3NZ1 | Genus

Total Genus 99

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	99
sequence length	249
structure length	249
Chain Sequence	PRYLKGWLKDVVQLSLRRPSFRASRQRPIISLNERILEFNKRNITAIIAAYKRKSPSGLDVERDPIEYSKFMERYAVGLAIATEEKYFNGSYETLRKIASSVSIPILMWDFIVKESQIDDAYNLGADTVALIVKILTERELESLLEYARSYGMEPAIVINDENDLDIALRIGARFIEIASRDLETLEINKENQRKLISMIPSNVVKVAWQGISERNEIEELRKLGVNAFGIGSSLMRNPEKIKEFILGS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
source organism	Sulfolobus solfataricus
publication title	Iterative approach to computational enzyme design. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Indole-3-glycerol phosphate synthase
total genus	99
structure length	249
sequence length	249
ec nomenclature	ec 4.1.1.48: Indole-3-glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date	2010-07-15

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00218	IGPS	Indole-3-glycerol phosphate synthase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3nz1A00

3N34A 4O1DA 3O07A 2E6FA 2NX1A 3I7QA 1N8FA 2QEZA 5CZTA 2Y88A 3EX6A 2Y89A 3O15A 5HUOA 1VHCA 1OK4A 3LHVA 3PS7A 4DEFA 4IJBA 4R34A 4BR1A 4KKXA 1OFQA 4Z0JA 2A2IA 1FWNA 3W7PA 2R94A 2PCQA 3IVTA 3MBDA 4Z1CA 4LV9A 3LBMA 1VZWA 5A8GA 1Q6RA 2VFEA 2JBMA 3SGZA 4HNUA 1LYXA 2V30A 3QFEA 1QPOA 2Y63A 1DHPA 5HUPA 1EIXA 1KLYA 2HTMA 4OV9A 4JTLA 3FJ6A 2Z6IA 1L6SA 1RQHA 5FEPA 4NQ1A 2XN1A 4WY0A 1GVSA 3DFNA 3A24A 2YFOA 3TSDA 3ZWSA 4LVAA 2JGYA 3P8JA 3S1VA 3FIGA 4MY1A 5CZ0A 1ZALA 1SW3A 4Q4KA 4JDBA 1L6WA 5CSSA 4K38A 3W7RA 1I2RA 3KAOA 2AQWA 2HS6A 4Z08A 5G2WA 4UR7A 2Q8LA 3TA6A 3MYOA 4DPQA 2CW6A 1TTQA 4X2RA 2OMAA 2CZ5A 2CLLA 5K2ZA 1HL2A 4ONVA 4RLIA 1LP6A 3IIPA 4LC6A 3W6YA 4L4LA 4N4PA 5L6UA 3M5XA 2FJKA 4N4QA 1HO4A 3MBFA 2RHGA 5CPOA 1QOQA 3IVSA 1OFEA 1W37A 3W84A 3RNDA 1KM1A 1IIHA 1ONRA 5BNKA 3LX9A 3GIYA 1QWGA 1EEPA 4NXKA 2ATMA 2Y7EA 4NJIA 1KM2A 2PRLA 2FIQA 3UPWA 2DZUA 3HGJA 1W3TA 3UWUA 4ZQOA 2ZA2A 4IMGA 1VPXA 2VEIA 3AJXA 5DY3A 1NF7A 2BX7A 1H7PA 4LVBA 3LM7A 1IXOA 2A6NA 3ANYA 4JNMA 3STFA 4FXSA 2DJXA 1XC4A 2JK2A 3T7VA 2ZRVA 1X1ZA 4Y8FA 1RV8A 4RV8A 4MIMA 3E49A 3S0CA 1W31A 3NXFA 5DCEA 4S2BA 4TO8A 4UTWC 5IM51 1SW0A 3BGGA 4FX7A 3QJAA 1QPQA 2CLKA 2HSAA 3TKFA 5E93A 1SFJA 5BOOA 5LNUA 3W2MA 3NVTA 3TV8A 4Z1DA 3KVKA 4X3ZA 3QW4B 4IMCA 2C1HA 3G3DA 2QAFA 1C29A 1FDJA 2ZQ0A 4Z1BA 4LS0A 1ZY9A 3PSWA 4ICNA 1F2JA 1WOBA 3P67A 4D2JA 3P8IA 4I7WA 1TPVA 3THQA 2ATSA 1W5OA 3F4WA 2XN0A 3WJXA 1G7VA 5LNVA 4NX5A 3FS2A 3NL3A 1J4EA 3GNNA 4E2BA 2ZFAA 5AHIA 3NQFA 4M5PA 1OVDA 3MMTA 4HHPA 1THFD 2OT0A 3HQ1A 4MKNA 2G96A 2QCDB 3QW3A 5DXYA 3MI2A 1W8SA 3G1FA 3KXQA 3NQCA 3FKRA 3DFTA 3HGOA 3O6DA 3UPBA 3IIXA 3PR2A 4AXKA 5CKSA 4P2VA 1LLWA 1X1OA 2GQ9A 2C13A 1SZGA 3HG4A 1PHWA 1H7XA 3ATYA 4K39A 4AF0B 4ORIA 3UXDA 4MZYA 3RMJA 4OGZA 2BWGA 3HIJA 2QKFA 4OT7A 2A7NA 4DF0A 1CW2A 4FIQA 3NAVA 3B03A 4I7UA 2VXNA 3Q2DA 3SECA 3ABSA 4LS1A 5FF2A 3G1AA 2PRMA 4LVGA 4JTEA 1UCWA 2YGYA 4PCFA 3G1HA 1QNVA 2QCGA 2X16A 4Q32A 3C2FA 4XQ6A 4FXRA 2P0OA 3S1WA 2QAPA 1H51A 1P0NA 3NL6A 3W1NA 3QMRA 3TJLA 3TW7A 3KRZA 1LBMA 2C18A 3TC6A 1BWKA 3TU9A 1FWWA 3UYCA 3M1ZA 3OA3A 1IF2A 2ZRXA 4P61A 4JTKA 1SO4A 3NM1A 4GBUA 3STEA 3VNDA 1LM1A 1SZFA 1X7FA 1TIMA 5C5YA 1LDCA 3NQ6A 3QF0A 2CWNA 2B7OA 2WNZA 4MZ8A 3SZ8A 1H7NA 4MFDA 1KM6A 3EX3A 1KM4A 4S1FA 3W7CA 1W56A 5AFDA 2DZSA 3PF3A 2VOMA 1ME9A 4U4MA 3EKLA 1G4EA 1TPFA 1KM3A 2J27A 3UZJA 4NJGA 1OFBA 2X2GA 1J5TA 3NQEA 5KTLA 1GVFA 4QNWA 4DXVA 3W1MA 3VE7A 4XTIA 4LV4A 3GYEA 1UBSA 1MSSA 3UWQA 1PCWA 3CTLA 4AVFA 1F73A 3QQ0A 1FWTA 1G6CA 2OX1A 3LCLA 5FEWA 3P7YA 3I6RA 5BW6A 2AGKA 5D37A 1FCQA 1G4SA 3O05A 3C3NA 4FB7A 5AOUA 4IGHA 4YMZA 1YTKA 1GJPA 4NNBA 5D03A 5I3GA 4Y90A 3HB9A 1AK5A 3MJYA 2YPIA 1GOXA 5BRBA 1P0KA 2KZHA 1OX6A 3LB0A 2DZVA 2V2DA 3NYZA 3DI0A 5HULA 2DZTA 5T26A 3TROA 4E38A 1QO5A 4WD0A 1K8XA 5FF0A 5D09A 4BFAA 3MW7A 2FPVA 4JX6A 3LXCA 3O16A 1PVNA 2ZZ4A 3PBVA 1H7RA 3W2UA 3NOEA 4LC8A 3L5LA 4K7YA 1B57A 2CU0A 3M41A 1XXXA 5CZSA 3EXRA 2QF7A 4CQ8A 2EPHA 3LHWA 3GX9A 3DGRA 1O5XA 4DBEA 3NDOA 2E6DA 3W7LA 3H55A 3KRUA 3V75A 1JUBA 2VFFA 3PBUA 4QNEA 1TYGA 3GDTA 1PV8A 3ZFHA 2CLOA 2PC4A 2WKJA 1WBHA 4Y96A 4JY8A 1VRDA 5DELA 4JDYA 4LT9A 4NZJA 5G2IA 3U8GA 5HR7A 1F5ZA 4RJEA 2LLEA 2R91A 2PURA 1IXNA 3DENA 2C16A 3LCIA 3R12A 3GDRA 1YLVA 4O12A 4DF2A 4DBDA 1VYRA 3QSRA 1ICPA 5FI8A 4DO6A 3CWNA 3N73A 3P61A 3QQ1A 4JTIA 1AL8A 4XTDA 4ZQNA 4EWND 3A5VA 1EUAA 1GWJA 2V2HA 3G1SA 3KFTA 4DO4A 3C61A 3GDKA 3CEUA 5K4ZA 1K02A 5LHFA 5EA9A 4QQ3A 4BF9A 3O6CA 1KTCA 4WOQA 4O57A 2WOQA 3S9YA 3ZR4A 3TUUA 3W7GA 2G5WA 3GLCA 1TTJA 4U28A 3CU2A 4WY0F 4AWTA 4HN4A 2VFDA 3FOKA 2Y61A 5KSWA 1K8YA 1M6JA 3Q58A 4AB4A 4IX2A 1GG1A 1SPQA 2A1YA 5G2HA 1FY6A 2E77A 2RFGA 4EF8A 3FJLA 4IQLA 4LVFA 1JCYA 4YWIA 3GXPA 4AHPA 5LSMA 4CNNA 3W2NA 3G18A 1TQXA 3CT7A 4UCGA 5I3IA 2WQPA 3QMTA 3UD6A 3L5AA 4JN6A 2RH9A 4M6PA 2ZBTA 3VCRA 2VENA 1GYNA 1R2TA 5LZLA 3A21A 4UFMA 4LY8A 3MP3A 3T44A 2J9ZA 2FPTA 3DZ1A 1I8JA 5DXXA 2QJGA 3G1VA 2NLIA 2C14A 2X1RA 3I65A 2YR1A 4AEOA 3O06A 4LRSA 3LTSA 2ZZ1A 1BEUA 4WZHA 3HGRA 3NQ8A 1TREA 3CHVA 3RU6A 3IIZA 4LNYA 3KVMA 4MZ1A 4JYEA 1TPEA 1JJKA 4ZZ9A 1ZFJA 3TSMA 1LZOA 2NZLA 3TW6A 4UTIA 4CCEA 4HSNA 4FNSA 2HS8A 2O7QA 5HR6A 1I2NA 4JYFA 3LTPA 3W3OA 4WUIA 2XN2A 5CG7A 2VFIA 4N02A 2DU2A 2J9YA 4LWWA 4FNPA 3LXAA 3N14A 2ZZ7A 1LCOA 4UTKA 1KLZA 3ZWTA 1H60A 5HMSA 4PH6A 4O4VA 4N6FA 3ELFA 3TQKA 3LXBA 1H1YA 3BV4A 1YPFA 1SUXA 1SU5A 4FX6M 1JCNA 1BTMA 3LLFA 3B0VC 2DZWA 5EYWA 1EP2A 1PS9A 3EX1A 1JCMP 2C6QA 1AW5A 1VCVA 3S1XA 2ZZ6A 1GVQA 4LVDA 5TBOA 4S2CA 1KV5A 2GOUA 3PY2A 3FLUA 5F4XA 3F1QA 3GR8A 1FDYA 3T40A 4UTMA 1IXQA 2RDUA 3LGEA 4XBKA 1RQEA 3PAJA 1S5WA 2ZRWA 1ME7A 3DXIA 5LNSA 4MLRA 1QR7A 5F4SA 3BLIA 1TPH1 2I14A 4IMFA 3TFCA 2V2CA 4GXMA 4LRTA 3D0CA 4IWWA 3C2EA 5K3VA 1XL9A 3DFPA 2QJIA 2ZTJA 3NL5A 2E68A 5D2WA 4JTTA 3JRKA 3ATZA 1KFLA 2Y7FA 3O6YX 1G4TA 4GUGA 4UMCA 1JVNA 3EX4A 3M5VA 3MHUA 2YXGA 1U5JA 1OFOA 1VS1A 3HBLA 3NO5A 4BWLA 1TTIA 3W2LA 7TIMA 5D2YA 4JR5A 1N7KA 2D73A 4LU0A 3BK0A 1NAL1 2E6AA 4CNPA 1EUNA 3VKJA 8TIMA 1R46A 1A5CA 4UTHA 2ZCGA 3BG5A 4JX5A 3O1NA 3TNOA 1MZHA 1G4PA 1FDZA 5G5IA 4A2SA 4I9AA 5SWUA 1KW1A 1HG3A 3G0UA 3HG3A 5HNRA 5CPNA 5CZJA 1KTNA 4BI7A 2V81A 4O0ZA 2VFGA 5AB3A 1F6PA 3G3MA 2W6RA 3KRSA 3M7WA 1V7YA 1WQ5A 4ORMA 2FPYA 4RX0A 1UUMA 2EAWA 1K7XA 1WX0A 3LHTA 4TU1A 1YPIA 5D33A 2VEMA 3UWYA 4LS2A 1JCJA 2DZPA 2C3ZA 3P74A 4PEKA 5TIMA 5E1QA 3R2GA 3C0JA 2GQ8A 5LNWA 3LCFA 3DU0A 3SR7A 3WJWA 4OBTA 3T4CA 4K7VA 1GVRA 2NXIA 1I2QA 1NEYA 1G7UA 3YPIA 4MUZA 3T78A 1TJRA 4M7TA 3UWVA 3GKFA 1MEWA 3KHJA 4XKYB 1W54A 5AHEA 2H8XA 3VE9A 1QAPA 3CM4A 3L67A 1H50A 1VH7A 4MJMA 3KOFA 1A50A 3L66A 4JICA 4UMAA 4MPQA 2CZEA 4KFOA 1OF8A 4GUHA 1ML1A 3STGA 1JQVA 3W7MA 3LCGA 3NA8A 4X9SA 5F2LA 4NVTA 3TAOA 6ALDA 3EX2A 4K36A 2G95A 2PE4A 5EMUA 5F1UA 1CI1A 3GAYA 2CFFA 3GB6A 4ML9A 2GQAA 5DCBA 5HJLA 4O50A 1P1XA 4E2DA 3W1QA 3S1UA 3L0GA 1ICSA 4FF7A 3DH7A 1UB3A 1DJQA 1KM0A 3MYPA 3Q37A 2WV8A 3BW4A 3WFAA 4W9TA 5G4WA 4PFMA 3BARA 4OQVA 1OYCA 2B7NA 4HSOA 2NX9A 2E09A 1EWEA 3BLFA 1OABA 2EF9A 3HPZA 2YW4A 3OVRA 3W71A 4FHAA 3SFKA 2WO5A 3LHZA 3WK0A 3CC1A 4ZQPA 3CB8A 3HF3A 4JGDA 5L9FA 3PUDA 3GKAA 4I7VA 2J24A 4PTNA 5LGZA 4O8RA 1TJPA 4GC4A 4O1BA 3B0PA 3UQNA 2GVGA 4YCPA 2H3DA 3BVJA 3QPZA 1B9BA 4N2YA 1DBTA 1L2UA 4JTHA 1HO1A 3W23A 4JYDA 2CLFA 1SFLA 4RZ6A 1WXJA 5HWMA 1OX4A 3PULA 3TQVA 2Y6ZA 3A23A 4IUOA 1OHLA 1SO5A 4MFEA 2QUTA 3FEMA 1TPDA 3CIWA 1OK6A 3IIOA 4UUIA 2YX0A 3FA5A 2QCNA 3HOJA 3M0ZA 3INPA 3U6WA 4WY0B 3F4NA 1O95A 3QSTA 3L5MA 4CLMA 4X22A 3NR0A 4JTJA 1M7PA 4LW7A 3NQVA 4WXZA 4YXGA 4GJ1A 2ZA3A 2ZZ3A 2H6RA 4J9JA 3PUEA 1ADOA 3EXTA 5FF3A 3W7HA 3W1PA 4N9BA 1KBIA 2J6XA 1EP3A 5D2VA 3ABOA 2QDGA 1B3OA 3B05A 3UWZA 1ZHAA 1KFKA 1VC4A 1Z41A 2FQIA 2QCEA 4C1KA 4DPPA 1H62A 1BKSA 1XI3A 5GVJA 3CEPA 4H4IA 4RXGA 3W07A 4DF1A 1FBAA 2JKPA 3BG3A 5D02A 3OHIA 1KFEA 3C2OA 5CGQA 3B06A 4IPIA 1TPC1 1O60A 3W1XA 1GYLA 2Z2UA 3R5EA 3W76A 2CLIA 4ZVJA 1Q6LA 4QISA 3TE9A 3PWAA 5U4NA 1YYAA 4UTJA 3NQGA 4GRSA 4K6AA 4H3DA 4HNVA 3EEGA 2A7PA 5D30A 5K9DA 2WPBA 2Y7DA 1G69A 1WBJA 4MYAA 4UNKA 4IPJA 2PRHA 1S5VA 4R7JA 3M16A 4QIUA 2NX3A 3NQ2A 1QPRA 5AYYA 5DBUA 1T99A 3NM3A 4BK9A 3WJSA 5IBXC 1GPWA 3NQ7A 3S5NA 4YLWA 3TDFA 3A5FA 2YYUA 4HIBA 3QPYA 2ZRYA 3LHUA 1W3IA 5DCDA 1VLWA 3G1DA 2JKAA 1FUYA 1Q6OA 3G22A 3VI2A 4O54A 3Q94A 4JS3A 1AW2A 4PL2A 5AHLA 2V5BA 3BW3A 4UTUA 1TRDA 3T55A 3DKJA 3B8DA 2TRSA 2OJPA 3E96A 1KA9F 3M44A 1GVOA 3PBWA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3NZ1A

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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