3OG3A

Crystal structure of an artificial thermostable (ba)8-barrel protein from identical half barrels
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
242
structure length
242
Chain Sequence
MQRVVVAIDAKRVDGEFMVFTHSGKKNTGILLRDWVVEVEKRGAGEILLTSIDRDGTKSGYDTEMIRFVRPLTTLPIIASGGAGKMEHFLEAFLAGADKVSINTAAVENPSLITQIAQTFGSQAVVVAIDAKRVDGEFMVFTHSGKKNTGILLRDWVVEVEKRGAGEILLTSIDRDGTKSGYDTEMIRFVRPLTTLPIIASGGAGKMEHFLEAFLAGADKVSINTAAVENPSLITQIAQTFG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Design of an artificial thermostable (BA)8-barrel protein from identical half barrels
rcsb
molecule keywords Imidazole glycerol phosphate synthase subunit hisF
molecule tags De novo protein, lyase
source organism Thermotoga maritima
total genus 77
structure length 242
sequence length 242
ec nomenclature ec 4.3.2.10: Imidazole glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date 2010-08-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3og3A00
1W31A 2J9XA 3G1YA 3PG8A 4EOUA 1QWGA 4BK9A 2W79A 4KWVA 1MO0A 4XWUA 3PULA 3W3OA 3QMSA 5LGXA 5D2TA 1W5OA 3TW7A 3KX6A 3W88A 2GVGA 4GNJA 1GVRA 2ZRXA 5LNSA 4OGZA 2DZSA 3HF3A 3M9YA 4GUIA 3IIXA 4NJIA 3O6YX 4AF0B 4U28A 2QJGA 1R2RA 3HPSA 3EWZA 1FWNA 3E0IA 4IOTA 2ZRYA 3CPRA 1J4EA 1PCKA 4O50A 7TIMA 3DI0A 4UMAA 5HQEA 5FESA 1HG3A 2V30A 3KAOA 3LCFA 3F4NA 5D38A 5HWJA 5DBUA 1NAL1 1W3IA 1JUKA 1HO1A 5G5IA 3TC7A 5D03A 2QCDB 3LHTA 4MIMA 2P10A 3C56A 1KM5A 4FNUA 4UFJA 2CLOA 4MYAA 2NV1A 4X22A 3PUDA 3C4UA 3SI9A 1F5ZA 4R53A 2X2GA 3L67A 4WY0B 3HO8A 3DXIA 5AYZA 1RVGA 5IM51 3BW4A 3INPA 3DFPA 3GZ3A 4ZQPA 1UASA 3VFLA 2DU2A 5D2WA 1C8VA 4O57A 1WYIA 5HWMA 4O18A 4OU1A 3LRLA 4NNBA 4NVTA 3NPUA 3NQFA 2EAWA 3N14A 1TPB1 1VS1A 3GDMA 4UR7A 1SO6A 1TSIA 2C1HA 1FCVA 3TW6A 4LS0A 3QF0A 2I14A 2Y63A 2ZTJA 2ISVA 3FJ6A 1RD5A 1SQ7A 5AHFA 3M6YA 4JTFA 4IWWA 2DZUA 3G0UA 1PE1A 3FYPA 2D73A 4CNOA 4CCDA 3S5ZA 3L0KA 2HS6A 4K36A 1WBJA 3LXAA 1P5BA 1VR6A 1GEQA 4MY9A 1N7KA 4N6FA 1ME7A 2A7NA 3CHVA 4MUZA 3LCHA 2OMAA 2O7SA 3CEPA 5K9XA 2CZ5A 4DPPA 2J9ZA 3N9RA 2Q3RA 3YPIA 3LDVA 1D3GA 4BFAA 3OG3A 3WJYA 2QDHA 4MLRA 4GFSA 1FBAA 3RK8A 3P8IA 2Y88A 5FEZA 4LV9A 4RX0A 4IPJA 5BW6A 1VPXA 2A6NA 1Q6QA 4O12A 1W5PA 3S6DA 3G18A 3TKFA 5AHNA 3NAVA 1I2OA 1LRQA 2ZZ2A 2CLLA 3W9ZA 1KLYA 1VRDA 1P4CA 4JYFA 3W2JA 3E12A 3TSBA 2UV8G 2Z1BA 2G5WA 2V5BA 1H1YA 3KOFA 4FX6M 3DFTA 1JULA 1OG0A 3IRDA 3QSTA 1OX5A 1I2RA 2GOUA 1UCWA 3VE7A 1T0OA 1H51A 2QCLA 1LDCA 4UTHA 4BI7A 3LCWA 3RLUA 4JX5A 1B4KA 1Z44A 1W5MA 1B9BA 1JQXA 4S1FA 3CEUA 1FCBA 1H5YA 4OWGA 2O7QA 4O14A 2YPIA 4UFKA 1K02A 1MXSA 2J88A 4HPXA 3OVPA 4HNNA 4MYXA 4I9AA 3S1UA 2QEZA 2Y62A 4IMFA 1DQXA 4GC4A 5I3FA 1QDSA 4LRSA 2YW3A 3PR2A 2QCHA 4FEZA 3S5OA 3RFAA 3TA6A 1TMHA 3NDOA 5D04C 1X7FA 3BW2A 1AW2A 1LOQA 1P0KA 4UTJA 3M44A 3UZ5A 3UWZA 1M6JA 4UTKA 4MJMA 4AWSA 2FB3A 2RFGA 2CLKA 3MP3A 1FUYA 1DVJA 1DKWA 1KV5A 1KV8A 1W3TA 5FF2A 2QR6A 3W7EA 3S1WA 3EXSA 3EWYA 4ICNA 1W1ZA 3W83A 4ZQRA 2NLIA 2HSAA 1U83A 4N4QA 2JGQA 2JKAA 3M16A 3HIJA 2ZZ3A 2QDGA 3S5NA 2DZXA 3UXAA 4JTEA 1XUUA 4ML9A 3N9SA 3UWUA 5AFDA 2JKPA 2BLEA 1H61A 1CI1A 4TMCA 1PV8A 3WJWA 2FTPA 2ZRZA 3TJLA 2OZ0A 1LYXA 1K3UA 4LW7A 4PEKA 3L21A 3NM3A 3M5XA 1OX4B 4ZQMA 3W1LA 4NJKA 2YXGA 3Q58A 3MWAA 3AO0A 1OFAA 1S3HA 4UTUA 3W86A 5LHEA 3MP4A 5J5RA 5E93A 3TU9A 4CCEA 5AC7A 5G2WA 4JTKA 1LLZA 1W0MA 1OFOA 2A21A 3I7SA 1R30A 3CWOX 3LTPA 3ABSA 4NT0A 4JY8A 4DXVA 3NQ8A 1GTEA 4NJGA 4WJEA 3P60A 1W56A 1BTMA 1Z48A 1X1OA 4EIVA 3HOJA 3SSJA 3NNTA 4NZJA 2C14A 3EX2A 1KM4A 2JKEA 4LVBA 4PFMA 3CT7A 2TSYA 3OA3A 2ATSA 1IXQA 3DAQA 1P0NA 2B7NA 3CWNA 2OCZA 3A23A 4LUJA 1NEYA 1K7FA 5AN7A 3F03K 1O4UA 4LVGA 5CPNA 1FCQA 3G1AA 1F2JA 1TYGA 1QPOA 3EWUA 5CSRA 3PF3A 1YADA 1YDVA 3SY5A 5LKYA 4N9EA 3L0GA 3UPWA 1GQNA 3GYEA 4Z1CA 1FX6A 4H4IA 4DELA 3CIWA 4FB7A 4FX8A 4WXYA 4ZQCA 2NX9A 3KVJA 2ABBA 5F1VA 2VFIA 4GUFA 2XN2A 5CKSA 4TIMA 3NQVA 1LBMA 2NUWA 4DQWA 2GQ8A 1XCFA 1H60A 1KFKA 4GE8A 4JYDA 4DO6A 5BNKA 5HJLA 4XBKA 3E49A 1RQHA 1I45A 5HR6A 2GVLA 3N34A 2R94A 3PG9A 2VFGA 5DCEA 3EX3A 3W1PA 1GYNA 1FDZA 4QIUA 3IVSA 4N9BA 3B04A 3EB2A 1F6PA 4O13A 3ABRA 1IGSA 4Y9AA 5K4ZA 3R5EA 2V2DA 4A22A 2YYTA 4QAIA 3T40A 5FI8A 3QMTA 4IJBA 5FEPA 1DV7A 3S42A 3EKLA 5I3HA 3LV6A 3EWWA 3GR7A 5AC8A 4MZYA 4IXHA 5D37A 1TPVA 3KXQA 3QPZA 1RV8A 3RMJA 2H3DA 2YFNA 2X1TA 2E6DA 2QKFA 3MBDA 1PIIA 3B8DA 3WFAA 2WQPA 4WUIA 5KZDA 2PRHA 3CLMA 3TQVA 2Y85A 4DO4A 1GWJA 3G8EA 2XN1A 4A21A 1H50A 3QJAA 2QCEA 2VFFA 2E5CA 2C19A 4IX0A 1KA9F 4HPJA 2VEMA 2F7FA 1G6CA 4L4LA 2E5BA 4Q4KA 3O1NA 4IPIA 5HUPA 1VYSX 4M7SA 3C52A 2FPYA 5AYXA 2NUXA 4M6QA 2VEKA 1I2PA 4I7WA 1ZAIA 4FNSA 3HPZA 1J5TA 1NF7A 3MHUA 4RLIA 3GXNA 3BARA 1JCLA 4WX2A 5J5DA 1I2NA 5E0KA 2QCGA 1H7XA 3WJZA 3UD6A 3SIZA 1OFRA 3F4WA 5DY2A 3I7RA 4AXKA 5KSWA 3CTLA 1D9EA 3N2MA 2CLIA 4E38A 2QUUA 1OJXA 4O28A 1F05A 2QCDA 1OK6A 5CPOA 3NQEA 5EA9A 3G1XA 1DQWA 3WJSA 5AHIA 3M7WA 3TQ0A 3O6DA 1KTCA 3UQNA 4NQ1A 5G2HA 1VZWA 5EL1A 8TIMA 1KFCA 1G7UA 4DEFA 2GVJA 1F74A 5DCBA 4XKYB 4ADUA 4WY0A 3DU0A 3GK0A 1A5CA 2CW6A 1B4EA 2OT0A 2TMDA 3W1MA 2VEPA 3MI6A 3A9IA 1K7EA 1JR1A 1YXDA 3UXDA 1YYAA 1HFBA 4HKPA 3ATYA 1UUMA 4IMCA 1ZAHA 2ZA3A 2E68A 1W54A 4O1BA 1C9DA 1KM1A 2X30A 4UFHA 3TXVA 3W73A 4RCXA 2QUVA 3EX4A 4HIBA 4FNPA 1JVNA 1VGAA 5H91A 3FLUA 3SJ3A 1M7PA 3A5VA 1GVFA 5LNVA 2A7RA 1L6WA 4MOZA 4HSOA 1MZHA 4JDBA 3TMQA 2A7PA 2ZA1A 4UC5A 3P7YA 2CLMA 5C2XA 2WO5A 2PCQA 5C54A 1R47A 2WKJA 3G1SA 3M0ZA 2A4AA 3M47A 2V82A 1DHPA 4S2CA 1QPRA 3E02A 3FKRA 2Y7EA 5G2IA 3W85A 1WX0A 3IV3A 5E1QA 3U2OA 3R89A 1OK4A 1Q6OA 2QCFA 3T55A 2OT1A 2A2IA 1EIXA 4RK8A 1SFJA 5D09A 3MI3A 4N4PA 3L68A 4PH6A 3TC6A 1H7NA 4PCFA 2VFEA 4JY9A 1LZOA 4UFLA 1HTIA 2FJKA 3HB9A 2VFDA 2CLEA 4O4WA 3TSDA 3FJLA 1OYBA 3TQKA 5AHMA 1IIGA 5FF3A 2NV2A 5A8GA 4O1DA 4OE7A 2BX7A 2QCMA 3B0PA 2WNQA 1SPQA 4QISA 4AH7A 1OX6A 2RDUA 3BG9A 5F2LA 1QR7A 3NQMA 1VHCA 5U4NA 3STCA 1KTBA 1TJRA 1W3NA 2Y6ZA 1A5AA 1ALDA 1UB3A 2E09A 3LCLA 3U8GA 4FXSA 3KVLA 4UNKA 2GJNA 1ICPA 3GLCA 3O15A 1YTEA 3PSVA 1CX9A 4ONVA 3W22A 3W7JA 3C2VA 3W1QA 2C13A 1YXYA 2RDTA 1TPDA 2EHHA 1QOPA 1A5SA 3NGJA 3W7OA 3NA8A 4LY8A 3DHDA 4ZMGA 3O8AA 3TH6A 4NNAA 1TREA 4LS2A 1JCJA 4IXXA 5LNUA 1S5VA 1RQBA 4RZ6A 2RHGA 5HUOA 4IQLA 3PUOA 4K8EA 3GVGA 4RV8A 3WK3A 4BR1A 4E0CA 1MSSA 3P84A 3QM3A 3LX9A 2EPHA 3NO5A 4A2SA 1T96A 3NPVA 2NUYA 5HULA 3W1XA 1KTNA 1FXQA 1LTDA 1WDWA 4PODA 5C55A 1EA0A 2X1UA 3LXBA 2B7OA 2LLEA 1HL2A 4X9SA 1V7YA 3FOKA 3BVJA 1F7BA 2H8XA 1EPXA 3W71A 1ZJIA 4P2VA 5CPMA 3SGUA 3IGSA 1EUNA 3AJXA 3LHUA 5L6UA 4RZ4A 1EP3A 4M5PA 1GOXA 4BWLC 4N6EA 2GQAA 2R91A 1YDNA 1OX4A 4ALDA 4QJ1A 1I4NA 3R12A 1BKSA 3LHZA 3P61A 4Z1BA 1WA3A 3P8JA 4FIRA 1XBYA 1TV7A 1U5JA 2YFOA 3GDTA 1H1ZA 4PC8A 4XTDA 1TPH1 1I8JA 1ICSA 4MJZA 4YL2A 4Z0SA 4J9JA 4OQVA 3UY8A 1FWTA 5KMYA 2A85A 1YXCA 3OEXA 4UTWC 3M41A 1SU5A 3I68A 1A5BA 2I9EA 3BG3A 3S8HA 1WXJA 3W87A 2H6RA 3H54A 4ORIA 3R8RA 2NXIA 3LI1A 1JCXA 2J9YA 1BWLA 3KVKA 3W72A 4LOCA 1VHNA 4FNTA 5G1YA 5EBUA 3LTSA 3CM4A 4KFPA 4WZHA 1OFQA 5F2IA 1TRIA 1TV8A 4GBUA 1XDLA 2VKZG 1WQ5A 4BI6A 3DI1A 1HO4A 3SECA 3OBKA 3QZEA 2ZQ0A 3QQ1A 2Z0IA 1F76A 4BWLA 1TQXA 5BMXA 2HTMA 5AOUA 4MPQA 3HGOA 4R34A 5LHFA 1TTPA 4QNWA 2Y7FA 3TIMA 3T4CA 4NJJA 4C1LA 3BO9A 3M1ZA 4B5NA 2FPTA 3NPXA 1OF8A 2VOMA 2C0AA 3G0XA 4M6VA 4O1CA 5AHLA 1Q6LA 4L4MA 3FIGA 2ZCGA 4O0ZA 3IIOA 3NQ7A 3W1NA 2NWRA 2ISWA 5CZJA 1SW0A 5K9CA 5L9FA 3TNOA 2Y7GA 3JR2A 1Q6RA 3PSWA 1FXPA 1QMLA 4PTNA 3DKJA 3P62A 4O0KA 1K8XA 5AHEA 4UTWA 3IIVA 5D2XA 1XL9A 1GVSA 2YDAA 3MYPA 4LVAA 4LVFA 2Q8ZA 3GX9A 4JTGA 4EWND 4DBDA 5CGQA 1DORA 2NZLA 5D30A 3M5YA 1SZNA 4UR8A 3NPWA 3TR2A 4LNYA 3TAKA 5FF4A 3GDLA 2QCNA 3O16A 4CQ8A 3P74A 5FEWA 3IIZA 3PS7A 1XM3A 2CFFA 1LBFA 1EUAA 4UTTC 3NL2A 3N73A 3L0NA 1M7OA 1TCDA 3HGJA 3BGGA 1TJPA 3UWVA 4LV4A 3A5FA 4QSHA 4K7YA 1GG1A 2WSQA 2EGZA 3GNNA 4IMGA 2GPTA 4GJ1A 4CQ9A 5DXYA 2A1YA 3SZ8A 3W7MA 2FIQA 3B03A 3DGRA 4JTTA 3W75A 4NJHA 2ISSA 3A21A 4JICA 1GYLA 3E96A 1H7RA 1K8YA 4R33A 1TPFA 3L9CA 3LHYA 2Y61A 3NL3A 3W23A 2OJPA 4AWUA 1G4PA 2ZRVA 1ICQA 4X2RA 2VENA 4JIQA 5EPDA 4GUGA 3Q37A 2VFHA 3W2LA 1GTHA 1QPQA 2V0TA 1KM2A 2JBMA 2Q8LA 2WSYA 1KFLA 4Q32A 1QCWA 4YWIA 2IQTA 3TE9A 4UTTA 1RQEA 4OT7A 4IGHA 4N2YA 1TTJA 4NNCA 1WOBA 1C29A 5K7JA 4K38A 3S1XA 2FQIA 2NXGA 2W6RA 2E5DA 1SO3A 3CU2A 5D32A 4TMBA 2BTMA 4LT9A 2B4GA 4WOQA 3OVQA 1OFDA 3UWQA 2BSLA 5DCDA 2ZA2A 4Y6GA 2VC6A 3W1AA 2WNNA 5AC6A 1KFJA 2DJXA 1XXXA 4XQ6A 3V75A 2GUUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 5K9D A;  2V2H A;  4M7T A;  3MJY A;  3I6R A;  1SW7 A;  3W7H A;  2E6F A;  5EYW A;  2OX1 A;  4WD0 A;  3HG3 A;  5CG7 A;  4LUI A;  3WJX A;  2ZYF A;  1DJQ A;  5DLC A;  5IBX C;  3T78 A;  2ABA A;  1W37 A;  4HN4 A;  3GKA A;  3W7D A;  4IX2 A;  2G97 A;  2E1D A;  1GPW A;  1O5X A;  1Y0E A;  3GXT A;  2CLF A;  2VEL A;  1TPU A;  3VND A;  1Q45 A;  1LCO A;  1L6S A;  5TQL A;  3W7C A;  3TK7 A;  3CQ0 A;  1J2W A;  1YDO A;  5I3K A;  3G3D A;  3ABO A;  5D05 A;  1FWW A;  2H3B A;  4NX5 A;  1B3O A;  3RLV A;  1QPN A;  5DY3 A;  1SW3 A;  4UNL A;  2J6X A;  3P80 A;  1TPE A;  4RZ5 A;  1PL9 A;  5D2Y A;  4GRS A;  3RND A;  1AL7 A;  4UFM A;  4R7J A;  5T26 A;  1A50 A;  3NQ2 A;  1OHL A;  5U7S A;  4DO5 A;  3V1P A;  1RR2 A;  1XI3 A;  1G69 A;  1KBI A;  4MZ8 A;  3C6C A;  1H7O A;  2TYS A;  3C2F A;  2FLI A;  5AB3 A;  4JX4 A;  3MBF A;  3FFS A;  2FFC A;  4I7V A;  2DJL A;  4NXK A;  3EX6 A;  1WOA A;  2Y7D A;  3LM7 A;  5IBX A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1S5M A;  3G1Y A;  2H9A A;  2GDQ A;  3PG8 A;  4EOU A;  4BK9 A;  2W79 A;  4M1R A;  3PUL A;  1XYZ A;  4AQL A;  2ACR A;  4QG6 A;  4M82 A;  4NJI A;  3O6Y X;  3KRB A;  4PBE A;  2QJG A;  1R2R A;  3E0I A;  3AS2 A;  3K8K A;  3BSG A;  1Q65 A;  1DIE A;  3OP2 A;  2XH7 A;  1PCK A;  4O50 A;  4AZH A;  2E9M A;  5FES A;  5CGM A;  4HN8 A;  1QK2 A;  2V30 A;  5D9N A;  5D38 A;  5HWJ A;  1ZUA X;  5GNX A;  4DHG A;  1W3I A;  5C7V A;  3GYC A;  3TC7 A;  5CXP A;  2PGR A;  2P10 A;  2PTZ A;  1TA3 B;  4GBD A;  4H83 A;  3WKZ A;  4AXN A;  2NV1 A;  3C4U A;  1Q5M A;  1A80 A;  5CAK A;  4A8L A;  4MAZ A;  5IM5 1;  4L5Z A;  3BW4 A;  4MDO A;  3INP A;  3GZ3 A;  2GSJ A;  4A05 A;  1UAS A;  1UD4 A;  2CC0 A;  4Z17 A;  1B2Y A;  1C8V A;  2IPG A;  4DXX A;  5HWM A;  4OU1 A;  6TAA A;  4NVT A;  4WLC A;  2PI6 A;  3NQF A;  5HA7 A;  3P0X A;  1TSI A;  2PGW A;  1RA0 A;  4Q22 A;  4PTM A;  3CBW A;  4KCW A;  1XGD A;  2ISV A;  3FJ6 A;  1RD5 A;  4E2V A;  2TOD A;  1SQ7 A;  5M03 A;  5REQ B;  4IWW A;  2ZOX A;  3MCM A;  1PE1 A;  3CUF A;  3S5Z A;  2FZN A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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