3NQ6A

Crystal structure of the mutant p180a of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from methanobacterium thermoautotrophicum complexed with inhibitor 6-azaump
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
218
structure length
218
Chain Sequence
VMDVMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISAGVGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESIKDL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the mutant P180A of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from Methanobacterium thermoautotrophicum complexed with inhibitor 6-azaUMP
rcsb
molecule tags Lyase/lyase inhibitor
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
total genus 83
structure length 218
sequence length 218
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2010-06-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3nq6A00
4N2YA 3FJLA 3WJSA 3DZ1A 1H7RA 3ZFHA 1H50A 3S6DA 4A21A 3A21A 1TTPA 2VFGA 5FEXA 5AHIA 3LCGA 4Z1CA 2ZBTA 5HR6A 2JGYA 2E5CA 2CZFA 1GVSA 2V2HA 5FF2A 3AJXA 2Z6IA 1XKYA 4U4MA 1KFBA 1XDLA 4WXZA 3C2EA 4UCGA 1N7KA 1H51A 1GWJA 2R91A 2ZZ3A 1I45A 4HPJA 4ICNA 1C29A 3O1NA 4HPXA 2ZQ0A 3B05A 4FNSA 4PTNA 2TPSA 3T44A 3SY5A 4UTKA 4NZJA 3P8JA 4TMCA 3PSVA 3W70A 3B06A 3IIVA 3FIGA 1W1ZA 1HO1A 4FXSA 4ZZ9A 3NQ7A 1KFKA 4N4QA 3GAYA 2ZTJA 3M5XA 2CWNA 3UXAA 4IXXA 1OX6A 1UJPA 4WZHA 1SFLA 3W1XA 5KZEA 1RR2A 1THFD 1FXPA 4RJEA 2ZRVA 3TX9A 1D3HA 1O4UA 3UPBA 3A5VA 3UWVA 3N2XA 3G1HA 1R2SA 2Y6ZA 1OF6A 4JX4A 3P67A 5DELA 3W7CA 4CCEA 1SSDA 3W2UA 5D2XA 2C6QA 2FTPA 1GYNA 1HFBA 1ZNNA 1H7OA 4DXVA 3ZWSA 1AL7A 3HF3A 4G1KA 1DVJA 3L5LA 1KV8A 1KM4A 4PEKA 1RQBA 1RD5A 4GNJA 1YYAA 4M7TA 4WY0A 5IBXC 1QO2A 2GOUA 1EUAA 4E38A 5KTLA 3TROA 1GG0A 3P82A 1K7EA 1PVNA 4DPQA 3HPZA 3W9ZA 1Q45A 4JICA 1ZAHA 3NM3A 3W7KA 3LB0A 3OVRA 2VFEA 2FDSA 3CHVA 4L4LA 1JUBA 1IXNA 1LLWA 4Z1AA 4NNAA 3S1WA 5G1TA 3WJWA 1KM0A 2YDAA 3PBUA 2OZ0A 3WK1A 1NEYA 1TYGA 1AG1O 4UFLA 2VEPA 1FWRA 1VZWA 4AWTA 1H7PA 1LTDA 4GFSA 3UZJA 3W2LA 3DFTA 4RV8A 1K8YA 1MEWA 2V30A 1G4EA 3DFPA 4JTSA 3HBLA 1W5PA 2ZCGA 3N19B 1PHWA 4TR9A 1QFEA 1OFDA 1ONRA 3TFXA 2QCEA 4MPQA 4JTLA 3DBPA 1FUYA 3OVPA 4OBTA 5TIMA 3UY7A 4LVDA 1YDNA 2QUVA 4MY9A 3PUOA 4UR7A 4M7SA 3LBCA 4PCFA 3EWUA 4KKXA 4X2RA 4M5PA 4UTTC 1K8ZA 1QWGA 3EWZA 3C4UA 1H61A 5C5YA 3F1QA 1IXQA 2P10A 3PG9A 3NEVA 4ONVA 1OVDA 5CPOA 2C15A 3DHDA 2XN0A 3UY8A 2RHGA 3KRSA 3KVKA 4O0KA 3M5ZA 1LM1A 2A5HA 2I14A 3Q2DA 3RU6A 2B7NA 4YCOA 1MEHA 4UC5A 3FA5A 3TV8A 1FX6A 1GZGA 2JKAA 1JCMP 4BI5A 2F7FA 2WNQA 4E2DA 3UWZA 1FCUA 5D38A 5EYWA 3GLCA 4MLRA 3S9YA 1KTBA 1T96A 3CT7A 2VC6A 2J88A 4CNNA 3KVMA 1GG1A 2DJLA 4IPJA 4XZ9A 4PA8A 3IV3A 1IIGA 4HKPA 3EKZA 3W72A 4NJHA 5D2TA 2WKJA 2B7PA 1HL2A 1XUZA 2CLLA 2VOMA 1G7VA 1W5QA 1TRDA 4RZ5A 5K4ZA 4FXRA 2GQAA 1BTMA 1S5TA 1ZJIA 3P80A 5ABTA 4UUIA 4XTDA 3U2OA 3G0UA 3QJAA 4NVTA 1X1ZA 5DCEA 3I68A 3LXCA 2H3DA 3TIMA 3L0NA 4QNEA 2GPTA 4NJGA 4XTIA 1LORA 1P4CA 1VQTA 4P2VA 3M41A 2E6FA 4Z08A 1OG0A 2V2DA 3B8DA 3HO8A 4UNKA 3UNDA 1ICSA 3C2OA 3S1XA 5D30A 3FEMA 2C16A 1W3IA 2X1TA 5D04C 1F2JA 1OFAA 1M7OA 5LGZA 2YFNA 4JIQA 4D2JA 2FB3A 5D05A 3W74A 2WPBA 5D02A 2OCZA 2OX1A 3BW4A 3VI2A 2QJGA 4WQ6A 1VJIA 2ISSA 2E68A 1OABA 5LKYA 4PODA 4IPIA 5F2MA 2W6RA 3W1PA 3OVQA 4UIOA 1A5AA 3CIXA 2G96A 3QQ1A 4GBUA 4GJ1A 4O52A 3H54A 3TQKA 1NF0A 1DQWA 3SECA 5G4WA 4AMAA 1TMHA 4DF2A 3MYOA 4QJ1A 3PULA 4MUZA 1J5TA 3OHIA 2VEIA 5D03A 3LGEA 2PRMA 4CNPA 4DQWA 3L66A 1VCVA 2KZHA 4JNMA 3NL5A 2Z6JA 2G5WA 4N9DA 4JDBA 4M6VA 1Z41A 1XBXA 3MBDA 3PVFA 3NG3A 3LCHA 4MJZA 1G6CA 3MI6A 3P5ZA 4NX0A 3L5AA 1XC4A 4BR1A 1EWEA 5CKSA 4JDYA 1YLVA 1OHLA 1W5MA 4UTWA 2GVJA 2NX9A 5F1VA 4H6KA 3R8RA 1K7FA 1QCWA 5AYYA 3LTPA 3EKLA 2DZUA 4N02A 3EX1A 4MKNA 3H55A 3TDFA 1H7XA 1DQXA 1G4PA 2WNNA 2ZZ2A 4FB7A 1Q6QA 1GYLA 4YWIA 5I3GA 2PRHA 3EXTA 3C61A 2NUWA 2OMAA 3DI0A 2DP3A 4AHQA 3LHYA 1LP6A 4QITA 1ADOA 3QC3A 1A5SA 3MBFA 5FF4A 5BOOA 3GR7A 2PE4A 2VFHA 1TTIA 3E49A 3UYCA 1WOBA 4BWLA 5DY3A 4M6QA 3ABQA 4MZYA 3FYPA 3STFA 1XM3A 4QIUA 3STGA 2QDHA 2DZXA 1Q3NA 2WSYA 4Y96A 4OGZA 3PR2A 3QZEA 2WNZA 3LLDA 3TQVA 4NZFA 3NQMA 1O5KA 4FEZA 2GVGA 1WAUA 3UWUA 1AW5A 3TSBA 3QRHA 4BK9A 4OE7A 4LT9A 4Y9AA 1W3TA 3HPSA 1RQHA 5CZTA 3TA6A 4JTJA 2GJLA 1YDVA 5KMYA 3M0ZA 3R5EA 4TO8A 3LV6A 5K9XA 3A23A 3ABRA 3MHUA 1XUUA 4Y6GA 1G69A 2FB2A 3NPXA 2BX7A 5BMWA 1KM3A 2E6DA 4HT3A 4EF9A 4CCCA 4GXMA 2QCDA 2Y85A 4N9BA 1FCVA 5TBOA 1CW2A 3V1PA 3LCFA 3TW7A 1WV2A 1JCXA 2QUTA 2QUUA 1M6JA 1DORA 5E0KA 3ABOA 3GKFA 2EGZA 3LOTA 1QO5A 4OQVA 1AW1A 4YMZA 4FNTA 2HTMA 3EX6A 4QSHA 3F03K 2CW6A 2AAMA 2BXVA 3PBVA 1NVMA 4DBEA 2WOQA 3RK8A 5EBUA 3P74A 4JYFA 2NWSA 4XKYA 4C1LA 3BO9A 3DFQA 1VYPX 4HSOA 5DN1A 2ZRYA 1ALDA 3TMQA 1WXJA 5C2XA 1AL8A 3GB6A 3TAKA 1FY6A 4UTJA 1QDSA 3W7MA 5FEWA 3UQNA 4ZQCA 5T26A 3BG9A 1ZAIA 3MUXA 3GXPA 3W7OA 1EP1A 5EKYA 3P8IA 1I2NA 3NQCA 1AK5A 1GEQA 2A2IA 1F73A 2ZDRA 1EUNA 1OX4B 2CU0A 5AC7A 3W7RA 3C6CA 2FLIA 3PC0A 4GUGA 2DZVA 2QCFA 4QNWA 3UWWA 4A29A 3CWNA 3QMTA 2QCMA 1L6WA 2Y63A 5EL1A 2ZRWA 5LHFA 3W1NA 2Y7GA 3GIYA 4JX6A 3BW2A 2Z1BA 3GNNA 3BG5A 4OWGA 1VCFA 1KM2A 1QR7A 1L9WA 3W88A 3W1TA 2FPVA 1NSJA 3TKFA 1JCNA 2NLIA 4Y90A 2DZPA 4J9JA 3B0VC 3NA8A 4IMEA 3F4NA 3BLEA 2QEZA 3N14A 4JTHA 1L6YA 4DO6A 4AHOA 1Z42A 2RDWA 2JK2A 2H8XA 1N55A 5HR7A 1EWDA 4TMBA 2C13A 5CZJA 2Y7FA 3WJZA 4DO5A 4FNPA 4LVAA 1BEUA 4LVGA 4RCXA 5HJLA 2J27A 1SFJA 3NQEA 1SPQA 4O1AA 5K9DA 2QJIA 3N34A 4GUHA 3W7EA 4NJJA 1VGAA 4FHAA 1H7WA 1SW7A 1UASA 5H2ZA 1TPVA 1YXYA 1D9EA 2WSQA 3DENA 4IMGA 1LLZA 1WYIA 3FOKA 4MYAA 4WUIA 1S3HA 4L4MA 4AH7A 5KINA 2C3ZA 4HSNA 2DU2A 3PS7A 5FEPA 1DV7A 1P1XA 3GDRA 4LUIA 4XWUA 4UTUA 2VFFA 2LLEA 3WFAA 1JR1A 5KZDA 2E1DA 2DZWA 3NL3A 5I3KA 4N9CA 3W7HA 1G4SA 5HUOA 3KVJA 3I7SA 2J9ZA 2O7SA 3MO7A 4UMBA 4O4WA 1QPOA 2A4AA 2H6RA 3B4UA 3DFNA 3CQ0A 4CLMA 3QYQA 3M5VA 3OA3A 3EB2A 1GOXA 2B0MA 3T40A 4QAIA 1J4EA 1QAPA 4UTWC 1WA3A 4UFKA 2P1FA 5G2WA 1SO5A 3G3MA 2NUXA 4LC6A 2Y88A 2XFWA 3ATZA 3M44A 3LERA 1BWLA 1X8FA 4CCDA 3TJXA 1BKSA 3HGJA 5AYXA 3QMRA 1EPXA 7TIMA 4BI7A 3N9RA 3NM1A 4WXYA 3M5YA 4C1KA 1Z44A 4FIQA 2OT1A 3BLIA 3W6YA 4O10A 1PL9A 4FX8A 1FBAA 4ZMGA 3S1VA 4FIRA 3LI0A 4O28A 4BWLC 4YL2A 1KFEA 2NX1A 3OG3A 3NL6A 2QCNA 3LBMA 3M7WA 1F5ZA 1G4TA 4JS3A 4LU0A 3VNDA 1JUKA 5AHNA 2EPHA 4R53A 1W5NA 2J24A 3A5FA 3W7DA 1UBSA 2TRSA 2EF9A 2VXNA 1XBZA 3I65A 3NL2A 3CLMA 3C3NA 4DELA 3CTLA 1TV8A 1GTEA 3SSJA 3W22A 5AHEA 1RZMA 3S42A 3Q58A 1KFCA 4O16A 2CZDA 3P5YA 4R33A 4TX9A 3L5MA 3QMSA 5D09A 1I2RA 3OBKA 2CLMA 3PM6A 1GVOA 3O06A 3WJXA 2ALDA 1OF8A 4O1DA 1YADA 3WJYA 2NX3A 3C56A 3E02A 1FWNA 4H4IA 2QKFA 3HG4A 4ZQMA 3TXZA 5LNWA 4UTHA 3A24A 1XBYA 4NXSA 2Y61A 3QPZA 1NFBA 1DHPA 5EA9A 2RDUA 4MY1A 2NXIA 2VEMA 3M43A 4Y8FA 3CU2A 3LRKA 3W2MA 3NGJA 4AWSA 2VENA 1ZALA 1FCBA 3LHUA 1SQ7A 5D2VA 2W79A 4PL1A 2X1RA 3O6YX 2ZZ6A 3BW3A 4RR4A 3W84A 3W1MA 1YDOA 3KRUA 5C54A 4UFHA 3W7LA 1QPQA 4EOUA 1W3NA 4PFMA 1FDZA 4O57A 5KITA 2E5DA 2Q8LA 3BG3A 4ADTA 5I3JA 5LGXA 1PCWA 2A21A 4HNTA 3GR8A 3CIWA 1FXQA 5BRBA 4XBSA 5IM51 4AHPA 3O6CA 1FWWA 4FNRA 2V9DA 3W83A 1B9BA 2WSRA 1TV7A 3B04A 1F7BA 2CLFA 3UXDA 2J6XA 3GDLA 2Y89A 5DXXA 1LROA 4ZQRA 2ZRXA 4AF0B 3S8HA 4RZ4A 2CLEA 4NX5A 1DL3A 1VCGA 3DFSA 2B7OA 4NT0A 3DKLA 2YW4A 1TPUA 3N2MA 1TIMA 4IMDA 3T78A 3R12A 4GWEA 1V7YA 1T8XA 4Z0JA 1M7PA 4PH6A 4UMAA 3W7IA 2QCHA 3KRZA 5H91A 2X30A 5K4XA 3MP3A 3TSDA 2VEKA 3O07A 4ML9A 5F2IA 5DBTA 1GVQA 1K03A 1SW0A 2C0AA 1K7XA 5J5RA 3C8FA 4ADSA 5U4NA 3LI1A 2B4GA 4BFAA 4MY8A 2EHHA 2NUYA 5SWUA 5G2HA 1NF7A 3MP4A 4AVFA 4FX6M 4QISA 4TIMA 3LRMA 3GAKA 1T99A 4IUOA 1PV8A 4ZL1A 3BV4A 4JYDA 3QFEA 1Y0EA 2E5BA 3NVTA 2GJNA 2A6NA 2NWRA 2V81A 3DXIA 3L68A 5CSSA 1VR6A 3NQ2A 4MLJA 1A5CA 1FDJA 4UFJA 4X22A 1W54A 4RLIA 1WQ5A 1F6KA 3TSMA 3UD6A 3CEPA 3WK2A 3W73A 2YX0A 4O53A 1TV5A 3LDVA 1O5XA 3LTSA 3W07A 1DJNA 1A5BA 3CB8A 5HMSA 1U5JA 3PBWA 5G2IA 4JD4A 3PG8A 1A53A 4R7JA 4IOTA 3U8GA 1DKWA 4LRTA 3KOFA 4MOZA 4EWND 1LDCA 4A2RA 4JEQA 1QNVA 2FQIA 4JTKA 1B57A 2Q3OA 1JCLA 3NQAA 2PRLA 3S5NA 4Q33A 1TPH1 3MYPA 2WQPA 3QSRA 2QCGA 5I3FA 1S5VA 5HUPA 4RKAA 5K3VA 3S1UA 1ME8A 4KFPA 1SO4A 1ZCOA 3SGUA 2R8WA 3S5YA 1XXXA 1J2WA 1SU5A 3MMTA 3L9CA 2YXGA 3LCIA 4MYXA 3TK7A 4O14A 1IXPA 1F6PA 4EVZA 4UTIA 1ZY9A 1TJRA 3LHVA 1O60A 4K36A 4LC8A 5LNUA 1KW1A 1Z48A 1DBTA 4PC8A 4MZ1A 3VFLA 4Z1BA 1JJKA 3CPRA 5CZ0A 4GUIA 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 4XQ6 A;  3T4C A;  1PE1 A;  2FPY A;  1SZE A;  5FF7 A;  4UTT A;  1KTN A;  5FES A;  3GVG A;  3VCR A;  2QAP A;  2GQ9 A;  1WOA A;  3I6R A;  1T0O A;  3TUU A;  4NJK A;  4S2B A;  5C6M A;  2WV8 A;  3ZWT A;  1VC4 A;  1EP3 A;  4EF8 A;  1IF2 A;  1SZG A;  1YXC A;  2H90 A;  4AB4 A;  1LRQ A;  1E51 A;  4FO4 A;  3QW3 A;  1SUX A;  3IEB A;  1P0K A;  3W3O A;  1KLZ A;  3Q37 A;  2IQT A;  3MP5 A;  2ZA1 A;  4MZ8 A;  4HIB A;  2ZZ4 A;  2OT0 A;  4H3D A;  1EIX A;  1H60 A;  3AO0 A;  2TYS A;  1XFB A;  3JR2 A;  4O19 A;  5I3I A;  2ZRU A;  1GTH A;  2ATS A;  2QCD B;  1EB3 A;  4ORI A;  1TPW A;  2A85 A;  4YXG A;  5DY2 A;  5LNR A;  2F84 A;  1S5W A;  3NQD A;  4IX0 A;  2CFF A;  3DKJ A;  5CGQ A;  3B03 A;  3PB2 A;  4UXD A;  1Q6L A;  3DFO A;  4XBK A;  3W7G A;  2FIQ A;  4Z1D A;  2R14 A;  3G1D A;  1MEI A;  4NQ1 A;  1VYS X;  4XKY B;  1BWK A;  3G1F A;  2ABA A;  2V5B A;  3O15 A;  3GXN A;  4IJB A;  3LTY A;  3IGU A;  2NZL A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1Y8B A;  1EC8 A;  1H7R A;  1H50 A;  1NFP A;  2VFG A;  5FEX A;  1VFU A;  2JGY A;  5DEZ A;  3WKZ A;  2GVY A;  3E5B A;  5FF2 A;  2CLP A;  4ZFC A;  2G8Z A;  2D3L A;  1V03 A;  1XKY A;  4WXZ A;  5LA1 A;  3R11 A;  4NL1 A;  2ZZ3 A;  3GTH A;  3KL0 A;  2X41 A;  4HPJ A;  1LQ2 A;  4AZC B;  1UD2 A;  4GVG A;  4UQC A;  3SCR A;  1YMY A;  3PTK A;  3B05 A;  4QLJ A;  2G4F A;  3BOF A;  4D1J A;  3T44 A;  3P8J A;  3IWP A;  4XSM A;  4QE5 A;  4TMC A;  2YL9 A;  4B5T A;  1W1Z A;  4LBS A;  4ZZ9 A;  3NQ7 A;  1KFK A;  3R4I A;  2P8B A;  4ILS A;  3SRK A;  3M5X A;  3E2S A;  4IXX A;  2YXO A;  1QXL A;  1UJP A;  1POK A;  4LUS A;  2OZ3 A;  1XYZ A;  4O1F A;  4GIN A;  1THF D;  1XHG A;  2ZRV A;  4IID A;  1AJ0 A;  4CN4 A;  1OY0 A;  4GKT A;  3MUY 1;  4OTK A;  2Y6Z A;  4H7V A;  1E56 A;  3P67 A;  4CCE A;  2V6A A;  4IGM A;  4AZ7 A;  1GOI A;  2FTP A;  1GYN A;  1X6L A;  3AYV A;  3RM4 A;  2YCL A;  1ITU A;  3K1G A;  3ZWS A;  3FHA A;  4G1K A;  3SDO A;  3CH9 A;  1KV8 A;  3CYJ A;  1KM4 A;  1SZR A;  1YYA A;  1YHT A;  4K3Z A;  2DSU A;  4M7T A; 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 1JCM P;  4BI5 A;  2F7F A;  1XYB A;  3UWZ A;  4QLL A;  3VNJ A;  1BYA A;  3BAI A;  4WKH A;  2AMG A;  1I1X A;  2VC6 A;  3GG0 A;  1UPM B;  3VDH A;  3F4D A;  4PA8 A;  3RRA A;  2Z00 A;  1OGB A;  1EDT A;  4NJH A;  5D2T A;  3APT A;  1W3H A;  3VC6 A;  1HL2 A;  1XUZ A;  4WSH A;  2WAN A;  3ART A;  1E71 M;  5I2U A;  3PAO A;  4F4R A;  1E0W A;  3P80 A;  5ABT A;  2FZ8 A;  4IJC A;  1BG4 A;  3NZP A;  3G0U A;  2E9M A;  4PMY A;  4W4Q A;  3GTF A;  5M17 A;  5DCE A;  3LXC A;  3TIM A;  4IH3 A;  1PO9 A;  4NJG A;  2Y1H A;  1CT5 A;  4P2V A;  2V2D A;  2XIJ A;  1M7X A;  3HO8 A;  4XAG A;  1V0L A;  4UNK A;  5A8N A;  2DY3 A;  4JQ4 A;  5JMU A;  1E9I A;  1ICS A;  3C2O A;  5D30 A;  4R9X A;  1PWM A;  1FWD C;  3ARX A;  4C6J A;  3WFL A;  5D04 C;  4YS1 A;  7CGT A;  1OFA A;  1M7O A;  2YFN A;  1Y7V A;  4D2J A;  4D6J A;  5A6J A;  2DIJ A;  1W8G A;  4FR1 A;  2FH6 A;  1VBG A;  3PZG A;  1H5V A;  3BW4 A;  5FJI A;  2CXE A;  2ACS A;  3I3E A;  3MAN A;  4CEX C;  3OZP A;  3PP7 A;  1KCL A;  4JNY A;  4IPI A;  5F2M A;  2HK0 A;  3NWR A;  3W1P A; 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