3M7WA

Crystal structure of type i 3-dehydroquinate dehydratase (arod) from salmonella typhimurium lt2 in covalent complex with dehydroquinate
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
KTVTVRDLVVGEGAPKIIVSLMGKTITDVKSEALAYREADFDILEWRVDHFANVTTAESVLEAAGAIREIITDKPLLFTFRSAKEGGEQALTTGQYIDLNRAAVDSGLVDMIDLELFTGDDEVKATVGYAHQHNVAVIMSNHDFHKTPAAEEIVQRLRKMQELGADIPKIAVMPQTKADVLTLLTATVEMQERYADRPIITMSMSKTGVISRLAGEVFGSAATFGAVKKASAPGQISVADLRTVLTILHQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into the mechanism of type I dehydroquinate dehydratases from structures of reaction intermediates.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 3-dehydroquinate dehydratase
molecule tags Lyase
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus 92
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 4.2.1.10: 3-dehydroquinate dehydratase.
pdb deposition date 2010-03-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01487 DHquinase_I Type I 3-dehydroquinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3m7wA00
1H7PA 4MY8A 1GEQA 3QC3A 3GNNA 3E96A 5AOUA 1Q45A 4H4IA 3HPSA 2QCHA 4JIPA 4LU0A 4EIVA 4WQ6A 1BWKA 1I45A 3STEA 3ABSA 3TQKA 2ZZ4A 4O4WA 5CZSA 4BI7A 3T4CA 1T0OA 1ZAJA 2VC6A 3G1DA 5AYYA 1P5BA 4CCCA 2CLFA 3EX2A 5KZDA 3STGA 2QCGA 5D38A 2ISVA 1AW5A 3BGGA 3TQVA 3W7EA 2RKXA 4GBUA 1T96A 3PULA 3GNDA 2P1FA 5K9CA 3MI2A 4IMFA 1R2SA 4K6AA 2J9XA 1K7XA 5C54A 1L6WA 3UPBA 2ZZ6A 3W7OA 2V82A 1W1ZA 2ZZ1A 1NEYA 3T78A 3SR7A 4NQ1A 1Q6LA 3A5VA 2E5BA 3QMTA 4O15A 1GG1A 1H7NA 1R46A 1X1ZA 2YW4A 1JCYA 3W3OA 4N6EA 3LHTA 3W1UA 4UTLA 4UFIA 3GR7A 2R94A 2V2CA 4FX7A 3PC0A 3UYCA 1Z42A 1W0MA 5EKYA 3LBMA 2A6NA 5CG7A 1XCFA 4IMCA 1TQJA 1L6YA 4ZQMA 1GVSA 1QR7A 4WXYA 1H63A 3G1YA 3G18A 1H50A 4DO4A 4XZ9A 6ALDA 1B3OA 4UTWA 2ZRUA 2JK2A 3P62A 3B8DA 2QR6A 2Y89A 3DHFA 4YXGA 4FEZA 4A22A 4Y90A 3W76A 1ZALA 1ICPA 3KRUA 1R30A 5KMYA 3LCFA 3TMQA 1O5XA 3H55A 4XBSA 4YCOA 1DVJA 3AJXA 1CW2A 4WUIA 3M6YA 3EWZA 5ABTA 1W3TA 4LRTA 3A9IA 3CEPA 1C9DA 1WOAA 5TBOA 2ZTKA 1W8SA 4OHQA 1AMKA 4AWSA 3NQ8A 3W7CA 2A21A 4MFEA 2JGYA 2X16A 3N34A 4GXMA 2TMDA 4MY1A 4PC8A 2GJLA 1KM2A 1FUYA 3GXNA 3TC7A 3DFPA 5HNRA 3LERA 4HPJA 4ALDA 3QH2A 4Z08A 1K7FA 2V5LA 2B0MA 2EAWA 3ZWTA 4LVBA 3GZ3A 4A29A 3RLVA 1OFOA 2DZPA 3WFAA 4Z1BA 5H2ZA 5G4EA 1P0KA 1VLWA 4MZYA 3W7MA 3M43A 1F73A 1H61A 1KM6A 5C55A 5F1VA 1EX5A 4IPIA 4BR1A 1PL9A 1OG0A 2E6YA 2XN1A 1VCFA 4ZQRA 4WD0A 1ZJIA 3LX9A 2I1OA 5TQLA 1PIIA 4UFLA 2YZRA 3L5MA 4PEKA 1ADOA 3LTYA 1SO4A 1XBVA 2R91A 5DBUA 1L2UA 3MHGA 1N8FA 4RZ5A 3B0PA 2W0UA 3R12A 1TV8A 3TNOA 5FEXA 5IBXC 4MIMA 1WBJA 3UWZA 1MSSA 2ATSA 1GYLA 2FJKA 3W7QA 4G1KA 5G2HA 4NZJA 2NWRA 4IOTA 4N6FA 3UWVA 1TTJA 3C2RA 1OFRA 4JTUA 1WAUA 4D2JA 3BV4A 2RDUA 4GFSA 5E93A 5D03A 2JKPA 1WXJA 3ABRA 4RZ6A 3I6RA 5D33A 3LLFA 1FDZA 3W1AA 2FFCA 5DCBA 3FA5A 3LI0A 4IXHA 4NX5A 3S5OA 4LVAA 4DO6A 5DELA 4R34A 1KM0A 2C15A 4ML9A 5DY3A 3LCIA 3P5YA 1LDCA 5DLCA 3EWYA 3CU2A 1W5OA 1SFJA 1A53A 4OV9A 4IMEA 1AW2A 3R8RA 3QW3A 1BKSA 4W9TA 5F2MA 4E0CA 4O0KA 4RXGA 1OFDA 3L0KA 1SU5A 1YADA 2AQWA 4TIMA 3QW4B 3UWQA 2H3BA 1YTKA 4NXSA 5D30A 2H90A 3TX9A 5MHBA 2H6RA 1VLIA 2QUUA 1M6JA 3N3MA 1WBHA 4LOCA 3BW2A 1OX4B 5CGQA 1KLZA 4FNTA 2PE4A 1I4NA 4MFDA 3SFKA 3QYQA 3MO7A 4H6KA 2X2GA 2DP3A 4LUIA 4IMGA 4HKPA 1X7FA 2ZQ0A 4K8EA 3WJYA 3IIVA 3Q37A 4GNJA 1O60A 3HO8A 5AYXA 1UUOA 5BW6A 1FY6A 1XI3A 2YYTA 4XKYB 2V9DA 4O17A 2UV8G 2QJGA 1VC4A 3P5ZA 4FIRA 3P84A 3NR0A 1H7XA 2Y63A 1TPVA 2E6DA 3O6YX 4IX0A 3W72A 3GX9A 1VCVA 1OX5A 2B7NA 3OA3A 4ZQCA 4CCDA 1JJKA 3MI3A 1KTNA 2CLMA 4LVDA 2WNQA 5LGXA 4X9SA 4PL2A 2X1TA 3M5VA 2E5CA 1JCXA 3HG3A 5AC8A 3SI9A 1PV8A 1VPXA 3QMRA 1G4SA 2Y7DA 2VFHA 4MKNA 5U4NA 3BARA 1M7PA 1EP2A 3B0VC 5EYWA 3C56A 4JX4A 1S5WA 3NZRA 1ZENA 2BX7A 2TSYA 3C3NA 1LOLA 3B0UX 1ZY9A 2ZRZA 4QISA 3FJLA 1P1XA 3PSVA 4NT0A 3NQGA 3W7JA 4CNPA 4OU1A 1W37A 3GXTA 4MLJA 1NAL1 1TCDA 1Q3NA 1D3GA 3BG5A 1KFEA 3I7SA 2Y7FA 3WK1A 1DJQA 1OF6A 2ISSA 4DO5A 1YDVA 4M6VA 3MUXA 3M0ZA 5HWNA 3TXVA 3B06A 3DKJA 1SW0A 1LBFA 3IV3A 1WDWA 1KFKA 2Z1BA 4RCXA 3USBA 5D09A 2G96A 1OHLA 3HPZA 3JRKA 4NJKA 3M16A 2B7QA 1H62A 3M47A 1M5WA 4RX0A 3F03K 2FLIA 4NJHA 4JY8A 4O50A 3UWUA 5BRBA 4KWVA 4KFOA 2E5DA 4UTTC 2DZSA 3Q94A 1YXDA 1VGAA 4JX5A 3UY8A 3L67A 3G22A 1JUBA 2GOUA 3PAJA 4NUWA 1CI1A 4RR4A 1ALDA 4N9CA 3KOFA 4HNTA 5AFDA 1A5BA 5D2XA 4GUJA 1B4EA 5T26A 1H7WA 4OQVA 4E2DA 1GTEA 1GT8A 4K38A 3HF3A 4JD4A 4LT9A 4DBDA 1I2QA 1ICSA 2ZYFA 3F1QA 2H8XA 3M44A 1TSIA 5KTLA 2YW3A 2I14A 1H7RA 3TMLA 5IM51 2C3ZA 1Z48A 2ZRXA 3LGEA 4UMCA 2GPTA 1RQEA 1TB3A 2BLEA 3EX3A 1JCJA 4OV4A 1GPWA 2ZRVA 3THAA 3MMTA 3A5FA 2J9ZA 1IIHA 3W88A 1K8XA 3NQDA 4B5NA 3L5AA 3W71A 1HFBA 3P8JA 1G67A 4LV4A 2OT1A 1RPXA 2CZFA 4GUHA 3W70A 3MP4A 3B04A 1VRDA 1S3HA 4A21A 2H3DA 3GB6A 3OEXA 1TIMA 3P61A 3VI2A 4CCEA 4O4VA 1RZMA 1O4UA 3LCHA 4QJ1A 2HMCA 1OYAA 5D2TA 2P0OA 4Y9AA 1SUXA 3UZ5A 3IGUA 1DQXA 5LSMA 4NNCA 4QIUA 1THFD 1W3IA 3LRMA 2R8WA 3UXDA 2G97A 2OMAA 2A2IA 3SJ3A 4AMAA 1A5SA 3RMJA 3M5YA 4FX8A 3O15A 1EP3A 4ICNA 1ICQA 1TJRA 3BO9A 1D9EA 2ZA2A 3E0IA 3NL5A 3ELFA 4PA8A 1LRNA 4ZVJA 1RQBA 1KM3A 2Y7GA 1L6SA 4JTEA 1CX9A 5F4XA 5U7SA 3LV6A 5L9FA 2DU2A 3FOKA 4JTGA 3FKKA 5CPMA 5J5DA 4L4LA 3LXCA 1Q6QA 3LTSA 5FEWA 4AEOA 2QDHA 1O5KA 2QAFA 1MEIA 5C5YA 3R5EA 4ORMA 1QO5A 3GDLA 1LM1A 3NAVA 1G4EA 2CLEA 1W5MA 3OG3A 3W1PA 4K39A 1JRBA 1D3HA 4DXVA 4GWEA 4O0ZA 3GIYA 1OABA 1MXSA 5CPNA 2ISWA 3W2MA 4UFJA 2C14A 1YTDA 3TFXA 3GAKA 1GZGA 3S9YA 2C0AA 3PB0A 3QJAA 1EB3A 3EXSA 4JY9A 3NQCA 3G1HA 2Y62A 4LS1A 1Q6OA 3DU0A 5D04C 1YPIA 1P0NA 1YPFA 1V7YA 3INPA 3OHIA 3P81A 3C52A 4AHOA 1LP6A 1R2TA 1JCMP 2OT0A 2HS6A 4TX9A 3SSJA 1ONRA 1B57A 1VH7A 1VJIA 3ZS4A 1WQ5A 3FEMA 3W07A 4X2RA 5G1YA 1WV2A 4M7SA 3M1ZA 3TV8A 3GKFA 4YWIA 3TE9A 1TTIA 2V30A 3MHFA 3W6YA 1H7OA 3WK2A 5DN1A 3G1AA 4DPQA 3EWXA 2VENA 2VOMA 3DGRA 1F7BA 3LTPA 3QZEA 2A7RA 1XKYA 3SY5A 5LNSA 3LHWA 2DZTA 1QMLA 4JGDA 2QEZA 1F6KA 4BI6A 3QMSA 3C2VA 5HMSA 1TRDA 3G0UA 4EWND 1EWEA 1TJPA 4UR7A 1QPQA 2LLEA 1OFQA 5K9DA 4GUFA 5AHLA 4TO8A 4LY8A 5BMWA 3OBKA 4PFMA 2P10A 4K37A 3C8FA 4O1CA 1FWTA 3U8GA 3DZ1A 1QPOA 5HUOA 1SO6A 5G4WA 3SW6A 3TIMA 3G3MA 3TR2A 4AWTA 3DFNA 1HTIA 2TYSA 4XBKA 5D2YA 4UTWC 3OVQA 5HJLA 1J5TA 3PM6A 2VFFA 1KM5A 2E77A 2OX1A 2CZDA 3NQ2A 2ZZ3A 3DI1A 3PUEA 4J9JA 3IVTA 1G69A 1A50A 3KRSA 4LRSA 4WZHA 2FTPA 5DCEA 4HNNA 3S5NA 1B9BA 3L0GA 1HO1A 3PVFA 3MP5A 4UTKA 2BSLA 5F4WA 4TMCA 3RU6A 3UWYA 2YPIA 1MEHA 3D0CA 3W2NA 1LOQA 3IGSA 2RFGA 1QDSA 3G8RA 3LRLA 3L2IA 2GQ9A 3KVKA 4TMBA 4PL1A 3LCWA 4FXRA 3W2JA 3WJSA 1C29A 4O28A 3NPUA 5AHFA 3N9RA 1NSJA 1KFJA 5HWMA 1VYRA 3NM3A 5HR7A 2YDAA 3H54A 1W56A 1F2JA 4UFKA 3EKLA 4RV8A 1UJPA 3C4UA 1W31A 3W1QA 2DORA 2BZNA 4JTTA 5KITA 4HPXA 2ZA3A 2F7FA 1FXQA 3QRHA 1YYAA 5E0KA 4AB4A 4DELA 2QCMA 1EUNA 2WSYA 4UCGA 2KZHA 1K03A 4Z1CA 1A5AA 1JVNA 1OFPA 2ABBA 4Z1DA 2FB3A 4C1LA 3LOTA 1K8YA 4YCPA 2RHGA 1UBSA 3S0CA 1W5NA 1JUKA 2GQ8A 4UNKA 2BTMA 3ABOA 4E38A 1TPB1 4Y96A 2QJIA 1DOSA 1PHWA 5LZLA 3KX6A 1OVDA 1OYBA 3PB2A 3FIGA 1DJNA 4NJIA 4O11A 1ZHAA 3C2FA 3EB2A 4MYXA 5AB3A 1PE1A 1NF7A 1IGSA 3NA8A 2A7NA 5FF2A 3QQ0A 4LVGA 1EA0A 4BWLA 3S1UA 4U28A 3DHDA 4XWUA 4XUGA 1LOSA 2C13A 3GR8A 1DHPA 3LXAA 4IQLA 3W7NA 4WXZA 2C16A 1H60A 4AAJA 2YFNA 4O52A 2DZVA 1YLVA 1AK5A 3NQ6A 7TIMA 5FF3A 3NNTA 4GJ1A 3WK0A 5LNUA 5KZEA 3C2OA 1OX4A 3G8EA 4KFPA 3R89A 1K8ZA 3W1MA 4R53A 2PRMA 1W5PA 3PS7A 4X22A 4UMBA 4I7VA 3IRDA 1RQHA 1Z41A 3O8AA 1N7KA 2ZZ5A 3ATYA 1JQXA 3NL2A 2GUUA 3UD6A 4ADSA 1I2NA 3HIJA 1XBZA 4ADUA 5CPOA 1XFBA 2X1RA 3O05A 4IJBA 4UR8A 4XKYA 3W7GA 4M19A 4DF1A 2VFDA 2V0TA 1PCKA 2RH9A 1IF2A 1J4EA 1H51A 1RR2A 1I8JA 3DI0A 3W7HA 4DF0A 3LDVA 1IIGA 4JTIA 4UUIA 3G3DA 3SGUA 3EWWA 3GAYA 1F76A 2V2HA 3KRZA 3TSBA 3NYZA 2VKZG 1LYXA 1LZOA 1N55A 5FEZA 5FI8A 2ATMA 2GVJA 5K9XA 2YXGA 3SGZA 5CPLA 2BXVA 4CLMA 1G7UA 3NQFA 4JYEA 1I2RA 4NVTA 4UTJA 3RLUA 3GVGA 1FXPA 4CQ9A 3KAOA 3TH6A 2CZEA 4TR9A 1SZFA 4JEQA 4HIBA 1QOQA 3EXTA 1RV8A 3QSTA 4PTNA 4JICA 1T99A 4FNUA 1W3NA 2O7QA 4LNYA 3S8HA 1YTEA 2QUTA 1ME8A 3CWNA 2NXHA 1WOBA 3LHYA 3V1PA 3W2UA 5AC6A 3W23A 1VCGA 4LS0A 3N2XA 3HGJA 3S42A 1SR9A 2QCLA 4MZ8A 1X8FA 4GUGA 5AC7A 4OWGA 3W85A 4IMDA 2HSAA 2YGYA 1LLWA 3LCGA 5TIMA 3TXZA 4PH6A 2VEMA 1OFBA 2YR1A 3YPIA 4KWWA 2WPBA 1KBJA 1TPH1 1LBMA 2ZTJA 3CC1A 3HJZA 5CSSA 3PUDA 2VFGA 4MJZA 5LGZA 5J5RA 3QPYA 5K4XA 1QFEA 4LV9A 1H1ZA 4AHPA 3UPWA 3ATZA 4FNSA 2IQTA 5D02A 1FCQA 1VZWA 3BGJA 1FDJA 2V81A 3DXIA 1TYGA 1H5YA 1EP1A 3L68A 1XBXA 3DFSA 3G0SA 4AXKA 4BI5A 1LCOA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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