3N17A

Crystal stricture of e145q/y227f chitinase in complex with nag from bacillus cereus nctu2
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
326
structure length
326
Chain Sequence
LGSKLLVGYWHNFDNGTGIIKLKDVSPKWDVINVSFGETGGDRSTVEFSPVYGTDADFKSDISYLKSKGKKVVLSIGGQNGVVLLPDNAAKDRFINSIQSLIDKYGFDGIDIDLQSGIYLNGNDTNFKNPTTPQIVNLISAIRTISDHYGPDFLLSMAPETAYVQGGYSAYGSIWGAYLPIIYGVKDKLTYIHVQHFNAGSGIGMDGNNYNQGTADYEVAMADMLLHGFPVGGNANNIFPALRSDQVMIGLPAAPAAAPSGGYISPTEMKKALNYIIKGVPFGGKYKLSNQSGYPAFRGLMSWSINWDAKNNFEFSNNYRTYFDGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structures of bacillus cereus NCTU2 chitinase complexes with chitooligomers reveal novel substrate binding for catalysis: a chitinase without chitin-binding and insertion domains
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitinase A
molecule tags Hydrolase
source organism Bacillus cereus
total genus 115
structure length 326
sequence length 326
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2010-05-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3n17A00
4N42A 4HOZA 2Y2WA 4M56A 4WKHA 1GJWA 2UY5A 3BAIA 3BMWA 4JFUA 1CGVA 3OBAA 1OGGA 2WANA 2YKKA 1OT2A 2XFFA 5AY7A 4PMZA 3K1DA 1W3HA 3AMGA 1Q6FA 3WF3A 1WP6A 2WHJA 1KQYA 2B31A 5E0FA 2VVNA 3QHOA 4QFUA 5EB8A 3AHYA 1BG9A 4U2ZA 4IPLA 1CGYA 1KWGA 2DPEA 2G3NA 3TTQA 4JHOA 2BFGA 3ARZA 4CD7A 4JL2A 5A8NA 2J77A 1ODUA 3WL0A 4W87A 4TOQA 4CD6A 1JZ5A 5A95A 5JBEA 1HXJA 1TUXA 5E70A 1E4MM 2WVTA 4LQ1A 5BRPA 3CUGA 3MMUA 5A6SA 3RJXA 2X2YA 4ATLA 4KGLA 2CESA 1W2VA 2DT1A 5BXTA 4WLCA 2OYKA 1KR1A 3APGA 3GYCA 1V6UA 1O7AA 1GHSA 1JXJA 1US2A 2J7GA 4H8UA 4KRUA 1E9LA 1R87A 1EDGA 3CZEA 2YBUA 3WD3A 5IHRA 5LYRA 1G94A 4P7OA 3ZR5A 1W1YA 4AMCA 4E4PA 3AIWA 1VENA 1KQZA 2JF7A 4M81A 3AIQA 4Y7EA 4W8AA 4AISA 1E15A 3S6TA 1WZMA 1CGXA 2DEPA 3BLKA 3GM8A 1I1WA 3WDIA 1BG4A 1D3CA 3RDKA 4BQ3A 2GUYA 5FL0A 3VIKA 1E72M 4MTVA 1NWUA 1JI2A 4DUWA 3POHA 3TA9A 2WMKA 3M6DA 1HP4A 3AS2A 1JYXA 3A4WA 4PRWA 5D4YA 4P7NA 4AC1X 3EMQA 1A3HA 2G3MA 3MV11 5IFPA 1RP9A 4HOXA 4M82A 1BTCA 1LL6A 3GTNA 2VZSA 1KXVA 5E6YA 1JZ7A 2J8FA 5C70A 2WMIA 1W32A 4DM2A 4BF7A 2YIHA 2CERA 3EYPA 2D0FA 3VINA 3AIBA 2OWXA 2YL6A 3B9EA 3VDAA 1E6PA 1XH2A 1XSJA 2VR5A 3PTMA 2XSBA 2GJXA 3AIUA 2ESCA 3ZT5A 1MFVA 3EMZA 3VDBA 1KGWA 3AIEA 3CHEA 1GUVA 1BYBA 1C7TA 2BVTA 5D9PA 5CPQA 1W2PA 5HDRA 1H2JA 2J79A 2XPKA 1SYTA 2A3HA 2UY2A 2OSWA 3VGEA 2PF0A 1V3JA 5M5DA 2W4XA 1L8NA 3W26A 3DC0A 2DH2A 2A3BA 4A3YA 2VX5A 1KFWA 1UQZA 2AOSA 1MW0A 1FHDA 3AROA 3N17A 1G1YA 4X0NA 4U2YA 4YHGA 2PBGA 4TVUA 2MANA 4P8VA 2Z1KA 3GBDA 3WQWA 3MMWA 2CCRA 3ARTA 1H1NA 1B1YA 1JDCA 1V3HA 3N1AA 1B3XA 4RE3A 5A8MA 1ZBKA 2QPSA 3K4DA 2G41A 3WD4A 1X1NA 4HA3A 2WWDA 3ARQA 3CPUA 3UETA 3EBVA 3LPGA 4BS0A 1ISWA 3VNZA 3ECQA 1NOUA 4L4PA 4AD1A 4HOWA 1PZ3A 4AZ7A 3J7HA 3KWXA 2CBIA 1H0IA 2EXOA 1JL8A 4XV0A 2O9RA 1WAWA 1GQIA 5A6JA 2CETA 4B15A 4UFJA 3W24A 1VFMA 3N04A 2W66A 3AJ7A 1OD0A 1M03A 4JFVA 1QNRA 2GVYA 3AHZA 2YDQA 2J7CA 3VGFA 1GQLA 1UWRA 1EIBA 2EEXA 3O9NA 3ZQ9A 4OBSA 2D23A 3RJYA 3FXYA 4ZE5A 1KR0A 1E3ZA 4E2OA 2ZUVA 5AC4A 4M1RA 3THDA 1R85A 1V3IA 4JKLA 5JIWA 2VRQA 3GDBA 2W91A 1MYRA 2EO7A 1UD2A 4DUVA 3CLWA 2XWEA 5I77A 3EDFA 2E3ZA 1UKTA 2D3NA 2OSYA 2J8GA 1V03A 3VPLA 2BY3A 3A6OA 3AMLA 3QOMA 4NZCA 5I5RA 2EPKX 2QHAA 4XB3A 2QF8A 4PMYA 4MPKA 3VO0A 3K46A 2VX7A 3AOFA 3VVGA 2DT2A 4W5ZA 4GZJA 1J10A 1FP8A 5CPSA 5A1AA 4J27A 2XVGA 2YL9A 2V3FA 4PMDA 1GOOA 4KMQA 3VIIA 1PX3A 1VBUA 2IUZA 3L4XA 2WKLA 2A3CA 1QNSA 1GHRA 2WMGA 2PC8A 3WQ5A 3MV01 4HTYA 4B16A 3WQ6A 4EK7A 3WUEA 1UA3A 5LA0A 4CU8A 2XG9A 1UH4A 2X8RA 3W28A 4TTGA 1KCKA 3N12A 1UR2A 5JUVA 3OGRA 4FF5A 3NJ3A 1XH1A 4D6CA 1C91A 3VILA 2EPNA 2X0YA 5IHSA 2ZICA 4NRRA 3WD2A 1E0XA 3NUKA 5A6MA 1M7XA 3RO8A 1BGAA 4D6EA 3FHAA 1LG2A 4XZWA 3SUTA 1B2YA 1TVPA 3WN6A 2VRKA 4PCSA 4AD3A 2Q8XA 4QLLA 4WIWA 4W84A 3F5LA 5I0DA 2D20A 1B30A 4GXPA 1OM0A 1HJXA 2CPUA 3RPMA 2VC9A 4UQCA 2W61A 1GJUA 4HPGA 2WBKA 1D2KA 2OWWA 1HX0A 3LPOA 1ZJAA 5E09A 1J0IA 1VJSA 2VI0A 3WUFA 3AHTA 1GZJA 1UA7A 3T2QA 1E0WA 3WMSA 2Z1SA 1LF1A 5D9NA 4EKJA 5BWFA 1GOWA 3BAXA 1E6XM 4GIAA 1EH9A 1J12A 2DT3A 4AIEA 1ZJBA 1JFHA 1JG9A 2DIEA 1QHPA 4IISA 4JL1A 4U31A 1EQPA 3F4VA 4UFLA 3T0AA 5FCZA 3EDKA 1UH2A 3OLGA 2WB5A 4CN6A 1W3JA 4OBRA 1AQMA 4A3HA 4P7RA 1HL8A 5I78A 1QHOA 4HP5A 4UFKA 2C8NA 1IV8A 4AY1A 3PN8A 4JFTA 2JEQA 5EFFA 1VEOA 2O92A 3B8SA 1VAHA 1NARA 1GVYA 1WDRA 1J18A 4W93A 5A2AA 4AZHA 3QR3A 3VDCA 2W92A 1EO5A 1VEMA 4GPNA 5KEZA 1EDTA 3AXHA 5CLWA 4ZEPA 3MUY1 1FFQA 1XH0A 1XCWA 3CUFA 1FP9A 1ZBWA 2WC7A 1LQ0A 3OZOA 2QMKA 2ZUSA 2OLHA 1G5AA 2VCCA 1O6IA 3W0KA 5I3DA 4Z2JA 3QGVA 1E56A 4ACZA 1L0PA 2WSPA 3RM4A 3NDZA 1X6NA 3VNYA 3A47A 3GNRA 5LA1A 1SR0A 2CBUA 3W81A 3VMOA 4ZE4A 1QI3A 3CBWA 4HZ8A 3MUIA 4PTMA 2D1ZA 2CHNA 1EA9C 4GI9A 4W85A 2CBVA 3ARSA 2YA0A 3VOCA 2Y8KA 1UH3A 4PCTA 1ECEA 3PZUA 4J3SA 3WEOA 3SCNA 1HJWA 1EQCA 2EPOA 1XC6A 4H2CA 4BQ2A 3AHXA 3CUJA 3WEMA 1E5NA 4JAWA 2ZUNA 1QNPA 3ZSSA 4CN4A 1KXQA 1V3MA 3RM9A 3I3EA 3UCQA 1V6WA 2WMFA 4AWEA 2XUCA 4Z2HA 4D71A 4HMDA 4CVWA 5CSUA 3DYOA 5JIPA 1GW1A 2E9MA 3BCFA 1H3GA 3FNDA 3GZAA 4UTFA 1E3XA 3AZSA 2VUYA 3AHVA 1WE5A 3POCA 3LPPA 4HMCA 1WZLA 3AI0A 4OZOA 2XM2A 4FLSA 4PTXA 1GNXA 1K9TA 2DSWA 1CXKA 4WJXA 3AMCA 1E6NA 4ZXLA 4PMOA 3AXIA 1VBRA 3TTYA 2E0PA 1UOKA 4GKLA 5A94A 3BAWA 5BCAA 1GOIA 4BA0A 1U30A 3WMCA 5FKYA 3L4TA 5A8OA 1JF5A 1JD7A 3RM8A 4F9JA 2CEQA 4XUYA 1UKQA 3VIOA 3W82A 2GK1A 3W37A 4OOZA 4Z2GA 1UKPA 1KCLA 3JUGA 1WO2A 1CXEA 4QP0A 1CENA 1JI1A 3WUBA 1JZ3A 1V02E 3DYMA 3FAWA 4JKKA 3WDRA 1EO7A 2CKSA 2C7FA 1E1FA 2V38A 3B9DA 2W5FA 5GNZA 2E8YA 3CUHA 4W7WA 2WMIB 1NWSA 4HA4A 1BPLB 1F4AA 2YA1A 3A3HA 4AIOA 3OB8A 2ZX6A 1Q6EA 4NI3A 3SCRA 3WH8A 4QLKA 3NSNA 4FLOA 3UG5A 4AD2A 3L4ZA 2FGZA 1V0MA 4CVUA 1E71M 2YOCA 3IK2A 2XJ7A 2JALA 1ZS2A 1QI2A 4W89A 5DT5A 5I24A 1E0VA 4PMXA 2VZOA 3SCVA 1JYWA 2WBGA 2XFYA 3SCOA 2BY2A 1OWQA 4D6IA 2J7BA 4GINA 1OB0A 1E6SM 5ECUA 2DIJA 4QCFA 4Z2IA 3K8KA 5IFTA 2ZXBA 1SFSA 2J47A 1HJVA 1BYDA 3KL3A 3W6LA 1B0IA 5BRQA 1WZKA 4QLJA 1OINA 6TAAA 2WMJA 4UOJA 3VMPA 1W9DM 5JBDA 2CITA 1H5VA 5D9OA 1UUQA 4ACYA 2UY4A 4AZ5A 2ZUMA 4HMEA 2EJ1A 4OJYA 1UHVA 2BY1A 1MXDA 4QCEA 3MSGA 3BAJA 1E6QM 3WNKA 3SEPA 1E55A 2UWFA 4LXFA 5ABFA 4WSJA 3OZPA 2Y5EA 3QHNA 4PN2A 4D6GA 1W1PA 5HOSA 1GOMA 1QNQA 1CXFA 3W4RA 2NSXA 3FAXA 2YDSA 2OYLA 3WBEA 1OIFA 4RL3A 2VL4A 3K8LA 3PZQA 1W3LA 4HZ6A 1MW2A 4S3JA 1AMYA 4CKQA 1HVQA 3G6LA 4CU7A 1DTUA 1JF6A 1PEZA 1BAGA 2VOTA 5CXPA 3GXIA 3VD9A 4URIA 3FW6A 1LJYA 1NH6A 1KWKA 8A3HA 1DHKA 2FHFA 1B90A 5ABHA 1EDQA 1UD4A 4KWUA 3W27A 4QDMA 3T2PA 4JHZA 1J0JA 4W8LA 1AQHA 1B31A 4PMUA 1YQ2A 4MJ4A 1GOQA 3IJ8A 4W7UA 3MKKA 3VIJA 1XCXA 1AVAA 3NCOA 3ALGA 1JZ4A 4F9DA 2WHLA 1W3KA 1WPCA 4RE2A 2XVLA 2BY0A 2NT0A 1JFXA 2BVDA 1NQ6A 4H7VA 2DDXA 2RGLA 3ZR6A 3BH4A 2VCAA 3PZGA 2ZX8A 4KGJA 7A3HA 2CBJA 1R7AA 5HXMA 1JYVA 4KRTA 1C93A 4OOUA 3ZO9A 1WDSA 2V3GA 3WDQA 2CHOA 5IDIA 5TD4A 2HISA 2VZUA 1PIFA 3VGDA 1NWTA 5M3WA 1MWOA 4NRSA 2WC3A 4FMVA 4MADA 4BCEA 1JDDA 2OYMA 1CBGA 1NP2A 4UFHA 1V6VA 2X05A 2WK2A 3BAYA 5I23A 2VMFA 1ESWA 1ZL1A 4MDPA 1J0HA 1G9HA 5CQ1A 2WHMA 3TOPA 2PWGA 2PB1A 3NSXA 1ISZA 1E6RA 1HF6A 2G3IA 2WKGA 2GDUA 2D24A 3SCQA 2JE8A 5BXSA 3AMKA 4U3AA 2OWCA 4F79A 2D22A 1TFVA 4GO9A 4KH2A 2V5CA 2BXYA 3FN9A 2AAAA 3WF0A 2WCAA 4MAVA 4J28A 3VIPA 1D7FA 3RCNA 3F5KA 2E8ZA 2FHBA 5AYIA 2WZHA 1W9PA 5DT7A 2J4GA 1CXLA 1PZ2A 3O6AA 3KEHA 4EE9A 1BSIA 4R5EA 4QAWA 4LYPA 1R7OA 4CD8A 1R8LA 2VTFA 4CD4A 1CIUA 3RMEA 4MB3A 2VQUA 4CGTA 3WL1A 2ZIDA 2WW5A 3ALFA 2WVVB 1NOFA 3G6MA 2WXDM 1R86A 1LWHA 4D1JA 2O9TA 2WC4A 5E6ZA 4MB5A 1F4HA 4J3WA 4D6HA 5A69A 4PTWA 1BQCA 3IANA 4F8XA 4YPJA 5A6AA 3OA5A 2BV9A 2WM0A 3ARYA 1DWFM 1EOKA 3WF4A 1BF2A 3CZGA 1QI4A 4PSPA 3M07A 4LYQA 4P8UA 1M04A 3T0DA 3SUSA 2BHYA 1HKKA 1WDPA 1UD5A 3EMCA 4W5UA 4PMVA 4A4AA 1CLXA 3T09A 1EOMA 3ZMRA 3THCA 1XRVA 1G01A 3LMYA 1DP0A 4TVCA 4MAZA 2ZXQA 3SUUA 1DWAM 2E40A 4H41A 4EAMA 3QOKA 1WCGA 3AYRA 3T08A 2EQDA 4W7VA 3WEZA 2WSKA 3AIVA 3CZLA 4OIFA 4Q22A 3BXWA 1QI5A 1QBAA 3TONA 4PUDA 4PBGA 4TX6A 4MDOA 5EBAA 4AZIA 3MU7A 2GSJA 2ZUUA 1H49A 1Q6GA 4P8XA 4E8DA 2WVUA 3ZSTA 1UZ1A 1CNVA 2DH3A 1Q6DA 1GPFA 1JNEA 4PTVA 2YDRA 3F5JA 3K4AA 4DUXA 4UQEA 1JIBA 4JCMA 1C8YA 1V3KA 1ZBCA 2D0GA 3ARPA 3BC9A 4ACZB 4U5IA 1B3YA 1RD6A 1DWGM 4D6DA 4WSKA 1KB3A 3WIJA 4MNLA 2O9OA 7TAAA 4YHEA 2VVSA 3W38A 2FHCA 4J3XA 1C7SA 4FLRA 4DWSA 1MQPA 2DSVA 1J0YA 2V3DA 5FOOA 3PZ9A 1PJ9A 4WK9A 2IXVA 2X0HA 3CO4A 2WLZA 1V02A 2G4FA 4U33A 1J9YA 4L4OA 5CSYA 1UWSA 2OSXA 5BXRA 2WCGA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4N42 A;  4HOZ A;  2Y2W A;  4M56 A;  4WKH A;  1GJW A;  2UY5 A;  3BAI A;  3BMW A;  4JFU A;  1CGV A;  3OBA A;  1OGG A;  2WAN A;  2YKK A;  1OT2 A;  2XFF A;  5AY7 A;  4PMZ A;  3K1D A;  1W3H A;  3AMG A;  1Q6F A;  3WF3 A;  1WP6 A;  2WHJ A;  1KQY A;  2B31 A;  5E0F A;  2VVN A;  3QHO A;  4QFU A;  5EB8 A;  3AHY A;  1BG9 A;  4U2Z A;  4IPL A;  1CGY A;  1KWG A;  2DPE A;  2G3N A;  3TTQ A;  4JHO A;  2BFG A;  3ARZ A;  4CD7 A;  4JL2 A;  5A8N A;  2J77 A;  1ODU A;  3WL0 A;  4W87 A;  4TOQ A;  4CD6 A;  1JZ5 A;  5A95 A;  5JBE A;  1HXJ A;  1TUX A;  5E70 A;  1E4M M;  2WVT A;  4LQ1 A;  5BRP A;  3CUG A;  3MMU A;  5A6S A;  3RJX A;  2X2Y A;  4ATL A;  4KGL A;  2CES A;  1W2V A;  2DT1 A;  5BXT A;  4WLC A;  2OYK A;  1KR1 A;  3APG A;  3GYC A;  1V6U A;  1O7A A;  1GHS A;  1JXJ A;  1US2 A;  2J7G A;  4H8U A;  4KRU A;  1E9L A;  1R87 A;  1EDG A;  3CZE A;  2YBU A;  3WD3 A;  5IHR A;  5LYR A;  1G94 A;  4P7O A;  3ZR5 A;  1W1Y A;  4AMC A;  4E4P A;  3AIW A;  1VEN A;  1KQZ A;  2JF7 A;  4M81 A;  3AIQ A;  4Y7E A;  4W8A A;  4AIS A;  1E15 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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