3LTSA

Crystal structure of the mutant v182a,i199a of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from methanobacterium thermoautotrophicum complexed with inhibitor bmp
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
214
structure length
214
Chain Sequence
VMDVMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGAGAQGGDPGETLRFADAAIVGRSIYLADNPAAAAAGIIES
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Conformational changes in orotidine 5'-monophosphate decarboxylase: "remote" residues that stabilize the active conformation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
molecule tags Lyase
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
total genus 81
structure length 214
sequence length 214
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2010-02-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3ltsA00
3FIGA 3W7EA 1EUNA 2B7QA 3G1AA 4PL1A 5EKYA 2ABAA 2EKCA 1YXCA 3NA8A 1SR9A 4UTKA 4NVTA 2QR6A 5AC7A 4LT9A 3EWYA 3EKZA 1XKYA 4QQ3A 4BR1A 1PHQA 3FLUA 2HTMA 3IIXA 2RDTA 4JX5A 3HGOA 3CLMA 3E02A 1NFBA 2PE4A 3UWVA 1GVQA 3G0XA 1N7KA 1A5SA 2RDWA 2DJLA 3CEPA 4ML9A 3QPZA 4NT0A 3C6CA 3ABRA 3LI1A 3M44A 1H7RA 1EX5A 6TIMA 2Q8LA 3W84A 1QFEA 3DFNA 4A29A 2E6FA 1Q3NA 1VS1A 3LX9A 1EP3A 3WK2A 1W31A 3HG3A 2ZZ5A 3LM7A 1WXJA 4K38A 5C6MA 1MSSA 3T44A 2Z2UA 1BKSA 1CW2A 3W1MA 4PODA 1K02A 3OHIA 5CZTA 3QPYA 3NVTA 3L0GA 2ZRVA 4CNNA 4GUJA 1JCJA 1PIIA 1VYRA 5AOUA 5D09A 3W1QA 4RXGA 3E96A 3W85A 4UTMA 1SZGA 1LRQA 2A1YA 5I3FA 2GJLA 3ZWTA 4N9CA 4O15A 3L5MA 1KFLA 1UJPA 2ZA3A 3KXQA 4WY0B 3M5VA 4IQLA 5IBXC 1OJXA 1G4SA 5LNUA 5BNKA 3DH7A 1M7PA 3N19B 3NL3A 4UCGA 2FJKA 3W7OA 5LGZA 3G1VA 1QR7A 2NUYA 2QUVA 3N2XA 2Z6IA 4MZ8A 4HPJA 3W2KA 4UR8A 5DXYA 5FF7A 5LHEA 3ABQA 4FX6M 1IIHA 5LNSA 2BWGA 1FBAA 2OJPA 1XBXA 4UR7A 3LCHA 1Q6LA 1K8XA 2ALDA 4MYXA 3QYQA 1V5XA 1L9WA 3DZ1A 1LBMA 1J4EA 1ALDA 2QJHA 5DLCA 3MHGA 4O14A 5G4WA 5D30A 1TTQA 2AQWA 1FWRA 2VEPA 1QNVA 4UFKA 3F4WA 2B7PA 3C2EA 3EX4A 3QH2A 1GQNA 4OE7A 3W6YA 1AW1A 1JULA 3S42A 2PCQA 2C15A 2V0TA 1QOPA 6ALDA 4AWUA 3P80A 1QAPA 3E12A 3BG9A 4QNEA 3IIPA 2B0MA 4U4MA 4AH7A 1CX9A 3M41A 3G1FA 3T40A 3W7MA 3PB2A 3KVMA 3GDKA 4PA8A 2V5BA 1WV2A 1W5NA 3PG8A 3ABOA 1KFEA 4R53A 1ZFJA 5D2YA 3GDTA 3F1QA 3TUUA 2YX0A 1PL9A 2ZDRA 3R2GA 5G1TA 2YXGA 5BOOA 4Y8FA 4YCPA 2VXNA 1VLWA 1P0KA 1SFLA 2EAWA 5K4XA 4UTTA 3LHTA 3EEGA 3LCWA 2TRSA 2RFGA 3NL5A 3PY2A 1KW1A 3W71A 4OV9A 4HNNA 3VFLA 1LZOA 1ZAHA 3WJWA 1GYNA 1Q6QA 2H6RA 3W74A 3MBDA 1ME8A 4L4LA 3GAYA 2X2GA 1TTPA 2C0AA 1O5XA 5BW6A 3UNDA 1EEPA 1I2RA 1W3IA 2GOUA 3ABSA 3HF3A 3TC6A 3W1UA 4O17A 4GUFA 3N3MA 1W3TA 4JTHA 4O50A 2NUXA 1GYLA 4CCEA 4RLIA 3P61A 2GVLA 4XUGA 3G3MA 5G2IA 1L6YA 2J9XA 4O19A 3S1UA 5CGQA 1AL8A 1NSJA 1FY6A 1OABA 2H8XA 3BLEA 4K8HA 3B0VC 5C55A 1YDVA 1EB3A 2ZZ2A 2WPBA 1R47A 2ZA1A 1W54A 3T78A 2FIQA 3TNOA 1VZWA 3HIJA 4YLWA 1WYIA 3LLFA 4MY8A 4P61A 1E51A 1LCOA 1XCFA 4AB4A 3LHVA 5GVJA 1RVGA 4BWLA 4ADUA 3LRKA 3GKAA 3M6YA 3W7KA 3FA5A 1TTIA 3KX6A 4M6VA 1R30A 1IF2A 3VE9A 3W7IA 4Q32A 4JN6A 1ADOA 3C0JA 3G1HA 3QJAA 2A7RA 1SPQA 3BLFA 4M6PA 1WOAA 1G7UA 3CHVA 3PWAA 1I2QA 5CPLA 1GPWA 3WK1A 3NQAA 2JKAA 4Y9AA 5H91A 4DO5A 4UUIA 1N55A 2EHHA 2R8WA 1VGAA 1UUMA 2AGKA 1H61A 1Z48A 1XI3A 3N14A 3GDLA 4JEQA 3KFTA 3LCGA 5EPDA 4QJ1A 4E2DA 4GUGA 5EYWA 1LRTA 3G1DA 4FNRA 3MBFA 3OVPA 3BW2A 1UBSA 4Z0SA 2ISWA 3USBA 4DPPA 5K4ZA 5LNWA 1IIGA 2DZSA 3FYOA 1DQWA 2B7OA 5I3HA 3K30A 2QCMA 2NXGA 3TFXA 2E5CA 3NL2A 1DBTA 3MYOA 3W70A 3DENA 1AW2A 3PUDA 2C16A 3TV8A 1VCFA 1VQTA 2HS6A 3M47A 1JCXA 3G8RA 4NQ1A 4UNLA 4BI6A 5AYZA 4WXZA 2NZLA 5DBUA 1AK5A 4IOTA 3FOKA 3O05A 2F7FA 1LOLA 3RFAA 1YYAA 5K9XA 3VNDA 2FB3A 3O15A 5LGXA 2WNQA 4GXMA 1KM1A 1TTJA 1UUOA 1KBIA 2O7SA 1TPDA 2YGYA 4E2BA 4IXHA 4RR4A 3THAA 3LV5A 4K7VA 4A2SA 2CLLA 1R2SA 2J24A 5F4SA 4OGZA 3R89A 3TE9A 4AAJA 3A5VA 4EOUA 3UWYA 3NEVA 5I3KA 1T96A 4HNTA 3ELFA 4JX6A 3EWZA 2Y62A 3HMJG 4Z1BA 1TPH1 3D0CA 1IXOA 2PRMA 1XBYA 1OFAA 3LDVA 2G97A 5U4NA 5HNRA 1JCYA 3BVJA 3O6YX 1BWKA 5DCEA 3SW6A 1ML1A 1T0OA 4RXFA 3EXTA 3MMTA 1TPB1 5E0KA 5CSRA 3UPBA 1VCGA 1RPXA 5AHFA 1EP1A 1I2OA 5FF4A 4TMBA 1ZCOA 1SQ7A 3I6RA 3FKKA 2QCDA 2Y6ZA 1A5BA 2YPIA 3TAKA 3P74A 5HMSA 1W8SA 4ZQMA 4HSOA 3M5ZA 3O07A 4RZ4A 4FNQA 4UTTC 2HS8A 4MZ1A 3T7VA 4JS3A 4O57A 4NJHA 4N6EA 4LRTA 1YDNA 3NL6A 5D02A 1W37A 4ZQOA 1H7OA 1G4EA 3TKFA 2DZWA 3BO9A 3O6DA 1C8VA 4Y6GA 2QCLA 4AHPA 4FX7A 1AMKA 1TRDA 2YFNA 4CQ9A 1DL3A 1Y0EA 4NXKA 1HG3A 3U8GA 1HTIA 4PL2A 1JCMP 1ZAIA 1PCWA 1JUBA 4NNAA 4ALDA 4MY9A 3W2LA 1OG0A 2YDAA 3MI2A 5DY3A 2ZCGA 1H1YA 5HULA 3NQFA 2Y7GA 3TXZA 4X22A 3DGRA 1QO2A 1TPFA 4MPQA 1QCWA 1W56A 1EP2A 3QQ0A 1S5VA 3LRLA 2C14A 3TXVA 4E38A 1ICQA 4JTKA 2TPSA 3GDMA 3NR0A 3W2MA 4JX4A 3IIVA 4N9BA 5KZEA 3M43A 2CU0A 2CZDA 1VCVA 1QWGA 3S1VA 2TSYA 3SZ8A 2BLEA 1NVMA 4QISA 3BARA 4C1KA 2ZTJA 4BWLC 2ATSA 4O28A 4EVZA 4JYDA 1B4KA 2QCNA 4D2JA 5HINA 4XQ6A 5AC6A 2VEMA 4MZYA 1ZAJA 2DZPA 2QDGA 3TQKA 3PF3A 1KV5A 3KVJA 4NX5A 3NZ1A 4B5NA 1LYXA 2E09A 2QCGA 4O11A 5D2TA 2E1DA 3KVLA 1KFKA 1MEWA 4O8RA 5HJLA 3W7GA 4MLJA 1FQ0A 2CLFA 2YFOA 3NQ2A 3LI0A 4L4MA 3PBUA 3PG9A 1RR2A 3H53A 1W1ZA 3QSRA 1ZALA 3BGGA 4AWSA 1SW0A 5F2LA 3TA6A 4QITA 2C13A 1SSGA 3I68A 1SO4A 5ABTA 1ZY9A 3W7DA 3RLVA 1DKWA 3UPWA 3NQDA 3LTSA 3W1PA 3RNDA 3KAOA 4TO8A 1FCQA 3HB9A 4O10A 1DV7A 3P8IA 3W7HA 1S5TA 1SO5A 1R2RA 1LLZA 3QEZA 2ZZ6A 3PBVA 1X7FA 2H3DA 1M7OA 1THFD 2ZRWA 3GVGA 2X1SA 3LGEA 4CCCA 4DO4A 3NAVA 3TH6A 3QQ1A 4IJBA 3QRHA 4AHQA 4R33A 5A5WA 2VENA 3Q2DA 5C2XA 2F84A 1FCUA 3NYZA 5T26A 4UFMA 1SO3A 3FS2A 2NX3A 3G24A 1XXXA 3FJLA 2G96A 3OVRA 3GZ3A 3W07A 2IQTA 1OX5A 4KFPA 4Z1AA 4H3DA 4CQ8A 4RK8A 1R46A 1XC4A 1GVRA 3S5OA 3P84A 4K37A 4JTFA 4Y96A 3DKLA 2OMAA 2VELA 2YYTA 3LOTA 4WQ6A 3N34A 4LWWA 4LTSA 1K7EA 1VYSX 1OF8A 5FEXA 1W5OA 1PVNA 1MXSA 3QMRA 3STGA 4Z08A 4TIMA 4I7VA 3UD6A 1TV8A 1TCDA 3QMSA 1GG0A 4LS0A 3VCRA 3C8FA 4JTTA 1B3OA 3P67A 2G5WA 3NPWA 4LUIA 3NM3A 3NPVA 5L9FA 1QDSA 1VR6A 1NAL1 3IGUA 4RZ6A 3GNNA 2VOMA 4O54A 4NZFA 1T99A 5BRBA 3S5NA 2OT0A 1B9BA 3GDRA 5U7SA 1KM3A 1DQXA 3H54A 4BFAA 2NX1A 5CKSA 5KSWA 4HN4A 4LVBA 4G1KA 4Q4KA 1GVFA 5DCBA 3LRMA 2C19A 4NJKA 2H3BA 4QAIA 2E6YA 5FEPA 4H4IA 2UV8G 2Y7DA 2VC6A 4O1CA 5E93A 5F1UA 1SSDA 2X1UA 5D03A 4UIOA 3IRDA 4X3ZA 3KRZA 4ONVA 3F4NA 2TMDA 1L6SA 5AHLA 1GT8A 3W88A 4O52A 4M6QA 3W72A 3IIZA 5FI8A 1ME9A 1IXNA 2Z1BA 4RV8A 2JKPA 2YCEA 4O53A 3W22A 1OFDA 3DI1A 3U2OA 3TQ0A 2C6QA 1YPFA 4NZJA 1AW5A 5KZMA 4MUZA 2NUWA 4YMZA 2BXVA 3CIXA 2GPTA 1QPRA 3O63A 5G1YA 3TSDA 4ZQCA 4JTEA 3W7NA 3W7PA 4PFMA 3TQVA 3NXFA 4NUWA 1DHPA 1ICSA 3W1XA 4ADTA 1LP6A 3IV3A 3CPRA 1VYPX 1PHWA 2FFCA 3QM3A 5D2XA 3OBKA 1SZEA 1TJPA 4UMCA 1XDMA 4PCFA 2NWSA 3G22A 4Z1DA 3W76A 1PV8A 1U5JA 3R8RA 4WZHA 4HT3A 3N73A 2GVGA 1O60A 3CC1A 1TPWA 4LVGA 1LOSA 3I65A 2DORA 5C5YA 1C9DA 3M1ZA 3NNTA 4ICNA 3JRKA 3L66A 3DHDA 3MYPA 3PSVA 3C2OA 5HQEA 4ADSA 4NJJA 1QPOA 4JTIA 3S0CA 2GUUA 2G95A 4DO6A 2Y63A 3QW3A 1TPUA 2X30A 1P0NA 3W87A 4S2BA 2QJIA 1WAUA 1GTEA 2C3ZA 1UB3A 2Z0IA 3L67A 4O4VA 3TU9A 1GJPA 4N2YA 4GNJA 4JD4A 4ZL1A 3LHZA 3GK0A 4CNOA 5HR6A 2A2IA 4MLRA 2ISSA 3Q94A 2A6LA 3B04A 3U6WA 3HO8A 3LCLA 3GB6A 2OZ0A 2ZFAA 4AMAA 4YL2A 1GZGA 4IUOA 2A0NA 1RV8A 1K8ZA 1WA3A 5G5IA 2ZZ4A 3V75A 2QUUA 4S1FA 4XTIA 3W23A 5DBTA 4FIQA 3WK0A 2WSRA 3CB8A 4N4PA 1RQBA 2W6RA 3P82A 2P1FA 4UFJA 1GOXA 1KLYA 1OYAA 4IMEA 4GC4A 3W1TA 4K6AA 3A5FA 1GTHA 1OX6A 3TDFA 1P4CA 4ZMGA 3LHUA 3RU6A 3HPXA 5FESA 3NQ6A 3TMQA 4XZ9A 5FEWA 4OHQA 4JTGA 3EWUA 5AB3A 1DORA 1XL9A 2J27A 3PB0A 3I7SA 3LHYA 3PAJA 4DF0A 2ZZ1A 1SUXA 2GQ9A 3UZJA 2WNNA 3VKJA 3B0UX 1T8XA 2Q3RA 1OK6A 2FLIA 4GJ1A 3C52A 2H90A 4QIUA 4JIQA 3EX6A 2O7QA 3IGSA 1AL7A 4LW7A 1PS9A 3CIWA 1PCKA 3MP5A 3G1YA 2CZEA 5AN7A 1TSIA 1ZENA 3TSBA 2ZA2A 1F7BA 3SGUA 4JTUA 1I2NA 4DF1A 2OCZA 4I9AA 3GLCA 3HGJA 4O13A 8TIMA 1X6UA 3TROA 1F05A 2WKJA 1L6WA 1K7XA 1HUVA 4CCDA 3L5LA 4PH6A 1OX4A 2VEKA 1GEQA 2CZ5A 4LV9A 2CLKA 1OHLA 5H2ZA 1JUKA 3C2RA 1SZNA 4AF0A 1FDZA 2VFGA 1YDOA 4MKNA 3PR2A 4OU1A 3QC3A 2Y89A 1WDWA 2QJGA 4HNVA 1LBFA 4LNYA 3W2JA 1JRCA 1O95A 1YXDA 4MYAA 2E5BA 5DELA 4A22A 3C2FA 4FNUA 5D2VA 3MUXA 1VPXA 2VEIA 1W5MA 4UTWC 1IXQA 2ABBA 3M9YA 4LU0A 1KM2A 1J2WA 3P60A 1J5TA 3SFKA 3DFTA 1TJRA 5D2WA 5AFDA 3CQ0A 3NQ8A 1EWDA 4NU7A 4IWWA 4TX9A 5D05A 1ONRA 4ZQNA 3NQEA 2CW6A 2I9EA 2QAPA 3PUOA 1Q6OA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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