3MW7A

Crystal structure of human orotidine 5'-monophosphate decarboxylase complexed with 5-fluoro-ump(produced from 5-fluoro-6-amino-ump)
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
APKELSFGARAELPRIHPVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSLARELLQLADALGPSICMLKTHVDILNDFTLDVMKELITLAKCHEFLIFEDRKFADIGNTVKKQYEGGIFKIASWADLVNAHVVPGSGVVKGLQEVGLPLHRGCLLIAEMSSTGSLATGDYTRAAVRMAEEHSEFVVGFISGSRVSMKPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKRGSDIIIVGRGIISAADRLEAAEMYRKAAWEAYLSRLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of human orotidine 5'-monophosphate decarboxylase complexed with 5-fluoro-UMP(produced from 5-fluoro-6-amino-UMP)
rcsb
molecule keywords Uridine 5'-monophosphate synthase
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 87
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.10: Orotate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2010-05-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3mw7A00
4FNUA 5L6UA 2GJNA 1G7UA 3R13A 1LRQA 1OX6A 2FTPA 1OX5A 5DXXA 1G67A 1LRNA 5TIMA 5D2YA 1QAPA 1RQHA 3F1QA 1JRBA 4N2YA 1IXNA 3RFAA 2E6DA 3P74A 4K7VA 4XKYB 3C4UA 4FO4A 3CIXA 3TH6A 1GVRA 2ZTJA 1D3HA 3S1WA 3ZFHA 3W83A 3F4WA 3O8AA 5C6MA 1Q6QA 3HB9A 3O6YX 3HQ1A 4JICA 4HIBA 1M6JA 1UUOA 3G0SA 1H1YA 3C2RA 3NZ1A 3GR8A 2CZDA 4Z1BA 5EMUA 2FPTA 4E2BA 5AHEA 4UFMA 1ML1A 1QPNA 3OEXA 4R53A 3TXZA 4A21A 1KFCA 4JTHA 4AF0B 3BG3A 1Z41A 4OQVA 1LBMA 3SY5A 3GNNA 3G8RA 4UNKA 4JEQA 1A50A 4YCOA 1LLWA 4RV8A 5F1UA 2DZUA 3TX9A 2KZHA 3MI3A 4N6EA 4O53A 1SR9A 4ZVJA 3O05A 1SO5A 4IPJA 1KM5A 4IGHA 5AOUA 2FFCA 4LRSA 3WK0A 5HJLA 4JTJA 4TO8A 3UWVA 3MYPA 1G6CA 1X1ZA 4DEFA 3CB8A 3TSBA 1GYNA 1W37A 4JY9A 1U83A 2A4AA 5AYYA 4HNTA 2H8XA 2A7NA 2EF9A 4N4PA 4NJKA 1WBJA 1XUUA 3R8RA 3G1HA 4XKYA 3PG9A 4MPQA 4NXKA 4O1DA 3W7JA 4Q32A 2AAMA 2WKJA 1F6KA 3M1ZA 3EX1A 3IIVA 4FEZA 4S2BA 2QJHA 1QNVA 1UBSA 1ZNNA 3W2KA 2YW3A 3B0PA 1JRCA 3N3MA 3W7IA 4WXZA 1SUXA 2CLEA 4Y9AA 1MXSA 4WY0B 3LI1A 1UCWA 2FB2A 3TSDA 4XUGA 2FPYA 1XBYA 3TAOA 3B06A 4ONVA 4FNQA 4AHOA 3NVTA 2NUWA 4A2SA 4E2DA 1IXQA 3O07A 4O1BA 1LDCA 4OV4A 1DVJA 1QCWA 3L65A 1PCKA 1LROA 3WJZA 3E9AA 5T26A 3KRSA 4AF0A 5F4WA 2Q3OA 3HG3A 1GVFA 4FHAA 2CLHA 3TMLA 2A5HA 3GIYA 4TX9A 3W71A 4AWUA 1RR2A 2E5BA 3TFCA 1AK5A 1SFLA 1AG1O 3QF0A 3PBWA 1YLVA 1SO6A 3NGJA 3UYCA 1AL8A 3BG9A 4A22A 3M41A 4LT9A 4O13A 5LGZA 1K02A 4WUIA 3HPZA 4O11A 5F1VA 1RZMA 4S2CA 3E0IA 5LGXA 3PS7A 3C8FA 1TPH1 2TYSA 5DN1A 4UTLA 3GXNA 3INPA 3BK0A 2V0TA 1E51A 3LTSA 4WX2A 5IM51 1YXCA 5G4WA 2V5BA 3DZ1A 2VEIA 3G1AA 1WAUA 3UNDA 1VJIA 1K3UA 1B57A 4GUFA 4LVGA 4WY0A 3ATYA 3P67A 3NL3A 4RXFA 3W1NA 2GOUA 3W2NA 3KRZA 4NJGA 5AC6A 1DOSA 5F4XA 2LLEA 2GUUA 3MP3A 3OG3A 3TK7A 2WNZA 3GAKA 3LX9A 1G4EA 3EX4A 3OIXA 3M5YA 1SU5A 1GJPA 1Q6RA 1XDLA 1ZHAA 2GVJA 3IIPA 3OA3A 4AHQA 1WXJA 5HMSA 2H90A 3TU9A 1W5NA 3VCRA 5D38A 3W7NA 3R12A 1TTJA 2CW6A 5D2WA 3WJXA 3KHJA 2XN2A 3GKFA 4ICNA 2ABBA 2I1OA 4AEOA 3ANYA 3DBPA 1W5MA 3TE9A 4FNTA 5DBTA 3W1XA 3BV4A 1B4KA 1G4TA 3PM6A 1BKSA 3CWNA 5AHMA 2VFDA 3KRUA 1AMKA 3FKKA 4Q4KA 3LHTA 3DENA 4PTNA 5I3FA 2X2GA 1GG1A 2J24A 3FYPA 4UTTC 1H7XA 1TYGA 3G0UA 2ZZ2A 1GEQA 3RK8A 1FWTA 2QF7A 1F7BA 4JIQA 2QCNA 3CM4A 4O17A 1KFEA 1QDSA 2XN0A 3LTYA 3NQGA 5CSRA 3TUUA 2B7PA 2WOQA 5BW6A 7TIMA 1O5KA 2J9XA 4LS0A 3G1YA 1Z44A 1W3NA 2PCQA 3DFOA 3G1DA 5FEWA 1WOAA 2X16A 3BPWA 2Y7EA 1TO3A 2GJLA 1QPQA 3S5NA 4X2RA 3STEA 4BI7A 2B4GA 3MMTA 1LOLA 3NL2A 3W7LA 3UY7A 3VNDA 3S1VA 4GJ1A 3NDOA 3AJXA 3BLFA 2CU0A 3LBMA 5BOOA 5AHNA 2Y88A 1GOXA 3STCA 4A29A 2YZRA 3UWZA 1GYLA 2JBMA 4PH6A 4NQ1A 3BO9A 4CLMA 5D32A 2I14A 3G22A 2ZRZA 3F4NA 4Y90A 2DJXA 4Z1DA 1VLWA 1VCFA 3JRKA 4FX6M 4LVFA 2CZFA 1FWRA 5HR7A 1TPVA 5EYWA 3PBVA 4JS3A 1UASA 1NAL1 2E6FA 4N9CA 4LS1A 3SR7A 4Y6GA 1FWNA 1EEPA 4JIPA 4JTKA 3B8DA 5DCBA 2NX9A 4M7TA 1OYBA 1WYIA 3P84A 4JTIA 2J6XA 1TJPA 3DH7A 5LNVA 2X1UA 3FA5A 1PIIA 5KITA 3BGJA 1X6UA 3FYOA 3DI0A 5D05A 1W56A 2W6RA 4X3ZA 1TPFA 3MP5A 5KMYA 4UNLA 4UXDA 3QJAA 3S1UA 4NVTA 1XC4A 4UTMA 4JYEA 3FEMA 3HGJA 5G2IA 4ZQCA 1QPOA 2H6RA 1R30A 5FEXA 3THAA 4JTEA 1K7EA 4ZZ9A 5GVJA 1AL7A 1JCNA 3W1LA 3O06A 3RF9A 2ABAA 4O0KA 1SO4A 3NAVA 4DBEA 1WOBA 3HIJA 1M7OA 1K7XA 4IQLA 4DELA 3LXAA 1PV8A 4RK8A 4CCDA 2WO5A 5SWUA 5K7JA 2ALDA 3A22A 1SW7A 4ORMA 1H5YA 3CTLA 1HO4A 2YSWA 4TMBA 3GDRA 3W1UA 3ZWSA 5ABTA 3C56A 4XTIA 4NZJA 4A3UA 3I68A 4O15A 4UUIA 2WV8A 1DQWA 1O60A 4AVFA 4O4WA 3ELFA 1PS9A 3CLMA 5KTLA 3QSTA 1FUYA 3IV3A 2E5CA 1GTHA 5G2WA 1KA9F 4DO4A 3I6RA 4IOTA 3MW7A 4ADTA 1EP1A 3ZWTA 3LRMA 3W22A 1Q6OA 3T78A 1IGSA 1P0KA 2ZZ7A 3QQ0A 2XFWA 3THQA 1KM0A 5CPNA 2BSLA 4RR4A 4YLWA 1MEWA 2UV8G 5AN7A 3S5YA 3W23A 1LTDA 1IIGA 1ZAIA 4P2VA 3C3NA 3LHWA 1KM6A 2VEPA 3PB2A 5CZ0A 1KBJA 2ATMA 1DV7A 2CLFA 1TPWA 5E1QA 4GUHA 4AH7A 1X1OA 2J27A 5BMXA 1I2PA 4Y8FA 2PRLA 4HKPA 1XI3A 4JX5A 5FF0A 3GDLA 4JY8A 3U6WA 5IBXC 2CFFA 2QEZA 4MJZA 3T40A 1Q3NA 4NJHA 3GLCA 3MP4A 1VGAA 4ZQNA 5H91A 1A5SA 1F73A 5KZEA 6TIMA 2TRSA 3OVRA 3PVFA 1TRIA 2PE4A 1RQBA 1BTMA 3WK2A 2R91A 2RDUA 3IGXA 2NUYA 1KM1A 1H1ZA 3OVPA 2VFEA 4ML9A 3QSRA 1SW3A 2TSYA 1XBVA 4ZMGA 1S5WA 5FF3A 1O94A 1OFOA 5LHEA 1FCUA 1OHLA 1JVNA 4B5NA 1ME8A 3NNTA 1OF6A 1XDMA 4MZ1A 4DF2A 5KSWA 3LB0A 2PRHA 3HGOA 2Q3RA 3MI2A 4JX6A 1C29A 4LTSA 1MSSA 2HS8A 2NXGA 3CQ0A 3EWBX 5I3HA 4UFIA 3FS2A 3PB0A 4RZ4A 1I8JA 4LY8A 1G4SA 3W1PA 1XUZA 1YXDA 2R14A 5AYXA 3A23A 3P5ZA 2HSAA 3EX6A 3I7RA 5A8GA 3BLIA 3L66A 5CPOA 1LRTA 4PL1A 5K9DA 2C1HA 4QM1A 3L21A 5D09A 4I7UA 1JCJA 3N34A 3LGEA 4PCFA 1H62A 2E6AA 1TPB1 5D2VA 3QMRA 2Z2UA 5KZDA 2Z6JA 3W1QA 1MEHA 3IGUA 4MJMA 3GDKA 3B0UX 2YDAA 2FDSA 2VC6A 4QJ1A 3EWXA 4JTLA 2ISWA 2H8ZA 1IXOA 3ABRA 4QNEA 3LDVA 5LZLA 3CHVA 2ISSA 4UR8A 4N6FA 5K2ZA 5HWNA 3UPWA 3DXIA 1SZNA 4LUJA 4FX7A 4DF1A 2NX1A 4UTWA 3W07A 2QCLA 3NQEA 2QKFA 4IMCA 4DPPA 2Y89A 3SSJA 2FPVA 3LCXA 4ZQPA 5E0KA 2YCEA 4WXYA 3ABQA 3E96A 1YTEA 1LBLA 3UWYA 4UFLA 1EUAA 1EX5A 1I2NA 3L5AA 2V5LA 3HF3A 3WJYA 4CQAA 2DU2A 4WOZA 2J88A 5G1TA 1TQXA 4Q33A 4ZQMA 2R94A 1KW1A 1KFJA 2E09A 5D30A 3ZR4A 1OK4A 1G7VA 1W0MA 3C2VA 2EKCA 5K4ZA 1IIHA 2TPSA 2JGYA 1CI1A 3W7OA 4OU1A 1JQXA 3M47A 1J2WA 4EOUA 4EVZA 5CG7A 2VFIA 1ZJIA 1SZEA 2D73A 2NV1A 5FEPA 3GDMA 1SSGA 3EWYA 2B7NA 1EA0A 4OGZA 4GXMA 4NNBA 2G97A 2A6LA 2E68A 3W7RA 3G1XA 1GZGA 3FKRA 1W5OA 2ZTKA 2GVLA 5LKYA 4CNOA 1LM1A 4POCA 1EPXA 3LCIA 1GT8A 3P7YA 4JR5A 1A5CA 1BWLA 4DO5A 1QOPA 3PSVA 4QAIA 3W1RA 4IXXA 1FXPA 3NR0A 2DZWA 4BF9A 5LSMA 1KLYA 1Y0EA 2NZLA 2Y70A 4HNNA 1LCOA 3H53A 1GQNA 4O57A 1WBHA 4IJBA 5K3VA 3NQDA 3QPZA 2V2CA 2ZA1A 2WQPA 3PULA 3BG5A 1H50A 4GBUA 1TCDA 5D33A 3N19B 4JD4A 2ZYFA 4FF7A 2DZXA 1S3HA 3LHVA 2C18A 3PUOA 4EF8A 3UY8A 4EWND 4H6KA 1QFEA 2JKEA 1V7YA 3GYEA 3QFEA 3TQKA 2C3ZA 3SGZA 2X1RA 3O16A 4ORIA 2H3BA 2V2DA 4WJEA 4MFEA 4MVAA 4MYXA 1W31A 1YTDA 5LNSA 4EF9A 1B9BA 1PCWA 5G4EA 3W1AA 3UZJA 1TTPA 3W84A 4NNCA 4YWIA 3P61A 3DFPA 1YYAA 3TW6A 4UTUA 5HUPA 1VRDA 3NQVA 3NZRA 3KVMA 3IEBA 1CW2A 1I2OA 4AB4A 3HJZA 4G1KA 4DF0A 1KFLA 4NX0A 3MBFA 3M7WA 1DJNA 4K38A 1W8SA 4DXVA 3N9RA 2ZA3A 1KTBA 3O15A 2QJIA 4BWLC 1IXPA 3O63A 2BLEA 3H54A 1ALDA 3W7PA 2IQTA 5A5WA 1KM4A 3ATZA 1J5TA 3DAQA 3QMSA 1LORA 1KV5A 1JUEA 3IGSA 3FJLA 1S5TA 3BGGA 3NPWA 2GQ8A 4X9SA 2ISVA 2C0AA 2E77A 3LCGA 3GAYA 3LI0A 1QO5A 1HTIA 4DO6A 4AXKA 3P8IA 3HGRA 2ZRUA 3V75A 1FX6A 2QAPA 4TU1A 3LOTA 1M5WA 1JULA 1WDWA 3G8EA 1JCXA 4MY8A 1W3TA 1G4PA 1AW1A 3FOKA 2EPHA 1F2JA 1V5XA 4TMCA 4JTFA 3O6DA 2Y85A 3F03K 4N9BA 4OT7A 1KLZA 1OABA 3NXFA 1L6WA 4HHPA 1MZHA 5EBUA 3R89A 1KTCA 3WK1A 5HQEA 4LV9A 3TMQA 3IVUA 1WV2A 2C15A 5KINA 3W3OA 1KFKA 1YDVA 3TQVA 1ADOA 2VKZG 2NWSA 1I2QA 1YDOA 4KFNA 2NV2A 4PL2A 3L0GA 1TTQA 1EP2A 1ZENA 2VEMA 4N4QA 5C2XA 1UJPA 1T96A 4AWTA 1JCYA 2O7QA 2W0UA 2Y63A 3BARA 5TBOA 3DFQA 1S5VA 1H63A 2R8WA 3O6CA 2Z6IA 5D04C 3W2JA 1QMLA 1W54A 1FCVA 3HG4A 3SECA 4O16A 3L5MA 4EIVA 1VCVA 5F4SA 5D37A 3DHDA 2AQWA 5K4XA 3L5LA 3QPYA 5HNRA 1QWGA 3NQ7A 2Y6ZA 1TQJA 2YR1A 3P5YA 4M19A 1VH7A 4QISA 4UMBA 1A5AA 4I7VA 1ZFJA 5HUOA 3T55A 4NZFA 1SQ7A 5E93A 1SSDA 3DI1A 2I9EA 3EWWA 3W6YA 1OFPA 4MFDA 4LV4A 1EIXA 5AC7A 3CC1A 3T44A 2ZA2A 3CIWA 3I65A 2JGQA 4ADSA 4PA8A 4BR1A 1LOQA 4HSOA 4NX5A 2DZPA 4FNPA 1H7PA 3CU2A 3MHUA 4FNSA 3CEUA 3PY2A 4GUGA 4KWWA 2CLOA 2RKXA 4WY0F 4LVBA 5FEZA 3G0XA 2VEKA 2FIQA 3WJWA 2HMCA 3UWQA 3LXCA 3PUEA 2Y61A 3TC6A 3NA8A 4CNPA 4HSNA 2Z1BA 1TRDA 1LLZA 3S0CA 2RFGA 4MIMA 1P0NA 2FQIA 3PBUA 1TPC1 4Z08A 1FXQA 1FBAA 4LC6A 4UTJA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4FNU A;  2D0F A;  2GJN A;  3OQE A;  1W8G A;  3R13 A;  4WDU A;  1OX5 A;  2C1I A;  1LRN A;  4PUM A;  1RQH A;  1GOR A;  1PKL A;  1EJR C;  4XKY B;  3NZG A;  4PEE A;  4ZEN A;  4AZC B;  3TH6 A;  1GVR A;  3S1W A;  3ZOA A;  3GZA A;  4HIB A;  1KXH A;  1J11 A;  3K5X A;  3G0S A;  3NZP A;  5E6Z A;  3BMW A;  3V3W A;  3BL3 A;  4Z1B A;  1GCY A;  3PWG A;  3BH4 A;  1ML1 A;  1DWJ M;  1UKP A;  1KFC A;  4JTH A;  1T5A A;  5BWF A;  1Z41 A;  1LBM A;  3VM5 A;  1B3V A;  3MVI A;  3WLK X;  1GVI A;  4GJI A;  1A50 A;  1FHL A;  3A12 A;  4YCO A;  4N6E A;  4QLJ A;  3PJW A;  3S2N A;  2E40 A;  1SO5 A;  1QWK A;  4DNM A;  1A5K C;  1X38 A;  2GJX A;  3PZO A;  3G2G A;  2BGQ A;  3MYP A;  4O0Q A;  1G6C A;  1X1Z A;  3RIL A;  4DEF A;  4DX3 A;  5B7Z A;  4HNT A;  3TN5 A;  4MNK A;  4NJK A;  2DUZ A;  2D1Z A;  3ES7 A;  4NXK A;  4AD3 A;  1CGX A;  4NAE B;  3VUS A;  2DT2 A;  1OWQ A;  3IIV A;  4M3P A;  4DUX A;  3W7I A;  3WF4 A;  3FDG A;  1SUX A;  1TCM A;  2CBV A;  3IJD A;  3TSD A;  3IAC A;  4XUG A;  4IIB A;  5BYW A;  5C9R A;  4E2D A;  1GOW A; 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