3P67A

T26s mutant of pentaerythritol tetranitrate reductase containing a bound acetate molecule
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
362
structure length
362
Chain Sequence
EKLFTPLKVGAVTAPNRVFMAPLSRLRSIEPGDIPTPLMGEYYRQRASAGLIISEATQISAQAKGYAGAPGLHSPEQIAAWKKITAGVHAEDGRIAVQLWHTGRISHSSIQPGGQAPVSASALNANTRTSLRDENGNAIRVDTTTPRALELDEIPGIVNDFRQAVANAREAGFDLVELHSAHGYLLHQFLSPSSNQRTDQYGGSVENRARLVLEVVDAVCNEWSADRIGIRVSPIGTFQNVDNGPNEEADALYLIEELAKRGIAYLHMSETDLAGGKPYSEAFRQKVRERFHGVIIGAGAYTAEKAEDLIGKGLIDAVAFGRDYIANPDLVARLQKKAELNPQRPESFYGGGAEGYTDYPSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Focused Directed Evolution of Pentaerythritol Tetranitrate Reductase by Using Automated Anaerobic Kinetic Screening of Site-Saturated Libraries
pubmed doi rcsb
molecule keywords Pentaerythritol tetranitrate reductase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Enterobacter cloacae
total genus 140
structure length 362
sequence length 362
ec nomenclature ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date 2010-10-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3p67A00
3A9IA 3CEPA 4X3ZA 4BI6A 3QQ0A 1FY6A 1W3NA 1WA3A 4LUJA 3G0SA 3TC6A 1YLVA 3W71A 4TMBA 5CPNA 1LOQA 1LOLA 1WBJA 3G1VA 3MHUA 3S5NA 4UNLA 3I7RA 3VFLA 5AHIA 2RKXA 5L9FA 5K9DA 4NNBA 4N2YA 2QCFA 4OBTA 3G24A 2XN0A 2V2DA 2HSAA 2V2CA 5K9CA 5L6UA 1OFAA 3KRSA 1VJIA 1XFBA 2OCZA 2ZRXA 5HR7A 1ML1A 1OYAA 1S5TA 1GYLA 1V7YA 4FX7A 3VKJA 3GIYA 3C52A 5I3KA 3N73A 3M44A 4LWWA 4Q4KA 1G4SA 2P1FA 4Z08A 1LTDA 1O4UA 1T0OA 4UMAA 3WK2A 1EP2A 1K02A 5D38A 1XBYA 4JX6A 4ALDA 3R12A 2OT0A 4LNYA 2Y85A 3DZ1A 3EEGA 3GXNA 3CTLA 4M7TA 1C9DA 1UBSA 2WKJA 3DU0A 2ABBA 3EWYA 1KTCA 3NPUA 1A5SA 4O17A 2DZWA 4XUGA 2TYSA 2E6AA 2DJXA 4UMBA 5K7JA 3TMQA 3P5YA 4RZ4A 1S5VA 3M6YA 2X2GA 2G5WA 5G1TA 5CZ0A 3EX3A 3SGZA 4BK9A 1TPC1 4JDBA 2GQ9A 3BV4A 1R47A 1ZFJA 1TV7A 4X22A 1DVJA 1O94A 2TRSA 2ZZ1A 5CSSA 1OFOA 5D2XA 4RK8A 1WOAA 4BI5A 2JK2A 4ZQOA 3O1NA 3QPYA 2YR1A 1Q6LA 4N4PA 5CKSA 1JCYA 4MLRA 2A2IA 2ATMA 3LRLA 5IBXA 4MIMA 2QCCA 1O5XA 1W5OA 4IX2A 2YGYA 3LX9A 4QJ1A 3ANYA 3R13A 3TQKA 1OG0A 4PH6A 4UC5A 2TPSA 1G4TA 2RFGA 2Z0IA 1QR7A 1VHCA 1OK4A 3CIWA 3Q58A 2PCQA 2RH9A 1YPFA 5FEZA 3L0KA 3QH2A 3VCRA 3MW7A 5I3HA 2A21A 3F03K 2AAMA 3EXSA 1K7FA 4AHOA 3M0ZA 2Y6ZA 2ZTJA 3G8RA 4O1DA 4O0KA 4KWWA 1HL2A 2FTPA 3LHTA 1DBTA 1SUXA 4GRSA 4LVGA 1CX9A 1PL9A 1QNVA 5SWUA 1W1ZA 3NM3A 2WOQA 2HS6A 1EP3A 1K8ZA 1N7KA 2VEMA 3P82A 1TTJA 4RXGA 4HNNA 3WK1A 4O28A 4JGDA 1LRQA 1HUVA 5FI8A 3Q37A 3W23A 3GB6A 1GEQA 5BOOA 4LTSA 1OX4A 3A21A 4M6VA 2RDWA 5AN7A 1KA9F 1YYAA 2DORA 4BI7A 4FB7A 1W5NA 1G7VA 3EWBX 3TMLA 1CI1A 3VNDA 4NVTA 2Z1BA 2H3BA 4QNWA 4O12A 1AMKA 1XBZA 4WD0A 2J88A 2W6RA 3NL2A 2WNQA 1HG3A 1OF8A 1H7NA 5KZMA 1FBAA 1GVSA 2GUUA 1FCQA 4KFOA 3PC0A 2F7FA 3PUDA 4N6FA 4UTTC 4NX0A 4CCEA 2G96A 4WY0A 1U5JA 3BG9A 3TROA 1SFLA 2NWSA 1ME8A 2D73A 1ICSA 1D3HA 5AYXA 1KFLA 1EA0A 2VC6A 2CFFA 2QAFA 3M5VA 3NM1A 4EVZA 1FXQA 1XUZA 5K9XA 3P80A 4RV8A 5LSMA 3ABQA 3KFTA 4JTEA 2ZTKA 4POCA 5CPMA 3W7RA 1ONRA 2NUXA 1JCMP 3UWWA 3C2VA 1TMHA 4S2CA 1H7OA 4JY9A 3LCXA 4MY9A 4X9SA 3M1ZA 5DY3A 1UUOA 1F5ZA 3CIXA 4JDYA 3FEMA 1VYRA 2VEIA 2ZRZA 5FEPA 1JUKA 1OFRA 1H7RA 2QCLA 4H6KA 3MJYA 5AHEA 5AYZA 2Z6JA 3NR0A 4FIQA 2CLKA 3SI9A 3OBKA 1A53A 1YTEA 5F2MA 4E0CA 2H8ZA 3SY5A 4QM1A 3MWAA 4AVFA 4X2RA 2RHGA 1QO5A 5D04C 2C1HA 3ABSA 2PRHA 2CLEA 4EF8A 4RJEA 4JTJA 2TMDA 1W37A 2X1RA 2VFGA 5GVJA 3C4UA 1ZNNA 4O1AA 1VH7A 3PBUA 1SW0A 1SW7A 3UY8A 4OGZA 2OMAA 1B57A 3W7CA 3G0UA 3W7NA 3E12A 1QDSA 3HPXA 4Q32A 3TCEA 4A29A 3EKLA 3G1AA 3HG2A 1KFEA 3DGRA 2HMCA 3CU2A 4DO4A 4LY8A 3JS3A 2YCEA 4R7JA 3U6WA 1C29A 1LBMA 1ME7A 1SSDA 5E0KA 3LI0A 2FIQA 4YLWA 3A22A 4O54A 4DEFA 1J4EA 4IPJA 6ALDA 5TQLA 1H61A 1LBLA 1A5CA 5EKYA 4FF7A 1XBXA 1KLYA 3SFKA 3O15A 5DELA 2B7OA 4CNOA 1SSGA 1Z41A 3FYOA 4O52A 3W7EA 4FNSA 5E93A 1DOSA 4HIBA 5AYYA 4UNKA 1PVNA 2CWNA 2VEPA 4IMDA 5KTLA 4OE7A 1F05A 4HNUA 3DI1A 4OV9A 2E68A 2VFIA 4GC4A 5LNUA 3I68A 3O06A 4E2BA 3O07A 1THFD 5C55A 3W1MA 5HNRA 3W7OA 3P5ZA 3UPWA 2C18A 4CCCA 3L65A 3SR7A 2IQTA 3A24A 1ZJIA 4LC8A 4QSHA 4UTKA 4I7UA 2FPTA 1ZHAA 1D3GA 3S0CA 3M5XA 1G67A 2Y70A 3PS7A 3NZ1A 4RX0A 3FYPA 4Z1AA 5BW6A 2BWGA 2E5CA 1ZENA 2KZHA 4DQWA 4BWLC 2J27A 4S1FA 2NZLA 3PUEA 4YCOA 5DLCA 1KFBA 3QQ1A 2Y61A 4O1BA 3HMJG 1S5WA 4PA8A 4A21A 1H5YA 4JS3A 5BRBA 1JCXA 3BLIA 7TIMA 5DY2A 3M43A 4O16A 3GNNA 3GXPA 1Q6QA 2GQAA 4K7VA 1DV7A 5G2WA 1X7FA 1GYNA 4DPQA 3TIMA 3W85A 1UJPA 3EX6A 5G5IA 4NNAA 1TTQA 2B7PA 1X8FA 5F1UA 3M41A 4IJBA 1R2TA 1B9BA 2A7NA 4NJJA 1C8VA 4IQLA 1LDCA 1LRTA 2RDUA 1ZY9A 3OVPA 3TQVA 4M5PA 5F2LA 1GT8A 3OG3A 3W7PA 1OK6A 4K37A 3VE7A 2ZRUA 3R5EA 2CLFA 4HNVA 4QISA 3PVFA 1VRDA 3TSBA 5G1YA 3KRZA 2Q8ZA 3LV5A 1XXXA 4Z0JA 2JGYA 1EEPA 3WK0A 2G97A 3DFQA 3G1HA 4WOZA 3DBPA 1JCNA 1VCVA 3W1AA 3LRKA 1W54A 4O19A 1Q6RA 5D2TA 3KX6A 4IGHA 1D9EA 2ZFAA 4QIUA 3S6DA 1NFBA 3FKRA 4LRSA 3B04A 1JCLA 4UR7A 5T26A 1SZEA 3TQ0A 3S1XA 5HJLA 3D0CA 3BW2A 4O53A 5K3VA 4QQ3A 1TPEA 1GOXA 1JRBA 1SO3A 2CLIA 3KVJA 1Q3NA 2EAWA 1KM3A 3OHIA 5C5YA 3N9SA 2X1SA 4DELA 4BF9A 3KVLA 1H51A 1TPH1 1I4NA 5K4ZA 2I14A 1L9WA 2FLIA 3QF0A 4U4MA 1J5TA 4JTGA 5CZSA 3VE9A 4DF0A 1YTDA 1BWLA 3RNDA 2I1OA 3WJWA 1LM1A 5D30A 4OT7A 1P4CA 3M47A 1RR2A 2CLLA 1CW2A 1QOQA 2Y7FA 5HWNA 2PRLA 1Q45A 3BVJA 3GDLA 1DHPA 4TU1A 4JYFA 1H60A 1QPOA 4XWUA 3PY2A 4JD4A 3I7SA 5KSWA 6TIMA 5AOUA 4H4IA 5AFDA 1KBIA 3LHYA 3NQMA 3NL5A 4DO6A 2H8XA 1UASA 5KZEA 3QM3A 5EL1A 3UXAA 2ISVA 3GZ3A 5KITA 3BO9A 3SW6A 3HJZA 1FWWA 1TPUA 4NZFA 1KV8A 5CGQA 2BZNA 4HSNA 2HTMA 2Z6IA 1VPXA 1JRCA 1AG1O 4GUGA 3E96A 3SJ3A 1W3IA 3STGA 5D2WA 2DZPA 3B0VC 3N19B 1G7UA 4PFMA 3EKZA 3M5ZA 1XCFA 2UV8G 3BGGA 3PG9A 2V2HA 1JJKA 1TPB1 3I7QA 5MHBA 5EYWA 1NVMA 1WXJA 3W1UA 1GVQA 3W9ZA 1IGSA 1MEIA 2O7SA 1Z44A 3ZR4A 3IIVA 1TB3A 1ME9A 3L5MA 4Y6GA 3OVQA 3L67A 2ZYFA 3FLUA 2GVLA 4MFDA 4LVAA 5LNWA 2E1DA 5A5WA 5J5RA 4UCGA 2VKZG 1KLZA 4LRTA 4O50A 3TFXA 1EX5A 3DFPA 3MYOA 1OVDA 1QO2A 1WAUA 1R2SA 4CLMA 1WX0A 2QJHA 3LCHA 2CZ5A 1KFJA 3SIZA 3H53A 3PSVA 3E0IA 2C6QA 2YYTA 1KW1A 3TKFA 2QUVA 3HGOA 3GDTA 3FJ6A 3ATYA 3FA5A 3RMJA 3BG5A 1RQBA 4IXXA 1QAPA 5D09A 2QCDB 3NOEA 4ADUA 1P1XA 2EF9A 1SO5A 3HG5A 2FJKA 1LCOA 3UNDA 3GR8A 5CG7A 1PIIA 1T99A 2J24A 2QDHA 3L21A 4HNTA 4I9AA 2GJLA 3DHDA 1T8XA 3L2IA 4NJHA 1QOPA 3NQAA 2X1UA 1Z48A 4N9EA 5D33A 4EWND 3PF3A 3FS2A 4NT0A 4WXYA 1GZGA 3P8JA 3CHVA 1ALDA 5DCDA 2VENA 3C0JA 1XM3A 1X1OA 4M6PA 4MFEA 4D2JA 1W31A 3E49A 3NO5A 1FCVA 4DXVA 1RV8A 3TW6A 3W88A 2PC4A 1VR6A 2DP3A 3UZ5A 1L6WA 4MUZA 1AL8A 3LRMA 2DZVA 1QPNA 4Z1CA 5HMSA 1NAL1 1XDLA 4N9CA 4AWSA 4IOTA 2NWRA 4IX0A 5LNVA 4UXDA 4JTKA 3NXFA 3IGXA 1KM5A 1XDMA 2CZFA 2ZZ7A 3F4WA 1GG1A 3E9AA 2C19A 1PHWA 3EXTA 4AHPA 2J6XA 2XN1A 2B4GA 3TXVA 4UTWC 3AJXA 1O95A 2CLMA 1Q6OA 4GFSA 2H3DA 2WNNA 3GDRA 2GJNA 1Z42A 2VFHA 2TSYA 1KBJA 3P84A 1IXNA 5EBUA 5J5DA 4WY0F 2NV1A 2JGQA 3F1QA 5H2ZA 3QSTA 3C2FA 4RZ6A 3H54A 3DXIA 1ZALA 2B0MA 4ORMA 4N9DA 3TX9A 3P60A 2B7QA 3W7HA 3RFAA 3GX9A 3R2GA 4DF1A 1OFEA 3L0NA 5F4SA 1YXCA 1KM2A 3C6CA 3MHFA 4MJMA 2E5DA 3ELFA 2BX7A 3EWZA 3W7GA 4UTHA 3S42A 4AF0A 4Z1BA 1TPVA 1UUMA 5HR6A 4ZQRA 2A85A 8TIMA 4UTTA 3UWYA 3W1XA 5LHEA 5CSRA 3C2EA 4IUOA 3ZWSA 5BMXA 1BTMA 5I3FA 3UD6A 4NJGA 5CZTA 3GAKA 3LERA 3NQCA 1K3UA 5G2IA 4UTUA 3GXTA 1WBHA 4P61A 4IMFA 3QYQA 2DJLA 3P8IA 4UMCA 1F74A 4LS0A 1BWKA 2CLHA 4GXMA 3LGEA 5LKYA 1DJNA 4AEOA 3T7VA 1ICQA 3WJYA 2V5LA 2VFEA 3IRDA 2AGKA 4J9JA 4PEKA 3MUXA 5A8GA 1FDJA 1DKWA 1FQ0A 4JIQA 4UR8A 3DFOA 1YTKA 3QSRA 1QWGA 3TAOA 2A1YA 2GQ8A 3IVTA 4JIPA 1TREA 2C14A 2ZRVA 4AAJA 3HGRA 2NX1A 2Y62A 1DL3A 1KTNA 2W79A 3PULA 3R89A 3NDOA 3W86A 3H55A 1F2JA 1VC4A 3QRHA 4DPPA 2EPHA 2ZA1A 3C2OA 3P61A 3W75A 1AW5A 3QW4B 1GQNA 1SR9A 1YXYA 2ZZ3A 1XUUA 2E5BA 2C13A 4XTIA 5FF4A 3UZJA 3UPBA 1O60A 1DORA 1W5MA 3NVTA 1KTBA 3KXQA 4MKNA 1W56A 4RR4A 3NNTA 3LHZA 4O18A 1M5WA 4TMCA 1MEHA 4O13A 3CLMA 1LYXA 3W07A 5KMYA 3NPVA 4JXCA 3TW7A 2B7NA 4O57A 1TO3A 2QCEA 3TXZA 3MP4A 1RQHA 3NQEA 4LV4A 3CB8A 4K8EA 3DHFA 5FF2A 2YW4A 3Q94A 4UFJA 3STCA 1OX6A 1TSIA 2GPTA 1RZMA 1Y0EA 5F4XA 1HO1A 3THAA 3USBA 3HG3A 3W74A 1I2OA 1KM1A 3W3OA 1FDZA 1VHNA 4GBUA 4JYEA 2QDGA 1OJXA 1R2RA 1T96A 4LW7A 3W2JA 5H91A 1L2UA 1G69A 1WYIA 3TJXA 2ZRYA 4OU1A 3FOKA 4GUFA 1NEYA 1A5BA 4YL2A 1LOSA 1RVGA 2PURA 1JVNA 5HWMA 3L5AA 1GVRA 3LV6A 2PE4A 4RCXA 4EIVA 5D05A 1OABA 2ISWA 3KVMA 4A2RA 2XN2A 5ABTA 2ZA2A 4O14A 1QMLA 1OYBA 1U83A 1TIMA 5DXYA 2R14A 3E02A 3W87A 4A2SA 2R94A 4BWLA 4A22A 4PCFA 3S8HA 2RDTA 3CT7A 4NXKA 2V0TA 4Y96A 1PCKA 3MP5A 2JKPA 3QZEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3A9I A;  3FST A;  3M7S A;  1FY6 A;  1W3N A;  2BMB A;  4F0S A;  2P8C A;  3W71 A;  4TMB A;  5CPN A;  1YDY A;  3EPM A;  1UG6 A;  4BY3 A;  1MW3 A;  3VNZ A;  4DWS B;  4MDO A;  2WSK A;  5I79 A;  2QCF A;  3G24 A;  4U2Y A;  3VD4 A;  2V2D A;  5L6U A;  3KRS A;  4H2C A;  4PB4 A;  4ZOA A;  1K8C A;  2ZRX A;  4W8L A;  1V7Y A;  3PTK A;  1Z89 A;  2CBU A;  1J93 A;  3BE7 A;  3DHU A;  5A6T C;  1F3X A;  4H7V A;  1LTD A;  2WLY A;  1EP2 A;  2ZWY A;  1BYB A;  3MWC A;  4YNG A;  4ALD A;  2PDK A;  2EPO A;  1VEN A;  3DZ1 A;  3EEG A;  4QXI A;  1R9Y A;  2BG5 A;  5BXR A;  1V0K A;  1UBS A;  3DU0 A;  1B30 A;  3THC A;  2ABB A;  1BVZ A;  1UH4 A;  4D71 A;  3ES7 A;  3NPU A;  4YU1 A;  4O17 A;  2DZW A;  2UY2 A;  2DJX A;  3REQ A;  1DWI M;  4YIW A;  5G1T A;  2FZM A;  1BVN P;  1TPC 1;  4I3G A;  2QQ6 A;  1R47 A;  4KRZ A;  3UR8 A;  4I9T A;  4NZ4 A;  2OEJ A;  2WK2 A;  3VOG A;  1DVJ A;  1ZUA X;  2ZDS A;  4AZ7 A;  5CSS A;  1XPG A;  4QRO A;  2OR2 A;  5M3W A;  4P8V A;  3O1N A;  3ITG A;  2YR1 A;  2VRK A;  4N4P A;  1ZS2 A;  4I90 A;  5CKS A; 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