3N17A

Crystal stricture of e145q/y227f chitinase in complex with nag from bacillus cereus nctu2
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
326
structure length
326
Chain Sequence
LGSKLLVGYWHNFDNGTGIIKLKDVSPKWDVINVSFGETGGDRSTVEFSPVYGTDADFKSDISYLKSKGKKVVLSIGGQNGVVLLPDNAAKDRFINSIQSLIDKYGFDGIDIDLQSGIYLNGNDTNFKNPTTPQIVNLISAIRTISDHYGPDFLLSMAPETAYVQGGYSAYGSIWGAYLPIIYGVKDKLTYIHVQHFNAGSGIGMDGNNYNQGTADYEVAMADMLLHGFPVGGNANNIFPALRSDQVMIGLPAAPAAAPSGGYISPTEMKKALNYIIKGVPFGGKYKLSNQSGYPAFRGLMSWSINWDAKNNFEFSNNYRTYFDGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of bacillus cereus NCTU2 chitinase complexes with chitooligomers reveal novel substrate binding for catalysis: a chitinase without chitin-binding and insertion domains
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitinase A
molecule tags Hydrolase
source organism Bacillus cereus
total genus 115
structure length 326
sequence length 326
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2010-05-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3n17A00
1ZU8A 1AMYA 2DSZA 4QLKA 5A2AA 3N9KA 1IZJA 1VENA 4XZBA 5A6KA 3W6MA 1L0PA 3ARVA 1HVXA 3SIMA 4OZOA 1LJYA 4H2CA 1UWUA 1PX4A 5EBAA 2WBKA 4D6IA 1US2A 1E6QM 4P8WA 1OT2A 3WDHA 5I24A 4MDPA 1I75A 3MSDA 4PBGA 4TX6A 1HJVA 2WMFA 2DT0A 2ZX5A 1BG9A 1JYXA 3VDHA 1K9TA 1UYQA 5LA0A 5E0FA 4PMNA 4BA0A 1IV8A 1DWJM 2D2OA 2V5CA 2PBGA 1J0ZA 5I6SA 4XV0A 4CD6A 1ISXA 1E55A 4JKLA 2UY3A 3ARRA 4X9YA 2J62A 2A3HA 4UQ9A 3QHNA 2ZE0A 1KWGA 2WVVA 3WUFA 3EDDA 3ECQA 1C3FA 5A2CA 1E9LA 2AMGA 1OCQA 3LPGA 3WDPP 3AIEA 4JCMA 3SCSA 2CIPA 5EFDA 3AMGA 3AISA 2DEPA 4GKLA 1U2YA 1UD6A 1SFSA 2VL4A 2CBJA 1TA3A 2CERA 3MMDA 3L4YA 2VZTA 2J25A 4N0RA 3VINA 1KGUA 1GW1A 1ZBVA 2NT0A 3F5JA 2OWCA 2GUYA 4F8XA 1FP9A 5HDRA 4A3HA 5JUVA 4D6HA 1QNPA 1CXKA 2WLYA 2E3ZA 5ABGA 2OLHA 5F7UA 4GI8A 1NM9A 4C7GA 2WMKA 4W7VA 3VMPA 5E09A 3UESA 1KXQA 1E0XA 3ARSA 2ZUWA 2WSPA 4UR9A 3BAYA 3SCOA 4M56A 1W9VA 4MNJA 1TMQA 1GORA 3ARTA 1E6PA 5C70A 3CHEA 4YHGA 4W8LA 5D4YA 1PIGA 3WD2A 4RE2A 2PB1A 5EB8A 4OBSA 2CCRA 3L4TA 2EO7A 3TTSA 1GPFA 3ZMRA 1V6UA 4PRWA 1E6RA 2AOSA 4HPHA 4QDMA 3WFZA 4HZ6A 3RM9A 4AISA 3BSGA 4F79A 3AIRA 1W2PA 3UETA 2GJRA 1HJWA 5AC4A 4AZ5A 1HL8A 5LYRA 2ZUUA 4L4OA 3PN8A 3ZJ6A 3NCOA 1A47A 4EE9A 2OSYA 1BG4A 2A3BA 4KH2A 1CNVA 2XFRA 1CGTA 2EPKX 2XVLA 4JFSA 4UZSA 2VRJA 3AXXA 4GXPA 1LLOA 1VBUA 1M53A 1GHRA 3UEQA 3SCQA 1UOKA 4IUGA 2Y5EA 4MTVA 3AIQA 3RMEA 1OINA 3DC0A 4ZXLA 3A4WA 1V3KA 4F66A 4E4PA 5A6LA 3VIFA 2WC7A 3QHMA 1JYNA 2YL8A 1A3HA 2X8RA 3RCNA 5A6BA 4ACYA 1B3ZA 4PMOA 2VMFA 2G3JA 4CCCA 1KWKA 1N82A 2DSKA 3B8SA 1TA3B 1F4HA 2CHNA 2UWFA 1UR1A 4CCEA 2DPEA 4WK9A 1EQCA 2JALA 2ZX9A 3D5HA 2XTKA 4LX4A 3PZQA 1EA9C 1HJSA 3UG4A 1JZ3A 3VM7A 3SCVA 5A6JA 4BQ4A 1UD8A 4W87A 1QI3A 3GZAA 3CH9A 2FGLA 4P8VA 5DT5A 2VR4A 2J8GA 4HOZA 1X6LA 5FCZA 1VEMA 4AD3A 2D3LA 1EHNA 3U5UA 2YOCA 1W9XA 1JZ4A 2OYMA 3WQVA 3CZJA 5BWFA 2FH8A 3WBEA 2TAAA 4HP5A 3OZPA 4IISA 1VFMA 1Q6CA 3IAQA 4YPJA 1VJSA 5CXPA 1KXVA 4V27A 3NDZA 1JF5A 3L4XA 1EDTA 4R5EA 2WM0A 3UR7A 3W6LA 1LQ0A 3NUKA 2YLLA 1WCGA 3ZT5A 1V0LA 1RH9A 4OBRA 2JE8A 5A8PA 2W67A 4DWSA 4H8VA 1DWFM 2X09A 3SUSA 4M24A 1V0MA 1MW0A 2CITA 1GONA 4NI3A 1HKMA 3AHTA 1V08A 4HZ8A 1JFXA 3F5KA 4JKKA 3CZGA 3T2PA 1OB0A 1H0IA 1QI5A 4HMDA 1JXJA 2CHOA 3WMBA 4GZEA 4Q22A 3VIOA 2WVSA 3D3AA 4KMQA 4OIFA 3VIKA 1R7AA 2WB5A 2C8NA 1E3XA 5CSUA 3T09A 2ZUMA 5GNXA 5CGMA 1E73M 4HPGA 3THCA 4FK9A 1GNXA 1OWQA 1QNRA 1CWYA 3LPOA 4AZIA 4MAVA 1ZBCA 2ZUNA 2D3NA 4ZFMA 4W5ZA 2B31A 4M82A 5I79A 1C91A 2ZUVA 2WCSA 1B31A 2VX4A 4UFHA 5AYBA 1QNOA 1E1FA 2VZOA 4J3XA 2DDXA 2G8ZA 3GNOA 1W3HA 5A8QA 3CUIA 3GH7A 1KQYA 2EPMX 1YHTA 1UKOA 1V3HA 1E56A 1EIBA 4D1IA 1J9YA 2YBTA 4BF7A 1GJWA 4PMXA 5GNZA 4XUYA 1RPKA 5FKYA 2G4FA 1XRVA 3EMZA 3SURA 2XVKA 1C90A 2A3AA 2YDRA 1J0KA 1J0YA 1MFUA 2JFEX 3SEPA 4PMVA 3HU7A 3AXIA 7A3HA 3VIGA 3EDEA 4MNKA 5LA2A 3WF2A 3DECA 3A47A 1WB0A 5HOSA 1BLIA 4D1JA 3CHCA 1W9PA 3CMJA 3PZMA 2VURA 1M04A 1JZ7A 2WMHA 4UQDA 1QPKA 2PI6A 1UZ4A 1WAWA 3F5LA 1UR0A 3PZUA 2EBNA 3K4AA 2YL9A 1CPUA 4HA3A 1QBBA 2J7DA 4H41A 4M80A 1Q6EA 3CGTA 2RGLA 1H0GA 1QI0A 2VZUA 1IZKA 2ZX6A 2GJXB 2JIEA 1AQ0A 4Z2GA 1R85A 4UCFA 4Z2KA 3WH9A 3LPPA 1US3A 4MNMA 3A4AA 4PUEA 4PTXA 3I3DA 3U5YA 3VX0A 4W89A 3VDCA 3FXYA 4MDOA 4UZUA 5CPQA 3AS2A 1VEPA 3VGGA 2EPLX 3OLEA 4OUEA 6CGTA 3RO8A 4UOZA 3T0AA 3GXFA 1GOIA 2DGAA 4H8HA 1QNQA 1EO7A 2VRKA 4AEEA 2BY2A 3BAJA 5CG0A 4ZXOA 3B9DA 1E40A 2JIWA 3CLWA 2VX6A 4J28A 3BAIA 3MV11 2CEQA 3T0BA 2XVGA 5BXPA 1JDDA 1GQLA 2V38A 5BROA 4MAZA 1BYAA 1CEOA 4W8BA 5ABFB 4CD5A 5BXSA 2C0HA 1BTCA 4TTGA 1EDGA 4NZCA 1HP4A 5BRPA 3VIHA 2CKSA 1UD4A 1W1YA 2WMJA 5D8ZA 2CKRA 2G41A 1V3IA 2WKGA 4ZEPA 2NSXA 2GSJA 4KGJA 5TD4A 3MANA 3VNZA 5CGTA 4BS0A 4OJYA 4AD2A 1UWRA 1LG2A 2VQUA 1GOMA 2YIHA 1WNOA 4AIEA 1JFHA 1UZ1A 4GI9A 3VO0A 1B3VA 5KEZA 2DT2A 1HIZA 2VQTA 2WSKA 1GVYA 2PWHA 3ZR5A 1XCXA 5CJ5A 2XWDA 4CCDA 2WCGA 2BHYA 4U5KA 3WEZA 3WUEA 5D9OA 3CZEA 1JDCA 3RILA 1XH2A 3AMKA 3VMOA 3WH7A 1AVAA 3CMGA 4AZBA 1WE5A 4K68A 3WQWA 2EPNA 5E6ZA 1C7SA 4W8AA 4HMEA 3T2QA 1XD1A 4D72A 1JGIA 2JEPA 4ZENA 2ZXQA 3WNMA 3UERA 5A6SA 3GXDA 3CZKA 3O9NA 2X0YA 4JKMA 4TUFA 4S3KA 3GBDA 3SUWA 3WNKA 5FOOA 3OBAA 2J7FA 1XSJA 4JCLA 2QHAA 5M17A 4JFWA 1DHKA 1LL6A 2VCCA 4UQCA 3LPFA 1W9UA 4XZWA 2XVNA 3AZSA 2O9RA 2F8QA 7CGTA 4AMCA 3A4XA 1UA3A 3OGSA 4UQEA 4AEFA 4PMUA 3UR8A 2D0HA 3AI0A 1FH8A 3PTKA 3FAWA 1B0IA 3AIVA 2VCAA 2XM1A 4JHOA 4TOQA 1UH2A 4TXEA 3AXHA 1CGVA 2CBIA 4CD4A 1CXLA 3SUVA 3IJ7A 3RJXA 1KR1A 1OD8A 3GBEA 3BCDA 5E6YA 2J78A 4E8CA 4A3YA 3T08A 3ZOAA 4WSJA 2X2YA 4J3SA 5JBEA 3WUBA 3AIWA 2ZX7A 1E1EA 1PPIA 1JXKA 1G0CA 1PX8A 3CPUA 2GK1A 2CNCA 2E40A 4PCSA 1WP6A 3N11A 4JIEA 1CDGA 2RGMA 1E4NA 3WELA 3OLGA 1JD9A 8A3HA 4FLSA 4AIOA 3PZIA 2ZIDA 1CGWA 4WF7A 1QBAA 4D6JA 1UWSA 4Z2JA 1EOKA 3ARXA 3A6OA 3TTQA 2DT1A 4W5UA 3AYSA 1OIMA 4GQQA 2OYKA 1XYZA 4GI6A 2BS9A 1WDPA 1CTNA 2Z1KA 1BQCA 1NP2A 4GZIA 4NF7A 3L4UA 1XD0A 3GYCA 1ZL1A 1FOBA 1XGZA 1JAKA 1QHOA 1EOMA 1P6WA 4A4AA 5IHSA 5A6MA 1PIFA 1K9EA 1KXTA 1UR2A 1TR1A 4MB5A 4XX6A 2VJXA 2J7BA 5FD0A 2ZXBA 1FH7A 1VF8A 1HT6A 1PZ3A 1JZ2A 3AS0A 1E72M 3ZJKA 1FFRA 5BYWA 1PEZA 1OD0A 4J3WA 1HKJA 3W27A 4GQRA 1MW1A 1J0JA 4Z2IA 1SMDA 1H41A 2HISA 2C7FA 5BRQA 4GO9A 2E4TA 1Q6FA 3BMWA 3MUIA 1BYCA 4AXNA 1FA2A 2D0GA 3AHYA 1JIBA 2MANA 4NRRA 7TAAA 2D20A 1JI2A 3MMUA 2D23A 4QFUA 1HP5A 1E4LA 2DH2A 4NRSA 1VRXA 1Q6DA 3IAPA 1FH9A 2XSBA 5FL0A 1UHVA 1E6XM 2PBOA 5C8BB 1C7TA 2VVNA 4LYRA 5A6AA 1JZ5A 1GOOA 2GK1B 4UFMA 2J8FA 1C8YA 1JAEA 2PWEA 1FFQA 3WD3A 5A6BD 3WSUA 1LF1A 1XC6A 2JF6A 3VNYA 1W9DM 4HMCA 2WXDM 2XFFA 5A69A 2XWEA 3QOMA 3MV01 1MQPA 1CLVA 1WDSA 1SYTA 1U30A 1CYGA 1W3JA 1E3ZA 1HX0A 3PZ9A 2OWWA 4HU0A 4WKAA 1F4AA 5DMYA 2XJ7A 2EJ1A 1UQZA 4C7DA 3EDKA 2JF7A 5I77A 4JFVA 3HJEA 1YQ2A 4WJXA 1K6AA 4JL1A 3GXIA 1D7FA 1CGXA 2ESCA 3AHZA 4Q7NA 3POCA 2E9BA 1R7OA 4B9YA 4OOUA 3W28A 1V3MA 2W63A 2V3DA 3AHVA 4CVWA 3L4VA 3WL1A 2E8ZA 3VD4A 1O7AA 2XHYA 3WH8A 3DYPA 2YDSA 3QOKA 4D6DA 1S46A 4ML4A 4J7RA 1W91A 3FY1A 3CO4A 1ESWA 3GH5A 1W1TA 3AMDA 4EANA 3O2LA 2J75A 3MKKA 4QLJA 1NOWA 1OGBA 3WDIA 3WQ6A 1CXFA 1NWUA 3CUJA 1JYWA 1QW9A 4U31A 1WDRA 4GPNA 3ZSTA 4DUVA 2YJQA 1PX3A 3ZQ9A 3AQUA 4DWSD 1EDQA 3L2MA 3VIPA 4GIAA 1HL9A 5I23A 3HN3A 2QV4A 3T0DA 1DEDA 1C92A 2YKKA 3UG5A 5M5DA 2GJXA 2WPGA 2EEXA 3APGA 2BY1A 4RE4A 3EDJA 3QHOA 4LYQA 3TONA 1KFWA 1E4MM 1UKTA 1VFFA 3CZ8A 1VFUA 5D9NA 1G01A 4D6GA 3AS1A 2F2HA 4S3JA 1PAMA 1E6SM 4D71A 3AHXA 3S6TA 3RM8A 3PBGA 3N18A 2XVPA 3VGDA 2WMIB 4UOQA 3UCQA 2XIIA 3QGVA 4JHZA 3VU2A 2BXZA 3WNLA 3NSXA 4PTWA 2WHMA 3POHA 1FP8A 2YA0A 1VB9A 3VILA 3ZSSA 2VRQA 5A3HA 2OSWA 2QMJA 4AIUA 3WD0A 1WZLA 1XV8A 1E6NA 1HJQA 4P7RA 1QHZA 5A8NA 1ZBWA 3F4VA 3VD3A 1V02A 2V3EA 3CHFA 1TCMA 5ABFA 1DWGM 1GUVA 3VD9A 3MUZ1 2BVYA 3FN9A 1HXJA 4AYSA 2HVMA 4CU8A 3I3EA 2DT3A 3TOPA 1LWJA 3AIBA 1H3GA 3T2OA 1U33A 2IXUA 4U3AA 2YA1A 3VGBA 3EBVA 3VUPA 1L8NA 1K9FA 3WF1A 1BGAA 5EFFA 2O9TA 1X6NA 1E71M 3IK2A 4AW7A 1UD5A 1J11A 1NOUA 2J74A 1UWQA 3AICA 3GDBA 5I0DA 2VO5A 3NIYA 1MVYA 2PC8A 1B3XA 1TZ7A 5I2UA 3VMNA 4JL2A 3MMWA 1KQZA 2WVTA 1JI1A 4L4PA 3WDQA 2PWDA 5A94A 2WANA 4MB3A 1J12A 1XH0A 1MFVA 3WY1A 1D3CA 3BSHA 3M46A 4D6CA 4PCTA 2V5DA 1CLXA 1JF6A 3K8LA 2DSVA 2WHKA 2JEQA 5CZKA 4FLQA 2UY2A 1H1NA 3FNDA 2BNJA 2WZHA 1B2YA 5IFPA 3CUHA 4U2YA 2QLYA 3RPMA 2DIJA 3BC9A 2BY0A 5I5RA 2W5FA 4H7VA 1EH9A 4HOXA 3AOFA 4TVCA 3CTTA 5DT7A 1E5JA 3DHUA 4EKJA 2FGZA 1WZAA 3IANA 3SUUA 4CUCA 1BF2A 1OBAA 1B3YA 1KR0A 1XHGA 5IDIA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1ZU8 A;  1AMY A;  2DSZ A;  4QLK A;  5A2A A;  3N9K A;  1IZJ A;  1VEN A;  4XZB A;  5A6K A;  3W6M A;  1L0P A;  3ARV A;  1HVX A;  3SIM A;  4OZO A;  1LJY A;  4H2C A;  1UWU A;  1PX4 A;  5EBA A;  2WBK A;  4D6I A;  1US2 A;  1E6Q M;  4P8W A;  1OT2 A;  3WDH A;  5I24 A;  4MDP A;  1I75 A;  3MSD A;  4PBG A;  4TX6 A;  1HJV A;  2WMF A;  2DT0 A;  2ZX5 A;  1BG9 A;  1JYX A;  3VDH A;  1K9T A;  1UYQ A;  5LA0 A;  5E0F A;  4PMN A;  4BA0 A;  1IV8 A;  1DWJ M;  2D2O A;  2V5C A;  2PBG A;  1J0Z A;  5I6S A;  4XV0 A;  4CD6 A;  1ISX A;  1E55 A;  4JKL A;  2UY3 A;  3ARR A;  4X9Y A;  2J62 A;  2A3H A;  4UQ9 A;  3QHN A;  2ZE0 A;  1KWG A;  2WVV A;  3WUF A;  3EDD A;  3ECQ A;  1C3F A;  5A2C A;  1E9L A;  2AMG A;  1OCQ A;  3LPG A;  3WDP P;  3AIE A;  4JCM A;  3SCS A;  2CIP A;  5EFD A;  3AMG A;  3AIS A;  2DEP A;  4GKL A;  1U2Y A;  1UD6 A;  1SFS A;  2VL4 A;  2CBJ A;  1TA3 A;  2CER A;  3MMD A;  3L4Y A;  2VZT A;  2J25 A;  4N0R A;  3VIN A;  1KGU A;  1GW1 A;  1ZBV A;  2NT0 A;  3F5J A;  2OWC A;  2GUY A;  4F8X A;  1FP9 A;  5HDR A;  4A3H A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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