3P8JA

Y351s mutant of pentaerythritol tetranitrate reductase containing a bound acetate molecule
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
362
structure length
362
Chain Sequence
EKLFTPLKVGAVTAPNRVFMAPLTRLRSIEPGDIPTPLMGEYYRQRASAGLIISEATQISAQAKGYAGAPGLHSPEQIAAWKKITAGVHAEDGRIAVQLWHTGRISHSSIQPGGQAPVSASALNANTRTSLRDENGNAIRVDTTTPRALELDEIPGIVNDFRQAVANAREAGFDLVELHSAHGYLLHQFLSPSSNQRTDQYGGSVENRARLVLEVVDAVCNEWSADRIGIRVSPIGTFQNVDNGPNEEADALYLIEELAKRGIAYLHMSETDLAGGKPYSEAFRQKVRERFHGVIIGAGAYTAEKAEDLIGKGLIDAVAFGRDYIANPDLVARLQKKAELNPQRPESFSGGGAEGYTDYPSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Enterobacter cloacae
publication title Active site modifications in pentaerythritol tetranitrate reductase can lead to improved product enantiopurity, decreased by-product formation and altered stereochemical outcome in reactions with a,b-unsaturated nitroolefins
rcsb
molecule keywords Pentaerythritol tetranitrate reductase
total genus 138
structure length 362
sequence length 362
ec nomenclature ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date 2010-10-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3p8jA00
2VC6A 4UFMA 4W9TA 1DOSA 3DGRA 5HMSA 2C14A 3S1UA 1AL7A 2WSRA 4QISA 1XBYA 4JIQA 2EHHA 1A5BA 2YYTA 3IGSA 3W86A 3W2UA 4MVAA 2E77A 4NJGA 3GB6A 4UUIA 2FTPA 5F2LA 3GZ3A 3W1LA 1GOXA 1AW1A 3LB0A 4JEQA 4HNNA 2QCHA 4RX0A 1C29A 1M6JA 3KAOA 1F76A 1YYAA 3DHDA 3QZEA 3FKKA 3TMQA 4XBSA 1V7YA 2V2CA 4IMEA 3GXTA 3HBLA 2O7SA 3TCEA 5TBOA 3S1WA 2TPSA 1EIXA 3NPXA 3HPZA 3F03K 3LI0A 3MUXA 2DORA 3GAKA 4RV8A 3AJXA 5CZTA 5K9XA 4UIOA 1G4EA 2JGQA 4WOZA 4JTUA 4FX7A 3FS2A 1N7KA 3T78A 2QCLA 2VFIA 4LVDA 4M6PA 4QITA 4FXRA 1K8XA 1ZAHA 1FQ0A 3L0GA 2YXGA 3STCA 4O10A 3PWAA 3N9SA 3LX9A 3W7LA 3PSWA 5G4WA 4UTTA 4MLRA 4NT0A 4K37A 3NL6A 3L9CA 1H7WA 3SECA 2BXVA 1QR7A 3C8FA 3I65A 3GAYA 1FDJA 3ANYA 4NNCA 5DXXA 3LHVA 2X16A 1W0MA 2HTMA 3CPRA 5F1VA 4GE8A 4AMAA 3PB2A 3NQCA 2CLEA 4Y9AA 4O19A 2ISWA 2CZ5A 4N9BA 5HWJA 3MI2A 5HR6A 1PS9A 3H55A 3DHFA 3UNDA 1MEIA 1JRBA 4JTEA 2C18A 1TSIA 3LV5A 4ZVJA 3MP4A 2BX7A 4AHOA 1IIHA 3NQGA 1G6CA 3HG4A 3LGEA 5EBUA 3WK3A 1CW2A 1TPH1 2NX1A 4JR5A 4LVAA 2LLEA 5KMYA 2QCMA 2Z2UA 5D32A 4O1DA 3CLMA 1VGAA 3S5ZA 1OVDA 3LM7A 1SUXA 2QUVA 4AVFA 3BPWA 5C6MA 3UWUA 4IGHA 5LZLA 3B0UX 3P5ZA 2QAPA 3F1QA 3IEBA 3GLCA 2A1YA 3FEMA 2C0AA 3LTYA 2FPTA 2A4AA 3PUEA 3KRSA 1OFEA 4UMBA 1H60A 3S5OA 2V2DA 4JICA 1ZAJA 3RFAA 1DQWA 1FWRA 3MP3A 1F6PA 3NQVA 2GUUA 3GDLA 1HUVA 1I4NA 1PL9A 1LLWA 3FLUA 1DQXA 3PUDA 5D05A 1OABA 2JK2A 3GK0A 1EA0A 1TJRA 1WAUA 3QW3A 4DO4A 2JKEA 3PULA 1DVJA 1SFJA 3MHUA 5CSRA 4MKNA 4N4PA 4X2RA 3SFKA 1FWNA 1WBJA 3MYPA 5LHEA 2WNZA 1UCWA 3S1XA 4P61A 1H7NA 4GUFA 4JDBA 2BTMA 3L65A 3NQAA 3M44A 4C1KA 1IGSA 3TUUA 4AWSA 2BZNA 2CLIA 1TQXA 5LNRA 1SR9A 3TR2A 4ADUA 2E5DA 2ZRXA 1KFLA 3QQ0A 4O1BA 1YXYA 5A8GA 2QAFA 1XL9A 3BO9A 2VOMA 1HG3A 4UTTC 1DJQA 3T44A 3UZJA 5AC6A 1EPXA 5AC8A 1OFPA 5G2IA 4POCA 1LRQA 1Z42A 4O54A 1Y0EA 3W73A 1GVQA 2Q8LA 3KXQA 4O57A 4A21A 1FX6A 4I7UA 3SIZA 3LHYA 3W23A 4NU7A 5A5WA 5HNRA 2VFEA 3LRMA 3M9YA 3CEUA 4XUGA 5EMUA 2P10A 3LHTA 2YGYA 1G4SA 1PV8A 3BK0A 3SSJA 4WUIA 5I3FA 5CKSA 2C15A 3Q37A 4WD0A 2NWRA 3L2IA 1J2WA 3L68A 3NPVA 2V30A 3W7KA 1PVNA 1WA3A 2EAWA 5DCBA 3W7IA 1H62A 5AFDA 3L5MA 3IGUA 1EUNA 2CLOA 1G69A 5LGZA 4Z1CA 2WO5A 3ELFA 3ABQA 3TKFA 3WK2A 1CX9A 2D73A 1VRDA 4Q33A 4A22A 4AWTA 3GDRA 4E38A 3PC0A 5K9CA 3TQ0A 2E6YA 4TMCA 1ZFJA 4L4LA 3UWQA 2PRMA 1X6UA 2A6NA 5DY2A 4N02A 3OVQA 3KVLA 3UWWA 4P2VA 4AF0A 5I3HA 4OE7A 3TJXA 1R30A 3N2MA 2ZZ1A 3WJSA 4BWLA 4PH6A 2TMDA 1IF2A 5AHNA 3DH7A 4NJKA 3HOJA 3W74A 5LGXA 1TTQA 2E09A 4K8EA 2R91A 1W5MA 5HWNA 4FNPA 1M7PA 5FESA 1DJNA 3ATYA 3GYEA 3QMSA 3HG3A 1SW7A 1JRCA 3QMTA 4UFKA 5AYYA 3W1NA 5EA9A 2E1DA 5KZEA 4MYXA 4NJHA 1QO5A 1XBZA 5K2ZA 1M5WA 5KZMA 3MMTA 4MPQA 1RR2A 1F5ZA 2V82A 4XTIA 4K7YA 3SR7A 3GX9A 1GWJA 1VQTA 1NFBA 2QCFA 1BKSA 4EF9A 4DO6A 4MIMA 1JCNA 5D2WA 1PE1A 3LCHA 1KFEA 3HG5A 3T7VA 4MY1A 5BMXA 1KFKA 1QPOA 1FWTA 3E49A 3Q2DA 4O0ZA 4CCEA 1F2JA 5I3IA 4HT3A 3W87A 1ICPA 3UZ5A 4JX4A 1V5XA 3O6YX 2NUWA 1VLWA 4DPPA 2GQ8A 4GNJA 2BWGA 3P80A 3GR8A 2X1RA 4JTTA 3P82A 4E2DA 1W8SA 2WV8A 3HG2A 3N73A 3EX2A 1H7OA 2XN0A 5D04C 3P60A 1RQHA 4C1LA 1QO2A 3BW2A 3GKAA 4IOTA 5LNSA 1F6KA 3G8RA 3GXPA 4MJMA 4FNUA 1KM1A 1ZCOA 3C2FA 2VFFA 3NR0A 1GVSA 1NAL1 1RV8A 2CW6A 3G18A 3W22A 3MBFA 5CSSA 2OX1A 3LBCA 4Q4KA 3IIVA 1TRIA 1HTIA 4CQ9A 3DENA 3OVPA 3G22A 1H5YA 3NL3A 5T26A 1YTKA 4R34A 3OVRA 3W6YA 2H8XA 3B05A 4NVTA 2E5CA 4NJIA 1HO1A 2ZA1A 3G24A 1FDZA 5IBXA 5C2XA 4XQ6A 3CWOX 1SO6A 1SU5A 4AWUA 1I2PA 3BLFA 3ABRA 1ZHAA 1QOPA 1EWDA 4RZ4A 3UY7A 3W2KA 3DFNA 1OX4A 3M47A 1OG0A 2ZYFA 2ZQ0A 3BG5A 1XXXA 3A5VA 4YWIA 1RQEA 2NXGA 3W1RA 5CG7A 1TTPA 2E68A 4BWLC 3W75A 2BSLA 3TAOA 2NXHA 4CCDA 4QQ3A 2NLIA 1H1ZA 1S3HA 4KFNA 3DXIA 3JS3A 3RF9A 2Y7FA 3IIOA 3MHGA 3C2OA 2F7FA 2YFOA 1MO0A 1W31A 2PURA 3LDVA 4UFIA 8TIMA 3FFSA 5HWMA 4OU1A 4H3DA 2OT0A 3KRUA 3FJ6A 3OEXA 1DL3A 1LBLA 4WXZA 3BW3A 2H8ZA 3L5LA 4I7VA 2QUUA 3U2OA 1VLIA 3VE9A 2V8ZA 3HGOA 1TPWA 3QQ1A 2A6LA 5D2TA 1K7XA 3KOFA 3IIPA 3BLEA 2NUXA 1BEUA 2WNNA 3O1NA 4IMFA 1SW0A 1S5VA 3UXAA 2C19A 5LSMA 4IX0A 3TFXA 1EP2A 1XBVA 4PFMA 3QRHA 3WK0A 4JS3A 1A5CA 3EX4A 3B0PA 4JGDA 4CNOA 4IWWA 4XKYA 5AOUA 2NUYA 1IXQA 3DFSA 4HPXA 1IXPA 3M43A 3NNTA 1SPQA 4QNWA 3M5VA 4MZ1A 3EWZA 4FB7A 3LCWA 3R8RA 3TA6A 3EXTA 4UXDA 1FCVA 1I8JA 4N4QA 5K7JA 1UBSA 1ONRA 3NQMA 4N9CA 2AAMA 1XM3A 1WOAA 4RCXA 4MLJA 3CIWA 2PCQA 2I14A 4QSHA 4TX9A 2OT1A 3N3MA 4NUWA 4NX0A 1A5SA 4RXFA 3C0JA 3R5EA 1XFBA 2FB3A 4GRSA 2HS6A 4RXGA 2FDSA 4CLMA 5IBXC 3DAQA 3GVGA 2CLLA 1GVFA 1X1OA 3P61A 1H63A 5LKYA 4MUZA 3QPZA 3TK7A 4CQ8A 3RLUA 1BTMA 3NQDA 3CWNA 4ZL1A 1EP3A 3WJYA 3VNDA 4FNQA 3NG3A 1LYXA 1RPXA 4PCFA 4ZQOA 4FHAA 3C4UA 2YDAA 5E1QA 3M6YA 2AQWA 3NQ7A 4LRTA 4JD4A 3DKJA 1HO4A 3RU6A 1R47A 5HQEA 1DV7A 3L21A 4WZHA 4Z1DA 2A21A 1WDWA 3A23A 3LV6A 4PODA 2Y62A 3PBVA 1WQ5A 3HMJG 4H6KA 3W1UA 4AF0B 3QYQA 5G2HA 3PAJA 2GQAA 3TIMA 4ALDA 4IPIA 3HQ1A 1JR1A 5AHIA 5FF0A 3TX9A 2ZDRA 2FJKA 3LRKA 2VFGA 2W79A 1O95A 1Z41A 1X7FA 1EP1A 1TV5A 2ZRUA 1SZFA 3LHWA 3LLFA 1TIMA 1KW1A 3SW6A 5DXYA 5HULA 2J9ZA 2ZTJA 2WJZA 3M16A 2CWNA 5HUOA 2RDWA 2V9DA 5DBTA 1SSDA 4BF9A 1WV2A 4CQAA 3NQFA 5KINA 1AMKA 5FF4A 3L67A 1KV8A 3RNDA 2JBMA 1JCJA 1PCWA 2QDGA 3LI1A 3QPYA 2B7NA 3UPWA 4UTUA 4FNRA 1LOQA 3IIXA 1TPEA 2ZZ2A 3G0XA 3EB2A 1KTNA 4Z1AA 3FJLA 4IQLA 2H90A 2PRHA 2X30A 2QCNA 2QR6A 4WY0F 3ATZA 2DU2A 1I2QA 4TR9A 3W7PA 1JQXA 1QPRA 3W7QA 4AH7A 3TU9A 2H6RA 4ADSA 4AHPA 4LOCA 1K8ZA 2ZZ6A 4I7WA 2VXNA 5TIMA 4U28A 4LVGA 4HIBA 4D2JA 1YPIA 4FX6M 1A53A 1AW2A 2QCDA 1EX5A 1TPUA 2HS8A 4K38A 4N2YA 1Q45A 3CQ0A 5H91A 4MJZA 3LBMA 4ORIA 1H50A 4X9SA 1F05A 5D02A 1KA9F 3KHJA 1SO3A 3NQ8A 3EXSA 4ZQNA 1JUEA 5FEXA 2GPTA 3EWYA 3NQ6A 1HL2A 1OFBA 3I7RA 4FNSA 3TW7A 2J9YA 2QJIA 3OBKA 4WQ6A 1TTJA 2C6QA 2FLIA 1L2UA 3MI3A 2VEPA 4EF8A 1AW5A 2GVLA 5D37A 1QWGA 3EWXA 1OX4B 2F84A 1ADOA 5AHMA 3Q58A 1KM5A 4OV9A 2EPHA 1TJPA 3NM3A 1TQJA 1UUMA 4BFAA 1IXNA 5MHBA 3G0SA 1D9EA 4JTHA 4NNAA 5IM51 1QAPA 1CI1A 4MOZA 1XI3A 2HSAA 1FBAA 5C54A 1G4TA 3TFCA 1B57A 2J9XA 1G4PA 3P62A 4FNTA 4OGZA 3W71A 1H7PA 1E51A 4LS2A 1UB3A 1A5AA 2Y85A 3DFPA 3B8DA 3NO5A 4Q32A 3IVSA 1VHNA 4YCPA 4DXVA 4DQWA 3O8AA 4JXCA 2XN2A 3H54A 3UWYA 4LUJA 4KFPA 4TMBA 3HGRA 1T99A 2Z6IA 3MI6A 1XDMA 2C3ZA 1OFRA 2GJNA 4OT7A 3CM4A 3C6CA 4QIUA 3R89A 2YW4A 2ALDA 3R12A 2QDHA 5LNVA 2ZZ4A 4XWUA 1U5JA 2Q8ZA 3NAVA 2ATSA 1MEHA 3A21A 1P4CA 2ZFAA 3TH6A 5GVJA 5FF2A 1GTHA 4XKYB 3C2VA 3G1HA 3VCRA 3PF3A 4O16A 1LZOA 2BLEA 1OFQA 4Z08A 5KITA 1QPNA 4LVFA 5KZDA 1KM2A 3VKJA 1IXOA 3V75A 5DBUA 1JCXA 2E6FA 4PL2A 1LRTA 3M1ZA 4NZFA 4YLWA 4IXXA 3PBYA 3W7CA 1QNVA 1SO4A 3O15A 2Z1BA 3ZR4A 4YCOA 1L6YA 3USBA 2WSQA 3T55A 3FYPA 1JCLA 4O15A 2R8WA 4FXSA 3W70A 2NX9A 1WBHA 4FF7A 2Y61A 4UTHA 3HGJA 3G3DA 3LTSA 1T96A 4HNVA 5L6UA 4MY8A 3W76A 1O94A 3JRKA 1B4KA 5AYZA 3UY8A 2R94A 1KFCA 3DZ1A 4UFLA 2CLHA 4K8HA 3MW7A 1XKYA 4RZ6A 1F74A 1YTEA 3GDTA 4FIQA 2NV1A 3TQKA 3TXZA 4MY9A 3G1DA 2Y7DA 1KM0A 3GDMA 4LV4A 3QH2A 4AXKA 4IJBA 5FEWA 1W5OA 4IX2A 4BK9A 4R53A 1KFJA 3NGJA 1OHLA 1P5BA 1O60A 4JYDA 1SO5A 1R46A 4O8RA 1AG1O 5AYXA 4UTMA 1JUKA 4LT9A 3W7RA 2JGYA 5CPNA 4A2SA 2GJLA 1EUAA 5FF7A 2Y6ZA 1G7VA 2CZFA 1W3NA 3B06A 1GVOA 2EF9A 1ICSA 2FPVA 1U83A 3FYOA 3TNOA 1MZHA 2JKAA 1B3OA 1OFAA 1UASA 1JCMP 4GUJA 3TMLA 3L0KA 3NZ1A 2GVJA 1W54A 3THQA 4YL2A 3GXNA 4GUIA 4OQVA 3ZWTA 1YDOA 2QKFA 1GVRA 2DZPA 2CZDA 3F4NA 2ISSA 1GG1A 3Q94A 4HN4A 3CB8A 1VCGA 1LM1A 1VS1A 1H1YA 3CT7A 4ZQPA 5G1TA 2V5LA 1ME9A 4UCGA 1IIGA 3QSTA 3I68A 1Q3NA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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