3MI2A

Crystal structure of human orotidine-5'-monophosphate decarboxylase complexed with pyrazofurin monophosphate
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
257
structure length
256
Chain Sequence
KELSFGARAELPRIHPVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSLARELLQLADALGPSICMLKTHVDILNDFTLDVMKELITLAKHEFLIFEDRKFADIGNTVKKQYEGGIFKIASWADLVNAHVVPGSGVVKGLQEVGLPLHRGCLLIAEMSSTGSLATGDYTRAAVRMAEEHSEFVVGFISGSRVSMKPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKRGSDIIIVGRGIISAADRLEAAEMYRKAAWEAYLSRLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
publication title Structural determinants for the inhibitory ligands of orotidine-5'-monophosphate decarboxylase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Uridine 5'-monophosphate synthase
total genus 95
structure length 256
sequence length 257
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.10: Orotate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2010-04-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3mi2A00
3KRSA 4UTWC 1UASA 1FWTA 1B3OA 4ZMGA 2OCZA 4NVTA 4NXKA 2YCEA 4GFSA 4RLIA 3WJSA 1SW7A 5KZDA 3TK7A 3TROA 5D04C 4W9TA 2TRSA 1K7XA 5HR7A 4K8HA 3PAJA 2ZBTA 5D30A 2Y6ZA 4Y8FA 1K02A 5TBOA 1TPEA 1GVRA 1F6PA 4IXHA 3VE7A 4QJ1A 3FS2A 3M44A 4M6PA 2X1TA 3G8EA 4FHAA 5D09A 4FXRA 3EWUA 2J24A 3NGJA 5G1TA 2FIQA 5I3HA 4LT9A 2J9YA 1O5KA 3W1UA 1VCFA 1JULA 1R47A 1M5WA 1VRDA 3G1VA 3TQ0A 2QR6A 4ZZ9A 2QAFA 5F2IA 3GR8A 1I2NA 1W3IA 1DL3A 3N9RA 1ZAHA 2J9XA 4TR9A 1LCOA 2ZRZA 1AL7A 4S1FA 1LM1A 4MFEA 4MUZA 5LZLA 3W22A 3N19B 1FDZA 3W9ZA 2GVLA 3JS3A 4K6AA 3CPRA 5DCBA 3VFLA 1R30A 1KFLA 4JIQA 3C0JA 1SZGA 1RR2A 4O28A 3CIWA 5K4XA 1W37A 2A7NA 2E1DA 1HTIA 3W75A 2X1SA 1QFEA 2X16A 1RPXA 2DJLA 3CWNA 4HKPA 2WSRA 5DBUA 5DBTA 1TIMA 3A9IA 5HJLA 1KFEA 3A5FA 4JXCA 5D33A 1OFQA 3W7HA 1MEHA 4GE8A 1ZAJA 4MVAA 5CPLA 5KSWA 1S5TA 5CGQA 4EF9A 2ZA1A 5DLCA 2DJXA 5F4WA 1N8FA 4JDYA 2YFOA 1W3TA 4YL2A 3DI0A 1XBVA 1I2QA 4O19A 3M6YA 4U4MA 1YTEA 3GDTA 1OYAA 3KRZA 3N9SA 3B06A 5K2ZA 4UMBA 2DZUA 4Z1CA 2V2CA 3M0ZA 2BSLA 2ZQ0A 3PUEA 4O10A 5MHBA 1VJIA 2DZXA 4Z1BA 3LI0A 3LCFA 3NO5A 3DAQA 4IWWA 2ZZ6A 4HIBA 3W72A 1OX4A 4O12A 3STEA 4WZHA 1KM4A 3FLUA 5F4SA 1TQJA 5TQLA 4UTKA 5CZ0A 5D05A 1QR7A 4FNSA 4I7UA 1TJRA 3G1FA 3PWAA 2ISWA 3IGUA 3Q37A 1KTBA 4A2RA 3ZWSA 1YDNA 1LRTA 1TO3A 1LLZA 1W5OA 2Y61A 4P61A 3C56A 5I3KA 1THFD 1QWGA 2WQPA 3NQ7A 1QO5A 4AMAA 2WSQA 2V0TA 2X1RA 4UFJA 3LCGA 1MEWA 1SU5A 3MW7A 3M1ZA 3B8DA 2ZRUA 4EF8A 5AHFA 4XBKA 1F73A 2CFFA 2R14A 5C5YA 1A53A 1YADA 2OMAA 3INPA 4AEOA 3P8JA 4O13A 5T26A 1ALDA 3W1PA 3GYEA 3HG2A 3ABOA 1RV8A 4WOQA 2WV8A 3QZEA 4IPIA 4NJHA 3W1AA 3MI2A 4X22A 4JTGA 1O5XA 3DHDA 3M41A 3G1YA 3U6WA 4UNLA 1KV8A 3GB6A 4K8EA 3EKLA 3S1WA 2OZ0A 1G67A 3QPYA 1TTJA 4UTLA 3G3MA 3M7WA 2BXVA 4M5PA 1XKYA 3IRDA 2X30A 4JD4A 4RXGA 1TTPA 3CWOX 3NM3A 1RQBA 4AHQA 2E77A 5D02A 5AHLA 3NVTA 4XUGA 3D0CA 4FB7A 5AB3A 4TO8A 4DPQA 4UFMA 3O6DA 3WFAA 5U4NA 4RZ5A 1OFEA 2QAPA 3UZJA 5BMWA 4I7VA 1GOXA 2CU0A 1A5BA 5FEZA 3GR7A 4LVDA 5I3JA 2QUVA 3MMTA 1PCWA 3PVFA 5I3FA 1TPH1 2XN2A 5TIMA 4A21A 1FWSA 2YZRA 3M9YA 2Y63A 1N7KA 4LC8A 5CG7A 3NL5A 2QJIA 4NJIA 4QQ3A 4OT7A 3FJLA 2FPTA 3DU0A 3KVLA 1IGSA 3EX2A 2G5WA 3W7MA 3LV5A 3ANYA 4GNJA 1X6UA 3WJZA 5AYYA 1OK6A 3YPIA 1FDJA 4JR5A 2V30A 3W6YA 3WJXA 1DOSA 2J88A 1S5WA 1RZMA 1EX5A 2P0OA 2VFDA 3TXVA 1V7YA 5EKYA 3OG3A 4M7SA 3RU6A 1DBTA 4MY1A 3GAKA 2W6RA 4E0CA 3C2RA 5D03A 4ADSA 4J9JA 2E6FA 3THQA 3QF0A 3LRLA 3GXNA 5F4XA 3FA5A 3NL3A 4IUOA 1H5YA 2NUYA 4PC8A 5IBXC 2A6LA 3UWQA 1ZAIA 1LYXA 3RLVA 1AK5A 1FWNA 4QM1A 3W7KA 3LHUA 2VXNA 5C55A 3SY5A 2YSWA 4HNNA 4YCPA 1SSDA 3EWBX 3BARA 4IJBA 1NVMA 4O1CA 1VH7A 3R2GA 4ORMA 2Z1BA 4OGZA 3CEUA 2FQIA 3T55A 4DPPA 5LGXA 5HR6A 2YPIA 2GQ9A 1NEYA 3DH7A 3O05A 1FX6A 1K7EA 2V9DA 2GQ8A 2VOMA 1TMHA 1ME9A 1WAUA 4POCA 3W2LA 1O60A 3DI1A 4C1LA 2A0NA 1ME7A 2QKFA 4I9AA 1MXSA 4FIQA 3QQ1A 1H7NA 3HMJG 5AC7A 4CNNA 1OFAA 4XQ6A 2BTMA 1J2WA 1QOQA 4YCOA 5DXXA 4AWTA 1E51A 3HF3A 3N2XA 3HG5A 4BI7A 4OWGA 4FX8A 1LOLA 3KVMA 1H50A 2ABBA 4O53A 4AVFA 1LRQA 4XWUA 4N4QA 4UTTA 1GG0A 1PIIA 1YDVA 1I2RA 2WPBA 4WUIA 2O7QA 4WD0A 2EF9A 1ZJIA 1KFCA 1MZHA 3H53A 1JCNA 1W5PA 1XBXA 1XFBA 3STGA 1FDYA 1CX9A 2GUUA 2NXHA 5LGZA 3QSTA 3NOEA 4JX6A 4Y96A 3QH2A 3LBCA 1NAL1 3C3NA 1GVFA 4FO4A 2DZPA 4Q4KA 4PFMA 4UXDA 2H3BA 3E12A 1H51A 4K36A 4L4LA 1ZFJA 3G0XA 3A22A 2NX3A 5C2XA 3S5OA 4FNRA 1F2JA 1SO4A 4UTJA 1ME8A 1SR9A 3N34A 3N3MA 1QPOA 3TA6A 2UV8G 3SGZA 1L2UA 1OJXA 4LTSA 3QSRA 4GXMA 2P10A 2ZA2A 3OVRA 3WK2A 2PRHA 5E0KA 5EBUA 4QAIA 2QJGA 1AW5A 5FESA 1FXPA 3HPXA 4MFDA 4NNCA 2QCCA 3BO9A 3NQ2A 4Z1AA 5HQEA 3G1XA 3O06A 4TMBA 5D32A 3C4UA 3UZ5A 1EB3A 3PUDA 1LBFA 3WJWA 2BWGA 1MO0A 2XFWA 2ZDRA 5CPMA 2ZCGA 5A8GA 2FJKA 2VFFA 4UIOA 5FF4A 4TMCA 3CLMA 3GK0A 3TV8A 4N9DA 1EWEA 1LBMA 4ZQNA 1VS1A 1ONRA 3KAOA 4JYEA 3PBWA 3BW3A 5G2HA 3PUOA 3GNDA 1PE1A 3O15A 2CLEA 5CPNA 3W2NA 3VKJA 4ZQRA 4UTMA 2QCMA 4CLMA 1H7XA 3PS7A 1DKWA 3SR7A 4Y6GA 3WJYA 3F4NA 2YGYA 2BZNA 2X2GA 2V81A 5J5RA 3E02A 2ZYFA 3T40A 3O1NA 3TFCA 5D37A 3PG8A 4WY0F 2CLFA 3FEMA 5DY3A 3QFEA 1EWDA 1QNVA 1O94A 7TIMA 1F74A 1IF2A 2NX1A 1G7UA 4N4PA 1F7BA 3L0GA 4GWEA 2WJZA 2CZFA 3S1VA 3UY8A 2DORA 3TMLA 5FEXA 1JVNA 3P60A 4WXYA 2WKJA 2XN1A 5KMYA 4BWLC 4LS1A 5CZJA 1ZCOA 4AWSA 2QCDB 5AHIA 1JJKA 1TTQA 3NZRA 1W31A 2CW6A 3TAKA 4WX2A 5D2XA 3LRMA 1JCXA 3H55A 3V75A 2PURA 2VENA 4LOCA 2WNNA 2J9ZA 1XDMA 1OX5A 2PRMA 3FKRA 1LRNA 1RVGA 3DFQA 1H1YA 5EA9A 4JTTA 2YX0A 1IXPA 3HIJA 1Z42A 1SO6A 5HWJA 3W7JA 4EIVA 1WOBA 1OFDA 4BF9A 2R94A 4JYDA 3LLFA 3LOTA 4FX7A 4Q33A 3S42A 3GVGA 1BWLA 5AYXA 1G4TA 4IMEA 3WK1A 1EUNA 5D38A 4Z08A 2ZFAA 3R12A 1ICQA 2A7PA 3O6YX 1J5TA 1HUVA 2V82A 3VI2A 4HHPA 4AHOA 3MO7A 3TIMA 4E2BA 5AC6A 2VEIA 1I2OA 3DBPA 3EWYA 3PY2A 1UB3A 4YWIA 5K7JA 4JTJA 1LBLA 1GWJA 4N2YA 4R7JA 1X1OA 3G1AA 1SFJA 2VELA 3N14A 3LTYA 1OFOA 3W7RA 2RH9A 5FI8A 3UY7A 3P7YA 3UNDA 1VLWA 4DEFA 4DELA 1JUEA 5EMUA 4XBSA 1ICPA 3LCWA 3PSWA 2QJHA 3LHZA 3PF3A 2QDGA 2JBMA 1YXDA 1PS9A 1T8XA 2E5BA 2C3ZA 3OIXA 4PA8A 2QCLA 5EPDA 4JTUA 4X9SA 4NXSA 1Q6OA 4LUIA 4NJJA 1VYPX 4JNMA 2QCNA 3G0SA 2A6NA 2NZLA 4RCXA 2PRLA 3FYOA 3LCLA 5LHFA 1SZNA 3P67A 3DZ1A 1ADOA 5EY5A 2ZA3A 2YW3A 4UTUA 3R89A 3S6DA 3W88A 3HPZA 1DQWA 2AAMA 4O1AA 5LNVA 2CLKA 1N55A 3NQDA 5FF0A 1D3GA 1SZFA 3BLEA 1G4PA 3UWUA 1I8JA 3LM7A 4N02A 4O4VA 4E38A 4JICA 1LZOA 3NPUA 3L5MA 3NM1A 5FF7A 3L9CA 5BNKA 4EVZA 2ZRWA 4PL2A 4O17A 2Q3OA 3A5VA 3NA8A 3Q2DA 3E0IA 3R5EA 1C29A 4LNYA 1VCGA 1ZALA 2H8XA 4LV9A 3HG4A 1K8XA 1KFJA 4MZ1A 3DHFA 2OT0A 3VCRA 5CSSA 3NAVA 1XC4A 3FIGA 4AB4A 1L6YA 3TSDA 1VC4A 4A29A 3P62A 4O4WA 1B57A 2HMCA 2ISVA 3W2KA 4MOZA 4QNWA 5K9CA 4ZQOA 2NXGA 3IIOA 1KTCA 5LHEA 3RMJA 5LKYA 4O18A 2QCFA 3EX1A 2ZRVA 1YXCA 4JTSA 1X8FA 1P5BA 1Q3NA 1V5XA 3C2OA 1B4EA 4K7VA 4LRTA 4ML9A 4QIUA 3TNOA 3LGEA 1GTHA 1PL9A 4IMGA 4BFAA 5BOOA 3KVJA 3GZ3A 1XXXA 1H61A 1TPB1 1Q6LA 4FNTA 1OF8A 1FBAA 3PBYA 3W85A 4WY0B 4IQLA 4MLRA 3G0UA 4DO4A 3SECA 2Z6IA 3GLCA 4O11A 2JKPA 2YFNA 2OJPA 3W07A 5K3VA 4CCDA 1GTEA 4DO5A 3NQMA 2NUXA 1XBYA 1YPIA 1K8ZA 1JCYA 4K38A 2J27A 5F2MA 3SZ8A 5HINA 2V2HA 1OVDA 4UNKA 5CZSA 3FKKA 1AL8A 3C52A 3IVTA 3SI9A 1M6JA 4PH6A 3DFSA 1FCBA 1G4SA 2B7QA 4UUIA 2QCHA 2F7FA 3S1XA 3LRKA 1A50A 2NWSA 1HFBA 3HBLA 4OU1A 1TPFA 3TAOA 3P5ZA 4CNOA 3NPVA 1KM2A 4GRSA 4S2BA 2GJLA 4XKYB 4DQWA 4KFNA 3OVPA 1WOAA 4G1KA 1TV7A 1UCWA 4MY8A 4DO6A 1LOQA 4JDBA 4CQAA 3BG9A 1DHPA 3BLFA 3TH6A 3TUUA 3GDKA 3TC6A 5C6MA 4ICNA 1TQXA 1XI3A 3GDMA 1OFPA 4LUJA 3W23A 2W79A 1XL9A 4FXSA 5EL1A 2DZTA 1YTDA 3NL6A 3W1MA 3Q94A 4AXKA 1K3UA 3W3OA 3IEBA 1OYCA 4M6QA 4ORIA 2FB2A 1XBZA 3L5AA 5BW6A 5DCDA 1S3HA 4MYAA 4LW7A 5HWNA 1TREA 1TYGA 3DKLA 1SQ7A 2CZDA 3W7OA 2DP3A 4LC6A 4HNUA 3C61A 3M5YA 2DZVA 4UTWA 3TQKA 4YLWA 2GQAA 1O4UA 2ZTKA 3HJZA 2TMDA 1LLWA 1LP6A 5I3IA 1W54A 1XCFA 2A4AA 1XDLA 4IX2A 3CT7A 3TU9A 3C2FA 5CPOA 3W2JA 1LDCA 1TB3A 3EXSA 3F1QA 3W74A 5D2WA 3OVQA 5AYZA 2HTMA 1OG0A 1M7OA 3W73A 2E5CA 3KXQA 3MHFA 4LRSA 2C18A 1VYRA 2V8ZA 1AG1O 3LXCA 5GVJA 3MWAA 4N9CA 3B0UX 4NUWA 3AJXA 2DU2A 4RZ6A 2VKZG 4RK8A 2Y7EA 2OT1A 3O16A 4LVBA 1W56A 2O7SA 1XUZA 1H7PA 1EUAA 4K37A 3TW7A 1KW1A 4JY9A 1IXNA 1TTIA 4JTFA 3DENA 4Z1DA 3RF9A 3W2UA 3S5NA 4AAJA 1GVQA 1OK4A 1O95A 4LY8A 3W87A 1KBIA 5EYWA 3B4UA 1QAPA 3G1SA 3RFAA 2QCDA 4LS2A 1KA9F 5LSMA 2GJNA 4IX0A 5G2IA 4AWUA 3LV6A 4E2DA 3QMTA 2WNZA 4IXXA 3M47A 4OE7A 4TU1A 1HO1A 3HGOA 1F5ZA 1LOSA 3P74A 4X2RA 1TPC1 1JUKA 1KBJA 1Z48A 2NV2A 2F84A 1WV2A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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