3PZQ | Genus

Total Genus 155

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	155
sequence length	357
structure length	357
Chain Sequence	FRFIGSNNYYMHYKSNRMIDSVLESARDMGIKVLRIWGFLDGESYCRDKNTYMHPEPGVFGVPEGISNAQNGFERLDYTIAKAKELGIKLIIVLVNNWDDFGGMNQYVRWFGGTHHDDFYRDERIKEEYKKYVSFLINHVNVYTGVPYREEPTIMAWELANELRCETDKSGNTLVEWVKEMSSYIKSLDPNHLVAVGDEGFFSNYEGFKPYGGEAEWAYNGWSGVDWKKLLSIETVDFGTFHLYPSHWGVSPENYAQWGAKWIEDHIKIAKEIGKPVVLEEYGIPKSAPVNRTAIYRLWNDLVYDLGGDGAMFWMLAGIGEGSDRDERGYYPDYDGFRIVNDDSPEAELIREYAKLF

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structural characterization of a novel hyperthermostable endo-1,4-beta-D-mannanase from Thermotoga petrophila RKU-1 rcsb
molecule keywords	Mannan endo-1,4-beta-mannosidase. Glycosyl Hydrolase family
molecule tags	Hydrolase
source organism	Thermotoga petrophila rku-1
total genus	155
structure length	357
sequence length	357
ec nomenclature	ec 3.2.1.78: Mannan endo-1,4-beta-mannosidase.
pdb deposition date	2010-12-14

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	3pzqA00

3AQUA 3OZPA 3VO0A 1W3KA 1B31A 3K4AA 5KEZA 4PTXA 1R87A 1TA3A 2E40A 4HOXA 3GXIA 1ZBCA 2VL4A 1TVNA 2VJXA 1E71M 2WB5A 4IPNB 4GO9A 1LG1A 2YBTA 1KR1A 4OOZA 1KB3A 2GUYA 1XYFA 1V3KA 5DT7A 1WE5A 2BY3A 2PF0A 3AS3A 3VIFA 4HA4A 1CEOA 2GVYA 4UFKA 4WKAA 3AJ7A 5E6YA 1JDCA 4MTVA 2E4TA 5A6BD 2EPKX 4GI8A 2DSVA 3BAIA 3EMQA 5D8ZA 1LF1A 1S46A 4UZUA 2JE8A 1BHGA 1PBGA 3FAXA 1C93A 4HZ6A 4V27A 1EDGA 3GH4A 1CXIA 1E43A 3SCRA 1C3FA 4OBRA 1BQCA 5F7UA 4Q7NA 3WKZA 3BAJA 3U5YA 2CERA 2J7CA 2ZX5A 3CMGA 3WDPP 1QI2A 4PMXA 3L4UA 2ZXDA 4QLLA 4F66A 1J0HA 4MB1A 1UWIA 1CLXA 4LYQA 3EDFA 1GOMA 3ZSSA 2WZHA 2VQUA 4AZGA 3W38A 4GXPA 3J7HA 1GOKA 2IUZA 3W25A 5ABEA 3SCSA 4D72A 1OD0A 2EO7A 1FH9A 4KRTA 4W86A 4ATLA 4M24A 4CU8A 3MUY1 2EPMX 3B9DA 3T2QA 4D6CA 2BY2A 3EDKA 1YHTA 1R7AA 3CHFA 3PHAA 2XG9A 3CZEA 1QNSA 3PTQA 5M17A 2OYMA 1Q6DA 5FIPA 3AI0A 4JL2A 1HVQA 1V3JA 2BXZA 4OZOA 2XSBA 2WC3A 1UKTA 3CO4A 1MVYA 3O9NA 1OIMA 2YJQA 4B16A 2YKKA 2PI6A 2BXYA 1PZ2A 1JZ4A 2J8FA 1FP9A 2WVTA 1JL8A 3CZ8A 4FF5A 1UR2A 4LQ1A 3HMCA 3L4XA 3SEPA 2WSPA 2D0FA 1WZAA 1I75A 4JFUA 1E4LA 3BGAA 4NZCA 2WMKA 5HPCA 3WDRA 5JIPA 4ATDA 3WQ4A 5A1AA 1J9YA 3SCQA 3ZT5A 4HMCA 2WMFA 2EPNA 2CKSA 2X1IA 5CPQA 4FLSA 2JFEX 1BYAA 1KCLA 3DECA 2ZUTA 2IXUA 4WIWA 4BZYA 3PN8A 2CCRA 2XPKA 2BS9A 3NJ3A 2WANA 2EXOA 3AHZA 2PWEA 1VENA 1HF6A 1OIFA 2QV4A 5CJ5A 2QPSA 1CPUA 1EOMA 1MW0A 4OBSA 1J0YA 3WNOA 2VI0A 3AIQA 4A3HA 4B9ZA 1WZLA 2PBGA 1XSJA 2XWDA 3DYMA 3WMCA 3ZO9A 2J4GA 3TTYA 1E1FA 1OT1A 1W9XA 4PSPA 5D9PA 1NWRA 4PUDA 1QOXA 4AW7A 4DUXA 2WBKA 2MANA 2WHLA 2YDQA 1F4HA 1HJUA 1ISVA 2UWFA 3N18A 2GK1A 3CIVA 4TVDA 1UD2A 1E56A 4MNMA 1TR1A 1ITXA 3T2PA 1K9TA 2D3NA 3FXYA 4DWSA 1TZ7A 6A3HA 1CXHA 1V3LA 3IAQA 1BG9A 5BYWA 3SURA 1Q6GA 4TVUA 3FY1A 2VRKA 4PMYA 4ZE4A 2IXVA 3D3AA 1EIBA 3SCOA 3WFLA 2VR5A 2QPUA 3AZRA 2D24A 1GONA 3UG3A 1XHGA 1DTUA 5CPTA 2A3BA 4X0NA 1KXTA 1KWGA 4UOJA 3N12A 2FHCA 4ML4A 4D6HA 1FHLA 1ISXA 1PZ3A 2OWCA 3AIWA 4JL1A 3MU7A 4DWSC 4BF7A 3TONA 1UR0A 2AOSA 3ZQ9A 3SCPA 4D6JA 3WUBA 2ZUMA 3DC0A 2TAAA 5A6SA 3PTKA 3ARSA 1WPCA 1OSEA 1E4NA 1JD7A 5EFDA 2QF8A 4D71A 4W85A 1DWHM 5FL1A 1WNOA 4J3VA 3MSDA 4PYSA 1UUQA 3GXFA 2X2YA 1W9VA 2WC4A 3WUGA 1H5VA 2WVVB 5D8WA 1Q6EA 2GSJA 3BAKA 1SMDA 1U30A 4DWSD 1E9LA 3QHOA 2FGLA 4QDMA 2OWWA 1MQRA 2CEQA 2WVUA 1UR8A 3SCNA 4J3WA 3NCOA 1E3XA 4MADA 1XYZA 1IZKA 4UQBA 4MB5A 3WQVA 3VNYA 4WK9A 1VB9A 2ZXBA 3RM4A 5M03A 5BXPA 2FH6A 1GOIA 3AHYA 3KL3A 4ZENA 1VBRA 2XFFA 2ESCA 4B3LA 3B9EA 1W2PA 1E3ZA 2J79A 3A3HA 1WZKA 1C8QA 1ODUA 3GXDA 2E0PA 1VEMA 5JIWA 2CNCA 2VVNA 3AHXA 1JNEA 2VUYA 1HP4A 2FHBA 4MJ2A 3TTSA 2CYGA 3OBAA 4E4PA 5I5RA 3W24A 5A8QA 1BGGA 3GYCA 3GH7A 3CBWA 1DWIM 3AIEA 2O9TA 2ZOXA 1DHKA 1MQQA 1TVPA 4ZEPA 1UWSA 1KQZA 1JDAA 2X8RA 4XZWA 4MAVA 2DGAA 2J77A 1WKYA 3VD9A 1TA3B 1KFWA 3O6AA 1JI1A 5DO8A 1VFMA 3VINA 2XHYA 3SCVA 1UH3A 3CH9A 4W87A 3BAWA 3CUIA 4AZBA 1FH8A 1V0MA 1I1XA 3WEOA 4QAWA 1GORA 4DUVA 2DSWA 1CGXA 1UZ4A 2O92A 4D6EA 1SYTA 2VZUA 5AC4A 1CXFA 3RDKA 2ZXAA 2BHYA 3PBGA 5A6JA 3QR3A 3AICA 1BPLB 1OM0A 1MFUA 3VUPA 5IXEA 2JALA 1BFNA 4AZ5A 1UKSA 2JF7A 8CGTA 3BSGA 1QW8A 2C7FA 1Y7VA 1VJSA 3BAYA 2WKLA 3PZQA 3BCDA 1KGXA 4MJ4A 4UQDA 1HKIA 1OWQA 1J0KA 1EGZA 3FW6A 4CN1A 2CHOA 3W53A 4JHOA 4FK9A 1E0XA 2XVLA 3EBVA 5ECUA 6TAAA 4OKDA 5I3DA 2VCAA 1E6RA 1A47A 3VNZA 2O9OA 1Z32X 3SUWA 1UOKA 2YA2A 3ARUA 2JIEA 2WHJA 4GZEA 3ZT6A 4PBGA 1CENA 3UERA 4AZCA 3WDJA 5A6AA 1BVZA 3VIIA 3CTTA 5I24A 1LLOA 1N82A 1JG9A 1UQYA 1GCYA 5A2AA 3WF0A 4B15A 4CD8A 4P7RA 3W81A 3DHUA 1JZ8A 3EDEA 2F2HA 4XX6A 2XM2A 2HVMA 2W61A 3AIRA 2QHAA 4CVUA 3GBEA 3W26A 1PJ9A 3WFZA 3WD3A 1HJXA 1M01A 3WD2A 2X09A 2XUCA 1VRXA 2ZX9A 2J7BA 3L2LA 2W66A 1C8XA 2ZICA 3BH4A 4HU0A 1UR1A 4BS0A 4MB4A 3WY1A 4UFJA 3PTMA 3CHEA 5CXPA 3AMLA 4GZIA 3OGRA 3FNDA 4BQ5A 5E0CA 3WD1A 3AMDA 4HZ7A 1HKMA 3EDJA 4H8UA 1BYBA 2XWEA 5GNZA 1B1YA 1V3HA 3VDHA 1KBBA 2CHNA 5HXMA 1X6NA 3N15A 3RM9A 5E9AA 2PC8A 1J0ZA 4C7DA 1HL9A 2VNCA 3QHNA 1EHAA 1SR0A 1C91A 1FP8A 2XIBA 1BLIA 3BXWA 5ABFA 2D23A 1IZJA 4HPHA 3RILA 3KZSA 2D2OA 2YL9A 2CETA 3UR7A 3FAWA 1KGWA 2XVPA 1KQYA 1QI5A 4UFHA 2Y4SA 3GM8A 4OUEA 1EDTA 5CSUA 1BAGA 2ZIDA 1MFVA 2GDVA 3NSNA 4F79A 1VFUA 3RM8A 2J74A 1EH9A 4RE2A 2DQXA 5A94A 4GZJA 3AMCA 4Z2GA 4UOQA 4CKQA 4JKLA 3CZLA 3K46A 2X0YA 1OGGA 1W9UA 4M80A 3ARPA 3VDBA 2EPLX 4OJYA 1V03A 1NP0A 4PMQA 4EANA 4AD4A 3CGTA 2WMIA 3PZTA 4V2XA 1JZ7A 3N9KA 7TAAA 1MWOA 2VCBA 4N0RA 2NT0A 3AISA 3AOFA 3WEMA 4DWSB 4R27A 3AXIA 4M81A 5A8PA 2ZWYA 3OGVA 4JFTA 1ZS2A 4LGXA 1V08A 3AZTA 2BNJA 2D0GA 4UQAA 1NOUA 2Z1KA 4GIAA 2X0HA 4DM1A 4X0VA 3DYOA 3L4TA 2WM0A 2BY0A 2J8GA 3AS1A 4R5EA 4KGJA 4RL3A 4PCTA 4RE4A 4AY1A 1V6XA 3CUJA 4PSRA 3E1F1 2FH8A 4WSJA 1EXPA 4MPKA 2WWCA 2VOTA 3UEQA 1H0IA 3RO8A 5HDRA 2EQDA 1W9PA 4MNKA 2B31A 3AS0A 4CVWA 3RPMA 2WCGA 5CZKA 2OSXA 3GH5A 1HJWA 2Z1SA 2ZUVA 1E6PA 2WKGA 3A4AA 2YIHA 2A3CA 1W3HA 3VMPA 1JYVA 2UY2A 3MUAA 4CCCA 1PAMA 1VBUA 4UQ9A 3G6MA 3IJ7A 1CGTA 3GDBA 4P8VA 3IANA 5JBFA 4W7UA 3VVGA 3PZGA 2BV9A 1NWSA 2YL5A 3N1AA 1G9HA 1UD6A 4URIA 1H3GA 2VRJA 2VX4A 1K9DA 4NRSA 4OOUA 2DIEA 1UQZA 2DSZA 2QMJA 3FHQA 5FL0A 1V0LA 1JGIA 2VCCA 2WZEA 1NH6A 4N42A 1LG2A 1R86A 1ZJAA 3B9AA 1VJZA 1D3CA 5C8BB 3WH7A 4IPLA 4LPCA 3U7VA 1IT0A 1O6IA 4Q22A 1ISWA 1W1VA 2VX6A 3AHVA 2XGIA 3WDQA 4RE3A 4XZBA 4JHZA 4GQQA 2NW0A 3VIGA 4TTUA 5A95A 4UR9A 3AHTA 1UWUA 2EEXA 1LJYA 1PEZA 3M46A 4JKMA 4S3KA 3VIHA 3WEZA 3T0BA 5LA2A 5JBDA 1P6WA 2F8QA 4U33A 1HVXA 1V3MA 1H2JA 2VQTA 4TUFA 3D5HA 4UOZA 4V28A 4M56A 4JZ5A 5A69A 3WQ5A 4EKJA 2VZOA 4KRUA 1MXGA 2VT0A 3T09A 4ACZA 3ZOAA 4YN5A 1JYNA 3LPOA 4P8WA 4WJXA 4KGLA 4AMCA 1JZ5A 1GUVA 4W8LA 1ISYA 2FHFA 1NP2A 2GJRA 1BGAA 1US2A 3AIBA 3NIYA 1PIGA 2GJXA 3W27A 4PUEA 3DHPA 2V5DA 1WP6A 4GO8A 1W1YA 3L4WA 1ZL1A 2CBUA 5LA1A 1J10A 3POCA 1HJSA 3KEHA 1E73M 3WH8A 3T0DA 5IHRA 1J12A 1D7FA 3VGGA 3T2OA 2YL8A 2WLZA 3AZSA 2BY1A 4AYSA 2QMKA 2PWGA 4TTGA 1L8NA 2PWHA 2O9RA 2ZXQA 1QHOA 4CD5A 1GQJA 4CU6A 1XSKA 4YPJA 3BLPX 4AEFA 2W67A 3A6OA 5JUVA 1DWAM 2DT1A 4P8UA 3KL5A 2Q8XA 2D3LA 1LQ0A 1CXKA 1EO7A 1E6NA 4A3YA 1B0IA 1GOQA 1C7TA 2VURA 3OLIA 4HP5A 4AD5A 5BRQA 2C0HA 1GJUA 4WKFA 4X9YA 5FD0A 1XV8A 3FHAA 2EJ1A 2Y24A 1X6LA 4D6IA 2EPOA 1UA3A 4F9DA 2DPEA 1JZ3A 2CBJA 3ARQA 1XRVA 4CUCA 4GI6A 3ZJ8A 1J11A 4HZ8A 4FLRA 2WMJA 2BVYA 5BCAA 2WWDA 2D0HA 1UD8A 4WKHA 4F8XA 3MMUA 5TD4A 2PWDA 3WH6A 3JUGA 5AYBA 3PZOA 2A3EA 4TXEA 5DEZA 1NM9A 4LYPA 1DWGM 1QNPA 3OLGA 3CUHA 5I78A 2CPUA 1MW3A 2XSAA 5IFTA 1XC6A 3ZT7A 4M82A 3U5UA 1E4IA 4U2ZA 4IUGA 5C71A 2G4FA 5CQ1A 1LL6A 1OB0A 1BSIA 1EHNA 2V3GA 2WVSA 1TG7A 3POHA 3UESA 1OD8A 1UHVA 4MB3A 1E15A 1W9DM 1QW9A 1UKOA 4CU7A 3GXMA 1R85A 5ABFB 3OLEA 1WDPA 3WF1A 1E0WA 4DUWA 1H09A 5D9OA 3LMYA 2A3HA 4PRWA 5A6LA 3CZJA 3ZJKA 1M7XA 4W8AA 1IV8A 1XD0A 2V3DA 1LWJA 4PMNA 4Z2HA 5A8MA 1JI2A 4UFMA 4CN6A 3UCQA 1CXLA 3WMSA 4H04A 3WDHA 1G5AA 2OSYA 2XFRA 3HJEA 4GPNA 3WUFA 1WAWA 2F61A 2OLHA 1FOBA 3BAXA 5BRPA 4CN4A 2WYSA 2GJPA 2YDSA 2GFTA 1BVNP 4HA3A 5D9NA 2WAGA 3CHCA 1QVBA 4FLQA 5DF0A 5I79A 2WMIB 2ZX8A 3VIOA 3VOCA 3ZR6A 2G3MA 1E4MM 1CBGA 3M07A 3WNKA 2ZUNA 1XD1A 4HU8A 1E72M 4GI9A 1G94A 3ARVA 3I3DA 1SFSA 3SUTA 1XCWA 3OIHA 5GQBA 1E70M 4W93A 3M7SA 3WD0A 2ZX7A 5CGMA 3RMEA 5IFPA 1WZMA 1W2VA 1H41A 4C7GA 4W84A 1KXVA 1UYQA 4QCEA 5EBAA 3EMZA 1E40A 3W82A 2AMGA 4W88A 3WF3A 3S6TA 3VD5A 3W29A 1UR4A 5CPSA 5BWFA 1H0GA 3BSHA 5FKYA 2VVSA 2ZWZA 3VKKA 1HN1A 5GNXA 4IM4A 4H41A 1BYDA 4GQRA 3RIKA 1EA9C 2FDMA 5I2UA 3VM5A 1JAKA 2A3AA 1CXEA 2XVGA 2Y5EA 1RD6A 3NYDA 2CIPA 1W3LA 1C8YA 1QHPA 4PTMA 1W1PA 2YLLA 3UETA 1O7AA 1B9ZA 4KMQA 3WD4A 3W0KA 3PZ9A 2J78A 1B30A 1FFRA 7A3HA 4PTVA 5ABHA 4PN2A 1ZBKA 1JZ6A 4OIFA 3VDCA 3PZMA 3KE0A 1C90A 2XJ7A 3F4VA 1V6VA 4U3AA 3CPUA 2EBNA 4QFUA 3HU7A 3VGDA 1ECEA 4PCSA 1NQ6A 1M03A 2RGMA 1B3XA 2NSXA 2GDUA 1WDSA 2JF6A 2WCSA 5ABGA 4EAMA 1OT2A 4FLOA 1E1EA 1W32A 1HT6A 3VIPA 2Y8KA 2XFYA 4XUYA 3VGFA 1B3YA 1JD9A 4W5UA 3U57A 4A4AA 2VMFA 1CYGA 1JFXA 5I0DA 4JFWA 1V0KA 4P7LA 2W4XA 4AIUA 4QCFA 2UY4A 4JCLA 4M1RA 1J01A 2G3IA 3N13A 3WF4A 2WC7A 3S2CA 1UWQA 5CLTA 4ZXOA 5CGTA 2YLAA 3UG4A 2ZUUA 4FMVA 2QLYA 2XM1A 3G6LA 3F5JA 5LA0A 2VTFA 4HA1A 1JDDA 1GNXA 1GHSA 3QOKA 4PTWA 4XV0A 5FCZA 2D20A 3WL1A 1BYCA 1NARA 1SMAA 1UD5A 4AZ6A 3CUGA 1JFHA 3PZNA 3GNPA 1FA2A 2E8YA 2G3NA 2XIIA 3WBAA 4B3KA 3GNOA 1TE1A 1LL4A 4AISA 3GZAA 2WHMA 5I77A 4JFVA 3OG2A 4KH2A 4HMEA 2V38A 2V3FA 4ACZB 5AC5A 3SCUA 4D1JA 5JBEA 4W7WA 1DEDA 4AC1X 3VX1A 3BMVA 3CZGA 1GZJA 1ESWA 3K8LA 3WQ6A 3WQ8A 3SUVA 4ATWA 4BQ4A 1JYXA 1GOWA 1BF2A 3TA9A 5GPRA 3WNMA 5IDIA 4AD2A 3ZJ6A 4D1IA 1KR0A 2GJXB 2J7EA 1XGZA 4PMRA 2UY5A 4S3JA 1CGYA 5AY7A 3IJ8A 7CGTA 4AZIA 1XCXA 1LL7A 3WMBA 1PPIA 2UY3A 9CGTA 4P7QA 3N17A 1VAHA 2GK1B 3THCA 4ZXLA 3CZKA 4IISA 4K68A 3L4YA 1FH7A 1WB0A 3WNPA 3MKKA 4CGTA 5CLWA 1E5JA 3VMOA 1E6XM 1J0JA 3K1DA 1WO2A 1HJQA 3PZVA 2J75A 2Y2WA 4BQ2A 2ZX6A 3DYPA 4MNLA 4D6FA 1US3A 3OA5A 4AIEA 4QLJA 3N11A 4U5IA 3AMGA 5CSYA 4PMDA 2W63A 2YL6A 1J18A 2VZVA 1A3HA 2YBUA 4J3UA 1EDQA 1V3IA 1Q6FA 1Q6CA 4H8HA 8A3HA 3AMKA 3T08A 1GOOA 3AXXA 2PB1A 2W91A 1UA7A 1VFOA 4P8XA 2DH2A 4CD6A 1EQCA 3VU2A 1JXJA 1XSIA 3BC9A 1OINA 3WN6A 3APGA 3GBDA 2JEQA 4H2CA 1VIWA 2BHUA 4EK7A 3W37A 4WF7A 2DSUA 4U5KA 4AZ7A 1M53A 3A4XA 4KWUA 1GQKA 3WNNA 2OYKA 1HNYA 4UZSA 2O9PA 1QI3A 3VD3A 2YOCA 4TX6A 2X05A 3U7BA 1AVAA 2PBOA 4YHGA 1QPKA 1EQPA 1KGUA 3AXHA 3A4WA 4U2YA 5HBFA 3SUSA 1QNQA 1XH2A 1BG4A 3W4RA 5E09A 1HXJA 1NWUA 4CD4A 1E0VA 4PMVA 1MYRA 2DT2A 3VGHA 1V02E 1R7OA 1JNDA 1VF8A 1U2YA 3EYPA 1G01A 2WPGA 3O2LA 1OGSA 3GNRA 1C92A 1GPFA 1V02A 5E70A 4JCMA 3F5KA 1Q4NX 4AD3A 4JKKA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3PZQA

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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