3MHFA

Tagatose-1,6-bisphosphate aldolase from streptococcus pyogenes
Total Genus 126

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
322
structure length
322
Chain Sequence
TLTENKRKSMEKLSVDGVISALAFDQRGALKRMMAQHQTKEPTVEQIEELKSLVSEELTPFASSILLDPEYGLPASRVRSEEAGLLLAYEKTGYDATTTSRLPDCLDVWSAKRIKEAGAEAVKFLLYYDIDGDQDVNEQKKAYIERIGSECRAEDIPFYLEILTYDEKIADNASPEFAKVKAHKVNEAMKVFSKERFGVDVLKVEVPVNMKFVEGFADGEVLFTKEEAAQAFRDQEASTDLPYIYLSAGVSAKLFQDTLVFAAESGAKFNGVLCGRATWAGSVKVYIEEGPQAAREWLRTEGFKNIDELNKVLDKTASPWTE
5010015020025030030025020015010050
020406080100120Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
3H1 (61-63)AH1 (6-15)TIV1 (16-19)TI'1 (17-20)3H4 (278-280)S1 (21-25)AH3 (46-60)S4 (123-130)AH2 (30-38)AH10 (281-291)S2 (66-69)AH11 (293-317)TI2 (82-85)AH6 (136-156)S3 (86-90)S5 (160-166)TI3 (97-100)EMPTYTI4 (108-111)AH5 (113-119)AH7 (177-195)TI5 (131-134)S6 (203-206)S7 (245-247)AH8 (227-239)3H3 (212-214)TIV4 (219-222)AH9 (254-267)S8 (273-276)O1 (322-324)AH4 (74-80)TIV2 (70-73)TI6 (168-171)TI7 (173-176)3H2 (197-199)TII1 (215-218)TIV5 (249-252)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Lyase
source organism Streptococcus pyogenes serotype m1
publication title Structure of a class I tagatose-1,6-bisphosphate aldolase: investigation into an apparent loss of stereospecificity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tagatose 1,6-diphosphate aldolase 2
total genus 126
structure length 322
sequence length 322
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.40: Tagatose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2010-04-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01791 DeoC DeoC/LacD family aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3mhfA00
2J88A 3IIOA 1ZENA 3E49A 3KVJA 2CZ5A 4TO8A 1OFRA 4J9JA 2EGZA 3HG4A 4JY8A 1XI3A 4K38A 4QAIA 2YFNA 5AYXA 4PEKA 3EXRA 3Q37A 4FB7A 3LERA 2V81A 3C2OA 4O13A 1XBYA 2B7PA 2ZZ1A 2YFOA 1ADOA 3TW7A 3P5ZA 1TTPA 3PUOA 3LOTA 4QJ1A 2JBMA 2PCQA 2ZFAA 2AAMA 4KFPA 2A21A 1HO4A 2R91A 5DELA 4S2CA 1QAPA 1T0OA 1N55A 4UFJA 3TQKA 1R47A 2YCEA 5CZ0A 5K4ZA 1Q6RA 3OA3A 5DY3A 3LCFA 1DJQA 1JCLA 2Y89A 4N6EA 4S2BA 3HBLA 1O60A 1NAL1 4A29A 3L5AA 3LXCA 5AHIA 1NSJA 3CTLA 2E5CA 2ZCGA 7TIMA 2P10A 2ZZ4A 3GK0A 5C54A 4M7TA 4E2BA 4JYFA 2QCDB 4YCPA 2RDWA 2FB3A 1LORA 3O63A 4EIVA 4JTUA 1GTHA 4TMBA 1JQXA 1K03A 4RCXA 1PIIA 3O6DA 1W8SA 2VFFA 2O7SA 4MUZA 2V2CA 3A23A 4OHQA 2FTPA 2GJLA 1L6WA 3EX4A 1KTBA 2LLEA 1XBVA 1K3UA 5I3KA 4A3UA 4TIMA 5F2LA 4O15A 4NXSA 4Z08A 3PBVA 2KZHA 3DENA 1P5BA 1H60A 3PB0A 2X16A 3DI1A 3PAJA 4L4MA 2R94A 5FF2A 1J2WA 2BTMA 3N34A 3DFQA 2E77A 3SJ3A 1W3NA 3PY2A 1H7NA 4UNKA 3NAVA 2HS6A 1KM3A 5D2WA 4G1KA 1ICQA 1WBHA 4IMGA 4JR5A 3L68A 3NGJA 4UR8A 2ZQ0A 4JXCA 4E2DA 1MSSA 3W7KA 2ZDRA 1SR9A 3CLMA 2C6QA 1BWKA 3MI6A 1W56A 2ZZ6A 4MJZA 1TV5A 4WUIA 4AAJA 4UTHA 1LOLA 5HJLA 1CW2A 2ZBTA 1GWJA 5K4XA 1TPB1 4IUOA 5D05A 3FOKA 4ADSA 3DFSA 1BKSA 1OABA 4N6FA 1FCVA 3W86A 1XUZA 5KINA 2FJKA 1OVDA 1SZGA 4UNLA 4I7UA 1VC4A 3QQ0A 1FWWA 4PL1A 2JKPA 1GG1A 3W1LA 4QIUA 3S1UA 5D33A 3OVPA 4KFOA 1HTIA 3W7HA 3GLCA 3QW4B 4ZMGA 1OFEA 3G18A 4DF2A 4A22A 1K8ZA 1OFPA 5KTLA 1QO5A 2R8WA 4UMCA 2FIQA 5LNUA 1DJNA 3W1TA 3W1AA 3C0JA 2OX1A 4O14A 5D04C 4U28A 1EWDA 1LP6A 2QJIA 3EXTA 3UNDA 4NXKA 4Q32A 1TPUA 4TU1A 1TTQA 3W88A 2GJNA 1XM3A 1LRNA 3P60A 3OHIA 1O94A 3EWYA 1BTMA 3HGRA 4AB4A 1OK6A 2BX7A 4UMBA 1V5XA 1L9WA 5HUOA 1H7XA 2YDAA 5K2ZA 3ABSA 2WPBA 3LCXA 5J5RA 4FX6M 4B5NA 2NV1A 4Y9AA 1H7PA 1FWRA 2EHHA 3GIYA 5C6MA 4ZQRA 1JUBA 2CW6A 1KLZA 2J24A 4LTSA 3WJWA 1TYGA 4H6KA 3LV5A 2VFIA 3G1SA 3NEVA 4NUWA 3CEUA 2C13A 4FNRA 3WK1A 4PODA 3P84A 5EBUA 3MI2A 3OVRA 2VELA 4KKXA 2ZTKA 2QCDA 3IGXA 2TPSA 4BWLC 5H91A 3ELFA 2DZWA 2EPHA 3P82A 3MBFA 2GVJA 1ICPA 1WA3A 3IVSA 2CZDA 2CZEA 3UWVA 1EPXA 3DBPA 2QEZA 1YTDA 3KRUA 4UTMA 4POCA 3K30A 5D2TA 4UTKA 4O53A 3IGSA 2C3ZA 3I68A 2Y7GA 4IQLA 3C3NA 3G1XA 2H8ZA 4GXMA 1SZFA 3KX6A 2X1UA 4GUHA 3N2XA 2NUYA 3CU2A 1NEYA 1PL9A 3O07A 4JX6A 4A2RA 1X7FA 1ME7A 1X1ZA 3HO8A 1TTJA 1A5BA 3W7JA 2OMAA 3W71A 1JCJA 5FF4A 5LNWA 2GQ9A 1EX5A 5D2YA 4MJMA 4JGDA 3LCIA 2QKFA 3GAKA 1R2RA 3ZS4A 1GVSA 2ABAA 3KVLA 3Q94A 4GRSA 2E6AA 2Z1BA 3UXAA 4XZ9A 3QH2A 3SFKA 1UB3A 3G0XA 4NJKA 1GJPA 3M43A 2BXVA 3A22A 3BG9A 4AMAA 3I7SA 4ADUA 4RR4A 4CQAA 4MFEA 1IXPA 4IMEA 3LCLA 3QC3A 4JN6A 4EF9A 3UXDA 2ISSA 3UWUA 2OJPA 3S8HA 5D2VA 1YXDA 3NOEA 5CGQA 3B0VC 3P5YA 2ZZ2A 3QJAA 5FEZA 3DFTA 3LHYA 2V2HA 5KMYA 2I9EA 3W75A 4IMDA 3P8IA 3TC7A 1OYCA 3TAKA 5AHFA 1NF7A 1XC4A 3ABOA 4O10A 3UY7A 2NX3A 1OFOA 3D0CA 3EWUA 2YW4A 5BMWA 4JTTA 2V8ZA 1KFKA 3PM6A 4Y90A 4I7VA 5G1YA 1VHNA 2RH9A 3W7MA 1W5NA 4BI5A 3P81A 4Z1BA 3O06A 1OG0A 4BF9A 4JTEA 4AF0A 3ANYA 3UWZA 3CC1A 2DZXA 2JKEA 3C52A 5FI8A 4JTLA 1HFBA 4OU1A 3YPIA 1UBSA 1GVQA 3MW7A 4OBTA 4LS2A 1GEQA 3N9RA 4WY0F 4IPJA 1DL3A 5C55A 4FXSA 1GT8A 3GB6A 2DZSA 1BEUA 4LUJA 4FIRA 1I4NA 3IIZA 3DFOA 4XKYB 1PCKA 1M6JA 5CPNA 2WNNA 1H1ZA 1VGAA 2GPTA 2ZYFA 3STCA 2BLEA 1GOXA 1D3GA 3LXBA 1AMKA 2C19A 1GTEA 4ZQPA 4MYAA 1ME8A 1QR7A 4PH6A 1FDJA 2J9XA 3N3MA 1I2RA 3DZ1A 3LHWA 3U8GA 1THFD 2ZRWA 5BMXA 3G8EA 1ZAHA 3LDVA 2RFGA 3N19B 2HS8A 1H61A 1OK4A 3QYQA 1JRBA 2Q3OA 3AJXA 1FQ0A 3DKJA 1VCFA 4MFDA 3FJ6A 2JK2A 4K7YA 2GOUA 4O12A 5F4SA 3M5ZA 3GX9A 3H54A 5F2GA 2TMDA 4CCCA 3MJYA 1TQJA 3KRZA 1B4EA 2Q8LA 1R2TA 3HGSA 5CSRA 5HNRA 1DBTA 3EB2A 3GXTA 1XL9A 1TB3A 2QDHA 5LNVA 1XDLA 3OVQA 1SW3A 3SIZA 3M5VA 3MUXA 5LSMA 4CNOA 1TPFA 2G95A 3P61A 2DZVA 4RX0A 2X1RA 5FEXA 4ICNA 1YXYA 4Z0JA 5DN1A 4ZQMA 1GPWA 3NNTA 3R13A 4GWEA 4WY0B 5TBOA 3T7VA 2BWGA 3DU0A 3TU9A 1MZHA 1TV7A 1F73A 3LLDA 4O17A 4FNQA 4JYEA 3ATYA 3EEGA 4O11A 4KFNA 3BLIA 4NJIA 4HNVA 3L0KA 4UMAA 3M7WA 1QPNA 1XCFA 4FHAA 5K9XA 4N9DA 1XFBA 2CLFA 5KITA 4LC8A 5I3IA 1G4PA 3CIXA 4Q33A 1TRIA 3WJZA 4ONVA 2W0UA 2ZTJA 3R2GA 3NQAA 4NNCA 1KA9F 1RPXA 3W87A 5AHEA 3GDMA 3KAOA 2XN1A 1Q45A 3LI0A 4FXRA 3GKFA 2V5LA 3WK0A 4FNTA 3H55A 1TPDA 3TA6A 1BWLA 2DZUA 3KRSA 4UTIA 3TH6A 2PRLA 4PA8A 3NM3A 4AWSA 3C4UA 1GQNA 1I2NA 1V7YA 3W1RA 1IXQA 3W6YA 1A53A 4Z1CA 4PC8A 3C6CA 1U5JA 1L2UA 3TROA 4BI7A 3RF9A 1FUYA 4HT3A 1UASA 2QUVA 3BW4A 1M5WA 3G24A 3JRKA 2NUXA 2Q3RA 3DI0A 3I65A 4YXGA 1WDWA 1PV8A 1TREA 1G69A 4WOQA 2GVGA 4LWWA 3ZR4A 1F6PA 4CCDA 5FEWA 1P4CA 3M0ZA 3E02A 2CLKA 5CZJA 2TRSA 4IMFA 3LTSA 3UWQA 5D09A 3WK2A 2TYSA 3NQCA 3DFNA 4RKAA 3GXPA 1DVJA 3IEBA 5K9DA 2RKXA 3W74A 3UZ5A 3WJXA 1MO0A 2QCGA 2Y63A 3G1VA 2JKAA 5EYWA 4LW7A 3EX6A 1KM6A 1R46A 8TIMA 1J4EA 3G22A 1TIMA 3NQGA 4FNSA 4LC6A 5FF7A 5DCDA 3LHVA 5TQLA 1YADA 1AG1O 1EWEA 2FFCA 4K7VA 3MP4A 4HSOA 5DBUA 3MBDA 3NPVA 2A0NA 2QUTA 1QFEA 4OQVA 3W7CA 1VZWA 1FWSA 3UZJA 3TE9A 1YTKA 4DO5A 2Z6JA 3LBCA 1DQWA 5FF3A 4WY0A 1MEWA 2Y70A 4DPQA 4JIQA 1VLWA 2Q8ZA 4PCFA 1TJRA 3BG5A 5BRBA 3TAOA 5FEPA 3NG3A 3UY8A 2B0MA 1A5AA 3O6YX 2YGYA 4JEQA 1QOPA 3PVFA 1NFBA 4JDBA 4MLRA 1MEIA 1TRDA 4K8EA 1PE1A 4H3DA 3LHTA 5BW6A 5H2ZA 2D73A 1GVOA 3HOJA 2RDTA 3GVGA 4MY9A 5EA9A 1LLZA 4ZZ9A 3OBKA 3PR2A 4UC5A 1TQXA 3TV8A 1G4TA 2RHGA 1JJKA 1A50A 3T44A 5E93A 1OX4B 3QSRA 4EWND 3LV6A 1QPQA 4ZQNA 3GDRA 2NX9A 3THAA 1O5KA 2PC4A 1J5TA 3CEPA 1FXPA 3DKLA 1W5QA 1O4UA 3W1QA 3G1AA 1SSGA 5LHEA 4O50A 1QWGA 4JTHA 2ISVA 3E96A 2CLOA 2J27A 2QF7A 1X8FA 3HQ1A 3L67A 1H7WA 3L5LA 3INPA 2VXNA 4BFAA 1KTNA 1KV8A 5CG7A 2H8XA 1YYAA 5HQEA 1X6UA 5K3VA 1QDSA 4DO6A 2XN2A 2EKCA 1PCWA 3BLFA 5F2MA 1CX9A 4OV4A 1JCMP 1VYSX 2B7OA 1PHQA 3PBUA 3VE9A 2WNZA 2FPYA 3GDLA 3N9SA 4AWUA 2FDSA 2QCLA 4LOCA 3IIXA 3P8JA 1QCWA 2E09A 1PHWA 3CWNA 5LGXA 3BW2A 2Y7EA 1EA0A 4Q4KA 5KZMA 3PF3A 4PL2A 3SECA 5HWJA 2YSWA 2V0TA 2B4GA 2NXHA 4A21A 2V82A 3W2NA 3TDFA 5E0KA 2E68A 3O05A 2VFHA 3FLUA 4E0CA 1AW1A 3TC6A 3IGUA 4LNYA 2ISWA 1IXNA 3MHGA 1SSDA 4NU7A 1VYRA 5CZSA 4WD0A 5CPOA 3T78A 1QNVA 1LBMA 2QJHA 3LCHA 3U2OA 4RZ4A 3W7EA 1EP1A 2A85A 2XFWA 3LTYA 5DXXA 5IBXA 3S5OA 3W7LA 4JTFA 2H90A 3G1HA 3TCEA 2WKJA 4N4PA 2AQWA 4UTTA 3V75A 1L6SA 1SUXA 4ORIA 3PBYA 4NJHA 3C56A 3TQ0A 2QAFA 1OX6A 3EKLA 3EWWA 4UTUA 3W2KA 1W5MA 5K9CA 2QCEA 3BV4A 3CHVA 2C0AA 4JD4A 4K37A 2ZZ3A 4N2YA 1DKWA 5I3FA 5TIMA 3QRHA 1LTDA 1K02A 1WOBA 1B9BA 4HSNA 4IX2A 4LVGA 4XBKA 1YDNA 4UR7A 3LXAA 3O8AA 1LRQA 5T26A 3G8RA 3C2EA 1DOSA 2A1YA 3C61A 4UCGA 4IGHA 5HMSA 2X1TA 4MY8A 3T4CA 3LGEA 1FWTA 3NQDA 5G5IA 4LS1A 3M6YA 4LVBA 1SFLA 1OX4A 3EKZA 4UFKA 2QCMA 2XN0A 4X9SA 1EUAA 5K7JA 1HL2A 2Y7DA 5G4WA 1AW5A 3N73A 5DY2A 3NL2A 3HPXA 4AH7A 3AO0A 3HGJA 3B8DA 1IXOA 1RR2A 4NJJA 3DGRA 2VC6A 4NT0A 5HWMA 1W5OA 1W37A 3F4WA 4GNJA 5EY5A 4Y8FA 1ONRA 2YPIA 2V2DA 1K8YA 1KFCA 2G96A 3NQ8A 5KZEA 3ZFHA 3NO5A 1FXQA 2NLIA 3NL6A 4FNPA 4NQ1A 5D32A 1FWNA 3NA8A 5L9FA 2WSYA 4LVAA 2ZRVA 3G0UA 4JS3A 1Y0EA 1Z42A 1FDZA 3OEXA 3TJXA 3WJSA 5KSWA 1B4KA 2B7QA 3W1XA 5AC7A 4C1KA 1ME9A 3IRDA 2I1OA 3PG8A 3HG2A 3FFSA 1QMLA 2QCNA 3PUDA 2DU2A 4LVFA 4GUGA 1YTEA 3LBMA 4NJGA 2ZA2A 1VLIA 1SW7A 4JYDA 4JDYA 4UFHA 3QM3A 4NNBA 1C29A 3SR7A 3SI9A 1H1YA 1D3HA 3QFEA 4JX4A 1UUMA 4MY1A 3SW6A 4GJ1A 4ZQOA 2ZA3A 3LRMA 4AHOA 5G4EA 4XBSA 2Y88A 4TR9A 2A6NA 3WFAA 4QITA 3NXFA 2DZTA 1XUUA 4N9CA 1A5CA 1XXXA 2O7QA 2R14A 5EPDA 3RMJA 1OFAA 3BPWA 1VPXA 3RNDA 3W1MA 4JIPA 2P1FA 3ATZA 3EWZA 5LKYA 1RZMA 4I9AA 1VHCA 5F2IA 3W1PA 2C16A 4O16A 1FBAA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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