3NQ6A

Crystal structure of the mutant p180a of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from methanobacterium thermoautotrophicum complexed with inhibitor 6-azaump
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
218
structure length
218
Chain Sequence
VMDVMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISAGVGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESIKDL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the mutant P180A of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from Methanobacterium thermoautotrophicum complexed with inhibitor 6-azaUMP
rcsb
molecule tags Lyase/lyase inhibitor
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
total genus 83
structure length 218
sequence length 218
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2010-06-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3nq6A00
4YLWA 4ALDA 2R8WA 3HG2A 4HPJA 3PUOA 2QKFA 4FNQA 3TMQA 3LLFA 1XC4A 4QIUA 2PRLA 5J5RA 3O06A 2G96A 5BNKA 1M7OA 3HPSA 3PVFA 1EWEA 4C1KA 1GTHA 3MBFA 1SZEA 1F6PA 1HO1A 5D02A 3WJYA 2ZTKA 2QDHA 3C3NA 4IOTA 3TAKA 5FI8A 5KTLA 1TRIA 3LCWA 3DZ1A 1DVJA 3E02A 1WOAA 4MYAA 3A24A 4M6PA 2G97A 1VYRA 2YZRA 5ABTA 5E93A 1PS9A 2I14A 3T4CA 3TQKA 1SPQA 5I3GA 3G1HA 1YXCA 2NXHA 4ZQPA 1VYSX 5I3HA 5C54A 1GZGA 2J9ZA 1IIHA 4WY0F 1KLYA 1LYXA 2JKPA 5BW6A 3W1XA 1CX9A 1H62A 1ALDA 1GVSA 3BGGA 1OX6A 4GBUA 3KVKA 4YWIA 5EL1A 1QO5A 4HNTA 1BEUA 1HUVA 3G0XA 1IXPA 1OX4B 3LTPA 4EOUA 3TC6A 2DJXA 1JR1A 4HNNA 4BK9A 3U6WA 8TIMA 3CB8A 3FKKA 3N73A 4J9JA 2B7OA 4JYDA 1XFBA 2FPVA 3P74A 2A7RA 2ZRZA 1PE1A 1A5AA 4FB7A 1KFLA 1XBXA 1R2RA 5G2WA 4LU0A 5L6UA 4AWUA 1DQWA 5DBUA 5LNSA 3LHYA 1SO3A 1A5CA 3W83A 1W0MA 1WDWA 3W1MA 3KRUA 1P0NA 5IM51 2ZZ3A 3ATYA 5U7SA 2E6YA 5AC6A 1TRDA 2ZA1A 3H55A 3FA5A 4JX4A 1WYIA 3SFKA 4UNKA 1VHNA 4LRTA 2NZLA 1A53A 3MO7A 5TIMA 4BWLA 3NPXA 2WNZA 3VCRA 1W3IA 4M19A 1I2PA 3W72A 5IBXA 5D2TA 2WPBA 5CG7A 5EKYA 1ADOA 1OF8A 3KXQA 2NWSA 1EUAA 2ZZ7A 4ORMA 3W84A 3I65A 3HGSA 1YXDA 2H8ZA 2B7NA 1OFOA 1G4EA 3Q37A 3UWVA 4CQ8A 4O54A 3W7QA 1F5ZA 1G4TA 2GQ8A 2RDTA 4Z1CA 4WXYA 3G24A 4DO5A 2FB3A 3DFSA 2DJLA 4AWTA 5F2IA 1YYAA 2NXGA 3TQ0A 1WBJA 5AHEA 1W37A 4QAIA 2VXNA 3UWWA 3FJLA 2ALDA 3P82A 3WK3A 2JGYA 3HMJG 2JK2A 4QNWA 4LS0A 1I45A 1YDNA 4FX8A 3S0CA 1YPFA 3NOEA 1TPEA 3GXTA 3QMTA 5G4WA 1X7FA 3GXNA 5LNVA 1H7RA 1NSJA 2GOUA 1EUNA 4W9TA 5FEPA 3VNDA 2A6LA 1EX5A 3LHTA 4S2BA 3W7OA 3TQVA 3NXFA 2GQAA 4KWVA 2TMDA 1K8YA 3B04A 1GYNA 1YPIA 4JTIA 1SR9A 3W23A 3HF3A 4PTNA 4O1DA 1VCVA 2CZ5A 1G4PA 1VZWA 4MKNA 3CIWA 2E68A 2YGYA 1G6CA 1G67A 4JY9A 1FXQA 1TPWA 4UIOA 5C2XA 3HB9A 3PAJA 1KTBA 1UCWA 2EGZA 2WO5A 3MI6A 3JR2A 2X2GA 1YTDA 1WA3A 5AYYA 2WSRA 1M6JA 1B9BA 3M44A 3TXVA 4DXVA 2Y63A 2J27A 1KTNA 1ZHAA 1L6WA 1EEPA 3WJXA 3FEMA 4O18A 3BW4A 3PULA 1TPUA 1W5QA 3KVJA 5EBUA 1J5TA 4FX7A 3TFXA 3TAOA 1PL9A 3GZ3A 1KBJA 4JGDA 3BLIA 5I3JA 3GB6A 3NPUA 4A22A 5D32A 3LRMA 3B0VC 1NAL1 1H1YA 4RZ6A 1WX0A 4K6AA 4O12A 1IXQA 3YPIA 1OG0A 1OK6A 2OT0A 1XCFA 2QCCA 3FS2A 4Z1DA 2YCEA 3G1AA 1KV8A 4JTEA 3I7SA 3P61A 1F6KA 2Y7DA 4X22A 1MXSA 1S5TA 4CQ9A 1GOXA 4UTMA 3KFTA 1TO3A 2NV2A 1H7PA 2AAMA 1LM1A 1TPC1 7TIMA 3LHZA 3NQCA 3RFAA 4HT3A 2CLKA 3UNDA 2Q3RA 3NAVA 3NG3A 2YX0A 4LOCA 3ZWSA 1HG3A 4U28A 1SSDA 1JCNA 4K38A 3W1RA 1DBTA 1BWKA 3GKFA 3Q94A 3N19B 1XBVA 4S1FA 5FF0A 3H53A 4K37A 4XKYA 3FYOA 1P5BA 3W2NA 1N55A 4MY1A 5DN1A 4H4IA 5F4XA 3GVGA 4I7VA 4M7SA 3ELFA 3CEPA 1TB3A 4GXMA 5KZDA 4IMEA 4O4VA 2QAPA 1W5PA 4JTFA 1W31A 4KFNA 1MO0A 3W1QA 3DI0A 3EWWA 5K9XA 1K8XA 3M0ZA 2EKCA 3HBLA 5HUOA 3KOFA 4YXGA 3NEVA 4FNTA 3KRZA 3W76A 5HWNA 2AGKA 4IWWA 3IGXA 4I9AA 1LOSA 3M43A 4O14A 4UFIA 4N4PA 1FUYA 2TSYA 1EP1A 4NQ1A 4O1AA 3IIPA 1FCQA 3PM6A 4WUIA 4RV8A 4D2JA 4O10A 5EMUA 1IGSA 1H63A 3S5NA 5HULA 3KAOA 1MEIA 1EPXA 2P0OA 4O0ZA 4TMBA 4MJZA 5HWMA 1Z41A 3NQGA 4IXHA 2RHGA 4XBSA 3SW6A 5D03A 3W6YA 1ZAIA 2R94A 3C2RA 4NNBA 2ZRXA 1TIMA 1XBZA 3LCIA 3QH2A 1IXOA 5DCBA 1H7WA 5LGZA 3GR7A 4K7YA 1SO4A 2C13A 1FWSA 3PC0A 2VENA 4UFJA 3DENA 4NJIA 5F4WA 3TDFA 4MOZA 3GIYA 4Q4KA 1I8JA 3T7VA 4ML9A 2EAWA 3A5FA 3A5VA 4EVZA 3PG9A 2XFWA 3DU0A 4O57A 2FLIA 4POCA 3MHGA 5AHMA 1FBAA 2ZTJA 3LCGA 1YLVA 4QISA 3VI2A 4A3UA 3G1FA 1DJNA 3EWYA 5CKSA 4PEKA 1P1XA 1AL7A 5FF2A 3DHFA 5G4EA 5GVJA 2I1OA 4UTJA 3MBDA 2A21A 2CFFA 3GLCA 2W0UA 1QCWA 3L5LA 2C18A 3PBWA 1O5XA 3EX6A 1ICSA 3PBYA 3C2FA 1JJKA 4MFDA 3M16A 2DZUA 2X30A 2VFHA 4E2DA 4AAJA 3VE7A 1YDVA 3W7NA 3RMJA 4UUIA 4LY8A 2V9DA 1TTQA 2C0AA 1R46A 4NJHA 3QRHA 5LSMA 2V5BA 3NQVA 3T40A 4JTGA 4NZFA 5HWJA 3DKJA 4NJKA 3M6YA 3WK2A 3MYPA 2Z6IA 3LV6A 1TCDA 2CLFA 4X9SA 3PBUA 3R2GA 2O7QA 4R7JA 3RU6A 2QR6A 1UASA 3W87A 1CW2A 1FDYA 3DFQA 2JKAA 1H7OA 1AW1A 2HMCA 5CZ0A 3GDRA 3P60A 3EKLA 4N4QA 4FNPA 1QO2A 4JDYA 2E5BA 3LDVA 3QC3A 4LTSA 3LV5A 2GUUA 5AB3A 1OX5A 3QYQA 1Q6LA 3CTLA 4AEOA 3EEGA 1GEQA 3O07A 3NL3A 3MI2A 4GUJA 1KM2A 4O13A 4UR8A 3W2MA 1LROA 2GVGA 3NQ7A 5DCEA 4LVBA 3P5YA 1JVNA 3ANYA 3DBPA 1KA9F 1GTEA 4N9CA 5CGQA 5DBTA 4DO4A 3AJXA 3BLEA 2HS8A 3G18A 4CLMA 3P62A 1M7PA 2CWNA 3TK7A 1JUKA 4OGZA 3TUUA 2A1YA 1KM6A 4Z08A 1OYBA 4MUZA 1SFJA 1ZAHA 1VC4A 2WOQA 4PODA 1KLZA 3LTSA 2KZHA 1QWGA 2NUXA 2W6RA 1F74A 2NLIA 1KM4A 1L6YA 1TPB1 3EWBX 3NYZA 2RFGA 1LDCA 1M5WA 5AOUA 1GQNA 5T26A 3L9CA 5I3IA 1OYAA 4EF8A 4GFSA 3W88A 5SWUA 2BLEA 5HUPA 3THAA 3HG4A 4E0CA 3OVPA 3QMSA 1DHPA 3G3DA 3W71A 3B8DA 4NNCA 1EA0A 3FIGA 5AHNA 1VYPX 1OFEA 5DCDA 3NR0A 4UR7A 3IVTA 3ABOA 1O5KA 3S5OA 3PY2A 1LOQA 1QPQA 3G0UA 3P8IA 4M6QA 3ABSA 4X3ZA 4UFHA 1DL3A 3Q58A 5CSSA 5G2IA 5CZTA 1B4KA 4CNNA 3EX4A 4R34A 3UYCA 3W73A 2DU2A 1QMLA 4FIQA 4BF9A 3S9YA 1ZY9A 2ZYFA 1I2RA 1HL2A 4O15A 1YXYA 3C8FA 3TSBA 4AF0B 2YFOA 4LT9A 3WK0A 3HPXA 1TPVA 4O19A 2TPSA 4DF1A 1LBLA 3OBKA 3TFCA 3V1PA 2ZQ0A 1QR7A 1NF7A 1YDOA 4TO8A 3TSMA 1U5JA 3BVJA 3EXSA 4K7VA 2JGQA 2P10A 2QUVA 4MIMA 3L0GA 1SW3A 4MY8A 2VEMA 2J24A 4UXDA 3QQ1A 3SJ3A 2V81A 4IGHA 3O16A 3OA3A 1H7NA 4JXCA 4Z0JA 4OQVA 3SI9A 1JCJA 2F84A 1FCUA 5FEXA 3LHUA 4ICNA 1BTMA 2E5CA 2GJNA 3W1PA 3N3MA 4RJEA 1OVDA 1ICPA 5KZEA 2WNQA 4IQLA 5C6MA 4FNRA 3ZS4A 3SSJA 3NQ6A 3PUEA 4QJ1A 3W7GA 5KITA 5D2WA 3OVQA 2C3ZA 2DZPA 5DLCA 5BMXA 2YYUA 5K4XA 1JUEA 1LLWA 2QCDB 2J6XA 4UTWA 4AWSA 1IF2A 3B4UA 1XDLA 4N9EA 1LTDA 4ONVA 5KSWA 1VR6A 2A7NA 3A21A 2UV8G 4GE8A 2HTMA 2ZRWA 6TIMA 3P5ZA 3C52A 3W9ZA 2OT1A 2B7QA 2OCZA 4NXSA 4RK8A 2E77A 5D33A 4C1LA 3IIOA 3NQ8A 4PH6A 2EHHA 4DQWA 3TU9A 4HHPA 4FF7A 3HOJA 4HNVA 1OFAA 3DGRA 5G1TA 1IXNA 1KV5A 4EF9A 5EA9A 3I68A 3UXAA 3GAYA 1DORA 3MJYA 1H50A 2V8ZA 4GUHA 5HMSA 3WJWA 3HGJA 4JR5A 3Q2DA 1KFKA 3D0CA 4IMCA 2V82A 2YYTA 3O8AA 4N9BA 4Y6GA 2IQTA 3W7RA 4IPJA 3BK0A 2ABAA 4UNLA 1KFEA 5CPNA 4O28A 4PC8A 1QAPA 3G22A 1VLWA 1K03A 2BZNA 3UZJA 3HG3A 2VKZG 1O60A 2CLIA 1VJIA 3CEUA 3R12A 2QDGA 3L0NA 3HJZA 3RF9A 3IGSA 3RLVA 3UY7A 4UTTC 5DXYA 2YDAA 5F2GA 1TJPA 1J4EA 3F03K 2GQ9A 3NGJA 2VELA 4MFEA 4DELA 2VC6A 3A22A 3W7LA 4E2BA 4JTTA 1OFPA 1QPOA 2B4GA 4PCFA 1JCYA 1MEHA 3MP5A 3MWAA 3STFA 1Z42A 3BW3A 2FPYA 3B06A 5AHFA 2FTPA 4TMCA 2VEPA 2CW6A 4O53A 4JTKA 4K8HA 1QPRA 4R33A 3S5YA 4KWWA 3TR2A 4P2VA 3C2VA 2X1SA 3LLDA 4HIBA 5D2VA 1QOPA 3MHFA 2CU0A 3P67A 2C1HA 2ISWA 1FDJA 3LTYA 2VFGA 3QPZA 3O15A 4EWND 3INPA 3OIXA 3STGA 4GC4A 3RNDA 1W3TA 1RQBA 3G1VA 1AG1O 4BR1A 1WAUA 4NU7A 3CM4A 2R91A 4LVGA 5DELA 5F1UA 3QEZA 3M41A 2I9EA 4RR4A 2BXVA 4GUIA 1CI1A 2Y85A 1EWDA 1TTJA 4O11A 2RKXA 2V2CA 4IMGA 4JX5A 5AYXA 4CNOA 4BI6A 1TQJA 3PR2A 3UXDA 3BLFA 1FCBA 1ZAJA 3M5ZA 1YADA 4M7TA 2RDWA 3E0IA 2QCHA 3W22A 2XN1A 3W1TA 4AB4A 2Z6JA 2QUTA 2ZDRA 4O8RA 4GRSA 2QJHA 1VPXA 3HGRA 1UUOA 2DORA 5G1YA 3W7CA 1WQ5A 3CIXA 1EIXA 2X1RA 5AHIA 1UJPA 1X6UA 1ME7A 5C55A 4UTIA 2H3BA 1RR2A 1H5YA 5FF4A 3EXTA 4TU1A 2QJIA 3S1UA 2Y88A 1GT8A 3BGJA 1OK4A 5I3KA 1DKWA 3S1XA 4UFMA 4UCGA 2FJKA 3NL2A 4JNMA 3B03A 4MZYA 3SGUA 4ZQCA 2Y89A 2F7FA 3M47A 2FB2A 3MMTA 3DFPA 3E9AA 2V2DA 4HSOA 4A21A 2NXIA 3HGOA 1KFBA 4LS2A 5FF3A 1DJQA 3UPBA 2C15A 2Y61A 4K8EA 2H6RA 2JBMA 1R2SA 3NM3A 2Y6ZA 2QCGA 3LI0A 1B57A 1VQTA 3BW2A 3W7EA 4S2CA 5HJLA 4LNYA 4O17A 4OBTA 4RXGA 3IIVA 1G7UA 1MSSA 2DP3A 2ISSA 4JD4A 1F7BA 3R5EA 3AO0A 4Z1AA 1B3OA 3DKLA 5E0KA 4QNEA 1F05A 3W74A 2Z1BA 3HG5A 4MYXA 4JTUA 4OHQA 3RK8A 4NX5A 3QW4B 1XL9A 2Y70A 1Q6QA 5EY5A 3GDMA 4ADUA 4GNJA 4GWEA 4YCPA 4TR9A 3LOTA 3IIZA 1VGAA 3DHDA 4UTUA 4LUIA 1OFQA 2GPTA 2JKEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4UTF A;  3QZA A;  4YLW A;  4ALD A;  2R8W A;  4X2P A;  5EBA A;  2QKF A;  2RGM A;  4QE1 A;  3LLF A;  2A3C A;  4QIU A;  2ZWY A;  2PRL A;  4RE2 A;  3L12 A;  4XAF A;  3EOL A;  1M7O A;  1F3T A;  3H2E A;  2QJJ A;  4XZH A;  2V68 A;  3MBF A;  1CGX A;  3T1G A;  2JFE X;  3TAK A;  2WM0 A;  2XVL A;  3LCW A;  1DVJ A;  1WOA A;  3WUE A;  3COT A;  4YU1 A;  3WQW A;  4IIH A;  1VYR A;  5ABT A;  5E93 A;  4QXI A;  1E1E A;  1VYS X;  5C54 A;  2J9Z A;  4RW5 A;  4WY0 F;  1KLY A;  4CEX C;  5I3D A;  1H62 A;  3QGK C;  4C6I A;  4ZO6 A;  3BGG A;  4B2D A;  1OX6 A;  5E09 A;  3KBN A;  5EL1 A;  3EPO A;  3R8H A;  4F8X A;  4J3W A;  3T2P A;  1TWS A;  8TIM A;  4KF1 A;  4AZG A;  4V1Y A;  4J9J A;  1HKK A;  1H1N A;  2QIW A;  4JYD A;  1E0X A;  3M0V A;  3VD4 A;  4I5X A;  4FB7 A;  1KFL A;  1XBX A;  4AWU A;  2WB5 A;  2GGE A;  3BL3 A;  3PWG A;  1W0M A;  2AQO A;  3W1M A;  5IM5 1;  5DEZ A;  3ZVH A;  1GQL A;  5AC6 A;  3BCF A;  2F9R A;  3ZIZ A;  2ZA1 A;  3E0V A;  3H55 A;  3BMW A;  1WYI A;  4I9J A;  4YIW A;  4LUT A;  1QI2 A;  4LRT A;  3UPM A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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