3N18A

Crystal stricture of e145g/y227f chitinase in complex with nag from bacillus cereus nctu2
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
327
structure length
327
Chain Sequence
NLGSKLLVGYWHNFDNGTGIIKLKDVSPKWDVINVSFGETGGDRSTVEFSPVYGTDADFKSDISYLKSKGKKVVLSIGGQNGVVLLPDNAAKDRFINSIQSLIDKYGFDGIDIDLGSGIYLNGNDTNFKNPTTPQIVNLISAIRTISDHYGPDFLLSMAPETAYVQGGYSAYGSIWGAYLPIIYGVKDKLTYIHVQHFNAGSGIGMDGNNYNQGTADYEVAMADMLLHGFPVGGNANNIFPALRSDQVMIGLPAAPAAAPSGGYISPTEMKKALNYIIKGVPFGGKYKLSNQSGYPAFRGLMSWSINWDAKNNFEFSNNYRTYFDGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of bacillus cereus NCTU2 chitinase complexes with chitooligomers reveal novel substrate binding for catalysis: a chitinase without chitin-binding and insertion domains
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitinase A
molecule tags Hydrolase
source organism Bacillus cereus
total genus 114
structure length 327
sequence length 327
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2010-05-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3n18A00
2J74A 2ZE0A 5CZKA 1CGTA 1CGUA 1E1EA 1E55A 3EBVA 4S3KA 4BS0A 1E40A 3W82A 4B16A 4D1IA 2VZSA 1RPKA 1FA2A 1CGYA 2WVVB 4M8UA 1W2PA 2CBUA 4L4PA 2YL5A 4WF7A 5LA1A 1HJWA 3EDFA 3AS0A 3SUVA 2XG9A 1UKOA 4AZGA 1EDGA 3CHEA 4LX4A 4D6GA 3W0KA 3ARVA 1OT2A 1UD8A 1E4LA 2WAGA 3VD5A 3CZLA 4QLLA 2PWGA 3VDBA 4UFMA 3L4ZA 1JI2A 2WB5A 2VRKA 4MDPA 2QV4A 2VZVA 4JCMA 2IXUA 5DEZA 2CPUA 3OIHA 4YPJA 4AEEA 4FLQA 1HKJA 2O92A 5CSYA 1LL4A 2D23A 4PTMA 4E4PA 2XGIA 3CPUA 2WW5A 3K4AA 2X8RA 3B9AA 1C90A 4PCSA 1J0KA 3AMLA 2O9RA 3WQ4A 1OT1A 2YJQA 4C7DA 4YHEA 4WKFA 5I5RA 3CLWA 4PUEA 3NDZA 1D2KA 1HNYA 2ZXQA 1XYZA 1LL7A 3ARTA 1JD7A 5M5DA 1BQCA 3AHXA 3AMDA 8A3HA 3LMYA 5ABGA 1BGAA 3ARYA 3M07A 1HP5A 3AS3A 4ACZA 3SCRA 1SYTA 3EDDA 4DM1A 4V2XA 1GQKA 3ZMRA 1X1NA 2WMFA 3ARWA 4LYPA 2A3EA 4W85A 3ZO9A 3GH5A 1UD3A 3LPGA 3SCTA 4CD5A 2V3DA 5FL1A 3IJ8A 4Q22A 2Y4SA 3WDJA 2VQUA 5M3WA 1UQYA 2V3GA 4UNIA 1V6UA 1V0MA 2ZX9A 2ZUSA 2WHKA 3ZSSA 3GNOA 5EFFA 1EIBA 2ZUVA 4PN2A 1C92A 1JFHA 1U2YA 3BAJA 1XD1A 2WHJA 1OB0A 5GNZA 1E1FA 4U33A 4NRRA 2CEQA 5E9AA 1CXEA 2WXDM 4AZHA 2XM2A 4HOZA 1E6NA 1SR0A 2YA0A 4UZSA 5JBEA 2VQTA 3WBEA 3RIKA 3OGSA 3WMBA 2EPKX 2QMJA 1MW3A 2D22A 4PTWA 4AWEA 2A3HA 2WK2A 4NSBA 3VDCA 5HDRA 3K8MA 2DIEA 4ZEPA 2OSXA 2QHAA 1GONA 1PAMA 1CYGA 3WH6A 2X1IA 4AD3A 1CPUA 1H41A 2VZTA 2PWHA 1R87A 5A6SA 3AMGA 4TTUA 1KWGA 4CD8A 1U30A 2VMFA 7TAAA 3LPOA 4GPNA 3WF0A 4MB5A 5I0DA 1AVAA 2ZWZA 5A3HA 2DSKA 5F7UA 1E56A 4D6FA 4D1JA 1E73M 3ALGA 4M24A 2X05A 2ZUTA 3QHNA 3U5UA 5I77A 1QHZA 3KE0A 1K9TA 5A6LA 4P8XA 1W1VA 3SEPA 1WO2A 5JBDA 2F61A 1JZ5A 3DC0A 3RO8A 5JIPA 1J10A 3GXIA 3T0AA 2EPMX 5CLTA 1WCGA 4WKHA 2AMGA 1QPKA 3W6MA 2XFFA 1Q4NX 3F5LA 3VIIA 1Z32X 1JYWA 1EQCA 1KCKA 4HU0A 1B0IA 3NJ3A 1J18A 2HISA 1DWHM 4MJ2A 2J77A 1PPIA 3SUUA 3DHPA 3VIFA 3CZGA 1QOXA 1HL9A 1BYCA 1KGXA 1E4IA 3N18A 1WDRA 3GNRA 5AYIA 1H3GA 4IM4A 2DH3A 4MPKA 2Z1KA 2XVPA 2VI0A 1B30A 4XUYA 1SFSA 4URIA 1KQYA 1EHAA 4UZUA 3VGFA 1CXFA 2A3AA 3AIBA 3N11A 5E0CA 1JF5A 1CZ1A 1IV8A 2GDUA 3OZOA 4AZ5A 4W87A 1I75A 1EQPA 2XGBA 2D0HA 3AZTA 2WMKA 1E0VA 2VX4A 3WH8A 1GQLA 4M56A 1GOWA 2VTFA 4ACZB 1EH9A 4LYQA 2XSAA 3VD3A 5FKYA 1FHLA 5A8NA 3CZ8A 1VFMA 1JZ3A 1FH7A 2WZEA 4DWSD 3MMUA 2YDQA 3AOFA 3RDKA 1W3JA 2O9OA 4AZBA 3HN3A 1C8XA 2WCAA 4OIFA 2OLHA 2ZUUA 2YLLA 2Y24A 4WKAA 3MSGA 2VX6A 3VIGA 1WAWA 3AQUA 4HMEA 1KXQA 3L4XA 4V28A 2OSWA 1HVXA 1LQ0A 3WDIA 8CGTA 1U33A 4AMCA 2Y5EA 1ISVA 1NWUA 3A6OA 3PTMA 3VU2A 2W66A 5CJ5A 1J0JA 2J4GA 2C7FA 3U7BA 1BVZA 2Q8XA 1M01A 1V6VA 4PSPA 2FHBA 4W5ZA 3DYOA 4QCFA 4ATLA 3T09A 1JZ6A 4WSKA 2NT1A 2FHCA 3WY1A 1V3KA 1IT0A 1WZMA 3BAIA 1WKYA 4UFKA 3FW6A 4U5KA 3CBWA 4DWSA 2D3LA 4XB3A 2XIBA 3BSHA 3WNLA 2ZX7A 4MDOA 4GI8A 3I3EA 1KBKA 5A1AA 2W4XA 4PSRA 4PTVA 1TE1A 4A3YA 1US3A 1XCWA 4V27A 2VZOA 1NARA 1GHSA 1VIWA 2VVNA 3MANA 1HJUA 4J28A 5I78A 3WL0A 3RM9A 4CU6A 3EMCA 1EOMA 3WF3A 1GOQA 3AIQA 3SCOA 2J7DA 3VM7A 4ZENA 5C70A 4HTYA 4CN4A 2YDRA 2G3IA 4JFSA 1MFVA 3QHMA 3WN6A 1OGBA 4UQ9A 1JNDA 1E9LA 2ZICA 5A6JA 1HJQA 3WQ6A 1HT6A 5A2AA 4LGXA 1CTNA 4J3XA 3AS2A 3AHZA 1ZU8A 3WF2A 3WEOA 1W3LA 1ZBCA 4CD4A 3MU7A 3AIRA 2WC4A 1NP2A 1V3LA 1QBAA 2G3MA 4FLOA 1BAGA 4HMCA 1W32A 2RGMA 2QPSA 5E70A 1BPLB 3PN8A 5CPQA 1UD5A 3CUJA 2ESCA 3F5KA 2UY5A 4C7FA 4RE2A 4CGTA 4U31A 4Z2IA 2WMHA 3SCQA 4PUDA 1JDDA 2OWXA 1PEZA 1RH9A 4BQ4A 1ODUA 3MUAA 3A4WA 2BFGA 4P7RA 2D3NA 3WUFA 5ECUA 1HKMA 1R85A 1BGGA 1XV8A 2OYMA 3VIKA 1GJWA 1PX3A 1PZ3A 4W89A 1DTUA 4J3SA 2BNJA 1UH4A 1XH1A 3GBDA 1FFQA 3WQ5A 2Z1SA 1K9DA 1FH9A 3VDHA 4OJYA 5C71A 4DWSC 4JHOA 3GXFA 3MUIA 4CU7A 4U5IA 4CN6A 5I23A 1ZJAA 1W9XA 2JF7A 5EFDA 3VM5A 1H1NA 2J8FA 1M04A 2WYSA 1NQ6A 4NF7A 3WSUA 1VENA 5A69A 2V5CA 4HOXA 2WBGA 4DUWA 1GUVA 1UD4A 2PWEA 2NW0A 2XWEA 1OINA 5A8OA 2XIIA 2X09A 2UY3A 3N1AA 6TAAA 4PMRA 3CO4A 1MW1A 1TVPA 2GJPA 1VEMA 3BLKA 4OUEA 3VX0A 3AIWA 5BRQA 4CD7A 2PF0A 3WDRA 2PWDA 4KMQA 1R7OA 1BYDA 3VMNA 2J75A 4M29A 1B3VA 1E3ZA 2FDMA 4IUGA 1CXKA 3KEHA 2A3BA 1V0KA 1DWIM 4EK7A 5BWFA 4E8CA 1E6QM 4HZ8A 3WNNA 2PI6A 3W27A 4BF7A 4GZJA 3FHAA 1R86A 2W5FA 4XZBA 1J9YA 2YOCA 5CGTA 4D72A 1M03A 1P6WA 4KGLA 3U5YA 2JEPA 2NSXA 2FGZA 2OYLA 4JFWA 3WNOA 5BROA 1GPFA 1JNEA 5TD4A 4N0RA 1UR1A 1Q6CA 5DT7A 5CLWA 2FH8A 1V3JA 2W62A 2EPNA 3GM8A 3WUGA 5DT5A 3AZSA 1GVYA 4XV0A 4HA1A 1VFOA 3SCUA 3VNZA 5FOOA 2G41A 3IAPA 1YQ2A 1KBBA 1WDQA 2QLYA 3AIVA 5IHSA 1X6NA 3O6AA 5GNXA 5I2UA 1MVYA 3THCA 4PMQA 1JZ2A 3OLEA 2VRQA 3VOCA 2PWFA 3MMDA 1JG9A 3FAWA 1D3CA 4MADA 3L4VA 1CLXA 3RPMA 3T08A 2BV9A 3BCFA 3CUGA 3PBGA 1Q6FA 2ZWYA 4QDMA 1HIZA 2WSPA 4ML4A 1EDTA 1E0XA 4GZEA 4W88A 4UCFA 4CN1A 1KGWA 4W5UA 2ZUMA 2XVLA 5BRPA 2E8YA 4PCTA 4GQRA 2J47A 4HOWA 4HPHA 1JD9A 4U2ZA 3AS1A 2BXYA 4HP5A 5BXPA 1W9UA 1OIMA 5A8MA 4F9JA 5I6SA 4M81A 1C93A 2WM0A 1QW8A 3EMZA 4UQAA 1BVNP 4W7VA 4AISA 3PTKA 4QLKA 3UG4A 3LPFA 3N17A 3FXYA 5M03A 2CXGA 3THDA 2YA2A 5HXMA 1O6IA 1K9FA 2WCSA 4MJ4A 3ZJ6A 5BXTA 1VBRA 4H2CA 3L4UA 4JAWA 1JXKA 3MKKA 4JFTA 2GK1A 1F4HA 2CCRA 3WQ8A 2BHZA 3VO0A 2WLZA 1FFRA 1BFNA 2XJ7A 4PTXA 2JIWA 1Q6EA 4A3HA 1ISZA 3W37A 3WD0A 3MUY1 5JIWA 3F5JA 4YHGA 4W93A 4AD2A 4QP0A 4LQ1A 1CLVA 4P7NA 4Z2LA 1K6AA 1UZ1A 4X0VA 3AHVA 5DO8A 3BAYA 5CG0A 1GORA 3DHUA 3FAXA 2W92A 2FGLA 5E6YA 4S3JA 4JKLA 1J0IA 3IJ7A 4AXNA 3UERA 4PRWA 1HN1A 3NIYA 3L2LA 1RD6A 1XSJA 1YHTA 3PZUA 4XX6A 2E9LA 1DP0A 4J27A 5D9NA 3WQVA 3QR3A 3ARRA 3WDPP 2WZHA 3WELA 5ABFA 2GVYA 1VEOA 1V03A 1WP6A 5FIPA 3ARQA 4QFUA 3U7VA 1MW2A 1NH6A 4MNJA 1E6XM 3PZMA 3IJ9A 4CCDA 3W24A 1W91A 2AAAA 3M46A 3DYMA 2CESA 3ARUA 1BSIA 2XUCA 1J01A 1QHOA 4Z2GA 3VTRA 4W7WA 2BY0A 3CMJA 2CHOA 1BTCA 1GOKA 1HJVA 1E6SM 2X0HA 3BAWA 3VNYA 2JF6A 1EOKA 1E5JA 1KR0A 4BA0A 4EANA 1Q6DA 5FL0A 3II1A 3PZ9A 1UQZA 4E8DA 2EO7A 1QNQA 1W3HA 3PZNA 4FLRA 1WZLA 2QPUA 2DEPA 2DT0A 3T2OA 2XVGA 4OOZA 5DF0A 5D9PA 3VD4A 4HA3A 2JE8A 4PEEA 3M7SA 1KR1A 2DIJA 3PZIA 2G8ZA 3WDQA 1V08A 2UY2A 1DWGM 4KGJA 3S6TA 4E2OA 2IUZA 1TVNA 4OBRA 4MB3A 3CHCA 2C8NA 4MB1A 1OWQA 4JFUA 3SUWA 2CNCA 2ZUNA 3WIJA 1UHVA 1ESWA 1MW0A 1ITCA 1TCMA 1UUQA 3GH4A 3BAXA 4DM2A 1CBGA 1B90A 5A6BD 2G4FA 1B9ZA 4TVCA 4GZIA 1ISYA 3ZM8A 1JDCA 1UKTA 5CPSA 4J3UA 1JF6A 1E3XA 1TR1A 4TUFA 5A2BA 1BF2A 1UH2A 3QHOA 3S2CA 2EPOA 3W53A 1FH8A 4A4AA 5ABEA 1QI4A 2F2HA 4UTFA 2HVMA 1JYXA 1ISWA 4D6CA 3F4VA 3CZJA 3EDJA 4X0NA 2VO5A 3PZTA 1PJ9A 3VDAA 1IZKA 5I79A 3WKZA 1VEPA 1QHPA 3EMQA 1EA9C 3KL5A 4BQ3A 3NUKA 1J11A 2DSWA 5CGMA 1J0ZA 1QI2A 1V3MA 3GBEA 1B3WA 4RL3A 4B15A 4F9DA 3OB8A 1AMYA 1JXJA 3KL0A 1LL6A 3VGBA 4D6EA 4HZ6A 4HZ7A 1KWKA 4TVUA 3VPLA 4F8XA 1W9PA 1B3ZA 1PX8A 5CPTA 5HPOA 1A3HA 2CHNA 4OBSA 4PMUA 2VL4A 4MNLA 2ZUWA 4UQDA 3QOKA 3BC9A 1WB0A 3ZSTA 1UOKA 3VMOA 3O2LA 3UG3A 2QMKA 2BXZA 3ZOAA 2WVUA 1AQHA 3VILA 1UKSA 2VR5A 4UR9A 1KB3A 2ZX6A 3BSGA 2EQDA 1XCXA 1E15A 2YDSA 1E6RA 1DWFM 3PZOA 5GQBA 3VIJA 4PMVA 4W84A 2D0FA 6A3HA 3O9NA 4JL2A 2CKRA 1VFFA 2VRJA 4H8VA 4W8BA 1PIGA 1E0WA 2BVYA 2OYKA 2EEXA 1HJSA 3OLDA 1UD6A 4U3CA 4W8AA 5CQ1A 2O9PA 1HL8A 1XSKA 1US2A 3VIMA 4HA4A 3EYPA 2XTKA 2BS9A 1KXHA 3UESA 2WCGA 5EMYA 3OZPA 3CTTA 2VJXA 2CBJA 2VNCA 4M1RA 3GTNA 1KQZA 3L2MA 2CKSA 3SCWA 2C0HA 4M80A 1R8LA 1TG7A 3WDHA 3A47A 1WZKA 3AXXA 1I1WA 3VX1A 2J8GA 2VZUA 3ARSA 1HXJA 2WMIA 1N82A 4JIEA 3AHYA 1GHRA 1TA3A 4FLSA 2VCCA 3WF1A 4Z2JA 2XSBA 5D9OA 3JUGA 2YIHA 1HVQA 4W8LA 2Y8VA 1CXHA 1B2YA 1FOBA 5DMYA 1GQIA 3A4XA 1G9HA 1CECA 4TX8A 1E70M 4Z2KA 1UWUA 1OD0A 2MANA 3GDBA 5A8QA 2E4TA 1E71M 3FY1A 5A8PA 1V02E 2J7EA 4GINA 3EDEA 2V5DA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2J74 A;  2ZE0 A;  5CZK A;  1CGT A;  1CGU A;  1E1E A;  1E55 A;  3EBV A;  4S3K A;  4BS0 A;  1E40 A;  3W82 A;  4B16 A;  4D1I A;  2VZS A;  1RPK A;  1FA2 A;  1CGY A;  2WVV B;  4M8U A;  1W2P A;  2CBU A;  4L4P A;  2YL5 A;  4WF7 A;  5LA1 A;  1HJW A;  3EDF A;  3AS0 A;  3SUV A;  2XG9 A;  1UKO A;  4AZG A;  1EDG A;  3CHE A;  4LX4 A;  4D6G A;  3W0K A;  3ARV A;  1OT2 A;  1UD8 A;  1E4L A;  2WAG A;  3VD5 A;  3CZL A;  4QLL A;  2PWG A;  3VDB A;  4UFM A;  3L4Z A;  1JI2 A;  2WB5 A;  2VRK A;  4MDP A;  2QV4 A;  2VZV A;  4JCM A;  2IXU A;  5DEZ A;  2CPU A;  3OIH A;  4YPJ A;  4AEE A;  4FLQ A;  1HKJ A;  2O92 A;  5CSY A;  1LL4 A;  2D23 A;  4PTM A;  4E4P A;  2XGI A;  3CPU A;  2WW5 A;  3K4A A;  2X8R A;  3B9A A;  1C90 A;  4PCS A;  1J0K A;  3AML A;  2O9R A;  3WQ4 A;  1OT1 A;  2YJQ A;  4C7D A;  4YHE A;  4WKF A;  5I5R A;  3CLW A;  4PUE A;  3NDZ A;  1D2K A;  1HNY A;  2ZXQ A;  1XYZ A;  1LL7 A;  3ART A;  1JD7 A;  5M5D A;  1BQC A;  3AHX A;  3AMD A;  8A3H A;  3LMY A;  5ABG A;  1BGA A;  3ARY A;  3M07 A;  1HP5 A;  3AS3 A;  4ACZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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