3N19B

Xena - reduced
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
359
structure length
359
Chain Sequence
SALFEPYTLKDVTLRNRIAIPPMCQYMAEDGMINDWHHVHLAGLARGGAGLLVVEATAVAPEGRITPGCAGIWSDAHAQAFVPVVQAIKAAGSVPGIQIAHAGRKASANRPWEGDDHIAADDTRGWETIAPSAIAFGAHLPKVPREMTLDDIARVKQDFVDAARRARDAGFEWIELHFAHGYLGQSFFSEHSNKRTDAYGGSFDNRSRFLLETLAAVREVWPENLPLTARFGVLEYDGRDEQTLEESIELARRFKAGGLDLLSVSVGFTIPDTNIPWGPAFMGPIAERVRREAKLPVTSAWGFGTPQLAEAALQANQLDLVSVGRAHLADPHWAYFAAKELGVEKASWTLPAPYAHWLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
Updating...
connected with : NaN
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas putida
publication title Determinants of substrate binding and protonation in the flavoenzyme xenobiotic reductase A
pubmed doi rcsb
molecule keywords Xenobiotic reductase A
total genus 120
structure length 359
sequence length 359
chains with identical sequence D
ec nomenclature ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date 2010-05-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3n19B00
4CQ9A 4AWUA 4IJBA 4MY9A 1FUYA 4UMAA 3RLVA 1UCWA 4DO4A 4LS2A 4MUZA 3GAYA 1JCMP 5D33A 3TC6A 4YCOA 3LCFA 2GJLA 1V5XA 5K3VA 2RH9A 2VFEA 4N02A 1YDNA 3DFTA 1XBZA 3R13A 3I6RA 4OE7A 4WXYA 4ZQOA 3U6WA 1OX4B 5G1TA 2X16A 3S5OA 5IM51 2BWGA 3TMQA 4XUGA 1IF2A 1TTIA 2G95A 3RFAA 5IBXC 1T96A 4ZQMA 1TRDA 3USBA 2DZUA 1TV5A 2CLEA 1XDLA 1LOSA 3G1XA 2OX1A 2YPIA 1MXSA 1H5YA 4IUOA 3IVUA 5D38A 3KRZA 3UY7A 3EWZA 4JDBA 2ZA3A 3QM3A 1A50A 4WJEA 4TX9A 2TYSA 3O05A 1PV8A 3W7RA 3PSWA 5J5RA 1TSIA 5DXYA 1YYAA 1W8SA 3M7WA 3W6YA 1LBFA 1W31A 1WQ5A 1KA9F 1NFBA 4O18A 5AHLA 3S6DA 1DL3A 1NEYA 3PSVA 1FWRA 1I2PA 2VC6A 3MBFA 3C56A 4JY8A 5LHFA 1S5WA 3DU0A 1HUVA 1TJPA 2CLLA 1S5VA 4FHAA 1YPIA 1FWSA 3M47A 1Q6LA 2QJHA 1I4NA 4BFAA 1Y0EA 5K4ZA 3CWNA 3IVSA 3IIVA 3G1YA 3NEVA 4PL1A 1NAL1 3A21A 4PODA 4FNUA 2QDHA 3AJXA 1UUOA 3OVQA 3P62A 5BNKA 4E38A 3L21A 2E6FA 3AO0A 3W1AA 2QDGA 2J6XA 3W07A 4AAJA 1G69A 4MZ1A 4UFMA 3BO9A 4Z08A 4UMBA 1YLVA 1N8FA 2FIQA 3Q58A 3L66A 3O6YX 2NX3A 2OJPA 1ALDA 1H60A 2Y7FA 1XBXA 1HTIA 3IIXA 4JTKA 1MSSA 3JR2A 1W0MA 3DFNA 4UTWC 3QQ1A 3OHIA 3NQVA 1WV2A 5HINA 1MO0A 4WY0F 1PL9A 5DY2A 1QPRA 2YGYA 2Y70A 2H8XA 2Z6IA 1TYGA 3O16A 5EKYA 3OA3A 5I3GA 1PHQA 4NNAA 3W87A 2YZRA 3TXZA 1PCWA 3P67A 1TPVA 1KW1A 3WJZA 3EX2A 3NQFA 2V2CA 2A5HA 2YW3A 3CM4A 1WX0A 3TIMA 3CEUA 1OFEA 4ZZ9A 5I3HA 3HF3A 1ICPA 3Q37A 3L0KA 2C14A 3M6YA 3CB8A 5AHFA 1RR2A 1XL9A 2NXGA 5TIMA 1XBYA 1UB3A 2QCNA 1GZGA 1AK5A 2B7NA 4MJMA 4DF0A 4E2BA 1N55A 4C1LA 3ABOA 1G67A 3C2RA 4LS1A 2GQ8A 1H1ZA 4I7WA 3TDFA 5KMYA 2A21A 2VEMA 2ATMA 3NAVA 1SFLA 2BLEA 2ABBA 3NL6A 1FDZA 5CZTA 2V2DA 1F73A 4NJJA 3WK3A 3EWUA 5LNSA 4UFJA 4UNKA 3ZR4A 2R94A 4MVAA 5LGXA 1PS9A 3B4UA 1BEUA 1W5OA 2RDWA 5AYZA 3U2OA 2V0TA 4JY9A 5KTLA 2E5BA 2CLIA 2I14A 4LV4A 5F4XA 4O0KA 3NQ6A 1W54A 3TV8A 2X1UA 4HKPA 3HJZA 4OGZA 2NV2A 1EPXA 1AL8A 3DI0A 2VFFA 3HQ1A 3M5ZA 3C3NA 3DGRA 1KBIA 1F6PA 5F1VA 4RCXA 5HUOA 5DELA 2C6QA 4PH6A 4JTLA 3TSMA 4NX0A 4JYEA 2LLEA 3LXAA 3CTLA 1SZNA 1TQJA 3EKLA 3V75A 4N4QA 4O1DA 3FJLA 1DHPA 2VXNA 4FNTA 3R12A 3BARA 4NU7A 4N4PA 1TPC1 2QCHA 2WSYA 5K9CA 3QRHA 1LDCA 1OX5A 5D05A 4ZQNA 2I1OA 3CLMA 4WQ6A 5C5YA 2NUXA 1GEQA 2B0MA 3MBDA 3W7OA 4YCPA 3FS2A 1HO1A 1K7EA 4A22A 2DZTA 2HSAA 3BLIA 4CCEA 1WAUA 4IMEA 2E6AA 3EB2A 4NJHA 2QJIA 3DFOA 1BTMA 4RV8A 5AB3A 1B57A 2P10A 1R47A 4WXZA 2FLIA 3KAOA 3C61A 1B4KA 1EX5A 1O60A 1VZWA 4XTDA 1E51A 5F2GA 1IIHA 5HWMA 4HSNA 3OBKA 3M0ZA 4ORIA 4EOUA 3FYOA 3PUEA 1KFEA 3BVJA 4GUHA 1JVNA 2F84A 4ML9A 5F1UA 3S1UA 4UFHA 3LHZA 5KZDA 5EBUA 2CLFA 3NVTA 2WNZA 1GVRA 3GK0A 4JTJA 2G97A 1A5AA 2NX1A 2QAFA 3LHWA 2FB3A 4FX7A 4AWSA 3IV3A 2FQIA 1MEIA 3ATZA 4NXSA 3P5YA 5CPNA 1TJRA 1YXCA 5AYYA 2Y63A 3GXTA 2TRSA 3G8RA 4O53A 3EWBX 4OQVA 4P61A 3GB6A 3KFTA 1FY6A 3G3DA 3EX6A 3Q94A 1LM1A 3TCEA 2OT1A 4UTIA 4N2YA 3DENA 1B9BA 3EX1A 3N34A 3TA6A 1OFAA 1EWEA 3W86A 1KFCA 3PC0A 1LCOA 3TSDA 3FEMA 3CIXA 3TFCA 2WO5A 5CZ0A 1XKYA 4S2BA 1R2RA 2CU0A 5CSRA 1JR1A 5HNRA 4Y8FA 1ZAIA 1X1ZA 4GUGA 4FXRA 3PULA 1TTJA 2ZA2A 3BLFA 1M7OA 2Z1BA 2Z2UA 3S9YA 4GBUA 2VOMA 1SZEA 3EWWA 5D2TA 1K02A 1UBSA 3GDMA 1QMLA 2E5DA 3I7SA 2VKZG 2Q3OA 4JEQA 4Y90A 4N9BA 3TFXA 1FCQA 4Z0SA 4HHPA 4GNJA 1W1ZA 3C2VA 1F6KA 1VYSX 3YPIA 4QITA 3IVTA 5E93A 3WK2A 1LTDA 4OBTA 2CZ5A 5FF7A 3L65A 3QW4B 1G4TA 3W76A 5LHEA 3KHJA 3IGSA 4PCFA 5LKYA 2VFIA 1TPEA 5CPLA 2WSQA 2KZHA 1FCBA 1K03A 1ZALA 3IGUA 1F5ZA 4NNBA 5LSMA 4WOZA 2FPTA 1TPUA 4KWWA 3DFSA 3GKAA 3W7CA 3HIJA 3KVJA 4ZVJA 5DBUA 1FX6A 3VFLA 4U28A 1P0NA 3L68A 1H1YA 3LCWA 4ZMGA 3GDTA 1ZY9A 3A5VA 2JK2A 3HGJA 1DOSA 1WBJA 3BG5A 3W1NA 5C55A 3M5XA 3O8AA 4FNSA 3STGA 3QW3A 1H61A 2C3ZA 3DFPA 3NQDA 1H7OA 4UNLA 4Q4KA 3O63A 1QFEA 4M19A 1OK4A 2QAPA 4DF2A 1TTQA 5CPMA 3LTSA 4AH7A 3UPBA 2Y7EA 3NOEA 1SO4A 1IXQA 1OK6A 4KWVA 3QC3A 1VYRA 4ADTA 1JCNA 5LNVA 3NPUA 1R2SA 2QR6A 4ORMA 3P80A 3FYPA 4TMCA 1Z41A 3B8DA 3UWWA 3FJ6A 2YDAA 1TPDA 2FTPA 3OEXA 1NF0A 3G3MA 3OVRA 2C16A 3DKLA 3W7GA 1JRCA 4A2RA 4IGHA 3PBVA 3W1XA 4AWTA 1RQEA 3DFQA 1EP2A 1R46A 3IIOA 4JICA 3SSJA 1BWLA 3L2IA 4OU1A 1FQ0A 2CLMA 4Y9AA 3LHYA 4MKNA 3RNDA 1OFPA 3GX9A 2AGKA 2V9DA 4Z1BA 2E6DA 2A6LA 1UASA 2P1FA 2ABAA 2ZZ7A 3DZ1A 3G0UA 1GQNA 4LW7A 1OF8A 5FF4A 3SZ8A 4YLWA 1TMHA 3P82A 1GT8A 4I7VA 2OZ0A 1G4EA 2YSWA 5EL1A 3S5NA 1SZFA 3TH6A 4LV9A 4FXSA 3VE9A 3B05A 2ZCGA 3P74A 4O1AA 4EIVA 2EF9A 1Q6RA 2JBMA 1YADA 5F2IA 1QWGA 4XQ6A 2DZWA 3C6CA 2XN1A 4FF7A 1VCVA 5K9XA 1LYXA 2QEZA 4R34A 1ICQA 2VEKA 1XUZA 4QM1A 3P81A 5AC7A 3UWVA 3G18A 3SIZA 3VNDA 1VHNA 1DJQA 3HPZA 1Z42A 4RJEA 4BI6A 1QCWA 2DP3A 3LLDA 3VI2A 3W1QA 2ZZ6A 4JTHA 3LCIA 3L67A 1Q6QA 4XTIA 3P5ZA 5AC8A 4K6AA 1JQVA 2OMAA 4WY0A 1DJNA 1VC4A 1RPXA 1H7XA 1M6JA 3P7YA 2FPVA 2NV1A 3S5ZA 1OFRA 3LBMA 4I7UA 5A5WA 5DBTA 1H7WA 2NXIA 2DORA 3FIGA 4EVZA 4ZQPA 1FBAA 1JCLA 4LVBA 4DPQA 1KFLA 3NXFA 3QZEA 3W23A 1KM6A 3C2OA 1KLZA 4XBSA 1TREA 5K2ZA 3EX4A 4LT9A 3T4CA 2OT0A 1TTPA 1FXPA 3MI6A 2YW4A 2C13A 2BSLA 3MYPA 2YXGA 5TBOA 1W37A 2QCEA 4HN4A 3CQ0A 2QCGA 1LRNA 4FNRA 5K4XA 3GLCA 5D03A 1WYIA 3ABSA 3TX9A 5AHMA 3MW7A 6TIMA 1IXOA 3W2KA 4JIPA 4KFNA 4O17A 3D0CA 4QQ3A 3NDOA 4O12A 3NL5A 1QO2A 4HSOA 3UY8A 5DCBA 3NQ2A 5I3IA 3THQA 3VCRA 4ZQRA 4X2RA 3KX6A 2V5BA 5FF0A 2V30A 1HL2A 3M5YA 2O7SA 2X2GA 1CW2A 1BKSA 4LRSA 1QOQA 4BR1A 2Y61A 1YXYA 3BG3A 2CZEA 1OYBA 5AHNA 3LOTA 4GUJA 5CKSA 1VJIA 3TR2A 5D30A 5LNRA 3R5EA 3HGOA 5D04C 3RLUA 1RD5A 4GJ1A 3UXDA 4LTSA 1RQBA 3P8JA 4PL2A 2RKXA 1YTKA 2GPTA 3LLFA 3RU6A 2PRLA 4EF8A 3TJLA 4A3UA 2PCQA 1AW1A 4AHOA 1AG1O 4XBKA 2QCLA 3TMLA 2V82A 3MHUA 3W7DA 4FB7A 2WPBA 1M7PA 3NQCA 2GVGA 4WY0B 1GJPA 4IX0A 5FEXA 2E5CA 1H7RA 3L5LA 1XCFA 3W7IA 3BLEA 5G2HA 1LP6A 2ZQ0A 4RLIA 1F2JA 5BMXA 2YCEA 3NZRA 4Q33A 5AYXA 3ZFHA 4UFLA 1EUAA 2G5WA 3LRKA 3W1TA 1GTHA 3G1HA 2QCMA 3N2XA 5IBXA 2E09A 4JYFA 3UWQA 4QNEA 3W7KA 2NWRA 5D2WA 1PIIA 1EUNA 4LWWA 3ZWTA 2R14A 3BGJA 4GC4A 3E12A 5CG7A 4UTLA 3G1SA 4N6EA 2H90A 3LCGA 3N14A 1JUBA 4NT0A 4RKAA 4M6PA 2A2IA 5FEWA 1JCXA 4QNWA 4X9SA 4LVAA 2F7FA 4K7YA 3CWOX 1GVOA 4IPJA 5FEZA 4H3DA 2RDTA 5KINA 3N9RA 3N73A 2I9EA 2DZXA 2PURA 3C2EA 3LDVA 2WJZA 1ADOA 5CPOA 4JNMA 4Z1AA 4O11A 4HT3A 1U5JA 4R7JA 5BW6A 3W1MA 1KLYA 4J9JA 1S5TA 2NX9A 3W7LA 5E0KA 3ABRA 5AOUA 5ABTA 1OVDA 4YWIA 3HO8A 4DXVA 4H6KA 3JS3A 3T7VA 3W7JA 4DEFA 1U83A 4LC8A 3STCA 3TU9A 3O07A 4XZ9A 1K3UA 3LCXA 4JGDA 2DJLA 4FX6M 5F4WA 2G96A 3HG2A 3GXNA 3KVMA 3NZ1A 4BWLC 3IRDA 1BWKA 4LVGA 4JX6A 3SJ3A 4IXHA 3W7PA 1UUMA 3LCHA 3MMTA 2W0UA 3TC7A 1QPNA 2EHHA 3CC1A 2JKAA 4ADUA 3STFA 5E1QA 2NUWA 1KV5A 4JTSA 4ZL1A 4JX4A 4TO8A 2A4AA 3W70A 2YYUA 4RK8A 1IXNA 4O54A 1LLWA 1X1OA 4FNPA 2VELA 2R8WA 4QSHA 1ZAHA 3I65A 2E77A 3M9YA 1OYCA 1LZOA 3PWAA 3LHVA 3T55A 4O0ZA 1LBLA 1EP1A 1XI3A 2H8ZA 3L5MA 4QAIA 1D3HA 4Z1CA 3NPXA 4UTTA 3GVGA 1ME7A 2JKEA 3TAOA 2H6RA 4XWUA 5J5DA 4MY8A 2OCZA 3KVKA 5LNWA 2NLIA 4N6FA 3S0CA 3BV4A 4DQWA 3HB9A 5DCEA 4LC6A 1L9WA 3GKFA 1XC4A 2ZZ1A 3MJYA 3ATYA 2WKJA 3PBWA 5KITA 4CNNA 1LRTA 1A5BA 2Q3RA 2HS8A 3LV6A 5LZLA 3B0VC 4Y96A 1SPQA 1L6SA 2J27A 4AXKA 5F2LA 5HWNA 1V7YA 3E0IA 4YXGA 3EXTA 3TW7A 3UD6A 3MO7A 3C52A 3SW6A 1TRIA 3WK0A 3NPWA 1OABA 5HWJA 3FFSA 4AMAA 4O28A 1LRQA 4RR4A 5LGZA 4UUIA 5CZSA 3LB0A 4IMCA 1LBMA 1KM0A 8TIMA 3W74A 1SR9A 4O4WA 3W84A 2FPYA 3UXAA 3L5AA 1KTNA 5AN7A 5I3KA 1XXXA 3GDRA 4GRSA 4DO5A 1AW5A 5BOOA 5HULA 4IQLA 1HFBA 3UWYA 3MP5A 1CI1A 2TPSA 1A53A 3E49A 1GYLA 2PRMA 4A2SA 1D9EA 4FEZA 3P8IA 4K7VA 3VKJA 3P61A 1IXPA 1DQWA 3EKZA 3G1DA 3CU2A 2FDSA 1HO4A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4XZI A;  2V5B A;  5ENL A;  1JD9 A;  3UJF A;  4PYS A;  1W9V A;  1OYB A;  3VD9 A;  4GUJ A;  5CKS A;  3MV0 1;  4ZO6 A;  3G77 A;  3TA9 A;  1BG9 A;  5D04 C;  1MDL A;  1UD3 A;  5A6L A;  2FVL A;  1F3E A;  4PMR A;  1UC5 A;  2FZM A;  1XSK A;  2P3E A;  2Y8K A;  4DLM A;  4BY3 A;  2OR2 A;  1ECQ A;  1JND A;  4PL2 A;  2ODO A;  1XH1 A;  1YTK A;  3V0U A;  3TJL A;  2PCQ A;  1TZ7 A;  1AW1 A;  4XBK A;  5CGT A;  2V82 A;  5A6B A;  2WPB A;  3NQC A;  2DIE A;  1XLH A;  4WY0 B;  1GJP A;  1H7R A;  1XCF A;  3W7I A;  2ZQ0 A;  1BVW A;  3VC6 A;  1GQJ A;  1F2J A;  1C90 A;  2YCE A;  2ALR A;  3ZJK A;  2BGS A;  2YBU A;  4RW3 A;  3W1T A;  1JAE A;  2QCM A;  1DJZ A;  3CMJ A;  3KWS A;  3N2X A;  4J3U A;  5IBX A;  3TR9 A;  3QHO A;  4JYF A;  4QNE A;  5D2W A;  2HVO A;  2I5I A;  3KOY A;  1ZPT A;  5E5C A;  2O9P A;  4LWW A;  4BS0 A;  4A35 A;  3E12 A;  1Q4W A;  4UTL A;  1TWD A;  4DUV A;  4NT0 A;  4IPJ A;  1ZRQ A;  1HL8 A;  3N9R A;  2PTD A;  3LM3 A;  3VIP A;  2A3E A;  4S3E A;  3RPM A;  1L8N A;  5CPO A;  4JNM A;  1MDR A;  4O11 A;  1F3T A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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