3NYZA

Crystal structure of kemp elimination catalyst 1a53-2
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
247
structure length
247
Chain Sequence
PRYLKGWLKDVVQLSLRRPSFRASRQRPIISLNERILEFNKRNITAIIAAYKRKSPSGLDVERDPIEYSKFMERYAVGLAIATEEKYFNGSYETLRKIASSVSIPILMWDFIVKESQIDDAYNLGADTVALIVKILTERELESLLEYARSYGMEPAIVINDENDLDIALRIGARFIEIASRDLETLEINKENQRKLISMIPSNVVKVAWQGISERNEIEELRKLGVNAFGIGSSLMRNPEKIKEFIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Lyase
source organism Sulfolobus solfataricus
publication title Iterative approach to computational enzyme design.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Indole-3-glycerol phosphate synthase
total genus 102
structure length 247
sequence length 247
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.48: Indole-3-glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date 2010-07-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00218 IGPS Indole-3-glycerol phosphate synthase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3nyzA00
4ZVJA 1ZENA 3PR2A 3SIZA 5C6MA 4GUFA 5LHEA 1H1ZA 1FWTA 3TDFA 1T8XA 5AHEA 1VR6A 2VFHA 4OWGA 3KVJA 4ZQCA 1LROA 2PC4A 3LCGA 3MW7A 3BW3A 2ZFAA 4JTSA 1OFRA 3NA8A 3GIYA 3NG3A 4QISA 1LOQA 3W1TA 2F84A 4PEKA 3UY8A 4CCCA 3DKLA 2F7FA 3RU6A 2DZWA 3W7EA 2QCMA 3M5XA 3NPUA 1JUEA 3HF3A 2WV8A 2DP3A 3BLEA 3SZ8A 4R33A 3PVFA 2V81A 4UTJA 5CPNA 3T55A 1CX9A 3BG3A 2J9YA 2DZPA 2GVLA 1E51A 5CPMA 1WAUA 2FPYA 5I3FA 2CLLA 3O16A 2DZVA 1QPRA 3HBLA 5KZEA 1KFJA 1IGSA 3P80A 3HPXA 3GVGA 4BK9A 3S5OA 1AG1O 4MZYA 1ME8A 4UFMA 2Y7FA 1EP1A 2RDUA 3B4UA 5G2IA 2JK2A 5G4EA 4RZ5A 5MHBA 5KZDA 3VI2A 1TPH1 1ZHAA 5KINA 5E0KA 1GWJA 1J2WA 3UD6A 5HULA 4MFEA 5AC7A 3W3OA 1LBMA 2J27A 5KTLA 4DBDA 4AWTA 1Q45A 5D2VA 1SO4A 3P60A 4ZZ9A 3M5VA 1F7BA 3FIGA 1OFPA 3PBVA 4Z0JA 2LLEA 5LGXA 1FX6A 3QMTA 2P0OA 1RQHA 4EF8A 3RMJA 3EXSA 2FQIA 2RH9A 4RXGA 5LNVA 3V1PA 1JUBA 3BARA 3G24A 1TPVA 3IIVA 4UC5A 4IOTA 1N7KA 3DENA 3UWZA 1GTHA 1TRDA 3C3NA 3SI9A 1H61A 1X6UA 3PBYA 2JBMA 3UWVA 5BMXA 1DHPA 1UUMA 3B06A 4XUGA 2J6XA 1P0KA 2O7QA 2HTMA 4RK8A 4HSNA 4BR1A 2JKEA 3G18A 3HG5A 1R46A 5FF7A 1R47A 1Q6OA 2AAMA 2WPBA 4NJJA 2QCCA 5FF3A 1I45A 4HIBA 3HGOA 3G0XA 2GQAA 4HSOA 1VZWA 4IXXA 4TMCA 4JS3A 3I7SA 4E0CA 1JRCA 3OVQA 1H5YA 3TK7A 4Q32A 1K7FA 4RXFA 3CT7A 1TIMA 2JGQA 3QQ0A 1F05A 4OQVA 2VEIA 3NPXA 4WZHA 1T96A 1VJIA 1W5MA 4RKAA 2G5WA 1TQXA 1IXOA 1I2PA 3N14A 2R94A 1YDOA 2C15A 3BGGA 4UNKA 3W7HA 2A85A 3M43A 1JCLA 3HMJG 2V0TA 4CLMA 3FLUA 2CLFA 1VHCA 5H91A 5LNRA 1BTMA 3DHDA 3OEXA 4EVZA 4UNLA 1YADA 1ONRA 2E6AA 4Z08A 5FEZA 2BX7A 3W7NA 3DAQA 2FJKA 5BMWA 3TKFA 5EY5A 1DV7A 1H7RA 1LBLA 5HR7A 5D03A 1U5JA 1YTDA 3RF9A 3S1WA 2NWSA 3HG4A 3TAOA 5TBOA 4G1KA 1OJXA 3MO7A 2C13A 1MXSA 3THAA 5I3HA 1O5XA 1BWLA 3VE9A 3LV5A 1DKWA 3KVMA 3LHUA 1TJRA 2VFDA 1NSJA 1KM1A 1MO0A 4PL2A 1Q6QA 3G0SA 3W7IA 5HR6A 3VCRA 1KM5A 3TSBA 3UQNA 4Y96A 4TMBA 3SR7A 2RDWA 1VHNA 2J9XA 3NVTA 4FNPA 3GYEA 3NZRA 3RNDA 4MPQA 2GQ9A 5D02A 2QCGA 3QJAA 3WK2A 2WSQA 4IUOA 4K7YA 2JKPA 3G0UA 3BW4A 3QH2A 3LXCA 4FX7A 3ELFA 4CQAA 1O5KA 3IRDA 3P62A 4UFJA 4JTGA 2XN2A 1JQXA 4WY0B 1AW1A 2TSYA 4H4IA 3W7CA 2CWNA 2CU0A 3HGRA 4JTKA 4LVGA 1KTBA 2YW3A 4JICA 1ZNNA 3E49A 3BV4A 3EX2A 3C2EA 3GAYA 5D30A 1B57A 2DZUA 1XKYA 2ZQ0A 1PL9A 1SO5A 4EOUA 5FEXA 3EEGA 2QCLA 2C6QA 4IMFA 1TREA 2V82A 4UFLA 5DLCA 4O14A 1DBTA 1ICPA 1Z41A 1NF0A 2XFWA 2OT0A 3TW6A 1RQBA 1GEQA 3BGJA 3E9AA 4TU1A 4U4MA 2X1TA 3A22A 3S1VA 3EKLA 5CG7A 1DORA 1VCGA 3C6CA 2ATMA 4NJIA 5EA9A 3DKJA 1XXXA 5I3IA 2Y70A 3N9RA 2QR6A 4GJ1A 3W84A 4BI7A 4HT3A 3W2JA 4UFHA 3S5NA 3ABQA 4LUIA 4FEZA 3WK0A 3NL3A 3I7RA 4Y9AA 5TIMA 5CKSA 1ME7A 5C5YA 3NL2A 3C56A 5DXXA 1GVRA 1UJPA 3TV8A 1QO5A 4K8HA 1PV8A 3W7JA 3HG3A 1IXNA 4NXSA 3IV3A 3QYQA 1XI3A 1JCYA 1FCUA 3NPWA 5D32A 4N6EA 3HIJA 4I7WA 5LHFA 3LOTA 3B0PA 4O54A 4FXSA 1CW2A 2ZZ1A 4A29A 1KLYA 1A5CA 2E5BA 1LRQA 4AWUA 1P0NA 1KFBA 3STEA 1QAPA 3P67A 1B4EA 4OV4A 3TNOA 2CLEA 2O7SA 2VKZG 3L65A 1G7VA 3TQ0A 2V2DA 3EXRA 4E2BA 4KFPA 3LTSA 3EXTA 1OFDA 3N9SA 1W31A 4LWWA 2YSWA 1PHWA 3G8RA 1A53A 2KZHA 3C2RA 1PE1A 3LCXA 1QOQA 4Q33A 1EUNA 3CIWA 3F1QA 2Y7GA 4WUIA 4KKXA 5G1YA 1TV8A 4JTIA 3V75A 2CZDA 5D05A 5AB3A 1KBJA 2BWGA 2Z1BA 1QFEA 1KFCA 3F4NA 3BO9A 1S5WA 5KMYA 1LLWA 3GDTA 5HQEA 3K30A 1GTEA 1K8ZA 3H54A 1K7XA 1I2NA 3B03A 4OU1A 3EB2A 1QO2A 3O6CA 3P61A 3E02A 4O19A 4UMCA 3W07A 5F2GA 2C19A 2DZTA 3GB6A 1YPIA 2YDAA 2NXGA 3S1UA 4JX4A 3DXIA 3OA3A 4UTLA 1WOBA 2QCNA 3G3DA 2NLIA 4Y8FA 1W1ZA 2WNZA 2H3BA 1IF2A 1XL9A 4ADUA 3NR0A 4NNAA 4K36A 1H63A 3LXBA 3W7OA 3W1QA 4H3DA 5HWNA 3PAJA 3T78A 4NJGA 1KA9F 5KSWA 5DCEA 4UCGA 1ZAHA 3NAVA 1TCDA 3LV6A 3T7VA 5K9DA 1EPXA 5LNWA 4LOCA 2DORA 1TRIA 2BTMA 2E6DA 4LW7A 3W72A 4HNTA 4DBEA 4FIQA 3P84A 1TV5A 5HMSA 2RHGA 3NL5A 1W3TA 2VXNA 5U7SA 1AW2A 3PWAA 5E1QA 5D2XA 4QJ1A 3FFSA 3NPVA 4YWIA 4UTWA 3KHJA 4ORMA 1YDVA 3EX1A 1JULA 2QJHA 3L0KA 5AYXA 3W1UA 4O1AA 4XTDA 3MHGA 1IXQA 3TFXA 1H7NA 1HFBA 4U28A 3VE7A 4FNRA 4D2JA 3W1XA 3M0ZA 1B9BA 3EWWA 1GZGA 1UASA 1P4CA 1W3NA 3PS7A 2QEZA 2YX0A 1G7UA 2FTPA 3SJ3A 2A6LA 1VYRA 1G69A 2ZA3A 1IIGA 4JYEA 2CZFA 3TUUA 1TSIA 5EYWA 4TIMA 3CC1A 3M7WA 3GLCA 2UV8G 3PG9A 3PG8A 2Y88A 3W76A 4N9CA 2R91A 1EX5A 4AF0A 2FPTA 3ANYA 4WD0A 5I3KA 4PH6A 2Q8ZA 2A0NA 2A5HA 3CTLA 3ABOA 4KWVA 2VEMA 3TJLA 4GUJA 4JX6A 5AC6A 2A2IA 4S2CA 5DCBA 3HG2A 5AHIA 3KX6A 3KRSA 4UXDA 1OYBA 4Y90A 3QPYA 4M6QA 5FF4A 1XBVA 3FEMA 2NZLA 1OX4B 3IEBA 5G2WA 5D09A 4WOZA 4JIPA 1UB3A 2X1UA 3GDLA 3UY7A 5F2IA 1W3IA 3ZR4A 3FJLA 4LS2A 5ABTA 5AHMA 3LHZA 1GG1A 5FEPA 4HKPA 1XBZA 3LCLA 2OX1A 4YXGA 4GFSA 3U6WA 2YGYA 4MLRA 4FIRA 3H53A 3AO0A 4Q4KA 5HNRA 1QPQA 3GNNA 3SECA 5G5IA 4DO4A 2QAFA 2VEPA 4O10A 4M7SA 1GT8A 4S2BA 4ALDA 4AF0B 3FKKA 2GJLA 4POCA 1ZCOA 2GQ8A 4PODA 2Z6JA 2ALDA 3IIOA 1NEYA 4IMCA 1WX0A 2QCEA 4JGDA 4UR8A 4YCOA 3W70A 1P1XA 3D0CA 3LERA 1TO3A 3TSDA 3CEUA 4XWUA 1HG3A 1SFJA 1Q6LA 4IMGA 3LLFA 4K6AA 2OMAA 4GNJA 3WK1A 2C0AA 1SR9A 1FXQA 3MWAA 4NU7A 3W1RA 3PSWA 3E0IA 3NGJA 1Q6RA 3LCWA 1TTJA 2HS8A 1PHQA 5EMUA 1WDWA 4N9DA 5BOOA 2B7OA 4M6PA 1WV2A 1PS9A 4O15A 4AWSA 4GE8A 1H51A 4LUJA 3RFAA 3KRUA 1RVGA 3G3MA 1GYLA 1VQTA 4XBSA 2EPHA 5CGQA 4MZ1A 3T40A 1PVNA 1W56A 2YW4A 1GYNA 4RZ4A 3PY2A 3EX3A 5GVJA 3C8FA 2J9ZA 3BPWA 1EWDA 3NQEA 4JX5A 5D38A 3NNTA 4DO5A 1LRTA 2R8WA 4B5NA 3PSVA 4NX5A 4WQ6A 3SGUA 3M16A 1ALDA 3QRHA 3W1NA 4BI6A 3MMTA 1NFBA 3HJZA 1W5OA 1TPC1 2VFFA 3NQ6A 4CQ8A 4UFKA 2PRMA 2GOUA 2WOQA 4IPJA 3W23A 1OK4A 3S9YA 5IM51 3MP5A 4O1DA 4GUHA 2HS6A 3Q94A 3NXFA 1VRDA 4LNYA 1I2RA 5AYZA 1M7OA 3R89A 2BLEA 2ZRVA 3KAOA 2NXHA 1SO3A 4JEQA 4A2RA 2ZDRA 4CNOA 4Z1AA 4JYDA 3DZ1A 3NQAA 1LZOA 1EIXA 4I7UA 1FWWA 5K2ZA 3DFOA 1W54A 4HNVA 1O60A 3R13A 2Y7DA 2ZCGA 2WO5A 3QMRA 5D2TA 3TMLA 2QDHA 5C2XA 1W0MA 1HUVA 2WKJA 1OHLA 3QSRA 4I7VA 4R53A 3CPRA 4HHPA 5K7JA 5CPLA 3MYOA 1KLZA 4O53A 3FJ6A 3NQ8A 1XBXA 2X2GA 1JQVA 3UZ5A 1OVDA 3G1AA 1YXDA 4MYXA 3LDVA 3UPBA 1DJQA 4QQ3A 4O13A 3C61A 4N6FA 3IIXA 3MI6A 3W7DA 4IGHA 1L9WA 1X1ZA 3WJWA 1R2TA 1G4EA 1AW5A 3CEPA 3W1MA 4AHPA 1LOSA 1JVNA 4NUWA 4X2RA 1LDCA 2NX1A 3O8AA 5DY2A 2ZTKA 5C54A 4TO8A 3NYZA 4Z1DA 5BW6A 1RV8A 1YTEA 3B04A 1M5WA 2I9EA 4MFDA 2GVJA 3P8JA 1KM2A 4LU0A 1G4TA 1OG0A 4O1CA 2YFOA 4TX9A 5AHNA 1UBSA 3HGJA 3KOFA 5EKYA 4O4VA 1JR1A 3W9ZA 4BF9A 3YPIA 2J88A 2C3ZA 5J5DA 3W88A 3WFAA 2A6NA 5D04C 5AC8A 4K7VA 5AYYA 4UTHA 5DCDA 1TV7A 4XQ6A 3IVSA 2FLIA 3TMQA 1H62A 4AMAA 4PA8A 2E5CA 2EAWA 3NQGA 5FESA 5LNUA 1H1YA 3W2MA 2OT1A 3EWXA 4EIVA 3WJYA 2Y6ZA 4DXVA 2ATSA 2P10A 2V5BA 4DPPA 3MI3A 1WYIA 4N4QA 1Q3NA 2W0UA 5F4XA 3QM3A 4XTIA 3EWYA 4QSHA 1D3GA 1KM6A 1EP2A 2JGYA 2EF9A 2PURA 1H7OA 5D2WA 3W73A 2NWRA 4N02A 1ZFJA 3UNDA 3OHIA 1VS1A 2Q3RA 1GPWA 4X3ZA 2ISVA 1K02A 1OFEA 3GZ3A 1WBJA 1JCJA 2A4AA 1UCWA 4A3UA 1OFQA 5C55A 3LRLA 3S42A 3BLIA 4ICNA 4IXHA 4JYFA 3G1HA 2WNQA 3DGRA 3M1ZA 4MKNA 1T99A 4W9TA 3LB0A 1ZAJA 4GRSA 1ZJIA 1Z42A 3W7PA 3VNDA 3PUEA 5CZJA 2G96A 3TX9A 2YR1A 3LI1A 3W75A 2PE4A 3GDRA 4CNNA 4Z0SA 2Y61A 1VPXA 1PIIA 4MY8A 2J24A 4O0KA 4O1BA 5D2YA 4WXZA 3SY5A 1K8XA 2DZSA 3IVTA 2C16A 4H6KA 3DI1A 1YTKA 1DL3A 1AL7A 2V5LA 5K9CA 2NV1A 3O6DA 2YFNA 1S3HA 4J9JA 3B0VC 1I8JA 5L6UA 3W7GA 4QNEA 4I9AA 4XZ9A 3LBMA 1KM4A 3O63A 5F2LA 3C2OA 1GJPA 1LTDA 2QCDA 2HMCA 4AVFA 4JTTA 2QDGA 1GVFA 3ABSA 1F6KA 1KTNA 1I2OA 4DF2A 1GVQA 4FO4A 1C8VA 4MUZA 1B4KA 1P5BA 1OABA 3M5ZA 2E09A 3C4UA 1F5ZA 5F4WA 2Y62A 2QCFA 3H55A 2CFFA 5H2ZA 4K37A 1LM1A 1TPEA 4X9SA 1JCNA 3NQ7A 2PCQA 4NJHA 1U83A 2QAPA 4FF7A 4UMAA 5I3JA 3W2KA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1S5M A;  3R8G A;  1ZEN A;  5PTD A;  1H1Z A;  3TDF A;  1T8X A;  1YNY A;  4BKN A;  1M53 A;  3KP0 A;  1Z69 A;  4ZQC A;  3PPF A;  2PC4 A;  1PTD A;  3VAB A;  3B97 A;  4OJY A;  3L4Z A;  2ZFA A;  4MAZ A;  5C7V A;  4QIS A;  3H12 A;  4HA4 A;  3UY8 A;  2AGT A;  4QGC A;  4YVP A;  1US2 A;  3SZ8 A;  2YCL B;  2W3Z A;  5D9M A;  4BQ2 A;  1NJJ A;  4UTJ A;  2DZP A;  2PEV A;  2FPY A;  5I3F A;  4TTU A;  2DZV A;  1KFJ A;  1TJ2 A;  4AUB A;  4R9X A;  1ME8 A;  2JK2 A;  5LA2 A;  2J6V A;  2E9L A;  3VI2 A;  3PUG A;  4ILS A;  3JZU A;  4UB9 A;  4AZ7 A;  3MDU A;  4IH3 A;  4PMU A;  4AEE A;  1TV4 A;  1GWJ A;  1IWA A;  2RGL A;  5HUL A;  4QXI A;  3LSC A;  2GUB A;  1LBM A;  3VM7 A;  5D2V A;  3DHU A;  3M5V A;  3E1F 1;  5CC7 A;  3PBV A;  2LLE A;  1F61 A;  3TLQ A;  1ADD A;  1FX6 A;  4H9X A;  4R3U A;  3CZL A;  4RXG A;  1E5N A;  4WDT A;  1XPG A;  3QY7 A;  1Y8B A;  1TPV A;  4UC5 A;  2BFG A;  1R9X A;  1TRD A;  3SI9 A;  1IT0 A;  4MWA E;  4ENL A;  2ANU A;  1J93 A;  4AWE A;  2J8T A;  1LG1 A;  1TUX A;  4YIW A;  3OGV A;  4BR1 A;  2JKE A; 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