3P82 | Genus

Total Genus 140

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	140
sequence length	362
structure length	362
Chain Sequence	EKLFTPLKVGAVTAPNRVFMAPLTRLRSIEPGDIPTPLMGEYYRQRASAGLIISEATQISAQAKGYAGAPGLHSPEQIAAWKKITAGVHAEDGRIAVQLWHTGRISHSSIQPGGQAPVSASALNANTRTSLRDENGNAIRVDTTTPRALELDEIPGIVNDFRQAVANAREAGFDLVELHSANGYLLHQFLSPSSNQRTDQYGGSVENRARLVLEVVDAVCNEWSADRIGIRVSPIGTFQNVDNGPNEEADALYLIEELAKRGIAYLHMSETDLAGGKPYSEAFRQKVRERFHGVIIGAGAYTAEKAEDLIGKGLIDAVAFGRDYIANPDLVARLQKKAELNPQRPESFYGGGAEGYTDYPSL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	A Site-Saturated Mutagenesis Study of Pentaerythritol Tetranitrate Reductase Reveals that Residues 181 and 184 Influence Ligand Binding, Stereochemistry and Reactivity. pubmed doi rcsb
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Enterobacter cloacae
molecule keywords	Pentaerythritol tetranitrate reductase
total genus	140
structure length	362
sequence length	362
ec nomenclature	ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date	2010-10-13

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00724	Oxidored_FMN	NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3p82A00

5CPNA 3STEA 5D04C 1LBMA 4UFJA 3HPZA 3GNNA 4FHAA 3RLVA 3E12A 5U7SA 3EXTA 3MUXA 4PL1A 1JRCA 4QNWA 4MFDA 3G18A 5KZMA 1JCJA 4UTTC 1S5TA 3I6RA 5G2HA 2X1TA 3DHFA 5DXYA 3E02A 3PC0A 4JTEA 1QPOA 4UMBA 4UTUA 2GQ9A 3NG3A 2CLOA 2BZNA 1BKSA 1KA9F 4LY8A 4LUIA 1QPQA 4TIMA 2FPYA 4RJEA 3STFA 4IMGA 4Z08A 2E6FA 4O57A 2FLIA 1G69A 4BK9A 3CB8A 1A5SA 1TPWA 4FF7A 4NNAA 2PCQA 4RK8A 2PRMA 5DLCA 3HOJA 5J5DA 3P7YA 2ZYFA 1JUBA 3W22A 3C3NA 3LTPA 5DBTA 1OYCA 1YLVA 4K38A 4N02A 3W2MA 4JX4A 2G97A 2WO5A 3T55A 1SR9A 5TIMA 4LVAA 3L66A 3DXIA 4JTUA 3BG9A 5BRBA 3NQ6A 4NJGA 3W7QA 2E6AA 3ATZA 4JYFA 4FIQA 1OFDA 5D37A 1ALDA 1X7FA 3MMTA 1WYIA 4WX2A 3F4NA 3M5XA 1W3TA 2C18A 3QJAA 2VKZG 1OYBA 2C1HA 2J6XA 2V0TA 2ZRUA 4L4LA 4G1KA 3N14A 3NQ7A 2WJZA 2YR1A 3KFTA 5I3IA 2A2IA 7TIMA 3ATYA 3HBLA 3NDOA 2QF7A 2ISVA 1G4PA 2Z6IA 3LRKA 4O1DA 1R30A 4K37A 5AHIA 1JCMP 2YCEA 1TV8A 1RVGA 1E51A 3CIWA 1O5KA 2CWNA 2WSYA 4TX9A 3BG5A 1JR1A 1HG3A 1IF2A 3LX9A 3OG3A 4GJ1A 4CNPA 3LHUA 3HG5A 3IV3A 4JS3A 3QW4B 3AJXA 3L67A 3S1WA 4M7TA 3MO7A 3W1AA 1H50A 3WK0A 4TMCA 5AHEA 3CU2A 4E0CA 3LHTA 3TSDA 3L0GA 4IUOA 3W7MA 2ZZ7A 5TQLA 4BWLC 1O5XA 3UWZA 2B7OA 5D2YA 3C61A 3TSBA 4BFAA 3OA3A 1RV8A 3DENA 4PFMA 3I65A 2LLEA 5AFDA 3VNDA 2WKJA 3P8JA 1XBXA 1ME8A 2BWGA 3C2FA 4PTNA 4UCGA 1VQTA 1YTKA 1AG1O 2EHHA 4GUHA 6ALDA 4LVBA 1XM3A 4JTKA 4Y9AA 2J9ZA 1SPQA 5C54A 2O7QA 4A29A 1R2TA 2ZQ0A 4FO4A 1NEYA 4DO5A 3EWZA 1H5YA 1K8YA 4OWGA 3F4WA 4QSHA 4BI7A 5FF3A 4MPQA 5L6UA 2RDUA 4JTSA 3USBA 1R46A 1DJNA 3I68A 4HHPA 3QW3A 1VCVA 3KXQA 4M6PA 4AAJA 3G1FA 1FCQA 1WOAA 5U4NA 2QCDA 1KFBA 3HQ1A 3SGUA 3BARA 2TRSA 1SZEA 2YGYA 3JRKA 4HIBA 1TJPA 4JNMA 3PG9A 1EIXA 4GRSA 3CC1A 2ZZ2A 1QPNA 1VH7A 3DFOA 4WUIA 2ZRXA 4I7VA 3B0PA 3EX2A 1QO2A 1ADOA 4A3UA 5E93A 3T44A 1VYPX 2A1YA 4JTHA 3PBWA 3FIGA 3E9AA 3LTYA 5FEXA 3TE9A 1Z48A 2ZA2A 3CPRA 1D9EA 5G1YA 3W7CA 2R94A 1V5XA 2C0AA 3BPWA 4YWIA 1VLWA 4WD0A 2E09A 1GVOA 4I7WA 2XN2A 1MEHA 3UNDA 1OX4A 5DCBA 2BSLA 1OFBA 3RNDA 2VFGA 4LTSA 2WPBA 5G1TA 2CW6A 1Z44A 2DZPA 2RFGA 4O18A 2XN1A 4EF9A 5A5WA 2C19A 4NZJA 4LV9A 5TBOA 5G4WA 2VFFA 3W7HA 2NXGA 3TR2A 3TSMA 3NL3A 2Y61A 1VZWA 4UFKA 2V81A 1GVRA 3S8HA 2GQAA 3F03K 2J9YA 3VE9A 2HTMA 2ZFAA 1OFRA 4LU0A 2V9DA 3HMJG 1F73A 1IXQA 2RKXA 3TAKA 3LOTA 3B05A 3ZWSA 3TW6A 4ZQMA 3NEVA 5G2WA 2DORA 1I8JA 3AO0A 1UUOA 2QCEA 4W9TA 4Q4KA 3W75A 3PR2A 3WJWA 1SUXA 4O53A 5CG7A 1CI1A 3NO5A 4UUIA 1WQ5A 1L6SA 4IX2A 5D03A 1QFEA 4TO8A 3NR0A 3GX9A 4I9AA 2X16A 3KVKA 1EA0A 1TTQA 2VENA 3QMSA 2QEZA 3WK2A 3HF3A 3TJXA 1FQ0A 1W5MA 3C56A 2FQIA 1Y0EA 1BWKA 4TU1A 1I2RA 2P10A 1BEUA 4OV4A 3BGGA 3M0ZA 3S1XA 5AYZA 3C6CA 3LLDA 4DPPA 4ORIA 4QNEA 4XBSA 3PS7A 2XN0A 3NQMA 3L65A 3L5MA 3W83A 4WY0A 3HGOA 5FF4A 3TW7A 1LROA 3C2RA 1CX9A 4XWUA 3FA5A 3W7LA 1LLWA 3N2MA 1TSIA 5D2WA 1C8VA 4KWWA 1H1ZA 1IIGA 2NLIA 1I2OA 1V7YA 2ATSA 4JD4A 1QWGA 5DY2A 1DKWA 2G5WA 5CPMA 1FCBA 1QOQA 1GYLA 1EWEA 3MBFA 3Q94A 4UXDA 4CLMA 4ZMGA 1BWLA 1OFQA 2O7SA 1JQXA 1YADA 3LCLA 5C55A 1SZNA 1OF8A 1H7NA 2FFCA 3GXPA 4M19A 3T40A 1I4NA 2ZZ6A 2CU0A 2QAPA 1GYNA 3HGJA 4ZL1A 1TIMA 1Q6LA 4NVTA 1RPXA 4WOQA 2X1RA 2ZZ3A 5HMSA 3NL2A 4AF0B 2A0NA 1QAPA 3M7WA 1LOQA 2P0OA 4RXGA 2EPHA 2A6NA 2Y6ZA 1T8XA 1S5WA 1TCDA 2YXGA 3EEGA 3CEUA 1JJKA 5KZEA 4JICA 3W73A 1KFLA 4JYEA 4MIMA 5FF2A 2ISSA 5HULA 4D2JA 3NAVA 4HNNA 3OVRA 1ZAIA 1DV7A 1TREA 3FOKA 1TQXA 2Z6JA 1ZY9A 5LKYA 4IJBA 1F05A 2EAWA 3DU0A 4DO6A 1AK5A 2TPSA 3KX6A 2A7PA 1TPEA 3W1MA 2VFIA 3TUUA 5BMXA 2CLMA 1XDMA 3NNTA 3D0CA 4UTJA 3C2OA 4UTHA 3ZS4A 4UTWC 4U28A 1O95A 4MVAA 2CFFA 2CLHA 3HB9A 3SGZA 3EX1A 3LCGA 5HR7A 1GVSA 3QH2A 1IXPA 3SY5A 4LUJA 5HR6A 5HUPA 5BW6A 5BNKA 1OYAA 4ADTA 3GK0A 5DBUA 5AOUA 4N6EA 4O54A 5AN7A 4K8EA 5H2ZA 2WNQA 3QFEA 3C4UA 3QPZA 3CLMA 3P8IA 1F5ZA 3GB6A 5CPLA 4M6QA 2Q3OA 4AH7A 1OJXA 2H3DA 3GXTA 1K02A 2VEMA 1EUAA 3QM3A 1VGAA 3TH6A 4S2CA 3IIPA 3LHYA 1W37A 4N9CA 3GDKA 1JCLA 1VR6A 3M47A 3M6YA 5LHEA 1IXOA 2FTPA 3TU9A 3LCHA 4E2DA 1W3IA 1R2SA 3O63A 2C14A 1M6JA 1Q6OA 3B04A 5K4XA 3PY2A 3RU6A 4FEZA 2H8ZA 1TPDA 1YYAA 3BK0A 1QO5A 3IGUA 4O1BA 5HQEA 1AW5A 1YDOA 1H51A 1ZENA 3O8AA 4YXGA 1GOXA 4DF2A 3SJ3A 2P1FA 4RV8A 1Q6QA 4R7JA 4GFSA 4KFPA 4LNYA 5K9XA 4QIUA 1RQEA 3NYZA 5C6MA 4HNTA 4A22A 3HG2A 3EWXA 2ZRYA 5CZSA 4N9DA 1G7UA 4DF1A 3SFKA 3OEXA 4NJIA 3S1VA 1H7PA 2DJXA 1SSDA 4FNUA 4LVFA 2HMCA 3L68A 3A22A 3T78A 5FF0A 1P1XA 4UFLA 5AHNA 5EL1A 1UBSA 4KKXA 3FKKA 5T26A 1EWDA 4GUIA 3HPXA 3QSTA 3B06A 5I3JA 1XBZA 4GXMA 2DP3A 3TJLA 3KAOA 4HPXA 4GBUA 1AW2A 2QCNA 4AXKA 2CZFA 3N2XA 3VE7A 4I7UA 1FDYA 5I3FA 1SW0A 5FEPA 1SU5A 2CZEA 5EKYA 2ZRZA 3DH7A 4MYXA 4JIPA 2V2DA 4AHQA 1O4UA 3VFLA 3E49A 3W70A 4IWWA 2DZSA 4AB4A 2PC4A 3LCWA 2YFNA 4FIRA 3N19B 5KITA 3KOFA 2V8ZA 3C2EA 2A7NA 4A21A 2X2GA 4GNJA 3EXRA 3GZ3A 4DEFA 2YYTA 2QJIA 4K8HA 3GNDA 1I2PA 4X2RA 4IMEA 5HJLA 3GAYA 3S6DA 3BW4A 1WA3A 2GJNA 4OGZA 3SI9A 1KM5A 1W8SA 3CEPA 2ZCGA 4O12A 1BTMA 4PL2A 4Y96A 3PULA 5D05A 3W7IA 1YDNA 3P61A 4O15A 3SSJA 3FYPA 1SFLA 3TA6A 3G8EA 1Z41A 3W1UA 3LV5A 3TROA 3W84A 3N73A 4M5PA 2J88A 2AAMA 5K4ZA 5K7JA 2PRLA 1PV8A 2YW4A 3ABSA 4UMAA 5F1UA 5CGQA 3W85A 4FB7A 4IPJA 5D02A 3A24A 1PHWA 3ZR4A 1XI3A 3S5ZA 4O17A 3TDFA 3P84A 3SR7A 1TYGA 1SO6A 3R2GA 1VLIA 2B7QA 4N2YA 3W1XA 2ATMA 4GUJA 3W1NA 2W6RA 2WSQA 3EWYA 1L2UA 3JR2A 5AYXA 1XL9A 3I7SA 2I14A 3W7JA 1H61A 3MP3A 4CCEA 3RMJA 4BI6A 4FX6M 1W0MA 2C16A 1QPRA 1QNVA 4UFHA 3LCFA 5LSMA 1W3NA 3KRUA 3EWBX 1VRDA 2NWSA 3PAJA 3P82A 5CPOA 3I7RA 3P80A 1TPVA 3PVFA 5D09A 3NPWA 4JTGA 3S5NA 4LS2A 5HWNA 3EWWA 3TXZA 3HIJA 1H7WA 4NXKA 1VPXA 4JTLA 3G8RA 4S1FA 1XKYA 1F2JA 2NZLA 3N9RA 1TMHA 3U2OA 2WV8A 4MY8A 4Z0SA 3VCRA 2CLIA 4NJKA 3A5VA 3LXAA 4B5NA 2ABAA 4P61A 1JULA 1C29A 3QMRA 4P2VA 1W1ZA 2D73A 4TR9A 1GJPA 3W86A 4O0KA 3MW7A 3MYOA 4ICNA 3YPIA 3F1QA 4K7VA 4GC4A 1GT8A 1TPH1 3O07A 1G4SA 2Z2UA 4K6AA 3IVSA 5EBUA 3GDTA 5K3VA 2GJLA 3TMLA 2C3ZA 2ALDA 2YSWA 1JUEA 2FIQA 3ZFHA 3SIZA 4J9JA 1G67A 4ZQOA 5LGZA 3UWUA 3GIYA 4O52A 4ZQPA 1MO0A 3MYPA 4LS1A 1J4EA 4HNUA 1G4TA 3W23A 3W72A 2CLEA 1TV5A 1Q45A 5HUOA 3LBMA 4FNPA 3UPWA 2GVGA 5F4XA 3TQVA 4O16A 5C5YA 2E6YA 3GYEA 1AL8A 1TTIA 3O05A 2OX1A 1UJPA 3V75A 4DBDA 3L2IA 1I2NA 1SQ7A 3FJ6A 5FF7A 1J2WA 2OT0A 1GZGA 3N9SA 2BTMA 2ISWA 4AHOA 4AWTA 4C1LA 1UUMA 4JTJA 3NQVA 5K9CA 1MSSA 3NZRA 2QCCA 3BW2A 4WQ6A 4IX0A 3W71A 4XKYB 2JGYA 4A2SA 3NL6A 3IGXA 3PBYA 1LRNA 4LC8A 1UASA 4AF0A 5AC6A 3GLCA 4UR8A 5D2VA 3NPXA 4DQWA 3EKLA 4CCDA 3P81A 3NQGA 3W1TA 4LV4A 3W2LA 3QZEA 2R8WA 1WAUA 3G1YA 1H63A 3CHVA 3FFSA 1Z42A 1OF6A 1GVFA 4ZQRA 5BMWA 5DN1A 1MXSA 1QOPA 2ZDRA 2BXVA 3O15A 4FXRA 4RXFA 4UTIA 1EUNA 4MOZA 3UXDA 3IVUA 2J24A 2QCGA 5IM51 3W7KA 2Y7FA 3UZJA 2VFEA 3PWAA 3EKZA 1KM3A 2DZUA 3DKLA 2ZBTA 3GDLA 2Y7GA 3H54A 1XCFA 3MBDA 3NOEA 3DGRA 3BLEA 3SZ8A 4NU7A 3BV4A 4AEOA 2V2HA 4FNRA 1TQJA 5KZDA 3EX4A 4NNBA 5CZTA 2VXNA 2J27A 3KHJA 5FEZA 1ME9A 3C2VA 3UY7A 5F4SA 4Z1AA 2H6RA 1K8ZA 1KTNA 5K2ZA 2RDTA 3W7RA 4JTTA 2PURA 2UV8G 5CSRA 4E38A 4L4MA 4HN4A 1EEPA 1K8XA 2TMDA 1VCGA 3LCXA 3G1AA 1W5OA 3VKJA 4LT9A 1EB3A 1GWJA 1KLZA 1NSJA 1NVMA 2YW3A 1H7OA 1R2RA 1ZFJA 3DFPA 4WZHA 2GUUA 3GDRA 5LNVA 4RKAA 3W3OA 2R91A 1W56A 3L5LA 1HO1A 1M7OA 2QDHA 3QSRA 4ADUA 2QJHA 3C8FA 3LGEA 1WXJA 5EPDA 1DHPA 4YMZA 2NUXA 4H4IA 4IMCA 1LP6A 1DJQA 1XBYA 4XQ6A 3HPSA 5G2IA 1C9DA 3LERA 3NM3A 3IEBA 4EF8A 2GPTA 2VFDA 1KFEA 4PCFA 1RQBA 1D3HA 3LI1A 2QKFA 3L5AA 5H91A 1N7KA 3A23A 4MFEA 3PUOA 4LW7A 1LDCA 3TCEA 3BG3A 2VELA 2E6DA 2JBMA 5LZLA 1JVNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3P82A

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