3P67A

T26s mutant of pentaerythritol tetranitrate reductase containing a bound acetate molecule
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
362
structure length
362
Chain Sequence
EKLFTPLKVGAVTAPNRVFMAPLSRLRSIEPGDIPTPLMGEYYRQRASAGLIISEATQISAQAKGYAGAPGLHSPEQIAAWKKITAGVHAEDGRIAVQLWHTGRISHSSIQPGGQAPVSASALNANTRTSLRDENGNAIRVDTTTPRALELDEIPGIVNDFRQAVANAREAGFDLVELHSAHGYLLHQFLSPSSNQRTDQYGGSVENRARLVLEVVDAVCNEWSADRIGIRVSPIGTFQNVDNGPNEEADALYLIEELAKRGIAYLHMSETDLAGGKPYSEAFRQKVRERFHGVIIGAGAYTAEKAEDLIGKGLIDAVAFGRDYIANPDLVARLQKKAELNPQRPESFYGGGAEGYTDYPSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Focused Directed Evolution of Pentaerythritol Tetranitrate Reductase by Using Automated Anaerobic Kinetic Screening of Site-Saturated Libraries
pubmed doi rcsb
molecule keywords Pentaerythritol tetranitrate reductase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Enterobacter cloacae
total genus 140
structure length 362
sequence length 362
ec nomenclature ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date 2010-10-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3p67A00
3WK1A 4O4VA 3C52A 4NX5A 1AW1A 2ZZ4A 2AGKA 1MEHA 4GUHA 3S9YA 3EX1A 3LCFA 3DI0A 1FWSA 1T0OA 5DELA 2TYSA 3ABSA 5K9XA 1XUUA 3GXPA 1JCMP 1W8SA 1VYRA 2YDAA 1KFKA 1TRIA 4OBTA 4NUWA 3T4CA 5FEZA 1VC4A 1XL9A 3B0PA 3PR2A 5LZLA 2C13A 3W22A 3IVTA 2E6FA 2Q8LA 2V5LA 4HNUA 2VFEA 3F4WA 4LS1A 1ZFJA 1T99A 2IQTA 5FF0A 3M47A 2PE4A 3W1LA 1WDWA 2Z1BA 4UMBA 3QRHA 4GE8A 3WJZA 2A0NA 1O95A 1FXPA 4EOUA 3QQ1A 5LGXA 4TIMA 1ZNNA 1W5PA 3MI3A 3HB9A 1H5YA 1EA0A 3W2MA 3W1XA 2ISWA 2KZHA 1AG1O 1A5CA 3DFOA 2V81A 2EF9A 4IPIA 3C2OA 3VCRA 1Q6RA 5CZJA 1DORA 4Z08A 1GYLA 5IBXA 4OWGA 1WXJA 1DL3A 5G4EA 3EX3A 2YFOA 3W1MA 1G67A 2RHGA 3NL2A 2E09A 5I3FA 1B57A 2PCQA 2ATSA 1ZAIA 3DFQA 4OHQA 2V2DA 4O12A 1I2PA 3LB0A 1TB3A 1BWLA 2QJIA 1OYAA 4JN6A 3W1QA 3W3OA 4UIOA 1GYNA 1R47A 3AO0A 1S5TA 1W3IA 4UFLA 2TMDA 3P8JA 3SW6A 3IRDA 4JYEA 1U5JA 4ZZ9A 5H91A 2ISVA 4UTWC 3YPIA 1H51A 3P82A 1W56A 2DU2A 5J5DA 4G1KA 3W2UA 1LRNA 5BMXA 4QM1A 3HPZA 1OFPA 3FJLA 4IMDA 4IQLA 1GTEA 4MZYA 2VOMA 3S1UA 3W87A 4N4PA 3W2JA 1G4EA 3RK8A 5LGZA 2NWRA 1K8ZA 3UWVA 1R2RA 4AWSA 3LDVA 1IXNA 4BI7A 3UD6A 2WNZA 2EGZA 3NAVA 1IXOA 1KW1A 2QCFA 1VHNA 1W5NA 1Z48A 4B5NA 1H63A 1Q6QA 2V8ZA 3NQFA 2EKCA 3G8RA 5HUPA 5DXXA 3EWXA 1ML1A 4MKNA 1OFAA 1GPWA 2FDSA 1X8FA 3PB2A 3LHUA 2ZFAA 3TJXA 4LT9A 2C15A 2X1UA 2X1RA 1I45A 1R46A 4O11A 5I3IA 1KM0A 2A7PA 3HIJA 3EX4A 3RU6A 3SFKA 3M5ZA 5HQEA 3R89A 5AHFA 1I8JA 2JKPA 3C61A 1H62A 2JKEA 4JX5A 3HG2A 5BW6A 1YTEA 1GVQA 3BLEA 1ZAHA 1WBHA 4MY8A 4JY9A 3NG3A 3S8HA 1CX9A 4N6EA 2QJHA 4UFMA 2QDHA 3MJYA 4CQAA 4TO8A 3R12A 1TPFA 4N02A 1ME9A 5BRBA 2O7QA 1A5SA 4HIBA 4CLMA 1R2TA 5F2IA 4M5PA 4JS3A 4TU1A 3MP4A 1GVSA 1W31A 5EPDA 3NL6A 1KFEA 2A1YA 3LRLA 1FUYA 3U2OA 2VFIA 3P7YA 3GXNA 4NJIA 5F2GA 4WOQA 2WNQA 2ZTKA 2ATMA 1ADOA 4QQ3A 2A21A 4UMCA 1KFJA 1XI3A 3QSTA 4A29A 4O16A 4BFAA 5K9DA 4EF8A 3H55A 5C6MA 1WV2A 4UFKA 3KVKA 3KVJA 3SECA 3SIZA 2ZRUA 4MYXA 4O1AA 3LLFA 1SSDA 3LRKA 3MI6A 1QOPA 1X1ZA 3GKFA 3TDFA 1P1XA 4YWIA 2C0AA 2Q3RA 4AHQA 3LBMA 5EYWA 1TRDA 3W6YA 1O94A 2Q3OA 4X2RA 4TMBA 3KOFA 3N9SA 1JCLA 5EY5A 2FQIA 4FF7A 4DPPA 3MMTA 3P84A 3SSJA 2C16A 4QNWA 2BXVA 2WV8A 3E12A 1TTQA 4IX2A 4PL1A 3KRUA 5CGQA 2HSAA 1I2QA 4CCEA 3QW4B 3H53A 1SR9A 1W5MA 2E68A 3G1AA 3GNDA 4BK9A 3MHUA 3W2NA 1XXXA 2QCHA 4FXSA 3NQMA 3N9RA 1SW0A 4UMAA 3WFAA 1WYIA 4JTJA 4A2RA 2VEPA 3T55A 3W23A 3SR7A 5AFDA 2G5WA 3EX6A 1DV7A 1OX5A 2YFNA 3KX6A 3R13A 4O0ZA 3C3NA 1P0KA 3PUOA 4M19A 5LNWA 4RKAA 3NL3A 2V0TA 1LOLA 1TQJA 3RNDA 4FNRA 3G24A 3P74A 4ADUA 3O15A 2A2IA 5F4WA 3BK0A 3UYCA 5CSRA 4M6QA 2NV2A 4N9CA 3CEPA 1G7UA 1IIHA 2F84A 2Y85A 5F1VA 3STFA 4IMGA 3VKJA 3QMRA 1GZGA 1S5WA 4O28A 6ALDA 2ABBA 3B8DA 3LGEA 5KZEA 3LTSA 3HGJA 4UCGA 2F7FA 3EWZA 4Q4KA 4UTIA 2QCCA 3FA5A 3TFXA 4GUJA 2DZSA 1EPXA 1TPUA 2A85A 3G0XA 4EIVA 4UFIA 5HULA 1QPQA 2J88A 4O17A 3O06A 4NZFA 3LHVA 3QMTA 3IIZA 3TAOA 1LLWA 1ZAJA 2QAPA 1VCVA 2Y70A 3NQ2A 1ME7A 1A5AA 2DZVA 1DOSA 2CLIA 2ZZ2A 3A5FA 5KZMA 4XTIA 4MY9A 1GJPA 1OFQA 2P0OA 4MUZA 1YDOA 3HGSA 1YDVA 3HGRA 4JTFA 4RX0A 1Y0EA 1YYAA 3STEA 4TMCA 3R8RA 3W7IA 1L2UA 2DZXA 3NOEA 4JTHA 1KM2A 2Z6JA 3W7MA 3W7QA 2J27A 1VR6A 1FWNA 3THAA 3P67A 5FF3A 2WNNA 3TJLA 4Q32A 2CLHA 1Z41A 3TV8A 4ZQRA 2FB2A 5LNVA 3B05A 3UWYA 3B06A 1P5BA 3DHFA 3PWAA 4HKPA 2QJGA 3NZRA 3I6RA 2TPSA 4DO6A 5CPLA 4FEZA 3L5AA 1KTBA 3QSRA 1TTIA 3HO8A 4UNLA 1F76A 1YPIA 1QO5A 4NNAA 4O53A 2V30A 1UUOA 4MFDA 2Q8ZA 4LVAA 2OZ0A 1IXPA 4QJ1A 5DBUA 5EA9A 2QCMA 4XZ9A 4QNEA 1C8VA 4UFJA 4DXVA 3LOTA 4YCPA 2CLOA 3TA6A 2X30A 3ZWTA 3PBYA 3I7QA 5AC6A 3G1XA 3S5YA 2DJXA 1ONRA 1Q6OA 1RD5A 3G3DA 2ABAA 1FCBA 4KFPA 4LVDA 3L9CA 1AMKA 5EL1A 3W86A 3UY8A 1TV5A 3S5OA 2XN1A 5IBXC 2B7QA 1N7KA 4LS0A 3BW4A 3LHZA 2H3DA 2V5BA 4O54A 3LCWA 3GIYA 2W79A 5HWJA 3N2XA 4FX6M 1W54A 1U83A 4A3UA 3CC1A 1LYXA 3OEXA 3W88A 4ORIA 3PUEA 3B0VC 1F05A 3A23A 3FKRA 1YXDA 2YW3A 3M5XA 2W6RA 3HJZA 1TPC1 2UV8G 3W1TA 3QH2A 4FXRA 2HS8A 3L0KA 4ML9A 4FX8A 1QPOA 4JTKA 2Y63A 3I7RA 4NZJA 3C2RA 1LBMA 4UTJA 3PB0A 3M5YA 4ONVA 5G2HA 4LS2A 1MSSA 3USBA 3DFPA 3NQEA 5DY3A 3PUDA 2VEKA 4N4QA 1KM6A 1KLZA 3HF3A 1GTHA 1AW2A 3OVRA 1KM4A 3A21A 1F6PA 3O6YX 3L5LA 4CNNA 8TIMA 1V7YA 1XDMA 3G1DA 1GVRA 3IIVA 1DVJA 5LHEA 2ZRVA 3GLCA 4ZQPA 1TPH1 4LW7A 1Q3NA 3BW3A 2DJLA 3RFAA 2FPYA 5CG7A 4DELA 3ABOA 1JRCA 4P61A 3TW6A 4KFOA 3P8IA 5D09A 2HS6A 5AYXA 2I1OA 1ICPA 4ORMA 1HO4A 5EKYA 1H7RA 1GG1A 1ZCOA 2VFDA 5CSSA 1G6CA 4A21A 3I65A 1KV5A 1SPQA 1G4TA 4O1DA 3QFEA 2Y7GA 1CI1A 1EP1A 2DZPA 3UWZA 1KV8A 1K02A 2P10A 1JVNA 5I3JA 1KM1A 1X1OA 2BTMA 4OQVA 3DXIA 4JD4A 1FY6A 3NQ6A 2J9ZA 1JUEA 3IGUA 2NZLA 2GQ8A 3FOKA 3DI1A 1ICQA 4O4WA 2E1DA 3I68A 3MBDA 4E2DA 2PURA 1OK6A 3CHVA 4UUIA 4HNVA 1B4KA 3BPWA 2NUXA 4IJBA 4N9BA 1OYBA 3PBWA 2CLMA 3TUUA 1OF8A 1KTCA 5J5RA 3PG9A 2WO5A 1SO6A 3E96A 3IVUA 4FNTA 2NX9A 4JTGA 4KKXA 5K9CA 4RZ4A 2JGYA 4N9DA 1TPDA 3BLIA 4P2VA 5K4ZA 1YTKA 4PCFA 1OFRA 4BI5A 1TO3A 4X22A 2CZEA 2EPHA 3EWUA 1KM3A 3DH7A 5FF7A 4ZQCA 5AHMA 2BWGA 3ABRA 3S1VA 1VCFA 2X1TA 3WJSA 5HWNA 4PTNA 2H8ZA 2GVJA 1TJRA 2NLIA 3TIMA 3TCEA 4PH6A 1FWWA 5K2ZA 3WK0A 3L65A 4R7JA 1YXCA 3RMJA 1RQEA 3HG3A 3TXVA 3MYPA 2CU0A 3GDKA 2QCDB 1OFBA 1NAL1 1OJXA 4FB7A 3GXTA 3W72A 3M44A 3DZ1A 3W2KA 5KZDA 4NJHA 1WBJA 1JJKA 4DBDA 5L9FA 1FQ0A 1KBJA 2V82A 3CT7A 3IGXA 3S1XA 2PC4A 3M0ZA 3O6CA 4LNYA 2NX1A 6TIMA 3NPUA 2CZDA 4LVBA 1WQ5A 3N19B 3K30A 4Y9AA 4J9JA 1LROA 2C19A 3GR7A 4IMCA 3CWNA 4JDYA 5U7SA 3W76A 4M6PA 1YLVA 3SJ3A 3W83A 2Y62A 3UXDA 3W7DA 1LORA 5CPMA 5DCEA 4BWLA 3C56A 4RZ6A 1VLWA 4K7VA 3C8FA 4RR4A 4JNMA 3P5YA 3GAYA 3OBKA 5F4XA 4ZQMA 4XUGA 1K03A 3WJYA 2YW4A 2ZRYA 2QCDA 4MLRA 1F2JA 2E5CA 1F74A 2H3BA 1LRTA 4NXSA 4LRTA 2A7RA 4MJMA 3W1UA 1M6JA 2CW6A 5D04C 3NQAA 4X9SA 2ZA1A 4FX7A 1O5XA 2EHHA 3NZ1A 4UTTA 5LNSA 2NXIA 4GJ1A 1JCYA 4MPQA 2X16A 1VS1A 3ATZA 1OFEA 3W84A 3ZS4A 2NUWA 3NA8A 3QPYA 2RDTA 5F2MA 2OT1A 2JGQA 7TIMA 3UZ5A 1LOQA 2RDWA 1SO5A 2TRSA 3FS2A 2TSYA 4O50A 3TX9A 4I7WA 2WOQA 3PULA 5KINA 1XBYA 4AWUA 4CNPA 2WKJA 3L67A 3WK2A 1WOAA 2YX0A 2J6XA 5HWMA 1QO2A 1OFDA 4MJZA 3TSMA 1BTMA 1XBVA 2GJNA 3QM3A 3M41A 2FJKA 1F5ZA 3RLUA 1LTDA 4K8EA 1EIXA 2VEMA 2ALDA 1UJPA 3L0NA 3T40A 4OU1A 5KSWA 4XWUA 5AHIA 4KFNA 3MP3A 4NJGA 4DBEA 5DY2A 4AB4A 3W7JA 1GVFA 4O14A 3GDRA 4HSNA 4OE7A 2NX3A 2QAFA 1AW5A 1QAPA 3W1NA 3N73A 3LTPA 3DHDA 2J9XA 4JY8A 3BGGA 3GNNA 4H6KA 5DBTA 1OX4B 1SZNA 3N34A 1K8XA 3KVLA 3SGZA 1S3HA 3NM3A 1QNVA 5C2XA 1CW2A 3GYEA 1ME8A 5A5WA 2CLKA 1G4SA 3W7HA 5TQLA 5L6UA 1V5XA 4L4MA 1YADA 2B7NA 1YXYA 5AN7A 5G4WA 1UCWA 3O8AA 2GQ9A 5D2YA 2ISSA 1FWRA 1LCOA 1XCFA 4QIUA 3LERA 2ZQ0A 1WA3A 3N2MA 1J5TA 4AVFA 4JGDA 5FESA 1AK5A 2C18A 5D2VA 1D9EA 4MY1A 4FIQA 4UR8A 2J24A 2ZZ6A 4JTUA 4K38A 1SU5A 2YPIA 2VC6A 4RK8A 1ZY9A 3M9YA 5KITA 2DZUA 1PCKA 4LVGA 2Y88A 3CPRA 1GWJA 1S5VA 5AC7A 1HG3A 1W3TA 4Z1DA 3LI1A 5G2IA 4Y8FA 4MVAA 2AQWA 1TTPA 5FEPA 5D38A 3KRZA 3IIOA 2CLLA 1P0NA 2B4GA 5SWUA 3L2IA 4GUIA 2Y7EA 1GEQA 3N3MA 1OX4A 3DKJA 1MXSA 3S0CA 3CQ0A 1DJNA 1W0MA 4TX9A 1L6YA 4KWVA 4POCA 5EMUA 4ZQNA 3TSDA 4GUFA 4K36A 4H3DA 2ZDRA 5DCBA 3QMSA 3PSVA 4AH7A 1XDLA 3MYOA 4LUIA 3E49A 2QCEA 4NVTA 3B04A 1EP3A 2RDUA 3HQ1A 3VNDA 3HPSA 5EBUA 1XC4A 3W85A 1F7BA 2FTPA 3C2VA 5DN1A 4DO4A 2YSWA 2X2GA 3NR0A 5E1QA 1N8FA 5HR6A 4C1LA 1SZFA 2GPTA 3OHIA 4JICA 4M7TA 5C55A 1W5QA 4WOZA 1GT8A 4YLWA 4EWND 3BV4A 4HNTA 1TV7A 2ZRZA 5LHFA 1KFBA 4M7SA 4XBSA 3V1PA 5H2ZA 1D3GA 3QYQA 5HINA 2BZNA 3EX2A 1NVMA 1FWTA 3QQ0A 5FF4A 2BX7A 1PVNA 3W7KA 3Q2DA 3NL5A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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