3MHGA

Dihydroxyacetone phosphate carbanion intermediate in tagatose-1,6-bisphosphate aldolase from streptococcus pyogenes
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
323
structure length
323
Chain Sequence
TLTENKRKSMEKLSVDGVISALAFDQRGALKRMMAQHQTKEPTVEQIEELKSLVSEELTPFASSILLDPEYGLPASRVRSEEAGLLLAYEKTGYDATTTSRLPDCLDVWSAKRIKEAGAEAVKFLLYYDIDGDQDVNEQKKAYIERIGSECRAEDIPFYLEILTYDEKIADNASPEFAKVKAHKVNEAMKVFSKERFGVDVLKVEVPVNMKFVEGFADGEVLFTKEEAAQAFRDQEASTDLPYIYLSAGVSAKLFQDTLVFAAESGAKFNGVLCGRATWAGSVKVYIEEGPQAAREWLRTEGFKNIDELNKVLDKTASPWTEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of a class I tagatose-1,6-bisphosphate aldolase: investigation into an apparent loss of stereospecificity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tagatose 1,6-diphosphate aldolase 2
molecule tags Lyase
source organism Streptococcus pyogenes serotype m1
total genus 127
structure length 323
sequence length 323
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.40: Tagatose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2010-04-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01791 DeoC DeoC/LacD family aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3mhgA00
3GXNA 1ZAIA 3G1VA 4R33A 3QRHA 4S1FA 1PCKA 4BWLA 1OX5A 3BG9A 1N55A 2QAPA 6TIMA 3W75A 3QFEA 1UB3A 2Y63A 1TPDA 5EKYA 5LNSA 5C2XA 4Y9AA 5MHBA 1FQ0A 1GVRA 4M6QA 2ZA2A 3C0JA 5DY3A 4N9BA 3B04A 2Y70A 1SUXA 1W3TA 3PBYA 3RK8A 3W7NA 1GVFA 4DELA 2FFCA 5C54A 4LRSA 3DI0A 2GQAA 3UPWA 4ORIA 3HG4A 3L68A 3QQ0A 3W1PA 3T44A 1YTDA 3UD6A 4J9JA 1JCMP 2ABAA 1G4TA 4O1BA 4LS1A 1EPXA 3DAQA 4GC4A 1OFEA 1DV7A 2VFIA 2FDSA 5F2GA 3ATZA 3DGRA 1WOAA 3N2XA 1H1YA 3INPA 5F2LA 1GPWA 1PE1A 1TRIA 4Q33A 4CCEA 4JTSA 2JBMA 4AAJA 2R8WA 3NPVA 1LBMA 3KX6A 1GWJA 5C5YA 1LRNA 4K7VA 4AHOA 1N7KA 3QMRA 1QWGA 4JR5A 1J2WA 1DBTA 3S5NA 3EEGA 5FI8A 4PC8A 4ZQMA 4HPJA 3W71A 4IQLA 3BK0A 4DO5A 2NWRA 4PCFA 4PTNA 4PL2A 2Q8ZA 3P8IA 3S0CA 1HO4A 3L5AA 3THAA 2XFWA 4HNVA 3GR7A 2CLFA 1A5SA 1QO2A 3GNNA 4KFOA 1GTEA 4JDYA 3S9YA 1AMKA 4L4LA 1O95A 2V2CA 3DKJA 2TRSA 4EVZA 2NV1A 3DXIA 5AYXA 3E0IA 4NXKA 3N9RA 4KFPA 1F6KA 2I1OA 5LGXA 4OV9A 1P1XA 3NEVA 3EXRA 1Q6LA 5E93A 1ZAHA 3NG3A 3F03K 4RV8A 2P0OA 3G8RA 1OK4A 3HGSA 1OYBA 1TIMA 1W3IA 4PODA 2NUWA 1H62A 1RQHA 1LOLA 1MEWA 3P84A 2CZDA 5G4WA 3GXPA 3LI1A 3LHVA 3HG3A 1O4UA 3N3MA 3S42A 1PHWA 1LLZA 5G2WA 4JTHA 1XXXA 3IGUA 3LRLA 3FIGA 4QM1A 4DXVA 4GUIA 2QDGA 4UTKA 3L5MA 1OYAA 2GJNA 3VE9A 5LHFA 3M43A 4GWEA 3C2FA 1ALDA 5AC8A 2EF9A 3MMTA 1SR9A 4FB7A 3NL6A 3GDKA 3TE9A 5E0KA 2C18A 3KFTA 3NQ2A 2JKEA 4U4MA 1H63A 4ZVJA 1P0NA 3P7YA 4NZFA 2A4AA 4QJ1A 2NWSA 3G3MA 1OABA 4GXMA 3DH7A 2YXGA 3M0ZA 4CCCA 3N73A 2E09A 3HJZA 1QOQA 2GJLA 3CTLA 1DHPA 2ABBA 5G2HA 3O07A 4LV4A 3TNOA 3NO5A 3GIYA 4MY1A 3G8EA 5D2WA 5DLCA 3KVLA 4TX9A 2WV8A 1H51A 2H90A 3BG5A 3HBLA 3LCHA 2DJXA 3W1XA 4DF0A 3LTPA 3M6YA 3SECA 3LHZA 2Y88A 4POCA 4UFJA 4GRSA 3M5ZA 1XKYA 4M5PA 5CPOA 4CNPA 2G95A 1NAL1 3LI0A 2O7SA 1LZOA 5I3FA 4JTLA 2ZZ3A 4LV9A 2CLEA 1AW2A 2GVJA 4AXKA 4OQVA 1VQTA 4ALDA 1AG1O 1NVMA 3EX4A 3W2NA 1WX0A 1VPXA 1PVNA 4PEKA 1Q3NA 1H61A 3IIZA 5I3HA 1G4EA 5F1VA 3S1WA 3K30A 4HN4A 4GUFA 2QCEA 1T99A 3LCWA 4M19A 1BEUA 1SW0A 2QUTA 1XCFA 3MUXA 3NM1A 1DJNA 1GEQA 3Q2DA 1NSJA 4WJEA 2E68A 4N6FA 2H3DA 3PB2A 5H91A 2YGYA 4R7JA 2CFFA 3ZFHA 2X2GA 4OWGA 3WJWA 1K8ZA 2A0NA 1GJPA 1TO3A 2NUYA 3NPWA 3SW6A 4DF1A 1W1ZA 3VCRA 2CLHA 3W1MA 2GUUA 2QDHA 1YYAA 3HMJG 3A21A 1Q6RA 3FJ6A 4QITA 4M7TA 4S2CA 5AHIA 3SGZA 3ANYA 3L0NA 1K3UA 5FF7A 1UJPA 4I7WA 1GTHA 1H7OA 5D03A 4K8HA 4JS3A 1LLWA 1TPWA 5CPNA 1DQWA 5KSWA 2RKXA 1LOSA 4MZYA 1OF8A 1TCDA 4G1KA 3S5YA 1HFBA 4YLWA 1HL2A 3EWBX 1R46A 2Y7FA 3LTYA 3P62A 3CT7A 4WD0A 3HGRA 4JTEA 3G0XA 1QCWA 1XBZA 4UTWA 1W5PA 3GK0A 1WAUA 2JK2A 2KZHA 4XUGA 3ZWTA 1KFKA 1ZY9A 4UFIA 3FOKA 2G97A 1OFPA 3W70A 2F84A 4YL2A 3H53A 2C3ZA 3LHWA 3LHTA 4MFEA 4RZ6A 2HMCA 4FNQA 4UTTA 1OFOA 3M5VA 1NF7A 4MOZA 4GFSA 4Q32A 3WJZA 4ZMGA 1SZEA 1QFEA 3M5YA 1VRDA 5AC6A 2EHHA 4UTHA 5CG7A 1FCUA 1KFEA 2NXGA 5D32A 1IXQA 1JUBA 4KFNA 4N4PA 5DN1A 1WBJA 2VEKA 1A5AA 4NXSA 4IGHA 3G1AA 1B3OA 2QCDB 4LVGA 5F2MA 1J4EA 3TFXA 1VCVA 4Z1CA 4MVAA 4EIVA 2TYSA 4JX4A 3R13A 1WQ5A 4AH7A 4PFMA 1LOQA 2YDAA 3OVRA 3MWAA 2VC6A 1SO3A 2QCMA 1LM1A 3G1FA 3G22A 3A24A 3MYOA 3QW4B 4MUZA 3W2UA 4WUIA 1DL3A 3VNDA 3FYPA 4O0ZA 1DKWA 1LP6A 3KAOA 4MKNA 4JN6A 3LBCA 3OIXA 3EWUA 1A5CA 2C15A 3LGEA 4LOCA 1XFBA 2AAMA 1K7FA 2G5WA 3W7PA 2QEZA 3EX3A 1Z41A 3WK2A 1EA0A 1VH7A 1OK6A 2WOQA 3UWVA 5L9FA 2VFDA 1UUOA 4UFHA 1KBIA 3O63A 4UXDA 4W9TA 5C6MA 5D2TA 4UIOA 3W9ZA 4MJMA 1RD5A 3M41A 1YXDA 1FWTA 1TPH1 5E1QA 5FEPA 4GNJA 2X16A 2Z1BA 1Q6OA 2QJIA 3R8RA 4OBTA 3QC3A 3V1PA 3BW2A 4NUWA 1OX4A 1VYPX 4PA8A 1OYCA 1EEPA 2C0AA 3RLUA 3Q94A 4AWSA 3O6DA 4JTUA 4FNSA 4OHQA 5LNWA 5DCBA 3P60A 2NUXA 3LBMA 1W3NA 2ZA3A 1FWRA 4MZ1A 1QNVA 4I7VA 3S5OA 2J88A 3PUEA 3L65A 5LHEA 4TU1A 1VYRA 1VJIA 3LLDA 4O1CA 8TIMA 4Z1DA 3I6RA 2WNQA 3N19B 3ABRA 1S5VA 1XDLA 4O4WA 3HGJA 1IXNA 1FXQA 2RDUA 3CIXA 1LCOA 1HG3A 2BXVA 4LY8A 1XM3A 4QIUA 1G67A 3TQVA 1SO4A 3C61A 1Z44A 3CIWA 5FEWA 3RNDA 1TTPA 3A5VA 3HB9A 4UR7A 1VCGA 2FTPA 1DVJA 4NNAA 3CM4A 1IXOA 4KKXA 4UMAA 1U83A 1WBHA 4JTTA 3FKKA 2C6QA 2JKPA 3TDFA 2WQPA 1QOPA 1TPEA 4E0CA 4P2VA 2NX1A 1K7EA 1QDSA 4D2JA 4UTTC 4E2BA 1RPXA 2FLIA 3MP4A 4EOUA 4H6KA 3W7HA 3CC1A 2J24A 5AHFA 4WY0B 3WJXA 1OG0A 2DZTA 1JCNA 1QR7A 3T4CA 2VFHA 1EUAA 1TPUA 5KZMA 4GE8A 1YDVA 1W5NA 2J9XA 4WXZA 2OCZA 3OVPA 1R2RA 2CLLA 4K37A 1KTCA 1AW1A 1VLWA 3U2OA 3EWYA 3M5XA 2VFEA 3ZWSA 4K36A 1VHCA 3U6WA 3PUDA 3BGGA 3O05A 4OE7A 1T8XA 4ORMA 5DXYA 3NQ8A 4RXFA 4XTIA 3TCEA 1YXCA 5LNRA 3VFLA 1H1ZA 2ISWA 1O5XA 1I2QA 3UY8A 4MLRA 3TW7A 2BZNA 1UASA 4ZL1A 1TTIA 3TA6A 2EGZA 3CLMA 5CKSA 5U4NA 3W84A 3NQVA 3W86A 1A53A 1HO1A 2CU0A 1SZGA 1GYLA 1D3GA 2V2DA 1BWLA 3BPWA 2X1UA 1FDYA 1KW1A 2B7OA 3B0PA 4ML9A 4X22A 3KHJA 2ISSA 3P67A 3KRSA 5L6UA 3G24A 2IQTA 3BGJA 3W7LA 2DZWA 4FIQA 1B4EA 2VENA 1YPIA 1YXYA 1C29A 4WQ6A 5G1TA 3PR2A 4AF0A 4ZQOA 4LRTA 4MLJA 5CZSA 5BMXA 2DZSA 3QEZA 1H50A 3SR7A 2EKCA 4UC5A 2W6RA 5FEXA 1BWKA 2OX1A 2E5DA 3L9CA 2XN2A 2DZVA 3O8AA 3LRKA 1JQXA 3PULA 4Y6GA 1WA3A 5HWMA 1ZJIA 3EB2A 3S8HA 1ME9A 1JUKA 2FQIA 3TIMA 2CZEA 4LW7A 4DBEA 2QCGA 2Y6ZA 3MP3A 2FPTA 1N8FA 4XKYB 1OFBA 2HSAA 3FFSA 4HSNA 1VGAA 1D3HA 1VCFA 1W5MA 2H8XA 4ONVA 3EWXA 4MFDA 5AFDA 3LLFA 4DEFA 1KFCA 1Q45A 4A29A 2GQ8A 2BTMA 4AEOA 3FEMA 4EF9A 1C8VA 1F73A 4MYXA 2QR6A 1LBFA 2RDTA 3WJSA 4GBUA 1F7BA 3IIOA 5HWJA 1VS1A 5FESA 4GJ1A 1XBXA 3TV8A 3GLCA 2XN0A 1J5TA 2EAWA 1EWDA 3PM6A 1FDZA 3FYOA 1I2OA 2ZZ5A 3LM7A 5F1UA 5A5WA 2PE4A 3P5ZA 2ZQ0A 3HGOA 1W8SA 1F76A 4C1KA 2PC4A 3QSTA 3B0UX 2X1RA 3NQ7A 3B0VC 2NX3A 4MPQA 5CSRA 3P61A 2ZRWA 1NEYA 3TMQA 3C56A 4O53A 4MY8A 3F4WA 1SZFA 2CW6A 3Q37A 3QSRA 1W5QA 4JYFA 1M7PA 4TIMA 4YCOA 1GVSA 4UTIA 1XI3A 2WJZA 3G1XA 2WPBA 1P4CA 5AHNA 5BMWA 3TSBA 3DFSA 2PRLA 3P8JA 1A5BA 3U8GA 1H60A 4WX2A 2B7QA 3AJXA 1WOBA 1ZENA 3BVJA 2QCNA 5K4XA 1I8JA 4LS0A 2E1DA 3NDOA 1GOXA 2ZYFA 3YPIA 3QQ1A 5HUPA 3W1QA 4TR9A 2V81A 4AWTA 1YPFA 1G7VA 1H7PA 4HNNA 4BFAA 1U5JA 5HR7A 4NJIA 3W1LA 1Z48A 1F2JA 3TFCA 5DY2A 1XL9A 4IJBA 2UV8G 2Y61A 4R34A 5F4WA 3W22A 3PAJA 4ADSA 1TV7A 3STEA 4IMGA 2Q3OA 3PVFA 3IV3A 2C14A 5G2IA 3LHUA 5DCDA 2V5LA 4XTDA 4AHQA 1W37A 4BWLC 3CEPA 5G5IA 4O54A 4WOZA 2NLIA 1VC4A 3DBPA 5CGQA 3WFAA 1IIHA 4QISA 3L5LA 1EB3A 3NGJA 3UWWA 1OFDA 2WKJA 3F1QA 3HG5A 2YZRA 2ZZ7A 3NQAA 1W0MA 1O5KA 2ZCGA 3C52A 1TPC1 3C3NA 5FEZA 3GKFA 4JTJA 1EP1A 4H3DA 5HINA 2TPSA 3TC7A 1OFRA 5K2ZA 3NR0A 1I45A 4XQ6A 3A22A 2V5BA 4FX8A 1OFQA 1VLIA 2OJPA 1THFD 1MZHA 1C9DA 3IVSA 4IMEA 1KV8A 4TO8A 4GUJA 2RHGA 3HF3A 1UUMA 4LC8A 3W2KA 3GR8A 1XUZA 4NJGA 3H55A 5TIMA 3F4NA 4B5NA 4O12A 3A9IA 1VHNA 1OX6A 3L0KA 1I2PA 2QUUA 3TQ0A 1G6CA 4O19A 1FBAA 4JTFA 3PSVA 2V9DA 4S2BA 4Z0JA 2C19A 4LT9A 4DO6A 3PSWA 3NM3A 4RCXA 1TB3A 1EUNA 1RV8A 3GXTA 4JIPA 4Q4KA 2E6YA 2DP3A 2I9EA 4NJKA 5KZEA 4BR1A 2PRHA 4CCDA 2Z6IA 1S3HA 4FXSA 3UWUA 1SW7A 6ALDA 1KM2A 3SI9A 5F2IA 2HTMA 2OT0A 3VI2A 3TAOA 3W7JA 1EIXA 1RVGA 1TSIA 4JXCA 1QO5A 3TU9A 1MO0A 3KVMA 1ZNNA 3G18A 4N02A 1Q6QA 4HPXA 4A22A 2FPYA 4IX2A 3PB0A 3C2EA 3USBA 4WOQA 3LCFA 3UY7A 3NPXA 1Y0EA 3GX9A 4MYAA 5I3IA 1KLZA 4Z1BA 3P81A 2GPTA 2WSRA 4LU0A 5A8GA 3T78A 3FLUA 2RH9A 3B4UA 3R5EA 3DKLA 3LTSA 4Z08A 3TSDA 7TIMA 2YPIA 3TK7A 3C4UA 1UCWA 2R94A 5KTLA 1EP2A 3L2IA 4O57A 1SU5A 1LYXA 4I9AA 5F4XA 4NJJA 5D05A 1WYIA 3BLIA 4GUHA 1UBSA 4C1LA 1QPRA 2X1SA 4RKAA 3W87A 1KFLA 4JTIA 1SSGA 3DU0A 5K3VA 4WZHA 4O17A 2YCEA 1TQXA 1SPQA 5AHLA 4UR8A 4A2SA 1V5XA 1DQXA 2E6FA 4O0KA 1ONRA 3IVTA 3W7RA 2VFFA 1OVDA 1QMLA 2A2IA 4CQAA 2V30A 3UXAA 3JS3A 1A50A 2J27A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3QPY A;  3I68 A;  4Y8F A;  1TMH A;  3KRZ A;  3LXB A;  1ICQ A;  3GKA A;  3NPU A;  3UWQ A;  3CQ0 A;  1P0K A;  3MI3 A;  2VEL A;  4N2Y A;  3OEX A;  3IRD A;  3W72 A;  3VE7 A;  1JJK A;  4O18 A;  1KFB A;  2WNZ A;  3HPX A;  3LV5 A;  3W1R A;  2FB3 A;  4JNM A;  2J9Z A;  3P80 A;  5FF3 A;  5K7J A;  1R2S A;  3EWZ A;  2PCQ A;  1TJP A;  1K8X A;  3E96 A;  4JIQ A;  4MZ8 A;  3O06 A;  4O10 A;  3BW4 A;  3UYC A;  2F7F A;  4UCG A;  3L66 A;  5CSS A;  4UNK A;  4O16 A;  1R30 A;  3LRM A;  3GDT A;  5IBX C;  5D09 A;  1I2R A;  3WJY A;  2YYU A;  1GVQ A;  3G1S A;  3WK0 A;  3HPS A;  4LWW A;  4JEQ A;  4O14 A;  1W54 A;  3I65 A;  1GG1 A;  3W7M A;  3QH2 A;  1B4K A;  3S1V A;  2EPH A;  2A7P A;  4E2D A;  3LCI A;  3TAK A;  3W7D A;  3CB8 A;  2JGY A;  4JGD A;  3IIV A;  4FF7 A;  3W73 A;  1JCX A;  2ZRV A;  4LVA A;  1L6Y A;  3NZR A;  1F05 A;  1TRD A;  4OU1 A;  1BTM A;  4Z0S A;  3NA8 A;  3SY5 A;  4HNT A;  3E02 A;  4ZQP A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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