3O63A

Crystal structure of thiamin phosphate synthase from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
222
structure length
214
Chain Sequence
HMHESRLASARLYLCTDARRERGDLAQFAEAALAGGVDIIQLRDKGSPGELRFGPLQARDELAACEILADAAHRYGALFAVNDRADIARAAGADVLHLGQRDLPVNVARQILAPDTLIGRSTHDPDQVAAAAAGDADYFCVGPCWPTPTAPGLGLVRVAAELDKPWFAIGGINAQRLPAVLDAGARRIVVVRAITSADDPRAAAEQLRSALTAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure and Identification of Potential Inhibitor Compounds for Mycobacterium tuberculosis Thiamin Phosphate Synthase
rcsb
molecule keywords Probable thiamine-phosphate pyrophosphorylase
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 74
structure length 214
sequence length 222
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.3: Thiamine phosphate synthase.
pdb deposition date 2010-07-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02581 TMP-TENI Thiamine monophosphate synthase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3o63A00
4N9EA 1SUXA 1HFBA 1KBIA 1TJPA 3TU9A 4OGZA 3PBVA 3NQEA 5AN7A 4OU1A 3IIZA 2H3DA 3UXAA 4BFAA 3FYPA 1HL2A 3PUEA 1KFCA 1DVJA 4FNTA 4AHPA 5KINA 3CQ0A 1KFKA 1K7EA 4UIOA 1TPC1 2J27A 3W2KA 1LRQA 2YSWA 3B8DA 3W22A 4FO4A 4EWND 4B5NA 4JICA 2WOQA 5K9DA 3DFSA 2V81A 3TW7A 5AB3A 2B0MA 1XUUA 1AG1O 4AXKA 2YR1A 2Y7DA 4MFDA 4JTHA 4QAIA 1V5XA 4C1KA 2D73A 4RR4A 5BOOA 3ZFHA 1EA0A 1A5CA 1XUZA 3W7QA 4LS2A 2NV1A 3C4UA 1FCQA 3GLCA 4LT9A 3BW3A 3EX3A 5D33A 4O0ZA 5K4ZA 4WQ6A 3C2OA 1AW2A 1L2UA 3PG9A 1L6SA 3W1MA 3MW7A 4N9CA 3G18A 1FY6A 1GVRA 1FX6A 4TX9A 3NQVA 4CLMA 1DQXA 3L5AA 3O15A 4NJIA 3LTYA 4P2VA 3BW4A 2Y7FA 3EEGA 3KRSA 4RJEA 3NQFA 3N9RA 4XWUA 3R5EA 2PE4A 4A3UA 5C5YA 2ZZ7A 3CIXA 3NEVA 1VLWA 3LLFA 2QCHA 4JTSA 1SO3A 2H3BA 4O14A 3KVJA 3DH7A 1S3HA 3UWQA 4RZ4A 3LX9A 3HQ1A 4O28A 3V75A 3I6RA 4O1BA 3OIXA 2RDTA 3LHUA 5DBTA 2GVGA 2OX1A 1H7OA 1W56A 3EWYA 5F4WA 5F2GA 2Y6ZA 5EKYA 2WPBA 4GBUA 3B03A 4MJZA 2CLLA 4UR7A 4EIVA 3W6YA 1MEWA 2GPTA 3BW2A 3C52A 3YPIA 4LC8A 3UYCA 3ZWTA 1W37A 5HWNA 2A21A 2ZQ0A 1I2NA 5FEXA 4M7TA 1W5NA 2ISWA 2XN2A 1PL9A 4MJMA 1YXYA 1Q6LA 2CZFA 3FS2A 3UY8A 1THFD 1TRDA 2JGYA 4Z1AA 3JR2A 1JUEA 1TV7A 4CNPA 3A9IA 4JXCA 3C56A 1B57A 2QUTA 2DJLA 5AHFA 1DJQA 1XBXA 4NXSA 3CLMA 3G3DA 2OT0A 3PC0A 1QMLA 3L0GA 4UTJA 3HPSA 3TSBA 4GUFA 3U2OA 3KRUA 4C1LA 2ZTKA 4L4MA 5KZMA 2NUXA 2Q8LA 3P81A 5A8GA 2FQIA 2QAPA 3PAJA 5C2XA 3BV4A 4K8HA 1TJRA 1LLWA 3IEBA 1PE1A 1ZHAA 4LRSA 3IV3A 3IIOA 3NZRA 3VKJA 3OVPA 4MZYA 5CSSA 4MLJA 3B05A 4QJ1A 1G7UA 1TRIA 2Y61A 4TMCA 4NJGA 4M7SA 1PV8A 4AWSA 1I45A 2Y63A 1PHWA 2XN1A 3PBUA 4UFJA 1LTDA 3KFTA 3THQA 3LHVA 3FKRA 3C8FA 5G4EA 5FESA 1GG0A 1L6YA 5G1YA 3LRMA 3O6DA 1MXSA 5CZJA 3UY7A 2FFCA 4X9SA 1Q6OA 3RFAA 1NF0A 3UPBA 4ZQNA 3H53A 1DBTA 4FNQA 3BG5A 4FNSA 1OYAA 3SW6A 1M7PA 4NJKA 2YW3A 4HHPA 2C6QA 1RQHA 3W75A 2V82A 3L5LA 4DXVA 4R53A 3FJLA 3EWWA 3W72A 4QQ3A 2E6DA 1GVQA 4L4LA 4BWLA 2QCDB 2WQPA 3KRZA 2QCCA 5K2ZA 3GZ3A 1JULA 3B04A 4J9JA 3OVRA 3LLDA 4M19A 5I3FA 4LV9A 1J5TA 1PS9A 2J9YA 3EKLA 1VYRA 1F73A 3TQKA 5DLCA 1F7BA 3LXBA 2X1UA 5EYWA 4BK9A 2WO5A 1G67A 3W1PA 4IPIA 3NQGA 4GFSA 2Z6JA 4KKXA 1FDJA 4Z0SA 1L9WA 2EAWA 1IGSA 1KW1A 3VE7A 2JK2A 1KLZA 4IX0A 3LOTA 1ONRA 3SGUA 1EPXA 2TPSA 2ZRXA 3L67A 4GWEA 3NOEA 3RMJA 1H50A 1JUBA 3P82A 4EF8A 3LV6A 2ZRUA 4DBDA 3PB0A 1QOPA 5BMXA 4UTKA 2WNZA 4RLIA 3W1UA 3KAOA 1W31A 3N3MA 3PBWA 3R13A 4O17A 1XL9A 2PRLA 3HG2A 1TQXA 1GYLA 3HPZA 1O5XA 3GNNA 3NXFA 4XBSA 1QPQA 5LGZA 1JCXA 1UCWA 3DHFA 3QRHA 1ZENA 3LDVA 3TROA 3ZWSA 3T7VA 5AHIA 1CI1A 4BI5A 4RX0A 4UFMA 1K8XA 3B0UX 2YZRA 1HTIA 4AHQA 3M6YA 3OBKA 1BWLA 4IMEA 4TIMA 3T4CA 2VEKA 1BTMA 3ABSA 6TIMA 1TPB1 3NL6A 1GG1A 2EHHA 5G2IA 1EP2A 1A50A 2O7SA 3NR0A 3L5MA 3KVLA 4O11A 2QJGA 2DZUA 4IPJA 4FB7A 2FB2A 3TKFA 3N73A 2UV8G 1UUMA 2VENA 1TQJA 1VS1A 1A5SA 4ORMA 3H55A 3KVKA 5HR6A 3B0VC 1G4SA 3W2UA 1H62A 1EP3A 3NQ7A 1KTCA 3BVJA 3CPRA 3W7KA 3SIZA 3QJAA 3C2RA 4H6KA 3G1XA 2RDUA 3O06A 3BARA 2I9EA 4A22A 5EL1A 3HPXA 2DZWA 1H7WA 1RR2A 3EXTA 4O15A 3E9AA 3TV8A 3TK7A 2VFIA 3TFCA 1OFPA 4K8EA 3G1SA 1FWWA 2C16A 2FB3A 4UTTC 5T26A 1I2RA 3LCWA 2B4GA 4FHAA 5IBXC 3UWUA 3L21A 1ZALA 1LLZA 2W79A 3NGJA 3TAKA 2P10A 3W76A 3L0NA 1P5BA 1Q45A 3QC3A 1A5BA 2WKJA 1J2WA 2DZPA 3G0UA 3MI2A 5EY5A 1LROA 1O95A 1S5TA 1YTEA 5FF0A 3HO8A 3O05A 1GQNA 1TPDA 2V5LA 2E5DA 1OYCA 4GUJA 2JKPA 3W87A 5KZEA 3NM3A 3W7LA 1CW2A 5I3KA 5CGQA 3MYOA 1D3GA 3Q37A 1VPXA 1ALDA 4LS1A 3NQAA 4FX7A 2C18A 4UFIA 4K38A 1QOQA 3VNDA 4H4IA 3G1FA 4ALDA 1O4UA 2VEMA 3T55A 1VCGA 2QJHA 4YLWA 3UZJA 1F2JA 3LRLA 3PWAA 3TXZA 5FEZA 5LNVA 3BK0A 3ATZA 4ZL1A 4FIQA 2E5BA 2E6FA 5G4WA 4CNOA 3MI6A 3MO7A 3TC7A 1OFQA 3DU0A 3W1RA 3W1QA 1HUVA 4NUWA 2WSYA 1SU5A 3ABOA 3QW4B 4CCCA 1GEQA 2FPYA 2ZBTA 4DELA 3UWYA 3Q2DA 1XBZA 3QZEA 4N6EA 2ISVA 4JDYA 2QCNA 3WK0A 3M43A 2YFNA 4AAJA 1GVFA 3GR7A 3W7DA 1F76A 3W2LA 4MYXA 4M6VA 4XQ6A 1ME7A 1T0OA 1T96A 4YL2A 2QJIA 1YADA 4RCXA 4GNJA 4LUJA 3GYEA 2P1FA 1RVGA 4K7YA 3IIVA 4A2SA 3NM1A 1MSSA 5HUPA 1I2OA 3N34A 1EWDA 1OX4A 5CPLA 3CB8A 2A1YA 1QO2A 4PC8A 2ALDA 2DZSA 4NX5A 4O52A 3IGSA 3DXIA 3W1TA 1SW0A 4RKAA 5J5RA 1FCVA 5DN1A 3T78A 3D0CA 3DFOA 5FF4A 1IXPA 3TNOA 3UWVA 2V2HA 4NNBA 2R8WA 3GXNA 3LM7A 3L0KA 2ZZ6A 4PA8A 1GVOA 2ZTJA 1EUNA 1Z42A 5D30A 3UZ5A 5AFDA 1MEHA 3OG3A 4PTNA 3GKFA 3G0XA 4HPXA 3BG3A 4WY0A 1Z41A 3STEA 4N4QA 1K03A 2ZZ2A 4KFOA 1Y0EA 2X16A 3SECA 1SFJA 4MPQA 3P67A 2A7PA 4O54A 3UNDA 4UMAA 1B4EA 1WBJA 3TA6A 2RKXA 1W5QA 4GUHA 1WAUA 1XC4A 1OFEA 4K36A 3C61A 3WJXA 3G1HA 3H54A 5K9CA 1TPWA 3G3MA 1JCLA 3TXVA 3O1NA 1VR6A 2ATMA 1TPVA 1BEUA 2YYUA 3TDFA 1LBLA 4RXGA 3LB0A 2H6RA 1KA9F 3HBLA 5EA9A 2ZZ3A 4ONVA 4HKPA 1SZGA 5D04C 1U83A 4O4WA 3LBCA 2A6NA 3LRKA 3S8HA 3NL5A 1R2RA 3P7YA 1OYBA 2ATSA 2EPHA 1KM4A 3STGA 3FOKA 4UTLA 4AHOA 4WUIA 1G7VA 1YDNA 3P62A 4ZMGA 2Z0IA 3S1XA 4IMDA 2YXGA 2ZA2A 5KTLA 4CCDA 3GXPA 4Q32A 4FNRA 4MLRA 1JR1A 3TSDA 1WOAA 4LRTA 2RHGA 1DHPA 1YTKA 4JTLA 4MVAA 5CG7A 1LDCA 3HGSA 4MY1A 4NZFA 5A5WA 4HNVA 3CEPA 4ADTA 1W3NA 3W71A 2XN0A 1MEIA 1VLIA 3EWZA 5FEWA 5CKSA 1TV8A 4MY8A 4WOQA 3TJXA 3QMTA 1H7XA 1SO6A 2X1SA 4DO5A 2GVJA 4DF2A 5D2VA 1WXJA 2Q8ZA 2BWGA 1R2SA 3NQDA 3FLUA 4I9AA 3F4WA 2RH9A 5AC8A 4E2DA 4AF0A 2WNQA 4N9BA 2C13A 3C2FA 4R34A 5C54A 4MOZA 2G96A 4PEKA 3MP3A 2A5HA 3QH2A 5BW6A 2BTMA 1YTDA 5I3IA 1UB3A 3QSRA 3AJXA 5TQLA 3QMRA 1J4EA 3DGRA 4IGHA 1KV8A 4ADSA 1R2TA 3STCA 3QQ1A 2FTPA 4BWLC 1R30A 2NWSA 5HNRA 4Z1BA 3JS3A 4QSHA 3CWNA 1FQ0A 4XKYA 3DZ1A 1YYAA 4DBEA 3V1PA 4GRSA 1YPFA 4JX6A 3FFSA 4ZQCA 5HUOA 1DJNA 2VEPA 2YW4A 4CQAA 4ORIA 2CWNA 2CZEA 3PY2A 4JTUA 4IX2A 4JY9A 3IVSA 1DV7A 2OT1A 5ABTA 2OMAA 1B9BA 4EVZA 1RD5A 1EIXA 5LNRA 2Z2UA 5TIMA 2DU2A 5CSRA 2O7QA 4JTJA 3DKJA 5AYYA 2ZRYA 3EX6A 3GIYA 2KZHA 1OABA 2AGKA 3P80A 2H8XA 1IIHA 2ZRVA 3C6CA 3ZR4A 3P8JA 2EGZA 3FA5A 3PG8A 1AW1A 4JTKA 4RZ5A 3GDTA 3TQVA 2YDAA 1OJXA 4K7VA 2PCQA 3ATYA 3S42A 4AMAA 5F2LA 3ABRA 4IMCA 3HGJA 1XXXA 3QPYA 4TO8A 1FCBA 2ZCGA 5F1VA 1GZGA 2VEIA 2VFDA 4LC6A 1ME9A 2CLFA 2NLIA 3ABQA 3THAA 3P5YA 3WJYA 5LSMA 1XDLA 4NZJA 1H1ZA 2QUVA 3GAYA 2PRHA 4LY8A 2JBMA 2QDGA 3GDLA 3LHWA 2V9DA 2E5CA 1EP1A 2GQ8A 3NO5A 1T8XA 2QCLA 2Y7EA 3NQCA 2CLOA 4UFHA 4XTIA 3S5YA 1QPNA 4O12A 4X3ZA 1OF6A 2VFHA 3KOFA 1UBSA 1VHNA 2VELA 4HSNA 3PSWA 1SSDA 1SPQA 3HB9A 4WXZA 3FKKA 4LTSA 4AWUA 3S0CA 3M0ZA 1OFBA 3G8EA 4E38A 2VC6A 2QF7A 4NU7A 3NYZA 4XUGA 4PL1A 1LRNA 4O18A 2E77A 5CZSA 1VZWA 4FIRA 5EMUA 2AAMA 3OHIA 3TFXA 1H7PA 5D09A 5L9FA 4DO4A 1EEPA 4TMBA 4N9DA 1LRTA 1FCUA 4W9TA 1LM1A 2FLIA 1FUYA 3WK3A 3C2VA 2YYTA 3CTLA 3QSTA 1RZMA 4X2RA 4WZHA 3RLUA 2DZTA 2OCZA 1KM1A 3DFTA 3M7WA 1VCFA 3E49A 1GWJA 3GX9A 1X8FA 1TSIA 3TQ0A 4JGDA 1K7XA 4M6PA 4G1KA 4IOTA 5D2WA 4DEFA 4JIQA 3MHUA 2QAFA 5AHLA 2NX9A 1P0KA 2H90A 1OFRA 1VC4A 1XCFA 5K3VA 3BPWA 3LCXA 3MBDA 4JTGA 2CU0A 3O16A 4N2YA 1C8VA 4BI6A 3FYOA 3M9YA 2YGYA 1ZNNA 1O94A 3DFPA 3EWBX 1R46A 4N4PA 2QEZA 1D9EA 5HWJA 3TC6A 3TIMA 2CLMA 4X22A 1G69A 1H5YA 2QCDA 2TSYA 4QNEA 3A24A 4UTWA 3TMLA 1NF7A 1NAL1 5AYZA 3RLVA 1B4KA 1TMHA 2CLHA 3E12A 2VFFA 4GUIA 3B06A 1LORA 3QW3A 3TCEA 4UNKA 1ML1A 4ZQRA 1GJPA 1GT8A 3EKZA 3MJYA 5HMSA 4S2CA 3N19B 3LCIA 5KSWA 4LOCA 1JCYA 2EF9A 3QYQA 5G2HA 3MMTA 3C3NA 2DJXA 3KXQA 4JEQA 1LP6A 4HSOA 3KVMA 3IVUA 4WXYA 1G4TA 1QNVA 1QFEA 4ML9A 5LHEA 5HWMA 4KWWA 5E0KA 1KM6A 2PRMA 1Q3NA 4Y90A 4O19A 2V0TA 3LHZA 4DPPA 2AQWA 4ADUA 5F4SA 4A29A 4ZVJA 1KLYA 1W0MA 2OJPA 4AB4A 2V8ZA 3M5ZA 5I3JA 3P60A 4N02A 1NVMA 4BF9A 5K7JA 2NUWA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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