3P8J | Genus

Total Genus 138

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	138
sequence length	362
structure length	362
Chain Sequence	EKLFTPLKVGAVTAPNRVFMAPLTRLRSIEPGDIPTPLMGEYYRQRASAGLIISEATQISAQAKGYAGAPGLHSPEQIAAWKKITAGVHAEDGRIAVQLWHTGRISHSSIQPGGQAPVSASALNANTRTSLRDENGNAIRVDTTTPRALELDEIPGIVNDFRQAVANAREAGFDLVELHSAHGYLLHQFLSPSSNQRTDQYGGSVENRARLVLEVVDAVCNEWSADRIGIRVSPIGTFQNVDNGPNEEADALYLIEELAKRGIAYLHMSETDLAGGKPYSEAFRQKVRERFHGVIIGAGAYTAEKAEDLIGKGLIDAVAFGRDYIANPDLVARLQKKAELNPQRPESFSGGGAEGYTDYPSL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Active site modifications in pentaerythritol tetranitrate reductase can lead to improved product enantiopurity, decreased by-product formation and altered stereochemical outcome in reactions with a,b-unsaturated nitroolefins rcsb
molecule keywords	Pentaerythritol tetranitrate reductase
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Enterobacter cloacae
total genus	138
structure length	362
sequence length	362
ec nomenclature	ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date	2010-10-14

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00724	Oxidored_FMN	NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3p8jA00

5D2WA 1LOLA 3O6YX 4DO5A 3STFA 2QDHA 1WQ5A 3ZWSA 2HMCA 4RV8A 4IMFA 1MO0A 2OMAA 3EWYA 3WJSA 2AQWA 1NAL1 1IXOA 2Z1BA 4PL1A 1BWKA 1KLZA 1WAUA 3HG5A 3ABQA 3M5XA 5FF3A 1WBJA 1WBHA 4IXXA 3NPUA 3W1AA 3ZS4A 3NZ1A 1QAPA 1TB3A 5FESA 3P5ZA 2ZZ2A 3W76A 1H62A 1DJQA 3KOFA 3G0SA 4P61A 2CW6A 3ABOA 1F7BA 3NPXA 5G2WA 4AHOA 2DU2A 3TSBA 1KM2A 3TJXA 3KAOA 4Z1DA 2I14A 1LRNA 4OE7A 4UFMA 5HWNA 4XUGA 2C15A 1U5JA 2GVJA 5E93A 4WOZA 3NGJA 3BW4A 3P5YA 4RZ5A 2DZPA 2NX9A 4A2RA 4DF2A 2J27A 1FQ0A 1QOQA 2OJPA 1YPFA 3ZFHA 4ADSA 3W07A 4K8HA 3DXIA 2R91A 1F73A 4GUIA 1O95A 2H6RA 2E6DA 3DHFA 5D38A 1LORA 1VH7A 2V5BA 2VEMA 2CLLA 4GWEA 5CZTA 1RQHA 4NJHA 3B03A 3I65A 1MEWA 3BV4A 3P80A 4ZQRA 3D0CA 3E0IA 4UUIA 1OABA 1VCFA 3MJYA 4WY0B 1K8ZA 3EB2A 5K9CA 4UTKA 1XDMA 2ZA3A 2OT1A 3G22A 3G1XA 3HGRA 4PH6A 2X1TA 4B5NA 1C8VA 1ICPA 1PCWA 5AC6A 1T96A 5D32A 1K03A 5DY2A 4GC4A 1TPDA 5AHEA 3OHIA 5AB3A 1Q6QA 1IXPA 3C4UA 1EA0A 3IGSA 5C54A 2WO5A 3PM6A 4WD0A 3TSMA 2G96A 2WOQA 3GB6A 1AL8A 1SFJA 5G2IA 5C6MA 2DZWA 4WUIA 4GRSA 1SZEA 4Q33A 2H3DA 3EKLA 3ABSA 2X1SA 3PG8A 4Y90A 1FY6A 5EKYA 3W1RA 4MY1A 3PBYA 2CLKA 3L66A 5L9FA 1PIIA 1PHQA 1O5XA 4MLRA 3VE7A 2Q8ZA 4OQVA 1TV8A 2DZVA 2FPVA 4TIMA 3I6RA 4UTWC 3HGSA 4LV9A 5CPOA 2ZRWA 3MP4A 4MVAA 1PV8A 3L5LA 1OJXA 3NXFA 3PBUA 4XKYA 4IXHA 2LLEA 1UUMA 3VKJA 4IJBA 3DENA 1G4PA 2H3BA 3WJXA 5D30A 1I8JA 1B3OA 2WNNA 4GUJA 4NUWA 1OFQA 3OG3A 3EXTA 1ZENA 1NVMA 3QPYA 1RVGA 3BPWA 2PRLA 3OVQA 3L0GA 1SZFA 4HNUA 3WJWA 4QAIA 5MHBA 4PCFA 5CKSA 1X1ZA 4RZ6A 2J9XA 1BWLA 1YTEA 4LRSA 3T78A 1G4EA 1TRIA 3A23A 3R8RA 1JQVA 1AMKA 3GAYA 3CIWA 3P7YA 3KXQA 2Y7EA 4X22A 3AJXA 2AAMA 4N9BA 4HKPA 1EPXA 1GVOA 1R47A 2QCEA 4NNBA 1TRDA 2TRSA 3W7CA 1F6KA 1VJIA 2YX0A 1JCXA 1KM5A 1JCJA 5FEWA 3NOEA 5ABTA 2V0TA 4QNWA 1VYPX 3N19B 2CFFA 1NF0A 1GEQA 2FFCA 2QJIA 1HG3A 5BRBA 4N4QA 1OK6A 1Z42A 4IUOA 3TMQA 2WNZA 1TTJA 1D3HA 3GIYA 1P0KA 3LBCA 5LHEA 2A21A 2Y7FA 4GXMA 4JTEA 4O19A 2C1HA 1TTIA 4MZYA 1OG0A 2C13A 3LGEA 1KM0A 4Z1CA 3THQA 3W2LA 3LBMA 4IPJA 1ME9A 5FF4A 4MPQA 1O5KA 2JKEA 3NQCA 1U83A 3H55A 1W5OA 3P67A 7TIMA 6ALDA 1FCQA 1H1ZA 2G5WA 1FWTA 2X16A 4X2RA 3W1UA 3UNDA 1G67A 3O05A 3LB0A 3TE9A 1D9EA 1EP2A 4UFKA 5F4WA 1EB3A 1OX5A 2C6QA 3TKFA 4WY0A 4YLWA 3GAKA 1K7XA 1EX5A 3MHGA 3QQ1A 3O06A 3SY5A 5FEXA 4DF1A 1PCKA 4LOCA 3CC1A 2JK2A 3W88A 4O12A 3OIXA 2ZRVA 3M1ZA 3TSDA 3MI6A 4JEQA 2Q3OA 5KMYA 3M43A 1HL2A 4L4LA 1ZCOA 1D3GA 1W3TA 1VS1A 4QJ1A 4EF8A 1YXYA 1L2UA 3UWUA 5AC8A 1PHWA 3CPRA 2JKPA 5KTLA 1L9WA 4HIBA 5FI8A 3QEZA 6TIMA 3IGUA 3DFPA 4MJMA 4O17A 3RF9A 1HUVA 1IXQA 5I3FA 3N34A 1WOAA 2A4AA 4O11A 1SR9A 2QCCA 4NQ1A 2BZNA 5CGQA 4FHAA 3FYPA 4GUGA 2QCMA 2J9ZA 5H2ZA 3EWUA 2GJLA 1H1YA 1DQWA 4MFDA 4M6VA 4FX7A 1K7EA 4Z08A 2CLHA 5J5DA 1YTDA 3W1QA 5DCEA 2PCQA 4UTLA 5F2GA 1JR1A 3PULA 3NQVA 3S9YA 1W1ZA 3B4UA 1M5WA 3M0ZA 4UFJA 4FNQA 4Z1BA 2ABBA 2Y89A 3DKLA 1W5PA 1A5AA 3IIXA 5FF2A 3NYZA 2DZSA 3KRSA 3S5NA 3NA8A 2YW4A 1OYBA 2NWSA 2V9DA 4O13A 4TX9A 5LKYA 3NQ8A 3UYCA 4MYAA 4AH7A 1R30A 3GNNA 3QRHA 1KM4A 1W0MA 4DBDA 1XBYA 5K9XA 1DJNA 3UPWA 2OCZA 4ORIA 5DN1A 1GG0A 3LLDA 1KV8A 4Y8FA 4GNJA 3QF0A 4S2CA 1LLZA 3HQ1A 3MBFA 1XFBA 4BFAA 3VE9A 4LRTA 2KZHA 1VYRA 4LUJA 4QM1A 1B4KA 5D04C 4UMAA 2RKXA 1HO4A 1R2TA 2ZRXA 3NVTA 1A50A 1LROA 3TX9A 2YYUA 2OT0A 4ADTA 2CLMA 3CLMA 1GVQA 4O57A 3OBKA 3Q58A 2XFWA 1NSJA 1TPB1 5F4XA 3Q37A 1OVDA 3DFNA 4NX0A 3EKZA 1B9BA 4Z0JA 4OGZA 3HPZA 3C2RA 3G0XA 3SSJA 3CT7A 5I3GA 3P81A 3C2EA 5F2IA 3WJZA 4DQWA 2JGYA 4JX4A 1GVSA 4FXRA 4UTTC 4JTFA 2HS6A 3RMJA 2JGQA 1RQEA 3GDMA 2A6LA 4JS3A 1L6YA 2GPTA 1RV8A 5H91A 1OYCA 1TV5A 3MW7A 1LOSA 3UQNA 1W3NA 1VGAA 4JYEA 3TR2A 3TXVA 5HR7A 3LI1A 3LTYA 4UIOA 1GYNA 5F1UA 4CCCA 4ZQCA 2VC6A 1WOBA 5G5IA 3S6DA 1BTMA 3P60A 1W54A 2WV8A 3GDKA 5HINA 2RDTA 4UFIA 4LNYA 3GDRA 1E51A 5E1QA 3TA6A 3LRMA 3PB2A 1UASA 1M7PA 3O15A 4N6EA 3M5YA 4HPJA 3BG3A 4IX0A 3SFKA 3PVFA 1ZAHA 4S1FA 1KM1A 2A7PA 2PC4A 2QEZA 1GG1A 4O4WA 5AFDA 3MMTA 1N55A 3NQMA 3O07A 3NPWA 1XI3A 1TO3A 3QQ0A 4RZ4A 3EX4A 1A53A 3GLCA 2FJKA 2Z2UA 4JDBA 4PL2A 4K8EA 4OHQA 1ZY9A 3FKKA 3INPA 4EIVA 4PC8A 3RLVA 3JS3A 3G1DA 1LOQA 2H8ZA 4JDYA 1F6PA 4N6FA 3KVJA 3P82A 2TMDA 3H54A 4P2VA 4DEFA 2NUYA 1SO5A 3NR0A 3Q2DA 3VFLA 2QCLA 4AMAA 4O4VA 2NZLA 4UNLA 2ZZ5A 2YZRA 2VENA 4H4IA 3N2MA 4CNOA 3NO5A 4LVDA 3DFQA 1NEYA 4O0ZA 5CZ0A 2JBMA 2QUTA 3W2UA 1GTHA 3W7RA 4GE8A 4M5PA 4XKYB 1DVJA 3FLUA 4BI7A 2V81A 3USBA 4CQAA 1MXSA 4ZVJA 4YCOA 3RLUA 4WY0F 4O1BA 1OFEA 1FBAA 4OT7A 2BX7A 4C1KA 4M7TA 4HNTA 2GJNA 1ALDA 5C2XA 3W84A 1VZWA 1O60A 4EVZA 4LV4A 1KW1A 2C3ZA 2E09A 3W9ZA 3N9RA 2FPTA 3DGRA 4GFSA 2A0NA 5DXYA 2ZTJA 5K9DA 1IGSA 1JRBA 3S5YA 4O1CA 4TR9A 3LV5A 4Z1AA 1X1OA 2X1RA 3NDOA 4RJEA 3RK8A 1J4EA 2P1FA 4MJZA 3L9CA 3TNOA 5FEZA 5I3KA 3CU2A 3GDLA 1FWRA 1XBXA 3ATYA 3PC0A 1T99A 3LHUA 5LGZA 3GVGA 3LXBA 5TBOA 1LBMA 2V82A 4JICA 4KFPA 5HJLA 2QF7A 1XUZA 3UZJA 3SW6A 4WZHA 4R53A 4ADUA 1O4UA 3L67A 2BSLA 1JUEA 3QJAA 1YXDA 3GXTA 4XQ6A 2ISWA 4E2DA 3VI2A 4JY8A 2B7OA 1SW3A 3BW2A 4UTTA 3HO8A 3MYOA 4JTGA 4LT9A 1WYIA 3B8DA 2DJLA 2J24A 1RZMA 4JY9A 2NUWA 3DU0A 3G1YA 3DI0A 3K30A 1GOXA 3LX9A 1QPRA 2ALDA 3W7IA 1V5XA 4NJJA 3G8EA 1W31A 3G1HA 1ZALA 1VHNA 4YCPA 3G0UA 3B0PA 2B7NA 4O18A 3G3DA 3LCFA 5HWMA 3FIGA 1G4TA 3QM3A 2QJHA 4PEKA 2ZDRA 4K38A 4AF0B 2ATSA 2V2DA 3LXCA 1I2PA 2X2GA 4MZ1A 1TTQA 2FB3A 1SW7A 2WSYA 1H7PA 4ORMA 4HPXA 1P4CA 2I1OA 2Z6JA 2GVGA 2NUXA 1WA3A 4BF9A 1QPOA 3O6CA 1OFPA 1WV2A 3HIJA 3CEUA 2EKCA 3F4NA 4NVTA 3W7HA 2B7PA 1XKYA 4O10A 1W37A 3B0UX 2E77A 3B06A 3L65A 4E2BA 2DZTA 5CPMA 3IEBA 4AWUA 1TPFA 1MEHA 1C9DA 3C2VA 2Y61A 3GDTA 3TC7A 2W79A 4NZFA 3A5FA 1TQJA 4TMBA 4IWWA 2FDSA 3W3OA 3W2KA 5IM51 4DO6A 5EA9A 4I7VA 1RQBA 4KWWA 2ATMA 1VHCA 3MO7A 2IQTA 1S5WA 2EPHA 5DLCA 4AWTA 1SW0A 3EX2A 4JX6A 4Q4KA 1FXQA 3CM4A 1JUKA 1XL9A 4IMCA 4LVAA 3W1TA 3QZEA 1XXXA 1OYAA 1TIMA 1KFLA 5G2HA 2FQIA 2HSAA 3EWWA 3RNDA 1F76A 2VKZG 1H7RA 1LRQA 4CLMA 1JQXA 4K7YA 4ONVA 3MHUA 3NQAA 4N9EA 1EP1A 4UTIA 3F1QA 3HOJA 1O94A 2ZZ1A 1FDYA 1JCLA 3EX6A 3L21A 4A2SA 5K4XA 2WSQA 3DFSA 1KTNA 1R46A 1KFEA 3SGUA 3NL2A 5F4SA 4LWWA 5E0KA 2ZRUA 1VCVA 2A2IA 1EP3A 1EWDA 2YPIA 4JYDA 5EYWA 1JCYA 3EX1A 3P8JA 3B05A 5HMSA 3BVJA 2X30A 3BO9A 3U8GA 3LHVA 4Q32A 3MWAA 3QC3A 3NQEA 4DXVA 3UZ5A 3NZRA 1BKSA 1AW2A 1I4NA 2Y7DA 2ZA2A 4MLJA 2ISSA 3IIPA 1QOPA 4QSHA 4TU1A 1P0NA 5DCBA 1OK4A 4UR8A 5KITA 1MSSA 1LZOA 4UTUA 4MOZA 4XTIA 4NX5A 3HGOA 4LC8A 3O63A 4JD4A 3FEMA 2YR1A 3FJLA 5D2YA 3LDVA 1JVNA 2YW3A 3SECA 3UWWA 1G7VA 1TCDA 3TFXA 3STCA 2V30A 1H5YA 4FXSA 1OFRA 4NXSA 1FCUA 4IGHA 4FEZA 1FCBA 4N9DA 3T7VA 5EPDA 3PUOA 1WX0A 1B57A 4WX2A 3HGJA 2E5DA 4L4MA 1OHLA 3FKRA 2C18A 5AHIA 4AF0A 4R33A 3M7WA 2EAWA 4Y9AA 1GTEA 1VLIA 4PFMA 2RFGA 3DZ1A 1M6JA 4JTTA 3E12A 3RFAA 3M47A 4HHPA 2YXGA 3EWZA 5G1TA 1KFBA 2Y63A 1M7OA 1N7KA 2R94A 3HG4A 1XDLA 4IQLA 5EL1A 1QDSA 4M6PA 3BLFA 3W72A 1JRCA 5L6UA 2XN1A 4PTNA 3P62A 1NF7A 3W7PA 2ZFAA 3PWAA 4AXKA 1ONRA 2R8WA 1SPQA 5J5RA 4O14A 3W85A 2WPBA 1AG1O 3G8RA 4IOTA 4LY8A 3W7LA 3NQ6A 3W1LA 4UTJA 2W6RA 4CNNA 3JR2A 3C8FA 2QCNA 3M41A 2CLEA 1SZNA 3QMRA 2V8ZA 1LM1A 3FOKA 1VYSX 1OF6A 3L0KA 1ZAIA 3TK7A 4BK9A 3W2NA 3FJ6A 3IIOA 5CG7A 1Q6OA 5KZDA 2I9EA 5AHFA 4XWUA 3S1XA 5D2VA 1QNVA 3N3MA 1TTPA 3F4WA 2YSWA 1VPXA 5BNKA 1W3IA 2VXNA 1A5CA 4BWLA 3THAA 1CW2A 1H51A 3Q94A 4ZQMA 3HF3A 1Q3NA 3QW4B 3UXDA 4N2YA 4WJEA 2EHHA 3C56A 5K7JA 1RPXA 4FO4A 1J2WA 5LSMA 5BW6A 3A5VA 1IIGA 2V5LA 2JKAA 3W23A 2VFGA 2ZBTA 3KX6A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3P8JA

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Chord Diagram

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