3P74 | Genus

Total Genus 140

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	140
sequence length	363
structure length	363
Chain Sequence	KLFTPLKVGAVTAPNRVFMAPLTRLRSIEPGDIPTPLMGEYYRQRASAGLIISEATQISAQAKGYAGAPGLHSPEQIAAWKKITAGVHAEDGRIAVQLWHTGRISHSSIQPGGQAPVSASALNANTRTSLRDENGNAIRVDTTTPRALELDEIPGIVNDFRQAVANAREAGFDLVELNSAHGYLLHQFLSPSSNQRTDQYGGSVENRARLVLEVVDAVCNEWSADRIGIRVSPIGTFQNVDNGPNEEADALYLIEELAKRGIAYLHMSETDLAGGKPYSEAFRQKVRERFHGVIIGAGAYTAEKAEDLIGKGLIDAVAFGRDYIANPDLVARLQKKAELNPQRPESFYGGGAEGYTDYPSLHH

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	A Site-Saturated Mutagenesis Study of Pentaerythritol Tetranitrate Reductase Reveals that Residues 181 and 184 Influence Ligand Binding, Stereochemistry and Reactivity. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Pentaerythritol tetranitrate reductase
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Enterobacter cloacae
total genus	140
structure length	363
sequence length	363
ec nomenclature	ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date	2010-10-12

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00724	Oxidored_FMN	NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3p74A00

2NZLA 3OVRA 2PCQA 3QC3A 1NFBA 2V2DA 2A85A 3C52A 1KLZA 4FIQA 4NJGA 3TJLA 3NPVA 5D2WA 2YYUA 3O05A 5F1UA 3LV5A 1TRDA 3G22A 3P7YA 3W1XA 4TO8A 2B7NA 3SFKA 4LRSA 1A53A 2QCNA 2C1HA 3JR2A 3ATZA 3TX9A 1O95A 4JDBA 2QAFA 3QW4B 4QNEA 4BFAA 3PVFA 3C61A 3W1MA 3DFQA 1FDZA 1I2QA 1RD5A 1V7YA 4Q33A 1RVGA 3C8FA 3HMJG 3QSTA 3LTPA 1WV2A 2ZBTA 3LXAA 4NZJA 5G1TA 4FO4A 2H8XA 3KXQA 4OGZA 3PM6A 3LBMA 3NZ1A 4NNAA 2YYTA 3UWWA 1O94A 1RR2A 3VCRA 3QZEA 3G1FA 3CQ0A 2HS6A 2W0UA 1B3OA 1TJRA 4YXGA 3MHUA 1NSJA 1JCXA 1QFEA 3W71A 5FEWA 5J5RA 2CLEA 2V5BA 2B7OA 5J5DA 5E0KA 5CKSA 3ABRA 2E09A 2QCHA 1X8FA 3FYOA 1G67A 4KWVA 4ADSA 3EWWA 1ZAHA 1YLVA 4UFIA 3DU0A 5A8GA 3OHIA 5D2VA 3BLFA 4X22A 2TRSA 2YCEA 3DENA 3FA5A 3U8GA 4K6AA 1UCWA 5H2ZA 2JGYA 1OX4A 3L65A 2VEPA 3DKLA 1EWEA 1YTDA 4IX2A 2OCZA 3W7NA 2W6RA 3NM1A 3BW2A 5EBUA 3P80A 4NJIA 1RPXA 4R34A 2VKZG 4O1DA 5DN1A 3HGJA 4LU0A 1K7FA 4PCFA 3QEZA 3NPWA 2ZZ4A 1YPFA 3BW3A 3ZWTA 3RF9A 4Q4KA 1DV7A 1PHWA 4XZ9A 3AJXA 2Q8ZA 4FEZA 4DF0A 1XBVA 4N4QA 3QJAA 4O14A 1TPEA 2V81A 4CQAA 4UTHA 4N02A 3JS3A 3NQ6A 3DHDA 3TXVA 2GQ8A 3P8JA 1IXOA 5D05A 3ZS4A 2VFGA 1VLIA 3RFAA 5CSSA 2GQAA 1P0KA 1SO3A 2CLFA 3LHWA 4IMEA 2A7NA 1SW7A 1OFAA 1TQJA 1W54A 4JNMA 5TIMA 1ML1A 3C4UA 3EX1A 3PUOA 4M19A 2TPSA 1UJPA 3CWNA 3DXIA 4XUGA 3UPWA 4WD0A 1TPC1 2NUXA 3UQNA 2J9ZA 5I3KA 4O0KA 1SZEA 4IMGA 4WXYA 4GC4A 1FXPA 3IIOA 2DZSA 3UXAA 4U28A 1JCMP 1R30A 5EYWA 3W72A 1ADOA 4UIOA 1JQXA 4UTTA 1EEPA 2DJXA 3PBWA 4NQ1A 1TIMA 4PH6A 5CPOA 3G24A 1B9BA 4LWWA 4GRSA 2H8ZA 2Y70A 5L9FA 3BG5A 2V30A 3OEXA 1LORA 3NVTA 3PSWA 3RLUA 1JR1A 3EKLA 4UFHA 1W0MA 1S5WA 1OHLA 1MEHA 5FF2A 1TTIA 4JTHA 1AK5A 5FESA 2P10A 1SQ7A 3QMTA 5HWMA 2RDTA 4A3UA 1F2JA 2WJZA 1VYRA 3UZ5A 5D38A 2A1YA 1KBIA 2ZYFA 1EP2A 1QO2A 3L67A 1H62A 1LM1A 3GKFA 4JXCA 3CU2A 1H7PA 1TPUA 3N19B 5HQEA 4O8RA 3D0CA 2Z2UA 1X1ZA 2I1OA 2AAMA 3FKKA 3M9YA 1CW2A 4DPQA 3GDMA 4IQLA 4JIQA 3EKZA 4GUGA 4LVGA 1ZY9A 3S1WA 3HPSA 2CLHA 2ZDRA 2RH9A 4UMBA 2FLIA 1FY6A 4JTEA 5F1VA 2FQIA 4TMBA 4LOCA 4WY0A 3W22A 2NWSA 4JGDA 4UXDA 2G5WA 4MY1A 5AHEA 3H55A 3B03A 3NQFA 5IBXA 3BK0A 1KV8A 2CLOA 3GNDA 3DI0A 3ANYA 3W7HA 1ZHAA 2C13A 3STEA 4A29A 3NQCA 1G6CA 3KVKA 4QM1A 4LVAA 4RX0A 5HWJA 4JIPA 1QOQA 1LLZA 1SSGA 5LNSA 1T8XA 1ALDA 2ISWA 1F6PA 1H61A 2Y7DA 3UD6A 2Q3OA 3WJSA 3HOJA 1O5KA 3M16A 3C2FA 3UZJA 1BKSA 4O1BA 3S8HA 2V2CA 2XN0A 1N55A 3TAOA 2B7QA 1A50A 1W3IA 4OHQA 3LCHA 1H7RA 1OX5A 1XCFA 3S42A 3W07A 3DFOA 4JTTA 3W7IA 4K36A 3W1UA 3SSJA 3THQA 3O15A 4M6QA 1NAL1 1GPWA 3ATYA 4BI5A 5TBOA 1H1ZA 4DO5A 1EP1A 2FTPA 3IIXA 1GJPA 5DXYA 4RXFA 3TK7A 1QDSA 1KM1A 3UNDA 5DCDA 3FS2A 1JUBA 3TDFA 3P61A 2VOMA 3NDOA 4JYFA 4EF8A 3A5FA 4POCA 3WJZA 2BX7A 1QMLA 3PY2A 3QF0A 2V5LA 3BLIA 3LBCA 3M44A 2IQTA 5HJLA 1PL9A 2XN2A 1GT8A 2R91A 4EIVA 1VCFA 5K4ZA 1FBAA 2E5BA 4NXSA 3TQKA 2X30A 3KFTA 1SO5A 2ZRYA 3BVJA 2PE4A 3LTYA 3WK3A 1RZMA 2P0OA 4JS3A 1AW2A 1ICSA 4E2DA 4YCPA 5C5YA 1JVNA 2AGKA 3VE7A 2DZTA 3L68A 3M41A 4YCOA 3ABOA 3TSBA 1TPWA 5G2IA 2VFEA 4NNCA 3W1NA 5CZTA 4MZYA 4JTUA 4LTSA 1XI3A 1GG1A 2WOQA 1EUAA 4I7VA 4FNRA 4HPXA 2DZUA 1YADA 1UASA 3W2NA 2ABBA 3MI3A 3M5VA 4MZ8A 3R13A 2KZHA 4UTUA 2ZZ5A 3T4CA 1H7NA 3I7QA 3K30A 1EIXA 1WXJA 3G0XA 4UFLA 3MP4A 3C2OA 3M1ZA 1R2TA 3TC6A 4UTMA 1V5XA 1GQNA 1H60A 3MW7A 3M5ZA 4KFPA 2Y85A 3MO7A 3C2RA 3Q37A 2A7RA 4PA8A 5EA9A 4PL2A 1JQVA 3QPYA 2ABAA 4GJ1A 2DZPA 3NZRA 1A5SA 3LLDA 2ALDA 1FWRA 3P8IA 1W3NA 2JBMA 4WOQA 4HKPA 4Y9AA 4CLMA 4C1KA 3LCGA 1WAUA 3M6YA 3W73A 1VQTA 5E93A 1ME7A 3P84A 3TSMA 1J4EA 1HUVA 3B4UA 4YL2A 4Z1AA 3MP3A 1G4EA 1GG0A 4PEKA 3TFCA 2DORA 2Y7GA 4AWUA 3MUXA 2FPTA 4NU7A 4A21A 1B4KA 3TMLA 4W9TA 5FF3A 4LV9A 2VENA 4IMCA 3STGA 5D04C 1DOSA 3W74A 1EUNA 3EX3A 4DF2A 4Z1DA 4DXVA 1EP3A 5TQLA 2C6QA 4ZMGA 2CZEA 1EWDA 3NQ2A 3HG4A 1BWKA 1L2UA 3QW3A 1R47A 3NPXA 4Y96A 4YWIA 3NQEA 3YPIA 2Z6JA 1DORA 3Q2DA 2Z0IA 4Q32A 1O60A 1FWNA 3M7WA 2ZRWA 4N2YA 5HUPA 1OFBA 3ABSA 1OK4A 4DEFA 3M0ZA 4ZQRA 3PAJA 2GVLA 3QMSA 2BTMA 4WZHA 3GNNA 4TX9A 3CM4A 5FF7A 3A5VA 1SW0A 2JK2A 1VJIA 4R53A 3HBLA 1QPQA 1JCJA 4MFEA 2ATSA 3NL3A 1WX0A 3KRZA 4I7UA 4E0CA 3NQGA 2RHGA 2CLKA 3PSVA 5G5IA 1NVMA 4K38A 5LGXA 5AHLA 3UWYA 1XM3A 3TFXA 3U2OA 1Q45A 4RZ5A 3W87A 3I7SA 3PS7A 2WV8A 4MYXA 2ZA1A 2FDSA 2O7QA 3IEBA 4PL1A 4B5NA 1VZWA 5U7SA 1WBJA 1QR7A 3G1DA 3EXSA 2QDGA 1YTKA 4X9SA 3TAKA 3P62A 1G4SA 1U5JA 1KM3A 2V8ZA 1TO3A 1GVQA 4NX5A 1L9WA 2WPBA 4J9JA 3FEMA 3QFEA 1PCKA 1IIHA 1ME8A 1OFPA 4FXSA 4N9BA 1KTBA 1KTCA 1EA0A 4FNTA 1IXNA 2ZRVA 4WY0F 4JTJA 3TH6A 3UWUA 1IXQA 4LVFA 4UTTC 3FJ6A 1TV5A 4FNPA 1VS1A 4KFNA 3LV6A 5D03A 3VFLA 3W2LA 1EX5A 3IIPA 3DFTA 3KVLA 4PFMA 4FIRA 3TA6A 3UY8A 2JKPA 3NM3A 2RDWA 3VKJA 3AO0A 4XBKA 3MYPA 4GUHA 4UNLA 4TU1A 5EMUA 2YZRA 1JCNA 5AC7A 1ZALA 2YW4A 4Z08A 1WDWA 1UB3A 4HNNA 3TQVA 1JJKA 4CNPA 4IGHA 4QJ1A 3IIZA 1SFLA 5LKYA 2QKFA 3F4NA 3CPRA 1GVRA 5LGZA 4JTSA 3IVUA 2RFGA 1KFJA 2WNQA 7TIMA 1UUMA 2FPVA 4I7WA 1TSIA 3PBUA 1VYPX 4LNYA 4FF7A 1VYSX 3W76A 3PULA 3B06A 4TR9A 3A21A 5I3GA 4IXXA 4MFDA 4R7JA 4RXGA 1VHNA 1H51A 3UWQA 4UFMA 1B4EA 4S2BA 3W1QA 3E49A 3BLEA 4TIMA 5L6UA 1H5YA 3W7MA 2NV2A 3KVJA 4O19A 2ZZ1A 3BPWA 3SY5A 5HNRA 2WNZA 1SU5A 1KM5A 1WA3A 5FEXA 1YXYA 1OK6A 1JRBA 3O6YX 4HN4A 3SECA 1GYLA 3C0JA 5IBXC 4DBDA 1SFJA 2P1FA 1KM6A 1ZAJA 2CZFA 3G3MA 4XBSA 2YR1A 4KWWA 5DCBA 3M5XA 3QH2A 4ADTA 4UTKA 4Z1CA 1QNVA 1UUOA 1G7VA 1ICPA 1VCGA 2X1RA 5BNKA 3LTSA 3W7OA 2RKXA 3M5YA 5KMYA 2YDAA 2CFFA 2TSYA 4EOUA 3B8DA 2R8WA 4IUOA 4RCXA 1F7BA 4ZZ9A 4O54A 4YLWA 4IWWA 2NX1A 4M7TA 1C29A 4MLRA 3LCXA 3WJYA 4ORMA 4EVZA 1Q6RA 2J9YA 3FKRA 3NQAA 1HO4A 3EEGA 2TYSA 1OX4B 1XBZA 3LHZA 3P81A 1E51A 1MZHA 1DHPA 4HHPA 4BF9A 5KZEA 1KFCA 4BI6A 3S5YA 1ZFJA 4UTWC 3HG2A 2CLIA 5E1QA 6ALDA 3UY7A 4GNJA 1J5TA 3WK1A 1PIIA 1F73A 3GDTA 5LZLA 5MHBA 4O12A 1G7UA 3P82A 3NQ8A 5AC8A 1GYNA 2ZFAA 4AAJA 3MI6A 4G1KA 4Z0JA 3ZFHA 1DQWA 5LSMA 3L5LA 4AWTA 3HQ1A 4O15A 1OVDA 2ZTKA 3WK0A 3P74A 1WOAA 2C18A 3TCEA 5AHNA 1LRNA 3HG3A 1W5NA 2FJKA 3JRKA 1Z48A 2E6DA 3DFNA 5LNRA 2GJNA 3W7KA 2QUUA 4O18A 4M5PA 4N4PA 5HULA 3O6CA 4CNNA 1MSSA 3ZWSA 3USBA 3W86A 1DQXA 4RLIA 3LM7A 3GLCA 4M6PA 4TMCA 3S1XA 1AG1O 3G1XA 4YMZA 4OV4A 2Y6ZA 5C55A 2A2IA 4WJEA 4Y6GA 4DPPA 4HIBA 5HINA 2BWGA 3U6WA 3I7RA 3A9IA 3W7LA 2PRHA 1RQBA 3W83A 1RQHA 4HPJA 5CGQA 3PUDA 2FIQA 2Y7FA 3NQVA 1DL3A 3Q58A 4PTNA 1LCOA 3HG5A 3E12A 1XUZA 4D2JA 1R46A 2QCFA 4LY8A 3B0VC 3F1QA 4RZ4A 4MVAA 1R2RA 4AHPA 3S9YA 1YDNA 2QCMA 3LHTA 5D09A 2ATMA 4MIMA 4RV8A 4Y90A 1PS9A 2NLIA 3R2GA 5D37A 5HUOA 4MUZA 2A7PA 1KM2A 3V75A 1ZJIA 4JEQA 3L5MA 3W1TA 1FCUA 2CZDA 1I2OA 3P5YA 2XN1A 5AFDA 5I3JA 1GOXA 3W7RA 2ZTJA 3R89A 1TPVA 3FYPA 3NG3A 5LNUA 4AHQA 3L5AA 3IGXA 1SO6A 3B0UX 3FJLA 4GE8A 2W79A 4HSOA 3N73A 4OE7A 1W5QA 1P0NA 1ZAIA 1OFEA 3SR7A 1KW1A 4NVTA 3HO8A 3LXBA 5DY2A 3W7CA 3SIZA 2GOUA 4JX6A 1N7KA 4XTIA 3GDLA 3DBPA 2VELA 4JYEA 4NJJA 4WY0B 1DJQA 1LTDA 4PODA 4ML9A 3CEUA 2H6RA 4K37A 1CI1A 4ZQCA 3PBYA 3HJZA 3LI1A 3THAA 3HF3A 3T40A 2E68A 4RK8A 1ZCOA 3LCLA 3IVSA 1SZFA 4JTKA 4O50A 2EHHA 3VE9A 1TREA 2GQ9A 2Y7EA 4UTIA 3HPZA 3TJXA 1WOBA 1Z42A 3C2VA 4MY9A 2V2HA 4FNSA 3PUEA 4JR5A 1KFBA 3BG9A 4UR7A 4IXHA 2B4GA 2F7FA 1HFBA 3OVQA 1KFLA 4UCGA 5BMWA 1O5XA 2FPYA 2DZVA 1ONRA 3T7VA 2QCEA 4H6KA 2VXNA 4UMAA 1VH7A 3EXTA 4O0ZA 1X6UA 4HT3A 3O8AA 3EWUA 1KM4A 5K9CA 4FHAA 4IX0A 3NR0A 3B0PA 3W1PA 3IGSA 1S5VA 3QQ0A 3W85A 3L0NA 3UPBA 2NXGA 1AMKA 4XTDA 5HMSA 4O10A 1LOLA 3N9SA 1FX6A 1TRIA 4LS1A 4OT7A 2JKEA 1SO4A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3P74A

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