3NSM | Genus

Total Genus 185

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	185
sequence length	572
structure length	572
Chain Sequence	EDVVWRWSCDNGKCVKLKNDPRSSEPALSLEACKMFCNEYGLLWPRPTGEADLGNFLSKINLNSIEVKILKKGATDDLMEAAAKRFKEQVSLAIPRGSTPKLTGKAVDVYLVNENPNEKAFSLEMDESYGLRVSPSGADRVNATITANSFFGMRHGLETLSQLFVFDDIRDHLLMVRDVNISDKPVYPYRGILLDTARNYYSIESIKRTIEAMAAVKLNTFHWHITDSQSFPFVTTKRPNLYKFGALSPQKVYTKAAIREVVRFGLERGVRVLPEFDAPAHVGEGWQDTDLTVCFKAEPWKSYCVEPPCGQLNPTKDELYQYLEDIYSDMAEVFDTTDIFHMGGDEVSEACWNSSDSIQNFMMQNRWDLDKESFLKLWNYFQQKAQDKAYKAFGKKLPLILWTSTLTNYKHIDDYLNKDDYIIQVWTTGVDPQIKGLLEKGYRLIMSNYDALYFDCGYGAWVGAGNNWCSPYIGWQKVYDNSPAVIALEHRDQVLGGEAALWSEQSDTSTLDGRLWPRAAALAERLWAEPATSWQDAEYRMLHIRERLVRMGIQAESLQPEWCYQNEGYCYS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Hydrolase
source organism	Ostrinia furnacalis
publication title	Structural Determinants of an Insect {beta}-N-Acetyl-D-hexosaminidase Specialized as a Chitinolytic Enzyme pubmed doi rcsb
molecule keywords	N-acetylglucosaminidase
total genus	185
structure length	572
sequence length	572
ec nomenclature	ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date	2010-07-02

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00728	Glyco_hydro_20	Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A	PF14845	Glycohydro_20b2	beta-acetyl hexosaminidase like

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	3nsmA02
3.30.379.10	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Chitobiase; domain 2	Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like	3nsmA01

2ZXDA 1J0HA 1HNYA 2Y4SA 1EXPA 2VTFA 2DEPA 2CBJA 5BXSA 1UR2A 4KRTA 2CIPA 4H41A 3POCA 1M01A 2XWEA 3VO0A 1PJ9A 2QMJA 1CXLA 1UQYA 5BROA 2D22A 4CU8A 2WWDA 3M6DA 4HA4A 3T0AA 1BHGA 3AMKA 1BGGA 2ZX5A 4D6DA 2D0FA 3GYCA 4CD6A 3ZOAA 1UKSA 2CHOA 2BXYA 1OCQA 4OIFA 1EQPA 1H11A 1A47A 1J0IA 3W24A 4KRUA 3APGA 5EFFA 5A8OA 1GHRA 1MFVA 1J11A 3K46A 1ZBVA 4W5UA 4B9ZA 5A69A 4F8XA 1HVXA 3LPGA 3PZNA 3SCTA 1Q6EA 1DWFM 3MUY1 1EA9C 1EGZA 1AQ0A 2PWEA 1X6LA 3K8KA 4F9DA 5JIPA 2IXVA 1FP9A 2ZWYA 1M04A 3OGRA 3OG2A 1EDQA 4TXEA 1WAWA 3ARRA 4QLLA 4ATDA 2VT0A 5LA1A 1XSJA 4H8HA 1B3ZA 4LYQA 3SCSA 1G9HA 4V2XA 1GHSA 2XIBA 2XTKA 2ZE0A 4W84A 2ZIDA 4S3JA 4XZBA 3SCUA 5C71A 2Q8XA 5I78A 3B9EA 2OWCA 4PMNA 1QNQA 1PX8A 3WQ8A 2EPNA 4Z2GA 2FGZA 3QGVA 1MVYA 3OIHA 5CSYA 1NOFA 3GDBA 3VU2A 1GQJA 2XVLA 3ARQA 1MXGA 2E9MA 1BFNA 1JL8A 3BLPX 1XH0A 2CITA 3DYPA 3A4WA 2CKSA 1J18A 4PUDA 1DWJM 2XIIA 4EAMA 2EPMX 5TD4A 1D2KA 1V6XA 2WZIA 2O9RA 2WC3A 3KL0A 3CHDA 1UWIA 1MWOA 1XCXA 2CERA 2YL6A 2PWFA 5A2CA 1UD6A 1XYZA 3SEPA 4IM4A 2EJ1A 3HMCA 3WUEA 1XH1A 4BQ4A 2J7GA 5FOOA 5I23A 1EDTA 2VJXA 4HMEA 1EH9A 3WMCA 2BHZA 4M56A 3GH4A 1MYRA 5EFDA 3ZT5A 4XX6A 5E6ZA 2ZUVA 3GTNA 1XD1A 4XZWA 3OLEA 2DT3A 2XJ7A 4MAVA 2D3LA 4IPLA 3RCNA 5AY7A 4JCLA 4JKMA 1OIMA 2OWXA 1UWUA 4LYRA 1OD8A 4PTXA 3VM5A 3WDJA 2VR4A 4MB1A 2AMGA 4AD4A 2GDUA 1OGBA 3EBVA 4DWSB 2W62A 3F5LA 2XM2A 1WP6A 2X0HA 3AOFA 5I6SA 4UFHA 1FOBA 2G3IA 2CHNA 3NDYA 2A3EA 3AI0A 3VIJA 7CGTA 2XPKA 4CVUA 4GIAA 1WPCA 3EMZA 1V6YA 1CNVA 2V38A 2W5FA 2G8ZA 4XB3A 1QPKA 2GJPA 5HPOA 3S2CA 2ZXBA 1PZ2A 3WF2A 2DPEA 1NWTA 2XYLA 4HU0A 1VJZA 5HDRA 3AQUA 1LQ0A 1LG2A 4AISA 5DT5A 4ATLA 3WL0A 4ACZA 3KWXA 1JZ6A 3ARUA 1UR9A 2DIEA 3A4XA 3ARVA 1V03A 2O9TA 2A3CA 3AHVA 3WH6A 5CQ1A 4H8VA 1QBAA 4GZEA 4GO9A 4UNIA 1JZ5A 4HMCA 3N15A 1W3JA 3T2QA 2BVYA 1B3XA 4NF7A 4C7GA 4GZIA 3WMSA 2CXGA 2WK2A 4JFWA 1X1NA 3QOKA 1B30A 4PCTA 2GJRA 3W28A 2WKLA 5A1AA 1IT0A 1PEZA 3WF4A 2WBGA 5GPRA 1E6NA 4C7DA 1HJXA 1DWIM 2O9PA 1UWQA 7A3HA 1UZ1A 2WHKA 2YOCA 4WSKA 2WMIA 3W6MA 1H49A 4U3CA 1W9BM 3IAPA 3A47A 1YQ2A 2VQTA 1ESWA 3UESA 1JYWA 4PEEA 2J62A 2VRKA 1P6WA 1H0GA 4LYPA 3WBAA 5D9OA 2WLYA 3MU7A 3U7BA 2FH6A 3NSXA 4H2CA 4JFUA 1AQMA 1XGZA 3CLWA 2XHYA 2XVGA 1VFOA 1B0IA 4BQ5A 1JYNA 3ECQA 3VILA 1V0MA 1J01A 1C8XA 5KZ6A 1QI3A 2XFFA 3N17A 4FK9A 5HNNA 1HKIA 1RD6A 4NZCA 1UYQA 1MFUA 2ESCA 4U3AA 3N11A 2DDXA 4YPJA 3W27A 4HPGA 3WD2A 1TE1A 3CHFA 5A8MA 4Y7EA 4P8VA 3ZJ7A 1B3VA 1KGXA 1W91A 1NWSA 3KL5A 2CEQA 4M24A 4D71A 3UR7A 3WNMA 1RP9A 3ZR5A 3UEQA 4E2OA 2UY2A 4WK9A 1JFHA 3BMWA 3VIFA 2TAAA 3DECA 1JZ2A 3N18A 2WVTA 1HN1A 3NYDA 2NSXA 3FAXA 3VDHA 4CN6A 3G6LA 3TOPA 2XWDA 2YBUA 1G0CA 1CGTA 1W9UA 1OD0A 1EDGA 4J28A 2X1IA 3VIGA 1R86A 1JI1A 3THCA 3VIKA 5I0DA 4AZ7A 2PWHA 4EK7A 4HOZA 3VPLA 1Q6FA 2C0HA 3BXWA 5FCZA 2GSJA 2V3EA 2WCSA 1KWGA 2OLHA 3AISA 3FXYA 4GI9A 2A3BA 5ABHA 3AMGA 4GPNA 1CEOA 5C70A 4UQAA 3AHXA 1HKMA 2DGAA 1UHVA 2X0YA 4GQQA 1UR8A 5AC4A 1UOKA 3J7HA 2C8NA 3B9DA 1IV8A 3RM9A 3O9NA 2NT1A 1GOQA 4JKKA 4X0NA 1E0WA 1WDSA 1JD9A 3SCNA 3RILA 1E1FA 1ITCA 1KXTA 2JF6A 3QR3A 4M82A 4E8CA 1E71M 2BNJA 3OGVA 1FH8A 3W26A 3M7SA 5HBFA 4M8UA 1AQHA 4MB4A 4AC1X 1FA2A 1SMAA 3GH5A 4KGJA 1G94A 1GVYA 3GM8A 1CLVA 2G3JA 5EBAA 4LPCA 1CGUA 1JGIA 3WD1A 1JDDA 1MW3A 4BA0A 3DHUA 3TTQA 3ARZA 1C91A 1R8LA 2QF8A 4MNMA 2J74A 4DM2A 3AMCA 1LJYA 3T08A 1SR0A 1HL9A 1L0PA 1WZKA 3GNOA 3VD3A 4XV0A 1MQQA 3M46A 2DSWA 1GJUA 3A6OA 3OZOA 1C7SA 2YIHA 1JD7A 5DO8A 1CGYA 2X09A 4J3XA 4CUCA 1MQRA 1EQCA 3ZJKA 3PTQA 4AW7A 2WB5A 4J3SA 2PBOA 2VVSA 5LYRA 3FAWA 2V5DA 3VX1A 2ZX8A 1E6RA 4AYSA 3W0KA 1V02E 1UG6A 4WIWA 3VGGA 2BVTA 1S46A 3VM7A 3VIOA 4KMQA 1E9LA 1TUXA 3PZOA 1W9XA 4CU6A 4UFIA 4W8AA 3WD0A 3F5JA 3BLKA 4YHGA 1M53A 2WMFA 2XVKA 4B15A 1Q4NX 3ALGA 4P7NA 2EEXA 4OBRA 1R7AA 1X6NA 4UFMA 1ODZA 4JIEA 2Z1KA 4UCFA 1CENA 3GNRA 4E4PA 3ARWA 3VGEA 1Q6DA 1WB0A 2RGMA 4HU8A 2Y2WA 1IZJA 2FDMA 2G3NA 1SYTA 1VBUA 3SUVA 4NSBA 2BFGA 3OB8A 3W37A 1HJVA 1B2YA 5A6KA 2XSBA 3WL1A 1DWGM 3K4AA 4PN2A 2VCBA 1UUQA 1E5JA 1FH9A 3AIEA 3F5KA 5BXTA 1H0IA 1VEMA 1NP2A 4AZBA 2G41A 4P8WA 1D7FA 5A6AA 1VFFA 4CCCA 3RO8A 3OA5A 1FFRA 4PSPA 3T0DA 4AXNA 4UR9A 3BSGA 4PUEA 2BY3A 4PMYA 3D3AA 2VZVA 3MANA 1K9FA 1C92A 3N12A 2VO5A 1UH2A 3NCOA 3BSHA 3T0BA 3CZGA 1TZ7A 3PZTA 2YKKA 1JAEA 2VZTA 1CIUA 1ISZA 4MDPA 1AVAA 3NDZA 5D9MA 1VJSA 1WDQA 5HPCA 4PMOA 8CGTA 2VI0A 2ZXAA 1W9PA 2BY0A 3W25A 1KGUA 1MW0A 1U33A 3WSUA 2OYKA 4DWSA 4PTMA 3AIBA 4LXFA 1BYCA 4AZCA 1QNPA 3G6MA 4TVUA 3PTKA 2DH2A 1C7TA 2ZOXA 3L4YA 3VUPA 3UERA 3UETA 1H1NA 3CO4A 1PIFA 2D3NA 1JIBA 1R7OA 1PX4A 1KQYA 4W5ZA 3ALFA 1NM9A 3WQ6A 4AWEA 4P7LA 1NQ6A 4QLKA 3OZPA 5ABFB 1LG1A 4PTVA 1UH4A 1CXKA 4UZUA 1JYVA 3AIUA 2EPOA 4TUFA 1DP0A 4W8LA 3U7VA 4C91A 2CBVA 2W63A 5A6LA 1E0VA 2BVDA 4W87A 2E9BA 1OIFA 3F4VA 1O7AA 4D6GA 1KB3A 3VNYA 4YHEA 5BCAA 5FD0A 4UQCA 4NRSA 3AJ7A 3KE0A 5IXEA 4V28A 2WMGA 1ZB5A 2D2OA 1UWTA 2VL4A 1WKYA 4HA1A 4EE9A 1CLXA 1J0YA 5LA2A 4MB5A 3ZR6A 1GPFA 4D1IA 5DEZA 2OYLA 4CD7A 1H09A 4WKHA 3S6TA 1VBRA 5A6BA 3U5YA 2Y8KA 4D6JA 5DFAA 1QI2A 3A4AA 3WDHA 2QMKA 2EPLX 4GQRA 5DMYA 3MSDA 1NWUA 3RDKA 5D9NA 4TVCA 3ARXA 3WDRA 3GBDA 1HT6A 4KH2A 1KFWA 1CDGA 2C7FA 2EQDA 1E15A 1EOMA 1C8QA 1UKTA 3K4DA 5DT7A 1GJWA 1W3KA 1L8NA 4MPKA 4D6CA 4EANA 5A6SA 1TA3A 5CPQA 3ZMRA 4D6FA 3SURA 4UZSA 4OBSA 4PMUA 3ZJ8A 3MKKA 1JDCA 3MUIA 1V3HA 2XFYA 2VR5A 2Y8VA 2ZX6A 2CCRA 3VD9A 4B3LA 2DT2A 3ARPA 2J8GA 1W32A 2NW0A 1TG7A 5I79A 1GNXA 5M5DA 1GVIA 1WZMA 3BCDA 1HX0A 4UQ9A 2J75A 2PWDA 1W3HA 1QI5A 1K9EA 4HOXA 3TTSA 2RGLA 3E1F1 2ZUMA 1GORA 4D6HA 2XSAA 2YDSA 4PYSA 2WXDM 1W2PA 1H2JA 3BAKA 1V08A 1OWQA 4W85A 1FH7A 4S3KA 2G4FA 2JIEA 1HIZA 1QOXA 4QDMA 3GXIA 4AMCA 4DUXA 1PIGA 1HXJA 1HJWA 5IDIA 1WO2A 1LLOA 4CCDA 3PZGA 1V3IA 4AD2A 4ZE5A 5ABEA 1E6PA 3VGHA 6A3HA 1EO5A 1HF6A 1JDAA 3I3BA 1V02A 3BAJA 3KEHA 3WH8A 4L4PA 2FH8A 5A94A 5BRPA 1ISWA 3AS2A 1GOOA 3L4XA 1QI4A 2JF7A 1BLIA 2VCAA 2BY1A 2PWGA 3EDEA 2ZUSA 2PBGA 1JI2A 2EO7A 5CLTA 5IHRA 4D6IA 2X8RA 2J7EA 1H4PA 3AICA 1TVPA 1E0XA 2F61A 4P8XA 5CG0A 2GUYA 3WH5A 2PI6A 4JAWA 1BSIA 4J27A 2W61A 1CXHA 1H5VA 3M07A 2OSYA 2QHAA 5D8ZA 1F4AA 3W29A 4AD1A 1VAHA 3W4RA 2XGIA 2YL5A 3JUGA 4QCEA 3VKKA 4PTWA 3OLDA 2WVVA 1W2VA 2YA1A 9CGTA 4A4AA 4AZHA 3W53A 2W92A 2UY5A 1W1YA 4K68A 4BS0A 3EDFA 4NI3A 3A3HA 2J78A 4CN1A 2A3AA 3ZO9A 4BZYA 1NOUA 2WVUA 4J3WA 4ATWA 1E70M 3IAQA 2FGLA 4MADA 3SUTA 4HA3A 1XH2A 5BWFA 1UR4A 2VRJA 1HKKA 1E6QM 4CGTA 1R87A 4KWUA 3WNOA 5CPSA 4AY1A 3AHZA 3CUIA 4D6EA 3MMWA 1BPLB 1MXDA 1TVNA 3WBEA 5A8QA 1WZAA 2D20A 1VFMA 4CD5A 4FLRA 4QCFA 4CVWA 4Z2JA 1KR0A 2VUYA 2BV9A 3RIKA 4U2YA 1UR1A 5I24A 4MNJA 3PZ9A 3AZTA 5A6MA 3FN9A 4D72A 1PPIA 1V6VA 3CUFA 4GI6A 4MJ4A 2GJXB 1GOIA 1Q6CA 5LA0A 4JFTA 4PMZA 3W81A 2DSUA 1E73M 5E70A 4ACYA 2E8YA 3ZM8A 3AYSA 4J3VA 1ECEA 2ZUUA 1C8YA 4N0RA 2ZICA 2B31A 5A6JA 3RMEA 2YJQA 1VEOA 4CKQA 3GBEA 4W8BA 3WUBA 1F4HA 2CKRA 5A95A 4HMDA 2WANA 4AIUA 1NARA 4ZEPA 1V3MA 5DF0A 2WAGA 3MUZ1 1UQZA 1XCWA 3SIMA 2YA0A 3L4ZA 4H7VA 3U57A 1WDRA 1QHOA 3MO4A 3WQ5A 3ARTA 1US2A 1KWKA 2IXUA 4AD3A 8A3HA 3TP4A 3BAYA 1H41A 1E4IA 2J7BA 1XSKA 2F2HA 3POHA 4D1JA 4OOUA 3AS3A 3EDDA 5KEZA 1GUVA 1H3GA 4W7UA 4P7OA 4AZ5A 2WVSA 2MANA 2V3GA 4PMXA 3SCPA 2WYSA 1GONA 2YL9A 4W88A 2CESA 2Y5EA 3CHEA 3DYMA 4U2ZA 4DM1A 1J0ZA 5ABFA 3WELA 3GH7A 1V3JA 1TFVA 2E8ZA 4U5KA 2E9LA 3CZKA 3VGBA 1EIBA 2QPUA 3W38A 2J77A 3UG4A 4CD8A 1NP0A 4IPNB 1B3WA 3VDCA 1SFSA 2DQXA 3LPFA 1PX3A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 5FKY A;  2CET A;  1DTU A;  1YHT A;  4E8D A;  1W1P A;  1E6X M;  2WWC A;  1HJQ A;  1E72 M;  3OBA A;  1UKO A;  4FLO A;  4TX6 A;  3OLI A;  3DYO A;  1RP8 A;  3PZV A;  4GXP A;  1E6S M;  1QHZ A;  5IFT A;  1HJS A;  2VCC A;  5ECU A;  5CLW A;  2VX4 A;  1HVQ A;  1V3K A;  5BRQ A;  4OUE A;  4BQ3 A;  1AMY A;  4TVD A;  3EMC A;  4DUW A;  1LWJ A;  4GI8 A;  4ZXO A;  4X9Y A;  1W3L A;  2DSK A;  3ZJ6 A;  2WPG A;  5A2B A;  1JND A;  2UY3 A;  4MNK A;  5M17 A;  1GQI A;  1Q6G A;  5GNZ A;  1LL7 A;  1LF1 A;  2YLA A;  5ABG A;  5JIW A;  2OSX A;  2YL8 A;  4GKL A;  2VC9 A;  2W4X A;  3PTM A;  4UFK A;  5F7U A;  2EXO A;  1V0N A;  4J7R A;  2V3D A;  3AMD A;  1QNR A;  2BS9 A;  1B9Z A;  4URI A;  4QFU A;  1EHN A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1GEH A;  3NXL A;  2UV8 G;  2WZM A;  3B04 A;  4PMN A;  1T5A A;  1PX8 A;  1XX1 A;  2V67 A;  5FEZ A;  2EPN A;  4JTD A;  1RQB A;  3EX4 A;  3RCM A;  1NOF A;  2VD9 A;  1GQJ A;  1B54 A;  1H7O A;  1MXG A;  3JS3 A;  2E9M A;  4HG6 B;  2HTM A;  1J18 A;  4HN8 A;  2ATS A;  4MLR A;  2EPM X;  4XTD A;  3TE9 A;  2WZI A;  1XM3 A;  2WC3 A;  3KL0 A;  1PE1 A;  2CXE A;  4RZ6 A;  1UWI A;  5G4H C;  1KKR A;  5A6T C;  1XCX A;  1WBJ A;  3GIQ A;  3TJL A;  2OG9 A;  1IIH A;  4IHC A;  4H9U A;  3B8I A;  4OHQ A;  2PD9 A;  3A3W A;  2VGI A;  4NAF B;  5FOO A;  1VS1 A;  1SJA A;  3WMC A;  4M56 A;  5LIY X;  5CG7 A;  3VXG A;  5FF0 A;  3ZT5 A;  5D02 A;  1XD1 A;  4XZW A;  3OLE A;  4IUO A;  1O5K A;  2J88 A;  1H7P A;  4JCL A;  3MJM A;  2OWX A;  4LYR A;  2Z6I A;  1J93 A;  2Z2B A;  1NDZ A;  3W88 A;  3H8A A;  2XH4 A;  5I02 A;  2EJA A;  1OGB A;  3RO6 A;  2XM2 A;  3UA3 A;  1Z7A A;  2Z28 A;  2Y7G A;  3QYQ A;  4HZM A;  3AOF A;  2V5B A;  3WLH A;  2QJN A;  2G3I A;  4EPD C;  3S1V A;  7CGT A;  4ZBC A;  2V38 A;  4TMC A;  2GJP A;  2J13 A;  3S2C A; 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