3MSGA

Enzyme-substrate interactions of ixt6, the intracellular xylanase of g. stearothermophilus.
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
NSSLPSLRDVFANDFRIGAAVNPVTIEMQKQLLIDHVNSITAENHMKFEHLQPEEGKFTFQEADRIVDFACSHRMAVRGHTLVWHNQTPDWVFQDGQGHFVSRDVLLERMKCHISTVVRRYKGKIYCWDVINEAVADEGNELLRPSKWRQIIGDDFMEQAFLYAYEADPDALLFYNDYNECFPEKREKIFALVKSLRDKGIPIHGIGMQAHWSLTRPSLDEIRAAIERYASLGVVLHITELDVSMFEFHDRRTDLAAPTSEMIERQAERYGQIFALFKEYRDVIQSVTFWGIADDHTWLDNFPVHGRKNWPLLFDEQHKPKPAFWRAVSV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Enzyme-Substrate interactions of IXT6, the intracellular xylanase of G. stearothermophilus.
rcsb
molecule keywords Intra-cellular xylanase ixt6
molecule tags Hydrolase
source organism Geobacillus stearothermophilus
total genus 132
structure length 330
sequence length 330
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2010-04-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3msgA00
1QI4A 5A1AA 3PHAA 1CPUA 1BF2A 3BAXA 4MB5A 4PBGA 1JZ7A 3AS0A 3MANA 4MNJA 4JL2A 3EDDA 2E8YA 3GYCA 5HPOA 4AZGA 4UOQA 1JF5A 3OGSA 2VZUA 2XJ7A 5ABFB 4P8WA 3OIHA 1OD0A 3VIPA 1JZ2A 3VO0A 3GZAA 2J7GA 1WE5A 1MQQA 3GXDA 2VQTA 2CBVA 1W9DM 4XUYA 4W85A 4NI3A 4TXEA 4PMQA 3RILA 3W26A 4M24A 4TVCA 2QMKA 3PZTA 4GZIA 3APGA 2AOSA 5D9OA 3W4RA 3RJXA 2YOCA 1Q4NX 3SUTA 2F8QA 3OGVA 1LLOA 3FN9A 2HVMA 2QMJA 3AHVA 2WKGA 1WDSA 2VOTA 4UQ9A 1V6VA 4M80A 1E43A 4GZEA 4CN1A 2Z1KA 4IM4A 2OWXA 2XM2A 3NSNA 3ARVA 4QAWA 5CPTA 3EDEA 3NDYA 1KGWA 1OIFA 2WW5A 3HN3A 4Z2HA 1JDCA 3AHTA 4CU7A 5IHRA 3WH9A 3WNMA 1M7XA 4J27A 1H0GA 4KGJA 3WQWA 2UY4A 1CLVA 5E0CA 1UD4A 1BG4A 1BGGA 3WNOA 2VRKA 5EMYA 2G41A 3VIHA 1GOKA 1E71M 1E4MM 2GVYA 3EMZA 1Z32X 1OWQA 4LQ1A 1WDPA 1PAMA 1M01A 4JKKA 3VVGA 4M81A 1VFFA 2VVSA 1JD9A 3W38A 3G6MA 3POCA 1ITXA 1B9ZA 1JYWA 2QPUA 1HJUA 3EBVA 2WSKA 1N82A 2CNCA 1JZ8A 1WPCA 3ZQ9A 1XSJA 3T2QA 3B8SA 1V3HA 1XH2A 1NARA 1CGUA 2RGMA 3OB8A 3VGBA 3CHCA 4GO9A 3WFLA 4Z2JA 2J7DA 3WQ6A 1EXPA 3WH8A 3WN6A 1WAWA 2X1IA 1QPKA 2CPUA 4FMVA 1QNSA 3VGGA 1JYNA 5GNYA 2CXGA 2BHYA 1QNRA 3VILA 3FAXA 3BSGA 2J47A 4P7QA 1OT1A 1TFVA 4K68A 1KXVA 1U30A 4PSPA 3G6LA 1MW1A 3AIEA 1R85A 1W9XA 1HXJA 2WWCA 2JFEX 3L2LA 2ZUVA 3AFBA 3IAPA 4MPKA 1W9BM 1NP2A 2DQXA 1I75A 5A95A 1VB9A 4AD1A 2G3IA 3RMEA 5HOSA 1MXDA 1E6NA 1W91A 3PZIA 1K9FA 2CKSA 4D72A 4AZ7A 4A3HA 4WJXA 2WAGA 1UR9A 2A3EA 5A2BA 4PUDA 1VFUA 3D5HA 4WKAA 2XM1A 1E6XM 3GDBA 1W32A 3RM8A 1AQ0A 2PWHA 1J0HA 1VJSA 4L4PA 4F9DA 2G3MA 1D7FA 4JCLA 2J4GA 1EQPA 5JBDA 1LG1A 4MB3A 2X2YA 1QI5A 2PWFA 1UR0A 1HVQA 4F79A 2JIWA 3KZSA 1HT6A 5DO8A 3L4UA 3VKKA 1W3KA 1KB3A 4UTFA 1V3KA 2VZOA 1JAEA 1HVXA 1HF6A 5TD4A 3VD4A 4PMOA 1UWSA 2WANA 4CCEA 3EDFA 4BQ2A 2GDVA 3VD7A 3OLIA 1R86A 2JEQA 1HKJA 4RL3A 4J3VA 4X0NA 3UERA 4B16A 5IFPA 2CETA 5HPCA 1KGXA 1BVNP 3CIVA 1E4LA 1JDDA 1KCLA 5D9MA 3VD9A 1WZKA 5JUVA 3S6TA 2XUCA 3VNYA 2VR5A 2QLYA 1DP0A 5CZKA 4NRRA 4PMZA 2WCSA 3WD2A 3AISA 5CG0A 2Y5EA 3PZNA 4UOZA 4H2CA 3ZR5A 1UZ1A 4AW7A 4W5UA 4JCMA 3AI0A 4MDPA 2E3ZA 2ZX5A 1S46A 3ZMRA 1SYTA 2XTKA 5FL0A 4AMCA 1ZU8A 3CZKA 1W3LA 1W9UA 6CGTA 3VDAA 4AWEA 2VZVA 1VEOA 1C91A 3LMYA 1FFRA 3ZT5A 4WF7A 2Z1SA 4AZBA 1UWRA 2W4XA 5BRPA 5A8MA 4GKLA 2VR4A 4H8VA 3MU7A 1V02A 2IXVA 3ZT6A 4D6CA 4HPHA 1E6ZA 2WHLA 2CBIA 5KZ6A 5A94A 2J7CA 4GI6A 4XZBA 1NH6A 2XVPA 3VIGA 4UZSA 4EKJA 3UR8A 3I3DA 2BS9A 4WKHA 1FH9A 4YPJA 2WLYA 2WBGA 1UYQA 4F66A 3CHDA 4UFMA 1CBGA 3ARQA 2VC9A 4DM1A 1K6AA 1UD3A 4NZCA 1JG9A 5CJ5A 1E55A 2PBOA 1H11A 3AXIA 3AXHA 3VDCA 3UG3A 1QW9A 4AXNA 4TX8A 3CMJA 4HU0A 3HJEA 3PZVA 1CECA 4MDOA 1TE1A 3DC0A 4AZCB 4ZEPA 3BMVA 3U57A 2J25A 3MS8A 1OSEA 1TA3A 4M82A 3ZIZA 4V27A 3ALFA 3VIKA 3A4WA 2WNWA 2ZUTA 5E6ZA 2DH3A 1R7AA 4P7NA 5ABGA 1QHPA 4P7LA 1CGWA 3ECQA 4OBRA 3SIMA 4NRSA 3LPOA 1JFHA 3VIFA 3ZM8A 1HP4A 1IT0A 1J18A 1LL6A 2WVVB 4JHOA 1XRVA 2E0PA 4IPLA 4UQEA 1PEZA 4U33A 4WKFA 3CUIA 3SCNA 1CIUA 1MFUA 1WNOA 1K9DA 6TAAA 1UH3A 3PZGA 1QNQA 1JDAA 1ODUA 1EO5A 2F2HA 3W27A 3AS1A 5FCZA 3VDBA 3AJ7A 2PWGA 4KGLA 4JFTA 2CYGA 3WEZA 3CUFA 3CUHA 5HBFA 3AQUA 1CDGA 3OZOA 5FL1A 3WDIA 2VCAA 2A3CA 2YBUA 4U5IA 1E1FA 3WL1A 4PSRA 1EH9A 2TAAA 3WUGA 1R7OA 4XB3A 4R5EA 1HJWA 3CZLA 1JYXA 1E3XA 4E4PA 3FY1A 4IISA 5E6YA 3SCUA 2YDRA 4F8XA 1GUVA 5CPQA 1CXHA 3ZJKA 2GJXA 2D0FA 1V6XA 2YLLA 4W7VA 1SFSA 4UOJA 1E6PA 1BFNA 4R27A 3A3HA 1W2PA 1WO2A 1MW2A 4F9JA 4ZXLA 3AHXA 1EHNA 1GOIA 3VINA 3W81A 2CBUA 2J77A 3EDKA 3K46A 4PCTA 2EPNA 4MB1A 1JZ6A 2W5FA 2AMGA 4UR9A 3WMCA 1UR1A 4DWSC 1E6QM 3W25A 3WNLA 3T0BA 2F61A 3KWXA 2VCCA 1V0NA 3VNZA 5D9PA 2WHMA 2XVGA 2BFGA 5EB8A 1GPFA 1NOWA 4W7UA 2WLZA 3AIRA 5FIPA 5A6LA 1B3YA 1H0IA 2VVNA 5DEZA 3VU2A 5CQ1A 3AHYA 1UR2A 3T09A 4ZFMA 1XD0A 3WUBA 1VIWA 1EOMA 2XFYA 5JIWA 3KL3A 4ACZB 2B31A 1NQ6A 2VX5A 3NUKA 3ARXA 1UHVA 3VMNA 4FLRA 2DIJA 1MXGA 1W2VA 4JIEA 5ABFA 2WC7A 3CUGA 4HMDA 3OG2A 4OOZA 3SUVA 4CU8A 2CERA 6A3HA 4HMCA 1PX4A 1X6NA 4H04A 2OSWA 3ZSTA 5BCAA 1FA2A 4MJ4A 5HXMA 2J78A 2BY0A 1OIMA 1W3JA 2BHZA 4KH2A 1HJXA 4BQ4A 3VUPA 3EMCA 2BY2A 1UKPA 3ARPA 2WKLA 1YQ2A 5HNNA 3N1AA 2A3HA 1B2YA 1SMAA 1VBUA 1E9LA 1J9YA 1QNOA 1V6YA 5FOOA 4TVDA 3WNPA 1CZ1A 4OJYA 4AY1A 4KRTA 3ZJ8A 2PI6A 3GH7A 4AIOA 3N18A 1XD1A 1UOKA 1HJQA 1I1WA 2J7HA 3WIJA 1XCXA 4CGTA 1EO7A 4PTVA 1L0PA 2GK1B 4CD7A 3W24A 1OGBA 1QI0A 4PMNA 1G01A 4H8HA 1KBBA 1BPLB 5LA2A 1ISVA 3WF2A 1KXHA 3L4WA 2Y8VA 1EIBA 4GI9A 2XPKA 4GZJA 4X9YA 3BH4A 4M8UA 2OYLA 3MMUA 4E2OA 4CVUA 3SUSA 3WBAA 1BYAA 3VX0A 1FP9A 4UFLA 1BVZA 5CLTA 2A3BA 2WHKA 3S2CA 1ODZA 3GXFA 3BGAA 4MAZA 1FFQA 2VX6A 3AMKA 1E6SM 3NJ3A 3CO4A 2OYMA 3WBEA 1V0LA 2X0YA 1I1XA 1AQMA 3WL0A 4ATDA 3WKZA 5DFAA 4PYSA 3GH4A 4P8XA 1MYRA 1E70M 5CGTA 3HMCA 2Y2WA 4B9YA 3VMOA 4JZ5A 1K9EA 4GINA 1UKSA 1SR0A 4HA3A 3THCA 1IZKA 4U5KA 1HL8A 2YA0A 5CSYA 5A6KA 1NWUA 2YIHA 1XSIA 4UFKA 2WVTA 1VF8A 4UFJA 4UFHA 4D6GA 4S3JA 1DWJM 1G5AA 4ZE4A 2ZX6A 3BAJA 2VJXA 4U2YA 1GOWA 5A69A 1LWJA 4QLKA 3PTQA 2J8GA 4PMYA 2CHNA 2FHBA 1CGYA 1CXEA 4TTGA 4P8UA 2YKKA 4D6JA 4UQDA 4PTMA 1DHKA 2PWDA 2WMIB 3RM9A 1UWUA 1US3A 2G8ZA 2XVNA 1B1YA 1QHOA 1XC6A 3WENA 3OLDA 3GNOA 4JKLA 3B9DA 5IXEA 3RM4A 4ATLA 5CSUA 4JHZA 1DWHM 1GJWA 2RGLA 3RIKA 3T2OA 8CGTA 1GOOA 1TVNA 3BXWA 4GI8A 4AIUA 3PZQA 4BCEA 2VRJA 2V3GA 5DMYA 1GQLA 3WQVA 1A3HA 1H5VA 4BA0A 5F7UA 5I6SA 2CESA 1LL7A 4P8VA 1JGIA 5DF0A 2W92A 1ZBCA 1GONA 4Z2GA 2VUYA 1E0WA 5BXRA 2WMGA 3WY1A 4RE4A 1CXLA 1V0KA 5A6AA 3WNNA 1V3JA 1NM9A 1QOXA 1CTNA 3BSHA 1F4HA 5BRQA 4U3AA 2V38A 3UG5A 5FD0A 1GCYA 4CD6A 3KE0A 2XG9A 4M1RA 3PBGA 2O9TA 3L4VA 3WQ5A 1B3ZA 5BWFA 3FW6A 1HJVA 3II1A 4GQQA 5A6BA 3AS3A 1V3IA 4FLQA 1ZBVA 3TOPA 2YJQA 2PBGA 4JFUA 1EDQA 2BVTA 1HJSA 5E09A 3DYOA 4D6IA 2ZX9A 2PWEA 1JI1A 1OGSA 1WB0A 4H7VA 1O7AA 1UD8A 2VCBA 3AZTA 2VX7A 1E56A 3F5JA 5AYIA 5ABHA 2WMFA 2XGBA 1QBBA 4V28A 4EANA 1QBAA 1VAHA 4L4OA 3IJ9A 1UH4A 2EXOA 4QCFA 2E4TA 1Q6GA 3GBEA 3WMSA 2DGAA 1MVYA 4HA1A 3GM8A 2D24A 3VIOA 4LGXA 4C7DA 7CGTA 3FAWA 4W89A 2NT0A 1HX0A 4M29A 3CPUA 3AROA 4AZCA 2CBJA 1FOBA 1HIZA 1DTUA 3CBWA 4HTYA 4UQAA 3AS2A 3OZPA 2DSUA 2QF8A 5I23A 2YA2A 3I3BA 3WNKA 1GHSA 3PTMA 3M46A 2OLHA 2WK2A 1GHRA 3K4AA 2GUYA 4MNKA 1O6IA 3QGVA 2DIEA 4D71A 4LYQA 2DSKA 3N17A 3QOMA 1ISYA 3SURA 3DECA 4PCSA 1AQHA 3W28A 3ALGA 1JIBA 1H1NA 1W1PA 3K8LA 2WVVA 4AEFA 1NWRA 1UD2A 1AVAA 3ZT7A 3AMDA 1ESWA 3DHPA 1FH8A 4PMVA 1VRXA 1R87A 3VGFA 1J01A 2WMKA 4DUVA 1XV8A 4GO8A 3WUEA 1AMYA 3VTRA 4BZYA 1E5JA 3RO8A 5CLWA 4J28A 2VI0A 3MUZ1 1XGZA 3BCFA 2ZOXA 5A8OA 5HDRA 2HISA 2DT2A 2QV4A 1Q6CA 1E72M 3AXXA 4PTWA 4W87A 4ML4A 5A2AA 5CGMA 4MTVA 3VD5A 3T2PA 2VL4A 1E3ZA 1LF1A 3W0KA 1KGUA 2X05A 1GQJA 4BQ3A 4AD0A 1IZJA 3E1F1 1QNPA 3KL0A 4HOXA 4B15A 2G3NA 3B9EA 3LPFA 4AC1X 1LL4A 2JE8A 4A4AA 3VGHA 2ZUSA 1LG2A 3VPLA 2VZSA 1C8XA 4JAWA 5IHSA 5JBEA 2D2OA 4AD5A 5BROA 3AZSA 2FGZA 3NDZA 1HP5A 4D6HA 3N9KA 1RP8A 1KR0A 3K8KA 4UZUA 1QI2A 2YDSA 4WK9A 1UG6A 5D8ZA 3VIIA 3VGEA 4UQCA 4KMQA 3WDHA 4OOUA 3WDJA 1SMDA 3D3AA 1NWSA 4MJ2A 2J7BA 1HKKA 3CZGA 3W6LA 2WC3A 4DWSB 3N11A 4UCFA 2O9OA 1GOMA 1HN1A 3AMLA 3ZSSA 1B3VA 3DHUA 4D1JA 2YL8A 5A6SA 3W82A 5LA0A 3OLGA 4AD4A 2O92A 4ZXOA 2XFFA 1JZ3A 4TTUA 1EHAA 1KWGA 1OGGA 3WH7A 1BLIA 4UFIA 1VENA 5I79A 1GZJA 3AIWA 3L4TA 1BSIA 1ZL1A 1C90A 3MV11 4LYPA 1F4AA 2DSVA 1BYCA 3MSDA 1CLXA 3WSUA 3RPMA 1E6RA 1FP8A 3CLWA 1H4PA 1XSKA 4ACZA 1CWYA 3VX1A 2XGIA 1GVIA 4C7FA 1XYFA 4RE3A 1ZBKA 1KFWA 1V6UA 1PX3A 2WMJA 4J3UA 2FH6A 2DSWA 2J62A 4MNLA 2EPKX 2VT0A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1QI4 A;  5A1A A;  3PHA A;  1CPU A;  1BF2 A;  3BAX A;  4MB5 A;  4PBG A;  1JZ7 A;  3AS0 A;  3MAN A;  4MNJ A;  4JL2 A;  3EDD A;  2E8Y A;  3GYC A;  5HPO A;  4AZG A;  4UOQ A;  1JF5 A;  3OGS A;  2VZU A;  2XJ7 A;  5ABF B;  4P8W A;  3OIH A;  1OD0 A;  3VIP A;  1JZ2 A;  3VO0 A;  3GZA A;  2J7G A;  1WE5 A;  1MQQ A;  3GXD A;  2VQT A;  2CBV A;  1W9D M;  4XUY A;  4W85 A;  4NI3 A;  4TXE A;  4PMQ A;  3RIL A;  3W26 A;  4M24 A;  4TVC A;  2QMK A;  3PZT A;  4GZI A;  3APG A;  2AOS A;  5D9O A;  3W4R A;  3RJX A;  2YOC A;  1Q4N X;  3SUT A;  2F8Q A;  3OGV A;  1LLO A;  3FN9 A;  2HVM A;  2QMJ A;  3AHV A;  2WKG A;  1WDS A;  2VOT A;  4UQ9 A;  1V6V A;  4M80 A;  1E43 A;  4GZE A;  4CN1 A;  2Z1K A;  4IM4 A;  2OWX A;  2XM2 A;  3NSN A;  3ARV A;  4QAW A;  5CPT A;  3EDE A;  3NDY A;  1KGW A;  1OIF A;  2WW5 A;  3HN3 A;  4Z2H A;  1JDC A;  3AHT A;  4CU7 A;  5IHR A;  3WH9 A;  3WNM A;  1M7X A;  4J27 A;  1H0G A;  4KGJ A;  3WQW A;  2UY4 A;  1CLV A;  5E0C A;  1UD4 A;  1BG4 A;  1BGG A;  3WNO A;  2VRK A;  5EMY A;  2G41 A;  3VIH A;  1GOK A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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