3QFE | Genus

Total Genus 113

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	113
sequence length	314
structure length	305
Chain Sequence	MVPRVPQPGIWCPAVTFFDSKTDTLDLASQERYYAYLARSGLTGLVILGTNAEAFLLTREERAQLIATARKAVGPDFPIMAGVGAHSTRQVLEHINDASVAGANYVLVLPPAYATTPPVIKSFFDDVSCQSPLPVVIYNFPGIDLDSDMITTIARKNPNVVGVKLTCASVGKITRLAATLPPAAFSVFGGQSDFLIGGLSVGSAGCIAAFANVFPKTVSKIYELYKAGKVDQAMELHRKAALAESPCGIATTKYAAAIFSAKAAGIEDAEEKLRPRKPYDPPSEAAKQEVRKVMAEVAAIEAGLS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structures of a putative dihydrodipicolinate synthase family protein from Coccidioides immitis rcsb
molecule keywords	Putative dihydrodipicolinate synthase family protein
molecule tags	Lyase
source organism	Coccidioides immitis
total genus	113
structure length	305
sequence length	314
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2011-01-21

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3qfeA00

1VYRA 2CLHA 1GVSA 5IM51 2ZRVA 1OK4A 4LY8A 3A5VA 4O11A 1A5BA 1GVFA 3LBMA 8TIMA 1U83A 1RQBA 1TRIA 3FYOA 1FY6A 3INPA 4LV4A 3LV6A 5G4WA 4O17A 2CLLA 1KM3A 5HWNA 2ZRXA 4JDBA 4Q4KA 5LZLA 3FJLA 5FEXA 2VKZG 4OQVA 3LCWA 1LBFA 3G8RA 3GIYA 4O57A 4X9SA 4GC4A 3L5AA 2JBMA 4MYAA 4Z1CA 3HGOA 3TUUA 5C2XA 5G1TA 4OV4A 3T78A 4HPJA 1EB3A 5AHIA 3SIZA 1C9DA 5G2WA 1FWRA 3OEXA 3EKLA 4J9JA 3UY8A 4X3ZA 1ONRA 3DXIA 4GUIA 1H5YA 3WJSA 3MHFA 5D2WA 3PF3A 4JYEA 3PVFA 2R91A 1L6SA 3MHUA 1OVDA 3MI2A 2FIQA 2I1OA 1GJPA 2HS8A 3OG3A 3NYZA 4UUIA 1T0OA 3DFPA 5AHEA 1HO4A 4AF0A 4NT0A 3C2VA 4FXRA 3FYPA 3P74A 5AYYA 4IMDA 5D02A 2NX9A 3BW3A 3PS7A 2QF7A 3E9AA 3MI6A 4YL2A 1GVRA 3PUDA 4TMBA 2W6RA 4IMCA 5C5YA 3LCGA 3HQ1A 3CC1A 2YZRA 3W85A 3DENA 5HR7A 1K02A 2CZDA 4TX9A 2CWNA 3MBFA 3DI1A 5BNKA 4MKNA 4LC8A 3LCFA 1NFBA 3NPUA 5DCDA 4ADSA 1V7YA 3I6RA 1RQEA 1G4PA 4N6EA 5LNSA 3W9ZA 3PG9A 1GT8A 3NQMA 5K7JA 2BZNA 3W7MA 4UTKA 3KAOA 3MYOA 4UTUA 2A7PA 3SI9A 3W1QA 1WYIA 3W2KA 5DCBA 4FNRA 2CZFA 4DELA 1EPXA 5KZMA 3NZRA 1QO5A 2CLEA 3LB0A 3SFKA 1WDWA 3HGSA 1AW2A 1LOQA 4RJEA 4FF7A 2E77A 1SSDA 4PEKA 3DKJA 4MY1A 3BGJA 3W7QA 4H3DA 1TMHA 2A6NA 5EA9A 3UWYA 3G0SA 2VEKA 5I3HA 2CLFA 4LVGA 3RF9A 1I4NA 3WFAA 4NU7A 2FTPA 4ZQMA 2I14A 1TRDA 2Z6IA 4FNQA 3B03A 3RU6A 4BI7A 1U5JA 1KLYA 1DORA 1SZEA 2VFDA 1LORA 4IX2A 4MY8A 3R2GA 3QQ0A 3W6YA 3B0PA 3V75A 3NQ8A 1BTMA 1R47A 4N9EA 2WJZA 3GZ3A 3QF0A 1TIMA 1WAUA 2Q8LA 2CZEA 3CM4A 4DF0A 3W2MA 3G0XA 4P61A 3GNNA 1TJRA 1GOXA 3F03K 4S2BA 4ONVA 3CWOX 3PB2A 1O5KA 3UZ5A 5LGZA 4CQ8A 4YXGA 1DBTA 1B4EA 1FQ0A 4NNAA 3C3NA 4MZYA 3W83A 1RV8A 3M41A 4R34A 2Y88A 2FFCA 5KTLA 1FXQA 2E5DA 2Q8ZA 3IV3A 4NNCA 3IGXA 3L0NA 2BWGA 3HGJA 3PUEA 5D30A 5K4ZA 3KXQA 4FEZA 2Y7FA 4CQAA 5DN1A 5LNVA 4JTLA 5FEWA 2GQ9A 2V2DA 4ZVJA 4YLWA 3C56A 4JNMA 2QEZA 1P5BA 2GUUA 1RQHA 4L4MA 3QJAA 4POCA 4M6VA 5HUOA 5C55A 1NSJA 1D9EA 1QNVA 3VFLA 5J5DA 1HG3A 4DXVA 1QOPA 3L21A 3DAQA 3KOFA 2E6YA 4GJ1A 1SO3A 4N9CA 3PSWA 2WV8A 1F5ZA 2TYSA 5D04C 1IXNA 2PRMA 2RDTA 1YXDA 4O0ZA 3WJZA 4GBUA 2AQWA 3LCHA 3GKFA 2HS6A 3QW3A 2B7OA 4HT3A 2E5BA 4HPXA 4KWWA 3S0CA 2RH9A 2E6FA 4DF2A 3R13A 2ZYFA 2CLOA 3BG9A 5I3FA 3BW2A 5GVJA 3E49A 2KZHA 5HUPA 3R8RA 1OYBA 4CCDA 3A5FA 2VFIA 4MOZA 4O19A 2OMAA 1K8XA 2C0AA 4NJJA 3CEPA 3LHYA 2ABAA 1KFCA 1W0MA 3L0GA 5DLCA 1M7OA 4EF8A 2YPIA 5F4XA 3IGSA 3DHFA 3TW7A 5HR6A 3S5OA 4OE7A 1F74A 1KA9F 1KM1A 1P1XA 2TRSA 3IIOA 3B0UX 4GWEA 4XQ6A 2JKAA 2QJIA 4H4IA 4PCFA 3W7RA 3LRMA 4HKPA 3THQA 2Y89A 5ABTA 3P62A 1O95A 3HF3A 1ZENA 3E02A 4K7VA 4JTHA 3EWBX 5CSSA 3FFSA 1I2QA 2DZTA 4S1FA 3NDOA 5I3GA 1WQ5A 1WX0A 4JS3A 4LNYA 1SO6A 3TK7A 3GDTA 3NPXA 3B04A 1VH7A 5K9CA 3KX6A 3NQ2A 4O4VA 1JCJA 2GPTA 3FA5A 1LRTA 1FCUA 1VLWA 1QPNA 4MZ8A 4N4QA 2A0NA 3M0ZA 3W2LA 4NQ1A 2GJLA 1FDJA 3TC6A 1NF0A 4BFAA 1F05A 4QM1A 5F2IA 4RR4A 4TR9A 2QJHA 1GVOA 3M9YA 3HPXA 4LS1A 2WSQA 3QZEA 2ZTJA 4FIQA 2NWSA 3UWZA 4HNVA 3STGA 4XWUA 5AHNA 4E2BA 2VEPA 3TC7A 4M7TA 1MZHA 4HHPA 3TQKA 1XUZA 1OK6A 2A6LA 3O6CA 3SECA 4MY9A 3ANYA 3P8JA 1X1ZA 2FJKA 1AW1A 1DVJA 3GB6A 4IJBA 1DQXA 3W73A 1ME9A 1LRQA 1P4CA 1EP1A 1K8YA 4UR7A 4Y9AA 4OHQA 3LLDA 1C29A 1K03A 3BO9A 4K38A 4AHOA 5K2ZA 2C3ZA 3QH2A 1EX5A 5DXXA 3G0UA 1G67A 1S5VA 2X1SA 3QPYA 1KTBA 3LCIA 1VGAA 4LS2A 1TPUA 3LTPA 4JIQA 2PRHA 1RR2A 1YXCA 3O15A 3TE9A 3IEBA 1QR7A 3N19B 3IIXA 4MZ1A 4GFSA 3KRUA 3VKJA 3W1UA 3W1RA 2QCGA 4FNTA 5CZ0A 4WXZA 2ABBA 4NJHA 2Y85A 3UWUA 1GTEA 3C2EA 3MMTA 4ZL1A 4NX0A 3GDLA 3U6WA 3H53A 3KRZA 3SR7A 4DF1A 2LLEA 3WK2A 2EAWA 5EY5A 4O13A 4Q33A 3GNDA 3W1AA 1JJKA 4Y90A 3W1XA 1ICQA 2TSYA 1LOSA 3CWNA 3IIZA 3SGUA 3LTYA 3PAJA 5HINA 4UTWC 2QCMA 1UB3A 3BLIA 1G7UA 5DELA 4ORIA 2A21A 3W3OA 3M44A 4I7VA 3STEA 1ME8A 1TO3A 4JGDA 5BMWA 3V1PA 3LRLA 2ZZ1A 4UTMA 4UTWA 1TPWA 3QRHA 4Q32A 3E0IA 2RDWA 2ZTKA 1KFLA 1T8XA 4CCEA 2R8WA 3LBCA 5F2MA 1OYCA 1F73A 2DU2A 4A3UA 4WOZA 1PCWA 3CLMA 4M6PA 3LERA 1UASA 3P82A 4X22A 5H91A 1OFOA 4LVFA 3WJWA 3EXSA 3M6YA 2ZZ7A 5AOUA 1W3TA 1TPH1 1I45A 3L9CA 1FWSA 4JTEA 1GQNA 4KFNA 4JY9A 4QAIA 1GZGA 2UV8G 4MIMA 5HWMA 3G1SA 3AO0A 3LHUA 2QCCA 3P80A 2XN2A 4O12A 5AYZA 1S5WA 3L2IA 2QDGA 4JX4A 1KFKA 5K9XA 5LHEA 4MVAA 3THAA 2VFEA 2YW4A 4I7WA 3W70A 3S5NA 4A2RA 4EWND 3L66A 1SW7A 4UFMA 5CZSA 1KM6A 1R2TA 2VFFA 4AMAA 2A2IA 4PL1A 1A53A 2GOUA 2GQAA 4JTTA 1PCKA 4QNEA 1BWLA 2YXGA 5LHFA 3H55A 1DV7A 2OX1A 3HIJA 5CKSA 3W23A 1NF7A 4UC5A 3M43A 3IVTA 5L6UA 1OFEA 3N9SA 3FIGA 4LUIA 1ZFJA 2G95A 3A9IA 4MPQA 2Y6ZA 4AHPA 1G69A 3N2MA 3EX2A 1UUOA 3AJXA 3G1VA 1XFBA 3TR2A 2V9DA 4NX5A 1O60A 4A21A 2A4AA 2GVLA 1JUBA 1GYNA 3EX6A 3ZFHA 3S8HA 4QQ3A 5CPOA 2A5HA 1VHCA 4ZQRA 4X2RA 3S1UA 1FCQA 1HFBA 2VFGA 3EWYA 1IIHA 4UNKA 5AYXA 3NQ6A 1RPXA 5K3VA 2NZLA 3W7CA 1W3IA 4ZQOA 3D0CA 4CNNA 1JRCA 3ATZA 3UPWA 1H51A 1YPFA 2JGQA 2JGYA 3OBKA 2ZFAA 2Y63A 2QAFA 1QO2A 3G1XA 1OYAA 1OFPA 2H3BA 1JCYA 3W84A 4EF9A 4RX0A 1GG1A 1Q6QA 3NA8A 3PWAA 1ZHAA 1O5XA 4Y96A 4IPJA 4XUGA 3PBWA 3QSTA 1JR1A 3W7GA 1SO5A 3UWWA 4JD4A 1LLWA 5AHFA 4QISA 3BLEA 5G1YA 4K37A 1AW5A 1H7XA 3P60A 3A22A 4UMAA 4JX6A 2CLIA 4LC6A 1DL3A 1SPQA 3I7QA 2EHHA 3G1YA 1LROA 5AC7A 3NGJA 5SWUA 3B4UA 1XM3A 2C13A 2HTMA 1OFAA 4QSHA 3NEVA 2C14A 1EWDA 2V82A 3QM3A 3LI0A 1JQXA 3W2UA 1IF2A 4PTNA 1TV5A 1PVNA 1YLVA 1NEYA 1OF8A 2QCLA 4PC8A 1OG0A 1FBAA 1NVMA 4IXHA 3LCXA 4UFJA 3HG3A 2I9EA 2YSWA 2ALDA 3ELFA 1ADOA 2VEMA 2VEIA 3F4NA 2WQPA 5D33A 3HPSA 4ADTA 4BK9A 1TB3A 3W87A 1PS9A 3NL6A 4UCGA 4JIPA 1Z42A 3TKFA 2ZA1A 4O16A 1VCVA 1W1ZA 4DO6A 5K4XA 2VC6A 3P84A 5FEZA 4RXGA 1J4EA 2H3DA 4ZQPA 1SW3A 3W7DA 1G4TA 4JTSA 4O0KA 3M16A 2FDSA 5FF3A 3NL5A 4G1KA 3C4UA 4K7YA 3SW6A 1XCFA 1DKWA 1N7KA 2GQ8A 4JTGA 1TPVA 4R53A 2ZZ5A 4AAJA 4YWIA 3CB8A 4TMCA 1W31A 1W56A 3LXAA 3QW4B 5HWJA 2J88A 4K39A 3NNTA 4Z1BA 1WBHA 3UZJA 1ML1A 1J5TA 1H50A 4UFIA 2WKJA 4Z0SA 3ZR4A 3LOTA 4FO4A 1VYPX 4RCXA 1FX6A 3IIVA 4O28A 5CSRA 1TJPA 1KM2A 3EWWA 3RFAA 3EX4A 1IGSA 1WOBA 4MFDA 4JTFA 3WJXA 3PG8A 3JS3A 5F1UA 1DQWA 3KHJA 1S5TA 5HULA 3MO7A 2QCNA 3RK8A 3PBYA 3SY5A 4FNPA 3RLUA 3QFEA 1K8ZA 1T96A 4PFMA 3HG2A 3I65A 3DFNA 4OWGA 1K7XA 1O4UA 1LRNA 2WO5A 1MEHA 4DQWA 3UPBA 1KFJA 4N9BA 5DY3A 3BV4A 1ZAIA 1VJIA 2QDHA 4KKXA 3C6CA 1EWEA 1SU5A 4IMGA 4ML9A 4XBKA 3O63A 1GG0A 2FPYA 4A22A 3FKRA 1A5SA 1TQXA 2XFWA 3ABQA 3QSRA 3TJXA 1X6UA 2DZXA 2PURA 4H6KA 1OF6A 2NUWA 1PHWA 2WPBA 3U2OA 2VENA 1M5WA 1L2UA 3H54A 1NAL1 1S3HA 5D38A 5HMSA 3NQAA 1D3HA 4UIOA 4I9AA 2GJNA 2P0OA 2OJPA 1LYXA 1ME7A 1QDSA 3E96A 3TXZA 2WNQA 3B0VC 4XTDA 3N73A 4ICNA 4I7UA 1K7FA 4R7JA 5G5IA 3USBA 4E2DA 1WOAA 1VLIA 4L4LA 2A85A 3CPRA 1YTEA 3E12A 4K36A 5G2IA 2YX0A 2B0MA 3HB9A 3UNDA 3CHVA 4N02A 1YXYA 4AXKA 2QAPA 2QCHA 1Q6RA 1SFJA 1KM5A 3G1FA 4ZQCA 2X1TA 3KFTA 4ZMGA 2H90A 4D2JA 2DJLA 2ZRWA 3QMTA 3WK3A 1Y0EA 3Q2DA 2C15A 3MUXA 2G5WA 1GPWA 1SZGA 3O1NA 1RZMA 1L6YA 3LI1A 2CFFA 2NXGA 4M19A 1SQ7A 2E5CA 2Z1BA 3I7SA 3IVSA 2NUXA 4UXDA 2Z0IA 2J6XA 1KTNA 4IOTA 1AG1O 5D37A 2BTMA 4QNWA 5G2HA 1Z41A 4JTUA 3W7NA 1KW1A 2QCDB 4MUZA 4RZ4A 1GWJA 3IRDA 1M7PA 2NUYA 3TDFA 4XTIA 3HPZA 4CCCA 3LCLA 5D2YA 3QMRA 3TV8A 1AK5A 4K8HA 1PE1A 3TAOA 3S6DA 3MP5A 4CNOA 1DJNA 3KVLA 3TNOA 1I8JA 2NXIA 1EA0A 3NO5A 1FCVA 3DFSA 2WNZA 4JTKA 4NVTA 4GRSA 3R89A 4EOUA 5BRBA 4M5PA 4MJMA 3F4WA 3GKAA 5F2GA 2NV1A 3NQDA 1JCXA 1H7OA 1FWNA 2FQIA 4GE8A 3GK0A 4TO8A 3LHZA 2O7SA 3GAKA 1TCDA 3N14A 4AEOA 3W1NA 4CLMA 1H7NA 3M47A 4OGZA 4AWUA 1JULA 3NQ7A 3Q94A 2V30A 3NM1A 3W74A 3TXVA 4JTJA 3BLFA 4RLIA 3VE9A 4LT9A 4LV9A 4O52A 2VOMA 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2Z2UA 3W1PA 2Y7DA 3S5YA 3W1TA 3KVKA 5I3KA 1QPOA 4OV9A 2DORA 1IIGA 4Z1AA 1PL9A 4NXSA 5CZJA 2VELA 3MP3A 2CLMA 3GR8A 3EXRA 3MHGA 4IWWA 4UTIA 2B4GA 2NV2A 1MEWA 4ORMA 4FX8A 1EUAA 1H1YA 4UFKA 4DPQA 3IVUA 3N34A 4JEQA 3CQ0A 2DZSA 1VHNA 4WOQA 3BW4A 3BGGA 3QEZA 2E1DA 3M7WA 1LCOA 3NQVA 2AGKA 3FEMA 3NL3A 1QFEA 4C1LA 4O1BA 4BI6A 1XDMA 3WJYA 3P67A 3CU2A 4NXKA 3TH6A 2OZ0A 3QQ1A 1UCWA 1VC4A 4AH7A 3RMJA 5LGXA 3S9YA 1B57A 4UR8A 4O10A 4O1AA 4UNLA 5D03A 1N8FA 3BPWA 3G1HA 1SO4A 3NXFA 1OFQA 3C2FA 2V2HA 3O8AA 4JX5A 2V0TA 3EKZA 4YCPA 4WZHA 3DFOA 4JTIA 1ZNNA 4FIRA 5DY2A 4DBDA 3MBDA 1T99A 2QJGA 5KSWA 1XL9A 3NQFA 3C8FA 1ICPA 3NQCA 2Y7EA 3P8IA 1KTCA 4UMCA 4OU1A 3C61A 4DPPA 1TYGA 1BKSA 1I2PA 1Q6OA 1GTHA 3P81A 5KZEA 1I2OA 2C19A 4IPIA 1OX5A 1TV7A 4GNJA 5CZTA 2VXNA 2QCEA 1H60A 1TTIA 1VZWA 3QMSA 4LRTA 3NG3A 3FLUA 3SZ8A 3CTLA 3N2XA 1UJPA 1KV5A 3SGZA 5E0KA 1GVQA 2R14A 5T26A 3W7PA 3TU9A 1JCLA 4JYFA 2E6AA 5EBUA 4KWVA 2B7QA 4C1KA 3LHWA 1H1ZA 4BR1A 1F2JA 4AWSA 3VCRA 2JKPA 3UXAA 1VS1A 3I68A 3R5EA 4GUJA 3S42A 3OVPA 5FF2A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3QFEA

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