3MO7A

Crystal structure of human orotidine 5'-monophosphate decarboxylase covalently modified by 2'-fluoro-6-iodo-ump
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KELSFGARAELPRIHPVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSLARELLQLADALGPSICMLKTHVDILNDFTLDVMKELITLAKCHEFLIFEDRKFADIGNTVKKQYEGGIFKIASWADLVNAHVVPGSGVVKGLQEVGLPLHRGCLLIAEMSSTGSLATGDYTRAAVRMAEEHSEFVVGFISGSRVSMKPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKRGSDIIIVGRGIISAADRLEAAEMYRKAAWEAYLSRLGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
publication title Novel interactions of fluorinated nucleotide derivatives targeting orotidine 5'-monophosphate decarboxylase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Uridine 5'-monophosphate synthase
total genus 98
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature ec 2.4.2.10: Orotate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2010-04-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3mo7A00
1VYPX 1T0OA 2V2DA 2BXVA 4JTIA 4M6PA 3W70A 2VFDA 3HPZA 1QOPA 3CHVA 1QWGA 2WQPA 4XTDA 3CIWA 1T8XA 5DCEA 3B8DA 1HL2A 4NJKA 1JUBA 2YW4A 3NQFA 3TC7A 1OF6A 2WV8A 4JTSA 2C0AA 5TBOA 2E09A 1VQTA 3B03A 4QISA 1LORA 4TIMA 2A21A 1FWNA 1IXNA 2DORA 4IXXA 1XDLA 5CZSA 4HPXA 2QDHA 4JTHA 2ISWA 3WJXA 1LBFA 1FQ0A 1IF2A 2A4AA 3CU2A 4E38A 5L6UA 3NL2A 3N3MA 1EIXA 2YZRA 3I65A 3PUEA 4NJGA 3Q37A 4TMBA 4QJ1A 1OVDA 3G8RA 1VH7A 1TPUA 4JTUA 2ZZ6A 1K8XA 1W5OA 3HGJA 3L0NA 2X1TA 1KM3A 1Z48A 1GJPA 5LHFA 3NAVA 5F2GA 1X8FA 3H55A 4IQLA 2P10A 3S1UA 2J9XA 4I9AA 4WOQA 3TU9A 4Y6GA 1G6CA 4QITA 2Y63A 4LS0A 3UPWA 3W7JA 4AWSA 3MO7A 4ZQNA 5L9FA 5KINA 4WZHA 1ZAIA 5U4NA 2B4GA 1WAUA 4IMFA 3QM3A 2GJNA 3HGSA 4HNNA 3MWAA 3BV4A 2PE4A 4O13A 4NQ1A 1VR6A 4FHAA 5D2YA 3LCWA 3LCIA 1F74A 1L9WA 1R2TA 3L5AA 3SIZA 3PY2A 4S1FA 3TW7A 2Z6JA 1TV5A 3NM3A 5A8GA 4AB4A 4DPQA 4WQ6A 4IXHA 3NZ1A 4O1DA 2OJPA 5CZTA 3NL3A 1RQEA 1SW0A 2VENA 4L4MA 1G4EA 2NWRA 1H7NA 1QNVA 4WUIA 1HG3A 1MZHA 3T40A 3WJZA 2ZRUA 1SW7A 1TJPA 1OX4A 3MBFA 1ZHAA 1H7XA 1ICQA 2ZZ1A 4J9JA 3GDKA 3NQ2A 4XBKA 2Y62A 1XBZA 5DBUA 3S8HA 1VLIA 3N14A 5FF4A 4JICA 2NUWA 1W5MA 4C1LA 4AH7A 2QKFA 4L4LA 1TV8A 5CPMA 3WK3A 5E1QA 3NXFA 3SW6A 4PL2A 1FDJA 3BG9A 4WJEA 4NX0A 2CWNA 3NEVA 4AF0B 3C4UA 1JCJA 3QMTA 1PHWA 1TYGA 1Z42A 4IPJA 2H6RA 1YDNA 1S5TA 5G1YA 1VZWA 3T4CA 4LC8A 4QNEA 2DZXA 3W76A 3IVTA 1S5VA 3MHUA 4POCA 1IXOA 1W5QA 1F6KA 3DHDA 1M7OA 2TRSA 4LNYA 3G1YA 2A0NA 2A6LA 3RFAA 2ZA1A 5AN7A 1JR1A 3W1PA 4RZ6A 4UTTC 3P7YA 3SY5A 5F1VA 1SQ7A 3O6YX 1TPFA 4PODA 5BMXA 3GR8A 4O57A 1VLWA 1OK4A 3NQDA 3LLDA 2HSAA 3WK1A 2BLEA 1XUZA 1LTDA 2GQAA 3W7DA 5IM51 3W2LA 1K02A 2Z2UA 4YCOA 1SZEA 3SFKA 1LDCA 3C52A 3IV3A 4JTGA 1W54A 3NDOA 5DN1A 4UTUA 4BR1A 2DJLA 3O15A 4TX9A 2OX1A 3I68A 1FUYA 5D04C 2O7SA 5LNRA 3WJYA 5TQLA 3A23A 3W2KA 2JKPA 4B5NA 4HSNA 3C2FA 5LZLA 1TB3A 2CLEA 2V82A 3B0VC 1UBSA 2CLHA 3G22A 5EA9A 5CZ0A 1ALDA 1AW1A 6ALDA 2V2HA 3TMQA 4WD0A 1OYBA 4WXYA 3LHTA 4UNLA 1VHNA 1R47A 3HPXA 4LV9A 3TNOA 1H1YA 4PL1A 3GLCA 3PB0A 3RNDA 1AL8A 3QSTA 1H7RA 1KFBA 4K37A 4FXRA 4NU7A 2P1FA 3C2RA 1OYAA 1X1OA 3PBUA 4KFOA 2E5CA 4N9CA 4IWWA 4BFAA 4BI5A 1BEUA 2GJLA 2PRLA 3YPIA 1SZFA 2CLLA 4GUGA 1H60A 4Z1DA 4XKYA 4ZVJA 3UWZA 2GVJA 2Q3OA 2W0UA 2X1RA 1NAL1 3THAA 3BLFA 3FYPA 3IIXA 5G2HA 1SSGA 5K9CA 1KBJA 3NPWA 1C9DA 1BWLA 2B7OA 1AL7A 1I2QA 1K7EA 3DU0A 3NPVA 2V9DA 5AHMA 4NNAA 2TPSA 1B9BA 3R13A 1QMLA 2FPTA 2I9EA 1KFKA 4UUIA 1WDWA 4BI6A 4OWGA 3W1MA 3B4UA 3NQAA 1YDOA 3HG2A 2FB3A 3PVFA 3TAKA 4ADSA 2UV8G 3QQ1A 1RPXA 1O4UA 4N02A 4BK9A 4LTSA 1WBHA 1K7XA 3SECA 3M43A 3W86A 1TCDA 2YGYA 2OZ0A 4AF0A 4LWWA 1FY6A 1AMKA 1IIGA 4QAIA 4RK8A 1EPXA 2Y7GA 4PH6A 1JRBA 5DXXA 1XBVA 1W37A 2ZTKA 2VC6A 3DGRA 3B0UX 4IJBA 1EWDA 3G18A 5FF3A 2J24A 3LCHA 2VELA 1XM3A 1TPVA 3EX1A 3UXDA 4CNNA 1YXCA 2ISSA 2JKEA 5HNRA 1R2SA 2V2CA 5DCDA 4U4MA 5DELA 5U7SA 3VE7A 3W3OA 4E2BA 3NQ7A 3QMSA 2VFGA 4UFHA 4EWND 3CEPA 4QIUA 2Y7FA 1L6WA 1GVRA 1GG1A 1VS1A 3CQ0A 2YCEA 5TIMA 3ZS4A 2YDAA 1EP1A 2A7NA 3A5FA 2EHHA 2E6DA 2HS6A 1G7UA 5HJLA 2NLIA 3LTYA 4YLWA 2LLEA 3UWWA 3NPUA 1EB3A 5D02A 2VKZG 1JCYA 3GVGA 2ZZ4A 3LBMA 2QCEA 4JTJA 3L65A 3E0IA 2TMDA 4HT3A 3MHFA 3MHGA 4FNPA 3C3NA 3QJAA 3PG9A 3RU6A 1W56A 5LHEA 3HOJA 1Q3NA 1XKYA 3N34A 4WY0F 1VCFA 5FF7A 3LHVA 3C2EA 4JY8A 3SZ8A 1QPRA 4FO4A 4YXGA 3C0JA 2FB2A 1OFQA 4TR9A 4IX2A 1H63A 3PSVA 4AAJA 1TPH1 1QAPA 3S5YA 1W5PA 2A85A 5I3HA 4Z1BA 2Y6ZA 3BPWA 3S0CA 1GWJA 5D2WA 2YYTA 5BOOA 4FX8A 4YL2A 2PURA 3W75A 4FNQA 3GXNA 3NQ6A 5AYZA 3TC6A 3B04A 2QCGA 3PWAA 1GEQA 5G2IA 4GUJA 3QPYA 4JDYA 1TPB1 1SFLA 4M19A 2VEPA 3CT7A 3W1TA 4I7VA 4JYDA 2AGKA 2WO5A 4LVAA 4ONVA 1Q6QA 1FWRA 3T7VA 4YMZA 4GXMA 1JQVA 4N9BA 1L2UA 2B7PA 1SZGA 1T99A 3G0SA 1RV8A 3NQMA 4LOCA 1L6SA 4NJIA 4MY9A 3NL6A 5C55A 1GTEA 4Y8FA 2CLIA 2C15A 3N9SA 2QEZA 3W72A 2ZRZA 3GDTA 4MVAA 2NUXA 1YYAA 4LC6A 3M0ZA 4O18A 4FF7A 1GVQA 3NR0A 3BGGA 2NWSA 2CU0A 3UY8A 1IIHA 1YPFA 2H8ZA 2QF7A 3A22A 1I4NA 5DY2A 1F05A 1U83A 2H8XA 2EF9A 3M5ZA 1H61A 3LCXA 3TK7A 5K3VA 3TFCA 1MO0A 1CW2A 4NNBA 3WFAA 2ZRVA 3L68A 4MUZA 3P67A 3LRMA 1OHLA 3P60A 4OU1A 2JGQA 1ZCOA 1SO6A 1KFLA 3FLUA 4E2DA 5G2WA 2CZFA 1KW1A 3SSJA 1Q45A 3NQEA 3OVRA 5D05A 3GDRA 5D33A 4DO6A 2E6YA 3LOTA 4FNTA 1P4CA 4GC4A 3W87A 4GUIA 4JX5A 3BK0A 4AWTA 3EKLA 1EWEA 1TQJA 1F76A 4NT0A 2YYUA 3W1LA 3LGEA 4A2SA 4JX4A 5EKYA 5C2XA 1P0NA 3ABRA 4MYAA 1I8JA 3M5XA 3BLIA 2GQ9A 3TX9A 4HN4A 1SO4A 4HNVA 1GTHA 3DFPA 2RKXA 3BARA 3ABSA 3QF0A 5ABTA 3GNNA 2FJKA 1LOQA 4O52A 3N9RA 3FJLA 4R7JA 1W3NA 2ZRWA 3W1QA 1E51A 3QEZA 4UTWC 1GYNA 1OFEA 4X2RA 3ZWTA 3TIMA 2Y7EA 3P84A 1KTCA 2C19A 3OHIA 2X2GA 3I7RA 1S5WA 2KZHA 3DZ1A 2QUVA 1THFD 3PM6A 3TV8A 4MFEA 1YLVA 1S3HA 3GKAA 1G7VA 4MLRA 4ZQCA 1VRDA 3ELFA 4AHOA 2G95A 3DFOA 2ZA2A 5KTLA 3EWUA 1ONRA 3IIVA 4CLMA 1TJRA 1JCLA 3A5VA 3CC1A 2Y85A 2ZRYA 3KVLA 3L2IA 1YTDA 4K8EA 3QZEA 3W2MA 4EVZA 3LBCA 1GOXA 3DFQA 5FESA 2H3BA 4Z0JA 3E02A 5G4EA 1FXQA 1VCGA 1TTJA 3UZ5A 2B7QA 2BZNA 5AHIA 3B05A 1HUVA 2QCDB 3PSWA 4O1AA 5F2MA 3TR2A 2FPVA 3LXBA 2WSYA 2ZQ0A 4M6VA 4U28A 5F4SA 2DZTA 4LW7A 3L0KA 4RKAA 1YDVA 3KOFA 5D32A 3SGUA 2E77A 1OFPA 1AG1O 3NG3A 3NNTA 1K8ZA 1QR7A 4R33A 1QO2A 1LOLA 4GJ1A 3HGRA 5KSWA 5LGXA 4A22A 3U8GA 4KFPA 1K03A 3TA6A 3EX6A 5CG7A 4MLJA 1DHPA 5LNSA 1HO4A 1LRTA 2QCNA 3STGA 3EXTA 3FEMA 5HWMA 5EPDA 2C16A 3VE9A 2Y88A 2Y89A 3BVJA 4OV4A 3GIYA 2EKCA 3N73A 4O0ZA 1V5XA 3NQVA 3IEBA 4HPJA 3Q94A 4O53A 1W5NA 4N4PA 1PCKA 3CM4A 5AHEA 3TXVA 1GQNA 1I2RA 3O16A 4ZQPA 4FNSA 2H3DA 2NZLA 2ZZ3A 1W3IA 2GPTA 1BKSA 3W7NA 1FWSA 3TSDA 3HQ1A 1X1ZA 4JEQA 1FWTA 4TU1A 4YCPA 2J6XA 3STEA 1N7KA 1LOSA 4WY0A 1N8FA 3S42A 1SO3A 5FF2A 5HUOA 3GDLA 4K36A 4ZMGA 8TIMA 4BWLA 3P8JA 4BWLC 1XUUA 3W74A 1KLYA 4MPQA 2OCZA 2V30A 4MKNA 3FJ6A 1QDSA 1OFDA 4GUHA 2V81A 4JTLA 4N6EA 1OYCA 1PHQA 3QYQA 3LB0A 3IVSA 3B06A 3E96A 1QCWA 3GZ3A 2GVLA 2WNNA 2VEIA 3UWQA 3NO5A 4UTTA 5LNVA 3IIOA 1LP6A 4JTTA 2V0TA 3DI1A 2W79A 3HG5A 3R5EA 2RHGA 4JXCA 4LVFA 4R53A 1TO3A 4UTJA 2CLOA 4HNUA 5C54A 5HMSA 4DF2A 5BRBA 2FTPA 4LRSA 1P5BA 5AC8A 2BX7A 2Z0IA 2QCLA 5AC7A 3KRSA 4G1KA 3U2OA 2QAPA 2CZEA 1J2WA 2C6QA 4RLIA 3P5ZA 5T26A 3T55A 1X6UA 5K2ZA 3P74A 5CZJA 1RQBA 1I45A 2A7RA 4TO8A 1OFBA 3W7IA 1Q6OA 1YXYA 4RXFA 4XZ9A 2WJZA 1Q6RA 2CLKA 1G4PA 5G4WA 1TV7A 3LTSA 5K9XA 3GB6A 3BW4A 4QSHA 4AEOA 1JVNA 4ORIA 3IGXA 2ZZ2A 1LCOA 5G5IA 1KLZA 1HO1A 3EWZA 4CQAA 4UR8A 3KFTA 4MYXA 4DBEA 1LBLA 2QCMA 3STCA 4RR4A 4IMDA 4RX0A 1O60A 4NJJA 4MJMA 3V1PA 4ZZ9A 5EY5A 3UWVA 4LUIA 3EWWA 5FEPA 2ZFAA 1W3TA 5AOUA 2WPBA 1C29A 1WBJA 4NZFA 1CI1A 2XFWA 1K8YA 1FDYA 4LUJA 4FIRA 3G1SA 3INPA 3H53A 5I3IA 3DAQA 1SZNA 2Q3RA 4UTLA 3GR7A 4O16A 3DH7A 1EA0A 1F73A 2E5DA 1G69A 3EXRA 3PUOA 3NVTA 4HNTA 1H51A 4K8HA 1GVSA 2A7PA 3ABOA 1KM0A 3DENA 1J4EA 1B4EA 1D9EA 1OFOA 3W73A 3R89A 4Q32A 1B57A 3LI0A 3O6CA 1VC4A 1FCQA 2NXGA 5D09A 3C6CA 1FWWA 3GNDA 4UFKA 3MUXA 5AHLA 2GVGA 1VHCA 3ANYA 4O0KA 3UYCA 4UIOA 1ME8A 3QQ0A 1MSSA 2E1DA 3NM1A 4FXSA 1OJXA 3LM7A 3W84A 4H6KA 2YXGA 1A5SA 1V7YA 3HJZA 3OEXA 2J88A 5D2TA 3E9AA 2P0OA 1OFRA 2V8ZA 3WJSA 2X16A 1FDZA 3CIXA 4BF9A 4UMCA 4PFMA 3GAKA 4O8RA 3MP3A 1DV7A 2VFIA 1WA3A 1Y0EA 5GVJA 1DL3A 2QR6A 2FFCA 4MOZA 3LCLA 4X22A 1KTNA 4O17A 2GOUA 2ABAA 4JS3A 3OIXA 1H5YA 2E5BA 3VKJA 4UTHA 3R8RA 3UWYA 3DFTA 1OFAA 3PBYA 1ZALA 3LTPA 1HFBA 1ICSA 3ABQA 3G1FA 2NV1A 1LRNA 3A9IA 5I3JA 1ZY9A 2WSRA 3W7HA 4RZ4A 4DO4A 4Z1AA 1TPC1 3W7RA 3G0XA 2C13A 5F2IA 2CZ5A 3DHFA 2Q8ZA 1SUXA 5AC6A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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