3NPWA

In silico designed of an improved kemp eliminase ke70 mutant by computational design and directed evolution
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
250
structure length
247
Chain Sequence
TDLKASSLRALKLMHLATADTDEKVIALCHQAKTPVGTTDAIFIYPRFIPIARKTLKEQGTPEIRIWTSTNFPHGNDDIDIALAETRAAIAYGADGVAVVFPYRALMAGNEQVGFDLVKACKEACAAANVLLSVIIETGELKDEALIRKASEISIKAGADHIVTSTGKVAVGATPESARIMMEVIRDMGVEKTVGFIPAGGVRTAEEAQKYLAIADELFGADWADARHYAFGASSLLASLLKALGHG
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Lyase
source organism Escherichia coli
publication title Optimization of the in-silico-designed kemp eliminase KE70 by computational design and directed evolution
pubmed doi rcsb
molecule keywords deoxyribose phosphate aldolase
total genus 96
structure length 247
sequence length 250
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-06-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3npwA00
2ISSA 1XC4A 5DBUA 2GVGA 2H3BA 4O8RA 3EWBX 2DZUA 2ALDA 4FX7A 1F2JA 4UFLA 1ZALA 5F2GA 5D04C 3GIYA 3BG3A 3UWZA 3W72A 2QCNA 4HPJA 1TMHA 3R12A 1TV5A 3TV8A 4MY1A 1OYBA 5GVJA 3W7JA 3WK0A 2NWSA 4PTNA 2Y63A 1LOLA 3B0PA 3TKFA 5KTLA 6TIMA 3MW7A 5K3VA 1YADA 3S1XA 4LW7A 5U7SA 2ZA2A 5HMSA 3I65A 3N19B 4P2VA 1EB3A 2YDAA 2DJLA 1TQJA 2BLEA 1LLWA 4UMCA 1SFLA 1VLIA 1YXCA 1WA3A 2E68A 3HG5A 2AAMA 1UBSA 2JBMA 3TA6A 3T55A 5AYZA 3GK0A 2FPVA 3PB2A 3T4CA 3M7WA 4MIMA 3R89A 1ZENA 2CLIA 3W87A 3BPWA 1JCJA 2Y89A 2CLFA 3YPIA 5EA9A 4O1AA 3P82A 4RZ5A 1NF0A 3CU2A 1M7PA 2X2GA 2WQPA 1DQWA 5G4WA 4JD4A 3HMJG 3UWUA 3UWYA 3N3MA 3O6CA 3F1QA 1DHPA 4PL2A 4YCPA 4ZQOA 3LRKA 1NEYA 5HWJA 3C2FA 2X30A 3P84A 3M5ZA 1H63A 5ABTA 2O7SA 3RNDA 1SFJA 3DFPA 1W3IA 4FIRA 1NFBA 3IIOA 1DJQA 2E5DA 1JUEA 4JNMA 3NM1A 5F4XA 4IGHA 2Y7DA 3Q2DA 4NU7A 4YXGA 4PA8A 2A85A 3BW2A 3EKZA 1O4UA 2H8XA 3HBLA 4DO4A 1LZOA 3DI0A 4E2DA 3O16A 3BGGA 1YPIA 1MEWA 4JYDA 1L6WA 5HINA 1OFAA 4CCDA 1OFBA 3C2VA 3IIVA 3MI3A 2YCEA 3PG8A 4BI7A 2NV2A 2DP3A 1OK4A 3GDMA 4LWWA 2WV8A 1TPH1 2FB3A 1H7WA 4FHAA 4QQ3A 1FCUA 3LHUA 4XBSA 2H6RA 1O60A 4RXFA 3ZS4A 1TV7A 3UZ5A 3WJXA 1I8JA 4AWUA 3NZ1A 2DORA 4X2RA 3SZ8A 2E6DA 4QSHA 3BARA 1EX5A 3VKJA 1NSJA 2D73A 4ZQCA 5TIMA 4QJ1A 3NPVA 5D33A 2E6YA 4JTEA 5F4SA 3O8AA 2G97A 5G1YA 1TTIA 2CLEA 3NQ6A 2A7NA 4FNPA 4RX0A 2OZ0A 1H1YA 1S5WA 1ZAIA 3M41A 3TQ0A 4M7TA 2WSRA 3W7RA 4UFMA 4RK8A 3N2XA 5KSWA 2DZSA 3PBUA 1XKYA 4UTIA 4MYXA 1AG1O 2ISVA 4UR8A 3GR8A 1TJPA 4UTTC 3OEXA 1W5OA 1ZFJA 1HL2A 3IIPA 1W5QA 4IOTA 2CLOA 2P0OA 4RXGA 2I1OA 2NWRA 3DFOA 3VFLA 1ICSA 3HG2A 1OHLA 2RH9A 4DPPA 1TPDA 1SSGA 1KBIA 2NUXA 2J27A 3EX4A 3WJYA 1SO6A 3KVMA 4E2BA 1LOQA 1XL9A 3G1HA 4JTLA 1FDJA 3VCRA 1PIIA 4AMAA 3CQ0A 4CNPA 4AF0A 3LCLA 3TIMA 1H51A 1BTMA 3W3OA 4NQ1A 4GJ1A 3HGSA 3KRSA 3C6CA 4IMGA 2V5BA 2ATSA 3LXBA 1ONRA 2X16A 1JCNA 1SO3A 4TMCA 2RKXA 3LCHA 3F03K 1VCGA 1SW7A 5D2TA 5AOUA 1SW0A 3Q58A 1FCVA 1JQXA 4QM1A 1ZHAA 1FCBA 1PS9A 4MPQA 3STGA 3PB0A 3CHVA 3LXCA 4JTIA 3L0NA 3TK7A 3KFTA 3UPBA 3TNOA 5IM51 1B3OA 3QMSA 4FO4A 3KXQA 2CZEA 3UY8A 1K8ZA 1IXPA 5AHLA 3N14A 1LRTA 2PRHA 3TQVA 3NM3A 3HF3A 2OJPA 1K3UA 1QFEA 3EX1A 4UXDA 3KRUA 3G24A 3H53A 4O14A 3EWUA 3M5VA 1GEQA 5G5IA 3W70A 5D02A 1H7RA 3SECA 1D3GA 3NQEA 4JTGA 3PS7A 3NO5A 2W79A 1YXYA 3QQ0A 4I7WA 3GVGA 1K8XA 3HGOA 3IV3A 4LT9A 1RPXA 1O5KA 1GYLA 5KZDA 4K8HA 2CZDA 1DQXA 4AXKA 1WQ5A 4OQVA 3DH7A 4A2SA 1H7XA 1MEIA 4LS1A 3L5MA 4NXKA 4K36A 3LHYA 1LCOA 4IMCA 5BMXA 2Y7GA 2ZZ5A 2YX0A 3NPXA 4EVZA 4UIOA 2Z0IA 3A23A 4XZ9A 1V7YA 3IGUA 4HIBA 4W9TA 5EL1A 3OG3A 2QF7A 2DZTA 5EMUA 3TAKA 5D32A 4I9AA 5FF4A 3DENA 3GNDA 1FXQA 1TPC1 3EWWA 3V75A 2I9EA 3LB0A 1EWDA 4MJZA 2QCDB 1TQXA 3NGJA 4MFDA 4S1FA 2HMCA 4M19A 3NQDA 3G0XA 3NEVA 2V30A 4MLRA 3QF0A 3STCA 1UB3A 4OU1A 2E6AA 4GRSA 1LM1A 3GXNA 3W6YA 2H8ZA 3DFQA 3CEPA 3LLDA 3P8IA 3MUXA 3KOFA 1VHCA 3LCFA 5AN7A 3QFEA 4WXZA 1N55A 2OMAA 2QCDA 3N9SA 5CPMA 2XN2A 4S2BA 5TQLA 1L9WA 1O95A 1LBLA 4Z1AA 2AQWA 3M5YA 4BR1A 1QPOA 5HNRA 4RZ6A 1OK6A 1G6CA 4AH7A 1F05A 3Q94A 2Z2UA 2JGQA 4KWWA 4UMBA 4O1CA 3HPXA 2ZZ2A 3BLIA 3ELFA 2A0NA 5J5RA 3U8GA 3G1SA 2WPBA 5F2MA 4FF7A 4N6EA 1LRQA 3UNDA 3B0VC 3N2MA 2RDUA 3SSJA 3USBA 2PRLA 3OIXA 1GVSA 3M0ZA 3KAOA 2RFGA 4HNUA 2XN1A 3HQ1A 4WQ6A 3W7QA 5D05A 4M6QA 2OX1A 3BK0A 2HSAA 3W23A 2VEPA 3W76A 2RHGA 1TPWA 3NG3A 5L9FA 1HO1A 3DFNA 4WZHA 3GX9A 2GPTA 1TPFA 2ZRXA 4K7YA 1YLVA 1PL9A 4MFEA 1L6SA 1SZNA 3OA3A 2G5WA 1TPEA 2JKPA 1HG3A 4NNAA 3E96A 4UFKA 3M47A 4GWEA 3TAOA 4A3UA 1VS1A 2EHHA 3FJ6A 3BVJA 1LYXA 3IVUA 3UWWA 1W5MA 5D2YA 3NQMA 3LTSA 2PCQA 2ZRYA 5KINA 3EWZA 3O1NA 3W7HA 1U5JA 4HT3A 1X1ZA 3TFCA 4R7JA 3GAYA 3W7LA 3OVQA 1XBXA 2X1SA 4MY9A 3ZWTA 2ZDRA 1WXJA 1DBTA 3GZ3A 4JX6A 4J9JA 5G1TA 4IXXA 4CQ9A 4BK9A 4GUIA 4UTKA 3SY5A 1SO4A 3M6YA 4LVGA 1D3HA 4LC6A 3ZR4A 3I6RA 4ZQPA 5FF3A 4JGDA 3TE9A 4GUJA 3QW4B 4DF0A 2OT0A 1QPRA 3UZJA 4IMEA 1ZAJA 3P8JA 4O53A 4GXMA 5HWMA 1M6JA 4LUJA 1EP3A 3IVSA 1TTJA 4MJMA 3IVTA 1KM0A 4FNRA 1TSIA 1FQ0A 1LLZA 2YR1A 1XI3A 3BO9A 2V9DA 1G7VA 3PM6A 3W2MA 2V82A 3UYCA 1YDNA 4N2YA 3G8RA 1X1OA 3LBCA 1ZNNA 3QC3A 5CSSA 4JTKA 3RLUA 1OVDA 3NL2A 1FWWA 3L5LA 3NVTA 4Z1DA 3C56A 1L6YA 2B7OA 1OX5A 1EWEA 1OX4B 4IWWA 3GDKA 3S1UA 3FLUA 4DO5A 1KW1A 2QUUA 2GOUA 1W5PA 2Y70A 1K7XA 4N9CA 1OFRA 4JTJA 4JX5A 3GLCA 3NQAA 5CG7A 3W88A 1T8XA 4FNUA 1H60A 1AL7A 2FFCA 3W1XA 3PUDA 2BX7A 5G2HA 1O94A 3CIXA 3P80A 2BSLA 1IIHA 3NQ2A 2C0AA 3L9CA 4KWVA 3W1TA 4IJBA 2B7NA 1YXDA 3B8DA 5I3JA 4GNJA 3M16A 4PH6A 4N02A 2RDTA 1OX4A 5FEXA 2YGYA 2WNNA 2Z1BA 3L2IA 4LV4A 4AB4A 1SSDA 5AHFA 4BI6A 2FTPA 2VEKA 3S1VA 4N4QA 2C1HA 4LVBA 4NJIA 1TPUA 1ICPA 4HHPA 1XCFA 5BW6A 3PG9A 5AYYA 4R53A 3W2JA 3QMRA 3ANYA 2WSQA 3BG5A 1VQTA 1OF8A 4JIQA 3GDLA 3TH6A 1QO2A 4PCFA 5DY2A 3E49A 2H3DA 1FCQA 3LHVA 3W2UA 2ZTJA 4JXCA 3UY7A 2G96A 2NX9A 3BLFA 1P0NA 4JEQA 4ALDA 3Q37A 2V5LA 2Y88A 1PHWA 1G4SA 3SR7A 3P67A 3LCGA 2ZRVA 1UJPA 3TW6A 2HTMA 4G1KA 5CGQA 5C55A 3NL5A 4YMZA 4KFNA 3RFAA 4IQLA 4O11A 4AVFA 3M44A 1LOSA 1W3TA 1A5CA 1IXNA 1ZCOA 3L21A 1KM6A 3G1DA 1QO5A 4H3DA 1XDMA 2Z6JA 4Y90A 3O6YX 4IX2A 4IX0A 1BWKA 3INPA 5CPLA 4UTJA 3W9ZA 1K03A 3G1AA 1B4KA 1TYGA 2NXGA 1XDLA 4UTLA 3LHZA 1T0OA 3LHWA 4FXSA 4XUGA 1TCDA 4RV8A 1FWNA 4N9BA 4MKNA 5F4WA 2C14A 4XTDA 3QRHA 5AC7A 3G0UA 3C2OA 3I7SA 2DJXA 1KV8A 3RMJA 3C0JA 3MBFA 4JTSA 4HSNA 6ALDA 2B0MA 2VOMA 2E1DA 4FEZA 3NQ7A 3UWQA 1LRNA 1VYPX 1SU5A 2JGYA 3AJXA 1CI1A 3OBKA 1WBJA 2Y7FA 1JQVA 5AHEA 5LZLA 2NX3A 3EB2A 2YYUA 1NVMA 2CFFA 5HJLA 5HQEA 4LVAA 1VPXA 1ZJIA 3DHDA 4IPJA 1K8YA 3WK3A 4CQ8A 5LGXA 3BW3A 2KZHA 2WNZA 3C52A 3C8FA 1VC4A 1IGSA 3W73A 2CLKA 1GVFA 4O54A 4O13A 3BGJA 1LTDA 2FQIA 1P5BA 4AWTA 3S42A 3O6DA 3TU9A 5KITA 3RF9A 3TSMA 1FWTA 4YLWA 3TCEA 1YTDA 1GTHA 2E5CA 2V8ZA 1MO0A 2FJKA 4Z08A 1YPFA 3TXVA 3O07A 1Z44A 1ZY9A 5D09A 3W2NA 3GB6A 4ORIA 4AEOA 5KZEA 2GJNA 4RZ4A 4O4VA 3DU0A 3WK2A 5K4ZA 4Y6GA 3VNDA 5A8GA 3SJ3A 1GT8A 4UTTA 1WX0A 2AGKA 4ML9A 1UUMA 4JYFA 3PBWA 1OX6A 2V2CA 2QR6A 4ADUA 2R91A 1WOAA 2CLMA 3QJAA 3MO7A 5H2ZA 4AF0B 3PUOA 2PC4A 2JK2A 1FBAA 3OHIA 3M5XA 4PC8A 3I7RA 4UTWA 1FY6A 1JVNA 2JKAA 5H91A 5DCEA 2ZZ4A 1TREA 1A50A 4WD0A 3QM3A 3W1QA 3W7OA 3NYZA 1C8VA 3QYQA 3W7KA 4UTWC 5K4XA 1JRCA 4MZ8A 1QPNA 2B7PA 1XBVA 4O57A 1SZGA 3NQFA 3E0IA 1FDYA 3FKRA 3N9RA 4IMDA 3HB9A 4GC4A 4IUOA 4O15A 3W7DA 1ICQA 1W31A 4IPIA 1P1XA 4Q32A 3C4UA 4RJEA 1O5XA 2BTMA 3MJYA 4FNSA 3B04A 5AYXA 5FF0A 5IBXC 3W7MA 3QZEA 4NJKA 4O1BA 3B06A 5K9XA 1TRDA 2VFFA 3P62A 3P61A 4UFJA 3PULA 5EKYA 3CEUA 5D2VA 1VYSX 1B57A 2VKZG 2W0UA 3G0SA 1ADOA 3N73A 4NJGA 4TMBA 3KVKA 3W07A 3I68A 5CSRA 3LV6A 4LS0A 3LM7A 4DO6A 4O19A 5FEPA 5AB3A 5BRBA 1GVQA 1NAL1 4JDBA 3GKFA 3LI1A 1VR6A 3TQKA 3TC7A 2NX1A 4ZMGA 1GOXA 4GBUA 5I3FA 4JTFA 5EPDA 4IXHA 5AC6A 2Y7EA 3W85A 1QNVA 2X1UA 4JYEA 4O28A 1WV2A 3G8EA 1SZFA 3GAKA 3JS3A 4PODA 2LLEA 3L67A 4LNYA 1JULA 1LP6A 5F2IA 4UNLA 4UC5A 4AHOA 2QUVA 3MMTA 4DF1A 3DGRA 1TPB1 4L4MA 1JJKA 4HKPA 4YCOA 1F6PA 5LNWA 1EP1A 1OFQA 1C29A 2X1RA 3QEZA 2ABAA 1IXQA 4RLIA 1FUYA 2C19A 3W2LA 3TSDA 2P10A 1OG0A 3NL3A 4TU1A 1H62A 3NPUA 4WJEA 5I3KA 2NUYA 3DBPA 4K38A 1RQBA 3A24A 3QPYA 3STEA 5KMYA 1THFD 4D2JA 2QUTA 4HPXA 4JR5A 1KM2A 3KVLA 1SW3A 3W7PA 2NXIA 5HWNA 2WJZA 3BG9A 3TC6A 1H50A 3PBVA 4OHQA 1AW1A 1GG0A 5E0KA 3FEMA 3S0CA 4NNBA 5K7JA 2J9YA 2V0TA 1MZHA 3W22A 4OV4A 1I2OA 1R2RA 1X8FA 4N4PA 4K37A 2NXHA 4U4MA 4MVAA 4UR7A 4AHPA 1VZWA 1EIXA 5EYWA 4HNTA 3MP3A 3CLMA 2VEMA 4WOQA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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