3M7WA

Crystal structure of type i 3-dehydroquinate dehydratase (arod) from salmonella typhimurium lt2 in covalent complex with dehydroquinate
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
KTVTVRDLVVGEGAPKIIVSLMGKTITDVKSEALAYREADFDILEWRVDHFANVTTAESVLEAAGAIREIITDKPLLFTFRSAKEGGEQALTTGQYIDLNRAAVDSGLVDMIDLELFTGDDEVKATVGYAHQHNVAVIMSNHDFHKTPAAEEIVQRLRKMQELGADIPKIAVMPQTKADVLTLLTATVEMQERYADRPIITMSMSKTGVISRLAGEVFGSAATFGAVKKASAPGQISVADLRTVLTILHQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
publication title Insights into the mechanism of type I dehydroquinate dehydratases from structures of reaction intermediates.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 3-dehydroquinate dehydratase
total genus 92
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 4.2.1.10: 3-dehydroquinate dehydratase.
pdb deposition date 2010-03-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01487 DHquinase_I Type I 3-dehydroquinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3m7wA00
3G0UA 2X1RA 3G1AA 4MKNA 2ZTJA 5F4XA 2JKAA 3QW3A 3SGUA 1XBZA 4H6KA 1W3IA 1VCFA 5G5IA 1HG3A 2F84A 3DKLA 1AG1O 1ME7A 1SO5A 2WV8A 4UTUA 2FB2A 1BEUA 3HPSA 3NZ1A 3H53A 1FWRA 3A9IA 4JX4A 4EVZA 2PE4A 3CT7A 3GXTA 1X1ZA 2CFFA 4FEZA 3MI2A 4MZ1A 1LOLA 1TTIA 1OHLA 5BMXA 2OT0A 2GUUA 3PBVA 3TFCA 4ZQOA 3G18A 1KFJA 4BWLA 4BF9A 4HNNA 3TC6A 3NQGA 3IVUA 1AW2A 3W23A 3GVGA 3TH6A 2WJZA 1HTIA 1WAUA 4FX7A 3R89A 2Z6JA 3RK8A 1O5KA 3MHUA 2RKXA 5HULA 3C0JA 3VE9A 3S9YA 1WDWA 1PHWA 4AEOA 2DZVA 3LRKA 3G1SA 1J5TA 4MJZA 1G4TA 4JGDA 3W70A 1U5JA 2P1FA 2V0TA 2NUYA 3NVTA 3TQVA 3W7JA 5J5DA 5KZMA 1Z42A 2TRSA 4PFMA 4IQLA 1G4EA 3PSVA 4UMBA 2OZ0A 3GIYA 1U83A 1F74A 1ALDA 4ALDA 2NZLA 1BWKA 2BSLA 1D3GA 1F05A 4R33A 3M5XA 3LCIA 4YCOA 3H55A 3WJXA 5BRBA 2X1TA 1K8XA 4ML9A 1Z44A 2QUTA 1OYCA 4UUIA 2YXGA 4Y8FA 3W88A 3NQFA 3BPWA 1M7PA 4RZ5A 1KM6A 2NXGA 2ZZ7A 1VYPX 3G8EA 4NNCA 1SW0A 3QF0A 3U8GA 5G2IA 4UTIA 2Y7EA 3NR0A 3P7YA 4I9AA 3QQ0A 1AW5A 2Y85A 3LCGA 1CW2A 3QEZA 3DFTA 4PA8A 3L65A 3NXFA 2W79A 4WZHA 1ICSA 2V9DA 1ZFJA 3IGUA 3UZ5A 4WY0A 3HGSA 4CQ8A 1X8FA 1MEIA 3O6YX 1K7EA 1AMKA 2GJNA 3W22A 4N9DA 1WX0A 3V1PA 4AB4A 1K7XA 3FS2A 3L68A 4M7SA 2YZRA 1SW7A 2GOUA 4CLMA 4JTLA 4LUJA 3LXBA 2CLOA 4OGZA 2YW4A 1FWNA 5ABTA 5H2ZA 3GNNA 4FNPA 5I3HA 2E5BA 4UC5A 4IJBA 1QOQA 4X9SA 1VH7A 1TPB1 5K9XA 3L21A 3TW7A 4TMCA 1DQXA 1D3HA 1EUNA 3FA5A 4LVAA 1XI3A 3RLVA 2X30A 2CZFA 2G97A 2NLIA 1XL9A 3P61A 4OWGA 1UB3A 2PURA 4NXKA 3HPXA 1GVQA 1ONRA 3QPZA 3MUXA 2DZUA 3M5YA 4UTTC 1X1OA 3G3MA 3TXVA 4FXRA 2FIQA 1KV8A 3LCHA 4MJMA 5LKYA 4LV4A 3W87A 4POCA 5F4SA 3SIZA 3OVPA 5CZJA 5EBUA 1OFOA 1OX6A 5LNVA 1TV8A 4FX6M 4NZJA 4DEFA 4O0KA 1W8SA 3CWNA 3UPBA 1DVJA 1I45A 5CPOA 3L5LA 4ONVA 1JUKA 1OFAA 3HG5A 4G1KA 4LTSA 3LTSA 4K7YA 2WOQA 2FJKA 3PF3A 3TMQA 5HR7A 1TPDA 1W56A 3W1XA 3KVKA 1RPXA 1TMHA 1C8VA 3B05A 3TQ0A 2Q3RA 4WOQA 2DZTA 1UCWA 3G22A 4FXSA 4RLIA 2CZDA 3TU9A 4GRSA 1QFEA 1JUBA 4E2DA 1TSIA 1H1ZA 4FIRA 3JR2A 3S5YA 3LOTA 3B04A 4QAIA 5FI8A 4YL2A 3LI0A 1ADOA 3F03K 1OFRA 4UMCA 3GDMA 2QCGA 5DCEA 3VI2A 4PTNA 2QCEA 7TIMA 3FEMA 4S1FA 4KWVA 3CPRA 4LC8A 4LY8A 3EX2A 4IWWA 5HMSA 4RX0A 4UTTA 3EX6A 2V5BA 3LBMA 3PY2A 4ORIA 2ZQ0A 2V2CA 2Z1BA 3DFPA 3LHTA 1A53A 3SI9A 4NJKA 2YDAA 4X22A 1MXSA 3OEXA 3QSTA 3C56A 2ZFAA 4JD4A 1A50A 1K3UA 4WXYA 4ZQMA 4P61A 3ZR4A 1GYNA 1TQXA 2VELA 5AB3A 3NDOA 4IXXA 4Z0SA 4NT0A 3UD6A 3W73A 2PRLA 4GBUA 5CPLA 3EXTA 2QCNA 5F2LA 4AHOA 4RZ4A 4N4QA 4XQ6A 4BK9A 1LCOA 1EWEA 3S1WA 2GQ8A 3W2UA 1OF8A 4L4LA 3I6RA 3PS7A 4LT9A 4TIMA 3T4CA 4JYFA 1KFBA 4BI6A 3LV5A 2A21A 5AC6A 3G3DA 3EB2A 3KXQA 4UTHA 3UY7A 2AQWA 4M19A 2A6LA 1KTNA 2GVGA 2R94A 3HG3A 2JBMA 2CLMA 2ZRVA 1H7WA 2NX9A 3WJWA 4M7TA 1VCGA 1H7OA 3IEBA 5KMYA 4JXCA 4ZQNA 5I3IA 2Y70A 1P0NA 3T7VA 3TJLA 3L0NA 4LOCA 3MJYA 3PSWA 4O15A 3A22A 5C54A 4WXZA 1T99A 1LBFA 4O8RA 3CLMA 1OG0A 1G4PA 1BTMA 1YXCA 2E6FA 2QAFA 1FCQA 1A5BA 2NV1A 1B9BA 4JTIA 3HIJA 2V5LA 1EX5A 3HMJG 1I2NA 1JQVA 1KTCA 1TPUA 1TPFA 5FEPA 3TX9A 3NM1A 3W7MA 3CTLA 3RMJA 3TDFA 2PCQA 2JKPA 1S5VA 1OJXA 2BTMA 1S5TA 3CU2A 3TSDA 2Q8ZA 4A2RA 3BW4A 3LERA 5FF0A 4Z1AA 4KFOA 3MMTA 4LVDA 3W1UA 5D2YA 1SUXA 4X3ZA 1EA0A 3PUEA 5LGZA 1DORA 1E51A 2GQAA 4IMFA 4OHQA 1F73A 4DELA 2H3DA 4E2BA 4QITA 3C2EA 1GT8A 2DJXA 3BVJA 3E02A 3L0GA 2CZ5A 1JCMP 1ME8A 4PEKA 4O19A 3F4NA 3QRHA 1FXPA 3N73A 5IBXC 2P0OA 2VFIA 4RK8A 3W1AA 3LCFA 1YTKA 3R13A 1YTDA 1FDZA 2Y88A 3LRMA 1VYSX 3N19B 3ABOA 4AH7A 1RQBA 3C2RA 4N02A 1D9EA 3M43A 3UXDA 2QKFA 3G8RA 3QZEA 1XM3A 3NL2A 3NQCA 3L5AA 4ZQRA 3DFOA 5CZSA 2FDSA 2E1DA 3I68A 2OJPA 2ZZ3A 3S5ZA 3HB9A 5DXYA 2H3BA 3VE7A 3QFEA 3SW6A 4DF2A 3DAQA 1H60A 1KBIA 3C6CA 2Y63A 1YLVA 3GKAA 2XN0A 3IIVA 5LHFA 1GVOA 3MBFA 2FFCA 4LVBA 4O54A 5HINA 3EWBX 2QDGA 3LGEA 2PRMA 4HN4A 2V8ZA 3OG3A 2CLFA 2ZZ5A 5IBXA 2PRHA 1HO1A 3RFAA 4LW7A 3M16A 1OFDA 3TAOA 5J5RA 3O05A 5K9CA 1L2UA 5F1VA 4ADTA 5FESA 3P8JA 4M6PA 3T78A 5LNWA 3KVJA 4K38A 3QYQA 1HUVA 5D30A 2W6RA 4UTJA 3MO7A 1LDCA 4BI7A 5D37A 1LOSA 1YXYA 3FYPA 4LU0A 4UXDA 4WUIA 3TKFA 4U4MA 4N9EA 2WQPA 2ZZ2A 4S2BA 5F4WA 3W7GA 4LS1A 3WK3A 2VKZG 3WK1A 2F7FA 5TBOA 3T44A 2QCHA 4K8EA 1FCVA 3VNDA 1LM1A 5LZLA 3F1QA 1GVRA 5CG7A 1KLYA 4UTMA 1HO4A 3W7RA 2JGQA 3G1DA 1VC4A 1VCVA 4XBKA 3U6WA 3L2IA 3DFSA 5EY5A 1TYGA 1CI1A 3UWUA 4N9CA 3PBUA 4NXSA 3W7DA 2ZDRA 3GR7A 3NQAA 4I7UA 4MUZA 3M5VA 4OT7A 4RJEA 3S1XA 3GDLA 4BWLC 1KBJA 3NNTA 3TR2A 1B4KA 1IGSA 4ZL1A 1EUAA 4O14A 5D33A 1VZWA 1Y0EA 3LM7A 3LX9A 2A1YA 5AHFA 5BNKA 4AF0B 5AHMA 5HUOA 3LLDA 3QMTA 2I1OA 3GDKA 3NQ7A 1XC4A 3G1XA 3PM6A 4NJIA 3P67A 3TV8A 3Q58A 2ISSA 1LOQA 3SZ8A 3BK0A 3M9YA 3EXRA 4ZQPA 5DLCA 2A7RA 4K36A 4R53A 3NAVA 3IIXA 1VS1A 1ME9A 3VKJA 1TTJA 1PCWA 3NOEA 3PUDA 2RDTA 1TPWA 3LBCA 4ADUA 1DQWA 1PE1A 1G69A 1R30A 1ZAJA 2CLEA 5K3VA 3PULA 4XKYB 1BWLA 1WXJA 3GK0A 2QEZA 3O06A 1S3HA 2Y7DA 3HJZA 4JTSA 5LSMA 4HKPA 4JYEA 3B06A 3U2OA 4CNNA 1FXQA 3TK7A 4EOUA 5BOOA 1JCNA 3LHUA 3DBPA 4W9TA 2V82A 3W6YA 4ZZ9A 3OVRA 3GB6A 2J9XA 2B7QA 1VHCA 4UR7A 4NJGA 4FX8A 3CEUA 1LRTA 5AFDA 3QJAA 1P0KA 4KWWA 5BMWA 2E68A 4OU1A 1NEYA 2B7NA 3HGRA 4HHPA 5CSRA 4R34A 2RHGA 4OV4A 3NQ6A 2RDWA 4N6FA 3C52A 3JRKA 4NX5A 2YFNA 3GNDA 4FHAA 1XDLA 1Q3NA 3TSBA 1OK6A 4Z0JA 5EMUA 3GAKA 1R2RA 2DJLA 5KINA 1KM5A 3IV3A 3N2MA 4RR4A 3OHIA 3A21A 3DFNA 5HWMA 4HPJA 4ZMGA 1XBVA 5DBUA 4DF1A 2J9YA 1UUMA 4FB7A 4XBSA 1UUOA 3ABRA 3NPXA 3H54A 3ZS4A 3QMRA 5BW6A 5DBTA 4GNJA 1LZOA 5KZEA 1FWWA 1SZEA 1OF6A 3DKJA 3LI1A 2EF9A 2QCDB 3DI0A 1H62A 4AMAA 4C1LA 1GVSA 2KZHA 5AC8A 5AN7A 1JULA 4JY8A 3BLEA 5FEWA 3KHJA 2VFHA 1W54A 2IQTA 4RV8A 3GDRA 3P84A 2ISWA 5AYZA 3P8IA 1I2QA 1Q45A 1I8JA 2A85A 4JYDA 4OBTA 2RDUA 3E9AA 3Q37A 2BX7A 3E49A 1V7YA 3CHVA 3FJLA 2QJHA 2WO5A 4NVTA 5E1QA 2BLEA 3HQ1A 2C3ZA 4J9JA 5FF2A 4PL2A 1SO3A 5D32A 1LP6A 1FQ0A 2OCZA 1RQEA 4MLRA 3B0VC 1G6CA 2A7PA 1XBYA 4UTWC 3W2KA 4GUFA 3W83A 1IXPA 1KV5A 1QPQA 4Q4KA 4U28A 2V2HA 3PVFA 2YX0A 4EF8A 3UZJA 3MYOA 3LTYA 2E09A 4DPPA 4AF0A 4A21A 1L6WA 1V5XA 5D2TA 4XZ9A 1L6YA 1JRCA 3WK2A 1ZNNA 1TJRA 3QC3A 4OE7A 1JCLA 3NGJA 1ZAHA 2ZTKA 4WOZA 4N2YA 1EWDA 1LBMA 1F6KA 1KM3A 2QCLA 3MYPA 3TIMA 4M6VA 3W7HA 1LORA 3P82A 4D2JA 2A6NA 4FNSA 4R7JA 1H7PA 1R47A 3CEPA 4FNUA 3BO9A 1KM0A 4GC4A 2OT1A 1YADA 5AOUA 3STGA 3NPUA 3P5YA 3CQ0A 4GUGA 1TPH1 5EYWA 1XCFA 5AYXA 4CCEA 4XKYA 3GAYA 2FLIA 2B7OA 1VLIA 3ANYA 1WBJA 4UTWA 3R2GA 3ZWSA 3KAOA 4AWSA 2ZA2A 3G1VA 4ORMA 3W1NA 1MO0A 2QR6A 4AWTA 1AL8A 1YTEA 1F76A 2JKEA 1K8ZA 2YW3A 3UY8A 1LROA 1GOXA 1I4NA 2TPSA 2Y7FA 5EA9A 2E5DA 3ATZA 3CWOX 3MHGA 4DO6A 1Q6QA 4WD0A 4ZVJA 3C2VA 1O94A 1LBLA 1PCKA 1I2RA 3I65A 3NEVA 4UR8A 2V2DA 3MP3A 2D73A 3CIWA 4Q32A 1W31A 4EIVA 4IPIA 3O6DA 2R8WA 4K6AA 4MFEA 3K30A 4GFSA 3PBYA 2AGKA 3UWWA 1EP1A 3W7OA 2Z2UA 2RH9A 2Y62A 3Q2DA 2Y89A 3A23A 3C61A 4GJ1A 3MI6A 3R8RA 3TSMA 4MFDA 3W76A 1EPXA 3NQ2A 5D04C 3PG9A 3LTPA 5D2VA 4OV9A 1PL9A 1G7UA 3OBKA 3RLUA 1KFCA 4E0CA 2QCDA 3IGXA 4LUIA 3KRUA 1DJNA 5F2MA 1IF2A 2FPVA 1GQNA 1NFBA 4M5PA 3GDTA 2DZSA 5D05A 2E6AA 1AW1A 3EX1A 1XXXA 3PBWA 1VLWA 3BG3A 4KFPA 1TTQA 2ZBTA 1I2OA 3UNDA 1GWJA 3LCWA 3UQNA 2DZXA 1VPXA 3LHWA 3N9SA 1TRIA 2ZYFA 3M0ZA 3STFA 1TQJA 4TU1A 3FYOA 4RXFA 1X7FA 3G1FA 1IXQA 3S8HA 3IIPA 2ZRXA 1DJQA 1FWSA 1WBHA 2GPTA 3CC1A 3O15A 1K03A 1Q6RA 4MZYA 5H91A 2GVJA 4GXMA 3WJZA 2Y7GA 5DELA 1KM1A 5AHEA 2HS6A 1EP3A 2ATMA 4CQ9A 1GTEA 4LRSA 5A8GA 1OX5A 3W7LA 1VYRA 5FF7A 1J4EA 4RKAA 4Z1DA 4XWUA 3PUOA 3G0XA 1ZAIA 2FPTA 3NM3A 5FF4A 2FPYA 1G67A 4WX2A 5L6UA 3W1QA 2CLHA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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