3MBFA

Crystal structure of fructose bisphosphate aldolase from encephalitozoon cuniculi, bound to fructose 1,6-bisphosphate
Total Genus 134
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
134
sequence length
337
structure length
337
Chain Sequence
MDCDHLLRLGMTAKKILENGKGILAADETPKTLGRRFEKLGITNTEENRRKFREILFSTKGIERYIGGVILNQETFEQTSGSGVPLTELLKKKGIEIGIKLDKGLIDYKEKEKISVGLEDLDLRCKSSAFKDATFAKWRSLFYFYDGIPSEDCINENCSILAKYAIICQKNGLVPIVEPEVFLEGDYSMKRSYEVTRQILSTLMKYLNYELVYIPGVLIKASYVTSGQLSNEKYTPKKVATFTLRALLSTIPCGIPGIVFLSGGHGSEDAIGFLNAINMERGCRTWSLSFSFARALTDGVLETWRGDDSNIEEAQKILLETSFKACRGAEGKLWDQE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure of fructose bisphosphate aldolase from Encephalitozoon cuniculi.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase
molecule tags Lyase
source organism Encephalitozoon cuniculi
total genus 134
structure length 337
sequence length 337
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2010-03-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3mbfA00
1UJPA 4ZQPA 1EP1A 4U4MA 4ALDA 3QF0A 5D2WA 1KFEA 1KFBA 3LLDA 2QUTA 5KSWA 2C13A 3KX6A 1RV8A 4WZHA 5F2GA 4K7VA 5AHIA 1OFDA 5HUOA 3TJXA 4EWND 5HJLA 4XBSA 5HR7A 5L9FA 1Q6LA 1ICPA 1N8FA 1SUXA 2OT0A 5CZTA 2QCDB 3CPRA 1A5AA 5CPMA 4N9BA 4NZFA 3G1HA 2C19A 2CLKA 3L5AA 3QMSA 4DO4A 1SQ7A 3W7CA 1M7OA 2WNZA 4H4IA 2QCFA 1K7XA 2Y62A 4MYXA 4QJ1A 2QCLA 2HTMA 3SECA 3PR2A 5AYYA 1OFRA 3OHIA 1DKWA 3UY7A 4Z1DA 5ABTA 4PA8A 3OVQA 3WJXA 3B05A 4Z1CA 1R2RA 1RQHA 1I2QA 5BMWA 4JTKA 1W1ZA 2Z6JA 3E96A 3QEZA 3GKFA 5HQEA 4ZQOA 4IXHA 3TXZA 1T99A 1ADOA 3ATYA 1P1XA 3CT7A 4ZQMA 2ATSA 3LCHA 1K3UA 5I3JA 3O05A 1WBHA 3LERA 4HHPA 3S8HA 2AGKA 2RKXA 2VFDA 2YCEA 4FNTA 5D30A 4M6VA 1WBJA 3DBPA 4GUIA 1NFBA 4FIQA 3IIXA 4O1DA 4XZ9A 3MBFA 4JTGA 2B7NA 2WO5A 2V0TA 1MXSA 1FXQA 2JKAA 5CPLA 1MSSA 3NA8A 2E5CA 1WXJA 2B7PA 3TK7A 3FS2A 1TB3A 1O60A 1C9DA 1QPRA 1FCVA 1LLWA 3GR8A 5AC7A 5K2ZA 1YTDA 3ABRA 5EKYA 1SW7A 2QUUA 3B4UA 2ZRXA 4HKPA 5LNVA 3B06A 1LM1A 1H62A 3IVSA 2VOMA 1LYXA 1QFEA 3MI6A 2E5DA 2FLIA 2PE4A 4ORIA 3QPZA 3QRHA 3D0CA 2ABAA 1P4CA 1W3NA 3QMRA 1TPVA 3H53A 4OU1A 2GUUA 3L0GA 3W7KA 3KVMA 2B7QA 3C52A 2Y61A 3B8DA 1Q6OA 3EXSA 2A6LA 2YFNA 3W07A 3W7NA 3B0UX 1VJIA 4FX6M 1QNVA 2V5BA 3W2MA 2FPVA 3A9IA 2OCZA 4UTJA 5BNKA 2OZ0A 5CSRA 1ZY9A 1XC4A 2J88A 2EPHA 4NXKA 3NQ7A 3UXAA 3LCXA 4XBKA 4N6FA 2VFIA 4W9TA 3S5NA 3T4CA 3W87A 3BW3A 5BOOA 4GJ1A 3UNDA 3LRLA 5E93A 3NQVA 1NAL1 1ZJIA 2ZRWA 5KZDA 5J5DA 3W2LA 1A5BA 5A5WA 4PODA 2X30A 3CC1A 3TSDA 1LZOA 3CU2A 2DZTA 2NXHA 1K7EA 1VC4A 3LDVA 2DU2A 1TQJA 3PSWA 2G5WA 4UTMA 4DF1A 1KM5A 4MVAA 1KLZA 1VCGA 5D32A 4XKYA 3KRZA 1TTPA 4K8EA 4FNSA 3VCRA 2J27A 4TO8A 3I7RA 3STGA 1WV2A 4DELA 4LRTA 3LB0A 3DXIA 2ZRZA 4KFOA 4TU1A 5H91A 1ICQA 2QKFA 3VFLA 1CX9A 2H3DA 4MPQA 3NQFA 1BEUA 4L4LA 2CZDA 5DLCA 2WQPA 4HNNA 2I9EA 3QYQA 2E09A 3QSRA 4UCGA 3STCA 3M0ZA 5EY5A 1GVQA 4O50A 1WYIA 3NL6A 2ISSA 3W86A 3TC7A 3P7YA 4GUHA 1MEHA 3SW6A 3UWYA 3PAJA 4RK8A 3FJLA 4O57A 1KTNA 3BLIA 4C1LA 3GDKA 3LCIA 3TDFA 3LBCA 1UB3A 2YYUA 3HG4A 3GXTA 1H50A 2FDSA 3M43A 5K9CA 4EF9A 1RQBA 3OBKA 1YPIA 1U83A 1SFJA 4GC4A 1WOAA 1UCWA 3LRKA 3PUEA 3NQCA 3KRSA 1RD5A 3IGXA 1LOLA 4UXDA 1Z48A 2ISVA 3GDLA 3NL5A 1YDOA 4LVDA 4LVAA 1VGAA 2YGYA 4NJGA 3KVLA 4IWWA 2RFGA 2H90A 4RKAA 3GK0A 4ORMA 4UUIA 3Q94A 1JVNA 3NM3A 3C56A 2E6FA 3A22A 1GOXA 4C1KA 4Y9AA 5DXXA 1F73A 1ME8A 3UWUA 1QDSA 2PURA 1K02A 2TMDA 3CEPA 4H6KA 2YPIA 3GLCA 2C0AA 5KZMA 3G1FA 4R7JA 4ADSA 2VEIA 1ZALA 1EWDA 1TTJA 5DCEA 1DQXA 3G1XA 5FF3A 3RMJA 4LV9A 1FX6A 1AW5A 1HL2A 3TFXA 5FF0A 1SW0A 4LW7A 3EWYA 4A29A 5I3IA 3A23A 1LBMA 2V2DA 3UY8A 3SI9A 4TR9A 3IGSA 2IQTA 1G4PA 5D33A 2NWRA 3HGJA 3W7GA 3S1VA 4N9CA 3W1MA 3F1QA 5L6UA 2QCMA 1J5TA 2ISWA 5K7JA 4JTEA 5TBOA 3NQMA 3UQNA 2ZFAA 1TREA 2Q8LA 4CNNA 3LHTA 3SGUA 1KM3A 4LNYA 1JCNA 3CQ0A 3W74A 4MZ8A 1OABA 3NPXA 3W83A 2A21A 1VQTA 1M6JA 1LRNA 2JBMA 3HG2A 2BX7A 2YXGA 3LCFA 4GWEA 2FPYA 5G2HA 4QISA 3RFAA 3KVJA 3FYPA 1LP6A 1JCMP 1QMLA 2QDGA 3NQDA 4IMGA 4JS3A 4K38A 3PG8A 2DZXA 1GWJA 5DBUA 4XWUA 1I8JA 5HWJA 2CLHA 5F1UA 2ZRYA 2FIQA 4R53A 3JRKA 4AF0A 2BSLA 2QCNA 1EUAA 3R8RA 2BLEA 1A50A 1CI1A 4R34A 4BK9A 4TMBA 3GXPA 3TMQA 4DPPA 3W7EA 5AC6A 4NNCA 3U6WA 4RXFA 4RX0A 4IMDA 1KV8A 3O63A 1Z41A 4MZ1A 3TAKA 1H51A 1OVDA 2ZZ5A 4LUJA 1TCDA 3DU0A 5T26A 5K9DA 1G7VA 1ZAIA 3G3DA 5D03A 4N9EA 3SGZA 1JJKA 4O0KA 4DPQA 2G95A 1BWKA 1Q6QA 2AAMA 2CLEA 5AYZA 5F4SA 1EPXA 1DORA 2OMAA 3MI3A 1GTEA 4IGHA 5I3HA 3QW3A 3M44A 4BI6A 1FDZA 4AVFA 2QJIA 1SZNA 3Q58A 4ADUA 4A3UA 1KM0A 1ZHAA 4FEZA 3L68A 4O4WA 8TIMA 5LNSA 3HBLA 3ZS4A 3W70A 2LLEA 3N73A 3USBA 3L5MA 4MFEA 1IIHA 1OFOA 2C18A 1V5XA 1TPDA 3C61A 1EUNA 1Q45A 4LOCA 3SZ8A 4E0CA 2GVLA 5KTLA 3TUUA 1SW3A 3O15A 4GUFA 2DJXA 3EX3A 2RDWA 4M7TA 1ICSA 1KTCA 3ABOA 2NUXA 3HG3A 2P10A 4JTTA 2V2CA 4S2CA 2YZRA 4KKXA 1TSIA 5E1QA 2YDAA 3G0XA 1MEIA 4A21A 3TXVA 2GOUA 4R33A 2ZZ3A 1V7YA 4AAJA 1YDVA 1Z42A 3DHDA 3W6YA 4IMCA 4HPJA 2DP3A 1VCVA 3PBWA 1XKYA 5FEZA 4Z0JA 3HOJA 1MEWA 2QJHA 4I7WA 1WOBA 1SPQA 4HN4A 1RR2A 2NUYA 3NPUA 1AW1A 1I2OA 1JUKA 2A7RA 3QQ0A 3N9RA 2RH9A 5CSSA 4UTTC 2VEKA 3NQGA 3BG3A 1SFLA 3B0PA 4ZMGA 3GX9A 3LCGA 1TO3A 4IX0A 4K39A 1I45A 1W5QA 3CWNA 3PB0A 3LV5A 2C15A 5CGQA 3SSJA 2FB2A 4AHQA 3WJSA 2CLMA 1I2NA 2R91A 5CG7A 1XM3A 4QAIA 3QC3A 5HWNA 3U8GA 3GDRA 2XFWA 2ZZ2A 5FI8A 3NG3A 1KV5A 2A0NA 2A7NA 1GVSA 2ZCGA 1ALDA 3P67A 1O4UA 3ZWSA 3NQEA 4E2BA 4RV8A 5LNUA 4PL1A 4JIQA 2Y7DA 3NNTA 2W79A 3P74A 5FF7A 3EB2A 5D09A 4O13A 1WQ5A 2GPTA 2Y7FA 1Q3NA 4GNJA 2WNQA 1H7RA 3GYEA 4FNPA 2BWGA 3HIJA 1KM2A 1OYCA 1ML1A 1SZGA 2WOQA 3GR7A 4JTHA 3C2RA 1WDWA 3F03K 3QMTA 3IIZA 3MYPA 2PRLA 1BWLA 4BFAA 3SY5A 2E6AA 3W2NA 1FXPA 3INPA 4MKNA 4AWTA 2B7OA 3A24A 1KFCA 4RLIA 2WSYA 3G18A 3GNDA 5E0KA 3PUDA 1O94A 4UMBA 4G1KA 4MY1A 3JR2A 4LVGA 4X22A 3G3MA 1EB3A 4Y90A 4O53A 3M1ZA 3LHYA 1O5KA 2UV8G 2ZZ4A 1VPXA 2CLFA 4RCXA 1KTBA 3S0CA 4JY9A 4ZZ9A 3W1PA 3DFSA 3HG5A 4O28A 1VYSX 3ZFHA 3Q37A 4CQ8A 3G8RA 1TIMA 2VELA 3UZ5A 4J9JA 4WY0A 2ZZ7A 4I7VA 4NJKA 3EEGA 3L66A 2FTPA 2VC6A 2Q3OA 3VI2A 3W1RA 2BZNA 3VE7A 4A2RA 4UFMA 1NVMA 2V5LA 4N6EA 1G69A 3W84A 1QAPA 3MP4A 1TJPA 3O6DA 1EP3A 5G4WA 3GDTA 1U5JA 4MLJA 2NX9A 4OE7A 3FYOA 4ICNA 3W22A 4DQWA 3E02A 3N34A 3GDMA 2F7FA 1W3TA 2EAWA 2VFEA 1HO1A 3EXTA 4WQ6A 3HMJG 4GBUA 4DF0A 1TTIA 1EWEA 1F6KA 4O16A 4O17A 3PS7A 3W7MA 1JCLA 2NLIA 1UASA 4PEKA 4O54A 3UZJA 4AH7A 2G97A 4AF0B 1FCQA 3C0JA 1W3IA 4GE8A 1DV7A 2OJPA 3M9YA 5BMXA 3MUXA 4FXSA 2YR1A 1THFD 1IXOA 1ZFJA 1YXYA 3G22A 4WD0A 3L2IA 3ATZA 4LS2A 4JYFA 4AHPA 3LI1A 1H61A 4NX0A 3W7OA 3GAYA 4MIMA 1GQNA 3HF3A 2D73A 1QPQA 3PSVA 3N2XA 2R94A 3OG3A 5DELA 2DJLA 3TX9A 1IXQA 3W1XA 3G1SA 3N19B 4GRSA 3LHWA 1GTHA 3W72A 4AMAA 2C6QA 3ELFA 1LRQA 1A5SA 3R5EA 3T7VA 1LRTA 4L4MA 1A5CA 5DXYA 4QIUA 4NZJA 3FLUA 2RDUA 2WSQA 4ZQNA 1SO5A 2J9XA 4XTDA 3LX9A 1X1OA 1G4EA 3WK3A 4KWWA 3W7DA 4BWLA 4UNKA 4O1AA 4JYDA 4KWVA 2TSYA 2V81A 5CZSA 5I3GA 3E12A 1TRIA 3NR0A 1NF7A 5DCDA 1SSGA 5C2XA 1F74A 1YXCA 5C54A 3DKLA 3P5ZA 4UFJA 1PCWA 3W1LA 1LOSA 4Q32A 2HMCA 4PL2A 4LT9A 3W7HA 4DXVA 2GVGA 2X1RA 1DHPA 3C8FA 2FFCA 3KRUA 4YCOA 3L0NA 3IRDA 4BF9A 3LHZA 4CNPA 1BKSA 5CZ0A 4HPXA 3VE9A 5AFDA 3TU9A 4OT7A 1OX4A 1C8VA 3BVJA 2QUVA 4JX6A 5IM51 4QSHA 1OK4A 3V1PA 5FEXA 2Z0IA 4LC6A 2YW3A 3R12A 5GVJA 5DBTA 3DI0A 1D3GA 3S5YA 4N9DA 3O1NA 1F7BA 4UFLA 1AW2A 3RK8A 3QW4B 5BRBA 3MYOA 4H3DA 4HNTA 3HPSA 3F4WA 1H7NA 2QF7A 4P2VA 2C16A 3G1YA 1WX0A 1QR7A 5F4XA 3NL2A 4FX7A 5F4WA 4JICA 2Y85A 2OT1A 5H2ZA 4IXXA 3WK0A 1O95A 2XN0A 4Q33A 2X1UA 3C2VA 2A6NA 4LVFA 4UNLA 2ZQ0A 4OWGA 1OFQA 4HNUA 2ZDRA 1M5WA 3WK1A 2O7QA 2YW4A 2W0UA 3P60A 3BG9A 2VFFA 4NXSA 4JN6A 5F1VA 1YPFA 1F05A 3B04A 4QNEA 2JKPA 5DY3A 4X3ZA 3N2MA 3RF9A 2QEZA 3TROA 2ZZ6A 3WK2A 4CCEA 4M6QA 4I7UA 4EIVA 3M7WA 4YCPA 3BW4A 2J6XA 1HO4A 1FCUA 3I7QA 3GXNA 3RU6A 4BI7A 1IXNA 2EKCA 4YWIA 2DZPA 2DZSA 3HGRA 2AQWA 5HNRA 4BI5A 3K30A 2CZEA 2JKEA 1EA0A 2HSAA 1OYBA 1J2WA 1Z44A 3UD6A 5I3FA 5EL1A 5D2TA 2ZRUA 5AYXA 2NV2A 3DFTA 3MI2A 4N4PA 1JQXA 4OV4A 3NPVA 4JYEA 3GVGA 3NQAA 3PULA 4O10A 1XBVA 2GQ9A 1XCFA 5U7SA 3P61A 5CPOA 3L67A 1XFBA 3ANYA 2Z6IA 1X7FA 1EEPA 3TKFA 3RLUA 1SU5A 3QSTA 3W1TA 3WFAA 4DO6A 1PE1A 3V75A 4UTUA 4E2DA 1CW2A 1SO4A 4WOZA 1VRDA 1ONRA 1DJNA 3O16A 3QPYA 3W7RA 3NPWA 4YXGA 1GEQA 4MYAA 3G1VA 2NZLA 3RNDA 3T44A 3GIYA 1SSDA 1AL7A 3CIWA 4OBTA 3W23A 5LHEA 3FA5A 4GUJA 4X2RA 5KZEA 2BTMA 4BWLC 5IBXA 1QO5A 3LCWA 4CNOA 1KBJA 2H8ZA 1H1ZA 1F6PA 1KA9F 4LS0A 3UPBA 5FEWA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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