3MMTA

Crystal structure of fructose bisphosphate aldolase from bartonella henselae, bound to fructose bisphosphate
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
341
structure length
341
Chain Sequence
GSMNERLEDIALTLVGAGKGILAADESTATIGKRFESIGVECTEDNRRAYREMLFTAKEAMESAISGVILFDETLRQKASTGQMLTDLIRDAGAVPGIKVDTGAKPLAAFPQETITEGLDGLRERLKDYYTLGARFAKWRAVIAIDAQTLPTRGAISQNAQALARYAALCQEAGLVPIVEPEVLMDGPSRQHSITRCFEVTKVVLHTVFKELFEARVLFEGMILKPNMVIDGKDARIASVEEVAEKTVHVLKQTVPAAVPGIAFLSGGQTDEEATAHLSAMNALGALPWKLTFSYGRALQAAALKAWAGKNENIVVAQKAFCHRARMNHLAALGQWTKDQE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of fructose bisphosphate aldolase from Bartonella henselae bound to fructose 1,6-bisphosphate.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase
molecule tags Hydrolase
source organism Bartonella henselae
total genus 132
structure length 341
sequence length 341
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2010-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3mmtA00
3NDOA 5F2IA 1W1ZA 5K2ZA 2YCEA 1BWLA 5F4XA 2ISVA 2B4GA 1VYSX 3S5ZA 2QF7A 3GAKA 4A22A 4KWWA 4Y90A 3KRZA 2X2GA 2ABBA 1HFBA 1W5NA 1ZFJA 4UFIA 1W3NA 5FF7A 4OU1A 5LNSA 1QPNA 4QSHA 4IMEA 2VKZG 2R14A 1Y0EA 6TIMA 4Z1BA 3B0UX 5AHNA 5HUPA 2PRHA 1UUMA 4AF0B 3IIPA 1JRBA 2TSYA 3DAQA 1J4EA 1CX9A 3NPUA 4ADSA 4IWWA 3RNDA 4UIOA 5BMXA 1G67A 3HG5A 1DVJA 1R2RA 3H54A 5EYWA 4M7SA 3C2RA 3L68A 3PR2A 2GJLA 3G1XA 4MUZA 4PL1A 2OT1A 3CWOX 5DCDA 3LCIA 4UTHA 2A85A 3ATZA 3PG8A 3HG4A 2X1TA 4LNYA 4L4MA 5BRBA 5AC8A 2E6DA 3W2NA 1LOQA 3HGRA 2D73A 7TIMA 3KOFA 4OQVA 3DZ1A 2QCFA 3LRKA 5KZMA 3W70A 5CZTA 1G4EA 1RR2A 1WOAA 4TIMA 3BLEA 5AC7A 3C2VA 1H60A 1NVMA 3EX1A 3GLCA 4JTGA 4ZQRA 4HHPA 1FUYA 4BK9A 3S0CA 4LVDA 2WNZA 1F74A 2FJKA 2DU2A 4ORIA 2WV8A 3L0NA 2E6YA 1GG0A 4IJBA 4UTWA 3FOKA 2VEIA 4IXXA 3W71A 3GKFA 1WYIA 4FF7A 3N14A 4OV4A 1W5PA 1EUNA 3I7QA 3R2GA 1C29A 4NNBA 1W3IA 5F2LA 1CI1A 4R53A 5FEPA 1R46A 4JTFA 4XKYA 1O4UA 2CZDA 1TB3A 2ZYFA 3EXSA 3P60A 2V0TA 5H2ZA 2Z6IA 2Z0IA 3BGJA 2NXGA 4R7JA 5A5WA 4O1CA 1JCMP 2XN2A 4JIQA 4PC8A 2ZCGA 3W7KA 2B7PA 1FY6A 1X1ZA 3STGA 4JYDA 1WOBA 3LHUA 1Z48A 1PCKA 1QAPA 1DKWA 1TV8A 3LTYA 3DFPA 3W1AA 2J9YA 1RZMA 5AN7A 4CCDA 3EX6A 1XBXA 1K8ZA 5AHMA 3CC1A 3TKFA 4PODA 2EF9A 1UJPA 4NU7A 4EWND 3USBA 3TFCA 3N19B 1VR6A 1G4TA 2YFOA 3ELFA 3E96A 1XDMA 5FEXA 3NQ6A 3G24A 1LOLA 1L2UA 4UNLA 1QWGA 5FEZA 3WK1A 1V7YA 4JTHA 3P81A 1VQTA 3EXTA 1C8VA 2VC6A 3SY5A 3W83A 4CQ8A 3LGEA 1DBTA 1E51A 4A29A 1ZJIA 2V81A 1GJPA 3L21A 4IGHA 4RXGA 4AXKA 2HMCA 2UV8G 4LOCA 1XBYA 4NNAA 1OYCA 1SO4A 3GB6A 3W7IA 2QDGA 3A9IA 4LS2A 4XTIA 1BEUA 4LWWA 4WX2A 1JULA 2NLIA 4UFLA 5HNRA 3W1PA 3BK0A 4JYEA 4LC8A 1TTJA 1IXOA 4E38A 2JKPA 2Y7GA 1YTDA 2GQ9A 1TV7A 5KINA 1TTPA 2CLOA 4PA8A 1JCXA 1J2WA 3QW4B 2I9EA 4IQLA 3B04A 2Q8ZA 4HNVA 5DXYA 3LHZA 1LORA 1LM1A 1KM6A 2JKAA 5AHEA 4O52A 4D2JA 2WO5A 5TIMA 3L65A 1QPRA 2DP3A 3A5FA 3NQEA 3NYZA 3LCXA 3O05A 5CPLA 3TSMA 5F2GA 1DV7A 4RJEA 4A3UA 4BFAA 1DJQA 4GBUA 4JYFA 4GXMA 4UUIA 3S1UA 1G7VA 1TPUA 1KM4A 3O6DA 4BI7A 4O8RA 4X3ZA 2RDUA 1WDWA 1O5KA 1SO5A 3S5NA 1U83A 2FQIA 3QPZA 3L9CA 2C16A 2VXNA 4K8EA 4MZYA 3W1NA 5AHFA 1XM3A 3P5YA 5LNVA 1S5VA 1PVNA 5EMUA 1F5ZA 1KTCA 1P0NA 2QAPA 2C3ZA 5HR6A 1G6CA 2G96A 2GUUA 4FEZA 1IIGA 1KM1A 1MEWA 3TE9A 3OVQA 1H61A 3CEUA 3C4UA 1DORA 5D2VA 3F1QA 3G1YA 2R8WA 1EA0A 2J9ZA 3C52A 2Y6ZA 3TXVA 4K7VA 4DF2A 4UMCA 3IGSA 3PC0A 4HN4A 5D2WA 5FESA 1W5QA 4DELA 5FF4A 5K9DA 5I3GA 1TPWA 4ZVJA 2ZQ0A 3MBFA 1T99A 2EKCA 1IXQA 2Y7DA 1Z41A 1ZNNA 1JCLA 3SGUA 5G1TA 3TSDA 1VH7A 3AJXA 3OVRA 1K8XA 5DCEA 3KVKA 4FX7A 3QF0A 5AYZA 2ZA1A 3EX4A 3PULA 4HPXA 4QJ1A 1JQVA 3CEPA 3TW6A 3H55A 5DN1A 3M41A 1XFBA 4JN6A 2F7FA 1KFKA 4O1AA 1YLVA 4IPJA 2QCDB 1VZWA 4DBEA 3M5VA 1TJPA 1QMLA 1SZFA 3UYCA 2BXVA 1YXDA 4UXDA 3VNDA 1JCYA 1KM2A 1EWDA 3QM3A 2WSQA 2FLIA 1TCDA 4JX4A 3MI6A 2HS8A 1TYGA 2FPVA 2QCLA 3THAA 4PFMA 1NF0A 3KFTA 1R2TA 3SGZA 3MO7A 3W7DA 3BPWA 3HB9A 3LCFA 3DHFA 3M5YA 3MBDA 5K4XA 4I7UA 5FF0A 3TQ0A 3ZFHA 1ICPA 3UNDA 1Q45A 5E0KA 1N55A 2OT0A 4DF0A 3S1VA 1L6WA 3LCWA 4FX6M 3LHYA 3W76A 4DBDA 4WXZA 3DKLA 4K8HA 3P5ZA 3W2JA 4LT9A 3KRUA 4MFEA 4PL2A 4O15A 4RR4A 1EUAA 3F4WA 5D2XA 2PURA 3E49A 3NQGA 1F73A 3GKAA 3NPWA 1GPWA 4UC5A 2E77A 2GVJA 1T0OA 3ATYA 3GK0A 4GNJA 2O7SA 1L6SA 1H5YA 4K36A 3O1NA 4KFPA 4GUFA 4O4WA 2FPYA 5CPMA 3KHJA 3UPBA 5CZSA 4ZQMA 3HPSA 2C19A 1EEPA 4O0ZA 4O19A 5L9FA 2E68A 3EX2A 4JX6A 4FNPA 4AH7A 2J88A 1GTEA 4O50A 3G1DA 5G4EA 2C6QA 4YCPA 3GR7A 1GVOA 3W7OA 4JIPA 1PE1A 2YW3A 5BNKA 3KRSA 4ZQOA 1OK6A 2EHHA 3VE9A 2Y63A 3O8AA 3GDLA 3H53A 1ICQA 3STFA 1ML1A 2YZRA 3ZS4A 4W9TA 1LRQA 3G0UA 4GUGA 5D09A 4O16A 4XBSA 2ZTJA 3NQDA 3NL5A 4IMCA 3M16A 3MJYA 2W79A 3C2OA 1A5SA 3OHIA 4ADUA 3MP4A 4OWGA 2V9DA 3QRHA 3PAJA 3TFXA 1KTBA 2ZZ3A 3W7GA 2G95A 3LTPA 2CLMA 3FFSA 3BG9A 4M6VA 1F05A 1X7FA 3UQNA 4IOTA 2E5BA 3R89A 1SO3A 1QOPA 3SI9A 1EB3A 4JTLA 3A22A 3LBMA 1EP2A 3MW7A 4BI6A 3BW2A 4O57A 4DF1A 1UCWA 4TU1A 5CSRA 2QJIA 2Y88A 2EPHA 3UZ5A 1YXCA 3DXIA 4UTLA 3EB2A 2CZEA 3O63A 3DHDA 3N9SA 1ZAJA 3E0IA 4RZ5A 5C6MA 1FDJA 2ZA2A 3IVSA 4R33A 5FF3A 3NQ8A 1K3UA 2Q8LA 4X22A 1XL9A 5ABTA 5AYXA 2WSRA 3QSTA 3LBCA 3O6YX 2Y7FA 4PCFA 4GJ1A 2QUVA 2NX1A 3NQCA 2ZRYA 5LNRA 2WOQA 1H7OA 2Z6JA 3GDMA 3TSBA 4P61A 5H91A 3TROA 2Z1BA 3NQVA 4FO4A 4WY0B 1D3GA 4GUIA 3CLMA 3B8DA 1X1OA 1DOSA 2A6LA 2QCMA 3QMSA 4JY9A 3W74A 4LV9A 1TSIA 5F4SA 4AVFA 1KLYA 2YXGA 4TX9A 4IMFA 3CWNA 1DL3A 3R8RA 1G69A 1RV8A 3CU2A 1SR9A 1VPXA 2C15A 3M43A 1IXPA 1YDVA 3MMTA 5BOOA 3IEBA 3OBKA 4UR8A 4DO4A 2XN0A 2QCHA 3JS3A 4HSOA 4O12A 1SSDA 4WQ6A 3EWBX 3W84A 1DQWA 4JGDA 4Y8FA 3LLFA 1NEYA 1ME7A 4LVBA 3SSJA 1KFBA 4FNRA 3RF9A 3QSRA 2CU0A 1OX5A 1FDZA 3KVJA 4DXVA 1EX5A 3UZJA 3GIYA 1OFOA 4UMBA 2FPTA 4Z1AA 4WJEA 5DLCA 5D02A 4ONVA 3IIOA 1X6UA 1KLZA 4K38A 3W3OA 1VCGA 2QCEA 3HBLA 1VLIA 5I3FA 4FB7A 1XC4A 3RLUA 3PUOA 1FWNA 3BG3A 4RCXA 5CG7A 2PE4A 3B4UA 3QYQA 3JR2A 5EY5A 5G2WA 1KBJA 5FI8A 4HT3A 5HQEA 1Q6OA 3HG2A 2A5HA 3B03A 4PEKA 2YW4A 3M47A 3NGJA 3TUUA 1SW7A 4PTNA 5HULA 4ALDA 3BO9A 4UFKA 4N02A 2W6RA 4O17A 4EVZA 1OFQA 3K30A 2WNNA 3G1FA 1FWTA 4LVGA 4FHAA 1LRNA 1EWEA 1YPIA 3N2MA 5CPNA 1GVFA 1TTIA 2BZNA 2OX1A 4MLRA 1ADOA 4FXSA 5K4ZA 2GOUA 2GQAA 4N2YA 1KM3A 2DZVA 2Y85A 2C0AA 4UTWC 3EWWA 3BG5A 3A21A 5AB3A 3TDFA 1KM0A 3PBYA 3GR8A 3L67A 3CT7A 3V1PA 3RMJA 3HGSA 3OVPA 1TIMA 4N9DA 2RDTA 3SJ3A 4NX0A 4CQ9A 3F03K 3DI0A 2VFEA 1NAL1 3M6YA 2ZRZA 4UTKA 1ZAHA 4YXGA 1TPB1 4GRSA 4IX2A 3C2EA 2PRLA 1DHPA 1B4KA 3W1QA 3T4CA 4OHQA 3PF3A 5EA9A 1AL7A 1IF2A 4AB4A 4KKXA 1NSJA 2TMDA 4MJMA 1YDOA 2ZRXA 3S5YA 4M7TA 1LTDA 3NL6A 1DJNA 4WXYA 3OA3A 1OFEA 2HSAA 2OMAA 4LW7A 3W07A 4JTJA 4N4QA 1OFDA 1WQ5A 2C14A 4DQWA 1SU5A 3IVTA 4Y9AA 1A5AA 5G4WA 2FDSA 2YX0A 1LCOA 2Q3OA 1AL8A 1GQNA 1LBFA 2NWSA 3FJLA 5DELA 1IXNA 4RZ6A 4DO5A 1OABA 2X30A 3S5OA 4UTIA 4M6PA 4UTJA 3WFAA 1MXSA 2I14A 2NX9A 3UWZA 3TQKA 3C3NA 1SFLA 4O18A 5K7JA 3LRMA 2NXIA 3TH6A 5E1QA 4JTSA 4R34A 3U6WA 3W86A 3Q2DA 4OT7A 2RHGA 2RH9A 1TPH1 1OX6A 4FIQA 3L2IA 1Z44A 4RV8A 4Z0JA 3W7JA 5U4NA 3ABOA 3MHGA 3ANYA 2ZZ2A 4AHPA 1OFAA 3INPA 3NOEA 4EOUA 1K7FA 1HTIA 3QFEA 3EWUA 3TNOA 4ORMA 4JEQA 1HO1A 3W1XA 3W1MA 3C8FA 2QJGA 1K02A 3UWQA 3PBWA 2C1HA 1DQXA 4JTKA 4K39A 2J6XA 1OX4B 1PIIA 3I68A 3G3DA 3E02A 3W9ZA 1B9BA 1L6YA 3TAKA 1OYAA 1OFRA 2GQ8A 2CWNA 3IIVA 2ZFAA 5K9XA 3GXNA 2YR1A 4HSNA 4JTUA 1GVRA 5FF2A 2H8ZA 2E09A 2RDWA 3CHVA 4DPPA 4BF9A 3O15A 1W37A 2NUWA 3ABSA 3IGXA 3PBUA 2V2HA 4NVTA 3TQVA 1UBSA 1VYPX 4O28A 2WQPA 2ZBTA 1R2SA 4NJKA 1QO5A 4AF0A 4QQ3A 5F2MA 3W6YA 4LVFA 3L5MA 1GYNA 4UFHA 5HWJA 4QAIA 1NFBA 4E2BA 1K7EA 1Q6RA 5EPDA 3W75A 1RPXA 1I2PA 4O54A 2CZFA 1HG3A 1M7OA 1HO4A 1OVDA 3B0VC 3V75A 3TC6A 3W1UA 2JGQA 3W7CA 3N2XA 3QZEA 3NVTA 4MY9A 1JUBA 4GUHA 3S42A 1QNVA 2ZRUA 3GDRA 1ZENA 2V5LA 3M44A 1M6JA 3TXZA 3W7QA 2C18A 1FDYA 2OCZA 2ATMA 1MZHA 2X1RA 1KFJA 3G1AA 3SW6A 2QUTA 3QQ0A 1OHLA 1TO3A 2Y62A 4IMGA 1S3HA 3EWYA 3QQ1A 2JGYA 1TRIA 1M5WA 4KFOA 4ZQCA 5HWNA 2OZ0A 3UPWA 4JTTA 1EPXA 3KAOA 1V5XA 4LUIA 4BR1A 1L9WA 4JICA 1MEIA 2A7PA 1TJRA 2IQTA 1I2QA 2VEMA 4TR9A 3IGUA 5AOUA 3N9RA 2BWGA 4FNSA 3W7PA 1HL2A 4H4IA 4TMCA 5LGXA 5KMYA 1LBLA 1ME8A 2E1DA 1VLWA 1OJXA 3P82A 3QMRA 4NX5A 4NJGA 3CIWA 4U4MA 3M5XA 2E6FA 1YTEA 3CM4A 4MLJA 4NXSA 3S1WA 3HJZA 1KBIA 1FWSA 2KZHA 3E9AA 1H63A 4O1BA 4LS1A 3NL3A 3S9YA 3W2LA 3W7MA 3LDVA 4CCEA 4DEFA 3TJLA 2W0UA 3PSVA 2ZA3A 1KFCA 3SFKA 3P67A 3L5AA 3C2FA 3PUEA 4QNWA 1XKYA 1THFD 2QCNA 3NQMA 5I3KA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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