3PG8A

Truncated form of 3-deoxy-d-arabino-heptulosonate 7-phosphate synthase from thermotoga maritima
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
272
structure length
264
Chain Sequence
GSFTLVSREFHPEDTVIDLGDVKIGNGYFTIIAGPSVEGREMLMETAHFLSELGVKVLRGGAYKPRGLGEKGLEYLREAADKYGMYVVTEALGEDDLPKVAEYADIIQIGARNAQNFRLLSKAGSYNKPVLLKRGFMNTIEEFLLSAEYIANSGNTKIILCERGIRTFEKATRNTLDISAVPIIRKESHLPILVDPSHSGGRRDLVIPLSRAAIAVGAHGIIVEVHPEPEKALSDGKQSLDFELFKELVQEMKKLADALGVKVN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Tyrosine latching of a regulatory gate affords allosteric control of aromatic amino acid biosynthesis
pubmed doi rcsb
molecule keywords Phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase
molecule tags Transferase
source organism Thermotoga maritima
total genus 98
structure length 264
sequence length 272
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.54: 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase.
pdb deposition date 2010-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00793 DAHP_synth_1 DAHP synthetase I family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3pg8A00
4C1KA 3R8RA 2QCLA 5CSRA 3MP4A 2V30A 5D05A 2G5WA 2VFGA 3GDRA 1JCYA 3W7KA 1AMKA 2E68A 5EL1A 4HN4A 3ZFHA 2JK2A 2QF7A 3LCHA 3KRZA 3PSVA 4WY0B 2QCNA 4AF0A 3S6DA 2UV8G 2ZFAA 3R5EA 1FWWA 1F74A 2V2DA 2F7FA 4TR9A 2TPSA 1M7OA 3TIMA 2NZLA 2C18A 1O94A 3P8IA 3HGRA 1WDWA 4AB4A 1TTJA 4MPQA 1TTIA 3ABSA 4FX6M 1LOSA 3GYEA 2Y61A 2QJGA 1I2PA 2KZHA 3C56A 3FEMA 3GNDA 4JY9A 4QISA 5J5RA 4LRTA 2RKXA 1OYBA 3KRSA 3JRKA 3TR2A 2NUYA 1QPQA 2AAMA 1G4EA 3QRHA 4UTJA 5FEPA 3TH6A 3VNDA 2ZYFA 1Q6RA 1KBJA 2FQIA 2V2CA 5HUPA 3LXAA 3G3DA 5D03A 1S5TA 3M16A 3QPYA 3BG3A 2VKZG 5G4WA 5KTLA 3IEBA 3I68A 4H3DA 1JCLA 2DZTA 4MVAA 1RQEA 3NQ8A 3STEA 3PY2A 4XKYA 4AF0B 3HIJA 1VYPX 1EWDA 2ZA3A 2PC4A 3M1ZA 3VE9A 2A1YA 2BWGA 4CQ9A 4ZZ9A 1X7FA 4HNTA 3VE7A 4HPXA 4O50A 1M5WA 5HNRA 3HBLA 4N6EA 2C14A 5CPLA 3KVLA 3TCEA 3DI0A 3A9IA 3M7WA 1C9DA 1G7UA 1XM3A 3UNDA 3GDTA 3W85A 5KITA 1I8JA 2V8ZA 1DHPA 4NJIA 2CLMA 3SR7A 5KZDA 4O1AA 3U6WA 5CZ0A 3CWNA 2QCEA 1KW1A 2V9DA 4P61A 4UTUA 3W2UA 3U2OA 4RZ5A 3W7HA 3L5LA 2R94A 1IIHA 1JCXA 1R30A 4LVBA 3TW7A 2ZZ5A 1OK4A 1TRIA 1NVMA 5DCEA 3A24A 4R33A 2QJHA 4ZQOA 1XBZA 4BI6A 2FFCA 5HQEA 3LHZA 5K3VA 3IIOA 1AW2A 4EF9A 1JULA 1F5ZA 1K8YA 3OEXA 4BI5A 1QPOA 3PR2A 1XDMA 5SWUA 2H3BA 3LBMA 1VCVA 1IXQA 3GB6A 2ZZ7A 4X2RA 2H90A 1RV8A 5BNKA 4BF9A 3EEGA 2CLIA 4POCA 1JCJA 3O6CA 3BGGA 3NL5A 1EUNA 2GQ9A 1W3NA 4M5PA 2BLEA 3WK1A 3UWVA 1BWLA 1WOBA 4BI7A 1QPNA 2A5HA 2FB3A 1PHWA 5HWNA 4GUJA 5G2HA 4DO5A 2A7RA 2W6RA 4O4WA 1GG1A 3NQ2A 5DBTA 2GVJA 4PH6A 4M19A 3G24A 1TTPA 4UMCA 3KXQA 4GNJA 3SY5A 3TE9A 1IXPA 4ALDA 3IIVA 4LRSA 2ZQ0A 4H6KA 3NQCA 1B9BA 1N8FA 2WNNA 4K8EA 3NYZA 3W3OA 4UXDA 3KOFA 4NNBA 5DY2A 1H7PA 3F4NA 3NXFA 4NX0A 3W1MA 3MHGA 4DPPA 4RV8A 5EY5A 2B7NA 3GX9A 2C19A 3ABQA 3UD6A 4RK8A 3W76A 3W7RA 4O17A 1T96A 1G4PA 4DPQA 1TREA 3QMTA 4QNEA 3VKJA 2FPVA 1Q3NA 3M47A 3P84A 1BTMA 2RHGA 1UBSA 3SGUA 1KFCA 5G1YA 3LTYA 4FNTA 1BKSA 4FXRA 5D30A 2QCHA 4ADUA 4UTWC 4DBDA 1JJKA 3P67A 2NXIA 3C2VA 4KFPA 3QF0A 1U5JA 4N02A 3RLVA 4ONVA 4IXXA 4RZ4A 3QEZA 4HPJA 3L68A 5LGXA 1KV8A 2C1HA 3MJYA 2DP3A 1XUZA 3W7GA 1KV5A 3LRLA 3C52A 4MJZA 3LLFA 3PUDA 3OVPA 2J6XA 1OF8A 3OVRA 4OGZA 5HULA 4O1BA 1F6KA 5BRBA 3RK8A 4UR7A 4MY8A 1X8FA 3NZ1A 3W70A 2VEKA 1DL3A 2J9XA 2CLEA 3EXSA 3LTSA 1WXJA 2QDGA 2Q3RA 2JKPA 5E1QA 4YL2A 3BPWA 1F76A 3W71A 2GJNA 3UXAA 3O07A 1UCWA 1S5WA 2AQWA 2ZRXA 4JD4A 4A22A 3ZR4A 1SW0A 3QFEA 1IF2A 1L9WA 1QWGA 3EXTA 2DZPA 2ISVA 4LUIA 4LVDA 1VGAA 3BVJA 3DFTA 3W9ZA 4FNSA 1LBLA 1OFPA 4HSOA 4O10A 3L0NA 2G95A 1XDLA 1KM2A 2V5LA 4JEQA 3C61A 3E02A 2O7SA 2YW4A 3G8EA 1I2QA 1ML1A 5K2ZA 2GQAA 3NAVA 4UNLA 1PVNA 5KZEA 4NXKA 1ICPA 1W8SA 3C4UA 1VCFA 3NDOA 4UIOA 2V5BA 3NQGA 1TPWA 1M7PA 3FOKA 4O53A 4XZ9A 5AHLA 4JX6A 3LCXA 3DXIA 3LOTA 2TSYA 4LVAA 3QMSA 5EMUA 4RLIA 2Y6ZA 4LVGA 3W1QA 1K8ZA 4NJGA 1EEPA 1AW1A 4FB7A 1AG1O 3A21A 3K30A 3P5ZA 4HNUA 4N4PA 5T26A 1ZHAA 3W7DA 4S2CA 1TQXA 1VYRA 5G1TA 4ZQCA 4Y8FA 3NVTA 3P61A 3W22A 4UC5A 1FDJA 3OVQA 3LB0A 2BSLA 1C8VA 4QIUA 3B05A 3E0IA 4IGHA 5HUOA 3ABOA 3W73A 4FNQA 1LBMA 3QJAA 3S1WA 1ICQA 4NZJA 4NUWA 4IMGA 5CPNA 3RMJA 3TXVA 3S9YA 1F2JA 3YPIA 3MUXA 3UPWA 1NFBA 3KRUA 2FJKA 3C2EA 3IIZA 1TV8A 3IGUA 3G1VA 4HNNA 3BG9A 4DF2A 1ZAIA 3M5YA 3NGJA 5HWJA 5F2GA 3S8HA 4K7VA 2DZUA 4K7YA 2VEIA 3DZ1A 2CLLA 1WQ5A 1TO3A 2QKFA 1SUXA 2YFNA 2WO5A 1T8XA 1M6JA 4R53A 1Q6LA 2DJLA 3LI0A 4ZQNA 4U4MA 1PCWA 4N4QA 4UFIA 1H63A 3EX4A 3OG3A 4KKXA 3UQNA 3LX9A 3B8DA 1FCUA 3QM3A 3P81A 1H7NA 4CNPA 1HTIA 3G0UA 1H7WA 3BO9A 3TSDA 2WSQA 3PB2A 3RFAA 3DI1A 5D02A 1UUMA 4CCEA 3LRKA 3F1QA 3HGOA 1L6WA 1ME7A 5AC7A 4R7JA 3P5YA 1UUOA 4A21A 5ABTA 5KINA 2Z0IA 4S1FA 4UNKA 4DF1A 1YDVA 5G2IA 2JGYA 3L2IA 4NNCA 3BGJA 5TQLA 2ZTKA 4AMAA 2GVLA 1FCBA 1KFBA 3PULA 1GYLA 4CNOA 2Z6IA 2W0UA 3LHTA 4JYDA 4KWWA 4O4VA 3NQMA 1TPB1 2ZDRA 3L5MA 3BG5A 2YYUA 1TPH1 2OT0A 3SECA 2O7QA 3OA3A 4MZ8A 3FKRA 3TC7A 4YWIA 3T7VA 3KAOA 3C2FA 4IXHA 1W37A 1GTHA 2YW3A 3LCGA 3LGEA 4UUIA 4XQ6A 3MBFA 1RZMA 4DQWA 1RQHA 4DELA 1ZY9A 1H62A 4JTJA 3FS2A 5F2LA 2QDHA 3P60A 4FX8A 4OU1A 3VFLA 1XL9A 4JTLA 1OYCA 1ME8A 4NJKA 4E2DA 4LC6A 3W1AA 5F4SA 4BWLA 3BLEA 5AYZA 1W5QA 3W2JA 4JTGA 2ZTJA 2WQPA 4P2VA 1PE1A 3L67A 2CZ5A 1W5NA 1FUYA 3TDFA 3EX2A 1FBAA 3H55A 3N3MA 3STFA 3W88A 3NQ6A 4NVTA 3S1VA 1DKWA 3I6RA 5C5YA 3S1XA 3FYOA 4X3ZA 2PURA 1QPRA 4N6FA 3HMJG 3PSWA 3C8FA 4CCCA 1NAL1 4UTTA 3N19B 1TJPA 3WJZA 1TV7A 3A22A 2A7NA 4JXCA 3T55A 4MUZA 2ZRWA 3DKLA 3HGJA 1JQVA 2VOMA 3M41A 1XBVA 5BW6A 3A5VA 4RX0A 4NQ1A 1TYGA 4AWUA 5K9XA 2B7QA 3W83A 2YFOA 1EP3A 1LOQA 3NA8A 1I2OA 3M0ZA 4O28A 3MHFA 4MZYA 1LRTA 3O8AA 1OFAA 3G1YA 2FPYA 4HKPA 5AHMA 3S5ZA 3IVSA 1XUUA 3TC6A 1Q6QA 1HFBA 1MEIA 4ADTA 1YTDA 5CZJA 2E1DA 5K4XA 3NQFA 3AJXA 3I7QA 1A53A 3M43A 4A2RA 2LLEA 4ZQPA 1YXYA 1GPWA 3LTPA 4AAJA 1OFOA 4NNAA 2ZZ2A 3WK3A 2E6AA 4Q33A 3V75A 5A5WA 3LHYA 3PF3A 1K7XA 2QCCA 3NM1A 3QZEA 5DLCA 3PG8A 2VC6A 4U28A 4JNMA 5E93A 5AC8A 4FO4A 1GWJA 4K36A 4MFEA 2AGKA 2Y7GA 3FJLA 3TAOA 3ATYA 5LNWA 3CPRA 4LS1A 1ICSA 1KA9F 1TB3A 3CC1A 3DKJA 1DORA 2OCZA 1G4TA 1MZHA 1QO5A 2IQTA 4TX9A 1IGSA 5L6UA 3TUUA 1VYSX 4K8HA 2A4AA 5DN1A 3NPXA 1OG0A 3LI1A 5FF2A 4ADSA 4UTKA 4N9CA 2ISSA 2RFGA 4LOCA 4Z1AA 5CPMA 1VQTA 5AHEA 4TIMA 1JUEA 5C54A 2I9EA 3LXCA 3W2KA 3DGRA 2WJZA 3EX3A 4O57A 2J27A 2C15A 1HUVA 3PBVA 5D2TA 2E6DA 3W84A 3P7YA 3W1RA 4A29A 1EA0A 1EP2A 4YXGA 4MOZA 4CCDA 1P4CA 2RDTA 5BMWA 2R14A 3O63A 4EOUA 3JS3A 3TKFA 3W2LA 4PTNA 1OHLA 1H51A 1E51A 3MI3A 3TJLA 1EUAA 2NXHA 3G1XA 4IX0A 4GRSA 1P0KA 3E49A 4XBSA 1QNVA 1P5BA 1A50A 1SW3A 1OX5A 2EGZA 1TSIA 4IWWA 2E5BA 1FX6A 5DBUA 2QCDA 2V2HA 5BOOA 4IUOA 1B4EA 4XKYB 2YR1A 3NPVA 3KFTA 4O8RA 3OHIA 3TXZA 2TMDA 2NX3A 1GEQA 4MZ1A 5AYYA 4IPJA 5I3IA 5F2MA 3LLDA 1VLWA 3A5FA 4RKAA 2YZRA 4MY1A 3IGXA 4DEFA 4OV4A 1TJRA 2CU0A 2QEZA 3BW2A 4EWND 3I65A 1VJIA 3KVKA 3ATZA 4MLJA 4K6AA 4Y9AA 3BV4A 4JS3A 3MI2A 1F6PA 1F73A 4JTUA 2E77A 2OZ0A 1QOPA 1LM1A 3HG5A 3MMTA 5FEXA 4ZVJA 5KZMA 4M7TA 5EKYA 3WFAA 2NX1A 5I3KA 1XC4A 2HSAA 1J5TA 5AHFA 2ZRUA 5CZTA 3EWXA 4NX5A 2DU2A 2GPTA 3TV8A 4ML9A 4XUGA 1FCQA 3B06A 3NOEA 1SO3A 2JKAA 4UMBA 1T99A 1XKYA 3L21A 1MO0A 2C0AA 4MLRA 4JX4A 4M6QA 4DBEA 3B0PA 4QNWA 4WD0A 3NL3A 3S1UA 4E38A 1OFDA 2NX9A 3FYPA 2R91A 4B5NA 1RR2A 1SR9A 3HB9A 3GVGA 2VEMA 1MEHA 2QCDB 1NSJA 2YPIA 2HMCA 4LNYA 4W9TA 3T44A 5AB3A 1W31A 1OF6A 1W54A 2OJPA 4FX7A 2QAFA 3S42A 3WJYA 3TSBA 4PA8A 4FXSA 1K3UA 1KM3A 4CNNA 4N2YA 1K7FA 3W7QA 1OABA 1SZNA 2NV2A 4KFNA 1SZFA 1EX5A 2CFFA 4HIBA 4ZL1A 3VCRA 6ALDA 3P80A 4N9DA 4MJMA 2E5CA 5CPOA 1XBYA 1JCNA 1YTKA 4LS2A 3T4CA 4PODA 1LBFA 1IXOA 3NL6A 4CQAA 1TPFA 3STCA 3NQAA 5HR6A 3VI2A 2CLKA 1SSDA 4QQ3A 4PEKA 3ABRA 3UY8A 4GFSA 1FWSA 3W7PA 2DZSA 3LBCA 2Y62A 3DHDA 4AH7A 4BFAA 3T78A 4WJEA 7TIMA 3GAYA 4LVFA 3QQ0A 5IBXA 3NPWA 2V82A 3GXNA 5H2ZA 1VPXA 1V5XA 2F84A 3WK0A 1ALDA 4JGDA 1ZAHA 1LRQA 4S2BA 5D37A 3PM6A 1TRDA 3DBPA 3W07A 4Z1DA 3LRMA 3EKLA 4WOZA 2PRLA 2DZVA 1J4EA 1A5CA 2Q3OA 4BR1A 4HNVA 2ZRYA 4DO4A 4JY8A 4JIQA 4JTKA 2VELA 2B7OA 2WNZA 4GBUA 4L4LA 4UFMA 3KX6A 1VZWA 3CHVA 3RLUA 2C6QA 5HJLA 4BWLC 2FB2A 4XWUA 4O11A 3T40A 3TX9A 5FF7A 1GQNA 2DZXA 1W5OA 1YADA 1H1YA 2H8ZA 3LHUA 1SQ7A 3HOJA 4PFMA 4NJHA 5G4EA 2ZA1A 3MW7A 3MO7A 2OT1A 3DFNA 1WAUA 5LNVA 3HG4A 3WJXA 3M6YA 1K03A 5DCDA 5K9DA 1GT8A 1RVGA 2ATMA 3TQKA 1WBHA 3N14A 2X2GA 4D2JA 1LZOA 5FESA 4WXYA 4Y96A 4JTSA 2HTMA 3QSRA 1X6UA 2J24A 3PBWA 4FIRA 4WXZA 1GVOA 5I3HA 2CLFA 1Z48A 4OT7A 1N55A 1KTNA 3M5XA 3LCWA 1W56A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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