3Q58 | Genus

Total Genus 80

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	80
sequence length	229
structure length	229
Chain Sequence	SNAMSLLARLEQSVHENGGLIVSCQPVPGSPMDKPEIVAAMAQAAASAGAVAVRIEGIENLRTVRPHLSVPIIGIIKRDLTGSPVRITPYLQDVDALAQAGADIIAFDASFRSRPVDIDSLLTRIRLHGLLAMADCSTVNEGISCHQKGIEFIGTTLSGYTGPITPVEPDLAMVTQLSHAGCRVIAEGRYNTPALAANAIEHGAWAVTVGSAITRIEHICQWFSHAVKR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Isomerase
source organism	Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhi
molecule keywords	N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase
total genus	80
structure length	229
sequence length	229
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 5.1.3.9: N-acylglucosamine-6-phosphate 2-epimerase.
pdb deposition date	2010-12-27

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF04131	NanE	Putative N-acetylmannosamine-6-phosphate epimerase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3q58A00

3UY7A 3TAOA 1A53A 1GQNA 1GG0A 2X1UA 1K8ZA 5T26A 2YGYA 2Q8ZA 4JTHA 1GVRA 4TU1A 1TPWA 1G4PA 1DBTA 1M7OA 2YR1A 3N73A 5G1YA 2C13A 4DXVA 1FDJA 3GLCA 4EF8A 3LCHA 4GRSA 1YDVA 1EP2A 5HR6A 3WJYA 3CM4A 2PC4A 4WY0F 3GAYA 3LB0A 1TPDA 3MI6A 3M5VA 1QPOA 1IXQA 4RX0A 3AO0A 3I6RA 3S42A 3N3MA 2CLKA 3W74A 2G96A 2DZXA 3W76A 4FXSA 3LCWA 1VHNA 5C55A 5HWMA 5K9DA 1FQ0A 3W7OA 4AVFA 3DKLA 3NG3A 3S1XA 2WQPA 3T7VA 5LNUA 4H3DA 4Y8FA 2H90A 3F03K 5CZ0A 3P67A 3SGZA 1VCVA 3NQVA 1F73A 3EWWA 3DBPA 3TXVA 5DELA 1OHLA 1DJQA 3PG9A 3CWNA 4UMCA 3NQ6A 2E5DA 4BI7A 5LZLA 1P0NA 3TQVA 4JEQA 5KITA 3LCGA 2QCLA 1TPC1 3O6YX 4O15A 4EIVA 1WAUA 1OX4A 2H8ZA 3WK1A 2G97A 2QJGA 3L5AA 3KRSA 1VLWA 4EF9A 4TMCA 1WYIA 5AYXA 3FKRA 5GVJA 1KFKA 1QDSA 4NZJA 3WJWA 1Z44A 1PL9A 3UWUA 3HG5A 5I3KA 1S3HA 3GIYA 1GT8A 1YTEA 1PV8A 4LVBA 4Y90A 1THFD 4AF0A 1TTIA 1JUBA 5BMXA 4ICNA 1ZENA 4LW7A 5FF4A 5EMUA 3RLVA 2OZ0A 1JCJA 4S2BA 3SY5A 2AQWA 4MLJA 5LGXA 4JR5A 2ZZ4A 4NX5A 3NPWA 4IPJA 2BTMA 2ZCGA 1VYRA 4LC8A 1BWLA 4N6EA 2A85A 2BZNA 4LTSA 3C3NA 4AHOA 1LBFA 2V0TA 2H8XA 3B05A 3PF3A 3VCRA 1U83A 3TMQA 5K3VA 5DCDA 5AHMA 1XBVA 4NJGA 1HL2A 1T8XA 3IRDA 1TRIA 4O28A 3KXQA 1FWTA 4N9EA 4UTIA 4L4MA 1TPEA 1OJXA 2H3BA 1KM2A 2NX9A 2CZDA 2A2IA 4NVTA 4GUIA 3TK7A 3W7NA 3QMTA 1KM3A 4R53A 5DY2A 5CPMA 3NQEA 1RQEA 4IMGA 1ALDA 3QMSA 1NSJA 3QPYA 4N6FA 3TAKA 4JTJA 3O8AA 1ICPA 1Q6OA 4YCPA 1QNVA 2WSYA 4JTIA 4JTGA 4NT0A 1TCDA 1EIXA 3PS7A 4N4PA 1CI1A 1H7WA 3NGJA 3P7YA 1A5BA 4FX6M 3HPSA 1LTDA 1OK6A 3LXAA 1IGSA 4NXKA 2DJLA 5K2ZA 3HG2A 3EWZA 4RZ6A 5HJLA 1CX9A 1SSDA 1YYAA 3G1DA 1QWGA 4PCFA 4PL2A 4OWGA 3HG3A 3C8FA 4GBUA 2ISVA 4UFLA 3S1WA 1H1YA 2OJPA 1L2UA 3PY2A 4DELA 2CZFA 1IXOA 1SO6A 1LM1A 1XUUA 3Q37A 1W5OA 5J5RA 1TPH1 2CU0A 1W5QA 3PAJA 1F74A 3M7WA 1J5TA 3KAOA 1EWEA 3PBVA 4LS1A 4NUWA 2GPTA 1L6WA 2J27A 2ZRXA 2PE4A 3IVSA 1YDOA 4UTTC 4Z0SA 5J5DA 1JCYA 3LXCA 1NEYA 4L4LA 3MBFA 5E0KA 3W2MA 1XL9A 1RZMA 1LDCA 3TE9A 2P10A 3STGA 1H62A 4PFMA 4KKXA 4DPPA 1G69A 1LZOA 2TYSA 4NX0A 1QMLA 3L5MA 3G0XA 2FJKA 2DU2A 2E09A 3ABQA 4RZ4A 3W22A 3NPVA 5CGQA 4M6PA 4E2BA 4FXRA 3LI0A 3Q94A 3PSWA 1OYBA 2YW4A 2QJIA 4FNRA 3LGEA 1Z41A 5AHLA 1ICQA 1JRCA 1YTKA 1G4TA 1LOLA 5HULA 4ALDA 3GNNA 2YYTA 3G1AA 5IBXA 2JK2A 5AHNA 3CIWA 4U4MA 1SZNA 2Y7GA 2VFIA 3PUOA 1W8SA 1QR7A 5FF7A 3JRKA 1M6JA 5G2IA 2NZLA 2Y61A 1LCOA 3W7JA 3L2IA 2CLHA 4M19A 1TMHA 1H61A 2X1SA 1G4SA 4NJIA 4JICA 2QCGA 3FFSA 1EB3A 4ADSA 1F6KA 4XKYB 5D09A 3BV4A 2XN2A 3G8EA 1X1OA 4GUJA 1D3GA 3PULA 1TTPA 5G5IA 1IF2A 4ZZ9A 4HNTA 3SECA 3ZWSA 2YW3A 2E68A 5K9CA 1TREA 3IIXA 3WK2A 2EAWA 2X1RA 4FX8A 1BKSA 2G5WA 1SO4A 4O1CA 2PRMA 3JR2A 2ZFAA 3M0ZA 1QO5A 4KFPA 1WBHA 4EVZA 2J6XA 3GAKA 3QQ1A 1XM3A 3G3DA 3C2FA 3QPZA 4AB4A 3DFSA 4YXGA 3LHYA 5I3JA 1ICSA 3DGRA 2GUUA 3NNTA 4LVGA 3NQ8A 3SIZA 5DXXA 4O14A 4Q33A 3OHIA 1FCUA 2E6AA 3CT7A 3EXRA 3QC3A 3ZWTA 4OBTA 5FF0A 5K4ZA 1P5BA 4YWIA 3W2KA 3TA6A 1TV7A 3MP4A 2ISSA 2CLIA 5D30A 4O0KA 3CTLA 2J9XA 1ZAHA 3A22A 2P1FA 1EA0A 4LNYA 4JGDA 3N14A 4WOZA 1SQ7A 4OQVA 4XTDA 3W1XA 3HG4A 1RQHA 3KFTA 4P2VA 5F1UA 1LROA 1KW1A 3O16A 2IQTA 4GFSA 2QCDA 4O16A 3MP3A 1W1ZA 2WSQA 3GDMA 3W84A 3MP5A 1TYGA 3NR0A 1UCWA 4NJHA 3WJSA 2FIQA 1BEUA 3W7RA 1KFJA 3I7QA 5FEZA 4UMAA 1ZCOA 3H53A 2TMDA 3IGUA 5DXYA 3QW3A 4Q4KA 5SWUA 2ZZ7A 1XBXA 1KM6A 3PBUA 4NNAA 1AL8A 1TIMA 2WNZA 1PE1A 5G4EA 1DQXA 4XBKA 1DORA 2BXVA 4JDBA 1PHWA 2YZRA 3S9YA 2CLFA 4K7YA 4Z08A 1PCWA 1TJPA 3FKKA 1AW2A 5TIMA 1KBIA 1N7KA 2CLEA 2C19A 2A6NA 3UWWA 1YDNA 4UTHA 2QCMA 1KLYA 4MKNA 4WZHA 2VEPA 4HNNA 3P8IA 3TR2A 2Z1BA 4O10A 4RKAA 5AHFA 1GVSA 1SZGA 2C6QA 1XBYA 4WD0A 4O4WA 3LI1A 1RV8A 3TH6A 2DZTA 2DZVA 1TB3A 3QRHA 2VFDA 3DZ1A 1AK5A 3IVTA 3CLMA 3TQ0A 5F4XA 2OX1A 3T44A 1TO3A 2RH9A 4NXSA 3DFOA 5EKYA 4JTTA 2C1HA 3L67A 1F2JA 3S5YA 2NUXA 5D2VA 3O1NA 3QF0A 3C2RA 3BGGA 4HPJA 2AAMA 1B3OA 3TC7A 1PIIA 2ISWA 1F5ZA 4ORMA 3H54A 2E5CA 4POCA 1K8XA 3TNOA 2ZZ1A 1DV7A 3P81A 4ONVA 1UUOA 1XKYA 6ALDA 4LT9A 4ML9A 4MVAA 1R47A 3S5NA 4MFEA 3ABOA 3CIXA 4GUFA 2Q3OA 4AWUA 2V9DA 1A5CA 2VENA 3P82A 2C0AA 3ABRA 5IBXC 4IMEA 1XDLA 3W7DA 2VOMA 1WXJA 2ZTJA 4RZ5A 5U4NA 2BSLA 5DLCA 1C29A 4PC8A 3RMJA 4UTWC 3LTSA 4M7TA 4UR8A 1L6YA 3O06A 1I2OA 1L6SA 3G1YA 5DBUA 3QH2A 1AL7A 3W07A 4A3UA 5LGZA 5ABTA 3F4NA 3KRUA 2VKZG 1RD5A 3EWUA 3B8DA 5CPNA 3BW3A 4C1LA 3NAVA 3F1QA 4CLMA 1ADOA 1W54A 3TXZA 2I14A 3TJLA 2B4GA 1H7OA 1UASA 4IMDA 2FB3A 5DBTA 3KVJA 5H2ZA 4ADUA 1OVDA 3PVFA 1SR9A 2CLLA 3FJLA 5BOOA 2QUVA 2QF7A 2R8WA 3HPXA 1I2RA 4NZFA 3MHGA 2D73A 3W7QA 2B7QA 4RXFA 4JYFA 3UY8A 1HTIA 1P4CA 2A4AA 4UMBA 3N9SA 1KFLA 1X8FA 1O5XA 3THQA 4UTTA 3NXFA 1OK4A 1O94A 4DEFA 5AFDA 3OEXA 1H1ZA 2NV2A 1OX5A 4X9SA 4G1KA 3GXTA 3M9YA 4JS3A 4HN4A 4E38A 3W3OA 3W1QA 3C56A 4GC4A 3M41A 3BGJA 5FESA 4ZQPA 4K6AA 2OMAA 5LSMA 3SSJA 3T78A 2FPVA 4CQ8A 1FWWA 1ZALA 3V1PA 2C18A 5K9XA 2V81A 1UJPA 3EWBX 3VE9A 1Z48A 1R2TA 2CLMA 4BI5A 1H63A 1I2NA 4UNKA 4UIOA 2J9ZA 3KVMA 1C9DA 2Q8LA 2NUWA 4MUZA 3C52A 3LDVA 1F05A 5C54A 1EPXA 5CSRA 3P8JA 3BLFA 3NQ7A 3BLEA 4ZVJA 4LVAA 3EXTA 1CW2A 4GUGA 4UFJA 1NFBA 1OX4B 3NO5A 3I68A 3R2GA 1FX6A 1LOQA 4JYDA 3GDTA 5EYWA 1I4NA 2ZRYA 3QYQA 3THAA 3UWZA 3WJXA 4N2YA 3B0VC 4WUIA 2OCZA 1QPQA 1I2PA 3VFLA 4HHPA 3FEMA 4IXXA 3P60A 3F4WA 4JTSA 1LOSA 1FDYA 4R7JA 2ZZ5A 3TDFA 3NQAA 4AF0B 3NQGA 4KFOA 1GVOA 2ATSA 4QITA 3BG5A 4QQ3A 7TIMA 3S5OA 3HPZA 1SW3A 1U5JA 2CW6A 2O7SA 4WX2A 2JKEA 2Y62A 5U7SA 5FEPA 4K39A 2V8ZA 4B5NA 3W87A 3R8RA 2ZRZA 4JTUA 4MY9A 3RLUA 3TV8A 4EWND 2FPTA 4CQAA 1W37A 3GB6A 1LBLA 1W3NA 2C14A 3EWYA 3VKJA 1OFOA 1O4UA 1LRTA 2O7QA 1AG1O 5HWJA 4GJ1A 5LHFA 3P84A 1DL3A 2F84A 1F6PA 3W72A 4XWUA 3W1UA 1MEIA 4O54A 5D05A 3C2EA 3UWYA 4O0ZA 1KM0A 1X7FA 3MJYA 2E6DA 4K7VA 3G1VA 2QAFA 2J88A 4OT7A 3PM6A 4UFHA 1MEWA 5BNKA 4OV4A 4UFIA 5CZSA 1DVJA 2X1TA 3L5LA 2GVGA 3ATZA 5I3IA 2HTMA 1VYPX 3M43A 5LHEA 4K38A 2RDTA 3TFXA 1NVMA 1LRQA 1UB3A 2A21A 4X3ZA 4JIQA 4Y96A 2QAPA 2V30A 2DJXA 4XZ9A 2DZPA 3LX9A 1VHCA 1SU5A 3W1PA 5KZMA 4M6QA 4UTLA 5E1QA 5A5WA 3Q2DA 4JTFA 5D02A 4PH6A 2V5BA 1YXCA 4Z1AA 3TSDA 5EA9A 3PR2A 1R46A 3TUUA 1XC4A 4H6KA 3LRMA 2RKXA 3IIPA 1KTBA 1IXNA 3BW4A 3HOJA 2ATMA 3GR7A 4QM1A 1G67A 4ZQNA 4M6VA 4D2JA 2Z2UA 1JCXA 1XBZA 3UYCA 3PSVA 2QEZA 3LCXA 1W5MA 1ME8A 3B03A 2RHGA 4R33A 5LNWA 4O50A 1VS1A 3L0NA 3JS3A 1HO4A 4AH7A 2C15A 5G4WA 4MJZA 1PVNA 2QCNA 5G1TA 2LLEA 1JULA 5D33A 5MHBA 2XN0A 4CCCA 3HBLA 1H7NA 4M7SA 3SR7A 3MYPA 5HR7A 4O13A 2GQAA 3FOKA 1WQ5A 3HO8A 1OFPA 2X16A 1I8JA 1GTHA 2E77A 2WPBA 4LRTA 2ZTKA 1J4EA 3TIMA 4OU1A 4O53A 2XN1A 2R91A 1OYCA 3L65A 3W7MA 1SZFA 3FYOA 5BMWA 3EWXA 4O8RA 2TSYA 3LHZA 3W2JA 4KWWA 5KINA 3SW6A 3LLDA 3W6YA 5AYYA 1RVGA 4MJMA 2WNQA 3GNDA 4Z1BA 1VCGA 1FCBA 3A5VA 3RK8A 4FIQA 1SW0A 5FI8A 1RPXA 1SUXA 3W83A 5AHIA 3SFKA 3UNDA 4UTWA 3CWOX 4LOCA 4O19A 5L6UA 5CG7A 3RFAA 3LRKA 3S5ZA 1SZEA 4NNBA 4DF0A 4XUGA 4U28A 2X30A 1TPVA 1DQWA 2Y7FA 1VLIA 3OBKA 3R13A 3LOTA 5CKSA 2NX1A 4CCEA 1LP6A 3A5FA 3O07A 3NL2A 2NXGA 3MI2A 4QJ1A 2X2GA 3PB0A 3UZJA 1JUEA 3HGOA 3LCIA 3H55A 3UD6A 1W3TA 4WY0A 5CZTA 3M16A 1ZAJA 5HINA 3DI1A 3G18A 4DF1A 2QDHA 4HKPA 1FY6A 2ALDA 1R30A 4ZMGA 3M5XA 3HJZA 2EGZA 3M47A 3NZRA 3NZ1A 5HNRA 4O12A 3NL3A 3DHDA 3R12A 1FCQA 1KFCA 1TTQA 3MUXA 2VFGA 4X2RA 1VPXA 1W56A 2ZBTA 1MXSA 4ZL1A 3W1MA 1GWJA 3ANYA 1ME9A 3T40A 3UXAA 3W7EA 1KM4A 2UV8G 3DFTA 3MHFA 2DZSA 4GE8A 5H91A 4CNPA 2C16A 3DFNA 3HF3A 4S1FA 3G1SA 2QCDB 8TIMA 2ZDRA 3UQNA 3VE7A 4PL1A 1Q6QA 4RXGA 1IIHA 1QPNA 2VELA 1NAL1 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3Q58A

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