3MUIA

Enzyme-substrate interactions of ixt6, the intracellular xylanase of g. stearothermophilus.
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
NSSLPSLRDVFANDFRIGAAVNPVTIEMQKQLLIDHVNSITAENHMKFEHLQPEEGKFTFQEADRIVDFACSHRMAVRGHTLVWHNQTPDWVFQDGQGHFVSRDVLLERMKCHISTVVRRYKGKIYCWDVINEAVADEGDELLRPSKWRQIIGDDFMEQAFLYAYEADPDALLFYNDYNECFPEKREKIFALVKSLRDKGIPIHGIGMQAHWSLTRPSLDEIRAAIERYASLGVVLHITALDVSMFEFHDRRTDLAAPTSEMIERQAERYGQIFALFKEYRDVIQSVTFWGIADDHTWLDNFPVHGRKNWPLLFDEQHKPKPAFWRAVSV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Enzyme-Substrate interactions of IXT6, the intracellular xylanase of G. stearothermophilus.
rcsb
molecule keywords Xylanase
molecule tags Hydrolase
source organism Geobacillus stearothermophilus
total genus 129
structure length 330
sequence length 330
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2010-05-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3muiA00
3CBWA 3WEOA 3MO4A 4U2YA 1E72M 4CD4A 5A6LA 5ABFA 1UR9A 1CXIA 3VKKA 2BY0A 3RJXA 2WMJA 4UZSA 3VD3A 1UH3A 1JDDA 2QLYA 3LPGA 1DWJM 1E1EA 2UWFA 4MAZA 4U31A 4OUEA 4JIEA 1UQYA 2XVLA 3QHNA 4UFIA 3PZGA 2W4XA 1LG2A 2GJRA 2WHLA 1MW0A 2QMJA 5E9AA 2C8NA 1WZKA 1UZ1A 4AZ6A 4PTMA 1JIBA 2AOSA 2XTKA 3EBVA 2X09A 5A95A 1V3HA 2UY5A 3CO4A 1KQYA 4PRWA 1ISWA 4U5IA 1Y7VA 4JL2A 3OGVA 3ZOAA 1BVZA 1FA2A 2CITA 1V6WA 1OM0A 2D0GA 5CJ5A 4D1JA 3FHAA 1F4AA 1L0PA 4MTVA 3UG3A 2OWWA 4XZWA 2XM1A 1EOKA 2WHJA 3CZKA 4UOJA 3PZTA 2WZIA 1HNYA 4UQCA 4H04A 3WDQA 1CGWA 1B3ZA 2O9OA 3VGBA 3CZEA 4AY1A 1ECEA 1JF5A 2E4TA 3W28A 2J47A 3OGRA 3WBEA 1G5AA 3ARQA 4MJ4A 1UHVA 2DSWA 2X2YA 1V0KA 1GUVA 3VM7A 4CU8A 3PZNA 2ZUMA 4IPLA 2JF7A 1BGGA 1KFWA 2XJ7A 2OSYA 3BAWA 1KWGA 2XIBA 1Q6CA 1LG1A 5M3WA 5BXPA 5I6SA 1GOWA 2D2OA 5CSUA 3IJ8A 1QVBA 4UFKA 4UTFA 1C91A 4PMVA 2BVYA 3LPOA 4AWEA 2E9MA 3AMLA 1QI2A 1CWYA 4MADA 2Z1KA 3VU2A 1Q6FA 5F7UA 5HPCA 3WF3A 4AZGA 2XIIA 4QP0A 1XCXA 4B15A 1UQZA 3L4WA 1DWGM 2VURA 3CUFA 4IUGA 3K46A 2QV4A 1CGTA 1HKKA 2VL4A 2XGIA 3ARYA 1HX0A 4MB4A 5D9OA 2D3LA 4WLCA 3W82A 3PTMA 2DT0A 4QCFA 3WEMA 3GBDA 3OLEA 1TA3A 1UKPA 3OLGA 3VGGA 2IXUA 5I3DA 5CPQA 3TTSA 1DEDA 4V27A 4WK9A 1W1PA 1B3VA 4HOZA 4CD5A 2BXYA 1J12A 1C93A 2EBNA 2WMGA 1TVPA 4TOQA 1OCQA 3WBAA 1EDGA 4JCMA 4MDPA 4HA1A 3RO8A 2VRKA 4WKFA 5AY7A 4E8DA 2GFTA 2D0HA 4W93A 5D9NA 3WDRA 4P7OA 4FLSA 3K8MA 3IK2A 1DTUA 3K8KA 4WIWA 1DHKA 4HP5A 2IXVA 3I3BA 4PSPA 4MDOA 3VDHA 4MB3A 1D7FA 1NARA 1TE1A 4PMZA 4NI3A 1E6QM 4QLLA 2W5FA 1OSEA 2JEPA 3F5KA 2ZX5A 5FCZA 3WEZA 5LA0A 2VZSA 3CUIA 3ARSA 3HU7A 2ZOXA 4FK9A 4XB3A 5CZKA 3AMCA 4W8LA 3WFLA 4B9ZA 2BV9A 3N11A 1OT1A 2DH2A 1YQ2A 5DO8A 1I1WA 1GQJA 4JKMA 4KMQA 3SUWA 2WHKA 4TVDA 2VO5A 1GOQA 2ZWYA 1M04A 1XH1A 5D8ZA 4PMYA 1V0MA 1JI2A 2CERA 3AIEA 4XZBA 2XVKA 1FHDA 2Y24A 1E4NA 1O6IA 3VPLA 2WCSA 3UCQA 1BLIA 2G4FA 4S3KA 1PEZA 3BAXA 1W9UA 1JZ5A 3U5YA 2VX5A 2CHOA 2V5DA 2J7HA 3PZVA 1PZ2A 3ZSSA 3T2OA 2ZXQA 4JFSA 1QNPA 3L2MA 3PZQA 1GOIA 4AZHA 2WAGA 2V3GA 1BYBA 2B31A 4DUXA 4B3LA 1VBRA 3B9AA 1FP9A 5A2BA 1FFQA 2GVYA 4HOWA 4GZEA 1HL8A 1R7AA 4GQQA 4AIUA 5KEZA 1BG9A 1OINA 3VIIA 3WNNA 3LPFA 4HZ6A 1C7SA 3K4AA 1CXHA 2J4GA 4BZYA 2VNCA 4HZ7A 1MQQA 3GH4A 2PB1A 6TAAA 1GW1A 2ZUVA 3D3AA 1E15A 1VENA 1EGZA 2VZOA 3PZMA 4A3YA 3MMDA 1EXPA 1VF8A 2VVNA 2J62A 2PWEA 2TAAA 4U33A 1EDTA 4ATLA 1QW9A 4Z2IA 5A3HA 1AQ0A 1BGAA 1JYNA 3NUKA 2FH6A 3PZ9A 2VR4A 2BNJA 1H0GA 4URIA 4MAVA 4AEFA 3MANA 1KGWA 1HF6A 4R27A 4S3JA 3U5UA 3N12A 2W91A 4D6FA 1V3LA 4AD3A 4J3XA 3NSMA 3O9NA 4AMCA 4PMUA 4UFJA 4HTYA 1MW1A 1DWFM 3BAKA 3WQ5A 2WK2A 1X6LA 1W9PA 5EBAA 3GNRA 1VFUA 2XSBA 3WIJA 2OYKA 1Q6EA 2BVDA 1GJWA 1NM9A 3SCWA 3VGEA 5C71A 4UQ9A 3LMYA 3TOPA 4BQ5A 5I5RA 1UD8A 1JZ4A 1UWRA 3SUUA 4B9YA 1JDCA 3IJ7A 5A6KA 2XM2A 4M8UA 4CGTA 4W5ZA 3ZJ6A 5EMYA 2CKSA 3B9DA 2DH3A 5A8MA 3VD7A 1JYVA 3UG4A 4PCSA 1NOUA 4BQ4A 3KZSA 1HP4A 2V38A 2AMGA 4M56A 4J3SA 2G3JA 3ALFA 1V6YA 3GXIA 1HJSA 5JBDA 5CPSA 3RDKA 1BVNP 4V28A 5D9MA 2EPOA 3GXFA 4M82A 4Q22A 5JIWA 1GHRA 4W7VA 2XVPA 1JF6A 3AI0A 3L4UA 1VJZA 3BC9A 4HOXA 1AVAA 1DWHM 4MB1A 3WELA 5A8OA 1XCWA 2X8RA 1R85A 2WHMA 1OB0A 1JNDA 3WD2A 3OBAA 3SUSA 1ZU8A 3SCRA 1HP5A 2DT3A 3HJEA 5A6JA 2WCAA 2YBUA 3TONA 3WH6A 1QHOA 3CZGA 3IAQA 1CDGA 1NWTA 5JIPA 2VX6A 4MNMA 1KGUA 3QR3A 4FLQA 3FAWA 2BY2A 4NF7A 2RGMA 3L4ZA 5ABEA 5CLWA 2C7FA 3VD5A 5DMYA 3OA5A 2O92A 3POHA 2O9PA 4LXFA 4DWSB 1KGXA 3GYCA 2VI0A 1ISZA 2JIEA 2E9BA 5LA2A 5AYBA 2PWFA 2W67A 1UG6A 2DT1A 4H7VA 4CU7A 4GXPA 1UKTA 5DEZA 3PBGA 1KXHA 2HVMA 3EDDA 3MUAA 3A4AA 1UR4A 5BXSA 2ESCA 2J25A 2DDXA 3DC0A 3S6TA 4AEEA 1KR1A 3PZUA 1GCYA 3VM5A 3BAJA 3KL3A 3GH7A 4F79A 4W8BA 1W3HA 2CBIA 3BAYA 1B3XA 2WZHA 2E0PA 3N04A 3BXWA 2VJXA 3RIKA 4KRUA 5FL1A 4AD4A 2WWCA 2WXDM 1K9DA 4D6CA 4ZE5A 2VQUA 1QI0A 4CN4A 3CMJA 1KCLA 3DHPA 1B2YA 1QHZA 3A47A 1UD6A 1WPCA 3D5HA 3WQVA 4J3TA 1ZS2A 3MUIA 2YJQA 2X05A 1EHAA 2GK1B 3THCA 3T2QA 2E8YA 1BFNA 1XH2A 3II1A 5I2UA 4UFLA 5I78A 3KL5A 1JD7A 4UFHA 1UR2A 1WNOA 3DYPA 2E40A 1GONA 3MV11 4E8CA 3HMCA 3RILA 1WDRA 2IUZA 3AQUA 1E3ZA 3ALGA 3SEPA 1CTNA 4PSRA 5LA1A 3VO0A 5AC5A 4U3AA 3UETA 1UKQA 2YA2A 3UEQA 2JIWA 3WMSA 2ZWZA 3N17A 2XUCA 2VQTA 2YA0A 1UH4A 1HJVA 4F8XA 1NOWA 4B3KA 4F9JA 3APGA 3WFZA 3B9EA 4DWSD 3W81A 1HT6A 1EO7A 5FOOA 2YL5A 3CGTA 3AXHA 2BS9A 1JNEA 4D71A 2J78A 1WDQA 3VDCA 1NWRA 1CENA 1BQCA 3WN6A 2CYGA 5JBFA 2VT0A 4D6JA 1E43A 3CUHA 1TG7A 1TMQA 1W9VA 2J77A 3G6LA 1L8NA 1W9DM 3FNDA 1FFRA 4OBSA 1W91A 3A6OA 1ZJBA 2BXZA 4R5EA 3WMBA 1WDSA 2WLZA 3AIVA 3L4TA 3N15A 5A69A 3NJ3A 3VD4A 5IFPA 1GQLA 2VCAA 3CPUA 5ABHA 2JF6A 5A6MA 1BYCA 2YOCA 3EMQA 5I24A 1CEOA 5CLTA 3DECA 4JAWA 3WF2A 2CKRA 1CIUA 3WUBA 1DP0A 1WKYA 3AOFA 4PTVA 4MJ2A 2EPNA 1PX3A 2YL8A 1QBAA 1E6SM 3N9KA 3SCTA 2EPMX 3RM8A 1UR1A 1V08A 1W1YA 5DT7A 1AQHA 1QNQA 3GXDA 3HN3A 1HXJA 2D23A 4GO8A 4P7QA 1EO5A 4X0NA 3QHOA 4TX6A 1WZAA 3NDYA 2Z1SA 1HKMA 1VIWA 2OYLA 1CZ1A 1E56A 3S2CA 2JALA 3T09A 4FLRA 3TTYA 5BRPA 2EPLX 4MNKA 5E6ZA 3FW6A 3AZTA 2NW0A 1UWQA 3VMPA 2XPKA 1E0WA 4QCEA 3G6MA 3SCNA 1C92A 4YN5A 1NH6A 4UR9A 3RM9A 3M6DA 4HU0A 1JZ6A 2PBOA 2QHAA 5BCAA 1F4HA 1BF2A 3WL1A 2DT2A 1VEMA 1G9HA 2G3IA 1KQZA 1V0LA 1TVNA 1B3YA 1PX8A 2FH8A 1FP8A 4E4PA 1U2YA 1KBKA 3TA9A 1UKSA 3GXMA 1GQKA 3PHAA 1KXTA 4GO9A 2FHBA 3WH9A 1JZ8A 1CPUA 2WKLA 4FLOA 5EB8A 1G94A 3L2LA 2ZXDA 3CIVA 3WDJA 5BXTA 3WQWA 1JI1A 2OYMA 2W92A 3WUFA 2GJPA 4LPCA 4PUEA 1QNOA 1CXKA 2DQXA 2YDSA 4ZXLA 2VUYA 1WB0A 3AIRA 1X1NA 3N13A 3AXIA 1AMYA 1J01A 2WBKA 2J7DA 1M7XA 4N0RA 1Q6GA 2F61A 4UQBA 1RH9A 3ZQ9A 1XD1A 5A8QA 1HJWA 2ZE0A 4C7DA 1OD0A 1H4PA 2ZX6A 5KZ6A 3BH4A 4JHZA 4X9YA 2XWDA 4LYRA 4DWSA 4AZCB 1FH8A 4D6IA 4NZCA 2A3BA 4J3WA 1C8YA 3UR8A 3DHUA 3EDJA 3MUZ1 3PN8A 3CUJA 1ODZA 3I3EA 1R86A 4KGLA 1RP8A 2DSUA 3AHYA 2QF8A 4UFMA 4ML4A 1X6NA 2Y2WA 2OSWA 4A4AA 3FAXA 2CBUA 3SUVA 1JAKA 4UNIA 4HA3A 3LPPA 1EHNA 4OBRA 3CHCA 3NCOA 1VEPA 1TFVA 2G3MA 1GPFA 2PWGA 4AD1A 1K9FA 2GJXB 5CQ1A 1NOFA 1MW2A 2NT0A 1M01A 1VB9A 2WMIB 2W62A 3RJYA 3PZOA 4M81A 3F5JA 2XWEA 3I3DA 7A3HA 4EANA 1B9ZA 2V5CA 3ZMRA 5FL0A 3NYDA 2GK1A 1H0IA 4H8UA 4LYPA 3T08A 4EKJA 3W29A 1ZBKA 2WMKA 1UUQA 4WSJA 4N42A 4RE4A 2J75A 3ZT7A 3AIUA 1A3HA 2ZUUA 2EO7A 5A8PA 2X0YA 3W38A 1GOMA 5C70A 2WLYA 3RMEA 1JZ3A 3BGAA 1ESWA 3VMNA 1JFXA 3AYSA 5D4YA 1XHGA 1CXEA 1JAEA 3BSGA 2WB5A 2XFFA 4CD7A 4CUCA 4GZJA 1VAHA 4JL1A 5HOSA 5A2CA 1J11A 3W24A 4W5UA 2OWCA 1PJ9A 2BHUA 2PF0A 5GQBA 1EQCA 3OLIA 1E6PA 3WMCA 1SYTA 1HJQA 2A3AA 1E4LA 4KH2A 1V02E 3M46A 1V02A 2ZUTA 3WUEA 5BROA 1WDPA 3AHVA 1K6AA 3L4XA 3VMOA 3EDEA 4W86A 1ISVA 1JGIA 5A2AA 4D6GA 3T2PA 2WPGA 1NP0A 3EDFA 4PN2A 1HVQA 3OZOA 4W84A 1ZBVA 2HISA 2FHFA 2ZX9A 4AD2A 4ZFMA 2QMKA 3EDKA 3AMGA 1BG4A 1J9YA 1UKOA 2WC4A 1Q4NX 4BF7A 4MB5A 1MQPA 4C7FA 1NP2A 2QPUA 4Y7EA 1YHTA 3WD3A 3B8SA 1MYRA 1CGVA 3NDZA 4DM1A 3T0BA 3ARTA 5ABGA 1WP6A 1TR1A 3OLDA 2ZXBA 4GIAA 2J7GA 1MW3A 4PTXA 3CHEA 1GJUA 4W8AA 1DWAM 4RE3A 1LQ0A 3GBEA 3VTRA 4OOUA 1OBAA 2ZIDA 3WSUA 2WANA 3GH5A 5AC4A 1BTCA 2WM0A 2D3NA 1B90A 1KBBA 3CZ8A 1EIBA 4CU6A 2Q8XA 3W4RA 1QW8A 3SURA 4UQEA 1BYAA 4J27A 4UQDA 3AFBA 3ARXA 4P8UA 4JKLA 2G3NA 4WKHA 5GNXA 4F9DA 2CESA 3SCOA 1LL6A 4BCEA 3MSDA 3ARPA 4AC1X 1GOOA 3CLWA 3WUGA 1C3FA 3AICA 2BHZA 1PPIA 3WF1A 2PWHA 1MXDA 4U3CA 1OGSA 2BFGA 1K9TA 1XV8A 1XD0A 3VIOA 5A6BA 2EEXA 1AQMA 2AAAA 2FGZA 4GQRA 4P8VA 3WD1A 1XYFA 3BSHA 2O9RA 3MS8A 1GQIA 4JFVA 1B3WA 4QLKA 3W26A 2FHCA 2ZX7A 4AXNA 3ZT5A 4D72A 3AHTA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3CBW A;  3WEO A;  3MO4 A;  4U2Y A;  1E72 M;  4CD4 A;  5A6L A;  5ABF A;  1UR9 A;  1CXI A;  3VKK A;  2BY0 A;  3RJX A;  2WMJ A;  4UZS A;  3VD3 A;  1UH3 A;  1JDD A;  2QLY A;  3LPG A;  1DWJ M;  1E1E A;  2UWF A;  4MAZ A;  4U31 A;  4OUE A;  4JIE A;  1UQY A;  2XVL A;  3QHN A;  4UFI A;  3PZG A;  2W4X A;  1LG2 A;  2GJR A;  2WHL A;  1MW0 A;  2QMJ A;  5E9A A;  2C8N A;  1WZK A;  1UZ1 A;  4AZ6 A;  4PTM A;  1JIB A;  2AOS A;  2XTK A;  3EBV A;  2X09 A;  5A95 A;  1V3H A;  2UY5 A;  3CO4 A;  1KQY A;  4PRW A;  1ISW A;  4U5I A;  1Y7V A;  4JL2 A;  3OGV A;  3ZOA A;  1BVZ A;  1FA2 A;  2CIT A;  1V6W A;  1OM0 A;  2D0G A;  5CJ5 A;  4D1J A;  3FHA A;  1F4A A;  1L0P A;  4MTV A;  3UG3 A;  2OWW A;  4XZW A;  2XM1 A;  1EOK A;  2WHJ A;  3CZK A;  4UOJ A;  3PZT A;  2WZI A;  1HNY A;  4UQC A;  4H04 A;  3WDQ A;  1CGW A;  1B3Z A;  2O9O A;  3VGB A;  3CZE A;  4AY1 A;  1ECE A;  1JF5 A;  2E4T A;  3W28 A;  2J47 A;  3OGR A;  3WBE A;  1G5A A;  3ARQ A;  4MJ4 A;  1UHV A;  2DSW A;  2X2Y A;  1V0K A;  1GUV A;  3VM7 A;  4CU8 A;  3PZN A;  2ZUM A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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