3MJY | Genus

Total Genus 107

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	107
sequence length	314
structure length	306
Chain Sequence	GSMSLQVNLLNNTFANPFMNAAGVMCTTTEELVAMTESASGSLVSKSCTPALREGNPTPRYQALPLGSINSMGLPNNGFDFYLAYAAEQHDYGKKPLFLSMSGLSMRENVEMCKRLAAVATEKGVILELNLSQVAYDFDAMRQCLTAVSEVYPHSFGVKMPPYFDFAHFDAAAEILNEFPKVQFITCINSIGNGLVIDAETESVVIKPKQGFGGLGGRYVLPTALANINAFYRRCPGKLIFGCGGVYTGEDAFLHVLAGASMVQVGTALQEEGPSIFERLTSELLGVMAKKRYQTLDEFRGKVRTL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Leishmania major
publication title	Novel insights for dihydroorotate dehydrogenase class 1A inhibitors discovery. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase
total genus	107
structure length	306
sequence length	314
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.3.1: Transferred entry: 1.3.98.1.
pdb deposition date	2010-04-13

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	3mjyA02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3mjyA01

4GUFA 2ZBTA 1WAUA 3TQ0A 4EVZA 2ZRYA 2QJHA 3GKFA 2C13A 2GPTA 3W73A 4LVDA 3M43A 3UWUA 3SR7A 2GQ8A 3OVPA 3CC1A 2ISSA 1C9DA 3I7RA 4PCFA 4N9DA 2ZZ4A 1I2QA 4O1BA 3W3OA 1W3TA 2FQIA 3RK8A 3TJLA 2OT1A 5KMYA 2DU2A 3G1FA 1Z42A 4UTHA 5K4XA 4MZ1A 2AQWA 4UCGA 3W1MA 2F7FA 4DELA 3GKAA 1D9EA 1G7UA 1SO3A 4PL1A 1RQHA 3B0VC 2OX1A 3V75A 2X1SA 1TJRA 2Y62A 1OYBA 1OVDA 1W5PA 2NZLA 1IXOA 1VRDA 3W2LA 3BARA 3V1PA 5CSRA 1I2PA 2VKZG 3VCRA 3U8GA 4BI6A 4UTMA 1GTHA 4N9EA 3MYPA 1O5XA 5EPDA 2XN2A 2NXIA 2Q3RA 3GYEA 3P62A 3I7QA 1LROA 2C1HA 3TX9A 4O57A 2PE4A 1XXXA 3NDOA 4PH6A 4ZQRA 5KSWA 2PRHA 1F6KA 2WOQA 1H7PA 3SECA 3TUUA 1AL8A 1ME8A 3W1QA 1U5JA 3MBFA 5C55A 4WD0A 4O1DA 1OFDA 3MI6A 3N73A 5G4WA 1Z48A 1SO4A 1ADOA 5D09A 4WXZA 2Z6JA 4CCDA 1OFQA 4MLJA 1OF8A 4UMBA 5HWJA 3I65A 2BWGA 1Q6OA 4XZ9A 3HG5A 2C0AA 5BW6A 3FJ6A 4HKPA 1TMHA 4O50A 2A5HA 3M5XA 4JD4A 3BW2A 3OG3A 4KFPA 3W7QA 2I1OA 1X8FA 1W5NA 3G18A 2QCMA 3P74A 4XKYA 4AMAA 1W3IA 2P0OA 4ZQCA 2J9XA 1EA0A 2Y88A 3O07A 4PA8A 3M44A 4UNKA 1JCLA 1XBYA 2YW4A 2V30A 3WK3A 1ME7A 3OEXA 3LRKA 1B4KA 3W86A 5F2LA 4OHQA 1EWEA 2ZRZA 1W31A 2A1YA 2Q3OA 3QH2A 2H3BA 4M5PA 4MOZA 2NUYA 3I7SA 4JYDA 1AW5A 3QW4B 5F4XA 2J6XA 3G1XA 3IGXA 3C3NA 1XC4A 4IMGA 3CEPA 1VQTA 4PFMA 3HGJA 1K8ZA 3INPA 3MHFA 3QFEA 2CLIA 3DFQA 3NQ6A 5D02A 4I7UA 3N3MA 1HO4A 3FS2A 4AHOA 2ZCGA 1BKSA 2VFIA 4LS2A 1FDJA 1BWKA 3OVRA 2Z1BA 2QEZA 5HR6A 1H1ZA 3H53A 2ZZ1A 3LTSA 4GNJA 5FEZA 1ML1A 1K7FA 2V5LA 3IGSA 4GWEA 2YSWA 1XL9A 2HSAA 4UFKA 3SJ3A 2X1UA 1L9WA 2QCGA 1AW1A 3T55A 4K38A 1XM3A 1O95A 2NUXA 5E1QA 4O19A 3B4UA 3DXIA 3NXFA 3P81A 4TO8A 4E2BA 3W7MA 3NNTA 3IGUA 3B04A 2KZHA 2YR1A 4ZMGA 5AYXA 3PUOA 5DXYA 3W83A 3C6CA 1GWJA 3N34A 4JTFA 5A5WA 4NX0A 1GVSA 2GQ9A 2HS6A 4QM1A 3W88A 1W37A 4AAJA 3M7WA 3W7LA 1W54A 2QDGA 5I3IA 3FOKA 1OX5A 2QR6A 3O6CA 3IIZA 4S1FA 5IM51 4K8HA 1DVJA 4O1CA 3TMLA 1XI3A 3FJLA 1LRNA 1AMKA 1WXJA 2YFOA 3G22A 4NQ1A 4A3UA 1DKWA 1I2RA 3QRHA 2FTPA 2RDTA 3N19B 4GBUA 3S5YA 1F05A 1MSSA 4HHPA 4ORIA 4UR8A 1SSGA 1PIIA 4XWUA 4KWWA 4UUIA 1K7EA 3L0NA 3G1VA 4M6VA 4QNEA 3W9ZA 4BWLC 3FKRA 2YFNA 2YXGA 3WJWA 4AWTA 1LOLA 2VELA 1ZAIA 3LRLA 2YZRA 1QWGA 2VXNA 4LS0A 3LX9A 5AHLA 1YXDA 5LHEA 3NOEA 4LOCA 3LBCA 3TC6A 4ZQOA 3EEGA 5FF0A 4E38A 5C5YA 1TIMA 3W23A 3L0GA 1JR1A 1KV8A 1RPXA 5EKYA 4CNOA 2H8ZA 4FNRA 3PBVA 5H2ZA 1Y0EA 3LXBA 2Z0IA 3EX1A 4O54A 4WQ6A 5K9CA 5LNUA 3W7OA 5DY3A 1LRTA 2WSYA 1TPFA 3WK0A 4X2RA 5CPMA 3LCXA 1LM1A 1W0MA 3ATZA 4R34A 3W1PA 3QPZA 3ABQA 3VKJA 3DENA 1QOQA 4JYEA 5F1VA 1O5KA 3G1SA 1H7RA 3MI3A 4UFHA 1EX5A 3CU2A 1FDZA 4MZ8A 1G6CA 1H51A 3GVGA 4JEQA 3QSTA 3YPIA 4O1AA 1TYGA 2CLMA 2Y63A 4LWWA 3MO7A 3TJXA 3QJAA 4CQAA 1WDWA 4FXSA 4WUIA 3GDLA 2VOMA 1O94A 2E77A 2CLOA 2R14A 4NJIA 5BMXA 4YL2A 5AC7A 3BLEA 4UTWC 5F2MA 2V81A 3EKLA 1JCMP 1J5TA 2E5BA 4MJMA 5EYWA 1X7FA 3RNDA 4RZ6A 4N6FA 4JICA 3CLMA 3B0PA 3M41A 5D30A 1GOXA 2AAMA 4FXRA 2A2IA 3KRZA 4N2YA 1G7VA 5CGQA 2WNZA 3W22A 5K9XA 1GVOA 3TSBA 1XKYA 4JX4A 4FNQA 3SGUA 3R13A 4A21A 3TU9A 1XDMA 1MEHA 4KWVA 3W7HA 1AG1O 3WJYA 4IX2A 1GVQA 4IXXA 3BVJA 1YADA 3O8AA 2CZDA 5HWNA 5K7JA 3UY8A 1F2JA 1LLWA 2YX0A 3NG3A 4AF0B 1SUXA 1PVNA 4IQLA 3W7IA 3L21A 3HF3A 3O05A 3VNDA 3G8RA 3M0ZA 1T8XA 5F4SA 4UR7A 1F7BA 4DPQA 1ZFJA 1NF0A 1DL3A 2A21A 4JDYA 3NQGA 3EWBX 1P5BA 5KZMA 4NVTA 4J9JA 2CZ5A 1NFBA 3W7GA 3CB8A 1X1OA 1TRIA 4IMEA 1D3HA 2E6YA 3OHIA 5C2XA 1GG1A 1HG3A 3O63A 1SW7A 3E49A 5E0KA 3UZ5A 1EIXA 1QOPA 3EX2A 5LZLA 1FCUA 3TR2A 3LTPA 1THFD 4EF8A 3MHGA 1UCWA 3G1DA 3UD6A 3N2XA 3NR0A 2W6RA 3P80A 4U28A 5FEXA 1N8FA 5SWUA 1JVNA 4N6EA 5BMWA 3LLDA 4OBTA 1PL9A 1D3GA 1SQ7A 5AN7A 3WJZA 1YXYA 4WOQA 1VS1A 4UXDA 3HPSA 4O18A 3A22A 4TR9A 4DQWA 4EOUA 3F4NA 3GAKA 5U7SA 5KTLA 4K39A 1CI1A 2ZZ7A 5FF4A 1G69A 1OFOA 2DP3A 2XN0A 2B7QA 1NF7A 4UMCA 3TQKA 1JCYA 2QDHA 3S1VA 4MY1A 3HPXA 3LHZA 1SFJA 5CZJA 2ATSA 3BLIA 4NZFA 1LCOA 1NAL1 1QR7A 3LGEA 1QDSA 3M16A 3W2JA 2TSYA 1RVGA 2VEKA 5EA9A 3IIVA 4MJZA 3W2MA 1GVRA 2WKJA 1W5OA 4H6KA 1YDVA 5DLCA 3NZRA 4LU0A 4TU1A 1VZWA 2GVGA 1RQEA 4BR1A 1OK4A 4JTJA 3TAOA 1EP1A 2UV8G 3S6DA 5AHFA 1G4SA 2FPTA 2O7QA 2G96A 3IIOA 4LC8A 4QNWA 4R53A 3WK2A 4NNCA 1A50A 3TDFA 4NZJA 3C56A 3KAOA 4OQVA 2C18A 3DGRA 2ALDA 5K9DA 2PURA 3A23A 2DZPA 3W2UA 2A7PA 1ZY9A 3NL5A 1KM6A 5EMUA 1K3UA 3W74A 3FEMA 1G4EA 3DKJA 2WO5A 2QCNA 1OX6A 3B03A 3GAYA 2QUUA 4ZL1A 3WJSA 1TV8A 2QF7A 1CX9A 3GNDA 4CLMA 1TCDA 2H8XA 4A2SA 1ZNNA 1N55A 3L5MA 2LLEA 5HMSA 2Y61A 2CLEA 4Q4KA 2VEMA 3S0CA 3OA3A 1I45A 1TQJA 4MPQA 1H7WA 5LNSA 8TIMA 2ZYFA 4IMDA 3PSVA 2ATMA 4IXHA 2A4AA 4RKAA 3GZ3A 4HPJA 1KM3A 1KTNA 4JTLA 2G97A 2RKXA 4MYXA 1UASA 1L2UA 2PRMA 4MLRA 1OYAA 2ZA3A 3QF0A 2BXVA 1LP6A 2ABAA 3DFTA 4B5NA 3W76A 5F2IA 3Q94A 1M5WA 1OHLA 3USBA 3NPUA 3NQFA 4BFAA 1SO5A 3B05A 4LY8A 2Y7DA 1TPB1 3O6YX 4GUHA 3PAJA 1SU5A 2DJLA 4BWLA 4AH7A 1O60A 4HNTA 3W1AA 1V5XA 3HG3A 1FCVA 1P0KA 3UQNA 5C6MA 2V2HA 1TTJA 4JX6A 1DBTA 2PC4A 1K7XA 2EPHA 3P84A 1V7YA 3PVFA 4I9AA 4M19A 4NJJA 3TKFA 2OT0A 1BWLA 5D2VA 4ZZ9A 3GXNA 4ORMA 3LTYA 1OYCA 4JNMA 3NA8A 3KVKA 5G1TA 3EXSA 1Q3NA 4MKNA 4X9SA 2J24A 4BK9A 1TPVA 2CZFA 3LHTA 1JUKA 2TPSA 4X22A 4O4WA 1UJPA 1LTDA 1K8YA 2NV2A 5L6UA 3PC0A 1W3NA 5AHNA 5FEPA 3DI1A 3UNDA 1X1ZA 4O28A 2ZZ3A 3EX4A 4ZQMA 3HMJG 3CT7A 5DXXA 3R89A 3KVJA 2Q8LA 3G1AA 5LSMA 5G2IA 4RZ5A 3S1WA 3NAVA 3KXQA 5D37A 5K4ZA 2EKCA 1ZAJA 4K36A 4C1KA 5D03A 2A85A 6TIMA 4UFLA 4UTIA 3HGRA 1KV5A 4FX6M 3C52A 1ZHAA 1OJXA 4JYFA 4L4MA 3C61A 3KOFA 1KFLA 4O14A 3HOJA 2F84A 3TROA 1M6JA 3DHDA 3SSJA 3MP5A 1OK6A 4UTWA 5EBUA 4Z0JA 1DHPA 5HJLA 5D04C 4TX9A 3DFPA 5DBUA 3Q58A 3GR7A 3NL2A 3KVLA 1OF6A 3HQ1A 1G4TA 5G2HA 3EWUA 3JRKA 1PS9A 4FHAA 3GX9A 1GTEA 4FIQA 3T40A 4FEZA 2EHHA 1SZEA 4LRTA 4AVFA 3W71A 1F74A 2G95A 4KFNA 3B0UX 3C2FA 2AGKA 1UBSA 4XUGA 3JR2A 4LRSA 1PCKA 4NU7A 4PL2A 4UMAA 2NX3A 2FPVA 2A6NA 3TC7A 3DH7A 4IX0A 4RR4A 1FDYA 5KZDA 2DZSA 5TIMA 5KINA 1LRQA 1GQNA 3TH6A 2NXGA 1LYXA 2QKFA 1KLYA 3S1UA 3W7NA 1VGAA 1TPWA 3FYOA 5J5DA 3LBMA 1Q6RA 1JUBA 3THAA 3CIXA 3LHVA 4GUGA 4MY8A 3NPVA 2V2DA 2GQAA 2H90A 3KRSA 1FWRA 3O15A 3TCEA 1AW2A 2E5DA 4TIMA 1IIGA 3WJXA 3P67A 2ZRXA 3UZJA 3F4WA 3EX3A 1G4PA 4QSHA 4U4MA 3EX6A 3W1TA 4PTNA 1W5QA 2CLKA 5IBXC 2B0MA 2H6RA 4QISA 3MBDA 2Y6ZA 1TTQA 4N02A 3LCHA 3S5NA 1QPQA 4O17A 1G67A 2V82A 1JCJA 1TPDA 2VFFA 1FX6A 1ALDA 3EXTA 5AYZA 2O7SA 2C19A 4BI7A 1OFBA 1W5MA 2QCFA 3HGSA 3M5VA 5HINA 1FBAA 2R91A 1AL7A 4AF0A 3TXZA 1L6YA 4K7VA 1DQWA 3BLFA 3QMSA 2C3ZA 1QCWA 3EXRA 4N4QA 1C8VA 2V2CA 4UFIA 3BK0A 2NUWA 1R2TA 1JQXA 5DBTA 5MHBA 3FIGA 3NVTA 4P2VA 1EP3A 2VFGA 4OE7A 5HULA 3PG8A 4WY0F 1RR2A 3W7DA 3I68A 1ZAHA 5KITA 4ZQNA 4NX5A 1PE1A 4LUJA 3SW6A 2NLIA 1ICSA 5DCBA 2DZVA 5GVJA 2J88A 1QMLA 1YPIA 3G0SA 1P1XA 3ABRA 4IMCA 3STFA 4EIVA 1GT8A 1OX4B 3EB2A 1VH7A 2QCDB 1I2NA 2C16A 2DZXA 3G3DA 3W1UA 3Q2DA 3W7RA 1GEQA 3MP4A 3QC3A 3W70A 1FUYA 2A0NA 3W75A 5CPOA 3S5OA 4MY9A 1NSJA 1T0OA 4JX5A 1WX0A 1SW0A 4WJEA 2I9EA 1LOSA 1FQ0A 3MI2A 3EWYA 5FI8A 3P8IA 3NM1A 4A2RA 5CKSA 2TMDA 1H60A 1GG0A 5CG7A 3BV4A 3LI0A 1OFAA 3FKKA 1XCFA 4Y8FA 3H54A 1KM2A 3BW4A 2VEPA 3QW3A 3THQA 1HL2A 2HTMA 3D0CA 3STEA 4KFOA 1DORA 4DF1A 4LT9A 3NQ7A 3G3MA 3TFXA 2V8ZA 4M6QA 2ZZ5A 4TMCA 2CFFA 1J4EA 2ZRWA 3EWZA 3PS7A 4LV9A 4FIRA 3TW7A 3PB2A 4IGHA 3STCA 2FB2A 3E12A 3LOTA 3TFCA 2RH9A 4HNUA 2Z6IA 4NJHA 3RMJA 1OFEA 2BSLA 1ME9A 1A5BA 4A29A 2PRLA 4P61A 1Q45A 1R30A 3LXCA 2RHGA 4GXMA 4JTHA 1SO6A 1VHCA 5HQEA 3LHYA 4N4PA 4FB7A 3MJYA 4UFJA 3NYZA 1ONRA 4LC6A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3MJYA

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Chord Diagram

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