3N9S | Genus

Total Genus 115

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	115
sequence length	307
structure length	307
Chain Sequence	MLVKGNEILLKAHKEGYGVGAFNFVNFEMLNAIFEAGNEENSPLFIQASEGAIKYMGIDMAVGMVKIMCERYPHIPVALHLDHGTTFESCEKAVKAGFTSVMIDASHHAFEENLELTSKVVKMAHNAGVSVEAELGRLMGIEDNISVDEKDAVLVNPKEAEQFVKESQVDYLAPAIGTSHGAFKFKGEPKLDFERLQEVKRLTNIPLVLHGASAIPDNVRKSYLDAGGDLKGSKGVPFEFLQESVKGGINKVNTDTDLRIAFIAEVRKVANEDKSQFDLRKFFSPAQLALKNVVKERMKLLGSANKI

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Rational Design, Synthesis, and Evaluation of New Selective Inhibitors of Microbial Class II (Zinc Dependent) Fructose Bis-phosphate Aldolases. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Fructose-bisphosphate aldolase
molecule tags	Lyase/lyase inhibitor
source organism	Helicobacter pylori
total genus	115
structure length	307
sequence length	307
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date	2010-05-31

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01116	F_bP_aldolase	Fructose-bisphosphate aldolase class-II

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3n9sA00

3I7QA 3STEA 3UXDA 5D2VA 1LORA 1QPNA 5F4WA 3ABOA 1Z44A 2ZBTA 1VYPX 3HPSA 5FF7A 3P82A 3V75A 1O94A 4AMAA 1JVNA 3NPVA 3L5AA 4MYXA 1M7PA 5KTLA 1SZEA 1RQEA 3P60A 4DO4A 2FPYA 4JTGA 3PUEA 1FWNA 5D04C 4CQ9A 4O1BA 1VZWA 3LHTA 1SSGA 3JR2A 5HR6A 1EIXA 2ISSA 3W71A 1CX9A 1A5AA 3LCFA 1H51A 1M5WA 1FDZA 1EUAA 3R13A 1O5KA 2JGQA 1AW5A 5IBXC 2VENA 1LRQA 3EX4A 5I3IA 1LTDA 4JNMA 1JCMP 2DJLA 3MBFA 5FEXA 3EX3A 3G8EA 4OQVA 5AYXA 3MYOA 3TA6A 2A7RA 1MO0A 2RDWA 3E02A 2C18A 4IX0A 4J9JA 1OYAA 3SJ3A 3SFKA 3NQ8A 1B3OA 5LNSA 2V5BA 1ADOA 3TW6A 3LM7A 3U2OA 5K9CA 3R12A 4UFHA 3LX9A 3QEZA 3QQ1A 1VCGA 5LNWA 3W1QA 3DBPA 1ICPA 5D2WA 3OVPA 5AYYA 3LRLA 3O07A 2H8ZA 1OFAA 2A1YA 5I3GA 1P0NA 3NVTA 4RZ4A 3S9YA 4XBSA 3CLMA 1A53A 4UTTC 1G67A 3CB8A 4FNRA 1YPIA 4H6KA 1S5WA 5AHNA 2NXIA 5I3HA 2CW6A 3MUXA 3NQDA 4JICA 3B03A 3FJ6A 4NJGA 2Y7FA 1JR1A 4ICNA 3G24A 1A50A 1VLIA 4XUGA 3THQA 3N2MA 4TMBA 1TTJA 1EA0A 3FS2A 3TQ0A 4OE7A 1DKWA 3PBYA 1IXNA 3TJXA 3ABSA 3QJAA 4JY8A 3W7EA 1BWKA 3EWXA 3HG2A 4DO5A 5AHLA 4GUGA 1MXSA 4FIRA 4I7WA 4O28A 1OFBA 1UJPA 4AVFA 4YL2A 4DQWA 3GB6A 4NXSA 3QPZA 3GYEA 1Z42A 2DU2A 3M5VA 5EPDA 3W2NA 5D02A 1IXPA 1EWEA 2QCLA 3EXSA 1ZJIA 3PS7A 1W5NA 1XBVA 3KX6A 1VYSX 3P8JA 2I14A 4AAJA 1QDSA 4POCA 1XUUA 3W84A 1SUXA 1XBZA 5CG7A 3S5ZA 4JTUA 1KFLA 2QR6A 2ZQ0A 3W2UA 4X22A 1LBLA 3I7SA 4NVTA 4GFSA 3L0KA 1W37A 3W87A 3SIZA 3G1FA 3ELFA 3LHYA 3TH6A 3QM3A 2DZVA 2NXGA 1YXCA 3B8DA 4TMCA 3NQ6A 2QDGA 3UNDA 5TIMA 1S3HA 1V5XA 4UFMA 4BWLA 5TBOA 2J88A 3GVGA 1AW2A 3W2KA 3TC7A 3R8RA 4DXVA 3DZ1A 2CLKA 3NL2A 2UV8G 2IQTA 3L65A 1ZFJA 4IUOA 3TFCA 4CCDA 1A5CA 4UFKA 2NX3A 5FEZA 3TR2A 1TPC1 3UPWA 1OVDA 1S5VA 5C5YA 3BG9A 2VFFA 4PC8A 5DCEA 3W22A 4A21A 2KZHA 3G1SA 5E0KA 3EWUA 5KITA 3LDVA 1QPRA 1DQXA 3OIXA 1VHCA 1WX0A 3SZ8A 1GVOA 5A8GA 5G5IA 3GX9A 2RH9A 1TRDA 3OEXA 3EWBX 1KFEA 2OT0A 4WJEA 5FF4A 1YTEA 4RXGA 2V2CA 3UWYA 2NUXA 2PRHA 3Q94A 4FNQA 1G4PA 3HF3A 1OYCA 5HWNA 5C6MA 1OX4B 4UMAA 2QCCA 3P8IA 4M5PA 1H63A 1H1YA 1G6CA 1I4NA 1OFRA 4K36A 2EKCA 1ME7A 4DEFA 4GC4A 3QH2A 4NNAA 4ZQMA 4NJKA 3W86A 1Q6RA 3H54A 1C9DA 1EP3A 1G7UA 4MY9A 5D37A 1B4KA 1SO5A 2C13A 1SZFA 3VE7A 2RDUA 4WY0F 1C29A 1SO3A 1I2OA 3AO0A 3M43A 4JTTA 1G7VA 1ML1A 4JXCA 4HIBA 1M6JA 3V1PA 4GWEA 3MP4A 2Y88A 3TW7A 3NL6A 2Q3OA 3C8FA 1WDWA 3F4WA 4LUJA 5CPLA 3STCA 2B7OA 3IGUA 5CZTA 2YGYA 2WJZA 3UD6A 2QUVA 4UUIA 3L67A 3BLIA 4HNVA 1KM5A 3CQ0A 3NR0A 2RFGA 3UWZA 4MZ1A 3G3MA 5G1TA 1W1ZA 4LY8A 3G8RA 3CWOX 3WJYA 3ZWTA 3DU0A 3I6RA 5K7JA 3LTPA 5D2TA 4UMBA 3NYZA 3PB0A 5IBXA 4XKYB 1JCYA 3G1HA 4RZ5A 4XKYA 2BLEA 4FNTA 4HPXA 1FCQA 3WFAA 1SR9A 3GKFA 2A7PA 3GXNA 3MHUA 3MJYA 2A6NA 1I2NA 1ZCOA 5AB3A 4FXRA 4RLIA 3TXVA 4MJZA 3NO5A 3E9AA 3M6YA 3O15A 5G4EA 3GK0A 2I1OA 4LVBA 3LGEA 1JULA 2E1DA 3DI0A 4MY1A 2FDSA 4RKAA 2J9XA 4TIMA 1KA9F 3P62A 4Y96A 1H7OA 2RHGA 2HS6A 4UTTA 3N34A 3W1MA 2R94A 4QM1A 3SW6A 4IWWA 4RZ6A 1P0KA 1W54A 3D0CA 2QDHA 4LVDA 4N9BA 1SZNA 2QAFA 2YXGA 4A2RA 3M7WA 3W7CA 4HT3A 4DO6A 2A21A 3PB2A 3WJZA 4M19A 4O17A 4O4VA 4MIMA 3A5FA 3GIYA 3ZS4A 2GOUA 4JDBA 4AF0B 1FWTA 4MLRA 3BGGA 4Z08A 3TQVA 1GTHA 4AF0A 4JTFA 3LV6A 3W7GA 2V9DA 4KKXA 2FTPA 3STFA 3EX6A 3BG3A 4GUJA 3UYCA 3LCLA 4UTHA 1E51A 1OFPA 3W6YA 3S1UA 3LXBA 3A22A 3DGRA 3PM6A 4XTIA 1HL2A 5EY5A 1I8JA 5HUPA 3IVUA 4QNWA 1WYIA 3S1VA 2J24A 3MI3A 4NXKA 1MEWA 1LYXA 3MW7A 3TMQA 1K8ZA 1XL9A 2TPSA 1VYRA 1LZOA 2JGYA 4Q33A 1ICSA 4Y6GA 4JTJA 3LTSA 1FDJA 5KSWA 1AL8A 4FNUA 3P5YA 2VFHA 1WOAA 1YTDA 2ZCGA 2ZZ1A 1JUBA 2CLLA 3NL3A 2CZ5A 3C3NA 3SR7A 1I2PA 3C56A 2JKEA 1OG0A 1QNVA 1KLZA 3G1XA 4A22A 3NQ7A 3TSDA 3MO7A 2NUYA 2O7QA 1P4CA 4R34A 5AOUA 3P84A 4R53A 4CNNA 1BEUA 3NQ2A 1PS9A 4O18A 4O0KA 5E93A 4YLWA 3QYQA 5U7SA 3S0CA 1FWSA 3L0NA 3MBDA 2NZLA 1ZNNA 3A5VA 5LZLA 1EX5A 4K8EA 1EB3A 1QOQA 3WK2A 3NQMA 1SW7A 3CPRA 4CQAA 1W5OA 2Y62A 1XDMA 2GJLA 2PCQA 4CQ8A 3TV8A 2HMCA 3LCHA 4N2YA 2QUUA 3USBA 1AG1O 4NX0A 4HHPA 4W9TA 4IPJA 3EX2A 3W1PA 4WY0B 4QQ3A 1H7PA 2QUTA 4IMDA 1TSIA 3UY7A 2H3DA 3RU6A 1HO1A 3Q58A 4LRTA 2GVLA 1OJXA 1KFJA 4JTHA 5CKSA 2FJKA 3CIXA 3NM1A 2V5LA 2YW4A 3P74A 3VFLA 3LBMA 4ZVJA 1F5ZA 3F03K 1W3IA 3O63A 3N14A 4Z1DA 1S5TA 3IRDA 3C0JA 2PURA 1JQVA 3M44A 1KM6A 1OABA 2ISVA 3W2LA 4QNEA 3CC1A 3RF9A 1JQXA 2P10A 1TJRA 4ZL1A 4K38A 1I45A 2WOQA 5C2XA 3WJWA 1GQNA 1Z48A 1IF2A 1QO2A 4I9AA 3CEUA 2P1FA 1EPXA 2NUWA 4ZMGA 3PR2A 3MYPA 3W7MA 4CNOA 5HULA 3QW4B 4JYEA 1DV7A 2H3BA 4A2SA 4E2BA 2F7FA 1TO3A 1VGAA 4XWUA 2E6DA 1JRCA 3KAOA 3C61A 2OT1A 3EWYA 4O15A 3UXAA 3NQEA 2CLFA 5SWUA 2ZRYA 2CLHA 2JKPA 1WXJA 4N9CA 4ADSA 3TXZA 3AJXA 4MFDA 4K37A 4UNKA 4E38A 2Z6JA 1D3GA 1M7OA 3NZ1A 2OMAA 1RZMA 1K3UA 4AXKA 5HMSA 3ATZA 3P61A 4MVAA 4O1DA 4UC5A 1UUOA 3NOEA 3TSBA 4JX6A 1OX6A 4HNUA 2YYUA 1XBXA 3CU2A 1KFBA 1J2WA 2TYSA 2DJXA 4TO8A 2X30A 2ZZ2A 2FLIA 2I9EA 4Q4KA 1H7RA 4DPPA 3PSVA 4NX5A 4FIQA 4GBUA 1YLVA 1YADA 1ZY9A 1SO4A 2OZ0A 7TIMA 2XN0A 3W23A 4MFEA 1FY6A 3WK1A 2VELA 1ONRA 3RLUA 4DF0A 1X1ZA 1OFEA 3M16A 5CGQA 4K39A 1ZHAA 4LNYA 1DJQA 1TIMA 1K8YA 4PH6A 3VI2A 4UFIA 3DKLA 4K6AA 3W7NA 4N9EA 4E0CA 1A5SA 5KINA 5EBUA 3GDMA 3W72A 3O8AA 3UWUA 2CFFA 4GUHA 3QMSA 2XN1A 1TTPA 1J4EA 1OF6A 3N9RA 4MKNA 4O1AA 2A6LA 2Y61A 3NZRA 3HGOA 5DY3A 3A21A 1FUYA 3IVTA 3T78A 4KFNA 1Q6LA 5DY2A 2ZYFA 4MUZA 1SFLA 1GTEA 1MEIA 1KTCA 1W31A 5DXXA 3OA3A 3SY5A 1ICQA 3FKRA 1X1OA 3HG5A 3UPBA 3ZFHA 3S5YA 2BZNA 1VJIA 3NPWA 3PUDA 5D05A 3EKZA 3O1NA 1XM3A 4UXDA 1QR7A 4IMGA 1Z41A 4N6FA 4CCEA 3OG3A 1YXDA 2JK2A 1DOSA 4YXGA 5HUOA 2EHHA 3S1XA 3KFTA 4S2CA 4Z0SA 2ZRVA 2QCFA 1FX6A 3LV5A 3S6DA 5F4XA 4JX4A 4JYDA 2ZFAA 2VFEA 3T4CA 1PIIA 4BI7A 1F73A 3LHWA 2WV8A 4IXXA 3H53A 6ALDA 3GAKA 3LTYA 3BVJA 5DN1A 3E0IA 1JUKA 2YW3A 3HQ1A 4NUWA 4N4QA 1VH7A 3K30A 1G4SA 3MWAA 5U4NA 4R7JA 1ALDA 3GDTA 4UTWC 3NQGA 4QIUA 3NG3A 3W7JA 3LCIA 3CM4A 3UZ5A 1KBJA 1TV7A 1SZGA 1LROA 1ME9A 5GVJA 4FX6M 4UMCA 3GNNA 3OVQA 4A3UA 2PC4A 4RX0A 2GUUA 4PEKA 2BTMA 3G1YA 3TAOA 2Y85A 2W79A 3L0GA 3HGRA 1GG0A 4JTSA 4PA8A 2QEZA 3BV4A 2QCEA 3KVMA 5ABTA 4TX9A 3MP5A 2ZZ4A 4JX5A 4MOZA 3M9YA 4ADUA 4M6QA 1P5BA 1XCFA 3LXCA 4DBDA 3B05A 2YCEA 4KFOA 1WBHA 3UWQA 2Y7EA 2FFCA 4QAIA 2CLEA 3OHIA 3PULA 5FEWA 3STGA 3KOFA 3W7OA 3FYOA 3GZ3A 5F1UA 2V30A 3ZR4A 3N73A 1RV8A 4ML9A 5K9DA 3LHVA 3QPYA 4LWWA 4RK8A 1OX4A 2FB3A 1T8XA 1YXYA 4YCPA 3G0SA 2H8XA 5C54A 1IXOA 1KFCA 2ZRWA 1O60A 4JTLA 4RV8A 2V81A 5BW6A 2G97A 4DF1A 1RQHA 1W0MA 2HS8A 3N19B 3M5XA 1GVFA 3CHVA 1WBJA 1YPFA 2LLEA 1KM1A 4PCFA 1PV8A 4BK9A 5F2IA 1OFOA 4ZQOA 1SO6A 2X1UA 2FPTA 3LI1A 4IOTA 4OV4A 4JGDA 3ANYA 3CT7A 3VNDA 3M5YA 4QSHA 2YSWA 1W56A 3DHFA 4NZFA 3TC6A 2ISWA 1FBAA 3THAA 4N6EA 3QC3A 1F2JA 4B5NA 2X2GA 1KV8A 3G0XA 2QAPA 3IV3A 4FX8A 5I3FA 4UFJA 4BR1A 3TJLA 3SECA 1VHNA 1AMKA 3CEPA 3NDOA 1TPDA 3WK3A 1T0OA 4WOQA 1SW3A 2V2DA 1TPFA 1QFEA 4LC8A 3WJXA 5D2XA 1GYNA 3W7KA 5CZ0A 2E6AA 1SU5A 2Y7DA 2YZRA 3HB9A 2QCMA 1R47A 2X1TA 4X2RA 4XQ6A 4ALDA 2C1HA 5LKYA 1OF8A 1Q45A 3ABQA 1EEPA 1KFKA 2RDTA 1QMLA 4ORMA 2VFIA 1JJKA 1QCWA 1TREA 3CWNA 3C2EA 3PF3A 4AHOA 2B7QA 2V82A 3W7QA 2O7SA 3LCWA 3W83A 3FEMA 3OVRA 2A0NA 5L9FA 2ZA3A 2Y7GA 2FPVA 2CLOA 3T55A 5A5WA 1FDYA 1VLWA 3HO8A 3LHUA 1TRIA 4HSNA 3GLCA 1THFD 5EMUA 1ZALA 4HKPA 2W6RA 1KW1A 1YDNA 3NXFA 3IIXA 5CSRA 4NNBA 4I7UA 4RR4A 4O16A 2DZSA 3OBKA 1H7NA 4S2BA 1NSJA 3Q2DA 4O11A 4WD0A 2FB2A 3LLDA 2ZZ5A 2DP3A 5HWMA 4P2VA 3KRZA 3DFOA 5G2IA 3CTLA 2E68A 3RMJA 3PUOA 2TMDA 3UY8A 2WSRA 3L5LA 5FEPA 4O52A 1KTNA 4ZQRA 4QJ1A 3PC0A 4Z0JA 4PL1A 2HSAA 2E77A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3N9SA

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