3N9S | Genus

Total Genus 115

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	115
sequence length	307
structure length	307
Chain Sequence	MLVKGNEILLKAHKEGYGVGAFNFVNFEMLNAIFEAGNEENSPLFIQASEGAIKYMGIDMAVGMVKIMCERYPHIPVALHLDHGTTFESCEKAVKAGFTSVMIDASHHAFEENLELTSKVVKMAHNAGVSVEAELGRLMGIEDNISVDEKDAVLVNPKEAEQFVKESQVDYLAPAIGTSHGAFKFKGEPKLDFERLQEVKRLTNIPLVLHGASAIPDNVRKSYLDAGGDLKGSKGVPFEFLQESVKGGINKVNTDTDLRIAFIAEVRKVANEDKSQFDLRKFFSPAQLALKNVVKERMKLLGSANKI

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Rational Design, Synthesis, and Evaluation of New Selective Inhibitors of Microbial Class II (Zinc Dependent) Fructose Bis-phosphate Aldolases. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Fructose-bisphosphate aldolase
molecule tags	Lyase/lyase inhibitor
source organism	Helicobacter pylori
total genus	115
structure length	307
sequence length	307
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date	2010-05-31

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01116	F_bP_aldolase	Fructose-bisphosphate aldolase class-II

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3n9sA00

3OVQA 4P61A 3NL6A 4GWEA 4NNBA 5HJLA 1FCBA 4WXYA 3I65A 1VS1A 4GRSA 3ZWTA 4LS1A 5DY2A 2VKZG 4FHAA 4G1KA 4PL2A 2AAMA 4MOZA 4O57A 1FWSA 1S5TA 4QQ3A 3PUEA 4QIUA 2VXNA 4ZVJA 3IEBA 1XI3A 3L5AA 4PCFA 1YDNA 1SSGA 4O17A 1HO4A 1JCMP 3P80A 3C2EA 4O19A 2D73A 5G1YA 1MEIA 1YXYA 3C8FA 3QW3A 4MZ1A 3TX9A 4QSHA 1BWKA 1RZMA 2ZZ7A 3G1HA 5AHIA 3UZ5A 1SW3A 4AF0B 3SR7A 4IX0A 2QCLA 4NX5A 3INPA 1LP6A 1O5KA 3PG8A 3HG4A 1SO6A 4GUGA 2DZPA 1IXPA 1ZFJA 5C6MA 3DENA 3CB8A 2ZRYA 4YCPA 5AHEA 3GNNA 1X1OA 2NZLA 1XUUA 4LV9A 1J4EA 1WA3A 2H6RA 1GPWA 3CWOX 1Q6RA 2WNQA 3STGA 6ALDA 3BLIA 1GVOA 3TQVA 1SZFA 3UWVA 4K37A 4RX0A 1VCGA 5CSRA 1QPRA 5EY5A 1SFJA 2C18A 3DHDA 1LM1A 1FWNA 4LC6A 4CCCA 3NA8A 2PRLA 1KV5A 4N4PA 1FWRA 1L6YA 3B8DA 5G2HA 2WSRA 2Y6ZA 3SI9A 3C2OA 3ELFA 1TQJA 1KLZA 5SWUA 5AC8A 1SO3A 3LBMA 1OFBA 1Z41A 3LB0A 5HQEA 4DF2A 4AH7A 3U6WA 4RLIA 1PHWA 1YXDA 4GNJA 2QCHA 4KWVA 5LSMA 3N14A 3TKFA 1G67A 4U4MA 4ORIA 4Q32A 2CZDA 3OHIA 5AFDA 1BKSA 3SGZA 1LBMA 3GX9A 2W0UA 3G1YA 4LNYA 1AL7A 4LVAA 3CIXA 3BG3A 2WV8A 2J6XA 1W5PA 1GWJA 3W73A 2VFFA 1GJPA 3HGOA 1OX4A 3DFPA 3PM6A 3R8RA 5LNRA 3QPYA 3A23A 4WJEA 3BPWA 5AYYA 1R30A 4LU0A 1VYPX 3G0XA 5C2XA 4GXMA 3G1VA 2FB2A 2NV2A 4JIPA 4JD4A 3QF0A 3UWZA 5E0KA 3CLMA 2ZRZA 1N55A 4XKYB 3V1PA 3SGUA 3NO5A 4O12A 1FX6A 4Y9AA 1SFLA 4JX5A 3B06A 1OYBA 3P60A 3AO0A 2RH9A 3A5VA 1PIIA 3NZRA 4CNPA 3N2XA 5I3GA 5EL1A 3HF3A 3S0CA 4YCOA 3PVFA 4IMEA 1IF2A 2G5WA 4Y96A 5AYXA 3UY7A 3MMTA 3QC3A 3NEVA 4JR5A 1XDLA 1YDVA 4UFIA 5J5RA 1YLVA 4ADTA 1GVRA 1K3UA 1MXSA 4KFNA 3NL3A 1EIXA 5DXYA 4N4QA 5CPNA 2ISVA 1EP2A 1K02A 1KFEA 2JKEA 4IPJA 3TW7A 4HPJA 4CNOA 3L9CA 5AC7A 3KXQA 1JCJA 6TIMA 2F84A 2FJKA 3EEGA 2C14A 3CC1A 1GVSA 3MW7A 4HNUA 3E02A 4GC4A 3WK3A 5KZDA 3W88A 1FWTA 3QSTA 1M5WA 5D2XA 1X8FA 4TU1A 4A2RA 3O05A 5LZLA 4ORMA 1VGAA 3NGJA 4OV9A 2V5BA 3A5FA 5CG7A 1I2QA 3O63A 5AHNA 5D2YA 5AOUA 1J5TA 3WJXA 2CLLA 2E6AA 5D37A 3EX2A 3LHUA 4MKNA 1LRNA 1HL2A 4A2SA 2GQ8A 2X1UA 1I45A 3GDMA 3W83A 2F7FA 1G4PA 3NL5A 3W76A 1JCNA 4NXKA 4BWLA 4WY0F 3W2MA 4MLRA 1AK5A 3T4CA 4O1CA 4S1FA 1TB3A 3L5MA 3W7DA 4OGZA 5FF0A 1TPUA 3I7SA 4JTFA 4LT9A 3OG3A 2B7QA 3H53A 4M7SA 3BARA 3HOJA 5LGXA 4XBSA 2CLIA 4M19A 3HBLA 1WX0A 3QMRA 4MY1A 2XN0A 2JGYA 4I7UA 4JGDA 5G1TA 4Q33A 3EWWA 3FYPA 1B3OA 3S5YA 1W0MA 3ABQA 1OJXA 3P84A 2Z6JA 4NJGA 4NX0A 5IBXC 1RD5A 4AWUA 5F1UA 1AL8A 2A21A 3L0GA 3LM7A 4Q4KA 5DLCA 3IIOA 3S5NA 2EF9A 1EEPA 4PEKA 3TSBA 3OVRA 5D05A 3FOKA 4JY9A 4M6QA 4Z1CA 3G1DA 5EYWA 3ZR4A 4AB4A 3E12A 1Z44A 4K6AA 4K8EA 1GEQA 4HKPA 2FTPA 2VEKA 1G4TA 3GIYA 1OX4B 4FO4A 4JTKA 4ADSA 4UNLA 4ZMGA 1X6UA 2C15A 2J27A 1UCWA 1JUEA 1LOQA 3THQA 3M5ZA 3G8EA 3TC7A 3IVSA 3A22A 1VZWA 3R2GA 3W7NA 2H8XA 3L5LA 1D9EA 2Q8ZA 5ABTA 3TAOA 2ZZ1A 1XBVA 4O10A 1W5QA 4JTSA 4ZQMA 4O54A 3NQ2A 1PVNA 2G95A 3P8IA 3NM1A 1FY6A 3W86A 3NPUA 3DHFA 1VLWA 1XBXA 1WQ5A 1O94A 1AG1O 1OFOA 4HSOA 2FFCA 4Z1DA 5D30A 4A3UA 4H4IA 4O1BA 4YWIA 4O52A 3GB6A 3TIMA 5C5YA 3ANYA 1VRDA 3EX3A 1P0NA 1N8FA 4RJEA 5F2MA 1TIMA 4PODA 1X1ZA 1YADA 5K2ZA 4NNAA 3C52A 3DZ1A 3PB2A 2ZRVA 4GUJA 3TV8A 4MYAA 4UR7A 5K3VA 2CZ5A 1KTCA 4IUOA 5HMSA 1DHPA 2QKFA 3W1MA 2ABBA 4RCXA 2J9XA 3NNTA 3LCFA 1QFEA 5HWMA 1NSJA 4K36A 4IMCA 1A5CA 2CLKA 3RMJA 2OCZA 2VFIA 3UWUA 5G2WA 3GYEA 4LS0A 1CX9A 3LCGA 3P67A 2RDTA 5AB3A 3UXAA 1BTMA 3M7WA 1VYRA 1I2OA 4FB7A 5CPLA 1M7PA 4FXRA 1KTNA 1W56A 3F1QA 3STEA 3QSRA 1O95A 4DO5A 3W75A 4FIQA 1K7EA 5D03A 4AWSA 1F05A 2HMCA 4C1LA 3B03A 1TTPA 3O6DA 4OT7A 1GZGA 4JTLA 3DAQA 4WX2A 4X2RA 3LRKA 1TPFA 1WXJA 1C29A 3AJXA 3DFTA 4LWWA 2GVGA 3HB9A 2ZQ0A 4JTGA 4QITA 3UY8A 1JRCA 1E51A 4D2JA 3HGSA 3W7PA 3V75A 2C3ZA 4MYXA 3R12A 3C56A 3NQ6A 3HG2A 1K8XA 3O15A 4O16A 1C8VA 3TC6A 2E5DA 4UTTA 2PRHA 4KKXA 2QJHA 3LCLA 1KM5A 4ZQPA 2DZUA 1KV8A 4UTWA 3IIPA 4POCA 1KFJA 1Q45A 1JULA 4JY8A 4OQVA 4UTMA 3UQNA 1NAL1 2B0MA 1W3IA 1W3TA 3G1SA 3MO7A 1GQNA 3EX4A 2EKCA 3UNDA 1EB3A 1UUOA 3UD6A 4AXKA 5D38A 1TPDA 1WV2A 4AEOA 1VLIA 4JNMA 3ZFHA 1RQBA 2VFGA 3GXPA 4S2BA 3NYZA 2X2GA 4FNRA 2BX7A 1KA9F 3RLVA 3QEZA 1TJPA 4K38A 4X22A 1LROA 2A7PA 3LLFA 3MHGA 4FNTA 2WNNA 2DU2A 4MIMA 4O0ZA 2PC4A 1F73A 3OEXA 3GAYA 4K7VA 1LLZA 3MI2A 3O07A 1H62A 1K8ZA 3W85A 4ZQCA 1TV7A 4DF0A 3GZ3A 3UXDA 5KINA 1U83A 3THAA 1GYLA 4QAIA 5F1VA 3YPIA 1TPVA 3GVGA 4CQ9A 3M5XA 5I3IA 2OX1A 3IVUA 4WOZA 4XWUA 4FNQA 1LOLA 3EWUA 1SZGA 1F5ZA 4TX9A 3UWWA 4N9DA 3BW4A 3W7IA 2YPIA 2XN1A 3ATZA 1ICQA 1RQHA 4PFMA 4UFMA 1HO1A 3W7QA 1IIHA 3P5YA 1M7OA 4TR9A 3U2OA 4GUFA 1LRQA 2VC6A 3TSMA 3IV3A 4MFEA 1TO3A 4IPIA 3G3MA 1L6WA 5D2VA 3LRLA 2CW6A 3I68A 3LCIA 5LGZA 3LHZA 3SSJA 1W3NA 1DQWA 5AHFA 1FWWA 2V81A 5D2TA 3W7RA 3HPSA 3O06A 4XTDA 1L9WA 4UC5A 1PE1A 3STCA 3T7VA 4TMCA 2WPBA 3JRKA 4RR4A 1LORA 1PL9A 5HINA 4BWLC 3W7HA 1XDMA 1Q6OA 1D3GA 1H60A 2A85A 1A5SA 2X1SA 1DBTA 1F2JA 3U8GA 4JTJA 2I14A 3LRMA 5FF3A 3NQ7A 3DI0A 1WYIA 3HIJA 4ADUA 4NUWA 3DH7A 5K9DA 1OYCA 2Q3RA 2GQ9A 2GUUA 4WQ6A 3TROA 3T44A 3E49A 4K7YA 4C1KA 3W6YA 1JUBA 4O14A 4BK9A 3W2JA 3EWXA 1CI1A 1JR1A 3S8HA 5F2LA 1GOXA 3CEPA 1VPXA 2TPSA 4ZQNA 4FEZA 3WJZA 2EAWA 3F03K 2YR1A 4OHQA 3TCEA 1WOAA 4BR1A 3S42A 2DZXA 1KM4A 4AAJA 3BG5A 2ZRWA 5I3KA 1GTHA 1SW0A 3NXFA 3UWQA 3TXVA 4IWWA 1H50A 4U28A 1AW5A 1S3HA 2X1RA 3M6YA 4MZ8A 2E1DA 3S1WA 4LV4A 2WJZA 4JDYA 2CLFA 4DBEA 1UB3A 2WQPA 2V5LA 5K4XA 5F2IA 1GT8A 3NDOA 2QDGA 3PB0A 2JKPA 4H6KA 5AHLA 4AHOA 5U7SA 3GKAA 3IIVA 4RKAA 1EP1A 1QPNA 2A1YA 3HJZA 4MPQA 1JQXA 2XFWA 1ADOA 4EOUA 2ISWA 2Y7EA 4ZQRA 3FFSA 5BRBA 3G24A 4OU1A 4O53A 3LI0A 3NQAA 4Z0SA 3C4UA 3LCXA 2P0OA 1SZEA 4JTEA 3P8JA 1VC4A 1G69A 3I7QA 3TSDA 4O15A 1JCXA 3W70A 1JUKA 3M5YA 3EX1A 1DKWA 5D32A 4LOCA 3ZS4A 2XN2A 5LNUA 4BF9A 2Y70A 3BLFA 1OFPA 2JK2A 3KHJA 3NAVA 2OT0A 1DOSA 4EF8A 1FDZA 3B04A 3JS3A 2E6YA 4IXHA 1T8XA 3MP5A 4O18A 5AYZA 2BTMA 3G0UA 3QYQA 4WZHA 3FYOA 3PUDA 5D04C 3CT7A 2VEIA 1TTJA 4UCGA 1UUMA 4L4MA 1FXPA 1A5AA 1R46A 4FNPA 1H51A 2G96A 4UXDA 7TIMA 4UTUA 1R2SA 3TJXA 5A8GA 3W2KA 4GUIA 2ZZ6A 5HUOA 2G97A 3QQ1A 5K9XA 3C6CA 4K8HA 1FCVA 1YPIA 5F4SA 1KBJA 1I8JA 3KFTA 2X30A 3W7JA 3UPBA 2I9EA 4GUHA 3D0CA 4N02A 2HTMA 3LXBA 4TO8A 4CNNA 4ALDA 4CLMA 5HULA 1KTBA 3MI6A 3W7EA 1ICSA 4ML9A 2A6LA 1H7OA 3M5VA 4GBUA 3O6CA 4CQ8A 1TJRA 4RXFA 5E1QA 5D09A 1IIGA 2Y62A 4LVGA 3VFLA 2R94A 2QCFA 2QCDA 1KM1A 5HWNA 1EUNA 3Q94A 2PURA 3W84A 3TNOA 3BG9A 3PAJA 5I3FA 3HGRA 4FNSA 2A7NA 1KM2A 3GKFA 1H7PA 1OFRA 4N6EA 3CWNA 3PBYA 1RPXA 1A50A 1NVMA 3Q37A 4QM1A 3PSWA 3MHFA 1ZJIA 1OFQA 5DCBA 4MVAA 3R13A 4OE7A 3L0NA 2H90A 2DZTA 4UTTC 1BEUA 1FBAA 1SZNA 1ZAHA 5EA9A 3W2UA 2BLEA 3N73A 3S1UA 1K7XA 4XBKA 3CEUA 3W7KA 1ZCOA 3HPZA 4UTIA 1F6PA 4UTWC 3LX9A 4JTHA 1XM3A 3GR7A 4RZ5A 1QR7A 4O0KA 5CGQA 3R89A 2V0TA 3LOTA 4QJ1A 2OJPA 5IM51 3TFCA 4Z1BA 3SJ3A 4BI5A 2EPHA 3HMJG 3W7GA 1ME8A 3GNDA 1DV7A 2C1HA 4NT0A 3VCRA 2ZZ3A 5LKYA 2YFOA 3O1NA 3SIZA 4JS3A 4LRTA 1F76A 5LNWA 1LBLA 3G1AA 3EXRA 1R2RA 1NF0A 4NZFA 2GQAA 3TU9A 1OK4A 4HHPA 4IMGA 2E68A 4JXCA 2QAPA 1PHQA 1ZAIA 3M1ZA 1W5MA 2PRMA 2J9YA 5DELA 3M41A 1MSSA 4YMZA 3P62A 4NNCA 4A22A 5DN1A 5BOOA 2GPTA 4AMAA 4X3ZA 2Y63A 3TQ0A 3EWYA 3KAOA 5DCDA 4M6PA 2QAFA 4UR8A 4UMAA 2ZCGA 1XFBA 3LLDA 2A5HA 5EPDA 3L68A 5AC6A 1I2RA 1G4SA 3SW6A 1OFAA 4LUIA 1XXXA 5F4WA 1O60A 4J9JA 5FF4A 2V30A 4IJBA 3TXZA 2AQWA 2BWGA 1F7BA 4CQAA 4UFJA 5K9CA 2P10A 4EF9A 1VYSX 5C55A 5D02A 1ME9A 3N2MA 3QZEA 2Q8LA 2O7QA 2JBMA 2VOMA 2B7NA 1P0KA 2TYSA 2WKJA 2VEMA 2PCQA 1KBIA 3TUUA 1OFEA 3GXTA 1A53A 1S5WA 1FCUA 2QCNA 3PUOA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3N9SA

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