3LTYA

Crystal structure of the mutant v182a,i218a of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from methanobacterium thermoautotrophicum complexed with inhibitor bmp
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
214
structure length
214
Chain Sequence
DVMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGAGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGAIESIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Lyase
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
publication title Conformational changes in orotidine 5'-monophosphate decarboxylase: "remote" residues that stabilize the active conformation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
total genus 82
structure length 214
sequence length 214
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2010-02-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3ltyA00
1GVSA 4OE7A 4S1FA 3S9YA 1HUVA 4LV4A 2I9EA 1OK4A 2ISWA 4UMBA 3TMQA 3LBMA 5G4WA 5G1TA 3W2KA 3HG3A 5L9FA 2Q3RA 2E1DA 4PTNA 4UTTA 1X1OA 3W1PA 2A6LA 3QMSA 3L21A 1HTIA 4IQLA 5AC7A 1LROA 3IIOA 3GVGA 3F4NA 3FFSA 4WXZA 3W9ZA 2D73A 5LNWA 3LCIA 4E38A 2OT0A 4JTGA 3BLEA 4UCGA 1DJQA 1TRIA 3NVTA 3IVTA 3FIGA 2NV2A 5D05A 3MI3A 4LC8A 4O1CA 1FCVA 3LCLA 4OWGA 5BRBA 5EY5A 2YPIA 4BI6A 3UY8A 1W5PA 3EX1A 2ZBTA 1B4EA 4ZQPA 3N14A 3UWYA 3LHTA 3DI1A 3UWZA 1EIXA 4O53A 1LBFA 1I8JA 3FA5A 2EAWA 2E5BA 1I2NA 4P61A 1Q6QA 3W2UA 2Z0IA 3R8RA 3SJ3A 3V75A 5I3GA 2V2HA 3NQFA 4MY1A 5F2LA 1OFQA 5I3FA 1P1XA 1KM0A 1VZWA 1OFRA 4MFEA 4MKNA 5E93A 5D04C 5CG7A 2JKPA 2RFGA 2FPTA 2Y88A 1B3OA 1NSJA 2FQIA 3G1DA 1N7KA 4NZJA 3LHUA 5I3KA 4A22A 2A7RA 4RZ5A 1IXOA 3OA3A 5AOUA 4UXDA 4O15A 4IX2A 2Y61A 4MYXA 2OCZA 3UQNA 1X8FA 4RZ4A 3PBUA 3B04A 4A2SA 3NZRA 3DFOA 1RV8A 2Y70A 3KRZA 4NNBA 4H4IA 2GQAA 1M7PA 1RQEA 4MJZA 2VEMA 1UBSA 5HINA 2B7NA 3PWAA 3SW6A 3P60A 4FX7A 2WOQA 2RKXA 1BWKA 1TPC1 2Y62A 5BNKA 1VLWA 1FQ0A 5AB3A 2ZRXA 5EPDA 1KBIA 4FX6M 4AHPA 3TH6A 1SQ7A 5EL1A 2QCEA 1H60A 1W1ZA 2W6RA 2VKZG 3GAKA 3L0KA 3M44A 4NU7A 4WZHA 4UTUA 4UFHA 1NEYA 2QR6A 5J5DA 3TA6A 4Y6GA 3JRKA 4FEZA 2WNZA 5FF3A 2W0UA 4O11A 1ME8A 1YTDA 3W1AA 3BLFA 5HQEA 4FIRA 2GVLA 2JKEA 1EB3A 3T40A 5KMYA 3K30A 4ORMA 1FCBA 4CNPA 2Q8ZA 4AWSA 4NJGA 1WBHA 3EXSA 3U2OA 4YMZA 1RVGA 3QMTA 4HHPA 1H7WA 1Q6LA 1SSDA 3NQCA 2ZRUA 3W07A 3NEVA 1AW2A 3A22A 3CTLA 3MBFA 2VFDA 4ZMGA 1QPOA 2J88A 1VR6A 3DFSA 2PRHA 3M5ZA 3PY2A 3LM7A 3LHVA 3TAOA 4X3ZA 4QQ3A 2XN2A 3DKLA 2IQTA 1QCWA 4IMGA 4JTEA 1WX0A 1G7VA 4PCFA 4JXCA 3LTYA 5LNRA 3GDMA 1VPXA 1ZAHA 4NQ1A 2QJIA 1K8YA 2Q3OA 2PE4A 3CLMA 2JBMA 3G1FA 3NQ8A 3W7JA 2FPYA 1QR7A 2Y7EA 5DN1A 1VLIA 3BGJA 1TPWA 3AJXA 4DBDA 3GYEA 2Z6IA 1J2WA 4ADTA 4JX5A 3N9RA 3UZJA 3INPA 4GUHA 1FXPA 3G1HA 3TAKA 4FHAA 1QPQA 2NWRA 4DELA 5MHBA 3TQKA 1WDWA 4MZYA 4AWUA 1SW0A 4O4WA 1XXXA 3GR8A 1AL7A 3P82A 4EF9A 4N9EA 4DPPA 1YDOA 5AYXA 4GXMA 3NA8A 4M6PA 5LNSA 3IGXA 1K03A 1A5AA 4JGDA 1EX5A 1ME9A 3EB2A 3TJLA 3QSRA 5E1QA 4X22A 5HULA 1FWSA 1GOXA 5CZTA 1ICSA 2JGYA 3PM6A 3C2VA 1H7PA 4A21A 1XBVA 4RZ6A 4O28A 2CZ5A 4MFDA 1O94A 3PVFA 2DU2A 1ICQA 5FF2A 2E6AA 2P10A 4LVFA 3TQ0A 1PVNA 3LRKA 5LGXA 4OV9A 1GVRA 1QPRA 3TDFA 4O17A 3E02A 4RX0A 4AHQA 3CB8A 1KM1A 1AMKA 4WY0F 3S1VA 3W7HA 4HN4A 1R47A 1VS1A 2C13A 4UNKA 1AL8A 3P5ZA 4WY0B 5AHEA 1ZJIA 5CZJA 3W1MA 3A9IA 4QAIA 4PFMA 2O7QA 3RMJA 1GEQA 2A7NA 3N9SA 3W1QA 3TMLA 4NX0A 1GYLA 4WOQA 3RF9A 2ISSA 5IBXC 4JTKA 3YPIA 2X1TA 3UY7A 5LZLA 5C54A 1VHCA 1FCUA 1TSIA 5D33A 3ZWTA 4FNPA 1BEUA 4YL2A 1LOLA 2TSYA 5K4XA 5DCBA 1P4CA 3GX9A 1TV7A 4D2JA 2C0AA 1SO6A 1W31A 3P74A 3W87A 3EWXA 3GKAA 3MJYA 3GNNA 1U5JA 1KM3A 2YW4A 1D9EA 3EWWA 1S5WA 3B8DA 3W83A 5AN7A 1JJKA 1UUMA 3KRUA 2J9ZA 1R2SA 1L9WA 3BW3A 4XZ9A 4JYEA 3PC0A 2PURA 3DFTA 3I7SA 4O52A 1K7FA 4IMDA 1UCWA 3FKRA 5G4EA 5TIMA 4LVAA 2Z6JA 3BARA 5F1UA 2P0OA 1H7NA 4MLJA 3A5FA 1YXCA 2X1RA 3G3DA 3M41A 3W72A 1XUZA 3IGUA 2F84A 1CI1A 1OJXA 5I3HA 5KTLA 3QZEA 2Y7DA 2ZRYA 3TXVA 1W3NA 3VE7A 1IGSA 1Q6RA 5C55A 3QM3A 3NQ6A 5FEPA 3Q94A 1GZGA 4UTWA 4UIOA 2R94A 1F05A 3LERA 3THAA 3W7GA 1KFLA 3LTPA 4EF8A 3LCXA 2NXIA 3W1LA 5FEWA 4JTHA 5AHNA 4K8EA 4DPQA 2F7FA 3UWWA 3FS2A 1XDMA 3O1NA 3CHVA 2CZDA 2YDAA 1W3TA 2BXVA 3T4CA 3W7RA 1P0KA 4RLIA 1D3HA 4MOZA 4AHOA 5FEZA 3DH7A 3UWVA 3EWYA 4JTLA 3QRHA 3HG4A 4O18A 2ZZ2A 3QYQA 3W1UA 3C2OA 1JCJA 1TPEA 2QCLA 5D2YA 3S6DA 3VE9A 1UJPA 2O7SA 3WJXA 3QPYA 1EWDA 1TPFA 1QOPA 3IEBA 1PV8A 4AXKA 1GWJA 3SY5A 3CQ0A 5LNVA 3IVSA 1N55A 1Z42A 3ZS4A 3ELFA 4J9JA 4NJKA 2C19A 2NUYA 3SSJA 2FTPA 4N6EA 1YLVA 1ZENA 2QUTA 3HPXA 4AF0A 4MYAA 3S5YA 1KM5A 4E2DA 2C18A 4ML9A 3EEGA 2FLIA 1F6KA 1R30A 4UR7A 2HTMA 2ZYFA 1K8ZA 3QH2A 5HWJA 2ZCGA 5C5YA 2YFOA 4QNEA 4I7UA 2E6FA 3W1NA 3W2JA 3TX9A 4PA8A 3W73A 3IIVA 1HO1A 3W3OA 2QDHA 1QFEA 3FYOA 3A24A 4UTHA 4CLMA 1PS9A 4AAJA 3NPUA 4ZVJA 5D2XA 4LVBA 2TMDA 3NOEA 5FF0A 2FJKA 2QCHA 3BPWA 1MXSA 3C61A 2AQWA 3LXBA 1U83A 3S5OA 5LGZA 3P80A 4K8HA 2WO5A 2ZZ1A 4KFNA 4MUZA 2QAPA 1JCYA 4U28A 4DEFA 2Y63A 1DQWA 4QITA 5LNUA 3RK8A 2GPTA 1M5WA 4N4PA 5DCEA 2YR1A 4GBUA 3FEMA 4FXSA 3STCA 3A23A 1CW2A 3S5ZA 3O05A 2V82A 2ZQ0A 5DBUA 3ABQA 1CX9A 4O0ZA 4EIVA 3DBPA 2A0NA 2C1HA 3PAJA 2VXNA 1TTPA 3HBLA 1JCXA 1SZEA 1F76A 5CSRA 1LLZA 3EKLA 3NZ1A 3P84A 3SECA 2NX9A 2WNNA 4DO6A 4L4LA 5TQLA 1LP6A 2ZZ5A 3FLUA 5G2HA 1ZAIA 1G4TA 4O14A 1C29A 1TJPA 2AAMA 5SWUA 1MEHA 1DJNA 5IBXA 2EPHA 3HGSA 1VCFA 5AC8A 4XUGA 3MHUA 1F73A 1TTJA 1TYGA 1J4EA 2EHHA 3S1WA 1OFOA 3P62A 2P1FA 2TPSA 1KLYA 1IIGA 1AG1O 5FI8A 5G2IA 4WD0A 1B57A 4H3DA 4WUIA 5K7JA 3HO8A 3B05A 3W7OA 1H7XA 1KA9F 1YYAA 4O54A 4OV4A 2B4GA 3LCFA 1QO2A 3PB0A 4BK9A 4AMAA 5K2ZA 3GDKA 1AK5A 3B0PA 1KTBA 5HJLA 1OX4A 1SU5A 3SZ8A 3DXIA 2C6QA 4LWWA 3DI0A 1LBLA 1YTEA 4QJ1A 2Y89A 4NJIA 4QNWA 4K7YA 1JUEA 4M7SA 4C1LA 3KVJA 5D2VA 1B4KA 5U7SA 3OVRA 3NXFA 1O5XA 3B4UA 2V81A 4CQ8A 3W86A 5D37A 4GNJA 1IXNA 5CPOA 4NX5A 3IIXA 4LRSA 4M6VA 4JEQA 2RH9A 4CNNA 4N9CA 2QAFA 1G4PA 5CZ0A 5AHIA 4IMCA 1PCWA 4I9AA 3G0SA 1SW3A 2CLKA 1XFBA 3LRMA 3HGRA 2JKAA 2OZ0A 2Z2UA 3L68A 2CWNA 4RV8A 2JK2A 3W1XA 3STFA 3LB0A 1O4UA 3HMJG 1TPH1 1TO3A 1SPQA 4XWUA 4Q33A 3C2EA 5CZSA 4O13A 4GC4A 1H1YA 4JDYA 4W9TA 3L5AA 1GTEA 2Y85A 3GXTA 3H54A 3LTSA 3BG3A 4OHQA 3UWUA 1JQXA 4DBEA 4YWIA 2B7OA 3TV8A 3LCHA 3CU2A 3QJAA 1S3HA 1T99A 2A5HA 3LDVA 3NPXA 3S1UA 4JX6A 4MPQA 5HUOA 1YADA 2CLOA 4OQVA 3O07A 4UFLA 1SO5A 4EWND 4LVGA 5HMSA 3W2NA 1OVDA 3DFNA 1XBXA 1SFJA 3C4UA 3C2RA 4JR5A 3PBWA 3W76A 2X16A 1J5TA 2E6YA 2DZWA 2YW3A 3CEPA 4YCPA 3C3NA 3JS3A 1T96A 4G1KA 3HJZA 3MHGA 1TREA 1VQTA 3N2MA 4NNCA 3PUEA 3LI0A 3IV3A 2V0TA 1D3GA 2BWGA 4FNRA 2WSRA 3RLUA 1QDSA 2VEPA 2J6XA 3R89A 3TFXA 4IGHA 3U6WA 5DELA 4IJBA 3NAVA 1KTCA 1UUOA 3F1QA 4RJEA 2AGKA 5LHFA 4I7VA 1UB3A 2ABAA 3TSDA 3BG5A 4UTMA 1K3UA 5FESA 2NV1A 3EXTA 3OHIA 3HOJA 4CCEA 4ZZ9A 3E96A 3W7EA 1XUUA 3GIYA 3NQ7A 4N9DA 3HIJA 4ADSA 4UTWC 4IOTA 1XI3A 2BX7A 1KV5A 6TIMA 3O6YX 3E49A 4UMCA 1KFEA 3LCWA 4AB4A 4RXGA 5G5IA 1W56A 5G1YA 3PSWA 2A7PA 1G6CA 3NNTA 3O15A 1ZY9A 3C6CA 3PUDA 5K4ZA 4RXFA 3C2FA 1GYNA 4CCCA 5HWMA 1SSGA 3MYPA 4DF0A 1Z48A 4RK8A 4JTFA 4LTSA 2VFHA 1WV2A 4HIBA 1VGAA 3O63A 4R7JA 3GKFA 1DL3A 3M5XA 1C9DA 5CGQA 3W7IA 1TV8A 1LCOA 1WYIA 2RDWA 4HT3A 4CQAA 1JUKA 1JULA 5CKSA 4Z1DA 1YTKA 1OX5A 5DCDA 2QCCA 1YDNA 2ZZ6A 3S1XA 5DLCA 3NQ2A 3A21A 2OJPA 3QFEA 3G8EA 2H8XA 5KZDA 3QMRA 3RU6A 2V30A 2A6NA 1LBMA 4UMAA 2NUWA 4AF0B 4S2CA 1TPB1 4IPJA 5AHLA 4M5PA 4O4VA 2DZPA 1A53A 3NO5A 2RDTA 1JRCA 1GG0A 3G0UA 4LW7A 4M7TA 3W70A 1E51A 1MSSA 3HGOA 4K37A 1HFBA 2ZFAA 2V5BA 1EA0A 3IIPA 5T26A 3TJXA 5U4NA 1LDCA 1FBAA 3TC6A 2CLIA 2DORA 2QJHA 3UYCA 3ATYA 2VFIA 2B7PA 3PULA 1VH7A 3O6CA 4O10A 4POCA 3SR7A 3G8RA 1SZFA 4N9BA 1ZALA 3HG5A 1IIHA 4AWTA 1FX6A 4K6AA 3LX9A 3S0CA 4TMCA 1LORA 4UUIA 1DQXA 1W5QA 4DF2A 4UNLA 2FDSA 3TW6A 3IGSA 2BSLA 3M5YA 4NJHA 4X2RA 1SO4A 4R33A 1L6SA 4Y9AA 3NL6A 3E9AA 1XBZA 4QM1A 4TMBA 4BF9A 1OHLA 1ZFJA 1TPDA 4XTIA 4IMEA 4YLWA 4M6QA 2A85A 3WK1A 4NNAA 6ALDA 1KTNA 3F03K 4AVFA 2LLEA 3GDTA 2V5LA 3MP5A 1I45A 2WSQA 1PE1A 2ZZ7A 1X6UA 2CLHA 1LOQA 2WJZA 1EPXA 3W75A 5HUPA 3PUOA 4EVZA 4N02A 4K38A 2CU0A 2J27A 3M7WA 3G22A 3TNOA 1R2RA 4JS3A 3FYPA 1RQHA 3BG9A 1KV8A 1QPNA 5AC6A 1H61A 1OYAA 3LRLA 3RFAA 3OIXA 1FDZA 1KBJA 4UFIA 3DGRA 2EGZA 3PS7A 3ATZA 3I68A 3M5VA 2DZSA 4Z0SA 4BR1A 4GUJA 2CLEA 4MY9A 1SZNA 1ONRA 1SUXA 3CT7A 3L66A 4O8RA 1QMLA 3F4WA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1PKN A;  4J2P A;  1HUV A;  1H2J A;  3ZLH A;  2Z7K A;  2VEF A;  3M64 A;  2J7F A;  3LBM A;  1BVW A;  4Y9N A;  2DQW A;  3EOE A;  5I6S A;  1HL9 A;  5L9F A;  1EX1 A;  2Q3R A;  1RJR A;  3KL3 A;  4PB4 A;  4UTT A;  2XFR A;  1CXF A;  1HKW A;  2G3I A;  4B91 A;  3ONB A;  2V5D A;  1J0Z A;  4AZB A;  3WEM A;  4WXZ A;  5LNW A;  2VGF A;  1CGT A;  1MQQ A;  2G3M A;  3ERP A;  4E38 A;  3D3F A;  1R3Q A;  1HJU A;  4UCG A;  5CBJ A;  4W84 A;  4JNZ A;  3BXW A;  3IVT A;  4C90 A;  3ARX A;  3VZZ A;  4OWG A;  1UG6 A;  1W5P A;  3ZVH A;  3N14 A;  3QZA A;  1H4P A;  3UWZ A;  1EIX A;  3BL3 A;  2OO0 A;  3AML A;  3QVQ A;  3FA5 A;  2EAW A;  2E5B A;  4P61 A;  1Q6Q A;  2F6X A;  5C71 A;  3H2M A;  2Z0I A;  4LNC A;  3TLL A;  3WN6 A;  4MY1 A;  5H1W A;  1AH3 A;  1WP6 A;  5A6B D;  1IT0 A;  3K1D A;  1KQY A;  3BAJ A;  1BQC A;  4Y9P A;  2JKP A;  5CG7 A;  4FMV A;  2EKG A;  3R6I A;  3R7M A;  1XIN A;  2YL5 A;  3TJI A;  3SCP A;  4NZJ A;  2PA6 A;  3LHU A;  2PLJ A;  1KXV A;  1QHO A;  3SCV A;  4RZ5 A;  4UXD A;  1JD7 A;  4MYX A;  4BHY A;  3WY1 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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