3O1NA

1.03 angstrom crystal structure of q236a mutant type i dehydroquinate dehydratase (arod) from salmonella typhimurium
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
252
structure length
252
Chain Sequence
MKTVTVRDLVVGEGAPKIIVSLMGKTITDVKSEALAYREADFDILEWRVDHFANVTTAESVLEAAGAIREIITDKPLLFTFRSAKEGGEQALTTGQYIDLNRAAVDSGLVDMIDLELFTGDDEVKATVGYAHQHNVAVIMSNHDFHKTPAAEEIVQRLRKMQELGADIPKIAVMPQTKADVLTLLTATVEMQERYADRPIITMSMSKTGVISRLAGEVFGSAATFGAVKKASAPGAISVADLRTVLTILHQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A conserved surface loop in type I dehydroquinate dehydratases positions an active site arginine and functions in substrate binding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 3-dehydroquinate dehydratase
molecule tags Lyase
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus 99
structure length 252
sequence length 252
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.10: 3-dehydroquinate dehydratase.
pdb deposition date 2010-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01487 DHquinase_I Type I 3-dehydroquinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3o1nA00
4FIRA 1JCYA 4EWND 3S9YA 3NPVA 3UXAA 3QMRA 4FNPA 2J9XA 1F7BA 4FIQA 4WY0A 3QPZA 1AG1O 3TSBA 4CCEA 2QUVA 2B7QA 2Y7FA 3L9CA 5E1QA 3F03K 1H60A 2A7RA 3TSDA 4GE8A 3QMSA 4ZMGA 3ABOA 2NV1A 3DFQA 5EY5A 2TPSA 3MUXA 3S0CA 4S1FA 1DJQA 3MP4A 3TDFA 6ALDA 1JRBA 5HNRA 1VHCA 3UWVA 3HO8A 3BLIA 3BO9A 3MHUA 2QUTA 3FJ6A 1HL2A 1TSIA 4RXGA 4G1KA 4EVZA 3NM3A 2NUYA 3QC3A 2ZYFA 1JUKA 3W86A 1DKWA 3C2RA 1H50A 3P8IA 4TX9A 3UWZA 1S3HA 2GOUA 2GJLA 1T96A 1EA0A 2CLHA 3E49A 3BK0A 4JS3A 1IIGA 3SIZA 4Y90A 3S5YA 5G4WA 4TMBA 4WD0A 2AAMA 1JR1A 2Y62A 5CKSA 2FB3A 3PUEA 3DFTA 1H1YA 1QNVA 3ATYA 1YADA 2RDTA 1G7VA 3MYOA 4IQLA 2B7NA 4FNUA 3IIZA 3TC6A 3L0NA 3NL3A 5CZTA 4NZJA 1TV8A 4R53A 1T8XA 1IXPA 1X1OA 5H2ZA 3TU9A 4RZ5A 1QPRA 5CPOA 5FF2A 5EL1A 5IM51 2VFIA 3NA8A 4Q33A 1DBTA 1YTEA 3MO7A 2ATMA 3ZFHA 3BGJA 1KA9F 1Q6OA 1I2PA 1WYIA 4AWTA 3L5LA 1QWGA 4LS2A 1FDZA 4UTUA 1M7PA 5DLCA 1TPB1 3LHWA 1WV2A 1A53A 2VFGA 4M7SA 3K30A 4XKYA 2F7FA 4JYEA 4DF1A 4M6PA 1DQWA 3HB9A 4UNKA 4N02A 1HFBA 1GYLA 4O18A 1SUXA 5A5WA 4PL1A 4J9JA 4UUIA 5AFDA 4N2YA 2R8WA 3DXIA 2RFGA 3FEMA 2Q8LA 3G1FA 1RPXA 3KVJA 4JTFA 3N14A 4EF8A 2WNZA 3G24A 3UNDA 1AL7A 3QSTA 4MZYA 5FF4A 1WXJA 1F2JA 3LLFA 5AB3A 1AL8A 1SPQA 1F6PA 1EPXA 3GIYA 1QFEA 3W7MA 5F4XA 3NG3A 1VLWA 2OCZA 3P61A 1ME8A 2A21A 1LRNA 2C19A 2ZTKA 4UFMA 3S6DA 4P2VA 4GUFA 4L4LA 3NXFA 3I65A 1J5TA 4ZQOA 3EB2A 3NDOA 3TE9A 1SFJA 3W1UA 2V5BA 2EKCA 1YYAA 3PF3A 4UTWA 3N2XA 1LBFA 3LCXA 2V2CA 4KFOA 3QEZA 3JRKA 1JCNA 4TIMA 3A24A 4TU1A 4MY9A 3C2OA 2CLKA 4R7JA 2G97A 3TQ0A 3LV6A 4O14A 4O12A 2BTMA 4PFMA 1KLZA 4LTSA 2ZRXA 3PBVA 2G5WA 4QJ1A 3S1UA 2VC6A 3EKLA 2YCEA 1X6UA 3W7CA 3KRZA 3IVTA 3DENA 3Q2DA 5D02A 2ISSA 4GUGA 2EHHA 2DZPA 2ZCGA 1QMLA 1K8XA 1VHNA 2C13A 1LLZA 2WSYA 3QFEA 4WX2A 2QDGA 4FNSA 3EWZA 1XC4A 4WY0B 2GVGA 4OE7A 4O15A 2B7PA 3MYPA 3D0CA 2ZBTA 1FCUA 1OX5A 2X2GA 2C16A 1YPIA 2D73A 3LCHA 3E96A 2PRHA 2VFEA 4YL2A 4FX8A 3H54A 4OBTA 1DORA 5AHNA 1TB3A 3PBYA 3W2UA 4OWGA 5K4XA 8TIMA 4MIMA 1K3UA 2QCEA 3GXTA 2NXGA 3W9ZA 2W79A 4JTJA 1W56A 4DQWA 5BW6A 5AC8A 3M44A 2P0OA 1G4EA 1OFDA 4NNBA 3IIXA 4RZ4A 3ZWTA 4BK9A 4ALDA 3O07A 3NR0A 4FHAA 4MZ8A 4UTTA 4ORIA 3FKKA 2ALDA 3MP3A 5T26A 4IMEA 2E77A 4GNJA 5I3GA 1O95A 3NQ7A 3R89A 2WV8A 2FQIA 3B4UA 3C2EA 4IWWA 5EKYA 4PH6A 2FPYA 2QCGA 5G2WA 4QQ3A 2QJIA 4JNMA 3B0VC 1UUMA 2YX0A 3I7SA 4MLRA 2Y85A 3PWAA 1GPWA 5FF3A 2Z0IA 4NXSA 3N3MA 4O1BA 3KVMA 4WY0F 4UTIA 1A50A 1H7OA 4XBKA 3W1TA 1GG1A 2QEZA 1KM1A 1H51A 4A21A 1YLVA 3QF0A 3HIJA 1L6YA 1MEWA 2Z6JA 4ZQMA 3TSMA 3PY2A 5DXYA 3R8RA 4UC5A 2VFHA 4C1LA 3RK8A 4XKYB 4MFDA 4O50A 2H8XA 3B03A 2C1HA 4WQ6A 1QPOA 3OEXA 3VCRA 3VNDA 2X1RA 4LVGA 3C2FA 1MXSA 2ZZ6A 1W5NA 1OYCA 1Q6QA 1SW7A 1QPNA 1WOAA 3DGRA 1IXOA 1KLYA 2NX3A 4JXCA 5AHEA 1TQJA 3W85A 2BZNA 3EXRA 4M19A 4IXXA 4Z0JA 3TA6A 2QAPA 2QJGA 3R13A 4O16A 2YDAA 2V30A 4BWLC 1I2RA 3TUUA 1TMHA 4GRSA 1P1XA 4CCCA 1SQ7A 1XFBA 4RK8A 1TQXA 2BXVA 3CU2A 4CQ9A 3GNDA 1ZAIA 5BMWA 4H6KA 3PC0A 5DCEA 2NXIA 3T40A 3W7EA 4LV4A 2VFDA 4I7VA 5AYYA 1KBIA 3CLMA 3M5XA 1W5QA 2QCLA 4JEQA 1R30A 3NQ6A 4N9EA 4AWSA 3PUOA 4NJJA 3W1MA 4OV9A 4X2RA 4IX0A 4FEZA 1L6WA 1S5TA 4MKNA 1NVMA 1KM4A 1ML1A 1TTPA 2CLLA 3BVJA 3SSJA 2FPVA 4NUWA 2I9EA 1RZMA 3THQA 1ZENA 4BF9A 3LHYA 4JTTA 2ZTJA 1GWJA 4FNTA 4XWUA 2JK2A 3KVKA 1GOXA 3WFAA 3HBLA 3W7NA 2E6AA 3AO0A 1JCXA 1W0MA 3PM6A 4AHQA 3INPA 5C6MA 5D2WA 3CPRA 1JQXA 5GVJA 1KM5A 1B3OA 1C9DA 3GDKA 3JS3A 3R2GA 3L2IA 3LB0A 1PL9A 3PB0A 3LERA 4NQ1A 1FCVA 3N9RA 3SY5A 4UXDA 4ZQNA 1LRTA 3DHFA 4NJHA 1LP6A 2P10A 2Y63A 4ONVA 2NWSA 5AHFA 5I3HA 5CG7A 1F6KA 4DEFA 3DFPA 3P62A 1Q6LA 4O57A 4JYFA 4O52A 1WX0A 2HS8A 3BG5A 3B0PA 4QSHA 1XI3A 4BI6A 2DZVA 2OT1A 5KMYA 2J24A 3LXCA 3T7VA 4AAJA 1G67A 5G5IA 2ZZ7A 4O4WA 4WOZA 1ZFJA 1LBMA 5F1VA 1C29A 4PA8A 3TV8A 3IIVA 5HULA 3QQ1A 5D2YA 3TCEA 3CTLA 4D2JA 3EWXA 3M7WA 3HPSA 1JUEA 1V7YA 3NQ2A 4IMGA 4IUOA 5HR7A 4DPPA 4GBUA 4WXYA 4JDYA 3EX3A 3MBFA 1FXPA 4O4VA 5HMSA 3EX1A 2C0AA 5D09A 4OGZA 3WJWA 4CQ8A 3P5ZA 5H91A 4JICA 1VLIA 2QCDA 1W54A 3BW2A 1QR7A 1AW2A 1W3IA 3FJLA 3G1AA 2WSRA 1F76A 1KFKA 3L67A 3Q58A 3PULA 4X22A 5F4WA 3NQFA 1RQBA 4JR5A 3EEGA 3NL6A 2W6RA 3TROA 3W7LA 4RR4A 1OVDA 3NAVA 2HSAA 1OFEA 3EKZA 4UR8A 3NOEA 1YDOA 5U4NA 5C55A 5G1YA 4IGHA 2XN0A 3EX4A 2BLEA 2E09A 3QH2A 4CNPA 3W83A 3ZR4A 5K9DA 5D2VA 2BX7A 1V5XA 4K8HA 5DN1A 2ZRYA 2VFFA 3CC1A 3HG2A 4QISA 3W7IA 1T99A 1JRCA 4MJZA 1DQXA 1SO3A 4A22A 4HNNA 1DVJA 2TRSA 3BGGA 3EWWA 4QIUA 5FI8A 5IBXA 1SO6A 3W7HA 3I7QA 1KFCA 2GQAA 3FLUA 1UB3A 4K7YA 2QCHA 2A2IA 1NSJA 5AYXA 2ZZ3A 4JN6A 4LS0A 3RLUA 2YFNA 3O15A 5HUPA 3LXAA 1G6CA 1TYGA 2DP3A 3TAKA 1C8VA 4JTUA 5HWNA 1QCWA 2J9ZA 2VENA 4E0CA 4UFHA 2VEPA 1GZGA 1OK6A 3GLCA 4FNQA 5DCBA 3W2MA 1DV7A 2JKEA 2CZDA 2YW4A 1TPC1 4ML9A 2WQPA 4RCXA 4EIVA 1HO1A 1IIHA 1JCLA 1EUNA 1TV7A 2FDSA 2Q3RA 1EWEA 3HOJA 1SO5A 2WSQA 3NPWA 3VE9A 5BRBA 2J9YA 2F84A 1P5BA 3TJLA 3GXPA 5D37A 4O1CA 5I3KA 3TMLA 3N34A 3LTSA 1KTBA 1VR6A 2AQWA 3GB6A 5DCDA 4JIPA 4PEKA 3M6YA 2X1SA 3TW6A 1QO5A 1O5XA 2RDWA 2NV2A 3W6YA 1VH7A 5HWMA 5D32A 1Z48A 1K7XA 3W2NA 1N7KA 1XUUA 1Z41A 4CCDA 4IPJA 3G1HA 3GX9A 3HPZA 5DBUA 2JGQA 2Y89A 4Y96A 2VKZG 1PE1A 2BWGA 2VEKA 3KHJA 4AHPA 2ZA2A 4NNAA 1ZALA 1K8ZA 1R2RA 4YWIA 3G18A 1PCKA 4R34A 4UCGA 2QCFA 2CLIA 4RX0A 3E12A 4JTHA 3W1PA 3M0ZA 2V81A 4QITA 4NU7A 3PAJA 2O7SA 4ICNA 3T44A 3QJAA 3VE7A 1LYXA 4DO5A 3UY7A 3OHIA 3LX9A 1ICQA 4WJEA 1VQTA 2V8ZA 3EX6A 2VEMA 3W1LA 1U5JA 5G1TA 5C5YA 3GVGA 4JTIA 3M43A 4K39A 1JJKA 1LOSA 3VI2A 4LWWA 3N2MA 1QPQA 1BTMA 2A1YA 2OZ0A 4LS1A 3S5ZA 3LI1A 3LRLA 3TK7A 4YCPA 4JIQA 1G4TA 3LHZA 3A9IA 1VS1A 1VCGA 4XBSA 3NL2A 3C6CA 1NEYA 2KZHA 2QCDB 2ZQ0A 2JKAA 1F5ZA 5CGQA 2RHGA 1ICSA 1UJPA 3C4UA 5D33A 2QCNA 1W5MA 1G7UA 2CW6A 4A2RA 5BNKA 4M6QA 1K03A 1KTCA 2ZFAA 1Z42A 1I2NA 1I8JA 2VXNA 3FYPA 3LTYA 4JY8A 1TJPA 1TRDA 1W37A 1FWSA 3BLEA 4Z1DA 1KBJA 2V0TA 3PBUA 4K38A 4XQ6A 4AH7A 5U7SA 3CHVA 2GJNA 3O6YX 4IMFA 4TR9A 3L21A 1FWRA 4MY1A 2CLMA 5DBTA 1XKYA 2EAWA 2B0MA 2PRLA 3S8HA 4XUGA 1H7PA 2GVLA 3FIGA 4NX5A 1YXDA 2Z1BA 2ZRVA 4KKXA 3W7QA 3W7DA 2CZEA 1W3TA 1LBLA 3LHTA 4UFLA 3IGUA 3IIOA 1MEIA 1KFLA 5D30A 1KM6A 2Z6IA 1VYRA 1TREA 3OVPA 2ZRWA 4UTHA 1OX4A 1SW0A 4AXKA 3MP5A 3NO5A 2ZZ5A 2J6XA 3TH6A 3PG9A 3FFSA 1FUYA 1A5AA 4AB4A 1H63A 2WNQA 5I3FA 3DKLA 5C2XA 2PRMA 4UTJA 3PR2A 3GDLA 2E68A 1QO2A 4U28A 4LVFA 4Z08A 2ZRUA 3L0KA 1KV5A 2TSYA 1GVFA 1TIMA 3WK0A 4A2SA 3Q94A 4JY9A 4N9BA 1K02A 5AN7A 4AVFA 1HUVA 2VELA 3P80A 4ADTA 4H3DA 3GDMA 3MHFA 4IX2A 1ZY9A 5MHBA 1B4EA 1RQEA 2CZFA 1D9EA 4MJMA 2RH9A 3NGJA 3W70A 2FFCA 1TPH1 1QAPA 3PG8A 1FBAA 3W1RA 4M5PA 1KM3A 1H7RA 1SU5A 1TJRA 4UMAA 3QSRA 1FY6A 2NWRA 1NFBA 4R33A 1NF0A 1R46A 3C61A 3CM4A 2R94A 5D05A 1BEUA 3G0SA 3LI0A 4O8RA 4DBDA 4MLJA 6TIMA 4WZHA 3W88A 1MZHA 2Y7DA 2FB2A 4K37A 2TYSA 4B5NA 3UPWA 3W87A 1TPFA 4BI7A 1DHPA 1FDYA 2H3DA 3TQKA 1L2UA 1W8SA 2I14A 2ABAA 3MHGA 3TMQA 3STEA 1EIXA 3SECA 2ZZ1A 3OG3A 1M6JA 1OABA 2NUWA 2V2DA 2NX9A 5DXXA 1JQVA 5CZ0A 3ANYA 5DELA 4ZQCA 2ABBA 3YPIA 2Y7EA 1IXQA 3T55A 3HGOA 4ADUA 4UTWC 1OK4A 4LV9A 2CZ5A 4UTKA 1GVRA 1LLWA 5CZSA 5DY2A 1R2SA 1UASA 3L0GA 1F74A 5C54A 3LGEA 4XTIA 2E5BA 3SI9A 1FWWA 3FOKA 1H5YA 4N4PA 3EXSA 2A85A 5FF0A 2HTMA 4NZFA 1OFOA 4O10A 1N55A 3RNDA 5DY3A 3NQDA 3LCIA 5ABTA 1GEQA 2YXGA 5FF7A 4XTDA 5CPMA 1TTJA 4OQVA 5AHIA 4IPIA 4UFKA 3HQ1A 3UY8A 3BLFA 4PCFA 5CZJA 1I4NA 1EX5A 1NF7A 3SW6A 1UCWA 1CW2A 1RV8A 4O19A 4RLIA 1K8YA 1BKSA 3G22A 3USBA 1VGAA 3O6DA 3A5VA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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