3PSWA

Structure of e97q mutant of tim from plasmodium falciparum
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
246
structure length
246
Chain Sequence
RKYFVAANWKCNGTLESIKSLTNSFNNLDFDPSKLDVVVFPVSVHYDHTRKLLQSKFSTGIQNVSKFGNGSYTGEVSAEIAKDLNIEYVIIGHFQRRKYFHETDEDVREKLQASLKNNLKAVVCFGESLEQREQNKTIEVITKQVKAFVDLIDNFDNVILVYEPLWAIGTGKTATPEQAQLVHKEIRKIVKDTCGEKQANQIRILYGGSVNTENCSSLIQQEDIDGFLVGNASLKESFVDIIKSAM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
source organism Plasmodium falciparum
publication title Revisiting the mechanism of the triosephosphate isomerase reaction: the role of the fully conserved glutamic acid 97 residue
pubmed doi rcsb
molecule keywords Triosephosphate isomerase
total genus 96
structure length 246
sequence length 246
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2010-12-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3pswA00
1D9EA 2FJKA 1OX5A 3PS7A 4E2DA 4IMDA 4O16A 2R94A 1LBFA 4WXZA 3GNNA 1JCLA 1ZCOA 2A85A 2QEZA 4JTSA 1N8FA 3GR7A 4NJHA 2QCMA 2A0NA 4K6AA 4W9TA 2QAPA 1F2JA 3EXSA 2Y88A 3NEVA 2PRLA 3PBUA 4X22A 2Y7DA 4KFOA 5DY3A 4LRSA 3EKZA 1OFEA 4MPQA 5HWNA 4MYAA 1OF8A 3NGJA 5U4NA 1D3HA 4O11A 4LVDA 4FXSA 3W3OA 1QPRA 3BW2A 4LU0A 3G1HA 3LCXA 1J5TA 1KFEA 1TMHA 2JGQA 3HG4A 1VRDA 3W2LA 3SECA 2H6RA 4MLRA 2ZRYA 1T8XA 1CI1A 2B7PA 1UCWA 3P84A 2V0TA 4FX6M 4HSNA 3STEA 1XUZA 1J4EA 1Q6OA 1Z41A 1OHLA 3MJYA 3W7HA 2YYTA 4JY9A 3W7DA 1ICPA 2WKJA 2QCHA 3BG3A 3R2GA 3WJWA 1A53A 3JRKA 1TTIA 3QJAA 3W83A 2JK2A 3LBCA 4O0ZA 3T55A 1KM5A 1KFKA 3C4UA 3SFKA 5HUPA 3M43A 1B4EA 1LRNA 3BGJA 1X1ZA 3RF9A 4JX4A 5KZDA 1AK5A 3L5MA 4FNQA 4CQ9A 3UZJA 3IEBA 3OVQA 3P8JA 3CT7A 4GUIA 1ME7A 2H3DA 2P1FA 2W6RA 1XFBA 3QMTA 1OX4B 4YLWA 3ZFHA 2A5HA 1L9WA 3LHYA 3TK7A 2GJLA 1SW0A 3CPRA 4PA8A 3HF3A 5I3IA 4O17A 3DAQA 1OYBA 1LP6A 3PUDA 4UFJA 3KVMA 4JTFA 1C8VA 3M5YA 3C8FA 5HR6A 3MP3A 1QOQA 4ZMGA 1WBHA 1KM4A 3GVGA 1K02A 2E6AA 4JR5A 1SSGA 3HOJA 2QCEA 1X7FA 4N6FA 3N34A 3CEUA 3FJLA 3E02A 1TPWA 2ZZ7A 3NNTA 4LY8A 1KW1A 4WY0B 1TPH1 3H55A 4EIVA 3HMJG 4ZQCA 3QMSA 3I7QA 6TIMA 3CQ0A 5D32A 3GXNA 3W87A 2JKEA 3M41A 1H63A 5G2HA 3E9AA 4FNRA 2VEMA 1EP1A 3UXDA 2C3ZA 1SU5A 3G1AA 3K30A 4RJEA 4Q4KA 1K3UA 3AJXA 4DO5A 3C2EA 4O12A 1PL9A 1G6CA 4UFHA 5KTLA 1WOBA 3O6DA 1G7UA 3TKFA 3P5ZA 2BWGA 1LDCA 4FNPA 4UTUA 2QUVA 2B0MA 4PC8A 5AB3A 3W7GA 3LHTA 5GVJA 3LTSA 3W7MA 3CU2A 3IIXA 1PS9A 1A5BA 4GUGA 5D04C 5DCEA 2NV2A 1K7XA 4A21A 3VNDA 1W3IA 1F05A 3N73A 3W2KA 1OX6A 4JTJA 2BTMA 3L66A 1GT8A 1B9BA 3UPWA 4MVAA 2E77A 2WNZA 2Y7GA 4NNAA 2Q3OA 1ICQA 2VFEA 2RHGA 2FIQA 3C6CA 5CZ0A 1GQNA 4M5PA 1ZAIA 4R53A 4K39A 4I9AA 1KV8A 5D09A 4X2RA 3TQVA 2P10A 4GUJA 1GZGA 2VENA 4RLIA 4BI7A 2B7OA 4ZQRA 3B0UX 4XZ9A 3OIXA 2ZTJA 1FWWA 3TSDA 5DBTA 1S5VA 2X1TA 4HPXA 3IIPA 1UJPA 1ONRA 5G1TA 2PRHA 4NXKA 3NQVA 1T99A 4AH7A 4IXXA 5I3FA 2RDTA 4MLJA 1NEYA 2WSQA 2DORA 4NJGA 1KBJA 2H90A 3Q58A 4Y96A 1GVRA 2HS6A 3BK0A 3ABSA 4BWLC 2X1RA 3QW4B 4O4VA 3NPXA 4WZHA 5E1QA 3G0XA 1P5BA 3HGRA 3S6DA 2G96A 2D73A 2OJPA 4GNJA 4GUFA 1XCFA 2QJHA 3ANYA 1VLIA 1M5WA 4Z08A 3MBDA 3W86A 1O95A 3EX4A 4O18A 2P0OA 2BZNA 1ICSA 3TC6A 2CU0A 3M44A 2Y85A 4M6VA 1PVNA 4UTHA 4ZQOA 1LLZA 2YZRA 3P62A 3H53A 1KFCA 3G24A 4RX0A 3G18A 3C3NA 4I7WA 4TX9A 5LNWA 2Z6JA 4CNOA 2NXIA 4UR7A 3W2MA 3PB2A 1IIGA 3QPZA 3GK0A 2WSRA 2QAFA 1W37A 4MIMA 4DO6A 4AAJA 3TMQA 3ZS4A 4P61A 4MZYA 3W84A 5F4WA 5AHLA 4K7YA 5K9DA 4LUIA 1F5ZA 4UXDA 4HN4A 4DPQA 5F2MA 2WPBA 1I8JA 1L6YA 2ZCGA 2NX3A 4N9EA 1H7XA 4ORMA 4RK8A 3RMJA 5DCDA 4Z1DA 3L0GA 4R34A 1FX6A 4NQ1A 4BR1A 1A50A 1QR7A 5G4EA 1A5AA 1EA0A 1GJPA 1Z44A 4CNPA 3NXFA 2YCEA 2Y63A 5K7JA 4RZ5A 2R14A 3P61A 5H91A 3TX9A 2NUYA 1BTMA 2HSAA 1RQEA 3PG8A 3MBFA 2DZVA 5K3VA 3T40A 2YXGA 4AWTA 2E5BA 1V5XA 1IIHA 1O5XA 3CWOX 1FWNA 4ML9A 3UYCA 4AVFA 4CLMA 3P7YA 2F7FA 2VEIA 4IX2A 4NNBA 3NR0A 3RLUA 1V7YA 2ZA1A 4CCCA 5AOUA 1ZFJA 4AEOA 4UTWC 1YTDA 5BOOA 3CTLA 3HJZA 2OCZA 4IMGA 1ALDA 3RLVA 3FA5A 3QFEA 3ELFA 3G1SA 2PURA 3LHUA 4FX8A 2ZFAA 1XM3A 5CPLA 1JRCA 3T44A 1Z48A 1OFBA 3DHFA 3W7NA 2IQTA 1GG0A 1HTIA 4S2CA 1MEIA 3PBVA 4AMAA 2B4GA 3W7CA 5AHEA 3A21A 3GXTA 5FEPA 1B57A 1KA9F 5KSWA 1JVNA 3BARA 3WJSA 3S5NA 4U4MA 1TTJA 1JR1A 3UY7A 4JEQA 2QCGA 4ADUA 3OVRA 3IIOA 3RU6A 1FDJA 4E0CA 3UWUA 5F2LA 3L21A 5CKSA 4BI5A 3BO9A 2E09A 2Q8ZA 3TROA 1TREA 5IBXA 1BWLA 1NF0A 4S1FA 3TE9A 3LCFA 3NPWA 3CC1A 2CLOA 4GFSA 4EWND 2GJNA 3TV8A 2NZLA 3WK0A 3W7LA 1KM1A 1QDSA 4UCGA 3NL6A 3W1XA 4LS1A 4PL1A 3TW6A 4NU7A 4XBKA 4MY1A 3SZ8A 5F2GA 4IX0A 4KWWA 4A22A 5HWJA 1TRIA 5D05A 3MI6A 4HNTA 4DF1A 3GR8A 1FBAA 2QDHA 3PBWA 3NL5A 2E6YA 4CCDA 5J5DA 5EKYA 2AQWA 1SFLA 3OHIA 3W2JA 3GDRA 5KITA 5D2YA 4QNWA 3HPSA 1ML1A 5DXYA 2NXGA 4FHAA 1RQBA 3EX3A 2DJXA 4EF8A 2J9XA 3I7SA 1PE1A 4LS2A 4AF0A 3GYEA 3W75A 4AXKA 4HNNA 3S8HA 3W7OA 3W1MA 2B7NA 4O10A 1XDLA 3CM4A 4N02A 4O28A 4UNKA 2CLHA 3THQA 4O0KA 1X6UA 4NJKA 1OFAA 4UTTC 5EBUA 3KRUA 2A4AA 2JKPA 1XL9A 3TA6A 3SR7A 1R30A 3HIJA 3QYQA 1W8SA 3L65A 5D02A 2DZSA 4XWUA 4PEKA 3BG5A 4GUHA 2YDAA 4QQ3A 1KFJA 3FJ6A 1SZFA 2FTPA 1PHQA 4C1LA 3NQ6A 1K8YA 1OABA 2H8ZA 2A1YA 4FB7A 3NQDA 5HINA 3W7QA 5BNKA 1G4EA 5CG7A 3L9CA 2OX1A 1ZHAA 1HL2A 4NXSA 1IXOA 1F6PA 1NSJA 4JTIA 3S1UA 3WJYA 2ZRWA 1GYLA 1Q6LA 3UWWA 1Q6RA 1O94A 3BV4A 3P74A 2A6NA 4NZJA 3SJ3A 2DJLA 2OZ0A 3KFTA 1CW2A 1A5CA 3DXIA 3DFOA 3GAYA 3LTPA 3N9SA 1YXCA 3IRDA 5TBOA 3ABQA 1X1OA 3BVJA 4TU1A 3M16A 3NQ7A 4LS0A 3PSWA 3SGUA 2H8XA 3IIVA 3U2OA 4UTWA 2WJZA 4UFLA 4AHPA 2ALDA 3NO5A 5L9FA 3B03A 4NJJA 3TFXA 2BLEA 2ZA3A 1UB3A 4HHPA 1OJXA 2EHHA 3OEXA 3S1XA 2GVLA 2CLEA 1QFEA 2TPSA 2FQIA 3DU0A 3PB0A 1EP3A 3C52A 3QSTA 3M5ZA 3MUXA 3GNDA 1H62A 3C61A 1LBLA 3S1VA 1LROA 2B7QA 3W70A 2E1DA 1P4CA 4JTTA 3LBMA 3OBKA 2CLKA 3KRZA 2X16A 3O1NA 2X1UA 5L6UA 3FLUA 3Q94A 3TQ0A 3C2FA 4Q33A 3IGUA 3NPUA 1KTBA 4FX7A 1K7FA 3B05A 1MSSA 3VI2A 1ZNNA 5K4XA 2ZRXA 3PWAA 5FEXA 4WY0A 3LCGA 1SO5A 1G4PA 4Y90A 5CZSA 4YXGA 4BI6A 1WAUA 2RFGA 3GKFA 5D2XA 4XTDA 1VR6A 3LLDA 3UPBA 2QCDB 3VKJA 3LI0A 3LERA 3R12A 3NPVA 3DFTA 2EAWA 1KV5A 1VZWA 2OT1A 3EWZA 1WBJA 2CW6A 3PY2A 5CZTA 1DKWA 5D38A 3H54A 4PODA 4JIPA 3PULA 1R2TA 2QR6A 4Y8FA 3PG9A 3C2OA 5CSRA 2QUUA 2ZA2A 1BWKA 3PR2A 4M7TA 3UWYA 2QJIA 1TYGA 1JCXA 3EWWA 1M7OA 3HGJA 2ABAA 5C55A 2ZRZA 3LOTA 1TPEA 3EX2A 3GB6A 3L2IA 3PSVA 3R89A 1Y0EA 1K03A 1TPUA 3RFAA 2HS8A 1FXPA 5I3KA 4JDBA 4ZQMA 4GBUA 3SGZA 4QM1A 3UY8A 4UTTA 1R46A 5AYYA 3TSMA 4UFIA 4JTLA 3LDVA 1FCBA 3D0CA 4NUWA 1JCJA 3PBYA 2ISWA 1LOSA 4AHOA 4J9JA 3QW3A 1JUEA 2FFCA 3Q2DA 4WOZA 3UWZA 3CIWA 1KBIA 3LV6A 3T78A 4GWEA 5AHFA 4TIMA 2QCNA 5LGZA 3L67A 1U83A 3S5ZA 1YYAA 2CWNA 1TPFA 2WO5A 1YADA 1ZAHA 1TPDA 3WK3A 2C18A 1LRTA 4IUOA 4JIQA 5A8GA 1G4TA 5FF3A 1HO1A 4ALDA 3FEMA 2R91A 4O4WA 1FWSA 1ZAJA 4WXYA 3N19B 3FKRA 3UNDA 4YCPA 1U5JA 5K4ZA 1SZEA 4ADSA 5K9CA 4LNYA 3STGA 3S42A 1DJNA 5KINA 3W2UA 1LBMA 3MWAA 4IQLA 2X30A 2EF9A 5F4XA 1VHNA 1H5YA 4OQVA 1ZY9A 2QCFA 2ZZ4A 3W72A 3W7IA 4PL2A 4A3UA 3S5OA 4OWGA 3W73A 1Q45A 1UBSA 2ZBTA 4ZQPA 2YW3A 2Z1BA 4WX2A 4O54A 4AWUA 3QEZA 4HPJA 4TR9A 4JD4A 3W1LA 2WNNA 4BK9A 5HR7A 3MHUA 1AW1A 1VYRA 2Z2UA 1RZMA 1SW7A 1YDVA 3HPZA 2CLMA 1E51A 1TO3A 1SUXA 1OYCA 1VS1A 5G4WA 4O1DA 3O8AA 4RXFA 3IIZA 3MI3A 4A29A 3PAJA 4JTKA 3NQ2A 5IBXC 2HTMA 4H3DA 4RKAA 4DPPA 4U28A 1SZGA 3W7PA 3W1AA 4N9CA 3GZ3A 4HSOA 1S5WA 3EWYA 4XQ6A 5DN1A 3FYOA 3TXZA 1SPQA 1SZNA 5HMSA 4JTHA 4O15A 5AHMA 1L2UA 1O60A 5TQLA 2XN1A 3G1YA 1DV7A 1BKSA 3NOEA 2Y89A 2C6QA 1TQXA 2WOQA 1I2NA 4N9BA 4AWSA 4DO4A 1NF7A 3NG3A 3NL3A 1MEHA 1YXYA 2E5CA 4LTSA 4PH6A 1YXDA 2Y7FA 2QKFA 2RDUA 1TPC1 3B8DA 4WOQA 3U8GA 3BW4A 3B04A 4OU1A 3KOFA 1H7RA 4UNLA 3EXTA 3P80A 1JULA 2J27A 2PE4A 4GXMA 3HO8A 1XBZA 4R33A 5D33A 1WXJA 5FF0A 2DZWA 5G1YA 3S0CA 4XTIA 2YX0A 1DQWA 1I2QA 4A2SA 1TPVA 4LVGA 3DHDA 1IGSA 1SO6A 1WOAA 1O4UA 4UIOA 2FPYA 3WJXA 3G0UA 2WV8A 5K2ZA 1H60A 3ABRA 2YR1A 4JTGA 3O05A 3Q37A 4TMBA 4K8HA 4KWVA 1IXNA 4HT3A 4E38A 4YCOA 5F1VA 5AC6A 1TSIA 2NLIA 3THAA 5E93A 4BFAA 1F7BA 1JRBA 2YGYA 3F4NA 1DHPA 4HNVA 1YTKA 5BMWA 3W22A 3LCWA 2VEPA 3BLEA 5CSSA 3EX6A 3N2MA 4IMEA 4XUGA 1W5PA 3KRSA 5HQEA 4X3ZA 3E12A 3E96A 3MP5A 3CWNA 3G0SA 3BLIA 3N14A 3M9YA 5F2IA 1GVFA 2QF7A 1EB3A 5D03A 1MZHA 2V5LA 1YTEA 3S5YA 1W56A 3DFSA 3C56A 1XBXA 2NWSA 2CZEA 4UTKA 2VFGA 1WX0A 1HG3A 2HMCA 3LRKA 5C54A 3M5VA 3NQAA 5D30A 5MHBA 2LLEA 3PF3A 1TTPA 2VOMA 5I3JA 3DI0A 3LI1A 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 3EXR A;  1EPX A;  1TV5 A;  5AYZ A;  1TJR A;  2KZH A;  3W1U A;  4OBT A;  1JUK A;  1RPX A;  1TIM A;  1EEP A;  3QQ1 A;  3GX9 A;  4XKY B;  3TCE A;  4C1K A;  4EOU A;  4WJE A;  5I3G A;  3HG5 A;  3HB9 A;  3CB8 A;  3DFQ A;  1H7W A;  5LNU A;  1EX5 A;  1AMK A;  5D37 A;  4OHQ A;  2E6F A;  3FFS A;  3QC3 A;  4MZ8 A;  3GLC A;  2WNQ A;  4JGD A;  4IXH A;  3W7J A;  3T7V A;  2G5W A;  2J9Z A;  3P60 A;  1TB3 A;  4LVB A;  1PV8 A;  1I45 A;  1NAL 1;  3KAO A;  5EYW A;  2ZZ5 A;  4LRT A;  1G69 A;  1SQ7 A;  4JY8 A;  4O8R A;  2XN2 A;  1N7K A;  3LRL A;  2UV8 G;  2WSY A;  4ZL1 A;  4OV4 A;  2E68 A;  1PHW A;  1AW5 A;  3NVT A;  1H61 A;  2CZ5 A;  4Q32 A;  3G1V A;  4LW7 A;  6ALD A;  3PUE A;  3DGR A;  3BLF A;  1VCF A;  3FS2 A;  3LHW A;  3NAV A;  4RR4 A;  3LXB A;  3G3D A;  3GIY A;  4AF0 B;  4QJ1 A;  1MO0 A;  4MOZ A;  4CQ8 A;  4O1C A;  1GYN A;  2Z6I A;  5G5I A;  1FDZ A;  3O6Y X;  4TO8 A;  1K8X A;  5BW6 A;  2A7P A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3SUV A;  1Y8B A;  3PS7 A;  4E2D A;  3CZK A;  2R94 A;  2C0H A;  3GG8 A;  2A85 A;  1ZCO A;  2PTY A;  4JTS A;  1N8F A;  1QJW A;  4TTG A;  2ON3 A;  2Y88 A;  3MKC A;  2PRL A;  4X22 A;  3GNP A;  2Y7D A;  4LSB A;  3RJX A;  1J96 A;  4LRS A;  1OFE A;  3VCC A;  5HWN A;  1D3H A;  1W8G A;  1PIF A;  1PTA A;  1QPR A;  2VGB A;  9XIM A;  4GXP A;  1PJ9 A;  3T0C A;  2PLK A;  1TMH A;  2ADA A;  2G3J A;  2JGQ A;  1UW9 A;  3B3D A;  2WZI A;  4MLR A;  1T8X A;  5A6B D;  3RM8 A;  1UCW A;  3O2L A;  1NWT A;  3RDK A;  2BOD X;  2DZB A;  5FSE C;  1URO A;  4RW5 A;  3BH4 A;  3ZLF A;  2YYT A;  3W7D A;  1R8L A;  3GTX A;  4GY1 A;  4R88 A;  1QHZ A;  3JRK A;  3MSY A;  3ES8 A;  4O0Z A;  2C91 A;  3GUW A;  4AZC B;  1J8V A;  2YCI X;  1B4E A;  1LRN A;  4NIL A;  1MXD A;  4B15 A;  1EGZ A;  4HYR A;  4ROQ A;  4FNQ A;  3P8J A;  3CT7 A;  3R58 A;  1IYX A;  3D3F A;  1D3C A;  1XRF A;  3QMT A;  4LH8 A;  3SM0 A;  2VOT A;  1L9W A;  2GJL A;  3V4B A;  4PA8 A;  4D8Z A;  1E4M M;  4JKM A;  5BRP A;  4PUD A;  1LP6 A;  1MVY A;  2FZD A;  1A5L C;  3NXL A; 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