3N18A

Crystal stricture of e145g/y227f chitinase in complex with nag from bacillus cereus nctu2
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
327
structure length
327
Chain Sequence
NLGSKLLVGYWHNFDNGTGIIKLKDVSPKWDVINVSFGETGGDRSTVEFSPVYGTDADFKSDISYLKSKGKKVVLSIGGQNGVVLLPDNAAKDRFINSIQSLIDKYGFDGIDIDLGSGIYLNGNDTNFKNPTTPQIVNLISAIRTISDHYGPDFLLSMAPETAYVQGGYSAYGSIWGAYLPIIYGVKDKLTYIHVQHFNAGSGIGMDGNNYNQGTADYEVAMADMLLHGFPVGGNANNIFPALRSDQVMIGLPAAPAAAPSGGYISPTEMKKALNYIIKGVPFGGKYKLSNQSGYPAFRGLMSWSINWDAKNNFEFSNNYRTYFDGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of bacillus cereus NCTU2 chitinase complexes with chitooligomers reveal novel substrate binding for catalysis: a chitinase without chitin-binding and insertion domains
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitinase A
molecule tags Hydrolase
source organism Bacillus cereus
total genus 114
structure length 327
sequence length 327
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2010-05-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3n18A00
1E5JA 2QF8A 3ECQA 1MYRA 1MXDA 2VX7A 4RE2A 5A8QA 3DYMA 1JG9A 4QLLA 1BYBA 1BG4A 2D20A 2WMKA 3OGVA 1JZ7A 3QGVA 5IHRA 4U31A 3I3EA 2Y4SA 2G3JA 4V27A 4AEFA 1EOKA 1QI2A 3SUWA 3K1DA 1FOBA 1EA9C 2HISA 5E0FA 5HPCA 1WE5A 2WMGA 3CHFA 3VILA 4GI9A 3VPLA 1HIZA 4AIUA 1GNXA 3ZT6A 5GQBA 1JZ4A 4W85A 1MW2A 2F61A 3HU7A 4JL1A 3VIOA 1B2YA 2C7FA 5HOSA 3WFLA 3M7SA 5E0CA 1H0IA 7A3HA 4WIWA 2VL4A 1FP9A 5BXTA 1WDPA 4LXFA 1UWQA 4UQCA 3EYPA 1E4MM 1E6RA 2X0HA 5EFFA 4BQ5A 1BPLB 5A6BD 1JYVA 3RMEA 1GOOA 2GK1B 4JKLA 2J7HA 3POHA 3WNMA 2G3NA 4W88A 2ZE0A 1KR1A 3VIPA 3OB8A 1NOWA 3N13A 1J0IA 3CMJA 1NWUA 2O9OA 3UG3A 3AMKA 5C8BB 1PIFA 2O92A 1E72M 3WF4A 3NSXA 4PMQA 3ZJ7A 5CPTA 3GNRA 1H09A 5M3WA 1WPCA 3OGSA 4TTGA 3IJ9A 7CGTA 4TOQA 2GJXA 4GI8A 3WUBA 1PPIA 4P8XA 5HPOA 1JAKA 1FH9A 5M03A 3WBAA 1VJZA 4DUXA 1A47A 2GVYA 3BSHA 1XH2A 2BHZA 3WD4A 1UD4A 1ZU8A 5ABHA 4UR9A 2CKRA 1OB0A 1DEDA 3NYDA 1D2KA 1WB0A 2DT3A 3SCSA 3F5KA 3NIYA 1UD3A 2WMIA 3QHOA 5E09A 5ABFB 4PMVA 3VD4A 1VAHA 3MV01 1H2JA 4RL3A 3CUJA 4HOXA 2VRKA 4Z2GA 3OLIA 1OSEA 5BCAA 2VCAA 3ARSA 3UG5A 5JIPA 1UKQA 4CKQA 1UQYA 1KBBA 3ZM8A 5I5RA 1C8YA 3PZQA 1Z32X 2CXGA 3VIIA 4H2CA 4NSBA 2AOSA 1UR2A 5JBDA 1XYFA 4OZOA 3L4WA 2C0HA 1PZ3A 1XD0A 1GQJA 4OOZA 5DT5A 4GQQA 3A4AA 2ZX5A 1X6LA 1ISYA 3VM7A 3GXMA 1W1PA 1EQPA 4D72A 3SCWA 2VC9A 3SUTA 3UERA 1G9HA 4CVWA 4MAZA 1VEOA 1ZL1A 3LMYA 3RDKA 3J7HA 3IAQA 2VO5A 1G01A 1UD8A 1SR0A 1UZ4A 3VIJA 1E0VA 4UNIA 4AMCA 2VX4A 4ACZB 3ARWA 3I3BA 4CU8A 4AZGA 3FY1A 1N82A 2AMGA 4BS0A 4FMVA 4GIAA 1LL6A 4D6CA 3KEHA 1HKIA 3TTOA 5IXEA 2EPMX 4CD6A 5IFTA 1EDQA 2CERA 1HN1A 3BMWA 3L4ZA 4FLQA 3AIEA 1C8XA 4L4PA 5GNZA 2VX6A 1JD9A 1GOWA 2VZSA 4TUFA 3GNOA 1FP8A 2PBOA 3VGFA 3DHPA 4MJ2A 3PZNA 2CETA 4D6JA 2WWCA 2V3DA 4DWSB 1CBGA 4CCDA 1IZKA 4DWSC 1J01A 1TR1A 2V38A 2WNWA 1E15A 2EBNA 1OT1A 2BFGA 3VD3A 1HJVA 3BAWA 8CGTA 4U3AA 2D1ZA 3FXYA 3GYCA 3MUZ1 3WEZA 1MQPA 2O9TA 3CO4A 4C7GA 1V3LA 4EANA 1CGYA 3FW6A 1HL9A 3VMNA 2GFTA 1KCLA 2JEQA 3NJ3A 1QI0A 2W61A 3SIMA 5CGTA 1CGTA 4URIA 1LG1A 2J47A 1D3CA 3RM4A 4NRRA 4HMDA 1OIFA 3N04A 2J74A 2W91A 3M6DA 2WW5A 3ZT7A 2WSKA 1GQLA 1HVQA 4PYSA 1WNOA 1UR0A 5I78A 3W27A 3OLEA 1TZ7A 1GOKA 3VM5A 1XH1A 1VIWA 1EDTA 5KZ6A 2A3HA 3VGBA 1HXJA 2WZEA 1GQIA 2DSVA 1TA3A 2G3MA 4W87A 4PMUA 3EMQA 4NRSA 1Q6CA 1NQ6A 3WMCA 1Q6GA 1BTCA 2YA0A 2XYLA 1GVIA 1BVNP 5D9OA 3HJEA 3SUVA 2WVVB 1V02A 4W5ZA 3AISA 2GDVA 3EDDA 3MSGA 1JIBA 3CH9A 1ZBWA 4QAWA 3SUSA 1CXIA 4X0NA 1UKSA 1C90A 1J0ZA 3WIJA 4PUEA 3GTNA 1Q6EA 1GHRA 3OLGA 1LL7A 3BXWA 3O2LA 1DHKA 1W9PA 4E8CA 2ZX9A 2XM2A 3T08A 2ZXAA 1E9LA 1LF1A 1SFSA 4B9ZA 4S3KA 4TTUA 1F4AA 1V3HA 4AXNA 1VRXA 3PZOA 1CGWA 5A2BA 2WZIA 3AIQA 1V03A 4XX6A 1BHGA 1UWSA 1JYWA 3ARRA 4MADA 2WLZA 5I79A 2ZUSA 2UY4A 4H41A 4JKMA 2PF0A 2WVTA 3GH5A 4XZBA 1C92A 3WH5A 2J78A 4AD4A 2WLYA 2D3LA 5DEZA 3WF1A 2Y5EA 6CGTA 3WDIA 4UCFA 2BVDA 3U57A 1MW0A 2YA2A 2FGLA 2PI6A 4UQDA 4B16A 1AMYA 1EIBA 2VZTA 4J7RA 3SCUA 3CUFA 4TX6A 1OM0A 4U3CA 3LPOA 1XV8A 2DIEA 1HL8A 2OLHA 3AFBA 2XVGA 3BGAA 2XWDA 1W1VA 1UA7A 2BY1A 2PWGA 4R27A 5CPQA 4MTVA 3MMWA 5IHSA 4UOZA 5I24A 3VOCA 4YN5A 1FA2A 3CUHA 3VKKA 3WDJA 3NSMA 3O6AA 3L2MA 2D24A 1JZ6A 2ZWYA 1SYTA 1QPKA 3LPFA 5A95A 3CHDA 4UFMA 3GXFA 2FH8A 1H41A 2BVTA 3DHUA 4YHGA 2Y8KA 4WSJA 3SCRA 4P7NA 2X05A 2W67A 3QR3A 2V3FA 3WQVA 1UWUA 1B3YA 4HU0A 2QHAA 5D9PA 1XSIA 3VTRA 1QNPA 2ZUNA 3CLWA 2OYMA 4UFLA 4CCEA 1K9EA 3L4XA 1W3HA 1JD7A 1KGXA 2JALA 5I23A 3ARYA 4UQEA 4PCSA 4QP0A 3K8MA 1UKPA 1ZBVA 3L4YA 2DT1A 4AZ6A 3RO8A 5M5DA 1V6XA 2XWEA 4U33A 2VRJA 5DO8A 3ZT5A 1TE1A 1CECA 2VT0A 3KE0A 1E56A 1ZBCA 3ARUA 4PTWA 4KRUA 1HKKA 1R8LA 1GZJA 2VVNA 4DM1A 3AIUA 4HTYA 3EDEA 2WBKA 5I2UA 3QHNA 4M8UA 3AMGA 2EXOA 2D0FA 2ZUUA 1WZMA 1KGWA 4IPLA 1QI5A 1US2A 2X09A 4PSRA 2E0PA 1X6NA 1RP9A 3CMGA 1K6AA 4MB1A 2GSJA 1GOQA 1KCKA 1XHGA 3GBEA 4AD5A 3VIFA 4HMCA 3MO4A 1FH7A 1C7SA 1H0GA 2VX5A 4Z2HA 5BWFA 5A3HA 4EK7A 4AZIA 2QMJA 5C71A 3MSDA 4AZCA 5JUVA 3MU7A 4UFHA 1QI3A 4Z2LA 4ZXOA 3BH4A 3WNNA 3OBAA 1BYCA 2J7CA 4M81A 4EAMA 5BXSA 1V02E 4ZFMA 3VNZA 1UD2A 1H1NA 4CUCA 4F8XA 4OBSA 3GM8A 4B3LA 1MFUA 4D6GA 1KR0A 2YIHA 3WNOA 4P8UA 1H11A 2J25A 3VDBA 3T2PA 4WK9A 5ABFA 3VGHA 1B31A 3ZOAA 4AY1A 1UR9A 4W84A 3AZSA 1V0LA 1E6NA 5A6KA 1E4NA 2J62A 1XCWA 3WD2A 5A69A 3CHEA 2WHLA 4WF7A 2Y2WA 5D8WA 2O9PA 4LYPA 4WSKA 2JF7A 3MUIA 2W66A 1J11A 3GZAA 3PZ9A 4FF5A 4RE3A 3F5JA 2DH3A 3VU2A 2CPUA 2G4FA 1DWAM 3AS2A 1JZ3A 3LPGA 3BAIA 2XIIA 3UCQA 1B3ZA 4DM2A 4Y7EA 1O6IA 1EXPA 4C7DA 1NWTA 2YBUA 4WJXA 3PZTA 3OA5A 4D71A 2F2HA 3WEOA 3WMSA 4GPNA 1OCQA 5A6AA 4W7VA 2CESA 1HJQA 4P8WA 5AY7A 1XH0A 4BCEA 3AIBA 4PN2A 1WP6A 1UG6A 3WUFA 1F4HA 3WL1A 1CXFA 3AIRA 1J0JA 1BAGA 1J10A 5CQ1A 3UESA 3FN9A 3GDBA 5FCZA 4JHZA 4U5IA 3NCOA 1R7AA 1FH8A 3NSNA 1UKTA 2VI0A 2WVSA 2OSYA 1MXGA 3KL5A 4HA4A 2V5DA 1BQCA 1KQYA 1C93A 2CBUA 2W4XA 1NOFA 2XGIA 5FD0A 3AZRA 3EMZA 1CXLA 5BRPA 2J79A 2WCGA 1GJUA 3IK2A 1VB9A 2E8YA 3WDRA 2J7EA 3PTKA 4DWSA 1GOMA 3I3DA 2BS9A 2YL9A 3GXIA 1MW3A 3W6LA 5ABEA 1VJSA 4AZ7A 3KWXA 1GJWA 1WKYA 2DSWA 2XM1A 1TVPA 4GXPA 1V3MA 4KH2A 1Y7VA 4LPCA 4A3HA 1QOXA 4H7VA 2X1IA 5EMYA 3A4XA 2WM0A 5E70A 1QHPA 5A8PA 2OWXA 5ABGA 1UWRA 5IFPA 1GVYA 5BYWA 1VENA 3CUIA 1CLVA 8A3HA 4RE4A 1ISZA 1ZJAA 3THDA 4PTXA 5CGMA 1AQMA 3PBGA 1U33A 1AQHA 5EB8A 3SCPA 2FHBA 2BV9A 3OZOA 4J3TA 1J0HA 4CD5A 4GQRA 1ITXA 1E0XA 1SMDA 2OYKA 2D23A 1VEPA 2DEPA 4U2ZA 2FGZA 3W38A 1ECEA 1GQKA 2UY2A 1CEOA 2J8FA 2XJ7A 2JIWA 1KWGA 1HJWA 2W5FA 1CYGA 1KXQA 3EDJA 1GORA 1RH9A 1J12A 1ODZA 4A4AA 1CWYA 1E6QM 3RIKA 3W6MA 3TTSA 5D9NA 4Z2KA 3IANA 4D6FA 3VO0A 4JCLA 4KMQA 3VD5A 4P7QA 3POCA 1CXHA 3GNPA 3RM8A 3SCTA 1EGZA 1TMQA 3AHZA 2ZUMA 2X0YA 3WNKA 2XVNA 1BSIA 1UR1A 1H3GA 2IXVA 3CBWA 1EQCA 3AROA 3ZR5A 1NWRA 1VBRA 2J4GA 3DYPA 3WQ4A 1E6XM 3WN6A 2WPGA 4AZBA 2YKKA 3QOMA 2BY0A 3HMCA 4V2XA 1W2VA 3W29A 4OIFA 2BVYA 2ZIDA 1ISXA 2PWDA 1LWHA 2E9BA 2YJQA 5JBFA 1V0KA 1ISVA 4QLJA 2OWWA 4PCTA 1U2YA 5FL1A 2XSBA 4ZXLA 1V6UA 2VR4A 2E9MA 5JIWA 3AHXA 4UZUA 1VFOA 3QOKA 1WZLA 2J7BA 3WDHA 3AS0A 4ATDA 3BSGA 1UR4A 2VRQA 4GZIA 2WMFA 5E9AA 2WMIB 3TTQA 4UFJA 3D3AA 4QCEA 4JFTA 5I77A 5D4YA 3II1A 4D1JA 1GW1A 1U30A 4MDOA 3WH9A 3OG2A 1ITCA 1JI2A 1EO5A 3DYOA 2Z1KA 1J0KA 4PUDA 4ATLA 1V3KA 4HP5A 1E4IA 3EDFA 3B9DA 1KQZA 5A2AA 2G8ZA 3F5LA 1BF2A 1LQ0A 2IXUA 3AICA 1CXEA 1QBBA 3WQ8A 1MWOA 4M80A 4HZ6A 5CZKA 3B8SA 3L4UA 5A6LA 2QMKA 1R7OA 1GHSA 1CENA 1UWTA 4C7FA 3W4RA 1G0CA 2WHJA 4IM4A 4GKLA 1Q6FA 1FHDA 3SURA 2E8ZA 2CBIA 2FHFA 2WANA 2DT2A 2DT0A 4M24A 3O9NA 2WC7A 2ESCA 1FHLA 1B3VA 1PZ2A 3VIGA 4MB5A 1OT2A 1XRVA 2A3CA 2J7GA 1ZBKA 3WDPP 4ZE4A 2W62A 2EEXA 4F79A 4FLRA 5CJ5A 3OZPA 4R5EA 4OKDA 1H49A 3W53A 2JE8A 3MMUA 1DP0A 3SUUA 1HT6A 2BY2A 1HF6A 2NSXA 1H5VA 4OJYA 3L2LA 5BRQA 4QLKA 1J0YA 1QW9A 1SMAA 4YPJA 3W25A 3EDKA 2ZXBA 4LGXA 4DUWA 5CPSA 2UWFA 2FHCA 4WKHA 1DTUA 1KB3A 2PWEA 2YOCA 2VUYA 2ZWZA 1UUQA 2A3EA 4UFKA 2W63A 3FAXA 1RP8A 2OSWA 4MB3A 4MPKA 3TA9A 9CGTA 3ARZA 3WL0A 3GBDA 4KGJA 1DWIM 1DWHM 2WB5A 1CGXA 3KL0A 2J8GA 2CIPA 1E43A 2C8NA 3VIMA 4FLSA 1AVAA 2YL5A 1CTNA 4AZHA 4MB4A 1CGUA 1OGSA 4WLCA 3W26A 4N0RA 1VBUA 3VGDA 1BYAA 1BGAA 3WENA 2MANA 2BNJA 3E1F1 4E4PA 5TD4A 4L4OA 1FFRA 2VR5A 4XV0A 3ZJ8A 4PTVA 3A4WA 3T0AA 1JF5A 1E6PA 1UR8A 1JYNA 1HX0A 1WO2A 2WBGA 3PTQA 2ZXDA 4J3UA 5FL0A 1G5AA 3AJ7A 3CUGA 3THCA 1MQRA 1GCYA 5LA1A 3G6LA 3K8KA 2D0GA 3ZSSA 2D22A 4W7UA 1DWFM 4JAWA 3WF0A 3T2OA 3WNPA 4PMZA 1BVZA 3PZIA 2WMHA 4HPHA 4BQ3A 1TA3B 4CD8A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1E5J A;  2QF8 A;  3ECQ A;  1MYR A;  1MXD A;  2VX7 A;  4RE2 A;  5A8Q A;  3DYM A;  1JG9 A;  4QLL A;  1BYB A;  1BG4 A;  2D20 A;  2WMK A;  3OGV A;  1JZ7 A;  3QGV A;  5IHR A;  4U31 A;  3I3E A;  2Y4S A;  2G3J A;  4V27 A;  4AEF A;  1EOK A;  1QI2 A;  3SUW A;  3K1D A;  1FOB A;  1EA9 C;  2HIS A;  5E0F A;  5HPC A;  1WE5 A;  2WMG A;  3CHF A;  3VIL A;  4GI9 A;  3VPL A;  1HIZ A;  4AIU A;  1GNX A;  3ZT6 A;  5GQB A;  1JZ4 A;  4W85 A;  1MW2 A;  2F61 A;  3HU7 A;  4JL1 A;  3VIO A;  1B2Y A;  2C7F A;  5HOS A;  3WFL A;  3M7S A;  5E0C A;  1H0I A;  7A3H A;  4WIW A;  2VL4 A;  1FP9 A;  5BXT A;  1WDP A;  4LXF A;  1UWQ A;  4UQC A;  3EYP A;  1E4M M;  1E6R A;  2X0H A;  5EFF A;  4BQ5 A;  1BPL B;  5A6B D;  1JYV A;  3RME A;  1GOO A;  2GK1 B;  4JKL A;  2J7H A;  3POH A;  3WNM A;  2G3N A;  4W88 A;  2ZE0 A;  1KR1 A;  3VIP A;  3OB8 A;  1NOW A;  3N13 A;  1J0I A;  3CMJ A;  1NWU A;  2O9O A;  3UG3 A;  3AMK A;  5C8B B;  1PIF A;  2O92 A;  1E72 M;  3WF4 A;  3NSX A;  4PMQ A;  3ZJ7 A;  5CPT A;  3GNR A;  1H09 A;  5M3W A;  1WPC A;  3OGS A;  4TTG A;  3IJ9 A;  7CGT A;  4TOQ A;  2GJX A;  4GI8 A;  3WUB A;  1PPI A;  4P8X A;  5HPO A;  1JAK A;  1FH9 A;  5M03 A;  3WBA A;  1VJZ A;  4DUX A;  1A47 A;  2GVY A;  3BSH A;  1XH2 A;  2BHZ A;  3WD4 A;  1UD4 A;  1ZU8 A;  5ABH A;  4UR9 A;  2CKR A;  1OB0 A;  1DED A;  3NYD A;  1D2K A;  1WB0 A;  2DT3 A;  3SCS A;  3F5K A;  3NIY A;  1UD3 A;  2WMI A;  3QHO A;  5E09 A;  5ABF B;  4PMV A;  3VD4 A;  1VAH A;  3MV0 1;  1H2J A;  4RL3 A;  3CUJ A;  4HOX A;  2VRK A;  4Z2G A;  3OLI A;  1OSE A;  5BCA A;  2VCA A;  3ARS A;  3UG5 A;  5JIP A;  1UKQ A;  4CKQ A;  1UQY A;  1KBB A;  3ZM8 A;  5I5R A;  1C8Y A;  3PZQ A;  1Z32 X;  2CXG A;  3VII A;  4H2C A;  4NSB A;  2AOS A;  1UR2 A;  5JBD A;  1XYF A;  4OZO A;  3L4W A;  2C0H A;  1PZ3 A;  1XD0 A;  1GQJ A;  4OOZ A;  5DT5 A;  4GQQ A;  3A4A A;  2ZX5 A;  1X6L A;  1ISY A;  3VM7 A;  3GXM A;  1W1P A;  1EQP A;  4D72 A;  3SCW A;  2VC9 A;  3SUT A;  3UER A;  1G9H A;  4CVW A;  4MAZ A;  1VEO A;  1ZL1 A;  3LMY A;  3RDK A;  3J7H A;  3IAQ A;  2VO5 A;  1G01 A;  1UD8 A;  1SR0 A;  1UZ4 A;  3VIJ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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