3MUIA

Enzyme-substrate interactions of ixt6, the intracellular xylanase of g. stearothermophilus.
Total Genus 129

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
NSSLPSLRDVFANDFRIGAAVNPVTIEMQKQLLIDHVNSITAENHMKFEHLQPEEGKFTFQEADRIVDFACSHRMAVRGHTLVWHNQTPDWVFQDGQGHFVSRDVLLERMKCHISTVVRRYKGKIYCWDVINEAVADEGDELLRPSKWRQIIGDDFMEQAFLYAYEADPDALLFYNDYNECFPEKREKIFALVKSLRDKGIPIHGIGMQAHWSLTRPSLDEIRAAIERYASLGVVLHITALDVSMFEFHDRRTDLAAPTSEMIERQAERYGQIFALFKEYRDVIQSVTFWGIADDHTWLDNFPVHGRKNWPLLFDEQHKPKPAFWRAVSV
5010015020025030030025020015010050
020406080100120Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Geobacillus stearothermophilus
publication title Enzyme-Substrate interactions of IXT6, the intracellular xylanase of G. stearothermophilus.
rcsb
molecule keywords Xylanase
total genus 129
structure length 330
sequence length 330
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2010-05-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3muiA00
3EDFA 1IV8A 4XUYA 4W8BA 1J0KA 1WDPA 3EDDA 4HA3A 3W53A 1W9PA 1V3KA 1ZL1A 2J79A 1IZJA 4P7OA 2G8ZA 1H0IA 3EDJA 3GH5A 4OUEA 5E6YA 1W9VA 3WNMA 4F66A 3MU7A 1WZAA 4PTWA 2EJ1A 4AEFA 3CHCA 3UR8A 4AY1A 1GW1A 4UQEA 4LPCA 2WW5A 2E8YA 1XSJA 1BTCA 3CMGA 4EAMA 1KGXA 3WD0A 1OD0A 3WH7A 1UWQA 4PEEA 4HOWA 4WK9A 4H04A 1CXKA 1XSIA 1EO7A 1E43A 2MANA 3ZR6A 1CWYA 3CUFA 5E9AA 1UD8A 2WMGA 3WFZA 1CZ1A 2ZX8A 4KRTA 2WC3A 2D23A 2D2OA 3VX1A 1WPCA 1NM9A 2W61A 5A8OA 1B3YA 1CGWA 1OINA 4FK9A 1QNPA 1DTUA 1XC6A 3WEZA 2YOCA 1O6IA 5A2AA 3A6OA 1LJYA 3AOFA 4OJYA 1W3KA 3VD9A 1WZKA 2CETA 2XJ7A 4TVUA 1FP9A 1FP8A 4RE3A 4UFLA 4DM1A 4FLSA 2JALA 3NDYA 3U57A 3PZOA 4W87A 5A8QA 4S3KA 4UFMA 4J3XA 2XVLA 3WD1A 4H41A 1E5NA 1UQYA 3UG3A 2E9MA 3VGHA 2GSJA 1J9YA 2WB5A 1FHDA 4AMCA 4UQBA 4CN1A 1CECA 1MXDA 3CUIA 4D71A 2J8GA 3WD4A 3ZJ6A 3PZVA 4E2OA 1UD3A 4J3VA 1WDRA 2WBKA 1QHZA 1TE1A 5I24A 1KBKA 1DHKA 4PMXA 2VX5A 2JE8A 1EXPA 3RDKA 3L4YA 5ABFA 3IJ9A 5DF0A 3SUWA 4L4OA 1CTNA 5KEZA 3BCFA 5FL1A 3CO4A 5DT5A 4PUDA 4V2XA 4B3KA 1HKKA 1NQ6A 1HJQA 5A95A 5HNNA 1SFSA 4YPJA 2WWDA 4F9DA 1HL9A 3OBAA 1PX4A 3KWXA 2J25A 3MKKA 2CITA 1WDSA 2D20A 4MADA 3A3HA 2WZIA 4GZIA 3GXMA 1Y7VA 4EE9A 5D9OA 3W0KA 4OOZA 2VC9A 2CEQA 3GM8A 3BMWA 4XX6A 3WD3A 3IANA 3VOCA 1I1XA 1Q6DA 4GO8A 1W1TA 1YHTA 2ZXAA 3CZLA 4F8XA 1US2A 1KFWA 1ISZA 4HZ6A 2JF7A 4AWEA 1M7XA 1WNOA 1WP6A 5BXTA 3EDEA 4W7UA 4TX8A 3VD7A 3RM8A 3WMBA 1BYBA 3RJXA 3OZOA 1Q4NX 1C93A 4HOZA 1W9BM 3AFBA 3T0DA 1E4IA 4FMVA 1FHLA 2E9BA 4Q7NA 2JIWA 3GXFA 3W24A 1R7AA 3N9KA 3L2LA 1QI3A 1CENA 1PIFA 3MUZ1 4CD7A 3KZSA 5I78A 4DUVA 1VRXA 4UFJA 4HZ8A 5CG0A 3ARYA 3VTRA 2OSXA 2WVVA 1KR0A 1P6WA 4AZHA 4M29A 2VZUA 1GUVA 4WSKA 4AZ5A 4LYPA 4PMZA 3TTSA 4GQRA 3AMLA 5A6AA 1XD0A 3QOMA 1RH9A 1GJUA 1CYGA 4PCTA 3GH7A 4PYSA 3W26A 1I1WA 3CGTA 4ZENA 2VQTA 3VGDA 2CYGA 1KGUA 1HT6A 2QPSA 4MAZA 3WSUA 4Z2GA 3K8LA 5DT7A 3N1AA 3UERA 1W9UA 3MSGA 4MB3A 1HJSA 5EB8A 1JXKA 4LYQA 3OA5A 3JUGA 1ESWA 1UR8A 3VGFA 3VDHA 2OYKA 1HJXA 3BCDA 2G3NA 5M03A 3SCSA 4JIEA 4CUCA 1E56A 3QGVA 2ZUUA 4ZXOA 2OWXA 4A3YA 3B9DA 3SCTA 1TG7A 2BXYA 4H8UA 3TTOA 1X6NA 5D8WA 3G6LA 3W38A 1E1FA 4AD3A 3WY1A 4MDOA 3PZGA 1UKPA 2VR4A 2A3EA 4AZCB 1E6XM 4YHEA 1DWAM 7A3HA 4PMDA 2CIPA 3ZR5A 4PMRA 2D1ZA 5ABEA 4J28A 1UD2A 1CNVA 4EK7A 1LQ0A 4GPNA 2XSBA 1IZKA 1S46A 4BQ4A 1E40A 3AHYA 1MW3A 5IHRA 2WANA 5CSUA 3PZTA 4GXPA 1B3VA 1HX0A 4HU0A 5LA1A 3N18A 3WMSA 3I3EA 5C70A 5AYBA 2XVKA 1WCGA 3CMJA 4NZCA 5A6BD 1EQCA 4N0RA 3WBEA 2YA1A 1CXLA 2W63A 4W86A 1UH2A 1UQZA 4X0NA 1JXJA 3HMCA 3NDZA 1MVYA 1R86A 4TTUA 3UR7A 3L4UA 2G4FA 3W81A 3W29A 4J3TA 4CD5A 1J0ZA 4QCEA 2XVPA 4BS0A 3U5UA 2CHNA 1C91A 2WXDM 2XWDA 4D6EA 1UA7A 2OWCA 4R27A 2DT0A 3WQWA 6CGTA 4P8WA 3FAXA 3LPGA 1FA2A 4GI6A 4ML4A 3DYOA 1CLXA 1BAGA 2J62A 4Z2LA 1QW9A 3VO0A 4RE2A 4CU7A 1M03A 3BAXA 4K68A 2QF8A 2DSKA 4P7QA 3MMDA 5HPCA 3CLWA 3PZIA 2FDMA 4UQ9A 4FLRA 1GOWA 1RP9A 1E6SM 4PMYA 1J11A 1B3ZA 1GQIA 2BXZA 2D0GA 2XFFA 1G01A 3WF3A 3OLEA 2CXGA 2GJXB 4CD6A 1B2YA 3BLPX 5BXSA 1PJ9A 1VEMA 1MWOA 1JD9A 3VX0A 1WZLA 1KCLA 2W4XA 3VD5A 1UH3A 3L4WA 4MJ4A 4QLLA 2IUZA 3WNKA 3S2CA 4OBSA 3ARVA 2EPOA 3W6LA 2WMKA 2DH2A 3WUBA 1OWQA 8CGTA 5CQ1A 4AIOA 1QPKA 1R8LA 3BC9A 5M3WA 4R5EA 2ZIDA 2F8QA 1OB0A 2BV9A 3N11A 4X0VA 1FOBA 5A69A 2WHKA 1XHGA 2WMFA 2ZUVA 3K4AA 3F5KA 4W88A 3RCNA 2BVDA 3OLGA 3WF0A 2IXVA 5DO8A 3BSGA 2D22A 3K8KA 1EOMA 4TVCA 5I3DA 3ECQA 3GYCA 2DPEA 4UZSA 3TA9A 2D24A 2X09A 4UZUA 2AMGA 4M24A 2J7EA 2QV4A 1GOMA 1JZ5A 1MQRA 5BWFA 1DWFM 3O6AA 2WM0A 2X0YA 5JBDA 3PTKA 1GNXA 3EMQA 2WCAA 1EIBA 3NCOA 1V0KA 1CGXA 3L4VA 1OT2A 3N04A 1W9XA 4HOXA 2XFYA 3POHA 1FH8A 1JZ7A 1E6NA 3WDPP 5D8ZA 3AS2A 3EMZA 1HJWA 3LMYA 2DT2A 4M8UA 5D9NA 1PAMA 3VIHA 1OIMA 3FN9A 5LA2A 4KH2A 1NARA 2NT1A 1K9TA 4QDMA 2J4GA 4WF7A 2WKLA 1EHAA 3VD4A 4H8HA 1G1YA 3WNNA 4JHOA 1UZ4A 1DWIM 1HP4A 2V5DA 3AMDA 3SCWA 4TUFA 5GNYA 1LWJA 4HU8A 4JL2A 2CBUA 3VUPA 1GONA 3W28A 1GQLA 4TVDA 1G94A 3GNPA 2C8NA 3N15A 1VBRA 3RILA 3VIFA 2XSAA 3WH9A 4MNJA 1CIUA 1PZ2A 2YDRA 1PX3A 1A47A 2CNCA 3AZSA 3WMCA 3AS1A 4AW7A 1M04A 3U7VA 5EFFA 1UKQA 3VIIA 3M07A 4ATLA 2XFRA 3N12A 2YA0A 1JAKA 3ZQ9A 1E4MM 1JF6A 1NWRA 3CUGA 3PBGA 1E9LA 3DYMA 3AYSA 3WH6A 4B3LA 4IPLA 2VCAA 4PMVA 3CZGA 3G6MA 1JZ4A 3PTMA 1LF1A 5A6MA 1F4HA 1MW1A 2BY0A 1JZ6A 2FHCA 1E6PA 1M53A 3D5HA 4GQQA 5CZKA 4QP0A 1BSIA 3UCQA 1UR0A 4UTFA 2VURA 7CGTA 1V3MA 3FHAA 1UKSA 4A3HA 4HMEA 2DSVA 2J78A 2Y4SA 1V3JA 1E4NA 2O9OA 2WMIB 4PMUA 1NOFA 1JYXA 4U33A 2YLAA 4MNKA 3DHPA 1WDQA 2WK2A 4MPKA 1G9HA 3AMGA 4JL1A 1OGGA 3WFLA 2C0HA 2Y5EA 1X1NA 4D6CA 4DM2A 3AIWA 3WDJA 4BZYA 1E15A 3WIJA 1XH2A 4CCEA 1W32A 1WAWA 1E6QM 4CGTA 2VZVA 1ODUA 2VRJA 2YDQA 2ZXBA 3WQ5A 4UCFA 1Q6EA 1B9ZA 3AIBA 1VBUA 2V3GA 4CU6A 2ZUWA 1I75A 4PMQA 1C8QA 2PWGA 2O92A 5A94A 1CBGA 1PEZA 4U31A 1JZ2A 1L8NA 3GNRA 4PMNA 3FY1A 1UWUA 1J0YA 2BVTA 1MXGA 3RJYA 4B9YA 2DT1A 2VCCA 4V27A 1UWTA 3L4TA 3VU2A 4TOQA 3D3AA 2VQUA 2QMJA 1YQ2A 3OLDA 4NRRA 4HA4A 1V6XA 4FLOA 1DWJM 1SMDA 1V0LA 4DWSD 1VIWA 5A2CA 1JNEA 3VDAA 4AYSA 2EQDA 2NT0A 3K4DA 1JG9A 3CHEA 3TOPA 2WVSA 2JEQA 1QHPA 5BRPA 3W37A 1O7AA 3CZEA 3WEMA 2QLYA 1SR0A 3CIVA 2J7FA 3AXXA 4W7WA 5CLTA 3CH9A 3U5YA 5BXPA 2PB1A 1CGVA 1H4PA 1GOIA 4C7GA 2J47A 1ECEA 5ABGA 4H8VA 5A1AA 1D7FA 5C71A 2WC7A 2ZUNA 4BQ2A 4B9ZA 1UR2A 1ODZA 3UETA 3ZM8A 5FCZA 4HMCA 3VDBA 3F5LA 5A3HA 1KBBA 2G41A 4ACYA 1VENA 4P8VA 1AQ0A 3SUUA 5M5DA 2XWEA 4GINA 2J7BA 5DEZA 3W4RA 1ITXA 3T09A 2D0FA 1N82A 3SCVA 2PWHA 1W1VA 4AD4A 4CN4A 1KGWA 2CHOA 3SCRA 2GK1B 1CGYA 2VR5A 3L4ZA 3SCOA 4M82A 4H2CA 5AYIA 3AIEA 2VMFA 3WN6A 2D3NA 3L2MA 4BQ3A 4HMDA 2Y2WA 4QCFA 1CXHA 3SCPA 1OGSA 1QBBA 1V6YA 2PF0A 3FAWA 4QLJA 1FFQA 1CGUA 4P7NA 2XGIA 1WB0A 5CGMA 2EPMX 4NF7A 4AD0A 2OYMA 1OSEA 5JUVA 1K9DA 4QAWA 4UOQA 1UZ1A 4C7FA 1C3FA 4XZWA 3NYDA 1FFRA 4U2YA 2Y8KA 5A8PA 4LYRA 5FL0A 2YL5A 4D6GA 1JDDA 2BNJA 1UWRA 1QOXA 4BA0A 4OIFA 4M1RA 5CLWA 1AMYA 1CXFA 2WKGA 4W93A 2VVSA 3SEPA 3I3BA 2EPKX 5D9MA 3NSNA 4CD8A 9CGTA 1R85A 3AROA 3WNOA 1HJVA 1BHGA 2O9RA 3SCQA 1VJZA 1UD5A 4U3AA 2VJXA 2A3BA 3QHOA 3AIVA 2J7CA 3AIQA 4FF5A 2WHJA 1H09A 3GZAA 1EOKA 1B3WA 4HTYA 4YHGA 3MMWA 1GVIA 1D2KA 7TAAA 1PPIA 1NP0A 3BH4A 1EO5A 2CESA 1H3GA 3PZMA 2BVYA 3IJ7A 3CZJA 1OD8A 3ARRA 4W5ZA 1TA3B 1JGIA 2WSPA 1ZBKA 2PBGA 5IDIA 5A6KA 2UY3A 3FW6A 1OM0A 1CXIA 4JKMA 1CEOA 1JI2A 4PTXA 3QR3A 2ZX9A 5EBAA 3SUSA 3CZ8A 4DWSC 2JFEX 1J0IA 1V0NA 4DWSB 3ARSA 2GJPA 1R7OA 3PZUA 4W85A 5GNXA 1D3CA 4UQCA 2ZX7A 3A4XA 2BY2A 3T0BA 1DWGM 2JEPA 4ZFMA 2ZWYA 2YBUA 1QNQA 2WC4A 3M6DA 2NSXA 4GI8A 1JYNA 4TX6A 4F9JA 3ZSSA 4PSPA 2DDXA 1UG6A 4ACZB 2X2YA 2WHMA 2E8ZA 3O2LA 4RE4A 1W3HA 3KE0A 1QI5A 1JZ8A 1E6ZA 2VL4A 3W27A 3BLKA 3PHAA 2J8FA 2X8RA 2D3LA 4JFVA 3AZTA 1R87A 3PTQA 3S6TA 4JCLA 3WELA 1GZJA 1ZS2A 2EPLX 2IXUA 3L4XA 5I0DA 2BS9A 3APGA 2ZX6A 2ZXQA 1TVPA 4W8LA 3AXIA 2YL8A 4PCSA 1GHSA 1NWTA 3GH4A 4AXNA 1J01A 4AD1A 1BYAA 4D72A 2QPUA 2W91A 4MNLA 5FKYA 1VFMA 3AHVA 3WQVA 2VI0A 1FH7A 1CXEA 2GFTA 4P7RA 3RMEA 3F5JA 1SYTA 1MFVA 4W89A 3OG2A 1NH6A 1TFVA 1ZJBA 2FHBA 3N13A 4MNMA 4KRUA 4W84A 5JBFA 1AQHA 2QHAA 4LQ1A 1PX8A 5HXMA 1U2YA 2HISA 3VNYA 4PBGA 3CZKA 1Q6CA 1RP8A 4AZ7A 3EMCA 5E0CA 4URIA 1VEOA 4CD4A 3MS8A 1Z32X 2D0HA 1J10A 1E73M 4LGXA 1GPFA 4M81A 4GZJA 3THCA 4L4PA 4D6JA 1V02A 3UG4A 1JNDA 4B15A 1JF5A 5FD0A 2J7DA 2OWWA 3SCNA 5IHSA 1KQYA 3ARUA 4Z2IA 1UKOA 2VOTA 3OGRA 3HU7A 2BY3A 1TR1A 4UNIA 2DSWA 1VFOA 3WEOA 5F7UA 1XCWA 1UR9A 1TMQA 1LG1A 1BYDA 1GORA 2XUCA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3EDF A;  1IV8 A;  4XUY A;  4W8B A;  1J0K A;  1WDP A;  3EDD A;  4HA3 A;  3W53 A;  1W9P A;  1V3K A;  1ZL1 A;  2J79 A;  1IZJ A;  4P7O A;  2G8Z A;  1H0I A;  3EDJ A;  3GH5 A;  4OUE A;  5E6Y A;  1W9V A;  3WNM A;  4F66 A;  3MU7 A;  1WZA A;  4PTW A;  2EJ1 A;  4AEF A;  3CHC A;  3UR8 A;  4AY1 A;  1GW1 A;  4UQE A;  4LPC A;  2WW5 A;  2E8Y A;  1XSJ A;  1BTC A;  3CMG A;  4EAM A;  1KGX A;  3WD0 A;  1OD0 A;  3WH7 A;  1UWQ A;  4PEE A;  4HOW A;  4WK9 A;  4H04 A;  1CXK A;  1XSI A;  1EO7 A;  1E43 A;  2MAN A;  3ZR6 A;  1CWY A;  3CUF A;  5E9A A;  1UD8 A;  2WMG A;  3WFZ A;  1CZ1 A;  2ZX8 A;  4KRT A;  2WC3 A;  2D23 A;  2D2O A;  3VX1 A;  1WPC A;  1NM9 A;  2W61 A;  5A8O A;  1B3Y A;  1CGW A;  1OIN A;  4FK9 A;  1QNP A;  1DTU A;  1XC6 A;  3WEZ A;  2YOC A;  1O6I A;  5A2A A;  3A6O A;  1LJY A;  3AOF A;  4OJY A;  1W3K A;  3VD9 A;  1WZK A;  2CET A;  2XJ7 A;  4TVU A;  1FP9 A;  1FP8 A;  4RE3 A;  4UFL A;  4DM1 A;  4FLS A;  2JAL A;  3NDY A;  3U57 A;  3PZO A;  4W87 A;  5A8Q A;  4S3K A;  4UFM A;  4J3X A;  2XVL A;  3WD1 A;  4H41 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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