3MBD | Genus

Total Genus 135

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	135
sequence length	336
structure length	336
Chain Sequence	MDCDHLLRLGMTAKKILENGKGILAADETPKTLGRRFEKLGITNTEENRRKFREILFSTKGIERYIGGVILNQETFEQTSGSGVPLTELLKKKGIEIGIKLDKGLIDYKEKEKISVGLEDLDLRCKSSAFKDATFAKWRSLFYFYDGIPSEDCINENCSILAKYAIICQKNGLVPIVEPEVFLEGDYSMKRSYEVTRQILSTLMKYLNYELVYIPGVLIKASYVTSGQLSNEKYTPKKVATFTLRALLSTIPCGIPGIVFLSGGHGSEDAIGFLNAINMERGCRTWSLSFSFARALTDGVLETWRGDDSNIEEAQKILLETSFKACRGAEGKLWDQ

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structure of fructose bisphosphate aldolase from Encephalitozoon cuniculi. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Fructose-bisphosphate aldolase
molecule tags	Lyase
source organism	Encephalitozoon cuniculi
total genus	135
structure length	336
sequence length	336
ec nomenclature	ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date	2010-03-25

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00274	Glycolytic	Fructose-bisphosphate aldolase class-I

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3mbdA00

4KFOA 1GWJA 3NOEA 4A3UA 3W7RA 5F2IA 4YWIA 1TQXA 3FIGA 1K3UA 1RQHA 2FFCA 4PC8A 1KM4A 4Q32A 5LNUA 3G8RA 3W2KA 4EIVA 4J9JA 1F7BA 3GNNA 3ABQA 1ZHAA 1QPNA 4QNWA 3SZ8A 3QW3A 2Y6ZA 1VCFA 2Z6JA 1H7XA 4LNYA 4N6FA 5SWUA 1O5KA 2QAPA 4LS2A 3W7OA 1JRBA 5CZJA 3S5OA 3DFNA 5D37A 3STEA 3GZ3A 5HUPA 1SQ7A 1VHCA 1L6SA 3DFQA 5FEXA 3CU2A 3TC7A 4JTTA 4LWWA 1DBTA 1JVNA 4ZQNA 1MEHA 5HULA 1FCVA 5AC8A 3BO9A 2A85A 2FIQA 2ABBA 4QITA 2WSQA 2Z6IA 3A21A 3PBUA 3B05A 1AW2A 4K7VA 5DCEA 1J2WA 3IGSA 4DO5A 2E77A 3UXAA 4A22A 2EPHA 3WJWA 2EHHA 2GQ9A 4O52A 3HPZA 3PBVA 5EMUA 4FNUA 2BXVA 4B5NA 3NR0A 1AW5A 3EWXA 4YXGA 2ZCGA 3KVLA 1H50A 3TNOA 3C3NA 4LV9A 3P67A 3FYPA 4CCEA 5HWNA 2VC6A 4AEOA 3NQVA 2HS6A 1LTDA 2ZFAA 3TMLA 3P7YA 3YPIA 3BW4A 1A5AA 2VENA 4NX0A 4EF9A 1HTIA 2NX1A 1W3TA 1KFKA 5AB3A 3JR2A 3OVPA 4G1KA 4P61A 4OV4A 3N9SA 4UTHA 1D9EA 2NXHA 4MUZA 1JUKA 4O8RA 1C8VA 2H3DA 1QMLA 3LLDA 3M41A 4JTLA 5LSMA 1W37A 1K7XA 1OFBA 4QNEA 5K9CA 1YTEA 3G0XA 4WXZA 4MYXA 1PCWA 3VE9A 4LOCA 1OFQA 3Q2DA 3PF3A 4MY1A 3RF9A 2DZVA 3TW6A 4MY9A 3HBLA 3QJAA 5D05A 2V2HA 1GYLA 2VFIA 4UFIA 3O1NA 3IIPA 3LHYA 4GJ1A 2R94A 1FDYA 1ICPA 1YPIA 5AHIA 1H62A 1P0KA 3C8FA 3HPSA 1RQEA 4IOTA 4E2DA 3WK1A 2YW3A 3MHUA 3F4WA 3E49A 1TQJA 4H3DA 2V2CA 4Z0SA 4DF1A 3MO7A 2C15A 4ZQMA 1TTPA 2DZSA 4FX6M 2ATMA 1KFJA 3TQ0A 1WBJA 3FOKA 1ZJIA 5H91A 3UPBA 2ZA1A 3WJSA 3ABOA 3G1YA 2C6QA 4FNRA 4DEFA 4WQ6A 3HG2A 5LNWA 3W84A 5ABTA 4WJEA 4JTEA 3IV3A 5T26A 1QAPA 2NLIA 2FTPA 4N9CA 4JXCA 1EWEA 1GVRA 3KRSA 1FX6A 4M7SA 3W1MA 5I3JA 2Y85A 5EA9A 2J9ZA 3MWAA 1P0NA 3W7IA 3D0CA 4JYFA 2H90A 3P80A 1MO0A 3IVSA 4FHAA 4M5PA 1IXQA 3IIZA 2F7FA 2LLEA 3WK3A 2ZZ1A 2NXGA 3PAJA 4K7YA 4DELA 1EP2A 4IXXA 1ZY9A 1S5TA 3GDMA 5K9DA 1K7EA 1H51A 1W31A 3W87A 4LVFA 4AH7A 4UTJA 3LCLA 4GUJA 3W6YA 1UUOA 4GUFA 3DH7A 5FESA 4UTLA 1A5BA 3P62A 2A0NA 2CW6A 1LZOA 4Y96A 2YZRA 3LHZA 4QQ3A 3LHWA 4ONVA 4O13A 5FF4A 3M47A 4WUIA 3MBFA 3TXZA 1F76A 3C2OA 1PCKA 3T4CA 1LROA 2ZZ3A 5CKSA 3Q58A 3G24A 4WX2A 1QWGA 2Z2UA 3W83A 1JUEA 1TRIA 4O0KA 3PUOA 4M19A 4LRSA 5AHEA 3V1PA 5BNKA 3IGUA 4O4WA 4LS0A 4GUIA 3B0UX 2OCZA 2Y62A 4N6EA 3DGRA 4OE7A 3W1PA 5A8GA 3LB0A 3W7GA 3W1UA 1XI3A 2P1FA 3CPRA 3ZWSA 1DQXA 4UFLA 4W9TA 2WOQA 2GQAA 4BI6A 4S2CA 3L0NA 5D2WA 1CI1A 1QOPA 2DJXA 2QCHA 2JBMA 4L4MA 4DO4A 3LTSA 2XFWA 1WQ5A 3A5VA 2QAFA 1JUBA 2E6DA 2ZRYA 1LBFA 3W73A 3PBWA 2IQTA 1I8JA 2GJLA 1NVMA 2QCFA 1PE1A 5CPLA 3SGUA 4Z1AA 3QH2A 1VS1A 1QPOA 3LOTA 4UFKA 1X1OA 5G1YA 3CQ0A 3O05A 5F2MA 5AHFA 1UASA 3GB6A 1OYAA 4BWLA 5TQLA 1I2OA 1KBIA 3I68A 3LTYA 4XUGA 8TIMA 1M7OA 4DPQA 5H2ZA 3FJLA 1VPXA 1QDSA 4NQ1A 1CW2A 4U28A 3F03K 4BWLC 1H7WA 4OWGA 4PA8A 4Z1DA 4ZQCA 1KFCA 2X30A 2F84A 4P2VA 3MI6A 4N02A 1B9BA 4O15A 2V81A 3GKFA 4MLJA 3DI1A 3G1AA 2AGKA 3OHIA 1SPQA 4NXKA 3QMRA 5KZMA 5IBXA 5C55A 4UTKA 2RDTA 3KX6A 2JKPA 3QRHA 5I3KA 5IBXC 4L4LA 4JY8A 1OFEA 4IMFA 3B0PA 1FBAA 3UZJA 2J24A 1HUVA 4K6AA 3WK0A 3WJYA 1KA9F 1PV8A 2V2DA 4IPIA 4HNNA 1GT8A 2B4GA 3JRKA 3UWQA 2OT0A 3GX9A 1YPFA 3JS3A 2X16A 3LRMA 4O1CA 5KINA 2R91A 4BI5A 3TC6A 1OX4A 4WXYA 1TSIA 4JYDA 4RX0A 3DI0A 4ADSA 4EOUA 4NVTA 1KLYA 2BZNA 2PCQA 5FF3A 2GVLA 3NO5A 2A1YA 4IMEA 4KFPA 4WOZA 3CM4A 3A23A 4RCXA 2E5DA 3CIXA 4MY8A 3QPYA 5F2LA 4Q33A 1OFOA 4ADTA 3O6CA 3RLUA 1RV8A 4RKAA 1FY6A 2J9YA 1EA0A 5BMWA 4LUIA 2ZDRA 2ISVA 4O28A 1K03A 3LLFA 5CPOA 3CHVA 2YDAA 3LM7A 1P1XA 4FX7A 4YLWA 2C3ZA 4IQLA 3PB2A 1Q6LA 2DZPA 5K4ZA 2X1TA 4LU0A 4MZ8A 1XFBA 5HNRA 1M5WA 1Y0EA 4MJZA 1OG0A 2A7PA 3NQMA 3O6DA 3H53A 3LI0A 3TQVA 3LERA 3NPUA 5D03A 1B4KA 2HMCA 1WBHA 1W1ZA 5BMXA 1ML1A 5D33A 4JDYA 4NJHA 2R8WA 4FO4A 4ORIA 5I3FA 1R2SA 1VCGA 1KV8A 4WY0A 4AHQA 3NPVA 4GWEA 1EWDA 1W56A 2BX7A 4IGHA 4ZZ9A 3QMTA 5HUOA 3GDLA 3KRZA 2YPIA 3EWZA 4UTMA 5HMSA 1PIIA 2R14A 2HS8A 4AMAA 4DBDA 4O50A 2ZTJA 4RJEA 3L0KA 1XUUA 3BG9A 4WZHA 1JCYA 2J88A 1SO6A 5FEPA 4HNUA 2QCDB 3IIOA 3MHGA 1PVNA 4XQ6A 4FX8A 3W7HA 4UNLA 5LNSA 4CQ9A 3FLUA 3M5VA 1XDMA 3A22A 4ORMA 3TU9A 1TRDA 2DP3A 1KFBA 1VR6A 4MFEA 3MHFA 4YL2A 4JGDA 1OFPA 3HGSA 2NXIA 2NV2A 1I2QA 5K3VA 1SFLA 1LLZA 4JD4A 1YXYA 3F1QA 3FEMA 4NU7A 3GR8A 2WNZA 3UPWA 2QCDA 4JNMA 4K36A 4N4PA 5AYYA 4PFMA 3NQ7A 4EVZA 3LV5A 5I3IA 3P8JA 1DQWA 2WQPA 3LCGA 3P82A 1FCQA 5AFDA 2FB3A 3G1HA 4RLIA 2CU0A 3KAOA 2OJPA 4GE8A 2YFOA 4Y8FA 4JN6A 5EPDA 2CLEA 2A6NA 2ZZ5A 3NM1A 4DF2A 2OX1A 1GTEA 4TX9A 3TQKA 3W23A 1WOAA 4FXRA 1BEUA 3W7CA 3EX4A 2DZWA 2ZBTA 4FXSA 4K37A 4MOZA 4O11A 1TPB1 4AWTA 4RZ5A 3CLMA 3DAQA 2CZEA 1ME7A 1FUYA 3T44A 1LCOA 2QUVA 3M9YA 2Q3RA 4FNQA 3F4NA 4HPJA 2JK2A 3NQDA 1Q6OA 4TO8A 3HOJA 3LRLA 1FWWA 4PL2A 4CQAA 4K38A 3O07A 1NF7A 1S5WA 2GVGA 5D02A 3VI2A 2VOMA 3DENA 4Z0JA 1DORA 3W7JA 1EP1A 1X8FA 3HQ1A 5LKYA 3QC3A 3EWUA 3TIMA 3G1DA 2ISWA 1P4CA 3MJYA 3IIVA 6ALDA 4A21A 3RLVA 3B04A 3NQ8A 4CNOA 1YLVA 3G0UA 3HG5A 4QSHA 1ZCOA 5LNRA 1WAUA 1VLIA 5EKYA 5HWMA 3OG3A 3EX2A 3TV8A 1XDLA 3M0ZA 1BWLA 1A5SA 1Z48A 3HJZA 4JY9A 2WSRA 5EL1A 2OT1A 3S6DA 3CWOX 2P0OA 4LV4A 3SGZA 3NVTA 4K8EA 1R30A 5G2IA 2FDSA 3KVKA 4RZ4A 4N9EA 5FF2A 4CCCA 4MZYA 3G1SA 1Z44A 4C1KA 3NYZA 2DORA 3G1VA 2CWNA 1ZENA 1F74A 3ABSA 1LOQA 3FYOA 3NM3A 2VKZG 3THQA 2V5LA 1WX0A 1FWSA 2A2IA 4PODA 3GNDA 2G97A 1T8XA 4JTKA 5C54A 4JICA 4I7UA 4AXKA 4IX2A 5KSWA 3S5NA 1F6KA 1X7FA 3RK8A 3U6WA 3W1RA 3KOFA 2ATSA 5D38A 4JX6A 5I3HA 4UR7A 2C18A 1WV2A 5E1QA 4O18A 2FPYA 4O14A 3BGJA 1G6CA 1XBZA 4MFDA 4LS1A 2VEPA 1QNVA 3NQGA 1FDZA 4JTGA 3ZWTA 1GG1A 3FA5A 3I6RA 5AC7A 3S5ZA 2NWRA 1RR2A 1LM1A 2YSWA 1GG0A 2Q8ZA 3W70A 1TPEA 3EXRA 1I2RA 2EAWA 5AHMA 3M5ZA 5KTLA 4QJ1A 3V75A 4R7JA 5DY2A 3A5FA 4JIQA 3UY7A 3PUDA 4IJBA 1OHLA 3QZEA 3NQFA 4HT3A 4HHPA 4O54A 4UTTA 5K9XA 1WOBA 3BV4A 3G3MA 3P61A 4KKXA 1PS9A 5HQEA 3MP5A 4UTTC 4UUIA 3IVUA 4I9AA 5MHBA 3C0JA 1H63A 4HN4A 4D2JA 2YYTA 1OVDA 1BWKA 2A7RA 4O19A 4Z08A 2A4AA 1AG1O 2ZA3A 3CEPA 3U8GA 4XTDA 3SR7A 1N8FA 3TFCA 4GUGA 3KRUA 1O60A 3MUXA 4JEQA 1GEQA 1IGSA 3GLCA 5F4SA 4KWWA 4BF9A 5CG7A 1U5JA 4JDBA 1HO1A 1SSGA 1W8SA 3ABRA 2E1DA 4IWWA 4UMBA 2AAMA 3LTPA 2A6LA 3L65A 1TPFA 1TV5A 2CLLA 1OYCA 3W75A 4CNNA 2ZRWA 5G4EA 2QEZA 3LCWA 3WK2A 1DJNA 1VLWA 2GOUA 5L6UA 5F4WA 1Q6QA 1KTBA 4UFMA 3CEUA 3DZ1A 4A29A 3NPWA 4S1FA 2ABAA 1KM5A 3C2RA 3QQ1A 3DFOA 3GDRA 3GKAA 3W3OA 2ZRVA 3CT7A 3C4UA 4I7VA 5HWJA 1T0OA 4EF8A 3TMQA 1GVQA 4NJGA 1WDWA 3BW3A 4O17A 4PEKA 1KM2A 3I7RA 2YW4A 4DBEA 4IMDA 3FJ6A 3AJXA 2QUTA 4FEZA 4HSOA 4AHOA 3GIYA 3W7KA 2ZZ2A 4OHQA 4XKYB 5D30A 5CGQA 3TSBA 1JCNA 4IXHA 4BFAA 1NFBA 2VFGA 4GXMA 4IX0A 1T99A 3P8IA 4AF0B 1XC4A 4NNAA 4JYEA 1TTQA 4FIQA 2ZZ4A 4XBKA 1GYNA 1MEIA 5AHNA 1TV8A 1KFLA 3AO0A 4A2SA 1G4PA 1L2UA 3O16A 2VXNA 3BG5A 1K8YA 2WKJA 3KFTA 1MZHA 4UR8A 2AQWA 5K2ZA 1LYXA 4TU1A 4MJMA 3TA6A 4N4QA 2RKXA 3NQ2A 4PL1A 3TKFA 1Q45A 5AN7A 5AYZA 3R8RA 4LY8A 2HTMA 4MYAA 1T96A 3HGJA 5D2TA 2QUUA 4Z1BA 1UCWA 4RXFA 5DXYA 1XL9A 4HPXA 1PL9A 2Y7EA 3LCHA 6TIMA 3TXVA 2GUUA 1H61A 5G2HA 3G18A 1G4SA 2Z0IA 3LGEA 1U83A 3MBDA 3ZS4A 1BKSA 5TIMA 3W2JA 3G0SA 1AL8A 3N2XA 1OYBA 3W1NA 1LBLA 3UWWA 1I45A 4XZ9A 2I14A 3W7EA 3QPZA 1ZAIA 3NQEA 1WA3A 4UTIA 3UD6A 2QCEA 1K8ZA 4NT0A 5J5RA 2RFGA 1XBVA 5J5DA 2PE4A 4PTNA 3CB8A 4Y9AA 4O57A 5D04C 5EY5A 4POCA 3R13A 3UWVA 2BLEA 2A5HA 4LVAA 1YDVA 3CWNA 4ALDA 3QM3A 3W2UA 3W88A 3INPA 4QM1A 2QCMA 3S5YA 1TO3A 3TJXA 4XBSA 1YYAA 3O63A 4JS3A 2E5CA 4E2BA 4DO6A 1EB3A 2DZXA 1TCDA 2ZRXA 1X1ZA 1OX6A 1G67A 2Y88A 4OBTA 1XBYA 5DLCA 4LVGA 5FF7A 3LHTA 2Q8LA 1KTNA 2DZUA 4X2RA 4BR1A 3E0IA 1KV5A 3PG9A 2J9XA 3DHFA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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