3P62A

Wild-type pentaerythritol tetranitrate reductase containing a c-terminal 8-histidine tag
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
364
structure length
364
Chain Sequence
EKLFTPLKVGAVTAPNRVFMAPLTRLRSIEPGDIPTPLMGEYYRQRASAGLIISEATQISAQAKGYAGAPGLHSPEQIAAWKKITAGVHAEDGRIAVQLWHTGRISHSSIQPGGQAPVSASALNANTRTSLRDENGNAIRVDTTTPRALELDEIPGIVNDFRQAVANAREAGFDLVELHSAHGYLLHQFLSPSSNQRTDQYGGSVENRARLVLEVVDAVCNEWSADRIGIRVSPIGTFQNVDNGPNEEADALYLIEELAKRGIAYLHMSETDLAGGKPYSEAFRQKVRERFHGVIIGAGAYTAEKAEDLIGKGLIDAVAFGRDYIANPDLVARLQKKAELNPQRPESFYGGGAEGYTDYPSLHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Focused Directed Evolution of Pentaerythritol Tetranitrate Reductase by Using Automated Anaerobic Kinetic Screening of Site-Saturated Libraries
pubmed doi rcsb
molecule keywords Pentaerythritol tetranitrate reductase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Enterobacter cloacae
total genus 138
structure length 364
sequence length 364
ec nomenclature ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date 2010-10-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3p62A00
4O14A 1R47A 3LCWA 1X1ZA 4WD0A 4FX8A 5CGQA 3IIZA 3GXNA 3GNNA 4DBDA 2ZZ7A 3A21A 3S1UA 1N55A 3BVJA 4O11A 3C52A 1CI1A 3UY7A 2Y85A 2BZNA 3ABQA 2X30A 1OF8A 1I2NA 4EF8A 4LWWA 5A5WA 5LKYA 3B8DA 3GR7A 3G22A 2R91A 1PIIA 1RQHA 1W3IA 4Z0SA 3E96A 2E5CA 2VELA 4KFPA 2DJLA 3P8IA 1B4KA 1GVFA 3TFCA 1TPH1 1V5XA 1F73A 1PS9A 2DZSA 3GDTA 4LC6A 3LBMA 3B05A 4ML9A 1J2WA 3B0UX 3FEMA 1UJPA 3WJZA 2GPTA 2YYTA 3PAJA 3O07A 3HPZA 3O8AA 4Q33A 4IMFA 2VFIA 4XUGA 2ZBTA 3HIJA 5A8GA 2NV1A 2WOQA 3TW6A 3AO0A 5LNWA 3RK8A 5K2ZA 3HMJG 4GNJA 3W87A 4KWWA 2FJKA 4N9DA 5F4WA 1Q6RA 3R5EA 4LVFA 5D2VA 1K02A 4XBKA 3QRHA 1L6WA 3G8RA 2RDWA 2NUYA 3I6RA 3HF3A 5CZTA 4BI7A 4UTJA 3W75A 3EKZA 3TCEA 4K37A 3NM1A 2NLIA 3F4NA 4LUIA 1OX4B 5DCDA 5ABTA 2ATMA 3W07A 4JX6A 2B7OA 4IMGA 2EGZA 3NXFA 4UR7A 4DQWA 3M44A 1AW5A 5K9CA 4RK8A 5C6MA 3NZ1A 4LVBA 1BTMA 4PFMA 4L4LA 3W88A 1A50A 1R2SA 4D2JA 2GQ8A 3BK0A 3CIXA 2WKJA 3W7EA 3C56A 4QIUA 1NF7A 3LTYA 1RQEA 5F1UA 3C8FA 1JCXA 3SECA 2HTMA 2NWRA 1LZOA 3N73A 1MO0A 3IIXA 1THFD 1EP1A 3FJ6A 4KKXA 2CLKA 1AL7A 3T7VA 4FNRA 1F76A 1EPXA 2CFFA 4NU7A 1AW1A 4MJMA 1M5WA 1TCDA 3A23A 4ZQRA 1NAL1 1O94A 3NQCA 3QW3A 4Z1CA 1TRIA 3G1SA 5LNSA 1MEWA 4RX0A 4MFDA 5HMSA 1F5ZA 1QOQA 4AEOA 1XXXA 4OGZA 4ZQOA 3NL3A 5KINA 4IX0A 3NDOA 2Z0IA 1VCGA 3E12A 3CWNA 1OFPA 1LOLA 5D09A 1S5VA 1VQTA 3B0PA 5AYYA 1SO3A 2JK2A 4Y96A 3BO9A 4GUGA 1LYXA 1ME9A 1QWGA 3SFKA 5EKYA 3STEA 1I4NA 3S1XA 2Y63A 1G67A 2Z1BA 3HPXA 3TFXA 1K3UA 3IRDA 4C1LA 3BG5A 4JS3A 4R53A 4MFEA 3PC0A 3C2RA 3OA3A 3W1TA 2VFEA 3TA6A 4Z1AA 1I45A 1I8JA 1TV8A 2TPSA 3LHWA 3C4UA 3S6DA 3MBFA 2B7NA 3CEUA 2HS6A 3WK0A 1S5WA 3E9AA 1LLZA 4HN4A 3N3MA 2DP3A 4GUHA 4RXGA 1CX9A 1SO5A 2RKXA 4NUWA 3VI2A 2JGQA 3GAYA 4UNLA 4YL2A 2NZLA 5EA9A 1GVRA 3L67A 3TV8A 5CSSA 3IGSA 1YXCA 3W1UA 2QUUA 4LV9A 3T4CA 1G4TA 4A3UA 5TIMA 4AWUA 1OK4A 3G8EA 4CQAA 5HWMA 3KVMA 2GJLA 2I9EA 1TQJA 4RXFA 3P61A 3GDLA 4S2CA 1FWTA 5G1TA 3SY5A 4U4MA 2C15A 4NJIA 1JUEA 4O54A 1S5TA 2PC4A 1C9DA 5AYZA 3MP3A 1FWNA 1G6CA 3EWUA 2H90A 3TMLA 3W1RA 3MHFA 2P0OA 4AHOA 2CLLA 1NSJA 2ZTKA 1AK5A 5FEZA 1ICSA 2NUWA 1WQ5A 1WAUA 2NV2A 4WXYA 1HTIA 3NQGA 4PODA 2G96A 3ZWTA 3W23A 2YFNA 4AMAA 2J24A 3MWAA 3PB2A 3C2OA 5MHBA 3PBVA 4JNMA 4JTTA 1FDYA 4OT7A 5AC7A 1U83A 1YDVA 1LRQA 2FDSA 4K39A 2EAWA 2B7QA 1W5QA 4LRTA 3HGSA 1TMHA 4TIMA 3SGZA 3LERA 1QAPA 5L9FA 1OX5A 4K7YA 2E6FA 1O4UA 1XFBA 4B5NA 4RJEA 5AHEA 5T26A 3L5LA 5L6UA 4YWIA 3TAKA 4OE7A 1GYLA 4E2BA 3WJSA 1TTQA 4X22A 1TRDA 5E0KA 2C18A 1K03A 1C8VA 3FYOA 3IIOA 4JIQA 2P1FA 1OX4A 4IUOA 2Z2UA 1ME7A 3BLFA 2CLFA 1EX5A 4LW7A 4W9TA 1OFRA 1KFCA 1ME8A 3NPUA 1D3GA 5C2XA 1EWDA 3NEVA 1H1YA 4UFIA 1W1ZA 1EA0A 4NJGA 3DHFA 2X1RA 4JTGA 5HWJA 2ZZ2A 3T78A 3DBPA 1OF6A 2A2IA 2ABBA 1ZFJA 3L65A 3M16A 3M41A 1HL2A 1IXQA 1OVDA 1VCVA 1W31A 4BI6A 3NR0A 1TPWA 1JCMP 5AHNA 1LP6A 1MEHA 5G5IA 5KMYA 5AC8A 2G95A 4FXSA 1L6YA 2DZXA 4AWTA 2FPTA 2JGYA 1ZY9A 3GB6A 4IMDA 5DBTA 4G1KA 5KZEA 5HJLA 3CM4A 5F2IA 5D02A 7TIMA 2HSAA 3TE9A 3OG3A 2RFGA 1P5BA 3BLIA 4JD4A 3DU0A 1EUAA 4A2SA 1TPVA 3EX3A 4ZL1A 5U4NA 2R8WA 3H54A 1EB3A 4DEFA 5K9XA 4HKPA 1FWSA 2D73A 2QF7A 4EVZA 4DO4A 2RHGA 3LRMA 4GE8A 5CPMA 3W1PA 4UMAA 2H3BA 4LUJA 3NQAA 2Z6JA 1O60A 5G2WA 1AL8A 4XBSA 4UTLA 2BXVA 1K7FA 2Q8LA 3K30A 3HGOA 4MOZA 3S0CA 1G4SA 4BF9A 1Q6LA 3DH7A 3N2MA 1KFKA 1PV8A 1QFEA 3LRKA 4DPPA 4CNPA 4XZ9A 2JKAA 1TPFA 3GKAA 1SW7A 4AWSA 3HJZA 1QPQA 3LLDA 1I2OA 4NT0A 4FNSA 5D30A 4M5PA 3QQ0A 3G1XA 1Q6QA 2FQIA 4X3ZA 2E6DA 2JKEA 5C54A 1K8YA 3CB8A 1SW3A 5DXXA 1QPNA 3W2UA 5HR7A 2ZZ3A 4H6KA 4CCEA 1QPRA 4EIVA 1PVNA 3LTSA 4K6AA 1KFJA 3M9YA 3O16A 4Z0JA 1SZGA 2ZRYA 4O10A 3VKJA 3VFLA 4O50A 3I7RA 5DN1A 3OEXA 2O7SA 3N2XA 4BWLA 4M6QA 4N2YA 1KM4A 2Q3OA 1TIMA 1OYCA 3G0SA 4FHAA 3GLCA 1ONRA 1F05A 2QAPA 3C3NA 1ADOA 3LOTA 3GZ3A 4RR4A 4ZQMA 1B9BA 3USBA 1VYSX 2ALDA 2VXNA 4XWUA 3I7SA 1H7WA 1M6JA 2C14A 3KRZA 3LCHA 3STFA 2Y7DA 1W5OA 3W1QA 4LS2A 1DKWA 4JX5A 1H61A 1MSSA 2RDUA 1TPB1 4HPXA 2PURA 3TIMA 3MP5A 3U8GA 3LV5A 3S5OA 2FIQA 2J9YA 2QCLA 4A29A 5LNUA 4ONVA 3GXPA 1BKSA 3MMTA 1EUNA 4OWGA 3S42A 2X1SA 3PG8A 3W7PA 2P10A 3C2FA 1TREA 4LV4A 1FUYA 5K7JA 2QCEA 1ZJIA 1G4EA 1J4EA 1ZENA 3O15A 4Y9AA 2B0MA 3MP4A 4AF0B 3W85A 5HQEA 1H62A 2J6XA 2Q8ZA 4WXZA 3W1XA 3LDVA 3LHUA 4O0KA 4ZZ9A 4JTHA 3ZS4A 4UFMA 2VKZG 1TJPA 4E0CA 4IPJA 2AGKA 3NL2A 3L9CA 3QEZA 3SW6A 3TSMA 4DELA 5E1QA 4UR8A 1VPXA 1LOSA 1VGAA 3QH2A 4GUIA 3UQNA 3S5ZA 4M7SA 3UPWA 4CNOA 3LTPA 2PRLA 1K7XA 4M6PA 2J27A 4GUJA 2XFWA 4IQLA 3UZ5A 1FXQA 1DJNA 3NQMA 1VYPX 1XDLA 4MLJA 5FI8A 5E93A 4Z1DA 4JY9A 3QJAA 1GYNA 3MJYA 4KFOA 3L66A 2A7RA 4UTHA 3LI1A 4ICNA 1BEUA 3UZJA 1ZALA 3W7KA 2V8ZA 4CNNA 2FFCA 4JICA 5DELA 2V2DA 4ZQPA 3LGEA 1H51A 5I3FA 2Y61A 1JCNA 2H8ZA 3CWOX 1VS1A 4WOZA 3DI0A 3NOEA 1ZNNA 3NPXA 4LC8A 2O7QA 4PL2A 1PE1A 2PE4A 5BOOA 4MIMA 3G24A 4WY0F 4JTIA 1H50A 2H3DA 2W0UA 1A53A 3ATZA 1X6UA 1YDOA 2E1DA 3P60A 4PC8A 4O15A 2A6NA 3CT7A 1ALDA 2QCCA 5AHMA 3KXQA 1VC4A 3P5YA 3QFEA 2WSYA 1ZAIA 4FNPA 4N9EA 1W5MA 2C6QA 4N9BA 1DHPA 4QSHA 4TU1A 2OZ0A 4TO8A 3NA8A 1YPIA 4Q4KA 1JQVA 3C0JA 4WX2A 1QO5A 3EWXA 3F4WA 3L0GA 2ISVA 3M5XA 4O1AA 3P81A 2X16A 2CLEA 2BX7A 3WJYA 4JTSA 3OHIA 1R2TA 4BWLC 2H6RA 3G1VA 2J88A 4UMBA 1DORA 4POCA 3OBKA 1ZHAA 5KITA 4NX5A 4IX2A 3DI1A 4JDBA 3TXZA 3SGUA 4ZQNA 3UPBA 3TK7A 1W54A 3G0UA 3W2LA 3FIGA 5D04C 3LHYA 3W83A 4IGHA 1G4PA 2RH9A 4LS1A 4OQVA 3L21A 4Q32A 3UWVA 3QMSA 5D38A 1NEYA 3PBYA 5K9DA 3W1NA 2ZDRA 3N34A 1OFQA 1VLWA 1YYAA 3WJXA 2I14A 2QJHA 3LM7A 1OABA 1P0NA 1OFAA 4MPQA 3O6CA 3STGA 1OFOA 3NQVA 4MUZA 3NO5A 4OU1A 1O5XA 3W7MA 4UTKA 5J5RA 2WPBA 1H7NA 2GVGA 2WV8A 3NYZA 4OHQA 3Q2DA 1QDSA 2ABAA 3VNDA 4UC5A 3NVTA 4M19A 1NVMA 3UYCA 4YMZA 1YTEA 2QCMA 1KM0A 2BLEA 3ABOA 3ANYA 1H63A 3T44A 3FFSA 4FNUA 3NQ2A 2I1OA 4O28A 1JRBA 3UXDA 1FCUA 1T0OA 2YSWA 3W74A 1QMLA 4I7WA 2C1HA 5D32A 5LHEA 1KV8A 4BR1A 4DF2A 1KFBA 4YCOA 3QYQA 2OX1A 1FDZA 3A5FA 1SO6A 3IGUA 2WNNA 1WDWA 4Y6GA 5G4EA 4AF0A 1KM2A 2E6AA 4AVFA 1EEPA 4OV4A 3W7QA 1OFEA 5DXYA 4MZ1A 3G0XA 1YXYA 3A24A 1W3TA 4QQ3A 3PF3A 3HB9A 3CPRA 3M5VA 4AB4A 3UXAA 5C5YA 3P67A 1PHQA 1Z48A 1RD5A 4UTWA 1DJQA 4EF9A 3W7RA 3RLUA 3LXBA 1GG0A 1F7BA 3OIXA 1ZCOA 3U2OA 1H7PA 5CPLA 3NM3A 1QOPA 2QJGA 4O18A 3HBLA 4HIBA 8TIMA 4QNWA 1DVJA 1W0MA 5I3IA 3NPVA 3LBCA 2ZTJA 4GXMA 3CEPA 4CCDA 4UFHA 5DCEA 4H4IA 3BLEA 2DZPA 1IIGA 2GUUA 1VR6A 4QJ1A 4O0ZA 4TMCA 4YCPA 3PG9A 4CCCA 3DKJA 4LT9A 4UFLA 1SQ7A 2ZZ5A 3GDKA 4ADSA 3G3DA 3P82A 3W7OA 2C0AA 3QSRA 3WK3A 4NX0A 2TYSA 4I9AA 3EB2A 3QZEA 3TAOA 1ML1A 2F7FA 3EX1A 1IXPA 1XBZA 3TC6A 3BGJA 3E0IA 3UY8A 4RLIA 2A6LA 3RMJA 2B7PA 4R33A 3M6YA 5LZLA 2WSQA 2W79A 4A2RA 1KM5A 2YW3A 5HWNA 2VENA 3W6YA 4QAIA 4MKNA 3GR8A 4RZ6A 3G1FA 2Y89A 1UBSA 2QCDB 3DFQA 3TUUA 2CU0A 3PY2A 5I3GA 4I7UA 5KZMA 3RU6A 4HSNA 1K8XA 1PHWA 2A4AA 3SJ3A 4DF0A 3GIYA 2DZUA 1GVOA 2AQWA 5HUPA 4R7JA 5D2WA 4DXVA 1LRNA 4NQ1A 1DL3A 1SO4A 3LCLA 3MHGA 3N19B 3L0KA 3NPWA 1GVSA 1FDJA 5FEXA 4N02A 1XKYA 1SPQA 2WNQA 1BWKA 3R2GA 3GNDA 1OHLA 4NXKA 4XQ6A 5D03A 3TR2A 3S8HA 3IVTA 1GG1A 4JTLA 5LGXA 1J5TA 2EKCA 5EL1A 1HFBA 4K7VA 5EBUA 3LHTA 4ZQCA 1PCWA 2NX3A 2DZWA 3V1PA 1UCWA 1KLYA 3QMRA 1Q3NA 2GOUA 2WO5A 3NG3A 3G1YA 3DKLA 1GOXA 3BW3A 1XCFA 1KTBA 1FCBA 1UASA 2QCHA 3PUOA 3R13A 4Y8FA 3S5YA 1I2PA 2CWNA 1DBTA 2QDGA 1KBIA 4QISA 3RNDA 2ZQ0A 1E51A 3Q58A 1IF2A 5D05A 2FB2A 4MY8A 3KVLA 5LGZA 3EXTA 1RZMA 2ATSA 3DGRA 1H7RA 2QCNA 3THQA 1JRCA 3M0ZA 4IMEA 4JY8A 4FNTA 1VHNA 4PA8A 1LCOA 4HT3A 2B4GA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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