3N3TA

Crystal structure of putative diguanylate cyclase/phosphodiesterase complex with cyclic di-gmp
Total Genus 91

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
ERLTLDTRLRQALERNELVLHYQPIVELASGRIVGGEALVRWEDPERGLVMPSAFIPAAEDTGLIVALSDWVLEACCTQLRAWQQQGRAADDLTLSVNISTRQFEGEHLTRAVDRALARSGLRPDCLELEITENVMLVMTDEVRTCLDALRARGVRLALDDFGTGYSSLSYLSQLPFHGLKIDQSFVRKIPAHPSETQIVTTILALARGLGMEVVAEGIETAQQYAFLRDRGCEFGQGNLMSTPQAADAFASLLDRQKAS

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Thiobacillus denitrificans
publication title Structural insight into the mechanism of c-di-GMP hydrolysis by EAL domain phosphodiesterases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PUTATIVE DIGUANYLATE CYCLASE/PHOSPHODIESTERASE
total genus 91
structure length 260
sequence length 260
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-05-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00563 EAL EAL domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.450 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel EAL domain 3n3tA00
4FOUA 3HV9A 4ES4A 3U2EA 3GFYA 4FOJA 5M1TA 4Y9NA 4Y9MA 3GG0A 3GFZA 3KZPA 4AFYA 3PJXA 4Y9OA 4FOKA 4Q6JA 4LYKA 3S83A 3GFXA 4HU3A 4Y8EA 4KIEA 4RNFA 4HU4A 3PFMA 2W27A 3PJUA 3PJWA 3TLQA 2BASA 4Y9PA 4HJFA 4LJ3A 4RNHA 3PJTA 3N3TA 5MKGB 4RNIA 3SY8A 3GG1A 4AG0A 4F48A 4F3HA 2R6OA 4RNJA 5MF5A 5MKGA 3HV8A 4J40A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3VDCA 1SFJA 3QM3A 1VR6A 4DF0A 2FHCA 2OSYA 3VABA 3W6LA 1RA0A 4GBUA 4BR1A 3UYIA 1JPIA 4J3WA 2OG9A 3SY1A 3E38A 2WJFA 3FJ4A 3MI2A 4U33A 3PZ9A 4GHRA 1HG3A 5EB8A 1DP0A 4N9EA 4NNCA 2VELA 4NZ1A 3N4FA 5CJNA 1XLAA 4RL3A 4WGXA 3EWCA 4KGJA 3ZZ1A 4ZR8A 3W84A 3WBXA 1WAWA 1XD0A 2BLEA 3TQVA 1QHOA 3QSTA 5M3WA 5HOSA 2QCEA 3BGJA 3OJGA 3BUVA 3W7QA 4XKMA 1J93A 3JU2A 3NPWA 3ERPA 2NX3A 1AJ0A 2YCLA 3ATYA 3CHFA 3CS2A 2ZCGA 1T6MA 3GZ3A 2ISDA 4JTSA 3QLLA 4D6DA 2J7CA 2VD8A 2HZGA 2ZE3A 2HDJA 5G4HC 1J96A 3M0JA 1YXYA 4LCSA 4HJWA 3VIOA 2FTYA 1WP6A 4LB3A 3HB9A 4AC7C 3BANA 4Z1YA 2ZZ6A 3V1HA 2GQ3A 1CXHA 3IGUA 1PCWA 3B0PA 4CCEA 4GLEA 1KNWA 4AZ5A 3W7CA 2J9YA 1JCJA 3W1QA 4DVOA 3OTRA 3N12A 4HPXA 3KWXA 2RGMA 2OT0A 1QNSA 4MUPA 3FLUA 1Q6OA 4NAEA 4OJYA 1CW2A 1X39A 4QRNA 2A3HA 4FNPA 1R85A 3KS5A 2NQZA 3R6IA 5D2WA 3A64A 4N9DA 1Q6CA 3Q4DA 3ZVHB 2Y5SA 4V28A 3RDKA 1OIFA 4DYKA 2VGFA 3SM0A 2YL8A 2E9LA 2J74A 3TJ4A 3CV2A 4HZ8A 1ONXA 1RPXA 3OLGA 3KBNA 4AZGA 3TR9A 3KL5A 5GNZA 4YJ5A 3HG5A 1DXEA 2Y8UA 3P61A 4FSAA 3VGFA 3V7PA 1HT6A 1AZ2A 4LTSA 6TIMA 4FXFA 3T0BA 4MVAA 4X3ZA 2ALDA 1XLBA 2DSKA 1DJZA 3D6NA 2DW7A 2OGJA 2PD5A 1P4CA 1LL6A 2E0PA 4JQ4A 2QEZA 1P6BA 4TX9A 2GVYA 1YIXA 2D2HA 3B06A 2FB3A 3TYUA 1CGUA 3MSYA 4GINA 1HL2A 2AQOA 3QV8A 1KRCC 1M41A 1F6YA 2PDMA 3M5VA 4QM1A 4O1CA 5JMUA 1QXLA 1V02A 3VOCA 3C4UA 1YDYA 5IXEA 4DJFC 5BMXA 2ZUVA 1VLWA 2OZ8A 2GK1B 3F7JA 4JKKA 3G77A 4ZVJA 3H2AA 4OV4A 3OP2A 3KDNA 4QS5A 2Y7EA 4KFOA 1E9IA 3M43A 2UY2A 1NOWA 1V6XA 4PUWA 1EDGA 4KRZA 4JTUA 4GFIA 3SDOA 1NDVA 2P5NA 3TMLA 4KBXA 4FPSA 4AVOA 3FKRA 4H83A 5BRPA 2GQ9A 4L1XA 1E3XA 1OD8A 2YZ5A 1LRTA 2CBJA 4KEVA 2HK0A 2QGHA 4XAFA 1X97A 4JYEA 1RLDA 2GGGA 4US5D 1YTEA 2GL5A 3M07A 1DIKA 4EK7A 3HG2A 1VZWA 2DZPA 2R6OA 4H00A 1SJBA 3V36A 4ASTA 1JZ5A 1K9EA 2OODA 3LQLA 1KA9F 4CNTA 3U2ZA 4PMUA 3TROA 3ZOAA 3RJYA 3ONCA 2X40A 4Q8PA 1GZ1A 1MFUA 1QNQA 3MQTA 3R58A 1R87A 4UC5A 4DO7A 4PSRA 1BQGA 1XKJA 2DZTA 1QWGA 3RNDA 3W82A 3IIVA 3W53A 5HMDA 3K30A 4MJ4A 4K37A 3C2YA 1IXOA 1TPWA 4AD4A 3I3EA 1A5NC 3VOHA 4ZQCA 1YTKA 1MEIA 1NFPA 2X0SA 4CNNA 3VKAA 3S6OA 1ECEA 1G1YA 2CEQA 7TAAA 5HNRA 3VZXA 1H11A 3UXDA 1XBYA 4O28A 1FFQA 1QHZA 3FJNA 3Q94A 1E4MM 1MWOA 2GJPA 2WSPA 1FDJA 4FNQA 2E6FA 1OX4B 5BXPA 1YNQA 2QJMA 4UTUA 1S1RA 2D2JA 3IJDA 3SZ8A 1E6XM 3WG6A 2WMGA 3K1GA 4RNJA 4LAMA 1F2JA 4LS2A 1E1EA 4CCDA 5CZSA 3M5ZA 4H2CA 3H8AA 1QNPA 3NJ3A 3NPXA 1POKA 5FEWA 1M7PA 2CXEA 3GUGA 1PX3A 5JIPA 1DTNA 2FPVA 5D9OA 3AZRA 2D22A 2WZTA 1HKJA 1P0EA 3UP8A 1TJ2A 5E70A 3CZEA 3KL0A 1X6NA 3QBUA 3RM8A 5EMLA 3WFLA 1G67A 1GVSA 3LYEA 3NDOA 2V81A 2NLIA 3O07A 5HK4A 1ME7A 4LNCA 3L66A 1I8JA 2F6KA 5K9CA 4RUBA 4D6IA 1GK8A 2CLMA 4Q8WA 2G3FA 2X0HA 1JCNA 3CMFA 3PWAA 1XLEA 3G6LA 1EJ7L 2WVUA 1JYVA 4CEXC 1D9EA 1QBAA 1OZMA 3HBLA 3O63A 3MI6A 2WVTA 4XD6A 1QI2A 2OOFA 1U2YA 1K3UA 3CH9A 5FI8A 2PWDA 1W6TA 4JX5A 2GUYA 1R3SA 3TN3A 2PDPA 3TCEA 1J0KA 1QI5A 3GNXA 2Y88A 1E4IA 5F4SA 4JZ5A 4GZ7A 5CJ5A 1CDGA 3HA1A 1KM1A 2FZMA 1GYMA 5F1VA 3VYLA 3W1NA 3G5EA 1H7NA 4NG3A 4QNEA 3H4XA 3CYVA 5BNKA 3M5XA 1IXQA 2XIIA 2YA2A 3H26A 1O1HA 1O12A 4HIBA 2HJPA 4GXPA 4WOZA 1NWTA 3WD4A 3DFQA 1UH3A 2CBIA 2VRJA 3EA2A 3IACA 3LN3A 4Y9MA 5FJIA 4C90A 4FMVA 4M82A 3EMCA 4MAZA 9RUBA 4GUFA 4IIEA 4M8UA 3ZYZA 2ZRXA 3SCNA 1SJDA 2JKPA 1MW0A 3HJEA 1JEZA 3BG3A 2EQDA 5C2XA 2P1FA 4HTYA 4QG6A 4IJRA 1A0EA 3GXNA 4DUOA 3O0KA 3S9YA 2VRQA 3DYMA 3A3XA 1J9YA 3OA5A 1KGWA 3NCOA 3B9NA 2EAWA 1ADDA 4B5TA 4DF2A 3VPLA 2OVLA 3R8GA 1IZKA 1UJQA 4CD8A 4N4PA 2X1TA 4KCTA 3UWUA 2VC6A 3FKKA 1CXKA 4GPNA 1XIJA 3FW6A 5BROA 4GZJA 4QAWA 3C2FA 4AZHA 3FK4A 4JTKA 4MY9A 7PTDA 3NQGA 5LXEA 3A4WA 3CB3A 1OADA 3P62A 2RHGA 4MKSA 2ZYFA 4IOTA 4AVFA 2WBGA 3GVVA 2WAGA 3WJSA 3L0NA 2ZUTA 3GAKA 3T05A 3IK2A 1H7XA 1B30A 4ZO6A 3VKJA 2JKAA 3OQEA 3DFSA 3ITCA 3M1ZA 4OU1A 2INFA 3OLDA 2V5DA 3CO8A 4JQAA 2Z00A 3VILA 3W7LA 1ZTVA 4A2RA 5EMMA 3VNMA 5ABHA 5FF2A 5L9FA 1A5LC 1W3HA 3NL3A 4OOZA 1S5TA 1H1ZA 4B3ZA 1LP6A 3THCA 2Y63A 1BD0A 3QC0A 3BH4A 1D2KA 1M5WA 3BJTA 3BAXA 2WC3A 3D46A 1EJVC 1XL9A 3QQWA 1TCMA 3AXXA 1QATA 4LUYA 1DOSA 2VZSA 1GOMA 1OD0A 3SRKA 1D3HA 3TZNA 5EY5A 3ISIX 2EO7A 3S42A 2ZDRA 4JHOA 2KZHA 3KE0A 1Q8AA 3VIMA 2OJPA 3BO9A 4HP5A 7REQA 1WQ5A 1XQKA 2QGYA 3TNOA 1J8VA 3B8DA 3SAZA 3OVQA 1NOFA 4FNRA 2OLAA 1QHPA 1YHTA 3VGDA 5BXRA 1FUYA 4AFYA 1ELSA 5TD4A 2YOCA 1DJHA 3M46A 1SW7A 3UJFA 1W5MA 3D47A 3DGRA 3U48A 2IQ0A 2GVJA 3USBA 4Z2KA 1Y5XA 1FY6A 1XFBA 3S6TA 1SO3A 2FFIA 1E6RA 4F0HA 1B3OA 2POZA 4GXWA 3LLDA 1B4EA 1TUFA 3S5YA 3TFXA 3NSMA 4Q33A 3WQCA 3R1ZA 1MW3A 1PKNA 4WXZA 1PTDA 5DY3A 3GYCA 4GZEA 4S2CA 5E6ZA 1EDTA 3FV9A 3ZLGA 2V3GA 6PTDA 1O68A 1FWGC 1Z32X 1BYCA 3PAOA 4PCNA 4I5RA 2G4FA 3WENA 4HHHA 3URBA 3J7HA 3KZSA 1V3KA 3W2MA 1XYFA 5G5IA 4F4RA 2YLAA 1XCXA 4Q6XA 3PZTA 2W3ZA 2PDBA 1YW1A 4QJ1A 3S5ZA 2ZRZA 4CQBA 3R94A 4LUIA 1OGSA 3CT7A 1US0A 5A6BD 2TMDA 4AX6A 2FVMA 1TRIA 2Z26A 1E73M 4AEFA 1B3VA 1MFVA 3U5YA 1U1HA 2W67A 4W8AA 1BG9A 3DHFA 2PTXA 3OZYA 2WM0A 4LVDA 3QQ1A 3SR7A 1SMDA 1H3GA 2JEQA 1FFRA 3I3BA 3CHVA 3RK8A 4M19A 3RM4A 2WSKA 2YA1A 3Q67A 2R24A 3HPAA 1R2RA 2DEPA 2BASA 1QBBA 4O4WA 1QASA 3AMLA 2CC0A 5F4XA 5I5RA 3S2MA 2DIEA 3SECA 3VDGA 2FFCA 3ES7A 1KFWA 3UCDA 1XC4A 4UTTA 3QHMA 2OXNA 4GIEA 5K9DA 1VB9A 1IIGA 4DM2A 4HK5A 4XX6A 1A5OC 2GOUA 5IM51 5IHSA 5D03A 4TVUA 3LSCA 3BLOA 1V51A 4WDXA 4US5A 4IGSA 4RK8A 2O56A 3GR4A 5I00A 2RDXA 3OIHA 8TIMA 1QI3A 3AFBA 3ANUA 5IFPA 3E5PA 3KVLA 3D0CA 4FF7A 4C65A 4NF7A 3NO5A 4ICCX 3P0WA 1UG6A 4RXFA 3EOUA 1VP5A 4CNUA 1PSCA 5REQB 2XFRA 2PLJA 4WD0A 1WDSA 3LRKA 2OWWA 2INZA 5AKQA 1VQTA 1JL8A 5DCBA 4GQ0A 1CIUA 1DJNA 1QPRA 5DMYA 3GFXA 1TWDA 3Q45A 1A5SA 2BHZA 3U7BA 1K7XA 4B4FA 1RVGA 1X38A 4NVTA 2WZHA 2XWDA 3W76A 1GQIA 4QS6A 4B5UA 1VGAA 1JPDX 1AMKA 2ZTJA 1VBGA 2VZOA 1TV8A 3DC0A 1GG0A 3MA8A 3W7JA 2Z2AA 1U5JA 1Y5WA 4NAFA 1SFSA 1NDWA 4WHBA 5TF0A 3AIQA 4B5SA 2WV8A 2FZ9A 3IIPA 4DX3A 3ZWSA 2OLHA 3W2JA 4ACYA 3D3FA 1W5QA 1VLIA 1DJWA 3QPZA 4IISA 2DIKA 2XGIA 4TX6A 4GRSA 3JS3A 1P6WA 1EF2A 4GUHA 4AIOA 3G1VA 3IVTA 4BI5A 1TIWA 4H7VA 2ZIDA 3TFCA 2OKOA 1BF6A 3PPCA 2DSVA 1V93A 4F9JA 1MSSA 3QR3A 4BI7A 3CZJA 3LHUA 4EIVA 4DO6A 4IG2A 2PMQA 4DXXA 1DE5A 3GSMA 3TTEA 4PSPA 3LB0A 4WK9A 2PWVA 3EXSA 4A3UA 2ZVRA 4IM4A 1ODUA 2XH0A 2ISFA 3I65A 4RDZA 4GI4A 3BSMA 4KFPA 2FMNA 4BF9A 2HMCA 3IWPA 4PMDA 2CLKA 3OA3A 1O5KA 2ZZ7A 2WVSA 5KZDA 2ISWA 2DIJA 1XG3A 1UWSA 2VR4A 2Y0FA 2P76A 6CGTA 3APYA 4HN4A 4HQVA 4I6VA 4O8AA 4HHPA 2CHRA 1WKFA 1JFXA 5LHFA 3A22A 4OGZA 1DQUA 4L4PA 4PTDA 1C8XA 1PPIA 3CK5A 7ODCA 2IW0A 5JQ9A 3AOFA 3VMOA 3UPWA 2WBKA 2DZSA 3U7VA 1ZAHA 3PSWA 1LZOA 3CU2A 4MDPA 2PGFA 3FGCB 4DJED 4KWVA 3I6RA 2W91A 2ZVIA 4LC8A 2EPNA 4J28A 3WX7A 4K8EA 5LNVA 4JOMA 3QOMA 2BXZA 3VUPA 5BMWA 2ZE0A 3BZGA 4IFRA 3VDHA 3AJXA 4I7WA 1ICPA 1ZL1A 3G0XA 5DBUA 2XSAA 4HMDA 5HNNA 3QY8A 4NJIA 5IRPA 4XAZA 5J04A 5EMYA 4QNWA 1MXDA 3GXMA 2J79A 3GO2A 2PCQA 2CWNA 1IEVA 3IRSA 1KRMA 4JCMA 4IIHA 1OF6A 1TPC1 3CV1A 3CMGA 3TC6A 1VYPX 3W70A 4ZZ9A 4G5DA 1R3QA 4IG2B 3WSUA 1EJSC 3NUKA 1J79A 1V08A 3NR0A 4IICA 5A6AA 2Z2UA 4O17A 2W92A 1QWKA 3MPGA 1B4KA 3MCOA 4CNPA 1CWYA 1GOQA 3URNA 5J8LA 2WJZA 4U4MA 2XN0A 1F61A 2J62A 1E70M 1HO1A 3A3HA 3DG6A 4DIAA 3WH9A 3OODA 4XAPA 1IXPA 1GJWA 3R12A 3H7RA 4OE7A 3PTDA 4YWSA 3HPSA 3SW6A 1XIIA 2J7GA 2WZIA 5HPCA 1B9BA 3LLXA 1REQB 1VHCA 4JN6A 4JFTA 5FKYA 2BS9A 4PBFA 2CERA 1U22A 1Q45A 2DT1A 2HBXA 1N55A 1VJIA 1N7KA 3CQHA 4FNUA 4I7VA 3S2NA 3B97A 1WZLA 4G9PA 3WDRA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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