A 2Y7DA 1VR6A 3GXPA 4LTSA 3W86A 5LNVA 2BZNA 5HINA 3W7CA 3QYQA 6ALDA 1B57A 4NJKA 4CNOA 3CTLA 2XFWA 5FESA 4IPJA 3T55A 2FQIA 1YDNA 2E6AA 4AAJA 3W70A 2NV1A 3WJWA 3P62A 4JYDA 1KFJA 1V7YA 4CCEA 2ZDRA 1O5KA 4JTSA 1HG3A 4PCFA 4LVDA 4U4MA 3MI3A 2ZTJA 3FJLA 1X7FA 1M7OA 3C3NA 4MFDA 1DL3A 3OBKA 4HSNA 3NQGA 1TTQA 1AMKA 4KFNA 2YW4A 4OBTA 1NF7A 1XDMA 3DU0A 1D9EA 5D05A 1W3NA 2TYSA 1LLWA 1JRBA 4JX6A 3I6RA 1OF8A 4N9CA 1FDZA 1I2RA 2A7RA 3P8JA 4MUZA 2GJNA 1LBFA 5F4SA 3IVUA 4ML9A 4RXGA 3G8RA 1LBLA 5D2TA 2FB3A 4AMAA 2CZDA 4DF1A 3TFXA 3EB2A 4JEQA 3P60A 4OGZA 3S5NA 3ABSA 3SJ3A 4QAIA 3UWZA 1H1ZA 3HPSA 4RR4A 1Q45A 2Y7FA 5F2IA 5I3KA 3BLIA 4MYAA 4QITA 3S1UA 4FO4A 1DQWA 3F4WA 3S1VA 1W8SA 4WD0A 1SZEA 1GT8A 1M5WA 1IIGA 2E6YA 4O1AA 4GFSA 4QSHA 1WOAA 1S3HA 1OHLA 2YGYA 4HHPA 1DHPA 4PFMA 2DORA 3TU9A 3G0UA 3PY2A 5AFDA 4CNPA 1O94A 1TSIA 1I2QA 1H7XA 4MY9A 3GVGA 2WPBA 4P2VA 5AC6A 2JKAA 5LSMA 1PE1A 2ZZ5A 4U28A 1L2UA 1K02A 2V9DA 3BPWA 1OX4B 2E09A 2DZXA 4DO4A 2Y85A 5KTLA 4QISA 4XTDA 3P81A 4A2SA 2A6NA 2ZBTA 4GBUA 3LHTA 4RCXA 4K6AA 1EWDA 5H91A 5AYXA 2G96A 3M47A 4B5NA 4FNTA 1B4KA 1NEYA 4HN4A 3TMLA 2NUWA 3UXDA 3G18A 1XBVA 2VFGA 2QCEA 3TFCA 1GPWA 5L9FA 2I1OA 4Q32A 3G1HA 4YXGA 3W2MA 5C5YA 5LGXA 1HO4A 3NOEA 1G67A 3G1XA 3GDRA 3MI6A 4WX2A 4MJMA 1AW2A 1VZWA 3DENA 2NX9A 4JD4A 3W1RA 3TMQA 2ZZ7A 4UC5A 4UTTC 3VE7A 2G95A 3EWWA 2Y88A 1S5VA 3EXSA 4LNYA 1PV8A 3LTYA 4AWUA 2ABAA 1QPOA 3DKLA 1TPVA 4CNNA 3GIYA 3GK0A 3MYOA 4PODA 3QMSA 3R89A 3HBLA 3L9CA 1SW3A 3G8EA 1AK5A 1KFBA 1LRNA 1W1ZA 2BX7A 3A5VA 3W2KA 3LHZA 4FNSA 4UUIA 3E9AA 3SW6A 4DF2A 3BGGA 1OX5A 1L6YA 3O06A 3LHYA 3A21A 3UZ5A 2VFIA 5DY2A 1RD5A 4LVFA 4UTIA 1FWWA 3G3MA 4IXXA 4LU0A 1H50A 1OFBA 5F4XA 3LBCA 3VFLA 1SO5A 2DZSA 3LI0A 3P84A 2WNZA 4EF8A 4HNUA 3HPZA 4XUGA 1OFOA 5EYWA 1YXCA 4E2DA 1OFEA 4S2CA 1BEUA 1G4SA 3HGOA 3T44A 4QM1A 1YTDA 3NM1A 5HQEA 3LXCA 4O8RA 3FJ6A 1TTPA 3PBWA 4GUFA 4RLIA 5D38A 1SO3A 3W07A 2Z1BA 2C3ZA 4UR7A 1JCYA 5KITA 1SO6A 5DBUA 3T4CA 2QCLA 4N9BA 4TMCA 3GKFA 3QQ1A 3V1PA 1EEPA 4ADUA 3C52A 3HF3A 1X8FA 1ALDA 4IMFA 1KFLA 1QPQA 4KWVA 1YPFA 2ZA1A 3NZ1A 1RR2A 1N55A 2A7NA 4AVFA 2YPIA 3M5ZA 4Y9AA 3KAOA 3OVPA 4JTTA 4XZ9A 2ZYFA 1IIHA 3CEUA 2RHGA 4OT7A 4JR5A 5LNWA 3MP3A 3N73A 2C18A 2O7QA 2QUVA 1I8JA 3O6CA 4AHOA 3PBUA 2ZRYA 2FTPA 2J27A 5L6UA 4ZQMA 2OCZA 3FKRA 5BMWA 3S1WA 3FKKA 1ZNNA 5BNKA 3N2MA 3QMTA 2XN1A 1JVNA 3S9YA 3CWOX 3MP5A 4HIBA 4FNPA 5AHIA 1OFQA 2RH9A 3W1UA 4K7VA 1TPWA 3M0ZA 5T26A 4AXKA 4PH6A 1MXSA 3LCXA 4K36A 4X2RA 5DN1A 2ISWA 4LV9A 2QAFA 3FA5A 1FX6A 3N9RA 4IMGA 4WXZA 4UFLA 3C2FA 3PBVA 1QOQA 3W7PA 4LUJA 2EF9A 2Q3OA 3G1SA 1RQHA 2GQAA 5AC7A 3RFAA 4UR8A 2QUTA 4RZ6A 3LM7A 4BI7A 1KLZA 3SECA 2E5BA 3W22A 1XBYA 3JS3A 2WQPA 5TQLA 3W1PA 4EIVA 2J88A 5ABTA 3PB0A 2BTMA 4O0KA 1L6SA 1GTHA 1WOBA 4RV8A 2XN2A 2QCDB 4LS1A 4JTEA 3W7NA 2NWRA 4X22A 3M1ZA 1F2JA 3CU2A 4BI6A 3LRLA 3GYEA 3PSWA 1XI3A 4NNBA 3TC6A 3W1NA 2WOQA 3IIOA 1W37A 4GE8A 1X1ZA 1G4PA 2J24A 4LC6A 1FXPA 1RZMA 5LNSA 2Y62A 5FEXA 3PBYA 4R7JA 3NQDA 1TPFA 3N19B 3HMJG 2ZZ1A 1L6WA 1ME8A 1XKYA 3IIVA 4ZMGA 1WDWA 4HSOA 5G4EA 2B7NA 3WJXA 1ZAIA 2VEMA 2NZLA 3O07A 4ADSA 4LS2A 1XCFA 2ZQ0A 3NA8A 3TH6A 2A85A 3HQ1A 4QQ3A 5I3JA 3LXAA 3OG3A 3KVKA 1K7EA 1LTDA 3W7HA 3C2OA 4NXSA 2QCDA 4WQ6A 4Z1DA 3M5VA 3NQ7A 4FIRA 4MZ8A 3EKZA 5HWJA 1SW0A 1ZHAA 1MZHA 3DFPA 3BO9A 4IXHA 4WUIA 5TBOA 5MHBA 2GOUA 2AGKA 4UTKA 1GYLA 3NPWA 5E93A 4O1DA 3BGJA 1F5ZA 1JCMP 1M7PA 1JQVA 1K7XA 2ZRXA 4H4IA 5DCDA 2EHHA 3UD6A 3LX9A 4O50A 5KZEA 4O4VA 2A1YA 4UTWC 3LCFA 3W7RA 1JR1A 1WQ5A 1G7VA 3BLFA 3HG2A 3IIPA 3QEZA 5F1VA 4WZHA 1OFDA 3MYPA 1EWEA 3WJSA 3E49A 4CQAA 2WNQA 3S42A 1HL2A 1DBTA 2QCFA 5AHNA 3NQVA 3Q2DA 3TSMA 4A29A 1JCNA 4JGDA 1EPXA 4JIQA 2NXHA 3CB8A 4ZVJA 4O0ZA 3W7DA 1XDLA 1P0NA 3LV6A 1SPQA 3THQA 1F6KA 4PA8A 1HUVA 2BXVA 2QF7A 2VFHA 3DAQA 2C15A 2VC6A 3IIXA 4BF9A 1JUEA 4CQ8A 1EA0A 5K4ZA 3W1TA 2WSQA 4JN6A 4UFIA 4WY0A 1QWGA 4OV9A 2Y61A 1W5PA 1A5CA 4N6EA 4A2RA 5EL1A 2W0UA 3BK0A 5LNUA 5FEPA 4NXKA 2DZPA 3BG3A 2Z6JA 5DLCA 5LKYA 1W56A 3FYPA 4I7WA 4ADTA 4Z1BA 2A0NA 2ZA2A 2GVJA 3LERA 2PRLA 5LGZA 5CPOA 2VKZG 1R30A 2WSRA 1SFJA 3VI2A 3QRHA 4IQLA 4UFJA 4MLRA 1T8XA 4HNTA 4RK8A 5KZDA 3ZWSA 1A5SA 3O6YX 4GNJA 1B9BA 4ICNA 1JUBA 1KM4A 1MEWA 3DI1A 5CPMA 3I7QA 5KZMA 1EX5A 5FF3A 5G2IA 2YFOA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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