3Q58 | Genus

Total Genus 80

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	80
sequence length	229
structure length	229
Chain Sequence	SNAMSLLARLEQSVHENGGLIVSCQPVPGSPMDKPEIVAAMAQAAASAGAVAVRIEGIENLRTVRPHLSVPIIGIIKRDLTGSPVRITPYLQDVDALAQAGADIIAFDASFRSRPVDIDSLLTRIRLHGLLAMADCSTVNEGISCHQKGIEFIGTTLSGYTGPITPVEPDLAMVTQLSHAGCRVIAEGRYNTPALAANAIEHGAWAVTVGSAITRIEHICQWFSHAVKR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule keywords	N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase
molecule tags	Isomerase
source organism	Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhi
total genus	80
structure length	229
sequence length	229
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 5.1.3.9: N-acylglucosamine-6-phosphate 2-epimerase.
pdb deposition date	2010-12-27

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF04131	NanE	Putative N-acetylmannosamine-6-phosphate epimerase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3q58A00

4Z1DA 2WOQA 2C19A 1AK5A 1F76A 3NM3A 1XL9A 5CPNA 4DO6A 1VRDA 3A22A 4TMCA 3UWVA 1RQBA 4O0KA 1SFJA 3M44A 3LLDA 1BTMA 3G1VA 4QIUA 3P61A 1C9DA 3C6CA 2QEZA 1KBJA 4IX2A 1LROA 1OK6A 3AJXA 4DF0A 2YR1A 2QAFA 4R53A 3QH2A 5FF0A 3T55A 4O28A 1EUNA 1O4UA 3IVSA 4N4QA 5G5IA 5LGZA 3EX2A 1LRQA 3I7QA 2PURA 3STFA 3W85A 1FCQA 1KM6A 1IIHA 3NPVA 2OT1A 1GYNA 1WOAA 3MI2A 3MYPA 2J27A 3L0KA 2QCGA 3DAQA 3O07A 3THAA 4QJ1A 3TXZA 2WSRA 1B4EA 1G67A 3FS2A 4UR8A 1OK4A 4N6EA 1SQ7A 1I2NA 4LV9A 3L0GA 1UUMA 3P67A 4A21A 5D37A 3NA8A 3R13A 3LGEA 1QOPA 1Z48A 4YWIA 1H5YA 1TPVA 1N8FA 2CLKA 2E6YA 3VFLA 1H63A 4HPXA 3CC1A 1EX5A 3GDMA 3HOJA 5F2MA 2GVLA 4GWEA 3PUDA 1WV2A 3QYQA 4MFDA 2C0AA 4FX7A 1FDJA 1GJPA 3LCXA 5FF4A 3I65A 5G2HA 5MHBA 1K02A 1ZAHA 3DI0A 3DFNA 4LU0A 1GVOA 3GYEA 3W7KA 2QCNA 2FB3A 5AYXA 2WSYA 3MW7A 2X1SA 2TRSA 4O4WA 1I8JA 4QAIA 4M6QA 3RLVA 3S1UA 1DKWA 1I2OA 3HG3A 1TQXA 1D3GA 2LLEA 4AVFA 1P1XA 1LOQA 2QF7A 4MOZA 1VCGA 3C8FA 3F03K 3NQAA 3TSBA 4R33A 2Y7GA 2D73A 2PCQA 1FCVA 2ALDA 1QO5A 2X1RA 5E93A 1QWGA 3LCLA 2JK2A 4O19A 2QJIA 3GDRA 3QSRA 3EWBX 3W1NA 1G69A 1JQVA 2C6QA 3EX3A 4PH6A 3OBKA 1OFDA 4N9EA 3LTPA 3TCEA 4GC4A 3HB9A 2J9ZA 2P0OA 3TAKA 1H50A 4JYDA 2Z6IA 3S9YA 4ZL1A 1KLZA 3LLFA 4U4MA 5G2WA 3P5ZA 4OBTA 3UWYA 3PUEA 4GUFA 3W1UA 3WJZA 4O4VA 1B9BA 4UMBA 2VC6A 3KX6A 2I1OA 3ABSA 1OVDA 2W79A 2Y88A 2C13A 4WOZA 2VKZG 4PCFA 3S5NA 1B3OA 5A5WA 1LDCA 2DORA 4UTIA 3VE7A 1VS1A 1ADOA 1WQ5A 2CW6A 1BWLA 1THFD 4K7VA 1J5TA 2GJNA 2PRHA 4JN6A 5H2ZA 2Y63A 5LNVA 2EPHA 3MP4A 3O6DA 3R2GA 3PUOA 1TPH1 2X30A 4WZHA 4O12A 1XBZA 4JIQA 1VQTA 4N9BA 2WPBA 2Y62A 2WO5A 4BR1A 4WY0F 1R46A 4LS1A 3HG2A 3PR2A 5D2VA 2FPYA 2NX9A 4N4PA 2TYSA 3W7EA 5LSMA 3KVMA 4UTWA 4RK8A 5BOOA 2Z1BA 2NWSA 2CZFA 1JCLA 4O53A 1YYAA 1LP6A 1VCFA 1ZENA 4RX0A 4YCOA 3KVKA 4H3DA 4JDBA 3CU2A 3L5LA 4LRSA 1XBVA 2CLMA 1SFLA 1NF0A 4MY8A 1ZJIA 3KRZA 3BGGA 3S5OA 4IWWA 1JUEA 5C2XA 4CNOA 4OHQA 5CSSA 3WK2A 3S0CA 4BI5A 4DF1A 4ADUA 1TV5A 2O7QA 1CW2A 2Z2UA 2AAMA 1MXSA 2FPVA 4LVDA 1EWEA 1FY6A 1FWWA 1TTJA 4LC8A 3Q37A 4GUIA 2E09A 2F84A 4LWWA 3H53A 1BWKA 5AB3A 3MP3A 4O50A 3B06A 4UTKA 4NUWA 4O54A 3C2EA 1J4EA 3QM3A 2W0UA 2YSWA 1F5ZA 1IIGA 2P1FA 3GAKA 3TIMA 3OEXA 3CQ0A 1A50A 1LOLA 2VXNA 3NG3A 4GUGA 2XN0A 4UTMA 3LXAA 5LNSA 2OCZA 1H7PA 4Q4KA 3E9AA 3BW4A 4Q32A 4GE8A 3M43A 4X2RA 1KFJA 2R94A 3OVQA 3W7PA 4ZQRA 3W7GA 3UXDA 3TR2A 1JULA 1XBYA 3A9IA 4AHPA 4FF7A 3S5YA 3ABRA 5G4EA 1RZMA 2PC4A 1N7KA 1QOQA 3OVRA 3P81A 4WXYA 2CLLA 2YZRA 1EIXA 1F6KA 2ISWA 2Y61A 2EGZA 3QEZA 1LBFA 2NV2A 3CPRA 4GFSA 2DZVA 1Q3NA 2ATMA 3AO0A 4WXZA 3UZ5A 3E0IA 3UYCA 4Y9AA 1ZAJA 1I45A 3WK0A 4O11A 2NZLA 4O8RA 4AB4A 1JCNA 4NNAA 4NZFA 4K8EA 3W2KA 3LERA 2C16A 5AYZA 4Z08A 3NQFA 3DHFA 4JY9A 4YL2A 2UV8G 5CKSA 4I7WA 1LBLA 3DU0A 1ZNNA 5G4WA 5D32A 3W1AA 4UFJA 1A5SA 3NQMA 2ZZ7A 3NL3A 3NGJA 3G3DA 5FI8A 4UTLA 3TQVA 4LNYA 4KWWA 1KM5A 1HO4A 4BFAA 1O5XA 2YXGA 4ML9A 3W75A 4Y6GA 3FKKA 1OX6A 4ADSA 1TPUA 3L66A 5HWNA 1F6PA 4CQAA 3EEGA 5K7JA 1KM1A 4IJBA 3SGUA 1TJRA 3L5AA 4UFKA 2YW4A 3E02A 3G1SA 1EPXA 3TSMA 5I3FA 2CLFA 2IQTA 4O0ZA 2QUVA 5LZLA 3NQ8A 2YYUA 3NQ6A 2WQPA 3RU6A 1XUZA 3T40A 1DORA 1Y0EA 1G4SA 3LX9A 5FEWA 5C6MA 2ZRWA 2OJPA 5C55A 1EP3A 2VEKA 4TIMA 1RQHA 3P62A 3SSJA 1SPQA 4NXKA 3HPSA 1VR6A 1A53A 1GG1A 3TW7A 1SZNA 3TU9A 2QUUA 2C3ZA 4LOCA 3LHVA 2J6XA 5DELA 3LHWA 1JVNA 2DZPA 1VZWA 1S5VA 4PTNA 4UFIA 5K2ZA 7TIMA 4GUJA 1QDSA 3PBVA 4MIMA 1JCJA 2GUUA 1G7VA 3N9SA 3TK7A 4AWUA 2CFFA 1IXOA 2NXGA 5CZTA 4HPJA 1LCOA 3KOFA 1W56A 3A5FA 2QCFA 2B7NA 3IEBA 1P0KA 3KXQA 1UUOA 4XQ6A 2WSQA 3W72A 3FYOA 3EWXA 3OA3A 3TW6A 4HSOA 5F1VA 4BI7A 1QPQA 3W83A 1U5JA 3O63A 1ZY9A 1DJNA 4RLIA 3W76A 1R2RA 2H3DA 2CLOA 3B05A 4IMDA 4UXDA 2A7NA 1KA9F 5I3GA 4JICA 1OHLA 3QZEA 2BSLA 1HO1A 3GDLA 4UR7A 1SSGA 2VEMA 3TQKA 3TUUA 3KFTA 2XN2A 2Z6JA 3LBCA 3BW3A 4FIQA 1FCUA 3G8EA 1A5BA 3OHIA 5AHFA 2YDAA 5EBUA 1XCFA 1SZGA 1L6WA 5DY3A 3BG5A 4ICNA 4AXKA 2V2HA 3FFSA 5LNWA 1W31A 1VJIA 3W2JA 4M5PA 1TPDA 5CPLA 4TO8A 4FNSA 1S5WA 1A5AA 5AFDA 3NDOA 2H8ZA 1TTQA 2DP3A 3RMJA 3O15A 1AL8A 5AC8A 3CB8A 3ABQA 1EA0A 4YXGA 1LBMA 2E6DA 2VFFA 1OFAA 1ZFJA 5DXXA 2V2CA 3A5VA 1LTDA 4IPJA 2RDWA 3QPYA 3QC3A 1WBHA 3EX1A 3TROA 3PSWA 2V5BA 4A29A 2AGKA 3SR7A 4C1LA 1QNVA 1RPXA 3LCFA 2BWGA 3WJYA 3DFPA 3HG5A 5F2GA 4B5NA 3RK8A 5HR6A 3NQEA 1KTCA 1M5WA 4JY8A 3DXIA 3G1AA 3ZFHA 3FA5A 5ABTA 1M7OA 2QJGA 3MI6A 1JCXA 2NX1A 1TTIA 1WXJA 2VFIA 4JS3A 2QCMA 1DV7A 2ZZ6A 3PG8A 5KINA 5F4WA 3S6DA 4LUIA 4M6PA 4TU1A 4K8HA 2ZZ1A 4FB7A 2ZA2A 1EP1A 3W3OA 1W5OA 1F7BA 1FWRA 2FFCA 1BKSA 2QUTA 2RKXA 3BW2A 4Y96A 1K03A 5CPOA 3DFOA 3T4CA 1FXPA 2Y7DA 3L67A 2H3BA 4K36A 1SO5A 1EUAA 4PL2A 1JCYA 4QSHA 1GVSA 3W1PA 1YTDA 1GVFA 3RNDA 5FEZA 2HS6A 2GQ8A 2GQ9A 3PVFA 2PRMA 1P0NA 4DO5A 5HULA 1EWDA 4AMAA 3UD6A 4IPIA 3WK3A 1L2UA 4WY0A 3W1MA 3CEPA 3NPUA 3VCRA 2ZQ0A 3UQNA 4JR5A 1O95A 2QCLA 2E6FA 1NFBA 4XBKA 1H62A 3SZ8A 2ZZ2A 1K8ZA 3M5XA 5IBXA 5AHIA 1VCVA 1A5CA 1RQEA 2KZHA 4UFHA 5IBXC 3OG3A 1FDYA 5K9XA 3TX9A 3O6YX 3BK0A 2WNZA 3TJXA 2E1DA 2G97A 5D33A 5EMUA 1H61A 3NPXA 4O57A 1Z44A 2ZRYA 5BNKA 5D30A 3TKFA 2Y70A 3GDTA 4A22A 5L9FA 1AW1A 1AW5A 2GOUA 3P84A 3FEMA 1OFPA 4ZQNA 4L4LA 3HF3A 4UNKA 4UMCA 1FWTA 4AHQA 2OT0A 3ZWTA 3BLEA 1SO3A 3EWUA 2VFDA 3MWAA 4JXCA 1W37A 4PODA 4Z1BA 4N02A 1LRTA 2ATSA 3B0UX 4DELA 1W54A 1GG0A 5AOUA 4IOTA 4NJIA 3O6CA 2A5HA 5DCBA 3VE9A 1W1ZA 1FDZA 5T26A 2VFGA 4EVZA 1JUKA 5HWJA 2Y89A 1PL9A 3I68A 3BLFA 4CCCA 4MKNA 4YLWA 2C14A 2G95A 1JRBA 3RF9A 3HPZA 3DBPA 4UIOA 2NLIA 4FHAA 1Q6OA 4KFNA 4KFOA 3EXRA 1KM0A 4ZQCA 3W1RA 4K37A 1Q6RA 1PVNA 3LI1A 4OV9A 3G1XA 5EY5A 1OX4A 5H91A 3PAJA 2X16A 3W2UA 3WK1A 1AG1O 4DF2A 5HNRA 3B4UA 1JRCA 2O7SA 4K7YA 5C54A 2WJZA 3LV6A 3MI3A 4CNPA 5DY2A 4OQVA 1K8YA 3FYPA 1HG3A 1AMKA 3CM4A 5CG7A 1GZGA 4UC5A 1W5MA 1T0OA 3RLUA 5K9CA 1S3HA 2FQIA 4I7VA 5L6UA 2QAPA 3PF3A 3S5ZA 5AN7A 4H6KA 3H54A 3YPIA 4QNEA 1OF8A 3DKLA 2FIQA 5D03A 1TJPA 4IXXA 4MY9A 3WFAA 1F73A 1QCWA 1B57A 2W6RA 3N2MA 3LRLA 4D2JA 4WOQA 5I3JA 3C56A 3LHUA 4DBDA 2QR6A 1WAUA 4P2VA 4WY0B 4MLJA 1TRIA 4L4MA 2JKPA 2EAWA 3TAOA 1I2QA 2NXHA 3G1FA 1QPRA 1SW7A 3N3MA 3ANYA 4MY1A 2VFEA 1WX0A 1FWSA 1W3IA 2QCHA 5KITA 1SUXA 3JS3A 3TA6A 1FCBA 2EKCA 4ORIA 1ZCOA 3GKAA 1TV8A 4WUIA 5DBTA 3NPWA 3U8GA 4UTWC 4BWLA 1MEHA 5FEXA 3IGSA 3TFXA 1KV8A 2NXIA 3HG4A 3O1NA 4BWLC 4CQ9A 4RZ6A 2Y85A 4MZ8A 4G1KA 3HO8A 2I14A 2GQAA 4DPQA 1CI1A 5AYYA 4OE7A 3IVTA 4LVBA 1GTEA 3NL6A 3L21A 8TIMA 4JTLA 2JGYA 1DQXA 5EPDA 1F05A 2A6LA 1LLWA 4FNQA 2C18A 2E5BA 3W88A 3GR7A 2JBMA 1YXDA 2V81A 3G0XA 3L9CA 3HQ1A 1DJQA 2CU0A 3G1DA 5K9DA 3G1HA 4Q33A 1FQ0A 3W7DA 4E0CA 1QFEA 3UPWA 3TMLA 2Y7EA 2J24A 2RDUA 3ATYA 1FXQA 4R7JA 3UWWA 3UWQA 1JJKA 3N2XA 4MJMA 4KWVA 4RZ5A 5FF7A 3BARA 3LI0A 1OX4B 4HNVA 5D2YA 3DKJA 4JYFA 4XUGA 5D05A 1VLIA 1CX9A 1F74A 1GQNA 1I2PA 3WJSA 2CLHA 4M7SA 4X22A 3NZRA 3M5ZA 4X3ZA 2QCEA 1X1ZA 3IV3A 3M16A 1U83A 3STGA 2ZFAA 4GBUA 3UNDA 5HUPA 1ZHAA 4R34A 1GPWA 2ZA1A 3BG9A 4XZ9A 4Z1CA 3DFQA 1EEPA 5KZMA 4H4IA 3U2OA 3QJAA 1KV5A 4POCA 1OABA 1GVQA 1GT8A 5D02A 3BVJA 4RXGA 3B0PA 3W6YA 5AC7A 3O06A 1FUYA 3C2OA 1JUBA 3R8RA 3LXBA 4AF0A 2E5DA 2G96A 5HWMA 1SR9A 2HSAA 3PB0A 1PCKA 2ZTJA 2ZZ4A 2QDGA 2PRLA 2YW3A 3TV8A 5D04C 3W7MA 4JTKA 4M19A 3W74A 1TTPA 2GJLA 3WJWA 4JTJA 3W7OA 1JCMP 1LM1A 2E5CA 3UXAA 3DH7A 1KTNA 1JQXA 1TCDA 2X1TA 3GVGA 3W73A 3C2RA 1NSJA 4UTTA 5HINA 1YDVA 3SIZA 4CCDA 1SW3A 2HTMA 4OWGA 4XBSA 5CPMA 3UWUA 5D2TA 5FESA 1ALDA 5KTLA 1Z41A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3Q58A

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