3QHMA

Crystal analysis of the complex structure, e342a-cellotetraose, of endocellulase from pyrococcus horikoshii
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
QTPTGIYYEVRGDTIYMINVTSGEETPIHLFGVNWFGFETPNHVVHGLWKRNWEDMLLQIKSLGFNAIRLPFCTESVKPGTQPIGIDYSKNPDLRGLDSLQIMEKIIKKAGDLGIFVLLDYHRIGCTHIEPLWYTEDFSEEDFINTWIEVAKRFGKYWNVIGADLKNEPHSVTSPPAAYTDGTGATWGMGNPATDWNLAAERIGKAILKVAPHWLIFVEGTQFTNPKTDSSYKWGYNAWWGGNLMAVKDYPVNLPRNKLVYSPHVYGPDVYNQPYFGPAKGFPDNLPDIWYHHFGYVKLELGYSVVIGAFGGKYGHGGDPRDVIWQNKLVDWMIENKFCDFFYWSWNPDSGDTGGILQDDWTTIWEDKYNNLKRLMD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Functional analysis of hyperthermophilic endocellulase from Pyrococcus horikoshii by crystallographic snapshots
pubmed doi rcsb
molecule keywords 458aa long hypothetical endo-1,4-beta-glucanase
molecule tags Hydrolase
source organism Pyrococcus horikoshii
total genus 113
structure length 377
sequence length 377
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2011-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3qhmA00
2JIWA 1GQLA 5HPCA 3BAXA 1QNOA 2WSKA 3ZT5A 1OT1A 3VX1A 1JDDA 1E0VA 4DUXA 1JGIA 1CXKA 3SCQA 1LF1A 3BXWA 1NM9A 1PZ3A 1LL4A 3L4WA 1VFMA 1ZBCA 4AW7A 1HKMA 3W26A 1E15A 1K9DA 4E4PA 3ZMRA 2WW5A 3VMPA 1VFOA 1WP6A 4BQ2A 1GVYA 1CZ1A 3EMCA 3O6AA 1BG9A 1EQPA 1AQHA 1VAHA 2UY5A 2RGLA 3KWXA 4RL3A 4CCEA 1DHKA 4BQ5A 1NP0A 4J3XA 2WVSA 3VDCA 1H11A 1DWJM 5A69A 2DT2A 2QPUA 2VX4A 3AIBA 1AQ0A 5I78A 4M24A 1V3MA 1D2KA 3ZJ8A 3I3BA 1HL8A 1OM0A 2YDQA 3THDA 1HP4A 3WH8A 4W7UA 4QAWA 3AXHA 4CVWA 2YL6A 1JYXA 5HOSA 1UWQA 3AI0A 1OIFA 2XVNA 4HZ8A 3A4XA 1CDGA 4TVUA 4W8BA 1JZ7A 3SCWA 3WQWA 1WCGA 1GPFA 2WCGA 2J7HA 2DIEA 1UG6A 4OIFA 5ABFA 2YDSA 5EFDA 2D22A 2XM2A 2FHFA 5A6MA 4UQAA 1E73M 2VT0A 5IHRA 4M80A 2GVYA 3ECQA 1ECEA 3MKKA 5CSYA 3WBEA 1I1WA 3WUFA 2E9MA 1C3FA 3U7BA 1EHNA 1GHRA 2WZIA 3GBDA 1J11A 4F66A 1VJSA 4W5UA 2VL4A 3WEOA 2GDVA 3WMCA 1VB9A 1BFNA 1AQMA 5A8QA 2JIEA 1OGSA 1FOBA 2ZWZA 1EO5A 1QNPA 5JUVA 4BCEA 4PUEA 3WMSA 2BY2A 5A8OA 1GHSA 2B31A 1US3A 4YN5A 3FAWA 4FMVA 3VGHA 3T08A 2VZSA 4DM2A 4IUGA 5D4YA 5E09A 2D0FA 3J7HA 4PMVA 4TOQA 4AIUA 2D2OA 3DHPA 1O6IA 5DT5A 1J0JA 3GH7A 3CHFA 1CXIA 1EDQA 2CHNA 5BRQA 1PAMA 1KXVA 4NRSA 1J0IA 2FGLA 2F2HA 1E4NA 3WEMA 4UTFA 1NOFA 1VF8A 2ZX5A 1B90A 4D6CA 1XYZA 5HNNA 3ZQ9A 4P8VA 2WB5A 4V27A 1FH9A 3VPLA 2WBKA 4AZBA 2CBVA 4NZCA 4HPHA 4J7RA 4U5IA 4PMRA 3W27A 4WSJA 1AMYA 3AHTA 1SYTA 1PX8A 2XVGA 3WD2A 3ARSA 3QOMA 1U33A 3RM9A 1UD3A 4JAWA 1JF6A 1QI5A 1W3JA 3APGA 3TOPA 1FA2A 5A6AA 1O7AA 3WF2A 4EAMA 5CG0A 3AXIA 5DF0A 2PWFA 4JCLA 1QHOA 3AMGA 3L2MA 4ATWA 3QHOA 5DEZA 2X8RA 3WNOA 4XV0A 3PTQA 3WELA 1WPCA 2Y2WA 3L4UA 1UD4A 4YPJA 4H8VA 3W81A 1W9XA 4GZJA 2DSUA 4W8LA 1ZBKA 1UWSA 1GOMA 1KWKA 5A2CA 4U5KA 2QMKA 3WL1A 2OWCA 3EMZA 4TX6A 4TUFA 2D3NA 2PI6A 1V0NA 1GZJA 3OB8A 4MTVA 2VURA 3GH5A 3VD9A 1JI1A 3FY1A 1G9HA 2V3GA 2WHKA 3KE0A 4OOZA 3WFLA 5D9PA 2YL8A 1WNOA 1BG4A 1WO2A 5E6YA 4CU6A 2WXDM 3ZR5A 5BCAA 4JFTA 1TMQA 2WLZA 1E6QM 2V3EA 4AZHA 4AZCA 1ZBWA 2J77A 1HXJA 1DWIM 2FH6A 2XPKA 1C7TA 2HVMA 2FDMA 1DWFM 1E71M 1QI4A 5GNXA 4J3UA 1GOWA 2J7DA 4PSRA 4W5ZA 3VD5A 1WAWA 2WVUA 2JEPA 3AIQA 2WMIB 4HA4A 4PMQA 4W8AA 5CXPA 5HBFA 3AHVA 3ARRA 4MAZA 1V6UA 4P7RA 1JL8A 4EANA 2VOTA 4HMCA 4GO9A 1V02E 3SCPA 3BAIA 2BV9A 1QBAA 1E72M 4AD5A 1QW9A 4TTUA 4AD2A 4LX4A 3BMWA 4U33A 1SFSA 2W4XA 2O92A 3LPOA 2VQUA 3POHA 2HISA 2WAGA 3VGGA 4FLSA 5FCZA 1E3ZA 4AD1A 1UWIA 1BVNP 2D1ZA 1HIZA 2A3EA 4DWSB 4H8HA 1J9YA 1X6NA 4KH2A 1RH9A 3NDZA 4Y7EA 3T0BA 4FF5A 3PN8A 1UUQA 1K9FA 1HJWA 4OBSA 3WQVA 4PBGA 1KXHA 1B3XA 2PBGA 3SCNA 1GORA 2XHYA 4MJ2A 1UKPA 5A8MA 1IV8A 1W9UA 1HJXA 4X9YA 1JYVA 1UH2A 1W2PA 3CMJA 1WZLA 5DFAA 4IPLA 3PZVA 2XVPA 5I23A 3W37A 1XV8A 1M01A 2GJPA 1TA3A 1FFQA 1BAGA 3T2PA 5IDIA 4C7GA 1GOOA 1Y7VA 3ZIZA 1K9EA 1MYRA 3AZRA 4ACZB 3AHYA 3ZJ7A 4OKDA 1U30A 3ZO9A 1QOXA 1UR0A 2BNJA 4F8XA 5A8NA 3B9EA 4MNKA 1GONA 3KL0A 1CGXA 3VM7A 3N9KA 2PWGA 1JIBA 2YA0A 4Z2HA 1V0KA 4WJXA 2J7CA 2DSVA 3VIJA 1JZ3A 1GOKA 1SMDA 2YA2A 4AMCA 3WD0A 4TTGA 3JUGA 5I3DA 4D1IA 3MV01 3WF4A 2ZXAA 3RO8A 3ARVA 1IZKA 1CGUA 2XTKA 4HTYA 1BSIA 1E40A 1JFHA 1QI0A 1HJQA 1H1NA 3KL5A 1UD8A 3B9DA 3FN9A 4EK7A 2V5CA 3WFZA 4CUCA 4DWSC 1BGAA 1J18A 2J8GA 3WF3A 3L4XA 3ARQA 4W88A 2PWEA 2DPEA 4GIAA 1BPLB 2V38A 4XX6A 1H09A 4F9JA 4CD5A 4K68A 3AYSA 1NQ6A 2WSPA 4UCFA 1RD6A 2UY2A 3UESA 1Q4NX 2ZWYA 3OGRA 3RDKA 1UKSA 1LL7A 4S3KA 1E0WA 2CNCA 1H41A 1VEMA 1GW1A 1EQCA 2BXZA 3N13A 4GZEA 4UOZA 3WDQA 2G4FA 1MQQA 3WH6A 1E4LA 1Z32X 1JF5A 4PMXA 4GKLA 4UFJA 1R8LA 5CGMA 4UQBA 4Z2IA 3MUIA 1W1TA 3ZM8A 1G1YA 2FGZA 4MB3A 4H7VA 5DMYA 3TTOA 1HX0A 3VIOA 3VINA 2WC4A 2J25A 3F5KA 4OUEA 2ZXQA 3N11A 4FLQA 1EHAA 1QNSA 1C92A 4D6DA 4H8UA 1FHDA 3SUVA 1BYAA 1OD0A 1UD2A 4U2ZA 3W25A 4C7DA 2XM1A 5EMYA 3AROA 1MW3A 3UETA 3W6MA 1W1VA 3BAWA 1DEDA 2CESA 5FD0A 4ZE5A 1R85A 4HU8A 3WQ5A 5CLWA 1XSJA 3CLWA 1KGWA 1CNVA 1RPKA 2GK1B 2WHMA 3WNMA 2G3JA 5E6ZA 2ZXBA 3VMOA 3PTMA 2WVVA 5I2UA 3AOFA 3EYPA 3EDDA 2CXGA 1SMAA 3WD4A 1E0XA 1MXGA 1UQZA 3RM4A 1E9LA 4KWUA 4PTWA 3VTRA 1L8NA 1Q6DA 2W63A 3SCRA 3ARZA 3U5YA 3M6DA 2E4TA 4MNLA 4D6GA 3GXDA 3SUWA 1UH4A 2EXOA 4YHEA 5D9NA 4ATLA 4GXPA 2JF7A 2GJXB 2ZX7A 4P7LA 5E0FA 4AC1X 3G6LA 2ZX6A 3CHDA 1ZU8A 3WH7A 3RCNA 1EH9A 2AOSA 1V6XA 4GPNA 4PMUA 2VCBA 3UERA 4UFLA 4HMEA 3GZAA 2W66A 4WF7A 2ZUSA 3A4AA 1OBAA 5AC4A 1CGTA 3UCQA 1OSEA 2E3ZA 2VMFA 4DUVA 4JKLA 3PZ9A 1VRXA 1FHLA 1K6AA 3MMUA 1UOKA 1H4PA 5FL0A 2NT1A 3CO4A 4GQRA 4FK9A 2XSBA 4Z2JA 1OT2A 4B15A 3EDKA 3S2CA 1BYDA 2PC8A 1B3WA 1BTCA 1C8XA 4KGJA 1BYBA 2WMFA 1FH7A 1PX3A 1PX4A 1NOWA 3AIRA 1LL6A 4TVDA 3W6LA 1QVBA 4GI6A 2WPGA 1MFUA 3F5JA 1V6VA 3B8SA 1FP9A 1H49A 3CBWA 8A3HA 1J0ZA 2OSXA 1GQJA 3UR8A 1QPKA 1XRVA 1W32A 1TFVA 5A95A 1UR1A 1M03A 2ZICA 1JZ8A 2XIIA 2W61A 3N12A 2QV4A 3CPUA 3OBAA 2G41A 2OLHA 3U7VA 3CZEA 1XH1A 1KXQA 3L4YA 2ZUMA 3SIMA 1CXEA 4FLOA 4GO8A 2UY3A 4NF7A 2VTFA 1G0CA 4AD3A 4CVUA 2WC3A 4AZGA 2NSXA 3IJ8A 1EIBA 5E70A 2J62A 4AZCB 1W1PA 3WF0A 4ML4A 1PIGA 3QHNA 1V6WA 1BGGA 3CHEA 4GZIA 3ZSSA 3AMDA 5BXTA 3E1F1 3BAYA 2QMJA 4W89A 3VDHA 1WDPA 5D8WA 5I5RA 1BF2A 3GDBA 1GQIA 5LA2A 3B9AA 2A3HA 1EGZA 1E1EA 5FL1A 3ZR6A 3W4RA 3VO0A 1KBKA 2O9PA 5I0DA 2XVLA 4MPKA 2A3CA 2WKLA 2YLLA 3CUIA 2WCAA 3WL0A 3WQ8A 1RP8A 2J47A 3GH4A 4URIA 3CUHA 4UFHA 2JFEX 2W5FA 2J8FA 4JFWA 1HP5A 3SUSA 1IZJA 1WB0A 6CGTA 4UFMA 4E8CA 2YIHA 3ALFA 3AMKA 1B30A 1CENA 3TP4A 3K8LA 5E9AA 5LA1A 3QGVA 3FXYA 1UQYA 2J7BA 5CGTA 1UKOA 3AIWA 4N0RA 2BHUA 4XZWA 1QNRA 1K9TA 3WNNA 3AS0A 1W3LA 2QF8A 7A3HA 1LQ0A 2J78A 2Q8XA 2VI0A 4CN1A 1I1XA 1JZ5A 3WNPA 1VEPA 3I3DA 4ZXOA 2OYLA 1HVQA 3GM8A 4HMDA 4P8WA 5ABGA 2D20A 1JFXA 3GYCA 2DQXA 4XB3A 2V3DA 4WKHA 5M3WA 4Q7NA 3SEPA 4MJ4A 3NUKA 3AS3A 1U2YA 3VGFA 1WDRA 4H41A 1JNEA 3VMNA 1ODUA 1W91A 4UQ9A 1MQPA 1TA3B 4E2OA 4CCDA 4AD0A 2BFGA 5A6KA 1NWTA 2VO5A 2ESCA 3T0AA 2D24A 1B31A 2WHJA 1KR1A 1JD9A 1KGXA 2E9LA 2DSKA 4HU0A 1FH8A 2WWDA 4U3CA 3A3HA 4W86A 3WNKA 4QCEA 1WZKA 4D6EA 1HKKA 5CSUA 2CCRA 3QHMA 3FW6A 4U2YA 4AEFA 3CZKA 4AZ7A 5KZ6A 3GXMA 4JIEA 1M53A 3T09A 1XYFA 3QR3A 3CTTA 1M04A 1HJUA 2BHYA 4JFSA 1ITCA 3PZQA 3MMWA 1CIUA 3WN6A 1UZ4A 4NSBA 3WUGA 5A6LA 1E70M 3EBVA 1KCKA 4ZE4A 1QW8A 3D3AA 3POCA 2IXVA 1KQYA 2VZUA 4M8UA 5EFFA 1ISXA 3AMLA 2ZUNA 2NT0A 4HP5A 6A3HA 1E5NA 1UD5A 4NRRA 1NARA 2CBIA 3EDJA 4HA1A 1LG2A 4TVCA 2EBNA 4U3AA 4AXNA 2XYLA 4P8UA 4UQDA 3N17A 2X09A 3VIFA 4WKFA 1XCXA 1NH6A 5GNYA 2DT1A 1QNQA 5ECUA 1G94A 2X0HA 2W92A 3AZSA 4YHGA 1B3VA 1KQZA 5E0CA 2RGMA 2DH3A 4UQEA 1CYGA 3BC9A 2W91A 1GQKA 1KB3A 2J74A 1WDSA 3FHQA 3W38A 3UR7A 1R87A 4MDPA 4JHZA 5BRPA 2GSJA 2YBUA 4B3LA 4UFIA 2PWHA 1US2A 4OJYA 2X0YA 1ISWA 4CD7A 1E4MM 3AZTA 4QDMA 5AYIA 4P7NA 4PMZA 4PTVA 1A47A 3M7SA 3CHCA 3AHXA 3IJ9A 1GVIA 1R86A 1C91A 1HN1A 2BS9A 3K1DA 1NOUA 2CBUA 1W9BM 4HOXA 4D1JA 1HKJA 4ZENA 4AZ5A 2X05A 2E40A 2G3NA 1JZ2A 1UWTA 4ZXLA 4X0NA 3PBGA 3WQ4A 1PEZA 1MFVA 5M5DA 1XD1A 3N04A 3ARTA 3VDAA 1QI2A 2IUZA 1ZJAA 3ZJ6A 3N18A 3AISA 2VZOA 1WE5A 1J12A 3CIVA 3MO4A 5DT7A 4LYQA 3A6OA 2QLYA 1VENA 3WDHA 1P6WA 1MW2A 3VIIA 3K8MA 4J3VA 1JDCA 2E0PA 1H3GA 3K8KA 4QLJA 2XGIA 2XWEA 3WDPP 1R7AA 3L4ZA 3OLDA 4JL1A 5GQBA 1BYCA 1E6XM 5IHSA 3L2LA 1NWUA 1JZ4A 4HZ7A 2XSAA 1JXJA 1OB0A 3MUAA 3VDBA 1HL9A 2BVYA 3PZGA 2Y8KA 4JFVA 3LPFA 1BHGA 2DT3A 2YJQA 5CQ1A 3U57A 2C7FA 1H5VA 2EPKX 1UA7A 4RE2A 4W85A 1OIMA 4TXEA 2J7EA 3TONA 4CCCA 3SCOA 3WD3A 2A3BA 2EPMX 2XWDA 4KRUA 2F8QA 9CGTA 4J28A 4WIWA 5FIPA 3KZSA 5LYRA 1QBBA 3W53A 5I24A 3RJYA 1CWYA 3L4TA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2JIW A;  1GQL A;  5HPC A;  3BAX A;  1QNO A;  2WSK A;  3ZT5 A;  1OT1 A;  3VX1 A;  1JDD A;  1E0V A;  4DUX A;  1JGI A;  1CXK A;  3SCQ A;  1LF1 A;  3BXW A;  1NM9 A;  1PZ3 A;  1LL4 A;  3L4W A;  1VFM A;  1ZBC A;  4AW7 A;  1HKM A;  3W26 A;  1E15 A;  1K9D A;  4E4P A;  3ZMR A;  2WW5 A;  3VMP A;  1VFO A;  1WP6 A;  4BQ2 A;  1GVY A;  1CZ1 A;  3EMC A;  3O6A A;  1BG9 A;  1EQP A;  1AQH A;  1VAH A;  2UY5 A;  2RGL A;  3KWX A;  4RL3 A;  4CCE A;  1DHK A;  4BQ5 A;  1NP0 A;  4J3X A;  2WVS A;  3VDC A;  1H11 A;  1DWJ M;  5A69 A;  2DT2 A;  2QPU A;  2VX4 A;  3AIB A;  1AQ0 A;  5I78 A;  4M24 A;  1V3M A;  1D2K A;  3ZJ8 A;  3I3B A;  1HL8 A;  1OM0 A;  2YDQ A;  3THD A;  1HP4 A;  3WH8 A;  4W7U A;  4QAW A;  3AXH A;  4CVW A;  2YL6 A;  1JYX A;  5HOS A;  1UWQ A;  3AI0 A;  1OIF A;  2XVN A;  4HZ8 A;  3A4X A;  1CDG A;  4TVU A;  4W8B A;  1JZ7 A;  3SCW A;  3WQW A;  1WCG A;  1GPF A;  2WCG A;  2J7H A;  2DIE A;  1UG6 A;  4OIF A;  5ABF A;  2YDS A;  5EFD A;  2D22 A;  2XM2 A;  2FHF A;  5A6M A;  4UQA A;  1E73 M;  2VT0 A;  5IHR A;  4M80 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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