3Q94A

The crystal structure of fructose 1,6-bisphosphate aldolase from bacillus anthracis str. 'ames ancestor'
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
285
structure length
285
Chain Sequence
MPLVSMKEMLNKALEGKYAVGQFNMNNLEWTQAILAAAEEEKSPVILGVSEGAARHMTGFKTVVAMVKALIEEMNITVPVAIHLDHGSSFEKCKEAIDAGFTSVMIDASHHPFEENVETTKKVVEYAHARNVSVEAELGTVGGQEDDVIAEGVIYADPAECKHLVEATGIDCLAPALGSVHGPYKGEPNLGFAEMEQVRDFTGVPLVLHGGTGIPTADIEKAISLGTSKINVNTENQIEFTKAVREVLNKDQEVYDPRKFIGPGRDAIKATVIGKIREFGSNGKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Bacillus anthracis
publication title The crystal structure of fructose 1,6-bisphosphate aldolase from Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'.
rcsb
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase, class II
total genus 100
structure length 285
sequence length 285
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2011-01-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01116 F_bP_aldolase Fructose-bisphosphate aldolase class-II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3q94A00
2QAFA 4PL2A 1WXJA 1JCMP 4PC8A 1HFBA 5D04C 3M41A 2YSWA 1XBVA 3M5YA 3RLVA 5DELA 5E93A 4H6KA 2Y88A 3LTSA 4NJKA 1H61A 1RZMA 1P5BA 3MHGA 3C2EA 1YADA 4IXXA 4J9JA 2V2DA 1HUVA 3ZWTA 3GK0A 3LBCA 3LCWA 3IIPA 3NYZA 4ORIA 3LRKA 3KFTA 3PF3A 1OYAA 3B8DA 3U2OA 3WJZA 3W6YA 3NOEA 3NM3A 2H6RA 4FNRA 4UTUA 1SZFA 2GOUA 5CPMA 5EL1A 2A6LA 4UFLA 4BI6A 2PRLA 2GQ8A 2HS6A 5T26A 2HS8A 1OFAA 3G1YA 1KM4A 4YMZA 4DF2A 4DO4A 5DXYA 5LGZA 3NM1A 2XN1A 1FY6A 3KOFA 2NUWA 4WQ6A 4BWLA 1KBJA 2ZRYA 4K7VA 2A85A 3LRLA 4AVFA 4LOCA 3R2GA 5D05A 3KAOA 2B4GA 1TO3A 1LYXA 3THAA 1M7PA 4LWWA 3PUOA 3LDVA 4LS1A 2JKPA 5DLCA 4HIBA 2QUUA 2ZTJA 3LX9A 3JRKA 4O14A 3IGXA 4D2JA 2CZ5A 3BV4A 3NR0A 3GYEA 4XBSA 5I3GA 4K38A 3G3MA 3LCGA 1IXQA 3WK2A 4Z1AA 4HNNA 3BLEA 4BF9A 4NVTA 3TFXA 2RH9A 1BWLA 3MI6A 3LHVA 2E09A 5EKYA 4Z0JA 3IGSA 3TQKA 2NX1A 4QNWA 3KRUA 3PG9A 2DZVA 5LHFA 2CLIA 4QNEA 2VFFA 1I45A 1A5CA 1RR2A 3PUDA 4WX2A 2R8WA 5DY3A 3VNDA 4JTTA 3T78A 3KRZA 1GJPA 1JQVA 1FWRA 3P8IA 1SZNA 5CPNA 2YR1A 1LTDA 3HQ1A 4JDYA 1KFLA 5G1YA 3B06A 2A2IA 2A21A 2Z6JA 3OVRA 4FNTA 4MYXA 1K3UA 3B0VC 1TPB1 1VPXA 4EF8A 2FTPA 4TR9A 3THQA 2BTMA 3IVSA 3S5OA 2O7QA 1J2WA 4UTJA 5D03A 2R91A 3RMJA 1OHLA 1AK5A 3HG3A 1KBIA 1TQJA 3QRHA 1PL9A 3UWQA 4ZQPA 4DF1A 5D2VA 3DKJA 3EWYA 2Y89A 3DAQA 1ICQA 3W1LA 1ZAIA 3EEGA 1X6UA 3UWUA 3NQ6A 3P81A 5I3KA 4GUJA 2Q3OA 3CIXA 4MIMA 3UNDA 1GVFA 3NQEA 2NX3A 1G7UA 5LNWA 1LRQA 5AHIA 3ZWSA 5LNUA 4BI5A 1VRDA 3R12A 1Q6LA 5AC6A 3FKKA 3QPZA 2ZA1A 3C2VA 1QDSA 3HBLA 4AHPA 5HR7A 1XKYA 3G8EA 1EUNA 3TKFA 4AMAA 1GVRA 1OFEA 3P67A 4RXGA 3PR2A 5DBTA 5E0KA 4JIPA 3EX4A 3A5VA 3C61A 3PB0A 1L2UA 3A5FA 4LS0A 3W1PA 4XZ9A 4JTSA 2ISSA 1OG0A 1O95A 2DU2A 1KLYA 5HULA 3GKAA 4K36A 4NU7A 4ORMA 3MP5A 4ZQCA 5FEWA 4AXKA 3PWAA 3M43A 2FB2A 3W7EA 3DFQA 1B3OA 2AGKA 2XN0A 2A4AA 5CSSA 4IUOA 1W3TA 1YDVA 3F4WA 3O06A 1LRTA 2P0OA 5BNKA 3CWNA 3TXZA 2FDSA 2I9EA 5CGQA 4YL2A 1DQXA 4IMCA 1JRCA 3N3MA 3TV8A 3L0GA 4N9BA 3W76A 2GPTA 4NJGA 4CQ9A 1QOQA 2FLIA 4RK8A 2DORA 1OF8A 1FCVA 3QZEA 4GJ1A 4ZQNA 4JTLA 4CNOA 1B9BA 5HUPA 1H1YA 4AEOA 5DN1A 4JGDA 1EWDA 1GZGA 1I2QA 5CZ0A 3OVPA 4WD0A 5CKSA 2OX1A 3C0JA 2PURA 5HNRA 2GQ9A 1KM6A 2YW3A 3LRMA 4DPPA 1P0NA 3T44A 1SPQA 3VCRA 1OFBA 2FJKA 2I14A 2QJHA 3A22A 2JBMA 4JY8A 2EGZA 3JR2A 3GAYA 1EUAA 4UFMA 5EBUA 5IBXC 3B0UX 1OABA 1F6KA 2CU0A 3C6CA 3M6YA 3S1VA 3SSJA 3HF3A 1QR7A 3O8AA 5KZMA 1F5ZA 2WJZA 2GJNA 4GXMA 2E6DA 1GVOA 2W6RA 2OT0A 1T0OA 3LCLA 1QCWA 2VKZG 5D2XA 1UJPA 3TQ0A 2JGYA 3UWVA 3K30A 1G7VA 3LV5A 4IX0A 2ZZ5A 3S5ZA 5SWUA 2QUTA 5GVJA 2TMDA 2P1FA 3HGJA 4JXCA 1W3IA 1LBLA 3QMSA 1NSJA 4LV9A 3EWXA 3ATYA 3UWYA 1U5JA 3W73A 5C55A 1DL3A 4Q33A 3V1PA 2Q8ZA 2E6YA 2RDTA 1TV5A 2DZWA 3WJSA 5DXXA 2OMAA 2P10A 1RQHA 1CW2A 1NFBA 4NNAA 4MYAA 3INPA 2WOQA 5KINA 5FEPA 3QQ1A 3GKFA 3HPZA 3EWWA 3N2MA 5AOUA 1YXDA 1ONRA 2ZYFA 3TR2A 3HB9A 3LXCA 4K39A 1LOSA 2LLEA 3E49A 1OFQA 3S5YA 5C2XA 3L5MA 2BZNA 3FIGA 3MUXA 3OEXA 3USBA 1MEHA 3HGSA 2W79A 3MYPA 5FESA 3MYOA 1YPIA 2X2GA 2ZA3A 3TX9A 4X2RA 1UASA 4RZ6A 2V2HA 4KWWA 1W5PA 3M0ZA 1H1ZA 1ME8A 1Z44A 4LRTA 5G2IA 4DELA 3QMRA 1G4EA 3O05A 1TTIA 1FQ0A 1SQ7A 1SFLA 4LT9A 1KM2A 2NXGA 2QDGA 2CLEA 3PVFA 4UTTC 3KVKA 2FPVA 2NLIA 4NJHA 2YW4A 4ZZ9A 3TROA 3VE7A 1H51A 3UPBA 1KV8A 3ZR4A 5C54A 2GVGA 5U7SA 3IGUA 3O6DA 4IWWA 3QJAA 1C29A 4IMFA 1HO1A 3GXTA 4UFIA 1RD5A 4WOZA 1KA9F 4TMBA 3PBYA 3CQ0A 3F1QA 2ABAA 3NL6A 3LLDA 4R33A 3W9ZA 3HGRA 4PTNA 5DCBA 1CI1A 3LXAA 2Y62A 3NNTA 1W37A 4HPXA 4PH6A 1TB3A 3NQVA 5K9DA 2QCLA 1PE1A 2C14A 4ALDA 1H62A 4Z1CA 3NDOA 4CNNA 3BPWA 4DO5A 4UMAA 3IV3A 3W7GA 1VQTA 5LHEA 3RNDA 3YPIA 4NQ1A 1GG1A 2Z2UA 3VFLA 4IMEA 1DVJA 1J4EA 3SGZA 1Q6OA 3P82A 5C5YA 3KRSA 3W7JA 5KZEA 4UIOA 4YLWA 3SIZA 3CLMA 3GB6A 3L9CA 1SZGA 4JR5A 2VFGA 4A2RA 3MHUA 4WXYA 4A22A 4O1DA 3L21A 4ZQMA 2EKCA 4CNPA 3DENA 4MLJA 4UTIA 1ZY9A 2QAPA 2QR6A 2V30A 1FCUA 1FCBA 3FOKA 5F1VA 5A8GA 1I2OA 4M19A 5G1TA 2OZ0A 4OV9A 1LDCA 3BW2A 3FS2A 1HG3A 4ZQOA 3LBMA 5KZDA 3NZRA 1G6CA 1OX4A 4G1KA 4JYEA 5F1UA 3LV6A 3QW4B 4EF9A 4R34A 5C6MA 3GDMA 2A7RA 3P8JA 1W1ZA 4O50A 1BTMA 2IQTA 4LTSA 5EYWA 3N9SA 1YLVA 1S5TA 3L68A 3V75A 3CU2A 3A23A 3G0XA 4O1BA 2FPTA 1GYNA 2E77A 3NA8A 4UXDA 1SO4A 3LHZA 1RV8A 2QCFA 1TTPA 3BVJA 3SJ3A 4UR8A 4YXGA 1O94A 3GAKA 4HN4A 3OA3A 3P80A 3PB2A 4A2SA 2CLOA 3HIJA 2ZZ6A 1ZCOA 3UWZA 3G1HA 1GTHA 1XBYA 4X3ZA 3NXFA 4BK9A 1OX4B 4R7JA 3G0UA 1DHPA 2FFCA 2WQPA 2HSAA 3CT7A 1NF0A 3P61A 3W71A 4DXVA 3HMJG 3E96A 1H60A 2DZUA 1OFOA 1OFDA 4NT0A 2QJGA 4BFAA 1R46A 1W3NA 4RR4A 3TSBA 4QJ1A 2ZRZA 4GNJA 1JR1A 3C52A 1OFPA 3QH2A 2ZRVA 3H53A 4NZJA 3W7QA 3NEVA 4POCA 5DBUA 3P5ZA 5F2MA 3DI0A 3HG5A 4RX0A 3SZ8A 3C2FA 1GQNA 3L0NA 3W87A 3RK8A 1SO6A 3W7IA 1QAPA 2B7PA 3TFCA 2TYSA 3LHUA 3WK3A 3O63A 2GVLA 4E2DA 3JS3A 3TJLA 2GVJA 1QFEA 5LZLA 1LRNA 3CC1A 3STFA 4IGHA 4O57A 4FHAA 1D3GA 5E1QA 1Z41A 4WOQA 1GVQA 1Q6QA 1WV2A 1K7FA 4LVBA 3IIOA 4Z08A 1KFEA 1AL8A 1U83A 4JNMA 3FA5A 4A3UA 3GNDA 4M6PA 4E0CA 1XFBA 1O60A 1R2SA 1K8ZA 4O17A 4UNLA 5FEXA 2VC6A 3UPWA 3SY5A 1K02A 4IJBA 2ISVA 4QIUA 4R53A 1MZHA 4GC4A 4N9DA 1R47A 2WO5A 2A6NA 4O18A 2RDWA 2VELA 2CW6A 4O4VA 4S1FA 1SSDA 2V5BA 1FDJA 4FF7A 3M5ZA 3BLIA 3C8FA 3W2MA 4MOZA 4FNUA 3G1SA 3NGJA 1IXPA 4HSNA 5AYZA 1TQXA 1JUKA 1Z42A 2QCHA 2C3ZA 1TJRA 4ADUA 1F2JA 3E0IA 1XBZA 1I2RA 1TYGA 1KV5A 1VYPX 3VI2A 3EB2A 4FXRA 1QO5A 3EWZA 1P0KA 3DFPA 1TCDA 1YXYA 4OWGA 4O54A 1K8YA 5AC8A 4MLRA 4ADTA 1VLWA 2WSQA 4I7WA 4Q4KA 3MWAA 1X1ZA 1XC4A 3BLFA 5K4ZA 4UFJA 4UTWA 1UUOA 1V7YA 2PCQA 2QJIA 2YYTA 3P74A 4QM1A 1MEIA 1GPWA 3Q94A 4UMCA 2OCZA 3CIWA 2H3BA 4LY8A 2KZHA 1VCFA 1OYBA 5AHEA 4M5PA 5HINA 1SW3A 4WUIA 4M7SA 4MZ1A 3TU9A 3TAOA 1WBHA 3NQDA 4KKXA 4QSHA 2Y7FA 1TPEA 1ICSA 3GXPA 3EX1A 4O0ZA 2PRMA 1VH7A 3FYOA 3TUUA 3O16A 1P4CA 1YTDA 2J24A 3U8GA 4C1LA 2ZZ3A 5CG7A 1TRDA 1UBSA 1KTBA 4JYDA 4ONVA 4JTHA 5D2WA 3QFEA 2V9DA 3CWOX 4H4IA 2ZDRA 5K4XA 1AW1A 1X8FA 1TJPA 3B0PA 4YCPA 3M9YA 4A21A 5TQLA 1TTQA 1UUMA 3W1MA 4JX4A 1IXOA 3G8RA 1IGSA 1SSGA 4MFDA 2AQWA 3RU6A 3ABOA 3LCHA 5D02A 2BSLA 5LGXA 1G69A 1W54A 1YDNA 3DFNA 3IRDA 3SW6A 3AO0A 3W7DA 5KITA 2C16A 4I7UA 3OBKA 3LTPA 3W74A 5J5DA 2WNQA 1X7FA 2DJXA 4ICNA 3HPSA 4OV4A 4MJMA 4NJIA 1PHQA 4LUIA 4XKYB 3HPXA 2A5HA 2DZTA 1X1OA 3PSWA 5G5IA 5K9CA 3NQFA 1VS1A 4O10A 2VXNA 3DI1A 2YCEA 3PBWA 3G3DA 1QPOA 4L4MA 4IPJA 4JTGA 3ABRA 4N9EA 3EX3A 4WJEA 3W7OA 2WSYA 3DFOA 5CZTA 2H8XA 2R14A 1B57A 2VEKA 1SO3A 3MBDA 3CB8A 4AAJA 3W83A 1Q3NA 1P1XA 3QQ0A 3BW4A 3C3NA 3UYCA 1A53A 3TCEA 4YCOA 3M44A 3DXIA 3UXDA 5TIMA 5AC7A 2J9XA 3TW7A 1EPXA 1OK6A 3UY7A 4WXZA 4HNUA 1EA0A 3L67A 1BEUA 2EF9A 3O6YX 1QPQA 5ABTA 2YZRA 2E68A 3DGRA 8TIMA 1XUUA 4Y96A 4Z1DA 1H7RA 2E5DA 3T7VA 4RKAA 3TJXA 2A1YA 4GFSA 4XQ6A 1H5YA 3MHFA 3W1TA 4UUIA 4OBTA 1XDLA 1F05A 4P2VA 4UMBA 1O5XA 1ME9A 1GG0A 4S2CA 1KM0A 1RQEA 5D37A 2BX7A 1M6JA 1K8XA 3RF9A 4BWLC 1I2NA 3P5YA 3NO5A 4AWTA 4UTKA 3QSTA 1VJIA 1QO2A 3U6WA 2QCGA 5BMXA 3R5EA 4UR7A 2C1HA 3LM7A 5BMWA 4E38A 4JEQA 2QCNA 3TXVA 1T8XA 3W7NA 5I3HA 1W8SA 2YYUA 3QSRA 2DZPA 1WX0A 3QC3A 2QCEA 4AHOA 2X1TA 3BO9A 1W5OA 2YXGA 4DQWA 3PM6A 2J9YA 2ALDA 1LBMA 4RXFA 1N8FA 1TPDA 1TV8A 5FF7A 2WKJA 4OGZA 3QYQA 2QCDA 3UQNA 3TE9A 4PEKA 1FX6A 1OX6A 3I7SA 4O19A 2J9ZA 1TREA 1KW1A 2A7PA 2X16A 3TH6A 5FF0A 3W1XA 3T40A 4IMDA 4LVGA 1XM3A 4S2BA 4DBDA 3LHTA 3GXNA 3DBPA 4P61A 3VKJA 1KM5A 3FYPA 3UZJA 1WA3A 2YFOA 2X1UA 3NQ7A 1JCNA 3GNNA 2CFFA 1TPC1 1ML1A 5CPLA 3DKLA 5BRBA 3A24A 4N4PA 3G1AA 1CX9A 1BWKA 1ZFJA 2F7FA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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