3N19B

Xena - reduced
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
359
structure length
359
Chain Sequence
SALFEPYTLKDVTLRNRIAIPPMCQYMAEDGMINDWHHVHLAGLARGGAGLLVVEATAVAPEGRITPGCAGIWSDAHAQAFVPVVQAIKAAGSVPGIQIAHAGRKASANRPWEGDDHIAADDTRGWETIAPSAIAFGAHLPKVPREMTLDDIARVKQDFVDAARRARDAGFEWIELHFAHGYLGQSFFSEHSNKRTDAYGGSFDNRSRFLLETLAAVREVWPENLPLTARFGVLEYDGRDEQTLEESIELARRFKAGGLDLLSVSVGFTIPDTNIPWGPAFMGPIAERVRREAKLPVTSAWGFGTPQLAEAALQANQLDLVSVGRAHLADPHWAYFAAKELGVEKASWTLPAPYAHWLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Determinants of substrate binding and protonation in the flavoenzyme xenobiotic reductase A
pubmed doi rcsb
molecule keywords Xenobiotic reductase A
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas putida
total genus 120
structure length 359
sequence length 359
chains with identical sequence D
ec nomenclature ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date 2010-05-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3n19B00
4JDYA 3PB2A 3PF3A 4NJKA 1A5SA 2FTPA 3QPYA 3NA8A 3QW4B 1V5XA 2QKFA 2X1SA 3NQVA 1RQEA 3PUOA 2ZTKA 3QZEA 4QSHA 1OF8A 2ZZ4A 3P80A 1LTDA 3M1ZA 4XBSA 1GEQA 1NEYA 4IMGA 2YXGA 5CSSA 4FB7A 3NM3A 4A21A 4UMCA 3YPIA 5AYYA 3WJSA 2YDAA 5EPDA 2VENA 4UFKA 3T7VA 3NPWA 2B7OA 3LDVA 3GXTA 3LHVA 5KZMA 3RNDA 1JCYA 2FQIA 3PG9A 4LVGA 3F03K 5L6UA 3SI9A 3NL6A 3G1SA 2V81A 3QSTA 3UY8A 1IIHA 2FFCA 1MZHA 1VZWA 3BV4A 3S5OA 2WNQA 3NO5A 1LP6A 3O8AA 1YXCA 5DY2A 2D73A 3WFAA 3S1XA 2HS6A 4K8HA 2V5LA 4ZQRA 4UUIA 4OV9A 4WOZA 3TQ0A 2A1YA 5C54A 5G2HA 1TCDA 4O57A 1DORA 3HGRA 1ADOA 3PBUA 1I2OA 2J9XA 1KBJA 1TRIA 2C15A 1EEPA 3LXAA 5CGQA 3KXQA 4Z1CA 1DBTA 1F6PA 5G5IA 4U4MA 3LCGA 5TBOA 1A5BA 1W5OA 2OX1A 3GAYA 5AFDA 4GNJA 3NNTA 2NWRA 1H7PA 3H55A 1Z48A 2QCMA 3ABRA 1GTHA 5KITA 1AW1A 2RH9A 5F1VA 3C2FA 4LU0A 2XN0A 3W9ZA 3G24A 3GZ3A 2A2IA 2DU2A 3W07A 1RV8A 4K7YA 1P1XA 4TU1A 2WNNA 4FXRA 1W5MA 1Z44A 1EWDA 3P8JA 2ZFAA 3ZR4A 1K7EA 3MHFA 1XBXA 1TPFA 3LTSA 3B4UA 1QNVA 3QMRA 2V2CA 3NQ8A 1YXYA 4IOTA 1SZGA 2A5HA 4K6AA 1R46A 2XN2A 4WY0F 1QPNA 4UXDA 4QJ1A 3L5AA 3N3MA 1BEUA 2FPYA 4PTNA 3GNDA 3RLVA 4JYFA 2DZVA 3LRLA 4DO5A 3S8HA 3FKRA 3IV3A 3O6YX 3TU9A 3HGJA 3SECA 1R2RA 1XC4A 3HG5A 2V9DA 1JR1A 3LV5A 3M43A 3G8EA 3M6YA 5BOOA 1CI1A 3U2OA 3UWVA 1TPC1 1GZGA 1VHCA 4DF1A 4IWWA 4HKPA 4QISA 4B5NA 3TJXA 1UASA 3NQ7A 4NNCA 3W71A 3B04A 1D3GA 4M6PA 3EX1A 3KRUA 3B05A 1PHWA 2A7RA 1EWEA 3GIYA 4IJBA 3W85A 3WJYA 2ZA3A 3EWWA 1Q6QA 2QDGA 1KLZA 4NJIA 1JCMP 1SPQA 4O28A 3P7YA 3DHFA 5HR7A 1IXQA 3CWNA 2RFGA 4DPPA 1GG0A 3UWUA 3EX3A 3CEUA 3OIXA 3PM6A 1K3UA 1M7PA 4XZ9A 1ICSA 4BI5A 4TIMA 4IQLA 1A50A 2X16A 3O15A 1XXXA 3W1QA 3Q37A 2V0TA 3OBKA 5DLCA 4JX4A 4UTIA 3Q58A 2WNZA 1F5ZA 3ZWTA 2DP3A 3P84A 5KTLA 1K02A 1Q45A 1FWRA 1H7OA 4ORMA 1JRCA 4TMBA 1JCLA 4JGDA 4NJGA 1JULA 4L4LA 2ZTJA 4MOZA 5A8GA 4ZL1A 4DELA 3A5VA 1KM0A 1T96A 1JRBA 3UWZA 5F4SA 3KAOA 3MP5A 3NDOA 2GJLA 1OYCA 1DHPA 5FF2A 3GVGA 1J2WA 4WJEA 2E68A 1GYNA 4O17A 3O1NA 1TTPA 4GRSA 3DFTA 1O95A 1IXNA 1W1ZA 1WOAA 4O50A 1VRDA 5G1YA 1VQTA 4LS1A 4UFHA 4UTJA 1GPWA 4O0KA 3CC1A 2H90A 4JTGA 2YZRA 3HBLA 4HHPA 1FWTA 2BZNA 3UZJA 3L68A 4JTFA 4RR4A 2QAPA 3A22A 5CZTA 3N19B 3FA5A 1VS1A 1ML1A 3MYPA 3WJZA 4ADSA 4AVFA 5LHEA 1LM1A 4JY8A 1G4EA 3M47A 3LBCA 4JX6A 1JUEA 5HUOA 2OJPA 2VKZG 4LC8A 4LWWA 2PE4A 1SW0A 1EP2A 3O06A 3CTLA 4AHPA 4NX0A 1AG1O 4DO4A 3W75A 2V82A 5FF0A 4HPXA 4UFIA 1I45A 2CLEA 3GXPA 2H3DA 4WXZA 1MEHA 3TQVA 5AHIA 1C29A 3P74A 4O1BA 1F6KA 3QC3A 4BK9A 2YYTA 3NQGA 2EF9A 3DZ1A 4E2DA 4IMFA 4MZ8A 1I2RA 3VFLA 3DFQA 4M5PA 1T99A 1P4CA 1VGAA 3C8FA 1S3HA 1IXOA 3HIJA 1VYSX 3UZ5A 4EWND 2RDTA 4RV8A 1AK5A 4LTSA 2QCFA 3LBMA 2J9ZA 3W1AA 1FX6A 3W1NA 1VC4A 3THQA 4XUGA 5AOUA 4N9DA 2H8XA 5K7JA 2DZPA 5LGZA 3P67A 1FCUA 3DHDA 2ATMA 5FF4A 4BWLC 3ATZA 1H5YA 4A29A 3E0IA 4K7VA 1ZY9A 4RX0A 5KMYA 3I65A 1NAL1 5DCEA 3TUUA 4M7TA 2CFFA 3TIMA 5TIMA 3MBDA 3L67A 4DXVA 4MFDA 4UTWC 5F2GA 1LZOA 2V8ZA 1C8VA 3S5ZA 3W86A 4MJZA 5E0KA 3NQDA 5BMWA 3FYPA 2QDHA 4K38A 5SWUA 3QJAA 3LCHA 2YPIA 3LCLA 2ZRZA 4CNPA 3PS7A 1TV8A 3IIZA 1KM2A 3U8GA 3LRMA 4LT9A 2Q8ZA 3HO8A 4NUWA 1XFBA 2ISSA 3K30A 2X1RA 3FLUA 3W76A 1QR7A 1ZAIA 2E6DA 3WK2A 2WSQA 1GVFA 4AXKA 4KWVA 1RR2A 5EL1A 4I9AA 1HL2A 3KVKA 3HQ1A 3N34A 3EWUA 1RD5A 2X2GA 3ZS4A 1I2QA 3P82A 2B7PA 3LLDA 3JRKA 1K7XA 3TW6A 3T44A 2FLIA 3B03A 4TMCA 3A23A 3QQ1A 5CZ0A 2EGZA 5C55A 1JCJA 1H7NA 4OE7A 2YR1A 1K8ZA 1JQXA 4Z0SA 3S42A 5AHMA 2NX3A 1LBLA 2G5WA 3GLCA 3PSWA 3E12A 1F7BA 1H61A 1H62A 1WX0A 3C3NA 3W22A 5MHBA 2TSYA 1OX6A 4LRTA 2PCQA 1SZFA 4JTJA 4GUIA 3PAJA 2HTMA 4QM1A 1SO3A 3V75A 4N9EA 4JXCA 1YADA 3TXVA 1W3IA 2UV8G 4UR7A 1TO3A 5C6MA 1TPB1 1HO1A 5FF7A 2IQTA 3SR7A 3QMTA 3N73A 3IIXA 1B4EA 1F2JA 3BPWA 2A7PA 1GVSA 1G4PA 3GR8A 1TTIA 2OT1A 2BXVA 2ZDRA 5CZSA 4ADUA 1T0OA 3P5ZA 4LC6A 3ABQA 3N14A 4PH6A 1MEWA 1U5JA 3OVRA 3LX9A 3GX9A 3EWYA 3UWYA 1N8FA 4N2YA 1XDLA 3KOFA 1EA0A 3G1VA 5EKYA 3PVFA 3G0SA 1SR9A 3TSDA 5D2YA 1L6SA 3NPUA 1UUOA 2NXGA 3N9SA 4MYXA 3GDMA 3HB9A 3NL2A 2ZYFA 4N02A 3G0XA 5HULA 2KZHA 1RQHA 3QQ0A 2YGYA 5GVJA 1LRQA 2W79A 3B0VC 1VJIA 3ZWSA 3QEZA 3DENA 3CLMA 1XKYA 3CHVA 3BGJA 1FWNA 3C4UA 3PUEA 4MPQA 1AW2A 3HGSA 3F1QA 3GNNA 3L0NA 3LCIA 3N2XA 1UB3A 1F73A 1OX5A 4A2SA 8TIMA 1K7FA 1SU5A 2OMAA 4IX0A 5E93A 1OJXA 1YTDA 3E9AA 5FI8A 3KX6A 4NX5A 3TA6A 5K2ZA 3I68A 5FEWA 2FJKA 4GJ1A 2PC4A 1OFOA 1CX9A 4POCA 2I9EA 4OGZA 1O4UA 1I2PA 2PRHA 4RCXA 4MJMA 2FIQA 4ADTA 4LV9A 4JX5A 1XI3A 3CT7A 1LORA 3QF0A 2XFWA 4W9TA 3SY5A 1MSSA 3TXZA 3VKJA 3LI0A 2Z0IA 1YXDA 4NNBA 1DQXA 2Y62A 3BLFA 4Y9AA 1S5TA 4RZ6A 3EWBX 3B8DA 6ALDA 4PCFA 3UY7A 2VEMA 4GUJA 3W70A 1U83A 5LKYA 4AHQA 2GQAA 1O5KA 3CEPA 3PSVA 4JD4A 3P5YA 3GAKA 2A0NA 3NL3A 5D30A 3TCEA 4ALDA 4K36A 3BO9A 1S5WA 2Y7FA 4LRSA 2CLOA 3NVTA 3W2MA 2B7NA 5CPOA 2HMCA 3T4CA 4OV4A 2VFEA 4O18A 1OHLA 4I7WA 1BKSA 3EXTA 1D3HA 1JCNA 2JGYA 1ZAHA 3G1DA 3ZFHA 3DFSA 4AB4A 4FX8A 1ZAJA 1EUNA 4FNUA 4XTDA 1QO2A 1LDCA 4EOUA 3G22A 3QMSA 1QAPA 1GQNA 4IMEA 1AL7A 1CW2A 3NGJA 3MI3A 4R34A 4UFLA 2Q3RA 2ZRYA 1GWJA 3MW7A 4A3UA 4ZVJA 4Z1BA 1PCWA 1O60A 4Q32A 4MYAA 5AC8A 2FPTA 2TRSA 3UWQA 5EYWA 1SUXA 1PE1A 3OVQA 3VI2A 4C1KA 3THAA 2YW4A 4X9SA 2B4GA 4ZQNA 5CPLA 4NZJA 1TV7A 3I7SA 2E6YA 3E96A 2GQ9A 4JN6A 4DQWA 1H7WA 3Q2DA 3HG3A 2AGKA 3B0PA 3L65A 2PRLA 4IMCA 3GDLA 1KBIA 4Z1DA 3USBA 4OWGA 1IGSA 1QWGA 1LOSA 2WPBA 5U4NA 3HPZA 1L9WA 5KZEA 3L5LA 1LBMA 4WOQA 3M5XA 4CNNA 2RDWA 2BLEA 3TV8A 3L5MA 3TMQA 1KV5A 1FY6A 1Q6LA 1QPRA 2BWGA 5HNRA 3LV6A 3TW7A 1H51A 2Y61A 1EIXA 1ALDA 3OEXA 5A5WA 4NJHA 1F74A 3DAQA 1WBHA 1QOQA 1TPWA 5G2IA 2CLMA 1E51A 1G7UA 3PB0A 1KTNA 3W72A 4BWLA 4HNTA 1OK4A 5DXYA 5I3GA 2B0MA 1PHQA 2H8ZA 2NX9A 2QJHA 2J24A 4EVZA 1PVNA 4KKXA 1Q6RA 4YCPA 3WK0A 3CPRA 3LGEA 2P10A 4WZHA 1FCQA 1TTQA 3DXIA 5G4WA 1GJPA 3EB2A 4I7VA 2B7QA 2CWNA 3QFEA 1PCKA 4FHAA 4UTWA 1AMKA 4ZQPA 4O13A 5DBUA 3MHUA 3O6CA 4JIQA 4K8EA 2E6FA 1XCFA 5ABTA 3NAVA 3SFKA 1OK6A 5LSMA 1K8XA 4PC8A 3PY2A 4YCOA 5TQLA 2JKPA 1FQ0A 3GYEA 5BW6A 5FEXA 4M19A 3BW4A 4JDBA 1RPXA 2CZEA 1MO0A 5HWJA 4I7UA 2EPHA 4RLIA 4UNKA 2CZDA 4UTMA 4M6VA 3M5ZA 3TC7A 1SW3A 4KFOA 1J4EA 3HPSA 3BW3A 2G95A 4JEQA 2E09A 4Y6GA 4CNOA 1OFAA 1NFBA 3G1XA 4MUZA 1SZEA 4D2JA 2CU0A 1IF2A 4U28A 2F7FA 1H63A 1TSIA 3T78A 3G1YA 4N9CA 4S2BA 4TO8A 3SJ3A 3PR2A 5FEPA 4QNEA 1Z42A 3TJLA 2JKEA 4YXGA 3HMJG 4UMAA 2BTMA 3EXSA 2ZA1A 5HINA 4WXYA 5AYZA 4IPIA 2R14A 3HJZA 3LHTA 2GOUA 3W7JA 4DF0A 3W7NA 1SO6A 3PBVA 4HPJA 2VFGA 1TPDA 3FS2A 4KFPA 3S5NA 2WSRA 4M6QA 2CW6A 2QAFA 1KM5A 1G4TA 4UFJA 3MP3A 1L6YA 1TV5A 2ISWA 4FNQA 3HG2A 3W7EA 3CB8A 1D9EA 3D0CA 4LW7A 3TSMA 3B06A 1KM6A 4UCGA 1R2SA 1NF7A 3S5YA 3ANYA 3O16A 4RZ4A 3S1UA 2X30A 3UXDA 2VEIA 3W7RA 1PV8A 1G6CA 3A5FA 1OFRA 3IGSA 5DBTA 3WJWA 3IIPA 3L2IA 1KM3A 1TPUA 2NXIA 4LV4A 2ZZ2A 1WQ5A 1QO5A 1HTIA 2AAMA 5BRBA 4O8RA 1DQWA 5K9CA 1LLWA 1UCWA 2Q8LA 4R33A 3G1FA 4H6KA 3W7MA 3QH2A 3L0GA 1A5CA 2Y70A 3G18A 4FIQA 2ISVA 3C6CA 4HSOA 1L6WA 1KFJA 3PC0A 3MP4A 4O54A 2W0UA 2ZRUA 2WQPA 4MIMA 4P61A 3W7GA 4HSNA 3INPA 1FWWA 3SGZA 3M5VA 4TX9A 5G2WA 4UMBA 4X22A 1F05A 4UTKA 1XUZA 3UWWA 1PIIA 2NZLA 4TR9A 2JK2A 5D2TA 4O53A 2VELA 4X3ZA 1MXSA 1TREA 3C56A 4UTHA 2ZRVA 4ML9A 2ZZ1A 3NL5A 3TSBA 3W2UA 3HGOA 3W88A 2GPTA 4MY1A 4NVTA 1P0KA 5I3HA 3GXNA 1ZJIA 2GJNA 5D04C 4MLJA 4JTUA 1KA9F 4JTHA 3W6YA 5EMUA 1UUMA 5LNSA 1WYIA 3W1RA 2Y89A 2LLEA 2YSWA 1X6UA 2DZWA 3P81A 3ATYA 3S1VA 4OT7A 3KRSA 1ME8A 2YX0A 3LHZA 4UTTC 2NUXA 3NQMA 1ZCOA 3M44A 1I2NA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1LRT A;  2FDS A;  3P61 A;  3DBP A;  2WJZ A;  1DL3 A;  1YLV A;  4UFM A;  1DJN A;  5CPM A;  2ZZ7 A;  1O94 A;  4HNN A;  4MVA A;  4PA8 A;  4UNL A;  3W7P A;  3C2O A;  3QM3 A;  4H3D A;  3N9R A;  5D2V A;  2VFD A;  3W7L A;  2TPS A;  3TML A;  3OA3 A;  5D03 A;  5LNU A;  2JGQ A;  4BF9 A;  1A53 A;  3I7Q A;  1KFK A;  3KVJ A;  4RXF A;  4Y90 A;  3M0Z A;  1GVO A;  4PL2 A;  1M5W A;  5DEL A;  3TE9 A;  1FXP A;  1R30 A;  2YYU A;  3L66 A;  1K8Y A;  1FCV A;  3LM7 A;  4LS2 A;  1DKW A;  3W2J A;  3W1X A;  5D09 A;  3HOJ A;  1YYA A;  1SFJ A;  2QUV A;  3W7O A;  4LUI A;  3S9Y A;  1V7Y A;  1H50 A;  1TPH 1;  2ABB A;  2I14 A;  1Q3N A;  3CIW A;  5EBU A;  2PRM A;  2G97 A;  1TQJ A;  2A21 A;  3IVU A;  1W56 A;  3AO0 A;  3KVM A;  3WJX A;  3STF A;  5LNR A;  5I3J A;  1OX4 A;  1OX4 B;  1C9D A;  1ZEN A;  2ZCG A;  2DZU A;  1VHN A;  5K9D A;  1HG3 A;  5K9X A;  4GUF A;  4YL2 A;  3GR7 A;  1XDM A;  2BSL A;  4H4I A;  4O11 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1DIE A;  2PU0 A;  3GH7 A;  3PF3 A;  4GYF A;  4C6F A;  1F4A A;  2FTP A;  1M53 A;  3GTN A;  4MWA A;  2QKF A;  3AZT A;  3GUW A;  2BNJ A;  3COT A;  3PUO A;  3GD6 A;  3ISI X;  4JHM A;  2AL2 B;  1SJB A;  2DEP A;  4IIG A;  4IMG A;  3PNZ A;  4GO9 A;  5CSS A;  1ZUA X;  4FB7 A;  1J18 A;  1IZJ A;  1M04 A;  2CYG A;  4A21 A;  1BHG A;  1L6G A;  3AHZ A;  3P93 A;  3NPW A;  2X41 A;  2E8Y A;  3H26 A;  3GXT A;  3LHV A;  1JCY A;  1JDD A;  1RA5 A;  3MUA A;  3SI9 A;  3G1S A;  1DQU A;  3GIQ A;  5GNX A;  1XIS A;  3SDO A;  4FAM A;  2X7W A;  3CYJ A;  1YXC A;  2D73 A;  3S1X A;  3WQF A;  2R1K A;  4UUI A;  3MAN A;  4MWA E;  1YMY A;  3UYI A;  5C54 A;  1O12 A;  1EYE A;  1DOR A;  3HGR A;  4H8U A;  1Z3N A;  1PYM A;  1KBJ A;  1TRI A;  3TLQ A;  2C15 A;  1SYT A;  1QRQ A;  1EEP A;  1UZD A;  1DBT A;  1XYZ A;  3VIJ A;  4KW2 A;  5BRP A;  1QI3 A;  2GGG A;  3LCG A;  1H7P A;  3H55 A;  1E5J A;  4ROQ A;  1PWL A;  1GTH A;  1V6U A;  3LMZ A;  3W9Z A;  1W1I E;  1RV8 A;  2G0W A;  1FP9 A;  3ONC A;  3T8Q A;  3ITY A;  3ZR4 A;  1K7E A;  1XBX A; 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