3NSNA

Crystal structure of insect beta-n-acetyl-d-hexosaminidase ofhex1 complexed with tmg-chitotriomycin
Total Genus 191

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
572
structure length
572
Chain Sequence
EDVVWRWSCDNGKCVKLKNDPRSSEPALSLEACKMFCNEYGLLWPRPTGEADLGNFLSKINLNSIEVKILKKGATDDLMEAAAKRFKEQVSLAIPRGSTPKLTGKAVDVYLVNENPNEKAFSLEMDESYGLRVSPSGADRVNATITANSFFGMRHGLETLSQLFVFDDIRDHLLMVRDVNISDKPVYPYRGILLDTARNYYSIESIKRTIEAMAAVKLNTFHWHITDSQSFPFVTTKRPNLYKFGALSPQKVYTKAAIREVVRFGLERGVRVLPEFDAPAHVGEGWQDTDLTVCFKAEPWKSYCVEPPCGQLNPTKDELYQYLEDIYSDMAEVFDTTDIFHMGGDEVSEACWNSSDSIQNFMMQNRWDLDKESFLKLWNYFQQKAQDKAYKAFGKKLPLILWTSTLTNYKHIDDYLNKDDYIIQVWTTGVDPQIKGLLEKGYRLIMSNYDALYFDCGYGAWVGAGNNWCSPYIGWQKVYDNSPAVIALEHRDQVLGGEAALWSEQSDTSTLDGRLWPRAAALAERLWAEPATSWQDAEYRMLHIRERLVRMGIQAESLQPEWCYQNEGYCYS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Ostrinia furnacalis
publication title Structural Determinants of an Insect {beta}-N-Acetyl-D-hexosaminidase Specialized as a Chitinolytic Enzyme
pubmed doi rcsb
molecule keywords N-acetylglucosaminidase
total genus 191
structure length 572
sequence length 572
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2010-07-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A PF14845 Glycohydro_20b2 beta-acetyl hexosaminidase like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3nsnA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 3nsnA01
4PMNA 2WANA 3EYPA 2WAGA 1W9PA 3N1AA 3BLKA 2J7BA 1CNVA 2CKRA 7CGTA 3CIVA 2DH3A 4MB5A 5AYBA 2WVSA 1GJWA 4MB4A 3LPOA 5DO8A 3D5HA 4CD8A 1VEPA 3WFZA 1C3FA 1HJXA 3SUVA 4MTVA 3BAXA 1EGZA 3SUUA 2VQTA 1MYRA 3VX1A 1W91A 2GFTA 4BF7A 1MFVA 2ZX8A 4ZXLA 3ZOAA 4U3CA 2WHLA 2VCAA 5A2AA 2JALA 3W38A 1V6YA 2NW0A 4TTGA 2V38A 5DT5A 5E09A 4PMDA 3AHXA 4PMUA 1OSEA 3HMCA 4FLOA 3AMLA 3F5LA 2J74A 2JFEX 1Q6GA 2A3CA 3MV11 5CSYA 3T0DA 3ZR5A 1IV8A 3T2QA 3WNMA 4AD3A 2WMFA 1NH6A 2W67A 1XHGA 3F5JA 2OYLA 2EPNA 2BY0A 5GPRA 4JIEA 4WSKA 3VNYA 4QLLA 1R87A 2F8QA 1I1WA 1LL7A 3VD3A 2YA0A 3QOMA 3RJXA 3NSMA 2XYLA 2CHNA 2ZX6A 5ABFB 5I23A 2W66A 1UWIA 3AZSA 2BHYA 2UY3A 4XZWA 1TCMA 3L4UA 1QHPA 4CN6A 2YJQA 4M29A 2VQUA 2ZUVA 4AD0A 2DGAA 2DSKA 3VGDA 3GH5A 1CENA 4HZ8A 1OIMA 3WQ8A 2G41A 1NOFA 8A3HA 3LMYA 4ML4A 4PMOA 4C90A 1HIZA 1BGAA 2A3AA 1V02A 2Z1SA 2OWXA 1GHRA 2ZUNA 2G3IA 1EIBA 2WXDM 3OZOA 2J79A 1TMQA 1CGWA 3WF0A 2EPLX 3ZM8A 1WO2A 4B3KA 3AICA 1KWGA 4AD1A 2E9MA 1BG9A 1DWHM 2V3EA 1E6PA 4JFVA 3UEQA 4Z2GA 1XD1A 4MJ2A 3WELA 2VJXA 3L2LA 5C8BB 4AIUA 4QLKA 1TA3B 4HPGA 1E6XM 4QLJA 4UOZA 3UESA 2XFYA 1CWYA 2WBKA 1IZKA 1MXGA 4CCEA 5A1AA 1BYCA 4D6GA 1EH9A 4P7OA 1HX0A 1GQKA 3WD1A 4U31A 3BCDA 1AVAA 1JF5A 1WZMA 2J8GA 4TTUA 3CTTA 4ACZB 3CUHA 1ZJBA 3W27A 4PTMA 3OZPA 2GK1B 1M04A 4OUEA 2VX7A 4H2CA 3ZJKA 3VIFA 1L0PA 4J3VA 1JZ8A 1I75A 3EMZA 3W37A 3EBVA 1EO7A 3RILA 2J78A 4OBRA 4PMXA 2WNWA 1UWUA 4DM1A 3BSGA 3ZO9A 2PB1A 1JZ5A 1ZL1A 2QLYA 5A8QA 3ARUA 2VRQA 1EDTA 4AMCA 3WDJA 3WEMA 2W4XA 4W8LA 1UR1A 1HJSA 1KBBA 1CGVA 2UWFA 5M5DA 4H04A 5CQ1A 2C8NA 3ARQA 1GUVA 2E8ZA 4UNIA 3AIRA 1KWKA 2DT0A 2BHUA 5FD0A 3OIHA 4HOZA 3WBAA 3L4WA 2EO7A 3KWXA 3CPUA 3QGVA 2GUYA 2D1ZA 4MNJA 3VGEA 3NSNA 1V08A 1JZ7A 3RM8A 2A3EA 1QI0A 2WBGA 1JI2A 1H4PA 1VB9A 3SEPA 1JYVA 1VFFA 3OG2A 1NP2A 4GI6A 5A6BD 2FH8A 4JFUA 5I0DA 4J3UA 1XCXA 3NUKA 1JZ6A 1U2YA 1UA7A 1C8XA 3OLEA 4C7FA 3WL0A 3A4AA 2W63A 3MUIA 3MU7A 2AOSA 1AQMA 3WH9A 4B3LA 5CSUA 3AMKA 1WP6A 3FW6A 1UA3A 2UY2A 5CPTA 3UG5A 4D6JA 4HMCA 2EJ1A 1KCKA 1V3KA 2J7GA 1BFNA 1EDQA 3CZJA 3OGSA 2BHZA 3ZIZA 3CHEA 2X1IA 1H2JA 3WD4A 3A4XA 1C92A 1OD8A 4B16A 3W82A 3BAJA 3FHAA 3FY1A 3WBEA 2VR4A 3NJ3A 1O7AA 4BQ3A 3DYOA 2Y5EA 4QDMA 6CGTA 4XUYA 1NWRA 2OLHA 3AHZA 1E6SM 3AHTA 4TVUA 4CU7A 2GJXA 3OLDA 3EDFA 4DWSA 5BXRA 2GJRA 4OBSA 1UKPA 1H49A 1JXKA 1X6NA 1K9EA 1GOOA 1VFOA 1OGBA 3CGTA 1E56A 1QBAA 4ZENA 1H0GA 3I3DA 1WDSA 4JHOA 4HU0A 3VPLA 1X6LA 2PWFA 2XSBA 1JIBA 2DT2A 3VIOA 2J4GA 4U2YA 1TE1A 3VIPA 2WWCA 4CVUA 2O9TA 1J11A 3O2LA 1VJZA 3BMWA 1VAHA 2B31A 4JKMA 3VDHA 1HKKA 3M46A 5CLWA 1E4NA 4D6CA 5BCAA 3IJ8A 2XGBA 1UOKA 1X1NA 5HPCA 2WM0A 3N11A 3WNNA 1E3ZA 4AZIA 4EKJA 1UKOA 3B9AA 4RE3A 1CXIA 4LXFA 3CZKA 3A6OA 1UYQA 4AXNA 4J27A 4ZE4A 4BCEA 1GOKA 4UQ9A 4OOZA 3VD9A 1GORA 1FFQA 3K8LA 3GH4A 3OB8A 1TZ7A 4U3AA 1UH3A 4ACYA 2WHMA 1IT0A 1GVYA 3ALGA 3ARSA 4WLCA 2WW5A 3U57A 4P7QA 3SCPA 4AIEA 3BSHA 3M6DA 1JI1A 3AS0A 3KL0A 5LA0A 4W88A 1HNYA 4UQDA 2CETA 5D9PA 5I24A 4WJXA 1E1EA 1ZBWA 1HJWA 1OINA 2UY4A 3L4VA 1BG4A 1B3ZA 1XH2A 3PZNA 4MNLA 4PRWA 3KL3A 4UQCA 4MADA 3SCTA 1HVQA 1W3JA 2Y8VA 2D0HA 1G9HA 1E6ZA 1QVBA 2DEPA 3W6MA 4PMVA 4HA3A 4PTWA 2VO5A 1UKTA 1BTCA 1GW1A 3SCNA 2QHAA 1BSIA 3AQUA 1QNRA 3RDKA 3NYDA 4X0NA 3TTYA 1MW3A 1CGUA 4P8VA 5E70A 2NT0A 4YPJA 4AD5A 1UG6A 2QPSA 5FL0A 3O6AA 1PPIA 5M17A 1EHNA 1XRVA 1US2A 3K8MA 5A2BA 2DQXA 1OGSA 1E4MM 3T08A 4PMYA 3GZAA 1W9VA 1W2PA 1WAWA 1HVXA 1BF2A 1RP9A 1LLOA 3F4VA 5HNNA 1HL8A 3RMEA 5BROA 3CLWA 2D24A 1BYBA 2J8FA 2DSZA 3WUFA 1HKMA 1ZS2A 1ZU8A 1UR4A 1FHDA 4ZE5A 4RE2A 2Y2WA 3WEZA 3PZOA 3VIMA 4UFKA 1JD9A 1NP0A 3GXDA 3BH4A 2OYKA 1HF6A 1V6VA 4PBGA 4Z2KA 2BV9A 4AZ5A 3A47A 4WKHA 3ARXA 2ZXDA 4KWUA 1JDAA 2O92A 2VURA 3PHAA 4BZYA 1NARA 1DWIM 1XSJA 1FP8A 4V2XA 2DDXA 1CPUA 4HMEA 3WMBA 2WSPA 4FMVA 3MSGA 2JEPA 4HA1A 3VDAA 4MNMA 4Y7EA 2VVSA 1TFVA 1WE5A 2VRKA 3GXMA 1UD4A 3VUPA 4LYQA 1GQJA 1KB3A 3EMCA 4BQ5A 4P7RA 3W53A 1UKQA 1DWFM 4J28A 2VT0A 4K68A 3CO4A 1OBAA 1KXQA 1SYTA 3OBAA 5CXPA 3PTMA 2JF7A 6TAAA 1XH0A 4TVCA 1MVYA 2F2HA 1UZ4A 1J0YA 3U7BA 4W89A 2EXOA 1C8YA 1ODUA 1JD7A 3AYRA 3GH7A 2ZUMA 3VOCA 5IFPA 1V0MA 4H7VA 2WPGA 2QMJA 1GOQA 4AC1X 4AY1A 4PUEA 1Q6CA 2XFFA 1NWSA 1ISVA 1J12A 1BLIA 3SUWA 3PZMA 3GBEA 3CMGA 3T2OA 2CERA 3GXIA 2E0PA 1GONA 4ATWA 3UG4A 4MJ4A 2F61A 3MMUA 3U5UA 3A3HA 4L4OA 2FGLA 1W3LA 4WKAA 1C8QA 5BRPA 2D22A 2RGMA 2WMKA 1RD6A 3ARTA 3W29A 3AXXA 2EBNA 5I78A 5IFTA 1VBUA 3VDCA 1E5NA 3ARWA 2YA2A 2CXGA 4HPHA 1LQ0A 3CZGA 1BVZA 1HKIA 4AZ7A 1Q6FA 4ZFMA 1DTUA 1TVPA 4CD5A 2GVYA 1LWHA 4JAWA 1EA9C 3DYMA 3S6TA 5ABFA 2GJPA 5EFDA 3WDPP 4V28A 1H1NA 3G6MA 3WDIA 4J3SA 3PBGA 1HT6A 1W1PA 2YDQA 1KGWA 1C7SA 2BVYA 2WMHA 3POCA 3ZJ8A 1WDRA 2FHFA 4IISA 4J3TA 1E3XA 3CHFA 3ZSSA 1W9XA 1H5VA 2IXVA 4HU8A 3AMGA 4CN1A 2W62A 3SCVA 3CBWA 2PI6A 2D2OA 1OGGA 3VM7A 5C70A 4AZHA 1YQ2A 1G94A 1DP0A 4DUXA 1US3A 3AHYA 3I3BA 1HJVA 1BYDA 4AEEA 1ISXA 5GNZA 1V3LA 1ODZA 3OA5A 4ATLA 3HU7A 2J7CA 2WSKA 4TOQA 2FHBA 2VZOA 4Z2HA 1Q6DA 5LA1A 4J7RA 2VUYA 1UR2A 5I3DA 5GNXA 1CZ1A 3VGGA 4DM2A 5EMYA 1RP8A 4Q7NA 3WY1A 3WMSA 1UD6A 3VX0A 2O9RA 3QHNA 1O6IA 7TAAA 1EO5A 1PAMA 1CBGA 1CXKA 2PWDA 1LG1A 4ZEPA 2XM1A 4NZCA 1MQPA 1JYXA 4DUWA 2TAAA 3CHDA 3MUZ1 5A6LA 1EHAA 3PZVA 5ABGA 2CKSA 4URIA 3SCOA 2G4FA 4HOXA 4EANA 2CIPA 2D20A 1D7FA 4UFLA 2V5DA 3K4DA 3GNOA 3B9DA 4PYSA 5FL1A 1JZ2A 3F5KA 1CECA 1K6AA 4GQQA 3KEHA 1NM9A 1UQYA 2GK1A 1W3HA 4TXEA 3NCOA 4MDOA 2J75A 2VRJA 3FAWA 2EEXA 1CLVA 1DWGM 2WC7A 4EE9A 5IHRA 3SCUA 2PWHA 1GHSA 2WLZA 4MAZA 1KQYA 1V3JA 2YBUA 3LPGA 2YIHA 3KE0A 1FP9A 1XV8A 2VVNA 2ZUUA 4MB3A 4OIFA 1KXVA 4M81A 4GIAA 4S3JA 1VFMA 1GQLA 2C7FA 4GI9A 5A3HA 5BYWA 3MS8A 2WC3A 4P8UA 2CPUA 3PZGA 1BVNP 1PZ2A 3OGRA 4PTXA 4AZCB 5BWFA 2VTFA 1XYFA 3MMDA 4RE4A 1JDDA 1OWQA 3VIHA 3RO8A 2XIIA 3IK2A 3WIJA 1VFUA 1OM0A 3AROA 1JZ3A 2YL5A 1ESWA 2ZXAA 1GOIA 1PJ9A 4QCFA 2W5FA 3AI0A 2Y4SA 2ZWYA 1BQCA 1NOWA 4TUFA 3DHUA 1J18A 2J7HA 1NQ6A 1U33A 4PCSA 4BQ2A 1OCQA 1E71M 2OSYA 4TX6A 5DT7A 1UWQA 2YDSA 5A6MA 4W87A 2OWCA 2DPEA 2WMIA 2JEQA 2DIEA 3WQ5A 2PF0A 4AISA 1PZ3A 3PTKA 1CYGA 4JZ5A 1M03A 1RH9A 4GQRA 3N17A 4HA4A 4JL1A 1FOBA 2WKLA 4FLQA 1EDGA 2FDMA 2WVVA 5ECUA 3W0KA 4UQEA 3QHOA 1F4HA 2VCBA 2VL4A 1N82A 1B1YA 2DSWA 3L2MA 1LWJA 3WDHA 4CVWA 3QHMA 3SCSA 3THCA 1HKJA 1R86A 3CH9A 3PZIA 1W9UA 4AW7A 2VZUA 1HN1A 4WSJA 1E43A 3WF3A 3N15A 3EDEA 3WF2A 2X0YA 3TONA 5KEZA 3W6LA 3VIJA 1E9LA 3UG3A 3AZRA 4N42A 3SIMA 3FXYA 3WH7A 4LGXA 3VO0A 2Z1KA 4E4PA 4GZIA 1FH7A 2ZE0A 5FKYA 3ZT7A 1B3YA 4C91A 1JGIA 3II1A 1QI2A 3D3AA 5A8MA 1VIWA 3W26A 1D3CA 4A3YA 5A6BA 5I6SA 1BAGA 1UZ1A 2PWGA 3BCFA 3RM4A 1WCGA 1WB0A 2J62A 3GNPA 2VX6A 1QHZA 1J01A 3WQ6A 2AAAA 4CCCA 1D2KA 3WD2A 3ARVA 1C90A 3BAIA 1E15A 2YDRA 1W2VA 3ECQA 4RL3A 2CCRA 2E40A 3AZTA 3M7SA 2GDUA 2X8RA 2ZX7A 2CYGA 4WF7A 2G3JA 1E0XA 3ZQ9A 2BFGA 1A3HA 1CGYA 4DWSB 1KGUA 3LPPA 1E0VA 2W91A 2XGIA 4F66A 1ZBVA 4YN5A 1V0NA 5IHSA 4GXPA 1PBGA 2WWDA 2QF8A 1JF6A 3FAXA 3MMWA 1NWUA 1CTNA 2J7FA 3BAWA 1ITCA 1B90A 1L8NA 3IAPA 4LX4A 5CPQA 1VRXA 1PIGA 2VNCA 1VBRA 2WK2A 4GZEA 2WMGA 3TOPA 3ZJ7A 2FGZA 4CCDA 2WYSA 1YHTA 3ZT6A 3NSXA 3PZUA 4D6FA 3UCQA 3KL5A 3WD3A 4V27A 4UFIA 3WH5A 4OOUA 5E6YA 2YLAA 2Q8XA 5AYIA 1SFSA 4PSPA 1GZJA 3EMQA 2ZICA 2C0HA 2E3ZA 2ZIDA 1S46A 2ZXBA 4AYSA 1QNQA 1H0IA 1MQRA 4XV0A 4CKQA 4P8XA 1ZBKA 1SMDA 2BVTA 4PMRA 3AMCA 3RJYA 3SUTA 1E40A 4D6DA 3ZR6A 4D1JA 4ZXOA 1PX3A 1UR0A 5FOOA 2WKGA 5AY7A 4LPCA 4JCMA 2D0GA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4PMN A;  2WAN A;  3EYP A;  2WAG A;  1W9P A;  3N1A A;  3BLK A;  2J7B A;  1CNV A;  2CKR A;  7CGT A;  3CIV A;  2DH3 A;  4MB5 A;  5AYB A;  2WVS A;  1GJW A;  4MB4 A;  3LPO A;  5DO8 A;  3D5H A;  4CD8 A;  1VEP A;  3WFZ A;  1C3F A;  1HJX A;  3SUV A;  4MTV A;  3BAX A;  1EGZ A;  3SUU A;  2VQT A;  1MYR A;  3VX1 A;  1W91 A;  2GFT A;  4BF7 A;  1MFV A;  2ZX8 A;  4ZXL A;  3ZOA A;  4U3C A;  2WHL A;  2VCA A;  5A2A A;  2JAL A;  3W38 A;  1V6Y A;  2NW0 A;  4TTG A;  2V38 A;  5DT5 A;  5E09 A;  4PMD A;  3AHX A;  4PMU A;  1OSE A;  3HMC A;  4FLO A;  3AML A;  3F5L A;  2J74 A;  2JFE X;  1Q6G A;  2A3C A;  3MV1 1;  5CSY A;  3T0D A;  3ZR5 A;  1IV8 A;  3T2Q A;  3WNM A;  4AD3 A;  2WMF A;  1NH6 A;  2W67 A;  1XHG A;  3F5J A;  2OYL A;  2EPN A;  2BY0 A;  5GPR A;  4JIE A;  4WSK A;  3VNY A;  4QLL A;  1R87 A;  2F8Q A;  1I1W A;  1LL7 A;  3VD3 A;  2YA0 A;  3QOM A;  3RJX A;  3NSM A;  2XYL A;  2CHN A;  2ZX6 A;  5ABF B;  5I23 A;  2W66 A;  1UWI A;  3AZS A;  2BHY A;  2UY3 A;  4XZW A;  1TCM A;  3L4U A;  1QHP A;  4CN6 A;  2YJQ A;  4M29 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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