3MO7A

Crystal structure of human orotidine 5'-monophosphate decarboxylase covalently modified by 2'-fluoro-6-iodo-ump
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KELSFGARAELPRIHPVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSLARELLQLADALGPSICMLKTHVDILNDFTLDVMKELITLAKCHEFLIFEDRKFADIGNTVKKQYEGGIFKIASWADLVNAHVVPGSGVVKGLQEVGLPLHRGCLLIAEMSSTGSLATGDYTRAAVRMAEEHSEFVVGFISGSRVSMKPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKRGSDIIIVGRGIISAADRLEAAEMYRKAAWEAYLSRLGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Novel interactions of fluorinated nucleotide derivatives targeting orotidine 5'-monophosphate decarboxylase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Uridine 5'-monophosphate synthase
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 98
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature ec 2.4.2.10: Orotate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2010-04-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3mo7A00
4ML9A 5K4ZA 3TMQA 5DELA 4MYXA 5D30A 1DJNA 4JR5A 5D2XA 3QSTA 1PV8A 1BWKA 4LV4A 1UBSA 1FQ0A 1G4PA 1ME7A 4OGZA 2RH9A 5AYZA 5AB3A 1XDMA 4BI6A 1OYCA 3IV3A 3RMJA 3MP3A 4IXHA 3G0SA 1IXPA 3CWNA 2FJKA 3P8IA 5LZLA 1W5PA 1KM2A 4UIOA 4UTKA 5CZ0A 4NVTA 4K8HA 5KTLA 2Q3RA 3W83A 3UPBA 3M7WA 3PAJA 1OG0A 3VNDA 3TE9A 1H1YA 5EPDA 2ISSA 3O1NA 3IGSA 5H91A 4EF9A 4WQ6A 3G0XA 1G6CA 4NZJA 4MIMA 1OFEA 3C2EA 1AL7A 4JGDA 3KVMA 3V75A 2CLFA 5E93A 3BVJA 3R5EA 1JJKA 5BW6A 4ADSA 4S1FA 2FPYA 1FDZA 1W5QA 3SW6A 3PBYA 2H90A 1R2RA 1T96A 4G1KA 3GAKA 3QW4B 3ELFA 5C55A 3HO8A 1K8XA 3ATZA 1VYSX 4JD4A 1JQVA 1RPXA 1QO2A 2J6XA 3Q37A 2C19A 5GVJA 4KKXA 3TV8A 3LTSA 4FNSA 5CG7A 3HOJA 3GAYA 3PG8A 3MBFA 3WFAA 1OFRA 3WJSA 5D09A 3W72A 2A7PA 3W1QA 5HWMA 4H4IA 3W7PA 4LC6A 1M7PA 4A21A 4X9SA 3GIYA 3IVUA 1Z44A 5AC6A 4O28A 4IMGA 1OX4A 2NWRA 4O4WA 4O10A 4QNWA 4IMEA 4JTIA 3HG3A 4LW7A 3V1PA 1PE1A 1H7RA 4KWWA 1GVQA 2VC6A 3QW3A 2C15A 3W1PA 3HG4A 3NO5A 1Z41A 2G97A 5L6UA 1TPDA 2I14A 3TXVA 2YCEA 2XN1A 3NQCA 3RLVA 3S5ZA 3GB6A 4O18A 1F73A 3S1UA 4BR1A 2HSAA 1C9DA 3L0NA 1SO3A 2CZ5A 8TIMA 1TTJA 2JGYA 4POCA 4Z1AA 1KM6A 3SZ8A 1TB3A 4OHQA 1XCFA 4K37A 2YW3A 1KTNA 3ZWTA 1O5XA 3WK0A 3LLDA 2NX1A 1J4EA 3TH6A 2RDTA 3MBDA 3NQ8A 3A5FA 1G7VA 4RZ6A 1J2WA 2H3BA 3TA6A 1WDWA 4IXXA 4EIVA 1X1ZA 5D05A 3W86A 4RCXA 1DHPA 4O53A 4O8RA 3LCWA 1EEPA 3LGEA 1WXJA 1Z42A 1NSJA 2NUWA 2WSQA 4LOCA 2VFDA 3W1RA 2B0MA 4ORIA 1LLWA 2ABBA 5BMXA 3ANYA 5FI8A 3CIWA 2A6LA 3IVTA 3TC6A 1LZOA 3MI2A 2GUUA 1GYLA 4JTTA 4JTJA 3LOTA 1H60A 4OV9A 1KFJA 3TSMA 1W5NA 1VH7A 2ALDA 3NQ6A 1TQXA 3FYOA 1VCVA 3P8JA 3H53A 5F4SA 4HT3A 4TIMA 5BNKA 1JCNA 2P0OA 3W7KA 4EWND 3PR2A 4KFOA 1VCFA 1SO4A 2VEPA 2D73A 2ZYFA 3LERA 4K8EA 4Y8FA 2GVJA 3UWVA 4K39A 4M7SA 4UTMA 2J9YA 3LHVA 1T0OA 5IBXC 1DQWA 1W54A 2YYUA 3B0UX 2EAWA 1K8YA 1DJQA 1WOBA 3I7QA 5AOUA 2DZWA 3MMTA 4JYEA 2E6FA 2HS6A 3M47A 3IIOA 1FCUA 5TIMA 2QJIA 4BFAA 2VFIA 3KFTA 3T7VA 1KLYA 1QCWA 4Z08A 4E0CA 2H8XA 4DF2A 2WO5A 3IIVA 3W7MA 2Y63A 4PTNA 3M1ZA 3GDMA 3Q58A 5D38A 4ADUA 1SO6A 2E5CA 4WOZA 1H50A 3MP4A 3O05A 2CU0A 1GQNA 2Y70A 4R34A 5CPNA 4UXDA 3S6DA 1JULA 3W74A 1O94A 4K7VA 3L0KA 4AWSA 3WJZA 5D2VA 3UPWA 1QDSA 1FWSA 1H1ZA 2R14A 3A21A 4CQAA 4LVDA 4GRSA 2R94A 4O0ZA 3MO7A 1HL2A 2CLLA 3LCXA 3NQ7A 2C13A 1L6SA 3O16A 4Q32A 1YDOA 1EWEA 2A2IA 5LGZA 2QJGA 5F2IA 4JTFA 1EP2A 5K9CA 1F05A 1ML1A 1ALDA 3PUOA 1P0NA 1LBMA 3MYOA 4MZ8A 5CPOA 4ZQCA 3FKKA 1JCXA 5C2XA 2EHHA 2Z6IA 4BWLA 3NDOA 3TUUA 3NXFA 2R8WA 4O19A 2ISVA 4QIUA 3W1AA 1OF6A 1EB3A 4CNPA 3R13A 1QPRA 3Q94A 1GG0A 1FWRA 5BRBA 3OVPA 3LCHA 5F1VA 1VLIA 2QCEA 2QCHA 3W1UA 2FB2A 2C14A 2ZCGA 3ZR4A 1OFAA 4MVAA 1SW7A 1BWLA 3W6YA 1GYNA 3MI6A 1C8VA 3LHWA 1TTQA 3HGSA 4DQWA 2B7NA 3Q2DA 3PS7A 4NQ1A 4Y90A 4UNKA 1GJPA 4JX4A 3CT7A 3HG2A 1VHCA 1U83A 2CLKA 2VOMA 3A24A 1MSSA 1XFBA 1GPWA 1K7EA 4HSOA 3PBVA 1KBJA 3LCGA 5LHFA 3O15A 3S1WA 2C1HA 1OJXA 1KFKA 4A3UA 4TMCA 4RR4A 1KA9F 1JCJA 2W0UA 1XBZA 4WD0A 4MFEA 1U5JA 1DOSA 1O4UA 3F03K 3LHTA 3TQKA 2O7QA 5K9XA 4EOUA 5K4XA 1I2NA 2OJPA 3QJAA 3E12A 1V5XA 3QMTA 4RK8A 1L2UA 4MUZA 1LOLA 3FKRA 2KZHA 3ZS4A 5I3FA 1PHQA 4UTJA 3UNDA 4LWWA 2B7QA 4N02A 3T55A 5CKSA 3PM6A 3E02A 5C54A 2Y89A 4JYDA 4O57A 3W7HA 3FFSA 3ABOA 2LLEA 1W1ZA 4DF0A 3L5MA 2HTMA 5G1TA 5T26A 4UMBA 2YW4A 5BMWA 5CZSA 1JUEA 3P61A 1JRCA 3W71A 5FF3A 1PCWA 3KXQA 4UTIA 1S5VA 3O8AA 2X30A 3S8HA 1X7FA 2OMAA 4NX5A 3P80A 1ZCOA 4I7VA 3EKZA 3O6CA 5HWJA 4GFSA 4X2RA 3NM3A 4JTUA 2DJLA 3A22A 1LRQA 1AW2A 3AJXA 4FIRA 4QJ1A 1EPXA 1K7XA 3NPUA 1FUYA 2VFGA 1KM3A 1TPEA 3UXAA 1TV5A 3D0CA 1IGSA 1ZY9A 4IMFA 4L4MA 1O95A 3IGUA 4LVAA 4ZQPA 1WAUA 1WBJA 3TXZA 4FF7A 5AC8A 3NNTA 1QPQA 5D33A 4NJIA 3TQ0A 3GXTA 2YFOA 4YL2A 3DHDA 1WQ5A 1D3HA 5DCBA 2X1RA 2Y7GA 4B5NA 3BLIA 3NQ2A 4DO4A 1LCOA 5FEPA 4M6QA 4A2SA 4O13A 4GUGA 4P2VA 1EWDA 2NX9A 4Z0JA 4YXGA 1W56A 3NQEA 1VHNA 2H8ZA 2TPSA 2DJXA 3KVJA 4XKYA 2ZRVA 3W75A 2DZPA 2F7FA 4GJ1A 4N2YA 2A7RA 3G1VA 3F4WA 2ZA2A 1TPWA 3B04A 3G1YA 3QQ0A 1H63A 5CPMA 2B7PA 3STCA 1F7BA 2PURA 4NJJA 4O0KA 1R46A 3W7JA 4CNOA 4K6AA 4UMCA 3TC7A 4JTSA 4X22A 4N9EA 1S5WA 3P7YA 4PC8A 3CPRA 3GDRA 2YX0A 3TX9A 4DO5A 2DP3A 3LHZA 1MEWA 1F76A 4XBSA 1PHWA 3W3OA 2Y6ZA 5G1YA 3HPZA 4HNTA 3LHYA 5F2GA 4LVBA 2VFEA 5EBUA 1D3GA 2FPTA 3NQFA 2NV2A 1EA0A 4FHAA 1ZFJA 3BK0A 4MZYA 5E1QA 1JCLA 2FPVA 3CHVA 4YCOA 3LCFA 5K9DA 1R47A 4BI5A 3TROA 3LCIA 1AK5A 4OT7A 4HPJA 4BK9A 2R91A 2ZTJA 2DZUA 1BEUA 4WXZA 3G1XA 4RXGA 2NXIA 2YXGA 5AHIA 1SPQA 1XDLA 3DXIA 3LX9A 3P67A 5HULA 3S1VA 5HR6A 4M7TA 4IMCA 3FLUA 5AYXA 4AEOA 3R12A 4FB7A 1YDVA 4UR7A 4O14A 4MFDA 4XUGA 3N2XA 4WY0F 2FB3A 2W79A 3IIPA 1FXPA 4LUIA 1VYPX 2GJNA 4CCDA 3B03A 3G24A 1TTPA 2B4GA 3LLFA 1MXSA 3EWZA 5A5WA 4QISA 3QM3A 3KX6A 2PRHA 1GVOA 2JKEA 1LYXA 3TQVA 5IBXA 5DXYA 4CQ9A 2TRSA 2GPTA 3PWAA 1W8SA 2O7SA 1H7NA 2TYSA 3NQAA 1RR2A 2QR6A 4DPPA 2EF9A 5G4EA 1H62A 3M9YA 2ZZ2A 3C2OA 4DO6A 3PUDA 1F6KA 3DFSA 1KM4A 1MEHA 4TMBA 3E0IA 5F2MA 4QAIA 3G1AA 1Q6LA 3NZRA 3RF9A 1TMHA 1VCGA 4AHOA 1N55A 4QM1A 5D2TA 3G1SA 2ZZ4A 2I9EA 5G2HA 1TO3A 1VGAA 3S5NA 1RZMA 4AHPA 1KLZA 3CQ0A 2V30A 3LV6A 3MHFA 5J5DA 1RQEA 4UTHA 1NEYA 4FNPA 5KZEA 3I68A 5LHEA 3HF3A 4UTTC 3P84A 2GJLA 1AW1A 2Y61A 4JTKA 1G4EA 1K7FA 4GXMA 1TV8A 2OX1A 4MJMA 2Q8ZA 1VC4A 1F6PA 3KHJA 5G4WA 3S1XA 5H2ZA 3NR0A 3QZEA 5F4XA 4LTSA 3GXPA 2FIQA 3HPXA 3DKJA 2ZFAA 3F1QA 3GKFA 3OIXA 4QSHA 2JBMA 3IVSA 2Y85A 1SFLA 4AF0B 3DFTA 5D37A 1ICPA 2OT1A 4QITA 1VS1A 1EP1A 3W1NA 3BGGA 1FXQA 2A1YA 1VZWA 4UFHA 3G1HA 3IRDA 1DKWA 2E6AA 3NPXA 3G8RA 1TQJA 3B0VC 2JKAA 5HR7A 4W9TA 5D03A 2C18A 1KM1A 3SIZA 2A21A 3H54A 4DEFA 3ABQA 2QEZA 1OVDA 2V5BA 2QF7A 3O6DA 1ZALA 3VE9A 1DVJA 4JTEA 4UC5A 2VEIA 1ONRA 3N34A 1IIGA 4NJHA 4EVZA 2JGQA 4NUWA 4IJBA 3M5ZA 1I45A 4XTDA 2QDHA 3W07A 3W7IA 1SZNA 2Z1BA 2YR1A 3WJYA 2ZRXA 3ATYA 4O12A 1YPIA 3C2FA 2G95A 3U2OA 4WX2A 3IIZA 4IUOA 3PB2A 5D04C 1DBTA 2X1SA 2XN0A 3NYZA 4LRSA 1K3UA 1H61A 4R53A 1FY6A 2QUTA 3BG3A 2OZ0A 1FCVA 3NQDA 2RDWA 3DI0A 1VJIA 2CZEA 3GDLA 1GG1A 1JCYA 2EKCA 1AL8A 2E77A 3A23A 3GNDA 2YGYA 1NAL1 3EWWA 4O4VA 1QMLA 1F2JA 4JEQA 5KMYA 1NVMA 2NLIA 1VRDA 3KAOA 1XL9A 1QPNA 3LM7A 3M16A 3KVKA 4RXFA 3U8GA 1L6YA 3W2UA 1C29A 5J5RA 4LVGA 1QPOA 3N9RA 3R8RA 4CQ8A 4CCEA 2DZTA 1OK6A 4IGHA 3L0GA 1XUUA 2VEMA 5I3GA 3LBMA 5DBUA 3T40A 5LNUA 1QWGA 1UUOA 2B7OA 3P5ZA 3W7GA 3OEXA 1ZHAA 1G4TA 2QCCA 2ZRWA 4LU0A 4ALDA 1AMKA 1N7KA 1V7YA 4JY9A 3DU0A 5LGXA 3A9IA 3TFXA 4GUHA 2X16A 1YDNA 3W1XA 4N9DA 2CLIA 1OK4A 3OHIA 5E0KA 4O52A 5IM51 1TIMA 3L5LA 2YZRA 4S2BA 1A5CA 3HGRA 3L2IA 3UQNA 2H3DA 3UZ5A 2ATSA 4DPQA 3G1DA 3ABSA 1JVNA 1NF7A 3TK7A 3TW7A 3FS2A 3CLMA 2Q3OA 3HJZA 4L4LA 2YPIA 1G69A 1JR1A 1I2RA 3W22A 3TSBA 3PSWA 4UUIA 1RD5A 4NJGA 4JIQA 1YTEA 3WK1A 3ABRA 3C3NA 1SR9A 1EIXA 1YPFA 4FNQA 1JQXA 3TR2A 4HNVA 4MY1A 3L68A 3N14A 1ZJIA 1K8ZA 2BTMA 2Y7EA 3NL2A 2DZSA 3STEA 1GVSA 2HS8A 3EX1A 3GYEA 3WJXA 3VI2A 2X2GA 2WKJA 4X3ZA 1KFEA 1QOPA 2E5BA 4NXSA 3W84A 4BF9A 1SSGA 1H7PA 3PG9A 5CZJA 5F1UA 4AXKA 3TAKA 3KRZA 3W76A 2QCLA 3A5VA 4GUIA 5F2LA 1ZENA 3UY8A 4CCCA 3LI1A 1SUXA 3W85A 3F4NA 3P74A 1Y0EA 2Y7FA 1EUAA 1QR7A 1DQXA 3G18A 3LXBA 4OQVA 4Y9AA 2RKXA 3QMSA 1OHLA 2C16A 3HG5A 3PSVA 5DCDA 3EX6A 3DZ1A 4ZZ9A 3QEZA 3O06A 3W7CA 1PS9A 4UTWC 3CEPA 2Z6JA 3WK2A 1KFBA 3N19B 3NQVA 4UTUA 2Y88A 2PCQA 4AWTA 2NXGA 4I9AA 4KFPA 5TQLA 1OX4B 3E49A 4WOQA 3W7NA 2AAMA 2V2HA 3O6YX 4XWUA 3BW3A 3KRSA 3SSJA 1TPC1 4OWGA 4GBUA 1CW2A 2WOQA 3HGJA 4O54A 3KRUA 1TCDA 2E6DA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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