3LTSA

Crystal structure of the mutant v182a,i199a of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from methanobacterium thermoautotrophicum complexed with inhibitor bmp
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
214
structure length
214
Chain Sequence
VMDVMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGAGAQGGDPGETLRFADAAIVGRSIYLADNPAAAAAGIIES
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Conformational changes in orotidine 5'-monophosphate decarboxylase: "remote" residues that stabilize the active conformation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
molecule tags Lyase
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
total genus 81
structure length 214
sequence length 214
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2010-02-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3ltsA00
3W1RA 1VQTA 2VELA 2V9DA 1H63A 4UFIA 5J5DA 2GVJA 3A21A 4IMEA 4ZQRA 1VRDA 3O05A 3MUXA 4XUGA 1F2JA 3RNDA 2YZRA 3CWOX 1SSGA 5EA9A 3EB2A 1FDZA 1W3IA 1OG0A 1W5QA 3W1UA 1A50A 4PFMA 3SR7A 3QJAA 1TTIA 3MMTA 3KVJA 4WY0B 3R89A 3MP3A 2NWRA 4LV9A 1FWSA 2JKEA 1NF0A 4ADUA 2NXIA 1N7KA 1TJRA 2CLIA 2X1RA 1H5YA 2X16A 2WKJA 2BLEA 1KA9F 3HIJA 3G0UA 5AYXA 4S2BA 1A5BA 4K8EA 3PM6A 5LNSA 1Z41A 4UR8A 3CM4A 3PG8A 3IIOA 3M5XA 2FPTA 3TR2A 3AO0A 3I7SA 4JD4A 5AOUA 4RR4A 2E6YA 4O28A 3I7RA 4JTSA 1TPVA 2ZZ1A 2B7QA 1IIGA 4RK8A 3UYCA 1PE1A 2A2IA 4M6VA 3IV3A 4JIPA 4JTTA 5D04C 1NAL1 2Y61A 1TRDA 4O4WA 1WXJA 4MYXA 4O8RA 1L6WA 4M6PA 1DHPA 5LHFA 1NF7A 3OEXA 1ZJIA 4FNSA 1KFBA 5KMYA 3PBVA 1WYIA 2H3BA 4OGZA 2J24A 4EIVA 3GAYA 1AK5A 3LI0A 5L6UA 1EWDA 4M6QA 5FF3A 1FCVA 4NXSA 4KFPA 2PE4A 3A5VA 1XBZA 2W6RA 3TSDA 1I2NA 1ZALA 3LBMA 1XUUA 1SFJA 3FYOA 1WAUA 1M5WA 1S5TA 1KBIA 2CZFA 3LB0A 4RX0A 4R33A 3LHYA 4ONVA 4H3DA 4FXRA 1Q6LA 3NQ2A 4C1KA 3TX9A 3C2RA 1BKSA 1D3HA 4K39A 2NXHA 1SFLA 1KFKA 4UTJA 1SSDA 3UWWA 2FB3A 4HT3A 4FB7A 1WX0A 3AJXA 2VENA 2E77A 4TO8A 2QJHA 1D9EA 1TB3A 2QJIA 1OVDA 4GUIA 3CU2A 1H51A 2DP3A 1TJPA 3WJZA 1BEUA 1SO6A 4U28A 3CWNA 1YXCA 5CZ0A 2QAFA 3KVKA 3PBUA 4GWEA 1MSSA 4LS0A 1R2TA 4O17A 5IM51 3B05A 1WOBA 1OFAA 2Y6ZA 2PURA 3S5ZA 1OYAA 5AHLA 1LBMA 1WBJA 4L4LA 3FJ6A 3PVFA 3W74A 2NX9A 4X2RA 3W7KA 3GNDA 3BG3A 3C3NA 1VS1A 3ABOA 5DXXA 4KWWA 3SW6A 3LX9A 2QUVA 3G0XA 5HR6A 4A2SA 4R34A 4ZL1A 3CIXA 3W3OA 3W7IA 3L5MA 4DBDA 1F7BA 5AN7A 1R30A 4QITA 5DY3A 4JY9A 4JTHA 1SPQA 4C1LA 3P74A 2A7PA 4M5PA 3G1XA 3QEZA 3TCEA 2YFOA 1WA3A 1GOXA 3IEBA 2B7NA 3A23A 1VCFA 1VCVA 4UFLA 3NPUA 4BI7A 3LRLA 1MO0A 4X3ZA 3LCIA 4TMBA 1GYLA 2R8WA 5DLCA 3S1UA 2I9EA 5LZLA 2YGYA 1W31A 4MYAA 3WJXA 1SW3A 3EWYA 3GK0A 1W8SA 4PCFA 2BXVA 2OT1A 3M0ZA 3U2OA 4A2RA 1XDLA 4OBTA 4JX5A 4PC8A 5FF7A 3W2JA 5HMSA 4I7VA 1V7YA 3VCRA 3G1FA 2CW6A 3DFPA 2H90A 3W83A 2E5BA 4IPIA 4YL2A 4A22A 1EUAA 3R12A 4Z1AA 1EX5A 3LTYA 1AL8A 4UFKA 3ZFHA 2X2GA 3PF3A 4ZQNA 3RK8A 2GQAA 3C2OA 4AH7A 1F74A 1YTKA 2Y7EA 1NFBA 2KZHA 2QDGA 1FCQA 3LCGA 4ML9A 3CEPA 3GDRA 2Z2UA 2WO5A 2ISSA 1F76A 3DGRA 1JQVA 1K02A 3T4CA 1JUEA 2PRHA 5K9XA 3I68A 4FO4A 1P0NA 3MBDA 1TV5A 4LVAA 4NZJA 1K8YA 4TMCA 1XCFA 1XL9A 4IX2A 3W84A 3NDOA 4DXVA 3RLVA 1P4CA 1KM4A 1YPFA 3UY8A 4CNOA 5LGXA 2ATMA 2CU0A 1J2WA 2WNNA 1KV8A 1FWWA 1Z42A 3LDVA 4LU0A 1UUMA 3DH7A 1G69A 2W0UA 4UTHA 3LV5A 4DQWA 2V5BA 3B8DA 1OX4B 4QJ1A 3LI1A 1L6SA 4PL2A 4MKNA 1KBJA 2ZRUA 3LHVA 3HBLA 3HJZA 4LT9A 4JTGA 4WX2A 1NVMA 2TPSA 4Y96A 3U6WA 3NZRA 2NLIA 3OA3A 2FDSA 4Y8FA 1EWEA 2O7SA 1QFEA 3FKKA 5DXYA 3TC7A 5SWUA 5FF2A 4N6EA 3QQ1A 1IXNA 2QCDA 1ADOA 1FCBA 5I3KA 1GPWA 1S5WA 4UFJA 5AHFA 3C2EA 4JTFA 2QKFA 5KZEA 1LOLA 2XN1A 3OVRA 2GVGA 3QZEA 3P82A 3TIMA 2CZDA 2ZDRA 4O1AA 3DFSA 5G2WA 4O1DA 5BW6A 1IXOA 2Z0IA 1B3OA 1K7EA 3HPSA 1TMHA 3RFAA 4IQLA 3I65A 4NT0A 4LW7A 1LDCA 4FXSA 1VHNA 3M16A 4IXXA 1CX9A 1TSIA 3A22A 4AB4A 1A5SA 1PL9A 3TE9A 4H6KA 4AWSA 1LRNA 2A85A 5G2IA 1QO5A 3BV4A 3MO7A 3LCXA 1H7WA 3Q2DA 3W85A 2G95A 4Z1CA 2E09A 3KVMA 1DKWA 3O8AA 1TPUA 3EX6A 3N2MA 1FDJA 1W1ZA 2Y7DA 3G0SA 3EKLA 4O11A 3T44A 4AAJA 2ZRYA 3L2IA 3P67A 4IGHA 4BF9A 3RLUA 4NUWA 1H61A 4UTWA 1J4EA 4WY0A 3T40A 2Q3RA 3BW2A 4HNUA 5I3JA 3RU6A 2ABAA 3OIXA 4BWLA 3UD6A 1Q3NA 3QRHA 5CZJA 2ATSA 4MZYA 5C55A 1KM3A 2V2DA 4WOZA 5CZTA 4HNTA 3OG3A 2P1FA 3NEVA 3CC1A 2ZTJA 2V2CA 3KRUA 3NL2A 3TQ0A 3NQMA 2WNZA 1CW2A 4FF7A 1HG3A 2FJKA 4OV4A 1TPH1 3H55A 3QPYA 1YXYA 3HGJA 4PODA 2C6QA 2F84A 4B5NA 3PWAA 4FNQA 4W9TA 3NQ8A 5AHEA 4NU7A 4S1FA 5F2GA 4IWWA 5HWJA 3HO8A 1TPDA 2EKCA 1FWNA 2B4GA 3CEUA 1XKYA 3INPA 1FQ0A 3MI3A 1NSJA 2OMAA 5CGQA 2X1TA 1EA0A 1KFEA 3BLFA 2CLMA 1KM5A 4UFHA 4IMCA 4FEZA 3TMQA 1AW1A 5D03A 1JVNA 1F6PA 4MIMA 4Y90A 3W76A 2C14A 3EXSA 2QCHA 4I7WA 4Q4KA 3GXNA 3W7MA 3WJSA 1GJPA 4LVBA 4FNPA 2AGKA 4DPQA 4GUGA 4IMGA 2YW4A 3QF0A 5H2ZA 1Q6OA 3P5ZA 4ZQOA 3NQAA 3PUDA 4UTMA 4UMCA 3LXBA 5HQEA 4JR5A 2ZQ0A 2CLKA 1IF2A 3DI1A 4KWVA 5U7SA 3W1TA 8TIMA 1PHQA 4EF8A 1ZAJA 4YMZA 3HG4A 2VFDA 1SR9A 1O95A 1G67A 1HTIA 3NPVA 3B04A 4ZVJA 2DORA 5T26A 1R2SA 3BW3A 5ABTA 4ZZ9A 5HUPA 1KM0A 1H50A 1I2PA 3M6YA 1GTHA 2Z6IA 2Q8LA 1ICQA 2A0NA 1OFRA 1HUVA 1P1XA 2ZZ2A 3P81A 3ZR4A 5E93A 3G1HA 3UY7A 4BK9A 1TRIA 3W7RA 4Q32A 2C15A 3W87A 1ME7A 4E0CA 4AF0A 3W71A 4R7JA 3MHUA 4XTIA 5DBUA 5CG7A 4RXGA 3G1VA 1YTDA 1IXPA 4WQ6A 4DEFA 2Y85A 2GQ9A 5C5YA 4UR7A 4JX6A 3OHIA 4IX0A 3SZ8A 5AC7A 1LZOA 1MEWA 1SO4A 1JCJA 3W73A 5I3HA 2FB2A 1ZHAA 4UC5A 3OVQA 3VKJA 3TH6A 3HGRA 1EB3A 5DCEA 3EX1A 1DV7A 4Y9AA 3O16A 3GAKA 3UZ5A 5F2LA 1BTMA 5K7JA 3NL3A 4GNJA 1ZCOA 3W7CA 4LY8A 4UTTC 4ALDA 4ZMGA 4XZ9A 1I45A 4GC4A 2EGZA 3GR8A 4LVGA 4UUIA 5BRBA 2ZZ7A 4N9BA 5EL1A 4E2BA 1YDVA 2J9YA 5TBOA 4GRSA 4JGDA 1OF6A 1O5XA 3UPBA 3W2MA 3E9AA 2QCNA 4CQAA 2FFCA 3HG2A 4M7TA 4FHAA 2WOQA 1VZWA 3TUUA 3MYOA 2VKZG 2VEIA 2Y63A 1ZAHA 3W75A 3SIZA 1YADA 3E02A 3QSTA 5AHMA 1VYSX 5F4WA 5AHIA 1JJKA 4NVTA 3TK7A 4JNMA 5LKYA 3C8FA 2WPBA 3WFAA 2VEKA 3F4NA 2YYTA 4JEQA 1HFBA 4CNPA 3JR2A 3DFOA 2ZRXA 4LC6A 3GXTA 1H60A 1VCGA 3QPZA 1K8XA 2V5LA 4P61A 2FTPA 1ZFJA 1SO5A 3C4UA 3PC0A 1IGSA 1JR1A 3W7LA 4AVFA 4O19A 2YR1A 2AAMA 5LNUA 2GUUA 1OFPA 1UCWA 2VEMA 2E6FA 3TROA 1X6UA 4K37A 1OFDA 3DBPA 5K3VA 3UWZA 3A24A 4GXMA 2RH9A 1FX6A 3DI0A 4DELA 3F03K 2QDHA 3R2GA 5F4XA 1FDYA 3L5AA 4DBEA 3S1VA 1WBHA 2G5WA 4E38A 3IGUA 2X1SA 1OX4A 4CQ9A 1DL3A 3L21A 2WQPA 1A53A 1OF8A 1U83A 3QW3A 1VGAA 4DO6A 1W5NA 4NJGA 1Y0EA 3SY5A 1R46A 4MY8A 2A7RA 1THFD 3W1PA 3WK2A 3GKAA 5EY5A 4IMDA 1M6JA 4JTLA 3DENA 1JCNA 3RF9A 3PBWA 3FFSA 5DY2A 4UCGA 5D2XA 5CPMA 5D05A 1K7XA 2YW3A 2RDWA 5AB3A 1O94A 3T7VA 4RV8A 1QPNA 2EAWA 3N9SA 2I1OA 5IBXA 4MFDA 4PEKA 1LTDA 3LCFA 2V8ZA 4OWGA 1QWGA 1UB3A 1S3HA 1TREA 5D30A 3L65A 3UWQA 2ZZ3A 3W6YA 1JQXA 2BZNA 4TU1A 1OFBA 3HGSA 2YXGA 3D0CA 4HSNA 3GB6A 4JTUA 5G1YA 4WOQA 4O13A 4N9DA 2J27A 1QNVA 4EVZA 1LLWA 5KZMA 3P8JA 3SJ3A 3IIVA 1ICPA 3LHUA 5EKYA 3QQ0A 1GEQA 3N9RA 3WJYA 1JUBA 4JDBA 3LLDA 5KINA 4IOTA 4P2VA 1AMKA 4JICA 3TQVA 3MP4A 2E68A 2GQ8A 2TMDA 1YPIA 1TTQA 1OFEA 4DF0A 4EF9A 1HL2A 1OX5A 1WV2A 1DOSA 1LCOA 2V81A 4EWND 4QSHA 1PS9A 1ZY9A 3HMJG 4MY9A 3B0UX 1Z44A 4LV4A 3PAJA 4PA8A 2V0TA 5D2VA 1W3TA 2A6NA 4OU1A 4XKYB 3HGOA 2CLLA 1P0KA 2J88A 4IMFA 4OT7A 3IGSA 3BPWA 4UFMA 3W7QA 3BO9A 2VFHA 2NUWA 3W7OA 3M47A 3UWVA 2TSYA 3EKZA 3TU9A 2OJPA 1OABA 1W37A 2GOUA 1H7NA 3K30A 3W2NA 4CCDA 2ZA2A 1VLWA 1I2OA 1F5ZA 4UMAA 4UTKA 2H6RA 3TMLA 1SZFA 3UQNA 3DHDA 3NGJA 5HJLA 4O14A 4LUIA 1RV8A 4BR1A 4LUJA 1SW0A 1Z48A 4RZ4A 4RKAA 5F2IA 3TSMA 5G1TA 1G7UA 3V75A 4LC8A 1O60A 1XI3A 4QNEA 3P5YA 3Q37A 2JKPA 3FOKA 1DJQA 4UTLA 5EBUA 3H54A 5E1QA 1U5JA 2LLEA 3WJWA 5K2ZA 4MZ8A 1GZGA 3N19B 1YXDA 1TPC1 1HO1A 2DU2A 3G1DA 4FX7A 5A8GA 5CPNA 2RKXA 4Z0SA 3OBKA 2DZXA 4NJHA 1SZEA 3L5LA 4ZQCA 3M43A 4K36A 1TCDA 2CLFA 4G1KA 1PHWA 1TIMA 3ZS4A 1RPXA 1KFLA 2HS6A 4FNRA 1QOQA 1TQJA 3DKJA 4NXKA 3W2LA 3NQEA 1YTEA 3PB0A 4IXHA 3PBYA 2BWGA 2VFGA 5AYZA 1H7OA 1B9BA 5G4WA 1DJNA 1C29A 1XFBA 2P0OA 4LS2A 4FX8A 2C16A 3G8RA 5CPLA 5DCBA 2QCLA 4XWUA 4NNBA 4JN6A 1DORA 3R13A 2YYUA 2OCZA 3EWZA 2FQIA 1ONRA 3TFCA 1LYXA 3C6CA 3KFTA 4N6FA 4OQVA 3VI2A 4K6AA 3USBA 3PY2A 3L66A 4MLJA 1R47A 2ZRWA 2B7OA 3WK1A 1PCWA 3MJYA 4ORMA 3ZWTA 1W54A 2DZTA 3NM3A 3BLEA 1TTPA 3SECA 4ADTA 1JCLA 3PR2A 4N02A 3MHGA 1DQXA 1X1ZA 3LM7A 2PRMA 4X9SA 1XUZA 2E5DA 5LNVA 2CLHA 3EEGA 4JTIA 1EUNA 1ME8A 3CQ0A 4NZFA 5G5IA 2NZLA 3IRDA 1YDOA 3NR0A 1F6KA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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