3P80A

Pentaerythritol tetranitrate reductase co-crystal structure containing bound (e)-1-(3'-hydroxyphenyl)-2-nitroethene
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
363
structure length
363
Chain Sequence
AEKLFTPLKVGAVTAPNRVFMAPLTRLRSIEPGDIPTPLMGEYYRQRASAGLIISEATQISAQAKGYAGAPGLHSPEQIAAWKKITAGVHAEDGRIAVQLWHTGRISHSSIQPGGQAPVSASALNANTRTSLRDENGNAIRVDTTTPRALELDEIPGIVNDFRQAVANAREAGFDLVELHSAHGYLLHQFLSPSSNQRTDQYGGSVENRARLVLEVVDAVCNEWSADRIGIRVSPIGTFQNVDNGPNEEADALYLIEELAKRGIAYLHMSETDLAGGKPYSEAFRQKVRERFHGVIIGAGAYTAEKAEDLIGKGLIDAVAFGRDYIANPDLVARLQKKAELNPQRPESFYGGGAEGYTDYPSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A Site-Saturated Mutagenesis Study of Pentaerythritol Tetranitrate Reductase Reveals that Residues 181 and 184 Influence Ligand Binding, Stereochemistry and Reactivity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Pentaerythritol tetranitrate reductase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Enterobacter cloacae
total genus 138
structure length 363
sequence length 363
ec nomenclature ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date 2010-10-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3p80A00
4LY8A 4IX0A 1YXCA 2GPTA 4LVAA 2A2IA 3LV5A 5EYWA 3TR2A 1ICQA 3BARA 1NFBA 1V5XA 5LKYA 4IJBA 2NUYA 5F4SA 3W7PA 2E68A 2PRLA 2DP3A 3CC1A 3JS3A 2BWGA 5BMWA 4FIRA 4PEKA 3KAOA 4UFKA 3EX1A 3GAYA 3GKAA 3S6DA 5K9CA 3NAVA 4XZ9A 4LS2A 2JGYA 3HB9A 3N9RA 1WQ5A 4BFAA 1AK5A 1EWDA 2WNQA 1QCWA 3VFLA 4HIBA 5D38A 1CX9A 2QCEA 3P82A 2Y6ZA 3G3MA 4Y6GA 4U4MA 3EWWA 1TPDA 2DZVA 2B7OA 4OV9A 1R30A 3QMTA 4EF8A 3DENA 3NPVA 3ELFA 4Y8FA 1FDZA 3GZ3A 3G1AA 1VHNA 3NL2A 1QOQA 3VE7A 1KTBA 4JTKA 3P67A 4JR5A 1AW1A 4NT0A 5CSSA 3SSJA 1I2QA 3QSRA 2ZRVA 2FJKA 3T7VA 1LCOA 4M7TA 3V1PA 1X8FA 2XN0A 3E12A 3LRLA 3TMLA 1W5QA 3UXDA 2V5BA 3TU9A 2EKCA 3MYOA 1VQTA 5J5DA 2WNZA 1R2SA 1PE1A 1KBIA 4IWWA 1TV7A 5FF7A 1P4CA 2A7PA 3E0IA 5F4XA 4AHPA 2VFDA 2C15A 2VEMA 3G0UA 4IX2A 3E49A 3R12A 4O53A 3UXAA 1LROA 5FF0A 3S9YA 3G1FA 4DF2A 3TC7A 3NQEA 3DI0A 2Z6IA 5C2XA 3W07A 3DFPA 4WY0A 1M6JA 3W1RA 4CQ8A 1SO5A 3G22A 2BTMA 3AJXA 2B7QA 2E6YA 4K36A 2YDAA 3UWYA 1H7RA 1FBAA 2JK2A 2QCGA 4BK9A 4JTIA 1OFDA 2JBMA 3B03A 2Y85A 2Z0IA 1W3TA 1OFQA 1O60A 5AOUA 4UCGA 1G7VA 4PA8A 1EIXA 4O10A 1GVOA 5DXXA 5KMYA 4NU7A 3BW3A 4NNAA 1RV8A 2ATMA 2NX1A 3C52A 4IXHA 3GXNA 1PVNA 3G1XA 1SSDA 2Y89A 3ZWTA 4IGHA 3LHZA 4I7UA 4YMZA 4O16A 6TIMA 3QEZA 5FESA 1R46A 3INPA 4WXYA 4ADUA 1F05A 1RQBA 5LSMA 4N9EA 4JTGA 3M5YA 4PL2A 5EY5A 1SFJA 3TXVA 2VEPA 5K3VA 3PG8A 1GTHA 4HPJA 4NX5A 3KVKA 1HO1A 1SO4A 4LV9A 2QF7A 4TR9A 3W7MA 3RLVA 5HR6A 3DHFA 3UY8A 4O0KA 3W7JA 8TIMA 4N4QA 1FXPA 4Y9AA 1YDVA 1TREA 1VYPX 1L6YA 1P0NA 4A2SA 3PS7A 3DAQA 4KWWA 2C14A 3IVTA 4AHOA 3LXAA 4DEFA 1AMKA 5KSWA 5HULA 2CZEA 2CU0A 3ZFHA 2NV2A 2CLFA 3DH7A 3W2NA 3W7DA 1P5BA 3HGRA 1F74A 3QPZA 1W54A 2GQ8A 2C13A 3LBMA 3TV8A 1JJKA 4RKAA 4S2CA 4FHAA 3P8JA 5FF2A 1U5JA 1THFD 2HS6A 2Y7GA 5E93A 3UNDA 4EVZA 3QM3A 3EWXA 4ZVJA 1KM1A 4NZFA 4HNUA 3W84A 2JKEA 2YW4A 3W7EA 3LXCA 3QRHA 1NAL1 2V2DA 2X1RA 1GG0A 1H7PA 1TJPA 4S2BA 2Q8LA 2X1UA 1H7NA 4HNNA 4X9SA 3NQGA 4M6VA 1H63A 3S5NA 5I3HA 3C8FA 4NJIA 2GOUA 1R2RA 5LHFA 4I7VA 1HTIA 5IBXC 4MFEA 3TQ0A 4IPIA 4DBDA 4DQWA 3LCFA 1KTCA 1L6SA 5AFDA 3SGZA 3HG5A 4DXVA 1JCYA 3TMQA 3CQ0A 4JD4A 3GXPA 3W1XA 1GVRA 1I2NA 1ZAJA 1SZEA 1IIGA 2A1YA 1OX5A 1YLVA 2R94A 3S0CA 2P10A 3PBUA 2G97A 3NNTA 1NF7A 5LNVA 3IIVA 3QW3A 3NL6A 5F1VA 4QISA 3HF3A 2ZRZA 2CLHA 2H6RA 4X22A 3UD6A 5MHBA 4FNTA 5D04C 1OX4B 2E5BA 4JXCA 1KFEA 4J9JA 4FNPA 4Z0SA 2OT0A 2NXHA 5D02A 3STCA 3NO5A 3W2UA 1DKWA 2DZXA 3WJSA 5FEXA 3QJAA 1K8YA 2VEIA 3S1VA 3PC0A 4A21A 2V9DA 4LVBA 4RR4A 5DELA 2BZNA 1WXJA 2C3ZA 2VXNA 3IGSA 4LVDA 3TA6A 3LM7A 3HPZA 2RDTA 1SUXA 4O14A 2QCNA 1F2JA 3SI9A 3O6YX 4Z1AA 1YDNA 1TPVA 2H90A 3HO8A 4RZ6A 3SIZA 5EL1A 1ZALA 1IIHA 2Z6JA 5AHFA 2QJIA 2OJPA 4AAJA 4IMCA 1TPWA 4HHPA 2CLKA 4QAIA 4Z1BA 2WKJA 3W7RA 1OYBA 4FEZA 3C0JA 1Q6LA 4AVFA 2C0AA 3THQA 1LP6A 5C6MA 5DN1A 3KXQA 2I14A 5G4WA 1HL2A 4O13A 5AC7A 3MHGA 2J6XA 4RCXA 3HGSA 1RZMA 1VCFA 1ML1A 1UJPA 4TU1A 4UTWA 5HQEA 4IMFA 1B4KA 3N2MA 1NF0A 3STGA 2FIQA 1L2UA 5L6UA 5LHEA 3LERA 4GUHA 2G95A 3Q94A 1AG1O 3DI1A 4JYDA 3NEVA 5DBTA 3R13A 3W83A 4MYXA 3W2KA 2ZYFA 1H62A 3PBYA 3W1UA 3QC3A 1C9DA 3GDMA 3EX6A 3DKLA 2Y7FA 4IXXA 3BG5A 2GVJA 3STEA 4MLRA 4EF9A 4MYAA 1Q6QA 3FIGA 1TPB1 1UB3A 1W5MA 4LVGA 1SSGA 5D2TA 3B0VC 1O5KA 1TV8A 3TW7A 1IF2A 2TYSA 4O11A 5AC8A 4QJ1A 5G5IA 4O0ZA 4QSHA 2R8WA 2YZRA 3LHVA 1H51A 3I7RA 1F5ZA 4K38A 3TQVA 3C4UA 1H60A 2A0NA 1QDSA 1PCKA 3M43A 1DQWA 5HNRA 3CIXA 4DELA 1M5WA 5KZMA 5D32A 3HGOA 4K7VA 3M1ZA 2HS8A 5AHNA 3W85A 1OX4A 3MP4A 4AMAA 5F1UA 3S42A 3L9CA 1YPFA 2Y7DA 1JRCA 5KITA 3L65A 4GUJA 3QYQA 5FF3A 4TMBA 4X2RA 3CIWA 1Z48A 1M7PA 4ALDA 1IGSA 1QPNA 4RZ4A 1FDYA 2ZRXA 3O06A 2Y70A 1G4TA 1QWGA 3H55A 1SU5A 5G1YA 2O7SA 3W7NA 3N14A 2B7NA 1GT8A 3LCGA 2RKXA 2OT1A 1DV7A 1Q45A 4LC8A 1OFOA 1LLZA 3LCLA 4Y90A 4O52A 3NL3A 4WZHA 1VJIA 4UFHA 3BW2A 1GYLA 3N2XA 2E1DA 1EB3A 4AWUA 3W70A 2NXIA 3PAJA 2X2GA 4JIQA 5FEWA 3G1VA 4RXGA 4JS3A 3LLDA 3LOTA 3PBVA 3TJXA 1LRNA 4AEOA 2VELA 3NR0A 4YL2A 2E6DA 4Z1DA 3TC6A 4LRSA 1B3OA 1G6CA 3N3MA 4LW7A 2QDHA 4RLIA 3NM3A 3GVGA 3IIZA 3C61A 2CZ5A 1OK4A 4OU1A 5HMSA 3UPBA 4PH6A 4FX7A 5D05A 1YXYA 4MY1A 3F1QA 3SR7A 2OX1A 4Z0JA 1Y0EA 3D0CA 4WY0B 3M16A 5AYYA 5AB3A 1X1OA 3P5YA 1IXPA 3ABOA 1JQXA 2QDGA 3DFTA 1RQEA 4MJMA 3NQCA 2EPHA 3RLUA 3TNOA 2NX3A 5C55A 1ZY9A 1NEYA 3HG2A 2H3BA 4BR1A 5IM51 3QF0A 1MZHA 4CNNA 5CPNA 2X1TA 3IV3A 3BGGA 3T40A 1I8JA 3MW7A 4DO5A 1OFRA 4UTJA 3E9AA 1D3HA 1ZAHA 2CLIA 5EBUA 2C6QA 3C2OA 1QPOA 4PODA 1GVFA 1K02A 2AQWA 3F03K 5FEPA 1WOBA 3RNDA 2C1HA 4CCDA 4XBSA 3STFA 3DFSA 2V5LA 4FIQA 3WK3A 2GQAA 3LCXA 4JTUA 1VLIA 3FEMA 3GXTA 2ZRWA 1OVDA 1XI3A 1RD5A 4L4LA 2X1SA 3CWOX 4XQ6A 3W2JA 3KOFA 4A3UA 3WJXA 2C19A 3QSTA 3SZ8A 1W5PA 3UWUA 1VZWA 2ZZ4A 1XBYA 5I3JA 2WJZA 1U83A 3W75A 3IIXA 3NA8A 2NUXA 2QAFA 3TKFA 2BXVA 3M5VA 3MHUA 4UFLA 4JGDA 3NM1A 2R14A 3OVQA 3L2IA 4JTEA 3NPWA 4JTJA 3EKZA 4Y96A 2A85A 1ICSA 3G1SA 5CZSA 1H7XA 4UFIA 2FLIA 1OX6A 4H3DA 2YCEA 3O1NA 1I2PA 1X7FA 1T96A 1G69A 1WAUA 4P61A 1XCFA 2B0MA 1OJXA 4MJZA 3P7YA 3BLIA 4UTWC 3VKJA 3JR2A 4JIPA 3P8IA 1JULA 4UXDA 3LV6A 4ADTA 5LNSA 1XDLA 4ZL1A 2VFFA 4UTTC 2Y7EA 1F76A 2NV1A 1OFAA 5D33A 2OZ0A 3P80A 1IXQA 4O4VA 1TPFA 3NZRA 7TIMA 4OBTA 1R47A 1MEIA 3TSDA 1VYRA 1ME9A 4LRTA 3DHDA 3LTYA 4IUOA 5F2IA 3L0KA 1R2TA 2VFGA 1KM5A 4GUGA 4M19A 2QEZA 1OFPA 1OF6A 5E0KA 3K30A 1JCJA 4UTIA 1EP3A 4DO4A 4TX9A 3NQDA 4NNBA 2GVLA 3VI2A 5K4XA 3UWQA 4QNWA 3NQ7A 4W9TA 4NQ1A 4LU0A 3R89A 4HNVA 4FX8A 1FCBA 2PRHA 4O19A 1D3GA 2ZQ0A 5CPLA 1IXOA 1AL7A 1KFJA 2QCLA 3A23A 4I7WA 4GNJA 5AHEA 1MO0A 3S5OA 3FJLA 3A5VA 4U28A 4OE7A 5FF4A 1TTQA 3NQFA 1NVMA 4TIMA 3G24A 5KTLA 4NJGA 3UQNA 3MYPA 1FX6A 2C18A 3A21A 4E2BA 4HN4A 4YXGA 3CPRA 1SO3A 4PCFA 1K3UA 3W1TA 4FNRA 2F84A 3M6YA 3BW4A 3H54A 3M5ZA 1SZGA 1VH7A 4FNSA 4O1CA 3EX3A 4UTKA 1W5NA 4PC8A 1OG0A 3NVTA 1QO2A 1UASA 4K6AA 4WX2A 1GOXA 4MIMA 3UZJA 2VFHA 1I2RA 4O57A 1OF8A 3W7LA 1MSSA 5LNWA 3B8DA 3ANYA 3MI3A 1K7EA 4UIOA 1MXSA 4GJ1A 3GX9A 3B05A 3B4UA 3FYPA 3CEPA 2CZDA 2PCQA 2YX0A 2Q3OA 2FB3A 3W1AA 3PG9A 1G67A 3PB2A 1OHLA 1OYAA 3M7WA 2WOQA 3EXTA 4NXKA 3W1PA 1KM6A 2YPIA 5ABTA 2WV8A 1ZAIA 1LOLA 3LDVA 4FXSA 3UWZA 1KM2A 4K8EA 1VRDA 3PSVA 1L6WA 3CM4A 1FQ0A 3CLMA 3QQ0A 3O16A 4QITA 4UMBA 1LBFA 4NVTA 3MBDA 1TB3A 1T8XA 1EX5A 3VNDA 3GDLA 3W9ZA 4H4IA 4ZQCA 1G7UA 2HTMA 4N6FA 5DCDA 1TV5A 2QR6A 1P0KA 3MUXA 1W3NA 3W7HA 1J2WA 1L9WA 3EWYA 3S5ZA 4UMAA 2G96A 3CWNA 1A5CA 4O17A 1H1YA 4EIVA 4JDYA 3FKRA 3TQKA 1LOSA 2JGQA 4G1KA 5KINA 4O4WA 2P0OA 5G2WA 5DXYA 4XKYA 3ZWSA 2DZUA 1OK6A 4LWWA 2CLEA 2ZZ1A 5F4WA 1LDCA 1ZFJA 2A6NA 3LHWA 4N2YA 3W7GA 4ZZ9A 4JTLA 3NQ2A 2EAWA 3I6RA 3PB0A 1FWNA 1TTPA 4UMCA 3QQ1A 1TPEA 3FJ6A 3N19B 3SW6A 3C56A 2GJLA 4O8RA 5K2ZA 3W71A 3W74A 2E09A 1GQNA 5FI8A 4K7YA 2QJGA 4ZQRA 2WO5A 3IVUA 3ATZA 3WJZA 3Q58A 1HUVA 4HT3A 3G1HA 2ALDA 3TROA 2E6AA 2H8XA 1I4NA 3CHVA 3IIPA 3USBA 3N34A 4H6KA 1SR9A 1B4EA 4RX0A 2FPYA 1EEPA 4M6QA 3W73A 1VC4A 2ZTKA 3EEGA 2I1OA 2QUUA 2ZTJA 2CZFA 5EMUA 2I9EA 2WQPA 5DY2A 2J27A 3PUEA 4MY9A 4C1KA 3UWVA 1ZNNA 4UTUA 3HG4A 1E51A 3W88A 2E5CA 4HKPA 1H1ZA 2NZLA 3T78A 1LORA 4IOTA 1TTJA 1RVGA 1B9BA 1TRIA 3LCIA 4DF1A 4XTIA 2ZRYA 4HPXA 2RFGA 1YTKA 2WSYA 3CTLA 3GAKA 4R7JA 3TAOA 1I2OA 3W2MA 3KVLA 4AH7A 1YPIA 3G18A 2Z2UA 3NGJA 2DZSA 1YYAA 4UUIA 1F7BA 2IQTA 1KBJA 3EX4A 4MLJA 3Q37A 4S1FA 3W23A 3CU2A 3KX6A 2H8ZA 4CNPA 4JY9A 4MZ1A 2XN1A 1OYCA 4ZQMA 3LTPA 1BWLA 4N9CA 1XBVA 1K03A 1FDJA 5F2LA 1Z44A 1F6KA 2FFCA 2NWRA 1DHPA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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