3MMTA

Crystal structure of fructose bisphosphate aldolase from bartonella henselae, bound to fructose bisphosphate
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
341
structure length
341
Chain Sequence
GSMNERLEDIALTLVGAGKGILAADESTATIGKRFESIGVECTEDNRRAYREMLFTAKEAMESAISGVILFDETLRQKASTGQMLTDLIRDAGAVPGIKVDTGAKPLAAFPQETITEGLDGLRERLKDYYTLGARFAKWRAVIAIDAQTLPTRGAISQNAQALARYAALCQEAGLVPIVEPEVLMDGPSRQHSITRCFEVTKVVLHTVFKELFEARVLFEGMILKPNMVIDGKDARIASVEEVAEKTVHVLKQTVPAAVPGIAFLSGGQTDEEATAHLSAMNALGALPWKLTFSYGRALQAAALKAWAGKNENIVVAQKAFCHRARMNHLAALGQWTKDQE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Bartonella henselae
publication title Structure of fructose bisphosphate aldolase from Bartonella henselae bound to fructose 1,6-bisphosphate.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase
total genus 132
structure length 341
sequence length 341
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2010-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3mmtA00
2Y7GA 1FBAA 1JQXA 1TIMA 4DO5A 1MO0A 3WK1A 4JY8A 1PCKA 4JX5A 4IPJA 5I3FA 3EWYA 1IXPA 3RK8A 4DQWA 2QAPA 4UNLA 4JIQA 4E0CA 5DY3A 3A23A 1OFAA 1T96A 3NQGA 2J9YA 4UFIA 3GYEA 3H54A 3W23A 4ADUA 3O8AA 3HPSA 1EPXA 3TDFA 3C52A 3L21A 1ME9A 4PC8A 3M44A 3GDRA 1C9DA 2A6LA 4OWGA 3HGJA 4TIMA 1TMHA 3QQ0A 4NJIA 3KHJA 4RCXA 3U6WA 4UFLA 5K4ZA 4FEZA 3W1UA 3EX6A 2RH9A 3JS3A 5HNRA 1TTJA 3P80A 4P2VA 4EOUA 1WXJA 1YPFA 1F6KA 4RZ5A 1WQ5A 3W70A 2A5HA 1BKSA 4R34A 3DFOA 3RLVA 1LBLA 1LCOA 3PF3A 2H3DA 4N02A 2Y61A 2I9EA 1WDWA 2BLEA 3PB0A 3NXFA 2YSWA 3NOEA 3LX9A 1NAL1 3S1UA 3TSMA 2YX0A 5U4NA 4MPQA 1YDOA 3STFA 5EMUA 4JS3A 4QM1A 3W1RA 1MSSA 2QCCA 4FNPA 2FPTA 3W2MA 3GDLA 2TYSA 4DEFA 1QPQA 3B06A 1PL9A 1FWNA 2F7FA 2YR1A 3LB0A 1X8FA 3EWWA 4O1CA 3C2FA 3M47A 3DI0A 3TU9A 1MZHA 5F2MA 3RU6A 4QSHA 3GDMA 3NZRA 1GQNA 1CX9A 3LV5A 1SSGA 4EIVA 1FDYA 1B57A 4QAIA 4YL2A 3MBFA 1LYXA 3TMQA 3USBA 3QQ1A 4JXCA 2C18A 1DOSA 1TPUA 3MP5A 5E0KA 3W2NA 3C0JA 3G1XA 2WKJA 1LM1A 3FLUA 4NUWA 5F2IA 3UWQA 4UXDA 3M0ZA 3EKLA 2QCDB 3MO7A 3T44A 4LC6A 1QCWA 2TSYA 4HIBA 1PHQA 5TBOA 1KTNA 4ICNA 3A22A 5HUOA 2FQIA 1IGSA 4K8HA 3FA5A 3W1TA 2QAFA 3LOTA 1OX4A 1R46A 4KKXA 4JYEA 3UZJA 2Y85A 3G18A 5AYXA 2J9ZA 1EUAA 3E0IA 3R2GA 4POCA 1K03A 3F4NA 2ZZ1A 2VEPA 3LXBA 3MP3A 4IX2A 2E5BA 2HTMA 1H7WA 4Z0SA 3KX6A 3O06A 1HO1A 2V2DA 2DZVA 4UTWC 3IVUA 2J6XA 1HL2A 4O53A 3MHGA 2XFWA 2VEKA 3GX9A 1U5JA 3BGJA 5IBXA 4A22A 4RZ6A 4NJKA 2ISSA 2AGKA 5D2WA 1RD5A 1GVOA 4Y9AA 5FF3A 2V5BA 1T0OA 2HS8A 2QKFA 4HNUA 3TROA 4JGDA 4MFDA 5K3VA 1LOQA 1KLZA 2CLFA 1MEIA 3DBPA 5FEWA 1NEYA 1JCLA 2DORA 1A50A 2OCZA 3DFPA 3S5YA 1LOSA 3L5AA 1AG1O 1D3HA 1H62A 3DFTA 4FNUA 5FI8A 2FB3A 3CU2A 3TV8A 1F05A 4NX5A 2W79A 1R30A 1GEQA 1ML1A 3WK0A 1W31A 3LHYA 2GJLA 4ZMGA 4I9AA 1H51A 3GXPA 4IUOA 3SW6A 4CNOA 4O4WA 4M7SA 2E6YA 2QUUA 3HGSA 3G0XA 3K30A 1JUKA 1W5NA 1X7FA 3ANYA 5AFDA 4UR7A 3JR2A 3KVLA 1XM3A 1AW2A 3MI3A 4ALDA 3FIGA 2RKXA 2X2GA 4LUIA 4ZZ9A 2PCQA 1XUZA 5F1VA 4X2RA 1ZENA 3R5EA 1SO5A 4RKAA 1S5WA 3R13A 1PVNA 5DBUA 3P84A 1VCVA 1BTMA 3BARA 1ZJIA 5D2TA 5CZTA 3M43A 2Y6ZA 4XBKA 4MIMA 3STCA 2NX3A 5EL1A 2C19A 3O16A 1XUUA 2RDWA 5LNUA 2VFGA 5LKYA 1YTEA 4UC5A 1OF8A 3EX2A 3NQCA 5C54A 3PUOA 2Y7FA 1SR9A 3HPXA 4QNWA 3VKJA 3L0NA 1G4SA 1SFJA 3TSBA 4O50A 4ZQPA 4CCCA 1F74A 3UD6A 4GUGA 3GXNA 3W2UA 2EGZA 5LZLA 2IQTA 1KM4A 7TIMA 3MJYA 1GWJA 2E6FA 3NPWA 3I6RA 2V2CA 3W7JA 1PCWA 3W74A 3T4CA 1W54A 3VE9A 2DU2A 3L68A 2ZRYA 1TRIA 3VCRA 1R2SA 4X3ZA 5AHMA 5D04C 3L67A 2V5LA 1JRBA 4O8RA 1GG0A 3M16A 5EPDA 2QCFA 1OX4B 3BLIA 3G8EA 5F2GA 3EWXA 4YLWA 3M5XA 5J5DA 3EWUA 2CLEA 4S1FA 5KTLA 2DJLA 1KFCA 3M6YA 4UTUA 4UTTA 3N9RA 2WOQA 3LHVA 1UJPA 4UFKA 3TIMA 2H90A 2ZTJA 2FIQA 2H8XA 4RX0A 1D9EA 3TC6A 4O17A 2C15A 3W1AA 3TXZA 3N3MA 1JJKA 3G22A 3HPZA 4AB4A 4QISA 1UB3A 1W8SA 1VZWA 2G96A 4E38A 5K9DA 1VPXA 4JNMA 1ADOA 4CQ9A 1L9WA 4YCPA 3ABOA 2Z0IA 3THQA 3OHIA 1LLZA 2NZLA 1FCBA 1VLWA 1JCYA 3HQ1A 3OVQA 3DH7A 1WAUA 4ZQNA 5BNKA 2GQAA 4AHOA 3QF0A 2X30A 4PFMA 4ZQOA 1GOXA 3TQVA 3M5ZA 4UMBA 2CWNA 2E6DA 3LCWA 4NXSA 3CWNA 1K7FA 4LV9A 1DL3A 3KVJA 3U8GA 4Z08A 1NVMA 1ICQA 1A5AA 3LV6A 5CSRA 1B9BA 4NXKA 4N6EA 5AHIA 1TQJA 2OJPA 4JX4A 4Z1AA 1CI1A 2OT1A 1K3UA 4N2YA 2QCLA 4OBTA 2BSLA 2QEZA 2C14A 3HBLA 3P60A 2I14A 2GOUA 4K38A 1LBFA 1A5SA 3FOKA 3ZR4A 3PVFA 3KRUA 4CQAA 1A53A 2YFOA 1PIIA 3ZWSA 2TMDA 3CT7A 3I65A 1XDMA 4OQVA 1W37A 4YXGA 2PURA 3L65A 1G7VA 3LCHA 5EYWA 2GVLA 3RFAA 4OV4A 4JR5A 3DFSA 3UY8A 1B4KA 4JTJA 3PSWA 5D09A 2NUWA 4OHQA 4C1KA 2YXGA 3UXAA 5C2XA 4IQLA 3L2IA 1GPWA 4EF8A 3A24A 1FQ0A 4N4QA 2ZRXA 3LI1A 4UTKA 1SZGA 4MZYA 1KFLA 1H7XA 2J24A 1XCFA 1VC4A 4QIUA 3FFSA 2V81A 3TW7A 3QMRA 1K7EA 5DLCA 4Y90A 4UTHA 5I3KA 1FWTA 1P0KA 5FEXA 4CLMA 2E1DA 4XTIA 4LVDA 2QJIA 1QNVA 2QF7A 2A7NA 1Z48A 3I7QA 4ADSA 3B04A 3N2MA 3NEVA 1ZY9A 3TK7A 2BXVA 1E51A 3NQ8A 2CLOA 4UTJA 5A5WA 1H63A 4O11A 5KINA 2QJGA 4ML9A 1JR1A 2TRSA 3T55A 3STEA 3EKZA 3F03K 3IV3A 3E96A 3NPUA 4JTKA 4OV9A 1PE1A 3TC7A 1JQVA 2E5CA 5L6UA 4FXSA 4Q33A 3NPXA 1SUXA 5LHEA 3IGUA 2ISWA 2J9XA 1PHWA 1TPVA 3N9SA 3P7YA 5G2WA 5HQEA 1P0NA 2RHGA 4HN4A 4R53A 3TH6A 1SW3A 1PS9A 4MFEA 4NU7A 1H5YA 2B7NA 3NL3A 3DAQA 3G1FA 2Y88A 3W87A 3HF3A 2FDSA 5D30A 1F76A 3HG5A 1J2WA 4NJHA 4WQ6A 5C5YA 1GVQA 1QO5A 1VQTA 1B3OA 4M7TA 3STGA 4EVZA 5I3JA 5CPOA 4AWTA 5LGZA 3KRSA 4M6QA 4IMDA 2VEIA 2C6QA 2H8ZA 4X22A 2OMAA 4LS1A 3FS2A 3FYPA 4XBSA 2A7PA 1R2RA 3T7VA 3A9IA 1XBVA 4LS2A 2HS6A 3N73A 1LRQA 2Y62A 3HO8A 8TIMA 3G1YA 4S2CA 2JK2A 3LXCA 2ALDA 4O19A 1SSDA 5AN7A 2GPTA 1KW1A 3SGUA 2XN0A 2PRLA 3W72A 3BGGA 1W3IA 4WX2A 1C29A 5F1UA 3IIOA 4PEKA 2EHHA 3W85A 3S8HA 3DXIA 3CWOX 5J5RA 3GR8A 5HWMA 4FNQA 2JBMA 2CLIA 4KWWA 4WXYA 4DO4A 5F2LA 3FKKA 1GVSA 3QSRA 1F73A 5CGQA 3SI9A 1F6PA 3C4UA 3N14A 5HWJA 3L9CA 3LCXA 4FX7A 2NXHA 4NNAA 3HMJG 3HG2A 4QNEA 2WNZA 1P5BA 3L0GA 3DZ1A 3S1WA 3UXDA 3NQ7A 4UMAA 2E09A 2GVGA 4UFJA 2CW6A 3P8IA 4LTSA 4XQ6A 2DJXA 3NDOA 1W5OA 3LRLA 4IPIA 1RPXA 4DPPA 4O15A 2C16A 1K02A 1IXQA 3DHDA 1F7BA 3IIVA 3W7OA 1VR6A 4JTHA 3P74A 1L2UA 5E93A 2WNQA 1HUVA 1XFBA 2VXNA 3BVJA 4O4VA 2Z6IA 4RV8A 1KTBA 3ABQA 4GRSA 4MZ8A 1YTKA 1G4EA 3AJXA 3B03A 3QYQA 5E1QA 1TTQA 2NLIA 4FNTA 3OBKA 3LTYA 3GB6A 1P1XA 3GVGA 3NM1A 4WUIA 1YADA 3I7RA 2ABAA 2WV8A 4HSNA 4PL2A 1KV5A 3VNDA 2ATSA 3SIZA 2W6RA 1OFOA 2H3BA 2JGYA 4MY1A 3W75A 1VHCA 3O6CA 1QOPA 1QOQA 3MWAA 3OA3A 1N8FA 3AO0A 3FJLA 4GFSA 3W7QA 1GTHA 2X1TA 4MY9A 1TJPA 1T8XA 4XKYA 2Y63A 1FX6A 3PBWA 4JTEA 1RQEA 2FJKA 1LTDA 3TE9A 1OYAA 3W76A 2Q3OA 1BWLA 2EPHA 4N9EA 1G6CA 1DORA 4JTLA 3SZ8A 1LRNA 1FXPA 2A0NA 3NA8A 2KZHA 2B0MA 4CQ8A 4Z0JA 5HINA 2XN2A 4B5NA 1QAPA 5T26A 5L9FA 4TMBA 3M9YA 2A1YA 3DGRA 3LHTA 3VE7A 2A4AA 3GNDA 3W2JA 4LNYA 2G97A 2NXIA 3N2XA 1IIGA 2HMCA 1JUEA 1EP3A 1OG0A 1OK4A 4DXVA 3LCLA 5AOUA 4K7YA 5IM51 1F5ZA 1YDNA 1ZHAA 4O16A 5EY5A 2R94A 4XUGA 6ALDA 1Y0EA 4GUIA 3B8DA 1C8VA 3SSJA 4K7VA 4LRTA 2LLEA 5HMSA 1G7UA 4CCEA 4UTMA 3T78A 3W22A 4JYDA 1EX5A 2C0AA 1UUMA 1H60A 3R8RA 1KBIA 1RR2A 3QMSA 3MI6A 4N6FA 5D33A 4BF9A 4FNRA 4K37A 1M7OA 1ZAJA 3G8RA 1EWDA 4UMCA 5FF7A 1EWEA 3KRZA 4FO4A 5LNVA 4GUJA 4NZFA 1FWRA 1OFBA 3W84A 2JKEA 2GQ9A 2YGYA 2I1OA 1QWGA 3JRKA 4K6AA 3W7CA 3NGJA 2A7RA 3W7LA 5TQLA 2UV8G 1H7NA 2NWSA 1JRCA 4NVTA 4L4LA 1ALDA 5AC6A 3W2LA 3F4WA 4N9CA 1YXCA 1VHNA 4O13A 3G0UA 5D05A 2NXGA 4E2DA 1ZCOA 2QCGA 4BK9A 4WOZA 1SW0A 5AB3A 3NQFA 1FCQA 4AAJA 1LP6A 1Q6QA 2JKAA 1B4EA 5LNSA 1I2OA 5AHEA 3KFTA 5D03A 3FKRA 1TO3A 4MYAA 1LZOA 3MUXA 5H2ZA 2QCNA 4JDBA 1EP1A 1S5TA 5U7SA 1NSJA 3VI2A 4BWLC 1G4PA 3BPWA 5D32A 1I2NA 3IVTA 5AHLA 1H1YA 3S9YA 5DCEA 4S2BA 2V2HA 2V30A 4LUJA 3NL5A 1RVGA 3UNDA 2V82A 2ZRWA 1U83A 1S3HA 1WOBA 1Z41A 3NQ6A 3LI0A 3IGXA 4LS0A 3C2RA 4JY9A 5LNWA 3HIJA 3OVRA 3PG9A 5HR6A 1SO6A 4XKYB 2E77A 4XZ9A 2PRMA 3MBDA 3QW3A 3LCIA 3SJ3A 4DF0A 4IXXA 4LVBA 1KFEA 1O60A 1UCWA 1DQWA 4AVFA 4LW7A 3W7KA 1W3NA 3PB2A 4CCDA 3Q37A 1QO2A 1RQBA 3QM3A 1SPQA 2NX1A 2R14A 4Y8FA 4GE8A 1AW1A 4A2RA 3UWZA 3KOFA 5EKYA 4ADTA 4BFAA 2WO5A 3DKLA 2YW4A 4JD4A 4AWUA 3LHZA 3FJ6A 4FIRA 1WX0A 1SW7A 1XBXA 4J9JA 3UY7A 3NQEA 4ONVA 1G4TA 4O1DA 3S6DA 3W2KA 4K39A 4GNJA 4IMEA 4EF9A 2NX9A 3IIXA 5CPNA 1DV7A 2V0TA 4W9TA 4ZL1A 3SY5A 2BTMA 2ZZ3A 2Z1BA 2VEMA 3M5VA 2A21A 2X1UA 3DFNA 4JX6A 3GAKA 1RQHA 1KM6A 4RLIA 4JTTA 3M5YA 3TMLA 1LBMA 4CNNA 3L0KA 3VFLA 1H61A 3EWBX 1XXXA 3G3MA 3QC3A 4KFPA 1O5XA 4XTDA 1X1ZA 3QW4B 4QITA 5CZ0A 5I3IA 1SU5A 2DP3A 1AL7A 3H55A 2AAMA 2OX1A 3O6YX 5CG7A 2ZZ2A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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