3PZGA

I222 crystal form of the hyperthermostable endo-1,4-beta-d-mannanase from thermotoga petrophila rku-1
Total Genus 155
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
155
sequence length
357
structure length
357
Chain Sequence
FRFIGSNNYYMHYKSNRMIDSVLESARDMGIKVLRIWGFLDGESYCRDKNTYMHPEPGVFGVPEGISNAQNGFERLDYTIAKAKELGIKLIIVLVNNWDDFGGMNQYVRWFGGTHHDDFYRDERIKEEYKKYVSFLINHVNVYTGVPYREEPTIMAWELANELRCETDKSGNTLVEWVKEMSSYIKSLDPNHLVAVGDEGFFSNYEGFKPYGGEAEWAYNGWSGVDWKKLLSIETVDFGTFHLYPSHWGVSPENYAQWGAKWIEDHIKIAKEIGKPVVLEEYGIPKSAPVNRTAIYRLWNDLVYDLGGDGAMFWMLAGIGEGSDRDERGYYPDYDGFRIVNDDSPEAELIREYAKLF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural characterization of a novel hyperthermostable endo-1,4-beta-D-mannanase from Thermotoga petrophila RKU-1
rcsb
molecule keywords Mannan endo-1,4-beta-mannosidase. Glycosyl Hydrolase family
molecule tags Hydrolase
source organism Thermotoga petrophila
total genus 155
structure length 357
sequence length 357
ec nomenclature ec 3.2.1.78: Mannan endo-1,4-beta-mannosidase.
pdb deposition date 2010-12-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3pzgA00
4AMCA 2RGLA 5LYRA 4GQRA 3RDKA 1IZKA 2CETA 2WLZA 3AHXA 3CMGA 1E5JA 2EXOA 3A47A 2XSBA 1GQJA 3VDHA 2PWDA 5D4YA 2O9OA 4UR9A 1V02A 4XV0A 1BYBA 4F9DA 4W5UA 3PZTA 2QMKA 5CG0A 2VZOA 1R7OA 1H2JA 4RE2A 1E4NA 1FP9A 1W3KA 3PZ9A 2YBUA 2ZUMA 1DWAM 1UKPA 5M3WA 2CESA 4W93A 3CUFA 2DSZA 4NF7A 2W4XA 4YHEA 3W4RA 4AD2A 3SCUA 4AEFA 1GOMA 5M5DA 1JDDA 1BG4A 4AIEA 2UY5A 2EPNA 4JL1A 1E0WA 2W62A 2WBKA 3WH5A 1VBRA 3BSGA 3VGHA 1BQCA 1UR9A 2HVMA 4WJXA 2WHKA 3AZSA 3RIKA 3M6DA 1W91A 1W9UA 1JDCA 4XUYA 4JFTA 3EMQA 3VDCA 2W61A 1V3MA 2WC3A 8A3HA 5GQBA 1V02E 2DT2A 3CMJA 3VMPA 1MYRA 1ZS2A 1LL7A 1CXIA 4ZFMA 3N9KA 1TVNA 1UWIA 4MAZA 1WNOA 5IHSA 2DPEA 3L4VA 5IFPA 3W53A 4D6FA 3AOFA 1US2A 1BF2A 1SYTA 1IT0A 1WDSA 1HJXA 2WVTA 2ZUNA 3WD4A 3G6LA 4UQDA 5D8WA 4GO9A 2QPUA 3PZGA 1VFOA 3HJEA 3PZOA 5CLTA 1CXHA 1GZJA 4Z2HA 1UKTA 3WQ8A 3WNMA 2WXDM 2WZEA 2X05A 2X8RA 1VFMA 1UD8A 4OZOA 1D3CA 2W92A 3M46A 2ESCA 1L8NA 1F4HA 2GFTA 1MQQA 5I0DA 3O9NA 1AMYA 3FW6A 1ZBKA 3UETA 5CQ1A 2BY0A 3ECQA 1XSJA 3WQ5A 2W63A 4GZIA 3FN9A 3E1F1 3CIVA 3D5HA 1E6SM 3VIMA 2J7BA 4X0NA 2ZX8A 1WZLA 1J9YA 5I23A 3AZTA 4UTFA 4TTGA 1HF6A 1JI1A 2CITA 4W88A 4HOWA 3U7VA 4U3CA 2XYLA 3QOMA 2WYSA 4D6DA 2VZVA 5CLWA 4JKLA 2JIEA 4P7LA 2VL4A 3CZGA 4OIFA 2VNCA 1XYZA 4OOUA 2WLYA 5GPRA 1UWQA 4ZEPA 4Y7EA 2WNWA 2J25A 3VGFA 3UERA 4H8UA 1J18A 3SUWA 5DEZA 1CXFA 1XCWA 1QBBA 4OBSA 4QDMA 1CTNA 4P8XA 3AXHA 1JNEA 2C8NA 1CLVA 2VI0A 3WUBA 3RMEA 3ZQ9A 3N15A 3MS8A 4JHZA 1J10A 3CTTA 1ISZA 1ZJAA 3LPFA 4P7OA 2CCRA 1NARA 1TCMA 4ATWA 2XVKA 1Q6GA 3AYRA 2D1ZA 1E56A 1CXLA 1VBUA 4YHGA 2XIIA 1NP0A 4A4AA 3AIQA 3ARYA 1QVBA 4MAVA 3GTNA 1PBGA 4WLCA 3HN3A 5DT7A 3SCPA 2BVTA 1QI0A 4CGTA 4GKLA 4PTXA 3T0AA 3QGVA 3RPMA 3CZEA 3L4TA 1CDGA 2FGLA 4PN2A 2JFEX 4UOQA 1W1VA 5HOSA 5A2AA 3S2CA 3B9EA 4QLJA 3VO0A 1H3GA 2WVVB 3W6LA 1E4LA 4BQ2A 2WMIA 1QHZA 1J12A 3VIFA 5IDIA 3VD3A 2PWHA 2ZX6A 2PF0A 4UFHA 4H2CA 5EFFA 3W38A 4NI3A 4EK7A 3AMDA 2PI6A 3AHVA 1OCQA 3SUVA 1FA2A 1FOBA 2JIWA 2HISA 1HT6A 1CIUA 2E8YA 5FD0A 4ZXOA 2PB1A 4LX4A 3CGTA 1UH4A 4AZIA 1DWGM 1BGGA 1ISVA 4U3AA 2WMIB 2E8ZA 2ZE0A 3KL3A 4W5ZA 3WH9A 4DM2A 1JZ4A 3W28A 2WCGA 2XFRA 4PCSA 3TP4A 4JCLA 1J0ZA 3AMKA 2XVLA 3PZVA 1H4PA 1M53A 2WMJA 1K9FA 1AVAA 4MNJA 3B8SA 1DWIM 2O9RA 5BWFA 4AZ7A 2E9MA 4IPLA 5FKYA 5AY7A 1F4AA 2WZHA 3WMBA 1V6UA 4AXNA 3WEZA 2WC4A 5D8ZA 4GI8A 1GCYA 5E9AA 1XC6A 2G4FA 4J3SA 1HVQA 2OSXA 4UQEA 1SMAA 2EQDA 4W8LA 3BSHA 1KCLA 3W6MA 4CUCA 3QHOA 4M80A 2G41A 1OD8A 2TAAA 3GDBA 5CPSA 4W85A 3GXFA 5I24A 1CGXA 1UWUA 3ZT5A 3BC9A 3W24A 3PZQA 3BAXA 4UNIA 2VX6A 2GJPA 2O9TA 2V5DA 2JF7A 3W37A 2A3CA 3AMLA 5ABGA 1JL8A 4MDPA 2YKKA 1JFXA 3I3DA 4E8DA 4Z2IA 3AMGA 1FP8A 4F79A 4H8HA 5A2BA 1E0XA 1OT2A 1J11A 1C7TA 3CZJA 1VJSA 2XVGA 5M17A 7CGTA 1QNOA 1MXGA 1HP5A 3WNNA 3WL1A 2G3JA 1UYQA 2XVPA 4AD5A 3AYSA 4UFMA 1PAMA 1V3KA 1V3IA 2D3NA 3L4XA 2A3BA 1VIWA 3OBAA 3UG3A 4MTVA 3W27A 4HPGA 4R27A 4UFLA 4GO8A 1XRVA 2J79A 2WCSA 2XM1A 3WUGA 3AROA 1E5NA 5BYWA 2WHLA 3L4ZA 1ISXA 3WN6A 3KZSA 1NWSA 4HTYA 5HDRA 4KGLA 2XUCA 3RM8A 1WZAA 1E43A 1TE1A 2YDSA 2BXYA 1PX3A 3AHYA 1G01A 1JDAA 4JZ5A 5A94A 4TXEA 1V0MA 1EOKA 4IM4A 3CH9A 1KQZA 1FFQA 4XZWA 1VAHA 3WD0A 1OIMA 4D72A 4PSRA 3IJ7A 4H04A 3GNOA 1HX0A 7TAAA 3W29A 3AS1A 3VD5A 2CYGA 3W0KA 1CENA 4CCDA 3SCOA 2ZXQA 1NWRA 4AY1A 2VTFA 4W7WA 5A6AA 2VCAA 1OD0A 2B31A 5AC4A 3CHCA 4J28A 3F5KA 3WIJA 5A8NA 4PTVA 5JIWA 3ZR5A 1QI3A 4ZE4A 3ZSSA 2AMGA 1G1YA 3AI0A 3VIGA 4L4PA 3MU7A 3SEPA 1PEZA 4N0RA 2CIPA 3VGBA 3NSMA 1D2KA 1OB0A 3POCA 1G9HA 1EQPA 2GSJA 5JBEA 3PZNA 5A2CA 1O6IA 4WKAA 2WHMA 3DECA 2WZIA 1TMQA 2XM2A 4PEEA 2QMJA 1UA7A 2VVNA 5IFTA 2G8ZA 3RM9A 2YA2A 1W9BM 4PMDA 3EMZA 3G6MA 3MMUA 1CGWA 4U2YA 2CBUA 1JYNA 3NSNA 2WWCA 4PMVA 1MVYA 1KXVA 1MFVA 3MANA 4HP5A 3EMCA 4H41A 1LG2A 3N18A 4MNKA 4EKJA 3IAPA 4HZ6A 2W67A 3MUIA 1CBGA 1HJQA 2J7GA 4CVWA 1BG9A 1C8YA 2VCBA 3EBVA 1SR0A 4JCMA 3N12A 1B9ZA 1DP0A 1CXEA 3F5LA 4W7UA 1ISWA 2V3GA 2E9BA 4K68A 1MW0A 4B9ZA 5IXEA 1ISYA 1V6XA 1RPKA 3ZT6A 3UG5A 4JL2A 1EHNA 4MJ4A 4LYPA 2J47A 3MUY1 5F7UA 4HZ7A 3VUPA 2QF8A 2WMKA 3NUKA 1FHLA 1LLOA 4KWUA 1US3A 3OIHA 4TVUA 5CSYA 1W1TA 4JFUA 3GH4A 4B9YA 3ARVA 1ZBCA 5LA0A 1V6YA 2QLYA 4KH2A 3ARWA 3WDRA 1PIFA 4F66A 4P8WA 1BFNA 2J78A 1TUXA 1LJYA 5A6SA 3M7SA 2UWFA 1AQMA 3AIRA 4M29A 3VILA 4UQ9A 2Y24A 1UA3A 1KFWA 1XSIA 1B3WA 2DSVA 1KQYA 2JF6A 3VTRA 3CBWA 1E6ZA 3CHFA 1D7FA 2Z1SA 1HKMA 5A8OA 5A6LA 2F8QA 1FH9A 2IXUA 1JD9A 4TTUA 4Z2JA 1C91A 5JUVA 3GH7A 1BVNP 1KXHA 3DYPA 1VFUA 1ESWA 4S3KA 4OJYA 4MB3A 1HJSA 2VOTA 1Q6DA 4IUGA 5I78A 1WO2A 1ZBVA 1GPFA 2FGZA 3SURA 1MW2A 4Q7NA 1PX8A 4TUFA 4V2XA 3WY1A 4CCCA 2CKRA 3ZJ6A 1V6VA 2NT0A 4FMVA 1E40A 5CPTA 1MW3A 2BY1A 5EMYA 4AWEA 2YL9A 5C8BB 1I1WA 3BGAA 3VMOA 2JEPA 1E6QM 2WW5A 3I3BA 1NQ6A 3SUUA 2CKSA 2BHZA 1J0JA 1CZ1A 1WE5A 3TTSA 3ARUA 2W5FA 4PMQA 4AZHA 3J7HA 1WB0A 4QAWA 2A3AA 4KRTA 3WUFA 1V0LA 2J8FA 3VKKA 1K6AA 2BFGA 3SIMA 1J0HA 5EBAA 2YL8A 3B9DA 5I3DA 2J7HA 1E15A 4CU6A 1W9DM 4ZENA 1G94A 4PYSA 4MJ2A 3NJ3A 1WDQA 2NW0A 1JF6A 4D6GA 3AS0A 5BXRA 4PMXA 1WP6A 1J0KA 2XWEA 4KRUA 2VX7A 4DUVA 2XTKA 1AQ0A 1JYWA 4P7QA 2J75A 3TA9A 2ZOXA 4UCFA 3CZKA 2AOSA 3UR7A 3A4WA 2FHBA 3A4XA 2E0PA 4E4PA 1G5AA 4GIAA 3PTMA 4GI6A 1BGAA 4J3VA 5CSUA 3MKKA 1W3JA 3NYDA 2XHYA 4L4OA 2WCAA 2YA1A 1B3XA 5A8QA 1DHKA 4CD7A 5M03A 1P6WA 1XV8A 1BYCA 2D20A 3K4AA 3WD1A 1NWUA 1C7SA 3OLDA 3VMNA 4W7VA 4HMDA 3WMCA 2VMFA 3DHUA 1UWRA 1PZ2A 4AISA 5BRPA 1GONA 2AAAA 2ZXAA 5C71A 4M82A 1BLIA 3WBAA 4NZCA 2WANA 1GNXA 1U2YA 3AHZA 4OUEA 3GBEA 1UWTA 3BAKA 4AIOA 4FLSA 1C90A 3AIUA 3UEQA 1KXQA 1CLXA 1K9TA 4TX8A 4GXPA 1HJUA 4JFSA 2O9PA 3VM5A 2YLLA 4IPNB 5CXPA 3M07A 1DTUA 2BS9A 2WKLA 2WVVA 1NH6A 1CGYA 4BS0A 1EHAA 3SCSA 3RCNA 2IXVA 3RM4A 5AYIA 1VRXA 3T2PA 4AEEA 3AQUA 4UQCA 4X0VA 3VGDA 1H0GA 2W66A 2QHAA 4AC1X 4HZ8A 2EPMX 1KR1A 3II1A 9CGTA 2V3DA 2JE8A 2WMFA 4ACZA 3TTQA 3W81A 2XFFA 2ZX9A 5E6YA 2VR5A 1BVZA 3OLIA 2X0YA 4W86A 1KGUA 3AIVA 1R85A 3W26A 1EH9A 1UR2A 4MB1A 1E4MM 1JZ8A 4B15A 2J7EA 1HJWA 2WMHA 1GVIA 5I79A 1GVYA 1K9EA 4BCEA 1EO5A 5CZKA 1Z32X 3L4UA 5A6BA 3WNKA 3WDJA 1E3ZA 4FLOA 1WDRA 3WELA 2V38A 4ACZB 4HMEA 4CN1A 3ZMRA 2ZUUA 2VT0A 5E6ZA 3PTQA 4ATDA 1AQHA 1SFSA 1W9PA 1E6XM 3OLGA 4PSPA 3IK2A 2J74A 1OT1A 4JFVA 1C93A 1HIZA 1UR1A 3GYCA 3CUIA 4CCEA 1UD5A 1FFRA 1X6LA 4MADA 2X2YA 1K9DA 3O2LA 4DWSC 3FHQA 3VDBA 2VX4A 4QFUA 1OBAA 4M8UA 3RO8A 3TOPA 4UFKA 2J62A 1QW8A 3BMWA 3AXXA 2E4TA 1MQPA 3RJXA 3CO4A 1RD6A 5HXMA 2ZXBA 1JG9A 5D9NA 3ARXA 1W1YA 3MSGA 2CHNA 2XGBA 2YIHA 1KXTA 3SCTA 2BV9A 4C7FA 4ACYA 1HVXA 3CPUA 1R8LA 4WIWA 5BXPA 1CGVA 2Q8XA 3SUSA 2DH2A 3N1AA 2VCCA 3BMVA 1UOKA 1LWHA 2VQUA 4AD1A 4GI9A 3VDAA 3DYOA 1UR0A 2VO5A 1QPKA 2Z1KA 1OWQA 1CXKA 2BVDA 1GOQA 3VIJA 1B30A 1J0IA 1W9VA 2BY3A 4CD6A 4D6JA 2CNCA 1FH8A 5D9MA 5ABEA 3WNOA 4LGXA 2GDVA 4OOZA 1GJUA 3SCNA 1BHGA 4M24A 4D6CA 1RH9A 1W3LA 4W89A 1GQLA 3LPPA 2VRKA 2ZIDA 4WK9A 3AICA 3WNPA 4AYSA 1NWTA 2C0HA 1JXKA 3A6OA 4J3TA 1JYVA 4FLRA 2ZXDA 3NCOA 1I1XA 3FXYA 3HMCA 5KEZA 5A8MA 3VNZA 1LG1A 2CPUA 3SCVA 2CERA 2GDUA 4AD3A 4W87A 3PHAA 3QHNA 4JFWA 4S3JA 3VIOA 3WH8A 1E1FA 1VEPA 3O6AA 3A3HA 4LQ1A 3FAWA 3DC0A 1TFVA 3NSXA 4D1IA 4NRRA 2CEQA 1IZJA 2DH3A 4H8VA 1ZB5A 4J3WA 1E6PA 2DT1A 2X1IA 1BTCA 3UG4A 3WNLA 4CKQA 3U7BA 3S6TA 2WC7A 1DWFM 1XYFA 1NOUA 4J3XA 3VIPA 4UZSA 4CD4A 4PBGA 3KWXA 4AW7A 2CBIA 3U5UA 5EFDA 4DUXA 4E8CA 1EOMA 5ABFA 2XFYA 1ITCA 1KGWA 4DM1A 3AS3A 3ZJKA 3PN8A 3MMWA 2WPGA 1B2YA 3KL5A 5LA1A 3TONA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4AMC A;  2RGL A;  5LYR A;  4GQR A;  3RDK A;  1IZK A;  2CET A;  2WLZ A;  3AHX A;  3CMG A;  1E5J A;  2EXO A;  3A47 A;  2XSB A;  1GQJ A;  3VDH A;  2PWD A;  5D4Y A;  2O9O A;  4UR9 A;  1V02 A;  4XV0 A;  1BYB A;  4F9D A;  4W5U A;  3PZT A;  2QMK A;  5CG0 A;  2VZO A;  1R7O A;  1H2J A;  4RE2 A;  1E4N A;  1FP9 A;  1W3K A;  3PZ9 A;  2YBU A;  2ZUM A;  1DWA M;  1UKP A;  5M3W A;  2CES A;  4W93 A;  3CUF A;  2DSZ A;  4NF7 A;  2W4X A;  4YHE A;  3W4R A;  4AD2 A;  3SCU A;  4AEF A;  1GOM A;  5M5D A;  1JDD A;  1BG4 A;  4AIE A;  2UY5 A;  2EPN A;  4JL1 A;  1E0W A;  2W62 A;  2WBK A;  3WH5 A;  1VBR A;  3BSG A;  3VGH A;  1BQC A;  1UR9 A;  2HVM A;  4WJX A;  2WHK A;  3AZS A;  3RIK A;  3M6D A;  1W91 A;  1W9U A;  1JDC A;  4XUY A;  4JFT A;  3EMQ A;  3VDC A;  2W61 A;  1V3M A;  2WC3 A;  8A3H A;  5GQB A;  1V02 E;  2DT2 A;  3CMJ A;  3VMP A;  1MYR A;  1ZS2 A;  1LL7 A;  1CXI A;  4ZFM A;  3N9K A;  1TVN A;  1UWI A;  4MAZ A;  1WNO A;  5IHS A;  2DPE A;  3L4V A;  5IFP A;  3W53 A;  4D6F A;  3AOF A;  1US2 A;  1BF2 A;  1SYT A;  1IT0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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